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当前共找到 1397 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-05-21 |
Identification of a pancreatic stellate cell gene signature and lncRNA interactions associated with type 2 diabetes progression
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1532609
PMID:39872314
|
研究论文 | 通过分析2型糖尿病胰岛细胞的基因表达模式，识别胰腺星状细胞特异性的基因标志物及其与lncRNA的相互作用网络 | 首次发现COL1A2hi/VCANhi/SULF1hi胰腺星状细胞是2型糖尿病特有的基因签名，并揭示了lncRNA-mRNA调控网络在2型糖尿病免疫微环境重塑中的潜在作用 | 结果主要基于公开数据集分析，缺乏实验验证；lncRNA-mRNA相互作用为预测性分析，未进行功能实验确认 | 探索2型糖尿病胰岛细胞的基因表达特征及胰腺星状细胞在疾病进展中的作用机制 | 2型糖尿病和1型糖尿病患者的胰岛细胞及外周血单核细胞 | 自然语言处理 | 2型糖尿病 | RNA-seq、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个公共数据集：3个T2D单细胞RNA测序数据集、1个T1D单细胞RNA测序数据集及2个T2D批量测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 182 | 2026-05-20 |
Identifying the NEAT1/miR-26b-5p/S100A2 axis as a regulator in Parkinson's disease based on the ferroptosis-related genes
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0316179
PMID:39739972
|
研究论文 | 基于铁死亡相关基因识别帕金森病中的NEAT1/miR-26b-5p/S100A2轴作为调节因子 | 首次通过整合铁死亡相关基因与竞争性内源RNA网络，鉴定出NEAT1/miR-26b-5p/S100A2轴在帕金森病发病机制中的调控作用 | 未提及具体局限性，但结果需进一步在更大样本和临床环境中验证 | 识别铁死亡相关基因并构建竞争性内源RNA网络，以评估帕金森病的发病机制 | 帕金森病患者和对照组的97个黑质样本 | 机器学习 | 帕金森病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 机器学习算法（包括随机森林、支持向量机等） | 基因表达数据 | 97个黑质样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 183 | 2026-05-20 |
Characterization of NOD-like receptor-based molecular heterogeneity in glioma and its association with immune micro-environment and metabolism reprogramming
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1498583
PMID:39882240
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研究论文 | 揭示NOD样受体信号通路在高级胶质瘤中的分子异质性及其与免疫微环境和代谢重编程的关联 | 首次基于NLR基因表达谱将胶质母细胞瘤患者精确分为两种临床亚型，并开发了基于TRIP6基因的新型预后分子标志物 | 基于公共数据库的回顾性分析，缺乏前瞻性验证队列；单细胞分析样本量有限 | 探索NLR信号通路在胶质母细胞瘤临床异质性中的作用，并识别其关键调控基因 | 胶质母细胞瘤患者 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | NMF聚类算法，LASSO回归，COX回归，随机森林算法，单细胞测序 | NMF, LASSO, COX, 随机森林 | 转录组数据，单细胞测序数据 | 496例胶质母细胞瘤患者 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 184 | 2026-05-20 |
Utilization of donor CLL-1 CAR-T cells for the treatment of relapsed of acute myeloid leukemia following allogeneic hematopoietic stem cell transplantation
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1491341
PMID:39896798
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research paper | 评估供体来源的CLL-1 CAR-T细胞治疗异基因造血干细胞移植后复发急性髓系白血病的安全性和有效性 | 首次研究供体来源的CLL-1 CAR-T细胞在异基因HSCT后复发AML患者中的应用，并通过单细胞RNA测序揭示CAR-T细胞动态变化 | 样本量较小（12名患者），且2名患者因疾病快速进展退出研究 | 评估供体来源的CLL-1 CAR-T细胞治疗异基因造血干细胞移植后复发急性髓系白血病的疗效和安全性 | 14名异基因HSCT后复发的AML患者，其中12名接受CLL-1 CAR-T细胞治疗 | machine learning | 急性髓系白血病 | CAR-T细胞治疗，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、临床数据 | 12名AML患者，1个患者样本用于单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 用于患者4的CAR-T细胞输注产品和扩增峰值期PBMCs的单细胞RNA测序 |
| 185 | 2026-05-20 |
Characterizing tumor biology and immune microenvironment in high-grade serous ovarian cancer via single-cell RNA sequencing: insights for targeted and personalized immunotherapy strategies
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1500153
PMID:39896800
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序表征高级别浆液性卵巢癌的肿瘤生物学和免疫微环境，为靶向和个性化免疫治疗策略提供见解 | 首次通过单细胞RNA测序系统解析高级别浆液性卵巢癌中C2 IGF2+肿瘤亚型及其与成纤维细胞通过MK信号通路的复杂互作，并基于该亚型构建预后模型结合免疫浸润和药物敏感性分析 | 未明确提及，可能包括样本量有限、功能验证范围及临床转化中的潜在挑战 | 利用单细胞RNA测序阐明高级别浆液性卵巢癌的分子机制、免疫景观和药物敏感性，以识别新治疗靶点并改善患者预后 | 高级别浆液性卵巢癌的肿瘤细胞亚型及其微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自GEO数据库的公共数据集，具体样本数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 186 | 2026-05-19 |
A brief history of somatostatin interneuron taxonomy or: how many somatostatin subtypes are there, really?
