单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 436 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-05 |
Integrative transcriptome and single-cell sequencing technology analysis of the potential therapeutic benefits of oleanolic acid in liver injury and liver cancer
2023-12-20, Aging
DOI:10.18632/aging.205349
PMID:38127054
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研究论文 | 本研究探讨了oleanolic acid在肝损伤和肝癌中的潜在治疗作用机制 | 发现oleanolic acid通过提高HMOX1的表达来抑制肝损伤并促进肝再生 | 没有提及具体的临床试验或动物实验数据 | 调查oleanolic acid在肝损伤和肝癌中抑制作用的机制 | oleanolic acid及其在肝损伤和肝癌中的靶点 | 数字病理学 | 肝癌 | 分子对接技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 162 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of bulk RNA-seq and single-cell RNA-seq reveals the function of pyrocytosis in the pathogenesis of abdominal aortic aneurysm
2023-12-18, Aging
DOI:10.18632/aging.205350
PMID:38112597
|
研究论文 | 本研究探讨了细胞凋亡在腹主动脉瘤(AAA)发病机制中的作用 | 首次整合了大宗RNA测序和单细胞RNA测序数据，揭示了与细胞凋亡相关的中心基因及其在AAA中的诊断模型 | 该研究仅基于两个公共RNA-seq数据集，样本量可能不足以代表所有AAA患者 | 研究细胞凋亡在腹主动脉瘤发病机制中的具体功能 | 识别与细胞凋亡相关的关键基因和免疫细胞 | 数字病理学 | 腹主动脉瘤 | RNA测序 | LASSO Cox回归分析 | 基因表达数据 | 2个RNA-seq数据集，共计24个与细胞凋亡相关的差异表达基因 |
| 163 | 2024-08-05 |
Machine learning algorithm integrates bulk and single-cell transcriptome sequencing to reveal immune-related personalized therapy prediction features for pancreatic cancer
2023-12-12, Aging
DOI:10.18632/aging.205293
PMID:38095640
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研究论文 | 本研究揭示了与免疫相关的个性化疗法预测特征，用于胰腺癌的治疗 | 首次结合了整体和单细胞转录组测序，以识别胰腺癌的免疫相关分类器 | 样本规模和临床验证可能会限制研究的广泛应用 | 探讨肿瘤免疫环境(TIME)在胰腺癌个性化治疗中的作用 | 胰腺癌患者，特别是不同免疫亚型的患者 | 机器学习 | 胰腺癌 | 转录组测序 | 共识聚类 | 基因表达数据 | 1612免疫相关基因的分析样本 |
| 164 | 2024-08-05 |
Conjoint research of WGCNA, single-cell transcriptome and structural biology reveals the potential targets of IDD development and treatment and JAK3 involvement
2023-12-12, Aging
DOI:10.18632/aging.205289
PMID:38095643
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研究论文 | 本研究通过整合多种技术，探索椎间盘退变（IDD）的关键基因及JAK3的作用 | 首次结合WGCNA、单细胞转录组学和结构生物学分析，识别出与IDD相关的新型天然化合物 | 研究的样本规模和自然化合物的临床验证仍需进一步拓展 | 揭示椎间盘退变的关键基因及JAK3在治疗中的潜在靶点 | 主要研究IDD的4个关键基因及天然化合物对JAK3的影响 | 数字病理学 | 椎间盘退变 | WGCNA, 单细胞RNA测序, 结构生物学方法 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 165 | 2024-08-05 |
Integrative analysis of single-cell and bulk RNA seq to reveal the prognostic model and tumor microenvironment remodeling mechanisms of cuproptosis-related genes in colorectal cancer
2023-12-08, Aging
DOI:10.18632/aging.205324
PMID:38078879
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研究论文 | 该论文结合单细胞和大规模RNA测序分析铜死亡相关基因在结直肠癌中的预后模型和肿瘤微环境重塑机制 | 本研究提出了一个通过铜死亡相关基因预测结直肠癌预后的新框架，并揭示了COX17在T细胞疲惫中的新角色 | 尚未深入探讨铜死亡相关基因对结直肠癌发展的具体影响机制 | 探讨铜死亡相关基因在结直肠癌发展中的作用及其对预后的影响 | 61个铜死亡相关基因及其在结直肠癌患者中的表达 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq, scRNA-seq, IHC, qPCR | Lasso-Cox模型 | RNA数据 | 使用了结直肠癌患者的样本进行分析 |
