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当前共找到 1392 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-10 |
Multi-omics and single-cell sequencing analyses reveal the potential significance of circadian pathways in cancer therapy
2024 Jan-Feb, Expert review of molecular diagnostics
IF:3.9Q1
DOI:10.1080/14737159.2023.2296668
PMID:38288973
|
研究论文 | 通过多组学和单细胞测序分析揭示昼夜节律通路在癌症治疗中的潜在重要性 | 首次系统性地在泛癌水平上分析昼夜节律相关基因（CRGs）的表达、突变、甲基化及与免疫微环境的关系，并计算昼夜节律通路评分（CRS）以评估其作为免疫治疗标志物的潜力 | 仅依赖TCGA等公共数据库数据，缺乏大规模独立验证；未深入探讨CRGs调控肿瘤微环境的具体分子机制 | 探索昼夜节律相关基因在泛癌中的表达模式、预后价值及作为免疫治疗新靶点的可能性 | 泛癌（包括KIRC等多种肿瘤类型）的肿瘤样本及肿瘤微环境细胞 | 机器学习 | 泛癌（多类型肿瘤） | 多组学分析、单细胞测序、免疫组化（IHC）、单样本基因集富集分析（ssGSEA） | NA | 基因表达数据、拷贝数变异、单核苷酸变异、甲基化数据、单细胞测序数据 | 使用TCGA数据库中多个肿瘤类型的大规模样本，具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-07-10 |
The conserved wobble uridine tRNA thiolase Ctu1 is required for angiogenesis and embryonic development
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0315854
PMID:39705244
|
研究论文 | 研究发现保守性摆动尿苷tRNA硫醇酶Ctu1在血管生成和胚胎发育中起关键作用 | 首次在脊椎动物模型中揭示CTU1在血管生成和胚胎发育中的必要性 | 仅使用斑马鱼和人类内皮细胞模型，尚未涉及更复杂的哺乳动物模型或临床样本 | 确定Ctu1在血管生成和胚胎发育中的生物学功能 | 斑马鱼胚胎和人类内皮细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼胚胎样本和人类内皮细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达 |
| 3 | 2026-07-06 |
Designing Oligonucleotide-Based FISH Probe Sets with PaintSHOP
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3766-1_12
PMID:38502486
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研究论文 | 介绍PaintSHOP平台用于设计基于寡核苷酸的FISH探针集 | PaintSHOP是一个用户友好的网络平台，整合了大量预发现的探针库和功能序列数据库，并提供交互式工具用于探针设计 | 文中未明确讨论局限性 | 描述PaintSHOP平台在寡核苷酸FISH探针设计中的应用方法 | DNA寡核苷酸FISH探针 | 数字病理学 | NA | 荧光原位杂交(FISH) | NA | 核酸序列 | NA | NA | 空间转录组学, 空间基因组学 | NA | NA |
| 4 | 2026-07-05 |
Isolation and Single-Cell Transcriptomic Analysis of Murine Regulatory B Cells
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3754-8_12
PMID:38622400
|
研究论文 | 描述了从狼疮易感MRL/lpr小鼠中分离调节性B细胞并进行单细胞转录组分析的方法 | 首次在转录组水平上深入表征调节性B细胞，超越了表面标志物的传统方法 | 未提供实验结果的验证或大规模样本分析 | 建立调节性B细胞的分离方案以进行单细胞转录组分析，探究其在自身免疫和癌症免疫中的作用 | 从狼疮易感小鼠中分离的调节性B细胞 | 自然语言处理 | 自身免疫性疾病（狼疮） | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据（单细胞RNA测序） | 狼疮易感MRL/lpr小鼠（具体数量未说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序 |
| 5 | 2026-07-01 |
Deciphering the role of CX3CL1-CX3CR1 in aortic aneurysm pathogenesis: insights from Mendelian randomization and transcriptomic analyses
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1383607
PMID:38715600
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和转录组分析揭示CX3CL1-CX3CR1在主动脉瘤发病机制中的作用 | 首次通过孟德尔随机化分析结合单细胞RNA测序技术，系统阐明CX3CL1-CX3CR1信号通路在主动脉瘤中介导内皮细胞与中间单核细胞相互作用的遗传机制 | 基于公开数据库的分析可能存在人群偏倚，且孟德尔随机化结果需进一步实验验证 | 探索炎症相关细胞因子和免疫特征与主动脉瘤的因果关系，并解析CX3CL1-CX3CR1信号通路的致病机制 | 主动脉瘤患者的血液免疫特征、主动脉组织转录组数据及单细胞测序数据 | 机器学习、数字病理学 | 主动脉瘤 | 孟德尔随机化分析、批量RNA测序、单细胞RNA测序、多重免疫荧光染色、Cellchat分析 | na | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 91种循环炎症蛋白和731种免疫特征的GWAS数据，以及批量RNA测序和单细胞RNA测序的公共数据集 | na | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | na | na |
| 6 | 2026-07-01 |
Single-cell transcriptomics reveals a role for pancreatic duct cells as potential mediators of inflammation in diabetes mellitus
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1381319
PMID:38742118
|
research paper | 通过单细胞转录组学揭示胰管细胞在糖尿病炎症中可能作为介质的作用 | 首次发现胰管细胞亚群在所有胰腺细胞类型中呈现独特的促炎特征，为理解胰岛炎症传播机制提供新视角 | 未提及具体局限性 | 探索暴露于炎症环境的人类胰腺细胞的细胞类型特异性分子反应 | 原代人胰腺细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病 | single-cell RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 未明确提及样本量 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 7 | 2026-07-01 |
Network-based pharmacology and UHPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS reveal Jinhua Qinggan granule's mechanism in reducing cellular inflammation in COVID-19
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1382524
PMID:39026676
|
研究论文 | 通过网络药理学和UHPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS技术揭示金花清感颗粒在新冠肺炎中减轻细胞炎症的机制 | 本研究结合UHPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS、网络药理学和单细胞RNA测序技术，系统分析了金花清感颗粒的活性成分及其在免疫细胞调控中的作用，揭示其通过调节中性粒细胞、单核细胞等免疫细胞活性来减轻新冠肺炎炎症的机制 | NA | 探究金花清感颗粒在治疗新冠肺炎中的疗效和作用机制 | 金花清感颗粒的活性成分及其对新冠肺炎患者外周血单核细胞中免疫细胞的影响 | 网络药理学 | 新冠肺炎 | UHPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS, 单细胞RNA测序 | NA | 质谱数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-07-01 |
B-cell immune dysregulation with low soluble CD22 levels in refractory seronegative myasthenia gravis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1382320
PMID:38711503
|
research paper | 本研究通过单细胞RNA测序和血浆蛋白质组分析，揭示了难治性血清阴性重症肌无力患者中以B细胞为中心的免疫失调及可溶性CD22水平降低的免疫病理机制 | 首次利用单细胞RNA测序联合血浆蛋白质组学分析，阐明难治性血清阴性MG中B细胞免疫失调与可溶性CD22水平降低的关联，为B细胞靶向治疗提供新方向 | 样本量较小（仅30名女性参与者），且仅限于外周血分析，未涉及组织或中枢免疫器官的免疫状态验证 | 阐明血清阴性重症肌无力的免疫病理机制，探索免疫失调状态与疾病严重程度的关系 | 30名女性患者（10名健康对照、10名早发型AChR阳性MG、10名难治性早发型血清阴性MG）的外周血样本 | machine learning | geriatric disease | single-cell RNA-seq, plasma proteome analysis | NA | gene expression data, proteomic data | 30例女性患者外周血样本（每组10例，治疗前后对比） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-07-01 |
Data Analysis Pipeline for scRNA-seq Experiments to Study Early Oogenesis
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3698-5_15
PMID:38351456
|
研究论文 | 介绍用于研究早期卵子发生的单细胞RNA测序数据分析流程 | 针对生殖细胞发育过程中异步分化和高度细胞异质性的挑战，利用单细胞RNA测序技术以单细胞分辨率揭示转录调控机制 | 未明确说明局限性 | 描述如何使用单细胞RNA测序分析早期雌性生殖细胞发育 | 小鼠E11.5至E14.5卵巢中的早期生殖细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自小鼠E11.5至E14.5卵巢的样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 10 | 2026-07-01 |
Integrating genomics and AI to uncover molecular targets for mRNA vaccine development in lupus nephritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1381445
PMID:39430760
|
研究论文 | 整合基因组学与人工智能，揭示狼疮性肾炎mRNA疫苗开发的分子靶点 | 将单细胞基因组学与无矩阵分解和机器学习算法相结合，系统识别狼疮性肾炎中潜在的mRNA疫苗靶点 | 信息来源有限，无法确定具体局限性 | 通过单细胞和批量转录组数据，利用机器学习识别LN中mRNA疫苗开发的潜在分子靶点 | 24名狼疮性肾炎患者和10名健康对照的单个核细胞，以及额外患者和对照的批量RNA-seq数据 | 机器学习 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 非负矩阵分解，机器学习算法 | 基因表达数据 | 24例LN患者和10例健康对照的单个核细胞，以及额外LN患者和对照的批量RNA-seq样本 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-06-30 |
Inferring Gene Regulatory Networks and Predicting the Effect of Gene Perturbations via IQCELL
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2022_465
PMID:36790623
|
方法论文 | 提出IQCELL平台，从单细胞RNA测序数据推断布尔基因调控网络，并可模拟正常和扰动条件下的网络行为 | 提供了一个从原始数据集开始实现IQCELL的详细指南，包括数据处理、信息基因推断、基因调控网络推断以及在正常和扰动条件下的网络模拟 | NA | 提供一种从单细胞RNA测序数据推断布尔基因调控网络并预测基因扰动效应的平台 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 布尔网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-06-30 |
Single-Cell mRNA-sncRNA Co-sequencing of Preimplantation Embryos
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2023_487
PMID:37278916
|
研究论文 | 提出了一种单细胞mRNA-sncRNA共测序方法，用于研究植入前胚胎的细胞动力学 | 首次在同一胚胎单细胞中同时进行mRNA和小非编码RNA测序，实现了多组学联合分析 | 未提及具体限制，但可能涉及技术复杂性和细胞损伤风险 | 开发单细胞多组学方法以深入理解植入前胚胎发育的细胞动态 | 小鼠和人类的植入前胚胎单个细胞 | 数字病理学 | 不适用 | Smart-Seq2, Small-Seq | 不适用 | 转录组数据, 小非编码RNA数据 | 单个胚胎细胞（具体数量未提及） | 不适用 | 单细胞RNA-seq, 单细胞小非编码RNA-seq | Smart-Seq2, Small-Seq | 在同一个胚胎单细胞上依次进行Smart-Seq2和Small-Seq |
| 13 | 2026-06-30 |
Evaluation of Stem-Cell Embryo Models by Integration with a Human Embryo Single-Cell Transcriptome Atlas
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2023_492
PMID:37351839
|
研究论文 | 通过整合人类胚胎单细胞转录组图谱评估干细胞胚胎模型 | 提出了一种整合不同实验室和不同技术获取的单细胞数据集的分析方法，用于比较和优化干细胞来源的胚胎模型 | 未明确说明局限性 | 改进对人类胚泡模型的评估，通过单细胞分辨率与胚胎转录组图谱的整合分析来优化干细胞胚胎模型 | 人类胚泡模型（类囊胚）、人类胚胎数据集和二维体外早期发育模型系统数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本数据（单细胞转录组数据） | 涉及多个实验室和技术的多个单细胞数据集，未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-06-29 |
Single-cell sequencing reveals SATB2/NOTCH1 signaling promotes the progression of malignancy of epithelial cells from papillary thyroid cancer
2024-01, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23631
PMID:37877736
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示SATB2/NOTCH1信号通路促进甲状腺乳头状癌上皮细胞恶性进展 | 首次利用单细胞RNA测序构建了新的甲状腺乳头状癌RNA表达谱，发现一个高度侵袭性的上皮细胞亚群，并证实SATB2/NOTCH1通路是导致该亚群高致癌性的关键机制 | 样本量较小，仅包含4例PTC患者和1例良性肿瘤患者，且缺乏功能验证实验的详细描述 | 探索甲状腺乳头状癌上皮细胞从良性向恶性转化的分子机制及关键调控通路 | 甲状腺乳头状癌患者和良性甲状腺肿瘤患者的组织样本 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 4例甲状腺乳头状癌患者和1例良性甲状腺肿瘤患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-06-26 |
Non-coding genome contribution to ALS
2024, International review of neurobiology
DOI:10.1016/bs.irn.2024.04.002
PMID:38802183
|
综述 | 总结非编码基因组在肌萎缩侧索硬化症（ALS）遗传风险中的作用，并强调细胞特异性功能注释的重要性 | 提出通过单细胞表观遗传图谱和空间转录组学改进细胞特异性基因组功能注释，以揭示非编码风险变异的功能，并解决编码与非编码变异之间的明显矛盾 | 未提供具体实验数据或样本分析，主要基于现有文献总结和理论推测 | 探索非编码基因组在ALS遗传病因学中的贡献，推动针对未解遗传因素的研究 | ALS疾病相关的非编码基因组变异及其在中枢神经系统细胞类型中的功能影响 | 自然语言处理 | 肌萎缩侧索硬化症 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 16 | 2026-06-26 |
Predictive biomarkers and initial analysis of maternal immune alterations in postpartum preeclampsia reveal an immune-driven pathology
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1380629
PMID:38745664
|
研究论文 | 本研究探讨产后子痫前期的母体免疫变化及其预测生物标志物，揭示免疫驱动的病理机制 | 首次在产后子痫前期患者诊断时进行单细胞转录组分析，发现胎盘CD163+细胞和孕早期血压作为预测生物标志物的潜力 | 样本采集时间点不一致（产后48小时至25天），且为初步研究，需要更大规模验证 | 理解产后子痫前期的免疫贡献及识别围产期预测生物标志物 | 产后子痫前期患者和正常妊娠女性的胎盘和血液样本 | 机器学习 | 妊娠期疾病 | 单细胞转录组学,流式细胞术,细胞内细胞因子染色,免疫组化 | NA | 文本,图像 | 产后子痫前期患者和正常妊娠对照组，具体数量未在摘要中提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 17 | 2026-06-26 |
Protocol of a prospective multicenter study on comorbidity impact on multiple sclerosis and antibody-mediated diseases of the central nervous system (COMMIT)
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1380025
PMID:39021565
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研究论文 | 一项前瞻性多中心研究方案，探讨共病对多发性硬化及中枢神经系统抗体介导疾病的影响 | 首次系统研究血管共病对MS、NMOSD和MOGAD临床及旁临床参数的影响，结合多种先进技术进行标志物分析 | 未提及具体局限性 | 评估共病（尤其是血管共病）及相关风险因素对MS、NMOSD和MOGAD临床和旁临床参数的影响 | MS、NMOSD和MOGAD患者（有或无共病）以及健康对照者 | 机器学习 | 多发性硬化, 视神经脊髓炎谱系疾病, MOG抗体相关疾病 | 蛋白质组学、超敏ELISA、RT-qPCR、质谱流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 外周血和脑脊液样本数据、OCT图像、MRI图像 | 多中心前瞻性研究，样本量未具体说明 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 18 | 2026-06-26 |
Dynamic immune status analysis of peripheral blood mononuclear cells in patients with Klebsiella pneumoniae bloodstream infection sepsis using single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1380211
PMID:38898888
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析肺炎克雷伯菌血流感染脓毒症患者外周血单个核细胞的动态免疫状态 | 首次利用单细胞RNA测序技术研究肺炎克雷伯菌血流感染引起的脓毒症在急性期和恢复期外周血单个核细胞的免疫状态变化 | 样本量较小（共13名受试者），可能限制结果的一般性和统计效力 | 分析肺炎克雷伯菌血流感染脓毒症患者外周血单个核细胞在急性期和恢复期的免疫状态变化 | 外周血单个核细胞 | 机器学学习 | 肺炎克雷伯菌血流感染脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 13名受试者，包括3名健康对照、7名急性期患者（其中4名死亡）和3名恢复期患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-06-26 |
Distinct cuproptosis patterns in hepatocellular carcinoma patients correlate with unique immune microenvironment characteristics and cell-cell communication, contributing to varied overall survival outcomes
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1379690
PMID:38868777
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研究论文 | 探讨肝癌患者铜死亡模式与免疫微环境特征及细胞间通讯的关联，以及对总生存期的影响 | 首次揭示铜死亡相关基因在肝细胞癌中与免疫微环境和细胞间通讯的关联，并构建了基于铜死亡相关基因的预后风险模型 | 未提及具体局限性信息 | 探索肝细胞癌中细胞铜死亡与免疫微环境的相关性，为免疫治疗提供潜在见解 | 肝细胞癌患者的铜死亡相关基因表达、免疫微环境及细胞间通讯 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, LASSO Cox分析, WGCNA, 共识聚类 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | TCGA数据库和GEO数据库的肝癌患者样本（具体数量未提及） | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq（推测） | TCGA和GEO数据库来源的测序数据， 平台细节未明确提供 |
| 20 | 2026-06-20 |
SORC: an integrated spatial omics resource in cancer
2024-01-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad820
PMID:37811897
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研究论文 | 开发了一个整合的癌症空间组学资源SORC，用于可视化和分析癌症空间转录组数据 | 首次构建了涵盖17种癌症类型、269个切片共计722,899个点的综合空间组学资源，并整合了匹配的单细胞RNA-seq数据，提供五大分析模块 | 未明确提及局限性 | 提供一个全面的空间解析癌症细胞图谱，增强对肿瘤微环境的理解 | 17种癌症类型的空间转录组数据集，包括722,899个点、269个切片，以及匹配的334,379个单细胞和46种细胞类型 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 图像 | 269个切片、722,899个点、334,379个单细胞、46种细胞类型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |