单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 438 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-05 |
Genomic Insights into Molecular Regulation Mechanisms of Intramuscular Fat Deposition in Chicken
2023-12-10, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14122197
PMID:38137019
|
综述 | 本文综述了影响鸡肉中 intramuscular fat (IMF) 沉积的分子调控机制 | 通过多种基因组学方法，系统描述了与IMF沉积相关的遗传和表观遗传因素 | NA | 探索鸡肉中IMF沉积的分子调控机制 | 鸡肉中的内脏脂肪沉积 | 数字病理学 | NA | 全基因组关联研究, 整个转录组测序, 蛋白质组测序, 单细胞RNA测序, 高通量染色体构象捕获, DNA甲基化测序, mA甲基化测序 | NA | NA | NA |
| 162 | 2024-08-04 |
Comparative Analysis of Single-cell and Single-nucleus RNA-sequencing in a Rabbit Model of Retinal Detachment-related Proliferative Vitreoretinopathy
2023-Dec, Ophthalmology science
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.xops.2023.100335
PMID:37496518
|
研究论文 | 本研究比较了兔子模型中与视网膜脱离相关的增生性玻璃体视网膜病的单细胞和单核RNA测序 | 创新点在于结合使用单细胞RNA测序和单核RNA测序，以更准确地识别与增生性玻璃体视网膜病相关的转录网络 | 两种RNA测序技术的局限性均被强调，特别是在细胞类型捕获率方面 | 研究增生性玻璃体视网膜病的发病机制 | 使用兔子模型诱导的单侧增生性玻璃体视网膜病变 | 数字病理学 | 增生性玻璃体视网膜病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 兔子眼睛的增生性玻璃体视网膜病样本及对侧眼作为对照 |
| 163 | 2024-08-05 |
Molecular heterogeneity of quiescent melanocyte stem cells revealed by single-cell RNA-sequencing
2023-Dec-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.19.571712
PMID:38187565
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了休眠黑素细胞干细胞的分子异质性 | 确认了休眠黑素细胞干细胞亚群的分子特征，并鉴定了新的亚群 | 研究可能受限于小鼠模型的生物限制 | 研究黑素细胞干细胞的转录组特征及其异质性 | 成人女性C57BL/6J小鼠的休眠黑素细胞干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从小鼠皮肤中分离KIT+/CD45-细胞的样本 |
| 164 | 2024-08-05 |
Interleukin-17-mediated protective cytokine signaling against degeneration of the retinal pigment epithelium
2023-Dec-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2311647120
PMID:38085785
|
研究论文 | 本研究探讨了IL-17介导的细胞因子信号在视网膜色素上皮退化中的保护作用。 | 首次揭示了脉络膜γδ T细胞在视网膜色素上皮损伤后的保护性细胞因子信号机制。 | 本研究主要基于小鼠模型，可能限制了结果的广泛适用性。 | 探讨IL-17信号通路在视网膜色素上皮退化中的作用。 | 研究对象是小鼠脉络膜中的免疫细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞免疫资料 | 小鼠模型 |
| 165 | 2024-08-05 |
Lymph node stromal cell responses to perinatal T cell waves, a temporal atlas
2023-Dec-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2316957120
PMID:38079541
|
研究论文 | 这篇文章探讨了围产期T细胞在淋巴结中的独特环境及其演变。 | 文章创新性地利用单细胞RNA测序生成初期淋巴结生态的地图，并揭示了基质细胞和T细胞之间的相互作用。 | 没有提及本研究的具体局限性。 | 阐明围产期T细胞在淋巴结中如何生成和作用。 | 主要研究小鼠的围产期调节性T细胞及其在淋巴结中的反应。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 未具体说明样本数量，但涉及小鼠的研究 |
| 166 | 2024-08-04 |
The activation of SIRT1 by resveratrol reduces breast cancer metastasis to lung through inhibiting neutrophil extracellular traps
2023-12, Journal of drug targeting
IF:4.3Q1
DOI:10.1080/1061186X.2023.2265585
PMID:37772906
|
研究论文 | 这项研究探讨了白藜芦醇对乳腺癌转移到肺部的影响。 | 该研究首次将白藜芦醇与抑制中性粒细胞外陷阱的作用联系起来，展示了其对乳腺癌转移的治疗潜力。 | 该研究在小鼠模型中进行，可能无法完全反映人类的生理条件。 | 研究白藜芦醇通过抑制中性粒细胞外陷阱来减少乳腺癌转移的机制。 | 主要研究对象为乳腺癌转移及中性粒细胞外陷阱。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | 小鼠正位4T1乳腺癌模型 | 血清样本 | 小鼠乳腺癌模型中的样本数量未具体提到 |
| 167 | 2024-08-05 |
DNA methylation-mediated Rbpjk suppression protects against fracture nonunion caused by systemic inflammation
