单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 436 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-04 |
PPARγ agonist treatment reduces fibroadipose tissue in secondary lymphedema by exhausting fibroadipogenic PDGFRα+ mesenchymal cells
2023-Dec-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.165324
PMID:38131378
|
研究论文 | 本研究探讨了PPARγ激动剂rosiglitazone如何通过耗尽PDGFRα+间充质细胞来减少继发性淋巴水肿中的纤维脂肪组织 | 首次提出PPARγ激动剂可以通过减少PDGFRα+细胞的数量来治疗继发性淋巴水肿导致的纤维化和脂肪组织沉积 | 本研究主要在小鼠模型中进行，缺乏长期的人体临床研究数据 | 研究rosiglitazone治疗继发性淋巴水肿的潜力，特别是其对纤维化和脂肪沉积的影响 | 小鼠模型和人类组织样本中的PDGFRα+间充质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术、组织学评估 | NA | 组织样本 | 人类和小鼠组织样本 |
| 142 | 2024-08-05 |
Global and cell type-specific immunological hallmarks of severe dengue progression identified via a systems immunology approach
2023-Dec, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01654-3
PMID:37872316
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研究论文 | 本研究通过系统免疫学方法识别出重症登革热进展的全球和细胞类型特异性免疫特征 | 首次揭示了重症登革热在儿童血液中的DENV靶细胞及其免疫学特征 | 该研究主要集中在儿童群体，未考虑成年人病例的免疫变化 | 定义重症登革热进展中的DENV靶细胞和免疫学特征 | 研究对象为儿童的血液样本及其中的免疫细胞 | 数字病理学 | 登革热 | 病毒包涵单细胞RNA测序（viscRNA-Seq 2）和靶向蛋白组学 | NA | 血液样本 | NA |
| 143 | 2024-08-04 |
Startle: A star homoplasy approach for CRISPR-Cas9 lineage tracing
2023-12-20, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2023.11.005
PMID:38128483
|
研究论文 | 提出了一种新颖的星形同义性进化模型，用于CRISPR-Cas9细胞系追踪 | 开发了专门的星形同义性模型以描述CRISPR-Cas9诱导突变的进化特点 | 未提及具体的应用限制 | 旨在改进CRISPR-Cas9诱导突变的细胞谱系追踪方法 | 研究CRISPR-Cas9诱导突变的细胞系谱系 | 数字病理学 | 肺腺癌 | CRISPR-Cas9 | 星形同义性模型 | 模拟细胞谱系追踪数据，鼠类转移性肺腺癌数据 | NA |
| 144 | 2024-08-04 |
Artificial intelligence-based pathology as a biomarker of sensitivity to atezolizumab-bevacizumab in patients with hepatocellular carcinoma: a multicentre retrospective study
2023-12, The Lancet. Oncology
DOI:10.1016/S1470-2045(23)00468-0
PMID:37951222
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研究论文 | 本研究开发了一种人工智能模型，以直接从组织切片中估计ABRS表达，并评估其与无进展生存期的相关性。 | 采用人工智能技术分析肝细胞癌数字切片作为无进展生存期的生物标志物，提供了新的治疗策略。 | 本研究为回顾性研究，可能会受到样本选择偏差的影响。 | 研究旨在开发一种人工智能模型来估计肝细胞癌患者对治疗的反应。 | 研究对象为接受了手术切除及活检的肝细胞癌患者。 | 数字病理学 | 肝癌 | 分子生物学分析，空间转录组学 | 聚类约束的注意力多实例学习模型（CLAM） | 组织切片图像 | 840名患者 |
| 145 | 2024-08-05 |
Lymphoid tissues contribute to plasma viral clonotypes early after antiretroviral therapy interruption in SIV-infected rhesus macaques
2023-12-13, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adi9867
PMID:38091409
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研究论文 | 该研究探讨了淋巴组织在抗逆转录病毒治疗中断后早期对血浆病毒克隆类型的贡献 | 此研究首次揭示了淋巴组织在抗逆转录病毒治疗中断后，如何作为病毒来源对血浆病毒克隆类型的影响 | 样本量较小，仅有七只动物被研究，可能限制了结果的普遍性 | 更好地理解在抗逆转录病毒治疗中断后，病毒弹回的细胞和组织来源 | 研究对象为被感染的恒河猕猴 | 数字病理学 | HIV感染 | 病毒条形码测序、完整前病毒DNA测定、单细胞RNA测序、CODEX与RNAscope原位杂交 | NA | 组织和血液样本 | 七只恒河猕猴 |