2024, Frontiers in neural circuits
IF:3.4Q2
DOI:10.3389/fncir.2024.1436915
PMID:39091993
|
评论 | 综述了生长抑素中间神经元分类的历史，重点讨论了基于单细胞RNA-seq的现代分类方法及其对实验神经科学的影响 | 提出将生长抑素中间神经元划分为约十个“超型”作为最实用的分类层级，批评基于细微基因表达差异的精细分类缺乏表型差异，对实验研究帮助有限 | 作者承认该综述具有主观偏见，未涵盖所有相关研究，且对基因表达差异的生物学意义评估可能不全面 | 探讨生长抑素中间神经元分类的演变历史，并建议适用于实验神经科学的实用分类策略 | 生长抑素中间神经元（somatostatin interneurons） | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA（综述文章，未涉及具体样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 187 | 2026-05-19 |
Histamine H4 receptor and TRPV1 mediate itch induced by cadaverine, a metabolite of the microbiome
2024 Jan-Dec, Molecular pain
IF:2.8Q2
DOI:10.1177/17448069241272149
PMID:39079948
|
研究论文 | 研究发现微生物代谢物尸胺通过组胺H4受体和TRPV1通路介导瘙痒反应 | 首次揭示尸胺作为一种新型内源性瘙痒原，通过结合H4R并激活TRPV1信号通路诱导瘙痒 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证，且未完全阐明肠道微生物产生尸胺与瘙痒之间的直接体内联系 | 探究尸胺是否调节疼痛或瘙痒及其分子机制 | 小鼠及DRG神经元 | 机器学习 | 瘙痒相关疾病 | 分子对接模拟、scRNA-Seq、钙成像、膜片钳 | NA | 序列数据、成像数据 | 实验小鼠及DRG神经元样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 188 | 2026-05-19 |
Nature and nurture in fruit fly hearing
2024, Frontiers in neural circuits
IF:3.4Q2
DOI:10.3389/fncir.2024.1503438
PMID:39568979
|
综述 | 综述了果蝇听觉感知中先天性因素和学习性因素的研究进展 | 将单细胞转录组和脑连接组学数据与传统分子遗传学结合，研究果蝇听觉感知中的“先天与后天”交互作用 | 未提供 | 概述果蝇鸣声偏好的本质及其神经机制 | 果蝇 | 机器学习 | 未提供 | 单细胞转录组 | 未提供 | 转录组数据 | 未提供 | 未提供 | 单细胞RNA测序 | 未提供 | 未提供 |
| 189 | 2026-05-18 |
Discovery of optimal cell type classification marker genes from single cell RNA sequencing data
2024, BMC methods
DOI:10.1186/s44330-024-00015-2
PMID:40893796
|
研究论文 | 介绍NS-Forest v4.0算法，用于从单细胞RNA测序数据中发现最优细胞类型分类标记基因 | 引入On-Target Fraction指标量化标记基因的特异性，通过模块化决策树提升标记基因选择的效率和准确性 | 未明确说明局限性，但模拟研究和真实数据验证仍可能受限于数据集大小和细胞类型复杂性 | 开发可扩展的数据驱动方法，识别最小组合的必需且足够标记基因，以最大分类精度捕获细胞类型身份 | 人类器官（脑、肾、肺）的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 无特定疾病 | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 单细胞基因表达数据 | 包含数百万个人类细胞的多个数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 190 | 2026-05-17 |
Nephron progenitors rhythmically alternate between renewal and differentiation phases that synchronize with kidney branching morphogenesis
2024-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.21.568157
PMID:38045273
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研究论文 | 通过空间转录组学数据与分支生命周期的关联，发现肾单位祖细胞在Wnt、Hippo-Yap、视黄酸等通路中节律性交替更新与分化相，并与肾脏分支形态发生同步 | 首次揭示肾单位祖细胞节律性交替更新与分化相，并证明其与分支形态发生同步的机制，通过时空转录组学整合发现Wnt/β-catenin与YAP激活的时间重叠信号转换 | 主要在人和小鼠类器官模型中验证，未在完整发育肾中直接验证节律性信号的时间模式，且信号通路的相互作用细节尚需进一步阐明 | 解析肾单位祖细胞更新与分化平衡的时空调控机制及其与分支形态发生的同步性 | 小鼠发育肾和人干细胞来源的肾单位祖细胞类器官 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 小鼠发育肾样本和人干细胞来源类器官样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台用于分析小鼠肾组织切片 |
| 191 | 2026-05-15 |
Autoimmune uveitis attenuated in diabetic mice through imbalance of Th1/Th17 differentiation via suppression of AP-1 signaling pathway in Th cells
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1347018