2023-Dec-05, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI168558
PMID:38051594
|
研究论文 | 该研究探讨了DNA甲基化介导的Rbpjk抑制如何保护骨折不愈合患者免受全身性炎症的影响 | 发现Rbpjk是Dnmt3b的直接靶标，并阐明了NF-κB/Dnmt3b/Rbpjk轴在炎症骨再生中的共同机制 | 未明确说明样本数量和临床相关性 | 研究全身性炎症对骨折愈合的影响及其机制 | 干细胞和前体细胞在骨折不愈合中的反应 | 数字病理学 | 骨折不愈合 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | 基因组数据 | NA |
| 168 | 2024-08-05 |
A targeted CRISPR-Cas9 mediated F0 screen identifies genes involved in establishment of the enteric nervous system
2023-Dec-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.28.573581
PMID:38234831
|
研究论文 | 本研究利用CRISPR-Cas9介导的筛查识别参与肠神经系统建立的基因 | 使用高效的CRISPR筛查方法，发现新基因进而推动肠神经系统的研究 | 研究仅限于斑马鱼模型，可能不完全适用于其他脊椎动物 | 探讨和识别参与肠神经系统发育的基因 | 以斑马鱼为模型研究肠神经系统的形成与基因调控 | 数字病理学 | Hirschsprung病 | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 169 | 2024-08-07 |
Heterogeneity and transcriptional drivers of triple-negative breast cancer
2023-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113564
PMID:38100350
|
研究论文 | 本研究通过结合功能和分子 profiling 以及计算分析，定义了三阴性乳腺癌（TNBC）的转录、表观遗传和代谢亚型及其亚型驱动的超级增强子和转录因子 | 本研究首次揭示了三阴性乳腺癌的转录亚型在单细胞水平上的相对均一性，并发现 PRRX1 转录因子是驱动间质型 TNBC 的关键因素 | NA | 旨在表征三阴性乳腺癌的异质性及其转录驱动因素 | 三阴性乳腺癌的转录、表观遗传和代谢亚型及其驱动因素 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞 RNA 测序 | NA | 转录组数据 | 大规模多平台多组学研究 |
| 170 | 2024-08-05 |
A longitudinal single-cell atlas of treatment response in pediatric AML
2023-12-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.10.008
PMID:37977148
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序剖析儿童急性髓系白血病(pAML)的治疗反应。 | 揭示了在治疗过程中，亚型特异性的细胞塑性出现，并识别了可能的靶向过程。 | 该研究样本规模较小，仅涉及28名患者。 | 研究儿童急性髓系白血病不同亚型的细胞组成及其对治疗反应的影响。 | 28名代表不同pAML亚型的儿童患者，涵盖诊断、缓解和复发阶段。 | 数字病理学 | 儿童急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 | NA | 基因组数据 | 28名患者 |
| 171 | 2024-08-05 |
Cell-in-Cell-Mediated Entosis Reveals a Progressive Mechanism in Pancreatic Cancer
2023-12, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.08.035
PMID:37657757
|
研究论文 | 该文章探讨了细胞间介导的细胞吞噬在胰腺癌中的作用机制 | 研究首次揭示了NET1作为胰腺癌进展的一个新型相关基因，且细胞吞噬与胰腺癌预后不良相关 | 未能全面探索细胞吞噬在所有胰腺癌表现中发挥的作用 | 阐明细胞吞噬在胰腺导管腺癌进展中的作用 | 研究对象包括胰腺导管腺癌细胞和其在不同培养条件下的表现 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 涉及胰腺癌样本及其肝转移样本 |
| 172 | 2024-08-05 |
A discrete 'early-responder' stromal-cell subtype orchestrates immunocyte recruitment to injured tissue
2023-Dec, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01669-w
PMID:37932455
|
研究论文 | 这篇文章探讨了一种在急性损伤后促进组织再生的特殊间充质干细胞亚型。 | 首次识别了'早期反应'间充质干细胞亚型，并展示了其如何促进免疫细胞的募集与组织再生。 | 未详细阐述该亚型在其他组织和病理情况中的作用。 | 研究急性损伤后间充质干细胞如何促进组织再生。 | 肌肉间充质干细胞(MmSCs)及其在急性损伤后的反应。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 转录组数据 | NA |
| 173 | 2024-08-05 |
Single-cell insights into epithelial morphogenesis in the neonatal mouse uterus
2023-Dec-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2316410120
PMID:38019863
|
研究论文 | 本文探讨了新生小鼠子宫上皮的单细胞转录组分析 | 揭示了子宫上皮成熟、谱系分叉和分化的轨迹分析，并识别了新的腺体上皮表达基因 | 所研究的模型仅限于新生小鼠，可能无法完全代表其他生物或成年状态 | 阐明子宫上皮发育过程中的细胞和分子机制 | 新生小鼠的子宫上皮细胞 | 数字病理 | NA | 单细胞转录组学 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 子宫上皮细胞样本 |
| 174 | 2024-08-05 |
