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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-10-06 |
MCT1-mediated endothelial cell lactate shuttle as a target for promoting axon regeneration after spinal cord injury
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.96374
PMID:39310103
|
研究论文 | 本研究揭示了脊髓损伤后内皮细胞乳酸穿梭机制对轴突再生的调控作用 | 首次发现MCT1介导的内皮细胞-神经元乳酸穿梭是促进脊髓损伤后轴突再生的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值仍需进一步验证 | 探究脊髓损伤后代谢改变对神经组织重塑和功能恢复的影响 | 脊髓损伤小鼠模型、内皮细胞、神经元 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 代谢组学、单细胞RNA测序、腺相关病毒技术 | NA | 代谢数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 182 | 2025-10-06 |
Conditional ablation of DIS3L2 ribonuclease in pre-meiotic germ cells causes defective spermatogenesis and infertility in male mice
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.98620
PMID:39310107
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研究论文 | 本研究通过建立条件性基因敲除小鼠模型,揭示了DIS3L2核糖核酸酶在雄性小鼠精子发生过程中的关键作用 | 首次系统研究了DIS3L2在雄性生殖细胞发育中的功能,发现其在精原细胞分化和精母细胞减数分裂进程中的关键调控作用 | 研究仅局限于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证 | 探究DIS3L2核糖核酸酶在雄性生殖细胞发育和精子发生过程中的生物学功能 | 条件性基因敲除小鼠模型的睾丸组织和生殖细胞 | 生殖生物学 | 男性不育症 | 条件性基因敲除,bulk RNA-seq,scRNA-seq | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据 | 条件性敲除小鼠睾丸组织 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 183 | 2025-10-06 |
Hepatocyte-specific Smad4 deficiency inhibits hepatocarcinogenesis by promoting CXCL10/CXCR3-dependent CD8+- T cell-mediated anti-tumor immunity
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.97276
PMID:39346534
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研究论文 | 本研究通过肝细胞特异性Smad4缺失小鼠模型,揭示了Smad4通过调控CXCL10/CXCR3信号通路影响CD8+ T细胞抗肿瘤免疫的新机制 | 首次发现肝细胞Smad4通过CXCL10/mTOR/LDHA通路调控CD8+ T细胞糖酵解和抗肿瘤功能 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 阐明肝细胞Smad4在肝细胞癌发生发展中的具体作用机制 | 肝细胞特异性Smad4缺失小鼠和肝细胞癌患者样本 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,流式细胞术,细胞因子检测 | NA | 基因表达数据,免疫细胞浸润数据,代谢通路数据 | 小鼠模型和人类HCC患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 184 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-Seq analysis of molecular changes during radiation-induced skin injury: the involvement of Nur77
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.100417
PMID:39346541
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析辐射诱导皮肤损伤过程中的分子变化,发现Nur77的关键作用 | 首次在单细胞水平揭示辐射诱导皮肤损伤的转录组框架和细胞间通讯,鉴定出Nur77作为新型治疗靶点 | 样本量有限,仅包含一名核事故患者和动物模型 | 阐明辐射诱导皮肤损伤的分子机制和潜在治疗靶点 | 人类皮肤样本(核事故患者)和大鼠皮肤样本 | 单细胞组学 | 辐射性皮肤损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 一名人类患者和大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 185 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomic sequencing reveals immune microenvironment features of Mycobacterium tuberculosis granulomas in lung and omentum
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.99038
PMID:39431015
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研究论文 | 通过空间转录组测序揭示肺部和网膜结核肉芽肿免疫微环境特征 | 首次从空间维度系统比较肺部和网膜结核肉芽肿的细胞组成差异,并利用类器官-巨噬细胞共培养模型验证THBS1在细胞外基质重塑中的关键作用 | 样本量较小(仅4例临床活检样本),需要更大规模研究验证发现 | 分析结核肉芽肿细胞群体的空间转录组特征,理解肉芽肿形成和发展的核心转录组特征 | 结核分枝杆菌感染的肺组织和网膜组织,以及非结核患者的对照组织 | 空间转录组学 | 结核病 | 空间转录组测序,类器官-巨噬细胞共培养 | NA | 空间转录组数据 | 4例临床活检样本(2例结核感染,2例非结核对照) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 186 | 2025-10-06 |
Re-analysis of single-cell transcriptomics reveals a critical role of macrophage-like smooth muscle cells in advanced atherosclerotic plaque
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.87201
PMID:38389849
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示巨噬细胞样平滑肌细胞在晚期动脉粥样硬化斑块中的关键作用 | 发现具有中间表型的巨噬细胞样平滑肌细胞亚型,并鉴定IRF8通过激活NF-κB信号通路促进平滑肌细胞向巨噬细胞转分化的新机制 | NA | 探究晚期动脉粥样硬化斑块中平滑肌细胞表型多样性及其分子机制 | 人颈动脉粥样硬化斑块组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, bulk RNA-seq, 谱系追踪技术 | NA | 单细胞转录组数据, bulk RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 187 | 2025-10-06 |
Mrc1+ macrophage-derived IGF1 mitigates crystal nephropathy by promoting renal tubule cell proliferation via the AKT/Rb signaling pathway
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.89174
PMID:38389846
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了Mrc1+巨噬细胞来源的IGF1通过AKT/Rb信号通路促进肾小管细胞增殖,从而缓解晶体肾病的机制 | 首次构建了乙醛酸盐诱导晶体肾病的单细胞图谱,发现Mrc1巨噬细胞亚型通过分泌IGF1促进肾小管修复的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究晶体肾病中的细胞特征和细胞间通讯,寻找潜在治疗靶点 | 小鼠肾脏细胞,包括肾小管细胞、免疫细胞和间质细胞 | 单细胞生物学 | 晶体肾病 | 单细胞RNA测序 | Seurat, CellChat | 单细胞转录组数据 | 超过40000个单细胞,来自不同时间点(0,1,4,7天)的乙醛酸盐处理小鼠肾脏 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 188 | 2025-10-06 |
Single cell RNA sequencing of human FAPs reveals different functional stages in Duchenne muscular dystrophy
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1399319
PMID:39045456
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析杜氏肌营养不良症患者纤维脂肪前体细胞的功能状态差异 | 首次在人类样本中揭示DMD患者FAP细胞存在不同功能亚群及其特异性基因表达特征 | 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 阐明杜氏肌营养不良症中FAP细胞的分子调控机制和功能状态 | 健康对照和DMD患者的纤维脂肪前体细胞 | 单细胞转录组学 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞RNA测序,qPCR验证 | Seurat分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确总样本数,验证阶段包含9个额外样本 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, Illumina测序平台 | 10x Genomics单细胞RNA测序技术 |
| 189 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal modulation of growth factors directs the generation of multilineage mouse embryonic stem cell-derived mammary organoids
2024-01-22, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.12.003
PMID:38159568
|
研究论文 | 通过时空调控生长因子实现了小鼠胚胎干细胞向多谱系乳腺类器官的定向分化 | 首次通过BMP4和PTHrP的顺序激活及hedgehog信号抑制,将皮肤类器官模型中的间充质转化为乳腺特异性间充质 | 研究仅限于小鼠胚胎干细胞模型,尚未在人类细胞中验证 | 开发能够模拟乳腺发育的多谱系类器官模型 | 小鼠胚胎干细胞(mESCs) | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 190 | 2025-10-06 |
In-depth transcriptomic analysis of Anopheles gambiae hemocytes uncovers novel genes and the oenocytoid developmental lineage
2024-Jan-19, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-09986-6
PMID:38243165
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研究论文 | 通过深度转录组分析揭示了冈比亚按蚊血细胞的基因表达特征和细胞发育谱系 | 发现了4020个新基因和20008个新转录本异构体,鉴定了一个新的前血细胞前体细胞类型,明确了卵血细胞来源于前血细胞的发育路径 | 血细胞仅占昆虫总细胞的极小部分,研究主要基于成年雌蚊样本 | 构建冈比亚按蚊血细胞的全面转录组图谱,研究血细胞分化和免疫功能 | 冈比亚按蚊成年雌蚊的血细胞 | 转录组学 | NA | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 伪时序分析 | Monocle 3, 单细胞分析工具 | RNA测序数据 | 基于约24亿条Illumina短读长和940万条PacBio长读长高质量序列 | Illumina, PacBio | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina测序平台, PacBio测序平台 | 短读长Illumina测序和长读长PacBio测序技术 |
| 191 | 2025-10-06 |
PancrESS - a meta-analysis resource for understanding cell-type specific expression in the human pancreas
2024-Jan-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-09964-y
PMID:38238687
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研究论文 | 开发了一个用于理解人类胰腺细胞类型特异性表达的元分析资源和工具 | 整合了多个胰腺单细胞RNA测序数据集,提供了参考转录组丰度和细胞类型特异性指标的数据库,并开发了可直接处理原始计数数据的通用工具 | NA | 理解人类胰腺细胞类型特异性转录程序,促进胰腺疾病治疗方法的开发 | 人类胰腺单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 胰腺疾病 | 单细胞RNA测序 | 元分析 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 192 | 2025-10-06 |
Expansion of highly interferon-responsive T cells in early-onset Alzheimer's disease
2024-Jan-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.26.559634
PMID:37823036
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现早发性阿尔茨海默病患者外周血中干扰素信号相关基因高表达的T细胞显著扩增 | 首次在早发性阿尔茨海默病患者中发现干扰素信号相关基因高表达的抗病毒样T细胞群显著扩增 | 样本量有限,需要进一步研究确认这些细胞在神经退行性疾病中的具体作用机制 | 探究早发性阿尔茨海默病的免疫反应特征 | 早发性阿尔茨海默病患者和临床正常对照者的外周血单核细胞及CD4 T细胞 | 单细胞基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 微滴数字PCR | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | 约182,000个外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 193 | 2025-10-06 |
Deciphering maternal-fetal cross-talk in the human placenta during parturition using single-cell RNA sequencing
2024-01-10, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adh8335
PMID:38198568
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术解析人类胎盘在分娩过程中母胎交流的细胞机制 | 首次建立人类胎盘单细胞图谱,揭示分娩过程中母胎细胞类型的转录组变化及细胞间通讯网络 | 研究主要关注足月分娩,对早产机制的分析仍需进一步验证 | 阐明分娩过程中母胎交流的细胞和分子机制 | 人类胎盘组织中的母体和胎儿细胞 | 单细胞组学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类胎盘组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 194 | 2025-10-06 |
Dynamics of Endothelial Cell Generation and Turnover in Arteries During Homeostasis and Diseases
2024-01-09, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究开发了一种遗传增殖追踪系统,用于定量分析动脉内皮细胞在稳态和疾病状态下的生成动态和细胞分裂方向 | 开发了基于Cre-loxP和Dre-rox的双重组系统,实现了体内内皮细胞增殖的无缝时间记录 | 研究主要针对小鼠大血管,对人类血管的适用性需要进一步验证 | 揭示动脉内皮细胞在稳态和疾病状态下的生成动态和调控机制 | 小鼠动脉内皮细胞 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,基因敲除,遗传增殖追踪 | NA | 基因表达数据,细胞增殖数据 | 成年小鼠主动脉内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 195 | 2025-10-06 |
BACH1 promotes tissue necrosis and Mycobacterium tuberculosis susceptibility
2024-Jan, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-023-01523-7
PMID:38066332
|
研究论文 | 研究发现转录因子BACH1通过调控铁死亡促进结核分枝杆菌感染的组织坏死和宿主易感性 | 首次揭示BACH1通过抑制抗氧化基因表达调控铁死亡过程,从而影响结核分枝杆菌感染的宿主抵抗机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究BACH1在结核分枝杆菌感染中对宿主抵抗力的调控机制 | 小鼠模型、巨噬细胞、肺组织 | 分子生物学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 多个小鼠模型组(包括Bach1敲除和B6.Sst1小鼠) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 196 | 2025-10-06 |
Dandelion uses the single-cell adaptive immune receptor repertoire to explore lymphocyte developmental origins
2024-Jan, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01734-7
PMID:37055623
|
研究论文 | 介绍用于单细胞V(D)J测序数据分析的计算流程Dandelion | 开发了能够改进V(D)J重叠群注释并识别非生产和部分剪接重叠群的单细胞分析流程,创建了可用于差异V(D)J使用分析和伪时间轨迹推断的AIR特征空间 | NA | 探索淋巴细胞发育起源 | 淋巴细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞V(D)J测序(scVDJ-seq), 单细胞RNA测序 | 计算流程 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞V(D)J测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 197 | 2025-10-06 |
MICA: a multi-omics method to predict gene regulatory networks in early human embryos
2024-01, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202302415
PMID:37879938
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研究论文 | 开发了一种名为MICA的多组学方法,用于预测早期人类胚胎中的基因调控网络 | 首次将基于互信息的非线性方法应用于结合染色质可及性的单细胞多组学数据,能够捕获复杂的非单调依赖关系和反馈回路 | 在单细胞样本有限的情况下进行GRN推断存在困难 | 开发适用于单细胞多组学数据的基因调控网络预测方法 | 早期人类胚胎 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序,染色质可及性分析 | 基于互信息的非线性方法 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 198 | 2025-10-06 |
YAP and TAZ couple osteoblast precursor mobilization to angiogenesis and mechanoregulation in murine bone development
2024-01-22, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.11.029
PMID:38141609
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研究论文 | 本研究揭示了YAP和TAZ在小鼠骨骼发育过程中协调成骨前体细胞动员与血管生成及力学调控的机制 | 首次发现YAP和TAZ在胚胎骨骼发育中空间耦合成骨前体细胞动员与血管生成,并调控血管形态发生和力学响应 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究胚胎骨骼发育过程中成骨前体细胞动员与血管生成协调作用的分子机制 | 小鼠胚胎骨骼发育过程中的成骨前体细胞和血管系统 | 发育生物学 | 骨骼发育疾病 | 单细胞RNA测序,3D细胞共培养 | NA | 基因表达数据,细胞成像数据 | 小鼠胚胎样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 199 | 2025-10-06 |
Insights into midgut cell types and their crucial role in antiviral immunity in the lepidopteran model Bombyx mori
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1349428
PMID:38420120
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综述 | 本文综述了鳞翅目模型家蚕中肠细胞类型及其在抗病毒免疫中的关键作用 | 利用前沿单细胞转录组学揭示昆虫中肠细胞中先前未被识别的亚群,并阐明昆虫与高等哺乳动物胃肠道之间的显著相似性 | NA | 探讨昆虫中肠细胞类型在免疫防御中的复杂作用机制 | 家蚕中肠细胞类型(柱状细胞、肠内分泌细胞、杯状细胞和再生细胞) | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 200 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells from pregnant women with Systemic lupus erythematosus
2024, International reviews of immunology
IF:4.3Q2
DOI:10.1080/08830185.2024.2376649
PMID:39066603
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析妊娠期系统性红斑狼疮患者外周血单个核细胞的免疫细胞组成和基因表达特征 | 首次在单细胞水平比较妊娠期活动性与非活动性SLE患者的免疫细胞比例和转录模式差异 | 样本量较小(仅12例患者),且未包含健康孕妇对照组 | 阐明妊娠期SLE患者的免疫细胞特征和分子机制 | 系统性红斑狼疮孕妇的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 12例SLE患者(包含活动性/非活动性、妊娠/非妊娠分组) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序技术 |