单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 436 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-07 |
Prostatic proliferative inflammatory atrophy: welcome to the club†
2023-12, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6213
PMID:37775958
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研究论文 | 本研究使用RNA原位杂交技术，在人类前列腺中发现了与肺部club细胞具有转录相似性的上皮细胞，并探讨了这些细胞在前列腺炎症和癌症中的潜在作用 | 首次在人类前列腺中定位了club-like细胞，并揭示了它们在前列腺炎症和癌症中的表达模式 | 尚未完全理解club-like细胞在人类前列腺炎症、再生和疾病中的功能角色 | 探讨club-like细胞在人类前列腺炎症、再生和疾病中的作用 | 人类前列腺中的club-like细胞及其与前列腺炎症和癌症的关系 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA原位杂交 | NA | RNA序列 | 未具体说明样本数量 |
| 162 | 2024-08-07 |
Apoptosis recognition receptors regulate skin tissue repair in mice
2023-Dec-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86269
PMID:38127424
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，探讨了在小鼠皮肤伤口早期炎症期间，细胞凋亡途径和吞噬凋亡细胞受体在纤维母细胞和免疫细胞中的上调情况，并分析了其在伤口修复中的作用。 | 本研究首次揭示了Axl信号在小鼠伤口修复中的必要性，以及Timd4受体在吞噬凋亡细胞和伤口修复中的作用，为慢性伤口的治疗提供了潜在的靶点。 | 研究主要集中在小鼠模型上，对人类糖尿病足伤口的应用和效果需要进一步验证。 | 探讨细胞凋亡识别受体在皮肤组织修复中的调控机制。 | 小鼠皮肤伤口的早期炎症过程。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠皮肤伤口样本 |
| 163 | 2024-08-04 |
Retinoic acid drives intestine-specific adaptation of effector ILC2s originating from distant sites
2023-12-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221015
PMID:37773047
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研究论文 | 该研究展示了小肠微环境中效应性ILC2细胞的适应性变化及其功能 | 展示了效应性ILC2细胞能够在不同组织微环境中适应并改变表型的机制 | 研究主要集中在小肠和寄生虫感染的模型上，可能无法全面适用所有类型的组织适应 | 探讨效应性ILC2细胞在不同组织微环境中的适应性及其功能 | 小鼠效应性2型天生淋巴样细胞 (ILC2s) | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞数据 | 小鼠多个器官的ILC2细胞 |
| 164 | 2024-08-04 |
STalign: Alignment of spatial transcriptomics data using diffeomorphic metric mapping
2023-Dec-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43915-7
PMID:38065970
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研究论文 | 本文开发了一种名为STalign的工具，用于对空间转录组数据进行对齐 | 该文章提出的STalign能够处理部分匹配的组织切片和其他局部非线性变形 | NA | 探讨如何在不同技术和样本之间对空间转录组数据进行对齐 | 空间转录组数据集 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | 小鼠大脑的空间转录组数据集 |
| 165 | 2024-08-07 |
Profiling cellular heterogeneity and fructose transporter expression in the rat nephron by integrating single-cell and microdissected tubule segment transcriptomes
2023-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.20.572656
PMID:38187558
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和微切割的肾小管片段转录组数据，分析了大鼠肾单位中的细胞异质性和果糖转运蛋白表达。 | 首次揭示了肾小管近端不同亚段细胞中果糖转运蛋白的复杂异质性表达模式，并发现S3段是果糖重吸收的主要部位。 | 研究主要基于公开数据库的数据，未进行实验验证。 | 探究大鼠肾单位中细胞异质性和果糖转运蛋白表达模式。 | 大鼠肾单位中的细胞和果糖转运蛋白。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了公开数据库中的大鼠和人类肾脏转录组和蛋白质组数据。 |
| 166 | 2024-08-07 |
Decoding aging-dependent regenerative decline across tissues at single-cell resolution
2023-12-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.09.014
PMID:37898124
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了年轻和老年小鼠八个组织中再生能力的年龄依赖性下降机制 | 揭示了老年组织中再生过程减弱的细胞和分子机制，特别是干细胞移动能力受损和血管生成不足的影响 | NA | 解码年龄与再生能力之间的关系 | 年轻和老年小鼠的八个组织 | 生物学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年小鼠的八个组织 |
| 167 | 2024-08-07 |
Generation of transgene-free hematopoietic stem cells from human induced pluripotent stem cells
2023-12-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.11.002
PMID:38065068
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研究论文 | 本文通过一种原创的一步培养系统，从人诱导多能干细胞（hiPSCs）中分化出无载体和基质的可移植造血干细胞（HSCs） | 首次成功从hiPSCs中生成无载体和基质的可移植HSCs，并展示了其在免疫缺陷小鼠中的多系造血能力 | NA | 研究从多能干细胞生成造血干细胞的可行性，并帮助识别人类个体发育过程中HSC产生的关键调控因子 | 人诱导多能干细胞（hiPSCs）和造血干细胞（HSCs） | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 168 | 2024-08-07 |
Identifying biomarkers of heterogeneity and transplantation efficacy in retinal pigment epithelial cells
2023-12-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230913
PMID:37728563
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研究论文 | 本文通过批量和单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了成人RPE干细胞衍生的RPE细胞产品，评估了其在体外和体内的功能细胞整合及视觉恢复效果 | 本文首次鉴定了lncRNA（TREX）作为体内疗效的预测标记物，并通过敲低和过表达实验验证了其在细胞整合和视觉恢复中的作用 | NA | 提高视网膜色素上皮细胞移植疗法的疗效和安全性 | 视网膜色素上皮细胞的异质性和移植效果的生物标志物 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | RNA测序 | NA | RNA | 涉及Royal College of Surgeons大鼠 |
| 169 | 2024-08-05 |
Tumor macrophage functional heterogeneity can inform the development of novel cancer therapies
2023-12, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2023.10.007
PMID:37995659
|
研究论文 | 本文讨论了肿瘤相关巨噬细胞的功能异质性及其对癌症新疗法开发的影响 | 识别出巨噬细胞的分子亚型和功能，从而发现新的治疗靶点 | 传统治疗方法未能提供改变临床实践的突破性进展 | 提高对肿瘤微环境中巨噬细胞作用的理解，并推动新型靶向治疗的发展 | 聚焦于肿瘤微环境中的巨噬细胞功能及其潜在治疗靶点 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和空间转录组技术 | NA | NA | NA |
| 170 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the lineage of malignant epithelial cells and upregulation of TAGLN2 promotes peritoneal metastasis in gastric cancer
2023-Dec, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-023-03194-6
PMID:37247132
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胃腺癌样本，揭示了恶性上皮细胞的分化轨迹及TAGLN2在胃癌腹膜转移中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了从正常黏膜到肿瘤组织再到腹膜转移的发展曲线，并验证了TAGLN2在胃癌腹膜转移中的关键作用 | 研究样本数量较少，仅基于单一患者的数据 | 探索胃癌腹膜转移的分子机制并寻找潜在的治疗靶点 | 胃腺癌样本，包括原发肿瘤、邻近非肿瘤组织、腹膜转移样本及正常腹膜样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 四个胃腺癌样本 |
| 171 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals a hierarchical transcriptional regulatory network of terpenoid biosynthesis in cotton secretory glandular cells
2023-12-04, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2023.10.008
PMID:37849250
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，全面分析了棉花叶片的转录组特征，并构建了一个层级转录调控网络，揭示了细胞特异性萜类化合物合成的调控机制 | 发现了两个新的转录因子GoHSFA4a和GoNAC42，它们在棉花色素腺体形成基因下游发挥作用，并能直接调控萜类化合物合成基因的表达 | NA | 揭示植物细胞水平上萜类化合物合成的特定调控机制 | 棉花分泌腺细胞中的萜类化合物合成 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 172 | 2024-08-07 |
HLA-I Evolutionary Divergence Confers Response to PD-1 Blockade plus Chemotherapy in Untreated Advanced Non-Small Cell Lung Cancer
2023-12-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-0604
PMID:37449971
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研究论文 | 本研究探讨了HLA-I进化分歧（HED）在未经治疗的晚期非小细胞肺癌（NSCLC）患者中对PD-1阻断联合化疗的预测和预后价值 | 首次揭示了HLA-I进化分歧（HED）作为预测PD-1阻断联合化疗疗效的生物标志物 | 研究样本量有限，需要在更大规模的研究中验证HED的预测价值 | 确定PD-1阻断联合化疗在未经治疗的晚期非小细胞肺癌患者中的预测生物标志物 | 427名接受一线PD-1阻断联合化疗或单纯化疗的晚期非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 427名患者，其中11名患者的58,977个细胞用于单细胞RNA测序 |
| 173 | 2024-08-07 |
CAR T-cell Design-dependent Remodeling of the Brain Tumor Immune Microenvironment Modulates Tumor-associated Macrophages and Anti-glioma Activity
2023-12-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0424
PMID:37971169
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研究论文 | 本研究探讨了脑肿瘤免疫微环境（TIME）和嵌合抗原受体（CAR）设计对B7-H3特异性CAR T细胞抗胶质瘤活性的影响 | 研究通过转基因表达41BBL在基于CD28的CAR T细胞中，增强了治疗效果和持久性，并揭示了CAR设计对TIME的调节作用 | 尽管在体外实验中CAR设计提高了抗胶质瘤疗效，但在体内实验中并未观察到类似改善 | 旨在理解转移性免疫细胞与脑肿瘤免疫微环境之间的复杂动态关系，以开发有效的基于T细胞的免疫疗法 | B7-H3特异性CAR T细胞及其在脑肿瘤免疫微环境中的作用 | 免疫学 | 脑肿瘤 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | CAR T细胞 | 细胞 | 使用了七种完全鼠源的B7-H3 CARs进行评估 |
| 174 | 2024-08-07 |
Single-cell isolation from full-thickness human intestinal tissue resections for single-cell RNA sequencing
2023-Dec-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102686
PMID:37925636
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研究论文 | 本文介绍了一种从全层人肠组织切除标本中进行单细胞分离的方法，用于后续的单细胞RNA测序 | 该研究提供了一种从全层肠组织中分离单细胞的详细协议 | NA | 研究单细胞水平上细胞间的物理和功能关系 | 全层人肠组织中的单个细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未提及 |
| 175 | 2024-08-04 |
Avoiding false discoveries in single-cell RNA-seq by revisiting the first Alzheimer's disease dataset
2023-Dec-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.90214
PMID:38047913
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研究论文 | 本研究修正了首个阿尔茨海默病单细胞RNA测序的数据处理和分析问题 | 首次使用单细胞技术揭示阿尔茨海默病中细胞类型特异性差异表达基因的潜力 | 此前的数据处理和质量控制方法存在局限性 | 旨在提高阿尔茨海默病相关基因的可靠发现 | 集中于阿尔茨海默病患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 176 | 2024-08-07 |
Charting the tumor microenvironment with spatial profiling technologies
2023-12, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2023.08.004
PMID:37673713
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综述 | 本文综述了空间分析技术在肿瘤微环境（TME）表征中的应用及其在临床上改善癌症患者诊断和预后的潜力 | 空间分析技术能够捕捉细胞在肿瘤微环境中的复杂空间背景及其密集的相互作用网络 | 传统的单细胞RNA测序（scRNA-seq）由于需要样本解离步骤，无法捕捉细胞的空间信息 | 探讨空间分析技术在肿瘤微环境表征中的应用及其在临床上的潜在价值 | 肿瘤微环境中的细胞组织和相互作用 | NA | NA | 空间分析技术 | NA | 细胞 | NA |
| 177 | 2024-08-07 |
Integrative single-cell transcriptome analysis reveals immune suppressive landscape in the anaplastic thyroid cancer
2023-12, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-023-00663-6
PMID:37679527
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研究论文 | 本研究通过综合单细胞转录组分析，揭示了间变性甲状腺癌中的免疫抑制微环境 | 首次在单细胞水平上揭示了间变性甲状腺癌与甲状腺乳头状癌的肿瘤免疫微环境及其动态变化 | NA | 深入理解间变性甲状腺癌的肿瘤免疫微环境，以改善癌症治疗和预后 | 间变性甲状腺癌和甲状腺乳头状癌的肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 间变性甲状腺癌和甲状腺乳头状癌的原发性肿瘤样本 |
| 178 | 2024-08-07 |
Characterization of the long noncoding RNA transcriptome in human preimplantation embryo development
2023-Dec, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-023-02951-4
PMID:37770818
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研究论文 | 本研究通过scRNA-seq和SUPeR-seq数据分析了人类植入前胚胎发育过程中的长非编码RNA（lncRNA）表达谱 | 研究揭示了不同发育阶段特异性和共享的高表达lncRNA，并发现这些lncRNA及其相关的超级增强子和RNA结合蛋白在胚胎发育调控中的重要作用 | NA | 旨在深入了解发育事件的转录基础 | 人类植入前胚胎发育过程中的lncRNA | NA | 不孕症 | scRNA-seq, SUPeR-seq | NA | RNA | 涉及多个发育阶段的人类植入前胚胎样本 |
| 179 | 2024-08-07 |
Exploration of a screening model for intrahepatic cholangiocarcinoma patients prone to cuproptosis and mechanisms of the susceptibility of CD274-knockdown intrahepatic cholangiocarcinoma cells to cuproptosis
2023-12, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-023-00673-4
PMID:37828105
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研究论文 | 本研究旨在探索易发生铜死亡的肝内胆管癌患者的筛查模型及CD274敲低肝内胆管癌细胞对铜死亡的易感性机制 | 首次系统全面地探索了肝内胆管癌中的铜死亡现象，构建了针对易发生铜死亡的肝内胆管癌患者的精确诊断和治疗策略 | 需要在大规模前瞻性队列中进一步验证这些结论 | 识别易发生铜死亡的肝内胆管癌患者的新诊断和治疗策略，并探索相关的细胞内和细胞外机制 | 肝内胆管癌患者及细胞 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单样本基因集富集分析、机器学习算法 | nomogram模型 | 转录组数据 | 训练数据集255例，验证数据集包括65例、104例、78例和14例 |
| 180 | 2024-08-07 |
Blockage of EGFR/AKT and mevalonate pathways synergize the antitumor effect of temozolomide by reprogramming energy metabolism in glioblastoma
2023-12, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12502
PMID:37920878
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研究论文 | 本研究探讨了表皮生长因子受体（EGFR）途径在脂肪酸代谢重编程和能量生成中的功能角色，并通过临床GBM样本的单细胞RNA测序和非靶向代谢组学分析，验证了代谢相关RTK-脂肪酸-基因特征。 | 本研究揭示了EGFR激活的GBM中代谢重编程的机制，并提供了一种组合治疗策略用于临床GBM管理。 | NA | 研究EGFR途径在GBM中的代谢重编程和能量生成的作用。 | 临床GBM样本，包括单细胞RNA测序和代谢组学分析。 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序，非靶向代谢组学分析 | NA | RNA序列，代谢数据 | 临床GBM样本 |