Benchmarking single-cell hashtag oligo demultiplexing methods
2023-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqad086
PMID:37829177
|
研究论文 | 本研究对七种HTO去复用工具的性能进行了评估 | 首次比较了七种HTO去复用工具的性能，并引入了对比基于遗传变异的数据 | 部分方法在较低质量数据下表现不佳 | 评估多种HTO去复用工具在单细胞RNA测序中的性能 | 七种HTO去复用工具 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 七种工具，在多个样本中使用遗传变异进行比较 |
| 175 | 2024-08-04 |
The Functional Roles of MDSCs in Severe COVID-19 Pathogenesis
2023-12-23, Viruses
DOI:10.3390/v16010027
PMID:38257728
|
评论 | 本文总结了骨髓来源抑制细胞(MDSCs)在严重COVID-19发病机制中的功能角色 | 文章提出MDSCs的早期扩展可能是严重COVID-19进展的关键特征，并探讨其作为潜在预后生物标志物的作用 | 缺乏对严重COVID-19进展的全面分子决定因素的阐明 | 探讨骨髓来源抑制细胞在严重COVID-19发病机制中的作用 | 严重COVID-19患者的MDSCs及其功能 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序, 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 通过转录组RNA-seq和单细胞测序数据的荟萃分析得出的数据 |
| 176 | 2024-08-04 |
Anterior Pituitary Transcriptomics Following a High-Fat Diet: Impact of Oxidative Stress on Cell Metabolism
2023-Dec-23, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad191
PMID:38103263
|
研究论文 | 本研究探讨高脂饮食对前垂体转录组的影响，特别是氧化压力对细胞代谢的影响。 | 本研究首次比较了男女小鼠在高脂饮食下前垂体细胞对氧化压力的适应能力。 | 未能深入分析高脂饮食对前垂体基因表达长期影响的变化。 | 研究高脂饮食对前垂体功能及其转录组的影响。 | 使用FVB.129P小鼠探讨高脂饮食对男女前垂体细胞的影响。 | 数字病理学 | 肥胖相关病 | 单细胞RNA测序 | NA | 血清激素和细胞转录组数据 | 男性和女性FVB.129P小鼠，每组增加了20克体重 |
| 177 | 2024-08-04 |
Single-Molecule Spatial Transcriptomics of Human Thoracic Aortic Aneurysms Uncovers Calcification-Related CARTPT-Expressing Smooth Muscle Cells
2023-12, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.319329
PMID:37823268
|
研究论文 | 本研究揭示了人类胸主动脉瘤中与钙化相关的CARTPT表达的平滑肌细胞的稀有亚型 | 采用高分辨率单细胞转录组成像技术揭示了胸主动脉瘤组织样本中稀有平滑肌细胞类型 | 主要集中于男性TAA样本，可能限制了对其他人群的普遍适用性 | 揭示人类胸主动脉瘤中平滑肌细胞的异质性及其功能 | 人类胸主动脉瘤组织样本中的平滑肌细胞亚型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单分子空间转录组成像 | NA | 组织样本 | 140个基因的转录本在新鲜冷冻的TAA样本中分析 |
| 178 | 2024-08-05 |
Deriving early single-rosette brain organoids from human pluripotent stem cells
2023-12-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.10.020
PMID:37995702
|
研究论文 | 本文开发了一种新的人脑类器官技术，能够在早期时间点生成自组织的单星状皮层类器官 | 提出了一种基于人诱导多能干细胞的单层培养方法，能够有效生成单星状皮层类器官 | 未提及具体的样本限制和对比分析的局限性 | 研究人脑发育及相关疾病模型 | 人诱导多能干细胞转化为皮层类器官 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 化学诱导 | 未提及 | 单细胞RNA测序 | 未提及 |
| 179 | 2024-08-05 |
Distinct secretomes in p16- and p21- positive senescent cells across tissues
2023-Dec-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.05.569858
PMID:38106149
|
研究论文 | 本文综合研究了不同组织中p16和p21阳性衰老细胞的独特分泌组 | 揭示了p21和p16转录本在不同细胞类型和组织中的重大异质性，强调了细胞衰老及其分泌表型的多样性 | 部分SASP因子持续贡献于共享的“核心”SASP，仍需在更广泛的生物学背景下进行更细致的研究 | 探讨p21和p16在衰老细胞及其分泌表型中的作用 | 多个小鼠和人类组织的单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 多个小鼠和人类组织的数据集 |
| 180 | 2024-08-05 |
Single-cell genomics reveals new rozellid lineages and supports their sister relationship to Microsporidia
2023-12, Biology letters
IF:2.8Q2
DOI:10.1098/rsbl.2023.0398
PMID:38087939
|
研究论文 | 本研究揭示了新发现的rozellid谱系，并支持其与微孢子虫的姐妹关系 | 首次通过单细胞测序提供三种新的rozellid谱系的基因组数据 | 目前尚未完全理解rozellids与微孢子虫之间的系统发育关系 | 探讨rozellid谱系的系统发育及其与微孢子虫的关系 | 新发现的三种rozellid谱系 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 来自环境样本的三个新rozellid谱系 |