| 166 | 2024-08-05 |
Integrating scRNA-seq and bulk RNA-seq to characterize infiltrating cells in the colorectal cancer tumor microenvironment and construct molecular risk models
2023-12-05, Aging
DOI:10.18632/aging.205263
PMID:38054820
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研究论文 | 本文探讨了结直肠癌肿瘤微环境中渗透细胞的特征，并构建了分子风险模型 | 首次将scRNA-seq和bulk RNA-seq数据整合，构建了详细的细胞分化轨迹和细胞间互动分析 | 研究主要依赖于已有的数据集，可能无法全面反映所有结直肠癌患者的特征 | 探究结直肠癌微环境中细胞成分及其相互作用，开发预后模型 | 研究对象为结直肠癌患者中的多种细胞类型及其相互作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 741个标志基因 |
| 167 | 2024-08-04 |
Hofbauer cells and fetal brain microglia share transcriptional profiles and responses to maternal diet-induced obesity
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.16.571680
PMID:38187648
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研究论文 | 本研究探讨了母体饮食诱导肥胖对胎儿大脑小胶质细胞和霍夫鲍尔细胞的转录组影响 | 首次证明霍夫鲍尔细胞可以作为胎儿大脑小胶质细胞发育的非侵入性生物标志物 | 研究主要基于小鼠模型，尚需在其他动物模型或人类中验证 | 识别反映胎儿大脑小胶质细胞程序的非侵入性生物标志物以支持干预 | 小鼠模型中的胎儿大脑小胶质细胞和胎盘霍夫鲍尔细胞 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用小鼠模型进行的实验，样本数量未详细说明 |
| 168 | 2024-08-05 |
Single-cell profiling reveals the impact of genetic alterations on the differentiation of inflammation-induced colon tumors
2023-Dec-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.30.569463
PMID:38077052
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研究论文 | 这篇文章揭示了遗传改变对炎症诱导的结肠肿瘤分化的影响 | 首次使用单细胞RNA测序分析了不同遗传突变在结肠肿瘤细胞分化中的作用 | 研究仅基于小鼠模型，可能无法完全反映人类结肠癌的形成机制 | 探索炎症诱导的结肠肿瘤中遗传突变与细胞分化之间的关系 | 使用小鼠模型研究具有不同遗传突变的结肠肿瘤 | 数字病理学 | 结肠癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同突变类型的结肠肿瘤样本 |
| 169 | 2024-08-05 |
Genomic and transcriptomic advances in amyotrophic lateral sclerosis
2023-12, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2023.102126
PMID:37972860
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研究论文 | 本文综述了基因组学、表观基因组学、转录组学和微RNA在肌萎缩侧索硬化症(ALS)研究中的应用 | 提出了微RNA作为潜在生物标志物和分子干预的有前景工具 | 至今尚缺乏有效的ALS治疗方法 | 深入探讨ALS的发展和维持的分子机制 | 与ALS发病机制相关的主要基因及其表观修饰 | 数字病理学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 高通量测序技术 | 体外及体内模型 | 基因组数据，转录组数据 | NA |
| 170 | 2024-08-04 |
Hyperactive mTORC1 in lung mesenchyme induces endothelial cell dysfunction and pulmonary vascular remodeling
2023-Dec-20, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI172116
PMID:38127441
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research paper | 该研究探讨了肺间质中mTORC1的过度活跃如何导致内皮细胞功能障碍和肺血管重塑 | 本研究提出了肺间质细胞与内皮细胞之间的配体-受体间相互作用，强调了在LAM及其他mTORC1驱动疾病中改变的间质细胞与内皮细胞轴的重要性 | 当前研究的限制是未能探讨TSC2突变对内皮细胞的直接影响 | 研究LAM细胞如何与内皮细胞相互作用，以引发血管重塑 | 使用含有Tsc2基因缺失的mTORC1功能获得小鼠模型来研究肺间质细胞与内皮细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | Tbx4LME-Cre Tsc2fl/fl小鼠模型 | 基因组数据 | 涉及1年的Tbx4LME-Cre Tsc2fl/fl小鼠 |