PMID:38887289
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研究论文 | 本研究利用小鼠模型探讨糖尿病对自身免疫性葡萄膜炎发展的影响及其免疫机制 | 首次揭示糖尿病通过抑制Th细胞中的AP-1信号通路，导致Th1/Th17分化失衡，从而减轻自身免疫性葡萄膜炎 | 研究基于小鼠模型，未在人体中验证；具体分子机制尚需进一步探索 | 探究糖尿病状态对器官特异性自身免疫性疾病（如葡萄膜炎）的影响 | 野生型C57BL/6小鼠和自发糖尿病Ins2Akita小鼠 | 免疫学 | 自身免疫性葡萄膜炎，糖尿病 | 单细胞RNA测序，免疫组化，流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型，具体数量未明确，涉及WT和Akita两组 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 192 | 2026-05-11 |
Leveraging single-cell ATAC-seq and RNA-seq to identify disease-critical fetal and adult brain cell types
2024-01-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-44742-0
PMID:38233398
|
研究论文 | 通过整合单细胞ATAC-seq（scATAC-seq）和RNA-seq（scRNA-seq）数据，识别与大脑疾病相关的胎儿和成体脑细胞类型 | 首次大规模整合GWAS数据与超300万scATAC-seq和scRNA-seq图谱，从染色质可及性和基因表达两个维度识别脑疾病关键细胞类型 | 研究依赖GWAS汇总统计数据，可能遗漏罕见变异或细胞类型特异效应；仅覆盖83种细胞类型，仍存在未检测的细胞亚型 | 利用单细胞表观组学和转录组学数据，优先识别与脑部疾病相关的关键胎儿和成体脑细胞类型 | 28种脑部相关疾病/特征以及83种细胞类型的scATAC-seq和scRNA-seq图谱 | 计算生物学、基因组学 | 脑部疾病（如重度抑郁症、精神分裂症、ADHD）、代谢特征（如BMI） | scATAC-seq, scRNA-seq | NA | 单细胞染色质可及性数据、单细胞基因表达数据、GWAS汇总统计 | 28种疾病/特征的平均样本量约298,000人；单细胞数据包含320万个细胞 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 193 | 2026-05-11 |
The phosphatase DUSP22 inhibits UBR2-mediated K63-ubiquitination and activation of Lck downstream of TCR signalling
2024-01-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-44843-w
PMID:38225265
|
研究论文 | 揭示DUSP22磷酸酶通过抑制UBR2介导的Lck K63-泛素化来调控T细胞受体信号通路 | 首次发现E3泛素连接酶UBR2是T细胞活化中Lck的正向上游调控因子，并阐明DUSP22通过去磷酸化UBR2促使其降解的调控机制 | 未提及具体局限性 | 研究T细胞激活过程中Lck激酶的调控机制及其在炎症反应中的平衡作用 | T细胞受体信号通路中的关键蛋白DUSP22、UBR2和Lck | 机器学习 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 系统性红斑狼疮患者外周血T细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 194 | 2026-05-11 |
BIDCell: Biologically-informed self-supervised learning for segmentation of subcellular spatial transcriptomics data
2024-01-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44560-w
PMID:38218939
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研究论文 | 提出BIDCell框架，利用自监督深度学习结合细胞形态和基因表达数据，实现亚细胞空间转录组数据的细胞分割 | 引入生物信息指导的损失函数，融合单细胞转录组和细胞形态信息，实现高精度细胞分割，避免碎片化或过大细胞导致的污染表达 | 未提及具体限制，但可能依赖高质量参考数据且对新型组织类型泛化能力未知 | 开发改进的细胞分割方法，提升亚细胞空间转录组数据中细胞识别的准确性和基因分配精度 | 亚细胞空间转录组数据中的细胞 | 数字病理学 | NA | 亚细胞成像转录组学、单细胞转录组学 | 自监督深度学习框架 | 空间基因表达数据、细胞形态图像 | 多种组织类型和技术平台的数据集 | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 195 | 2026-05-11 |
Integrated epigenetic and transcriptional single-cell analysis of t(11;14) multiple myeloma and its BCL2 dependency
2024-01-04, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023020276
PMID:37729611
|
研究论文 | 整合单细胞ATAC-seq和RNA-seq分析t(11;14)多发性骨髓瘤及其BCL2依赖性 | 首次在原发性多发性骨髓瘤细胞中整合单细胞ATAC-seq和单细胞RNA-seq分析，深入解析t(11;14)多发性骨髓瘤的表观遗传调控组和转录组及其对venetoclax耐药性的影响 | 未明确说明 | 揭示t(11;14)多发性骨髓瘤对BCL2抑制剂的依赖性及其表观遗传调控机制 | t(11;14)多发性骨髓瘤患者 | 表观遗传学 | 多发性骨髓瘤 | ATAC-seq, RNA-seq | NA | 单细胞测序数据 | 原发性MM样本 | NA | NA | NA | NA |
| 196 | 2026-05-09 |
