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当前共找到 437 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-10-07 |
High-Quality Brain and Bone Marrow Nuclei Preparation for Single Nuclei Multiome Assays
2023-12-22, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/65715
PMID:38189499
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研究论文 | 本文介绍了用于10X Genomics多组学测序流程的大脑和骨髓样本高质量细胞核制备方法 | 开发了针对大脑和骨髓组织的标准化细胞核制备方案，确保产生高质量的单细胞核悬浮液 | 仅针对大脑和骨髓两种特定组织类型，未验证其他组织类型的适用性 | 建立优化的单细胞核制备流程以提高多组学测序数据质量 | 大脑组织和骨髓组织样本 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞多组学测序，单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | 基因组学数据，表观遗传学数据 | NA | 10x Genomics | single-cell multi-omics, single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | 10x Chromium | 10X Genomics droplet-based single-cell profiling platform for multiome assays |
| 142 | 2025-10-07 |
Mapping the landscape of lineage-specific dynamic regulation of gene expression using single-cell transcriptomics and application to genetics of complex disease
2023-Dec-14, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.10.24.23297476
PMID:37961453
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研究论文 | 开发单细胞转录组学框架量化基因表达动态遗传调控及其细胞类型特异性 | 建立细胞类型特异性和细胞状态调整的基因表达遗传模型，实现单细胞分辨率下基因表达动态遗传调控的量化 | 研究聚焦中脑神经元，模型在其他细胞类型中的普适性需进一步验证 | 解析遗传变异如何通过影响基因表达参与人类生物学过程和复杂疾病 | 诱导多能干细胞分化的中脑神经元 | 单细胞转录组学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | 遗传模型 | 单细胞转录组数据 | 英国生物银行1500多种表型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 143 | 2025-10-07 |
PPARγ agonist treatment reduces fibroadipose tissue in secondary lymphedema by exhausting fibroadipogenic PDGFRα+ mesenchymal cells
2023-12-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.165324
PMID:38131378
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研究论文 | 本研究探讨PPARγ激动剂罗格列酮通过消耗PDGFRα+间充质细胞减少继发性淋巴水肿中纤维脂肪组织沉积的机制 | 首次发现促脂肪生成药物罗格列酮能同时减少淋巴水肿中的纤维化和脂肪组织沉积，揭示了PDGFRα+细胞在病理过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类组织验证有限，临床转化需要进一步研究 | 探究PPARγ激动剂治疗继发性淋巴水肿的机制和效果 | 继发性淋巴水肿小鼠模型和人类组织样本 | 病理生理学 | 淋巴水肿 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 组织学分析 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据, 组织图像 | 小鼠模型和人类组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 144 | 2025-10-07 |
Generation of renal tubular organoids from adult SOX9+ kidney progenitor cells
2023-Dec, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnad047
PMID:39872058
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研究论文 | 本研究从成年SOX9+肾脏祖细胞成功生成了肾小管类器官 | 首次证明成年SOX9+肾脏祖细胞具有自主形成肾脏类器官的能力 | 无法分化为肾小球细胞 | 研究SOX9+肾脏祖细胞的分化潜能和类器官形成能力 | 小鼠和人类的SOX9+肾脏祖细胞 | 组织工程 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 145 | 2025-10-07 |
DNA replication in early mammalian embryos is patterned, predisposing lamina-associated regions to fragility
2023-Dec-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.25.573304
PMID:38234839
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研究论文 | 本研究揭示了哺乳动物早期胚胎中DNA复制的模式化特征及其与染色体脆弱性的关联 | 首次发现哺乳动物胚胎在受精后第一个细胞周期就建立了早期和晚期复制区域，并证明这种模式导致核纤层相关区域易于发生染色体断裂 | 研究主要基于牛和小鼠胚胎，在人类胚胎中的验证仍需进一步研究 | 探索哺乳动物发育过程中DNA复制程序的建立机制及其生物学意义 | 牛和小鼠的早期胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组测序数据 | 牛和小鼠早期胚胎单细胞 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 146 | 2025-10-07 |
Rapid and Quantitative Functional Interrogation of Human Enhancer Variant Activity in Live Mice
2023-Dec-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.10.570890
PMID:38105996
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研究论文 | 开发了一种基于Cas9的双色荧光报告系统dual-enSERT，用于在活体小鼠中快速定量比较增强子等位基因活性 | 首次实现活体小鼠中增强子变体功能的快速定量分析，可在两周内完成从候选变异识别到胚胎活体分析的全流程 | 主要依赖小鼠模型，在人类疾病直接应用方面存在局限性 | 开发高效分析人类非编码变体功能的方法 | 与肢体多指症、自闭症和颅面畸形相关的增强子变体 | 功能基因组学 | 先天性畸形 | CRISPR-Cas9基因编辑，单细胞转录组测序 | 双色荧光报告系统 | 荧光成像数据，单细胞RNA测序数据 | 活体小鼠胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 147 | 2025-10-07 |
Bioinformatics and system biology analysis revealed the crosstalk between COVID-19 and osteoarthritis
2023-12, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.1123
PMID:38156385
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研究论文 | 通过生物信息学和系统生物学分析揭示COVID-19与骨关节炎之间的相互作用机制 | 首次通过生物信息学方法系统识别COVID-19与骨关节炎的共同病理机制，发现4个关键枢纽基因及相关调控网络 | 研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证；样本来源和数量未明确说明 | 探索COVID-19与骨关节炎之间的共同病理机制和潜在治疗靶点 | COVID-19患者和骨关节炎患者的基因表达数据，以及OA小鼠模型 | 生物信息学 | COVID-19, 骨关节炎 | 差异表达基因分析, 蛋白互作网络分析, 功能富集分析, qPCR, Western Blot, 单细胞RNA测序 | OA小鼠模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 148 | 2025-10-07 |
Transcriptomic research in atherosclerosis: Unravelling plaque phenotype and overcoming methodological challenges
2023-Dec, Journal of molecular and cellular cardiology plus
DOI:10.1016/j.jmccpl.2023.100048
PMID:39802625
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综述 | 本文探讨转录组学在动脉粥样硬化斑块表型研究中的应用价值及方法论挑战 | 系统阐述整合多组学数据与机器学习在动脉粥样硬化研究中的创新价值 | 研究结果可重复性低且缺乏标准化流程 | 通过转录组学研究揭示动脉粥样硬化斑块表型及推进精准医疗 | 动脉粥样硬化斑块 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | bulk sequencing, single-cell sequencing | 机器学习 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 149 | 2025-10-07 |
Benchmarking single-cell hashtag oligo demultiplexing methods
2023-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqad086
PMID:37829177
|
研究论文 | 本研究对七种单细胞哈希寡核苷酸(HTO)解复用工具进行了性能评估和比较 | 首次使用遗传变异数据作为'地面真实值'来系统评估HTO解复用工具的性能 | 研究结果可能受限于所使用的特定数据集和实验条件 | 评估和比较单细胞HTO解复用方法的准确性和可靠性 | 七种HTO解复用工具(hashedDrops, HTODemux, GMM-Demux, demuxmix, deMULTIplex, BFF, HashSolo) | 单细胞测序数据分析 | NA | 单细胞RNA测序, 哈希寡核苷酸标记 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 150 | 2024-12-24 |
scFseCluster: a feature selection-enhanced clustering for single-cell RNA-seq data
2023-12, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202302103
PMID:37788907
|
研究论文 | 本文提出了一种名为scFseCluster的新型计算框架，用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 | scFseCluster通过量子松鼠搜索算法进行特征选择，提取最优基因集，从而提高细胞聚类的性能 | NA | 提高单细胞RNA测序数据聚类分析的性能 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 量子松鼠搜索算法 | 基因表达数据 | 八个基准单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 151 | 2024-12-13 |
Single-cell transcriptomics reveals long noncoding RNAs associated with tumor biology and the microenvironment in pancreatic cancer
2023-Dec, NAR cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/narcan/zcad055
PMID:38023733
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学揭示了与胰腺癌肿瘤生物学和微环境相关的长链非编码RNA | 首次使用单细胞转录组数据全面评估了胰腺导管腺癌中的长链非编码RNA景观，并揭示了肿瘤内在生物学和肿瘤微环境中lncRNA的作用 | 研究仅限于胰腺导管腺癌，且样本量相对较小 | 探讨长链非编码RNA在胰腺导管腺癌中的作用及其与肿瘤内在生物学和微环境的关系 | 胰腺导管腺癌患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 21名胰腺导管腺癌患者的73个多区域样本 | NA | NA | NA | NA |
| 152 | 2024-12-12 |
scMIC: A Deep Multi-Level Information Fusion Framework for Clustering Single-Cell Multi-Omics Data
2023-12, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2023.3317272
PMID:37725723
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研究论文 | 提出了一种名为scMIC的深度多层次信息融合框架，用于聚类单细胞多组学数据 | 该框架能够整合细胞的属性信息和潜在的结构关系，减少不同组学之间的冗余信息，并通过多重协同监督聚类策略提高聚类精度 | NA | 提高单细胞多组学数据聚类的准确性 | 单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 深度学习框架 | 多组学数据 | 七个单细胞多组学数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 153 | 2024-12-12 |
scGCC: Graph Contrastive Clustering With Neighborhood Augmentations for scRNA-Seq Data Analysis
2023-12, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2023.3319551
PMID:37751336
|
研究论文 | 本文提出了一种名为scGCC的图对比聚类模型，用于单细胞RNA测序数据分析，旨在解决高维度、稀疏性和批次效应等问题 | 引入图注意力网络（GAT）进行细胞表示学习，并提出了五种数据增强方法以提高聚类性能和鲁棒性 | 未提及具体局限性 | 开发一种新的图自监督对比学习模型，用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型和亚型识别 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 图对比学习模型 | 数据 | 14个真实世界数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 154 | 2024-12-01 |
Spatial Transcriptomics Resolve an Emphysema-specific Lymphoid Follicle B Cell Signature in COPD
2023-Dec-08, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202303-0507OC
PMID:38064378
|
研究论文 | 研究分析了慢性阻塞性肺疾病（COPD）中与肺气肿相关的淋巴滤泡（LF）的转录组特征 | 揭示了肺气肿患者淋巴滤泡中B细胞活化的独特转录组特征 | 研究样本仅限于40名COPD患者和吸烟者，可能无法代表所有COPD患者的情况 | 探讨COPD患者中肺气肿与淋巴滤泡B细胞免疫成分的关系 | COPD患者和吸烟者的肺组织中的淋巴滤泡 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 40名COPD患者和吸烟者的肺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 155 | 2024-11-20 |
The testicular microvasculature in Klinefelter syndrome is immature with compromised integrity and characterized by excessive inflammatory cross-talk
2023-12-04, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/dead224
PMID:37910660
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研究论文 | 研究探讨了Klinefelter综合征（KS）患者的睾丸微血管在单细胞水平上的基因表达模式，揭示了微血管功能障碍的潜在机制 | 首次在单细胞水平上揭示了KS患者睾丸微血管相关细胞的独特基因表达模式，表明内皮细胞过度激活、血管形成紊乱和血管完整性受损 | 研究样本量不平衡，各组样本数量和细胞数量不同，且缺乏临床信息的限制，无法推断基因表达变化可能导致的生物学后果，未包含青春期前年龄组限制了研究结果的普遍性 | 探讨KS是否会导致睾丸中独特的基因表达模式，从而揭示报道的睾丸微血管功能障碍 | Klinefelter综合征（KS）、非阻塞性无精子症（NOA）、隐匿性精子症和对照组的睾丸细胞 | NA | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | KS组6例，NOA组5例，隐匿性精子症3例，对照组15例 | NA | NA | NA | NA |
| 156 | 2024-11-06 |
Temporal recording of mammalian development and precancer
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.18.572260
PMID:38187699
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研究论文 | 本文利用NSC-seq平台记录哺乳动物发育和癌前病变中的细胞事件时间顺序 | 开发了一种新的分子时钟方法，结合细胞状态和谱系信息，记录细胞事件的时间和克隆性 | NA | 研究哺乳动物胚胎发育和癌前病变中细胞事件的时间顺序 | 小鼠胚胎发育中的组织特异性细胞扩张和人类癌前病变中的多祖先起源 | 数字病理学 | NA | NSC-seq | NA | 单细胞多组学数据 | 116个scRNA-seq数据集和418个人类息肉样本 | NA | NA | NA | NA |
| 157 | 2024-10-21 |
CellBiAge: Improved single-cell age classification using data binarization
2023-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113500
PMID:38032797
|
研究论文 | 本文开发了一种名为CellBiAge的机器学习管道，用于通过单细胞转录组学对小鼠脑细胞的年龄进行分类 | 通过基因表达值的二值化显著提高了不同模型、技术和脑区的测试性能，并识别了潜在的与年龄相关的基因 | NA | 开发一种准确的方法来预测特定细胞类型的年龄，以理解衰老的异质性和评估 rejuvenation 策略 | 小鼠脑细胞的年龄分类 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 158 | 2024-10-20 |
Insect Insights at the Single-Cell Level: Technologies and Applications
2023-12-31, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13010091
PMID:38201295
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在昆虫研究中的应用，重点介绍了其在生物学应用中的进展、当前挑战及未来机遇 | scRNA-seq技术在昆虫研究中揭示了细胞类型的复杂性和异质性，发现了新的细胞类型及其相互关系 | 当前挑战包括技术复杂性和数据分析的难度 | 探讨单细胞RNA测序技术在昆虫研究中的应用及其未来发展 | 昆虫细胞类型及其功能 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 159 | 2024-10-20 |
Human disease-specific cell signatures in non-lesional tissue in Multiple Sclerosis detected by single-cell and spatial transcriptomics
2023-Dec-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.20.572491
PMID:38187779
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研究论文 | 研究通过单细胞和空间转录组学技术，分析多发性硬化症患者非病变组织中的细胞类型变化 | 首次在多发性硬化症患者的非病变组织中检测到细胞类型特异性变化，并验证了这些变化与疾病病理过程的相关性 | 样本量相对较小，且仅限于特定脑区的研究 | 探讨多发性硬化症患者非病变组织中的细胞类型变化及其与疾病病理过程的关系 | 多发性硬化症患者的非病变脑组织 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 共78个样本，包括15个对照个体、8个多发性硬化症患者和5个其他伴有脱髓鞘病理的个体 | NA | NA | NA | NA |
| 160 | 2024-10-20 |
SpaceWalker enables interactive gradient exploration for spatial transcriptomics data
2023-12-18, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100645
PMID:37972590
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研究论文 | 介绍了一种名为SpaceWalker的视觉分析工具，用于探索空间转录组学数据的局部梯度结构 | SpaceWalker能够实时识别转录组学相似的细胞，并通过空间投影突出组织结构特征，支持多种空间转录组学协议 | NA | 开发一种工具，帮助研究人员在空间转录组学数据中发现生物学相关的特征 | 空间转录组学数据的局部梯度结构 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多切片3D全脑数据 | NA | NA | NA | NA |