| 171 | 2024-08-04 |
Construction and Validation of a Prognostic Model Based on Novel Senescence-Related Genes in Non-Small Cell Lung Cancer Patients with Drug Sensitivity and Tumor Microenvironment
2023-12, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300190
PMID:37518773
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研究论文 | 本文开发了一种基于新颖衰老相关基因的预后模型，以评估非小细胞肺癌患者的药物敏感性和肿瘤微环境 | 提出了一种新的预后系统，基于12个衰老基因的表达，评估肺腺癌患者的生存风险 | 研究主要依赖于TCGA和GEO数据库的数据，可能会受到数据集的限制 | 研究衰老相关基因在非小细胞肺癌中对预后的影响 | 非小细胞肺癌（LUAD）患者以及相关细胞系 | 数字病理学 | 肺癌 | LASSO Cox回归 | NA | 基因表达数据 | 基于TCGA和GEO数据集的样本，具体数量未在摘要中说明 |
| 172 | 2024-08-05 |
ALOX5 acts as a key role in regulating the immune microenvironment in intrahepatic cholangiocarcinoma, recruiting tumor-associated macrophages through PI3K pathway
2023-12-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04804-1
PMID:38124204
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研究论文 | 研究ALOX5在调控肝内胆管癌免疫微环境中的关键作用 | 揭示了ALOX5通过其代谢产物LTB4招募M2型巨噬细胞的机制 | 未明确提出在临床应用中的具体限制 | 探讨ALOX5调控肿瘤相关巨噬细胞的潜在机制及其靶向治疗的转化效果 | ALOX5及其代谢产物与肝内胆管癌中肿瘤相关巨噬细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，多重免疫荧光分析 | NA | 组织样本，细胞培养模型 | 在小鼠异种移植肿瘤实验中使用的样本数量未详细说明 |
| 173 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics analysis identifies a unique tumor-promoting function of the meningeal stroma in melanoma leptomeningeal disease
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.18.572266
PMID:38187574
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研究论文 | 本研究描述了在黑色素瘤脑膜下疾病中脑膜间质的肿瘤促进功能 | 首次揭示了脑膜间质在黑色素瘤LMD中的肿瘤促进作用及其机制 | 仅针对特定肿瘤微环境进行研究，结果可能不适用于其它类型的转移性肿瘤 | 研究黑色素瘤脑膜下疾病的肿瘤微环境与肿瘤细胞之间的相互作用 | 侧重于黑色素瘤LMD的脑膜组织及对应的外脑转移位点 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组分析 | NA | 组织样本 | NA |
| 174 | 2024-08-05 |
Genomic Insights into Molecular Regulation Mechanisms of Intramuscular Fat Deposition in Chicken
2023-12-10, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14122197
PMID:38137019
|
综述 | 本文综述了影响鸡肉中 intramuscular fat (IMF) 沉积的分子调控机制 | 通过多种基因组学方法，系统描述了与IMF沉积相关的遗传和表观遗传因素 | NA | 探索鸡肉中IMF沉积的分子调控机制 | 鸡肉中的内脏脂肪沉积 | 数字病理学 | NA | 全基因组关联研究, 整个转录组测序, 蛋白质组测序, 单细胞RNA测序, 高通量染色体构象捕获, DNA甲基化测序, mA甲基化测序 | NA | NA | NA |
| 175 | 2024-08-04 |
Comparative Analysis of Single-cell and Single-nucleus RNA-sequencing in a Rabbit Model of Retinal Detachment-related Proliferative Vitreoretinopathy
2023-Dec, Ophthalmology science
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.xops.2023.100335
PMID:37496518
|