TooManyCellsInteractive: A visualization tool for dynamic exploration of single-cell data
2024-01-02, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae056
PMID:39172544
|
研究论文 | 介绍TooManyCellsInteractive (TMCI)，一种基于浏览器的JavaScript应用，用于交互式探索单细胞数据中的细胞群体 | 提供直观界面可视化径向树表示的分层细胞亚群，支持多分辨率覆盖、过滤和比较生物学特征 | NA | 开发一种用户友好的可视化工具，促进大规模单细胞测序数据的探索 | 药物耐受持久性细胞中的泛癌分析数据 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 197 | 2026-05-09 |
StereoSiTE: a framework to spatially and quantitatively profile the cellular neighborhood organized iTME
2024-01-02, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae078
PMID:39452614
|
研究论文 | 提出StereoSiTE框架，结合开源生物信息学工具和自定义算法，从空间转录组数据中推断免疫肿瘤微环境（iTME）中细胞邻域（CN）的功能性空间细胞相互作用强度（SCII） | 首次提供综合性分析框架，充分利用空间信息来精确推断细胞邻域内的空间细胞相互作用强度，并成功识别出由中性粒细胞主导的细胞邻域及其在治疗后的免疫肿瘤微环境重塑作用 | 仅应用于异种移植模型，可能需要在临床样本中进一步验证；框架的通用性和可扩展性尚未在多种数据类型和条件下全面测试 | 开发一种能够全面利用空间转录组数据、精确分析免疫肿瘤微环境中细胞邻域和空间细胞相互作用的分析框架 | 异种移植模型中的空间转录组数据集 | 计算生物学, 生物信息学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 多个样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 198 | 2026-05-09 |
demuxSNP: supervised demultiplexing single-cell RNA sequencing using cell hashing and SNPs
2024-01-02, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae090
PMID:39607981
|
研究论文 | 提出一种名为demuxSNP的监督算法，结合细胞哈希和单核苷酸多态性进行单细胞RNA测序的多重样本拆分 | 首次使用监督学习方法，同时利用细胞哈希和SNP两种数据模态进行样本拆分，提高了低质量哈希数据的分类准确性并克服了类别不平衡问题 | 要求生物学样本具有遗传差异，且依赖高质量哈希数据初步推断基因型 | 改进单细胞RNA测序多重样本拆分的准确性和稳健性 | 模拟数据和肾细胞癌真实数据 | 机器学习 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, 细胞哈希, SNP分析 | 最近邻算法 | 单细胞基因表达数据, 基因型数据 | 模拟数据（含5-50%双细胞率）及真实肾细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 199 | 2026-05-09 |
GPU-accelerated Kendall distance computation for large or sparse data
2024-01-02, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae088
PMID:39658191
|
研究论文 | 本文介绍了GADES，一个GPU加速的Kendall距离计算软件包，适用于大型或稀疏数据 | 提出利用GPU进行大规模并行Kendall-τ距离矩阵计算，通过特定内存管理突破GPU容量限制，并针对稀疏数据设计了额外加速算法 | 未提及具体局限性，可能依赖GPU硬件资源 | 开发高性能Kendall距离矩阵计算方法，实现大数据的高效处理 | 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | 数值数据 | 模拟数据集和真实单细胞测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 200 | 2026-05-09 |
Identification and experimental validation of cuproptosis regulatory program in a sepsis immune microenvironment through a combination of single-cell and bulk RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1336839
PMID:38947313
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研究论文 | 结合单细胞和批量RNA测序技术，识别并实验验证脓毒症免疫微环境中的铜死亡调控程序 | 首次在脓毒症中构建基于铜死亡的风险模型，并利用单细胞测序揭示铜死亡活性评分与单核细胞的关联及免疫微环境特征 | 未提及具体局限性，但可能包括模型验证样本量有限或体外实验的临床相关性需进一步验证 | 建立基于铜死亡的风险模型以诊断和预测脓毒症风险，并鉴定用于靶向治疗的铜死亡相关基因 | 脓毒症患者的免疫微环境及铜死亡相关基因 | 机器学习和数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、LASSO回归、Cox回归、流式细胞术、蛋白质印迹法、ELISA | LASSO回归模型、Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据 | 三个外部队列用于模型验证，具体样本量未在摘要中提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达分析 |