| 146 | 2024-08-04 |
ASCC3 promotes the immunosuppression and progression of non-small cell lung cancer by impairing the type I interferon response via CAND1-mediated ubiquitination inhibition of STAT3
2023-12-26, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007766
PMID:38148115
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研究论文 | 本研究探讨了ASCC3在非小细胞肺癌进展中的分子机制 | 发现ASCC3通过CAND1介导的STAT3泛素化抑制，稳定STAT3信号通路，从而影响肿瘤微环境 | 尚需进一步验证ASCC3在人体中的具体作用及机制 | 研究ASCC3在非小细胞肺癌中的角色及其对免疫反应的影响 | 探讨ASCC3在非小细胞肺癌细胞和小鼠模型中的生物学功能 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序, RNA测序, 免疫沉淀, 质谱分析, 免疫荧光, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 147 | 2024-08-04 |
SARS-CoV-2 mRNA vaccination-induced immunological memory in human nonlymphoid and lymphoid tissues
2023-12-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI171797
PMID:37815874
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研究论文 | 本研究分析了人类非淋巴组织和淋巴组织中针对SARS-CoV-2 mRNA疫苗的免疫记忆 | 首次全面分析了人类对SARS-CoV-2 mRNA疫苗的T细胞反应，揭示了组织记忆和驻留特征 | 研究仅基于手术样本和血液样本，样本量和患者的多样性可能有限 | 研究SARS-CoV-2 mRNA疫苗诱导的特定T细胞在不同组织中的生成和功能 | 主要研究肾脏、肝脏、肺、骨髓和脾脏中的SARS-CoV-2疫苗特异性T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本和血液样本 | 未明确说明样本数量和种类 |
| 148 | 2024-08-04 |
Ghrelin deletion and conditional ghrelin cell ablation increase pancreatic islet size in mice
2023-12-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI169349
PMID:38099492
|
研究论文 | 本研究探讨了削减生长激素在小鼠胰岛大小和β细胞质量方面的影响 | 首次系统研究了生长激素缺失如何增加胰岛大小和β细胞数量，并揭示了相关基因表达变化 | 研究主要在小鼠模型中进行，结果的临床转化仍需进一步验证 | 研究生长激素对胰岛大小和β细胞质量的影响 | 小鼠胰岛及其β细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | 多只小鼠，包括10-到12周龄和4周龄的小鼠 |
| 149 | 2024-08-04 |
Activation of the pentose phosphate pathway in macrophages is crucial for granuloma formation in sarcoidosis
2023-12-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI171088
PMID:38038136
|
研究论文 | 本研究探讨了巨噬细胞中戊糖磷酸途径的激活如何促进颗粒肿瘤在沙其多病中的形成 | 首次揭示了在沙其多病的颗粒肿瘤形成过程中戊糖磷酸途径的关键作用 | 本研究主要集中在沙其多病患者的特定模型上，需进一步研究其他类型的模型以验证结果 | 探讨沙其多病中颗粒肿瘤形成的机制 | 沙其多病患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 沙其多病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠颗粒肿瘤模型 | 基因表达数据 | 来自沙其多病患者的样本 |
| 150 | 2024-08-04 |
Bone-derived PDGF-BB drives brain vascular calcification in male mice
2023-12-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI168447
PMID:37815871
|
研究论文 | 本研究报告了骨源性血小板衍生生长因子BB（PDGF-BB）在雄性小鼠中造成脑血管钙化的作用 | 揭示了PDGF-BB通过激活p-PDGFRβ/p-ERK/RUNX2信号通路引起脑血管钙化的机制 | 未详细探讨微血管钙化的其他潜在机制 | 探讨骨源性PDGF-BB对脑血管钙化的影响及其机制 | 雄性小鼠及其脑血管细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | 转基因小鼠模型 | 血清样本及脑微血管培养系统 | 雄性小鼠，包括年轻小鼠和老年小鼠 |
| 151 | 2024-08-05 |
De novo identification of expressed cancer somatic mutations from single-cell RNA sequencing data
2023-12-18, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01269-1
PMID:38111063
|
研究论文 | 提出了一种计算框架RESA用于从单细胞RNA测序数据中识别表达的肿瘤体细胞突变 | RESA提供了一种新的方法来进行表达的肿瘤体细胞突变分析，并在现有方法中表现优异 | 没有提及具体的局限性 | 旨在提高从单细胞RNA测序数据中识别表达肿瘤突变的准确性 | 针对黑色素瘤药物耐药性数据集分析肿瘤内突变异质性 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 数据集 | 19个数据集 |
| 152 | 2024-08-04 |
Glioblastoma-instructed microglia transition to heterogeneous phenotypic states with phagocytic and dendritic cell-like features in patient tumors and patient-derived orthotopic xenografts
2023-Dec-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.05.531162
PMID:36945572
|
研究论文 | 本研究系统表征了胶质母细胞瘤在患者肿瘤和患者衍生的肿瘤异种移植中的肿瘤微环境 | 本研究揭示了教育后的小胶质细胞在不同胶质母细胞瘤环境和肿瘤腔室中转变为多样的表型状态，并显示其在支持胶质母细胞瘤生长和治疗反应中的关键作用 | 关于胶质母细胞瘤生态系统及其在临床前模型中的再现性尚不充分，导致结果不准确和临床试验失败 | 深入理解胶质母细胞瘤驱动的肿瘤微环境及其在临床前模型中的再现 | 以胶质母细胞瘤（GBM）患者的肿瘤和患者衍生的肿瘤异种移植为研究对象 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多色流式细胞术、免疫组化及功能研究 | NA | 细胞 | 不同肿瘤表型的胶质母细胞瘤PDOXs与胶质瘤小鼠GL261同源模型和患者肿瘤进行比较 |
| 153 | 2024-08-05 |
Personalized tumor combination therapy optimization using the single-cell transcriptome
2023-12-01, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01256-6
PMID:38041202
|
研究论文 | 该文章提出了一种利用单细胞转录组优化个性化肿瘤联合治疗的方法 | 介绍了一种名为comboSC的计算原型，能够基于单细胞转录组评估个别患者的免疫微环境并优化联合治疗 | 该研究的具体临床应用和实验验证尚需进一步探索 | 推动个性化癌症治疗的方法和工具的发展 | 119个来自15种癌症类型的肿瘤样本的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 119个肿瘤样本 |
| 154 | 2024-08-05 |
Complementary and countervailing actions of Jak2 and Ikk2 in hematopoiesis in mice
2023-12, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2023.08.005
PMID:37611729
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研究论文 | 本研究探讨了Jak2和Ikk2在小鼠造血中的互补和相对作用 | 提出了Jak2和Ikk2在促进造血干细胞自我更新与髓系分化之间的相互作用机制 | 研究局限于小鼠模型，临床应用尚需进一步验证 | 探讨NFκB通路的高活性如何与Jak2 V617F突变相互作用影响造血过程 | 使用含有Jak2 V617F突变和Ikk2-CA的小鼠模型进行实验 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 包含多个小鼠模型，具体样本大小未明确提及 |
| 155 | 2024-08-04 |
ENGEP: advancing spatial transcriptomics with accurate unmeasured gene expression prediction
2023-12-21, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03139-w
PMID:38129866
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研究论文 | 本研究介绍了ENGEP，这是一个基于集成学习的工具，用于在空间转录组数据中预测未测量的基因表达 | ENGEP能够通过多个单细胞RNA测序数据集作为参考，准确预测未测量的基因表达，超越了当前的先进工具 | 本文未提及具体的限制 | 旨在提高空间转录组技术的基因表达预测能力 | 研究对象为空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成学习 | 转录组数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 |
| 156 | 2024-08-05 |
A time-resolved meta-analysis of consensus gene expression profiles during human T-cell activation
2023-12-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03120-7
PMID:38098113
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研究论文 | 本文分析了不同T细胞群体在激活过程中的时间模式，以开发共识基因特征 | 本研究首次描述了不同T细胞群体的时间解析基因表达模式 | 研究未提及样本的具体来源和数量限制 | 本研究旨在识别和验证用于评估T细胞激活的生物标志物特征 | 研究对象为不同类型的激活T细胞 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | 包括521个基因和最多10个不同时间点的激活样本 |
| 157 | 2024-08-04 |
Neuronal types in the mouse amygdala and their transcriptional response to fear conditioning
2023-Dec, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01469-3
PMID:37884748
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研究论文 | 本文探讨了小鼠杏仁核中的神经元类型及其对恐惧条件反射的转录响应 | 提供了小鼠杏仁核细胞类型的详细分类，并识别出130种神经元类型及其在恐惧学习中的转录响应 | 研究主要集中在小鼠模型，结果可能无法完全适用于其他物种 | 研究小鼠杏仁核中神经元类型及其在恐惧学习和记忆巩固中的转录变化 | 采用了基因标记和单细胞转录组学对小鼠进行研究 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 对野生型和经过恐惧条件训练的小鼠进行了研究 |
| 158 | 2024-08-05 |
A novel oxidative stress-related gene signature as an indicator of prognosis and immunotherapy responses in HNSCC
2023-12-28, Aging
DOI:10.18632/aging.205323
PMID:38157249
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研究论文 | 本文识别了头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中与氧化应激相关的基因亚型，并构建了一个氧化应激相关基因评分模型 | 首次在HNSCC中筛选出九个预测总体生存的基因，提出了一种新的预后风险指示模型 | 研究主要基于现有数据集，未进行更广泛的临床验证 | 探讨与氧化应激相关的基因在HNSCC中的作用及其预测功能 | 重点研究头颈部鳞状细胞癌患者的氧化应激相关基因 | 数字病理学 | 头颈癌 | scRNA-seq 和 bulk RNA-seq | 预后风险模型 | 基因表达数据 | 使用了TCGA-HNSCC数据集及其他多个数据集进行验证 |
| 159 | 2024-08-05 |
Analysis of cancer-associated fibroblasts in cervical cancer by single-cell RNA sequencing
2023-12-28, Aging
DOI:10.18632/aging.205353
PMID:38157264
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了宫颈癌中肿瘤相关成纤维细胞的生物功能 | 该研究通过scRNA-seq揭示了宫颈癌病人个体细胞层面的异质性，并细分了CAF的三种亚型 | 样本数量相对较少，仅涉及3个宫颈癌标本 | 研究宫颈癌组织中肿瘤相关成纤维细胞的作用及其在微环境异质性中的地位 | 3例宫颈癌标本的单细胞数据 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 3个宫颈癌标本 |
| 160 | 2024-08-05 |
Identification and validation of key biomarkers associated with macrophages in nonalcoholic fatty liver disease based on hdWGCNA and machine learning
2023-12-21, Aging
DOI:10.18632/aging.205374
PMID:38147020
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研究论文 | 本文通过hdWGCNA和机器学习识别和验证与非酒精性脂肪肝病相关的关键生物标志物 | 本文创新性地识别了一种特定的巨噬细胞群体NASH-巨噬细胞，并筛选出两个与NAFLD高度相关的标志基因 | 仅使用了小鼠模型进行验证，可能不足以完全代表人类NAFLD的复杂性 | 探究非酒精性脂肪肝病的根本原因和分子标志物 | 本文研究的对象是巨噬细胞及其在非酒精性脂肪肝病中的作用 | 机器学习 | 非酒精性脂肪肝病 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因组数据 | 多个正常和NAFLD肝脏样本的scRNA-seq和RNA-seq数据 |