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当前共找到 436 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-10-16 |
Dynamic profiling of immune microenvironment during anti-PD-1 immunotherapy for head and neck squamous cell carcinoma: the IPRICE study
2023-Dec-08, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-11672-x
PMID:38066522
|
研究论文 | 研究旨在通过动态分析免疫微环境，识别预测头颈部鳞状细胞癌患者对PD-1免疫疗法反应的因素 | 采用多学科方法，包括空间转录组学和单细胞RNA测序，以深入了解免疫疗法的抗性和反应机制 | 研究为单中心、前瞻性、非随机、开放标签的干预性临床试验，样本量有限 | 识别预测头颈部鳞状细胞癌患者对PD-1免疫疗法反应的因素 | 54名接受PD-1免疫疗法的头颈部鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床数据、医学影像 | 54名复发/转移性头颈部鳞状细胞癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 162 | 2024-10-16 |
Quartets enable statistically consistent estimation of cell lineage trees under an unbiased error and missingness model
2023-Dec-01, Algorithms for molecular biology : AMB
IF:1.5Q3
DOI:10.1186/s13015-023-00248-w
PMID:38041123
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研究论文 | 研究了在肿瘤细胞进化历史重建中，基于四元组（quartets）的方法在面对无偏误差和缺失数据模型时的统计一致性 | 提出了基于四元组的方法，证明了其在高度未解析的模型树和定义为假阴性分支数量的误差情况下的统计一致性 | 文章主要集中在理论分析，未详细讨论实际应用中的具体实施和效果 | 研究肿瘤进化历史的重建方法，特别是在面对单细胞测序数据中的稀疏性和错误时的有效性 | 肿瘤细胞的进化树重建 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 四元组（quartets） | 分子序列 | 四细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 163 | 2024-10-16 |
Single-Cell Profiling of Premature Neonate Airways Reveals a Continuum of Myeloid Differentiation
2023-12, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2022-0293OC
PMID:37643399
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研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序技术分析极早产新生儿气道中的细胞类型，揭示了髓系分化的连续性 | 首次在极早产新生儿气道中进行单细胞RNA测序，识别出髓系细胞的不同分化轨迹 | 研究样本量较小，仅限于极早产新生儿，且依赖于临床干预的采样方法 | 探索单细胞RNA测序在极早产新生儿气道细胞类型分析中的应用 | 极早产新生儿气道中的细胞类型及其髓系分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 10名极早产新生儿 | NA | NA | NA | NA |
| 164 | 2024-10-14 |
Single-cell transcriptomic atlas of distinct early immune responses induced by SARS-CoV-2 Proto or its variants in rhesus monkey
2023-Dec, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.432
PMID:38020713
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研究论文 | 研究了SARS-CoV-2原型及其变种在恒河猴模型中诱导的早期免疫反应的单细胞转录组图谱 | 首次在非人灵长类动物模型中系统分析了SARS-CoV-2原型及其变种诱导的早期免疫反应的动态变化 | 研究仅限于恒河猴模型，结果可能不完全适用于人类 | 揭示SARS-CoV-2及其变种在感染早期诱导的免疫反应动态变化 | SARS-CoV-2原型及其Alpha、Beta和Delta变种在恒河猴中的免疫反应 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 恒河猴模型中的外周血单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 165 | 2024-10-13 |
Improved cell-type identification and comprehensive mapping of regulatory features with spatial epigenomics 96-channel microfluidic platform
2023-Dec, GEN biotechnology
IF:2.0Q3
DOI:10.1089/genbio.2023.0044
PMID:39380764
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研究论文 | 本文比较了50通道和96通道平台上的空间表观基因组分析，展示了96通道微流控芯片在细胞类型识别和调控元件识别方面的显著改进 | 开发了96通道微流控芯片，显著提高了细胞类型识别和调控元件识别的精度 | NA | 研究空间表观基因组学工具在细胞类型识别和调控元件识别中的应用 | 大脑结构中的胶质细胞和神经元定位以及控制细胞功能的顺式调控元件 | 数字病理学 | NA | 空间ATAC-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 166 | 2024-10-09 |
scResolve: Recovering single cell expression profiles from multi-cellular spatial transcriptomics
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.18.572269
PMID:38187629
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scResolve的方法，用于从多细胞空间转录组学测量中恢复单细胞表达谱 | scResolve能够准确恢复单细胞在其位置上的表达谱，这是细胞类型反卷积无法实现的 | NA | 开发一种方法来恢复多细胞空间转录组学测量中的单细胞表达谱 | 人类乳腺癌数据和人类肺部疾病数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 人类乳腺癌和肺部疾病数据 | NA | NA | NA | NA |
| 167 | 2024-09-28 |
Elucidating dynamic cell lineages and gene networks in time-course single cell differentiation
2023-Dec, Artificial intelligence in the life sciences
DOI:10.1016/j.ailsci.2023.100068
PMID:37426065
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研究论文 | 本文开发了一种名为Cell Smoothing Transformation (CellST)的机器学习框架，用于阐明细胞分化过程中的动态细胞谱系和基因网络 | CellST能够为每个单独细胞构建轨迹并跟踪其行为，不同于现有方法构建单一的细胞群轨迹，并且能够预测较少见的细胞类型的命运 | NA | 追踪细胞分化行为，重建细胞谱系并预测细胞命运 | 单细胞RNA测序数据中的细胞谱系和基因网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 机器学习框架 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 168 | 2024-09-27 |
Comprehensive analysis of scRNA-Seq and bulk RNA-Seq data reveals dynamic changes in tumor-associated neutrophils in the tumor microenvironment of hepatocellular carcinoma and leads to the establishment of a neutrophil-related prognostic model
2023-Dec, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03567-4
PMID:38006433
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研究论文 | 研究分析了肝细胞癌中单细胞测序和批量RNA测序数据，揭示了肿瘤相关中性粒细胞在肿瘤微环境中的动态变化，并建立了一个与中性粒细胞相关的预后模型 | 首次通过单细胞测序数据识别出271个肿瘤相关中性粒细胞的标记基因，并基于TCGA数据建立了包含八个基因的预后模型 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据，可能存在数据偏差和样本量不足的问题 | 探索肿瘤相关中性粒细胞在肝细胞癌肿瘤微环境中的作用，并建立预后模型 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的肿瘤相关中性粒细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | 预后模型 | RNA测序数据 | 12个肝细胞癌肿瘤核心和5个肝细胞癌癌旁组织 | NA | NA | NA | NA |
| 169 | 2024-09-27 |
Unraveling intratumoral complexity in metastatic dermatofibrosarcoma protuberans through single-cell RNA sequencing analysis
2023-Dec, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03577-2
PMID:37938367
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示转移性皮肤纤维肉瘤中的肿瘤内复杂性 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了皮肤纤维肉瘤中的肿瘤内异质性，并提供了全面的单细胞转录组图谱 | NA | 揭示皮肤纤维肉瘤中的肿瘤内异质性和分子机制 | 皮肤纤维肉瘤的原发部位、卫星灶和淋巴结转移样本 | 数字病理学 | 皮肤纤维肉瘤 | 单细胞RNA测序 | t-分布随机邻域嵌入分析 | RNA | 原发部位、卫星灶和淋巴结转移样本 | NA | NA | NA | NA |
| 170 | 2024-09-23 |
Blockade of IL-6R prevents preterm birth and adverse neonatal outcomes
2023-Dec, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2023.104865
PMID:37944273
|
研究论文 | 研究探讨了IL-6R阻断剂在预防早产和不良新生儿结局中的作用 | 首次证明了IL-6R阻断剂可以有效预防由无菌性羊膜内炎症引起的早产和不良新生儿结局 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类临床试验中验证 | 探讨IL-6R阻断剂在预防早产和不良新生儿结局中的潜在治疗作用 | IL-6和IL-1α在无菌性羊膜内炎症中的作用，以及IL-6R阻断剂的治疗效果 | NA | 早产 | 蛋白质组学、单细胞RNA测序、QUEST-MRI、宏基因组测序 | NA | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、MRI图像、宏基因组数据 | C57BL/6小鼠模型，具体样本数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 171 | 2024-09-20 |
Revealing spatial multimodal heterogeneity in tissues with SpaTrio
2023-12-13, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100446
PMID:38116121
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SpaTrio的计算方法，用于整合单细胞多组学和空间转录组学数据，以揭示组织中的空间多模态异质性 | SpaTrio通过概率对齐技术整合单细胞多组学和空间转录组学数据，能够准确重建空间分布并分析基因调控和细胞间相互作用 | NA | 开发一种计算方法以解决单细胞多组学和空间转录组学技术在捕捉和描绘组织多模态信息方面的局限性 | 单细胞多组学和空间转录组学数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 概率对齐模型 | 多组学数据 | 多个实际数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 172 | 2024-09-19 |
MIOX inhibits autophagy to regulate the ROS -driven inhibition of STAT3/c-Myc-mediated epithelial-mesenchymal transition in clear cell renal cell carcinoma
2023-12, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2023.102956
PMID:37977044
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研究论文 | 研究探讨了MIOX基因在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的作用及其抑制STAT3/c-Myc介导的上皮-间质转化（EMT）的机制 | 首次揭示了MIOX通过抑制自噬来调节ROS水平，从而抑制STAT3/c-Myc介导的EMT，进而影响ccRCC的进展 | 研究主要集中在体外和体内实验，缺乏更大规模的人体临床试验数据 | 探讨MIOX在透明细胞肾细胞癌中的作用及其分子机制 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）及其相关基因MIOX | NA | 肾细胞癌 | scRNA-seq | NA | RNA | 包括ccRCC患者的肿瘤组织和配对的邻近肾组织，以及体外和体内的ccRCC细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 173 | 2024-09-19 |
Single-cell RNA sequencing of intestinal crypts reveals vital events in damage repair and the double-edged sword effect of the Wnt3/β-catenin pathway in irradiated mice
2023-12, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2023.102942
PMID:37918127
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了不同时间点（第一天、第三天和第五天）接受13 Gy和15 Gy腹部辐射暴露后的小肠隐窝，探讨了损伤修复过程中的关键事件以及Wnt3/β-catenin通路的多重效应 | 本研究首次揭示了Wnt3/β-catenin通路在辐射暴露后损伤修复中的双重作用，并提出了肠道隐窝干细胞与巨噬细胞通过MIF-CD74/CD44轴相互作用可能加剧辐射损伤的新观点 | 本研究主要依赖于单细胞RNA测序和生物信息学分析，缺乏对Wnt3/β-catenin通路和MIF-CD74/CD44轴的直接调控实验 | 探讨辐射暴露后小肠隐窝损伤修复的关键事件及Wnt3/β-catenin通路的多重效应 | 小肠隐窝细胞在不同辐射剂量下的基因表达变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 接受13 Gy和15 Gy腹部辐射暴露的小鼠小肠隐窝细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 174 | 2024-09-14 |
Contribution of collagen XIII to lung function and development of pulmonary fibrosis
2023-12-12, BMJ open respiratory research
IF:3.6Q1
DOI:10.1136/bmjresp-2023-001850
PMID:38568728
|
研究论文 | 研究胶原蛋白XIII在肺功能和肺纤维化发展中的作用 | 首次探讨了胶原蛋白XIII在肺纤维化中的表达及其对肺功能的影响 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行大规模验证 | 探讨胶原蛋白XIII在肺功能和肺纤维化发展中的作用及其机制 | 胶原蛋白XIII在肺组织中的定位及其功能 | NA | 肺纤维化 | 免疫染色 | NA | 组织样本 | 5例特发性肺纤维化样本和正常及纤维化小鼠肺组织 | NA | NA | NA | NA |
| 175 | 2024-09-11 |
A distinct human cell type expressing MHCII and RORγt with dual characteristics of dendritic cells and type 3 innate lymphoid cells
2023-Dec-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2318710120
PMID:38109523
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序，鉴定了一种表达MHCII和RORγt的罕见人类细胞亚群，具有树突状细胞和第3型先天淋巴细胞的双重特征 | 首次在人类中发现了一种具有树突状细胞和第3型先天淋巴细胞双重特征的RORγt细胞亚群，并命名为RORγt DC-like细胞 | 本文主要集中在体外实验，尚未深入探讨这些细胞在体内的功能和影响 | 鉴定和描述一种新型的人类细胞亚群，并探讨其在免疫稳态、炎症和自身免疫中的潜在作用 | 表达MHCII和RORγt的罕见人类细胞亚群 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 176 | 2024-09-04 |
Single-cell level deconvolution, convolution, and clustering in spatial transcriptomics by aligning spot level transcriptome to nuclear morphology
2023-Dec-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.17.572084
PMID:38187541
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研究论文 | 本文提出了一种名为STIE的EM算法，通过将空间转录组数据与基于组织学图像的核形态对齐，实现了单细胞水平的空间转录组解卷积、卷积和聚类。 | STIE算法通过核形态相似性和邻域信息，填补了高达70%的间隙区域，实现了真正的单细胞水平和全切片尺度的解卷积/卷积和聚类。 | NA | 实现单细胞水平的空间转录组分析，提高空间转录组数据的分辨率和准确性。 | 空间转录组数据与组织学图像的核形态对齐，以及单细胞水平的解卷积、卷积和聚类。 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | EM算法 | 空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 177 | 2024-08-25 |
Behind the Indolent Facade: Uncovering the Molecular Features and Malignancy Potential in Lung Minimally Invasive Adenocarcinoma by Single-Cell Transcriptomics
2023-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303753
PMID:37991139
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了肺微小侵袭性腺癌（MIA）的分子特征及其恶性潜能 | 首次通过单细胞转录组学分析，揭示了MIA与侵袭性腺癌（IA）之间的联系和异质性，并发现了可能导致MIA恶性进展的机制 | 研究样本仅来自三位患者，可能影响结果的普遍性 | 揭示肺微小侵袭性腺癌的分子特征及其恶性潜能 | 肺微小侵袭性腺癌（MIA）及其免疫微环境 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 156,447个细胞，来自三位同步多发性肺腺癌患者的MIA和IA肿瘤样本、外周血单个核细胞及邻近正常组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 178 | 2024-08-25 |
Single-Cell Analysis Reveals Malignant Cells Reshape the Cellular Landscape and Foster an Immunosuppressive Microenvironment of Extranodal NK/T-Cell Lymphoma
2023-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303913
PMID:37949673
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了外周NK/T细胞淋巴瘤的肿瘤微环境，揭示了恶性NK细胞在重塑细胞景观和促进免疫抑制微环境中的关键作用 | 首次在单细胞分辨率下解析了外周NK/T细胞淋巴瘤肿瘤微环境的异质组成，强调了携带EBV编码LMP1的恶性NK细胞在重塑细胞景观和促进免疫抑制微环境中的重要作用 | NA | 更好地理解外周NK/T细胞淋巴瘤的异质性起源 | 外周NK/T细胞淋巴瘤的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个患者队列 | NA | NA | NA | NA |
| 179 | 2024-08-25 |
Single-Cell RNA-Sequencing Provides Insight into Skeletal Muscle Evolution during the Selection of Muscle Characteristics
2023-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202305080
PMID:37870215
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术（scRNA-seq）探讨了人工选择对猪骨骼肌细胞特征的影响 | 本研究首次提供了全景式的肌肉常驻细胞特征，并识别了新的和品种特异性的细胞类型，以及它们在伪时间轨迹上的分布 | NA | 探究人工选择对骨骼肌细胞特征的影响及其机制 | 猪的骨骼肌细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及不同品种的猪的骨骼肌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 180 | 2024-08-25 |
Identification and Characterization of CD8+ CD27+ CXCR3- T Cell Dysregulation and Progression-Associated Biomarkers in Systemic Lupus Erythematosus
2023-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202300123
PMID:37875396
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研究论文 | 本研究通过质谱流式细胞术、流式细胞术和单细胞RNA测序，全面分析了263例临床外周血样本中系统性红斑狼疮（SLE）患者的免疫细胞失调情况，并探讨了CD8+ CD27+ CXCR3- T细胞在SLE病理和疾病进展中的作用。 | 本研究首次详细描述了CD8+ CD27+ CXCR3- T细胞在SLE中的失调情况及其与疾病活动性的关联，并构建了动态网络生物标志物（DNB）模型，用于预测SLE的疾病进展。 | NA | 探讨CD8+ CD27+ CXCR3- T细胞在系统性红斑狼疮（SLE）中的失调情况及其作为疾病进展相关生物标志物的潜力。 | CD8+ CD27+ CXCR3- T细胞在系统性红斑狼疮（SLE）中的作用及其作为生物标志物的可能性。 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 质谱流式细胞术、流式细胞术、单细胞RNA测序 | 动态网络生物标志物（DNB）模型 | 外周血样本 | 263例临床外周血样本，包括活动性SLE（aSLE）、缓解期SLE（rSLE）和健康对照（HCs） | NA | NA | NA | NA |