研究论文 | 本研究比较了兔子模型中与视网膜脱离相关的增生性玻璃体视网膜病的单细胞和单核RNA测序 | 创新点在于结合使用单细胞RNA测序和单核RNA测序，以更准确地识别与增生性玻璃体视网膜病相关的转录网络 | 两种RNA测序技术的局限性均被强调，特别是在细胞类型捕获率方面 | 研究增生性玻璃体视网膜病的发病机制 | 使用兔子模型诱导的单侧增生性玻璃体视网膜病变 | 数字病理学 | 增生性玻璃体视网膜病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 兔子眼睛的增生性玻璃体视网膜病样本及对侧眼作为对照 |
| 176 | 2024-08-05 |
Molecular heterogeneity of quiescent melanocyte stem cells revealed by single-cell RNA-sequencing
2023-Dec-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.19.571712
PMID:38187565
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了休眠黑素细胞干细胞的分子异质性 | 确认了休眠黑素细胞干细胞亚群的分子特征，并鉴定了新的亚群 | 研究可能受限于小鼠模型的生物限制 | 研究黑素细胞干细胞的转录组特征及其异质性 | 成人女性C57BL/6J小鼠的休眠黑素细胞干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从小鼠皮肤中分离KIT+/CD45-细胞的样本 |
| 177 | 2024-08-05 |
Interleukin-17-mediated protective cytokine signaling against degeneration of the retinal pigment epithelium
2023-Dec-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2311647120
PMID:38085785
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研究论文 | 本研究探讨了IL-17介导的细胞因子信号在视网膜色素上皮退化中的保护作用。 | 首次揭示了脉络膜γδ T细胞在视网膜色素上皮损伤后的保护性细胞因子信号机制。 | 本研究主要基于小鼠模型，可能限制了结果的广泛适用性。 | 探讨IL-17信号通路在视网膜色素上皮退化中的作用。 | 研究对象是小鼠脉络膜中的免疫细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞免疫资料 | 小鼠模型 |
| 178 | 2024-08-05 |
Lymph node stromal cell responses to perinatal T cell waves, a temporal atlas
2023-Dec-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2316957120
PMID:38079541
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研究论文 | 这篇文章探讨了围产期T细胞在淋巴结中的独特环境及其演变。 | 文章创新性地利用单细胞RNA测序生成初期淋巴结生态的地图，并揭示了基质细胞和T细胞之间的相互作用。 | 没有提及本研究的具体局限性。 | 阐明围产期T细胞在淋巴结中如何生成和作用。 | 主要研究小鼠的围产期调节性T细胞及其在淋巴结中的反应。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 未具体说明样本数量，但涉及小鼠的研究 |
| 179 | 2024-08-04 |
The activation of SIRT1 by resveratrol reduces breast cancer metastasis to lung through inhibiting neutrophil extracellular traps
2023-12, Journal of drug targeting
IF:4.3Q1
DOI:10.1080/1061186X.2023.2265585
PMID:37772906
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研究论文 | 这项研究探讨了白藜芦醇对乳腺癌转移到肺部的影响。 | 该研究首次将白藜芦醇与抑制中性粒细胞外陷阱的作用联系起来，展示了其对乳腺癌转移的治疗潜力。 | 该研究在小鼠模型中进行，可能无法完全反映人类的生理条件。 | 研究白藜芦醇通过抑制中性粒细胞外陷阱来减少乳腺癌转移的机制。 | 主要研究对象为乳腺癌转移及中性粒细胞外陷阱。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | 小鼠正位4T1乳腺癌模型 | 血清样本 | 小鼠乳腺癌模型中的样本数量未具体提到 |
| 180 | 2024-08-05 |
A targeted CRISPR-Cas9 mediated F0 screen identifies genes involved in establishment of the enteric nervous system
2023-Dec-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.28.573581
PMID:38234831
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研究论文 | 本研究利用CRISPR-Cas9介导的筛查识别参与肠神经系统建立的基因 | 使用高效的CRISPR筛查方法，发现新基因进而推动肠神经系统的研究 | 研究仅限于斑马鱼模型，可能不完全适用于其他脊椎动物 | 探讨和识别参与肠神经系统发育的基因 | 以斑马鱼为模型研究肠神经系统的形成与基因调控 | 数字病理学 | Hirschsprung病 | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |