单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 436 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-05 |
Single-cell insights into epithelial morphogenesis in the neonatal mouse uterus
2023-Dec-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2316410120
PMID:38019863
|
研究论文 | 本文探讨了新生小鼠子宫上皮的单细胞转录组分析 | 揭示了子宫上皮成熟、谱系分叉和分化的轨迹分析，并识别了新的腺体上皮表达基因 | 所研究的模型仅限于新生小鼠，可能无法完全代表其他生物或成年状态 | 阐明子宫上皮发育过程中的细胞和分子机制 | 新生小鼠的子宫上皮细胞 | 数字病理 | NA | 单细胞转录组学 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 子宫上皮细胞样本 |
| 142 | 2024-08-05 |
Benchmarking single-cell hashtag oligo demultiplexing methods
2023-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqad086
PMID:37829177
|
研究论文 | 本研究对七种HTO去复用工具的性能进行了评估 | 首次比较了七种HTO去复用工具的性能，并引入了对比基于遗传变异的数据 | 部分方法在较低质量数据下表现不佳 | 评估多种HTO去复用工具在单细胞RNA测序中的性能 | 七种HTO去复用工具 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 七种工具，在多个样本中使用遗传变异进行比较 |
| 143 | 2024-08-04 |
The Functional Roles of MDSCs in Severe COVID-19 Pathogenesis
2023-12-23, Viruses
DOI:10.3390/v16010027
PMID:38257728
|
评论 | 本文总结了骨髓来源抑制细胞(MDSCs)在严重COVID-19发病机制中的功能角色 | 文章提出MDSCs的早期扩展可能是严重COVID-19进展的关键特征，并探讨其作为潜在预后生物标志物的作用 | 缺乏对严重COVID-19进展的全面分子决定因素的阐明 | 探讨骨髓来源抑制细胞在严重COVID-19发病机制中的作用 | 严重COVID-19患者的MDSCs及其功能 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序, 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 通过转录组RNA-seq和单细胞测序数据的荟萃分析得出的数据 |
| 144 | 2024-08-04 |
Anterior Pituitary Transcriptomics Following a High-Fat Diet: Impact of Oxidative Stress on Cell Metabolism
2023-Dec-23, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad191
PMID:38103263
|
研究论文 | 本研究探讨高脂饮食对前垂体转录组的影响，特别是氧化压力对细胞代谢的影响。 | 本研究首次比较了男女小鼠在高脂饮食下前垂体细胞对氧化压力的适应能力。 | 未能深入分析高脂饮食对前垂体基因表达长期影响的变化。 | 研究高脂饮食对前垂体功能及其转录组的影响。 | 使用FVB.129P小鼠探讨高脂饮食对男女前垂体细胞的影响。 | 数字病理学 | 肥胖相关病 | 单细胞RNA测序 | NA | 血清激素和细胞转录组数据 | 男性和女性FVB.129P小鼠，每组增加了20克体重 |
| 145 | 2024-08-04 |
Single-Molecule Spatial Transcriptomics of Human Thoracic Aortic Aneurysms Uncovers Calcification-Related CARTPT-Expressing Smooth Muscle Cells
2023-12, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.319329
PMID:37823268
|
研究论文 | 本研究揭示了人类胸主动脉瘤中与钙化相关的CARTPT表达的平滑肌细胞的稀有亚型 | 采用高分辨率单细胞转录组成像技术揭示了胸主动脉瘤组织样本中稀有平滑肌细胞类型 | 主要集中于男性TAA样本，可能限制了对其他人群的普遍适用性 | 揭示人类胸主动脉瘤中平滑肌细胞的异质性及其功能 | 人类胸主动脉瘤组织样本中的平滑肌细胞亚型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单分子空间转录组成像 | NA | 组织样本 | 140个基因的转录本在新鲜冷冻的TAA样本中分析 |
| 146 | 2024-08-04 |
Brain-wide correspondence of neuronal epigenomics and distant projections
2023-Dec, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06823-w
PMID:38092919
|
研究论文 | 这篇文章探讨了单细胞表观基因组学与远程投影之间的关联 | 通过epi-retro-seq技术，首次将单细胞表观基因组与长距离细胞投影链接起来 | 样本研究主要集中在小鼠大脑，可能不适用于其他物种 | 阐明不同类型的神经元如何通过长距离投影进行相互作用 | 分析来自32个不同脑区的33,034个神经元及其投影目标 | 数字病理学 | NA | epi-retro-seq | NA | 细胞基因组数据 | 33,034个神经元，来自32个不同脑区 |
| 147 | 2024-08-05 |
Deriving early single-rosette brain organoids from human pluripotent stem cells
2023-12-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.10.020
PMID:37995702
|
研究论文 | 本文开发了一种新的人脑类器官技术，能够在早期时间点生成自组织的单星状皮层类器官 | 提出了一种基于人诱导多能干细胞的单层培养方法，能够有效生成单星状皮层类器官 | 未提及具体的样本限制和对比分析的局限性 | 研究人脑发育及相关疾病模型 | 人诱导多能干细胞转化为皮层类器官 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 化学诱导 | 未提及 | 单细胞RNA测序 | 未提及 |
| 148 | 2024-08-05 |
Distinct secretomes in p16- and p21- positive senescent cells across tissues
2023-Dec-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.05.569858
PMID:38106149
|
研究论文 | 本文综合研究了不同组织中p16和p21阳性衰老细胞的独特分泌组 | 揭示了p21和p16转录本在不同细胞类型和组织中的重大异质性，强调了细胞衰老及其分泌表型的多样性 | 部分SASP因子持续贡献于共享的“核心”SASP，仍需在更广泛的生物学背景下进行更细致的研究 | 探讨p21和p16在衰老细胞及其分泌表型中的作用 | 多个小鼠和人类组织的单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 多个小鼠和人类组织的数据集 |
| 149 | 2024-08-07 |
A high-throughput single-cell RNA expression profiling method identifies human pericyte markers
2023-Dec, Neuropathology and applied neurobiology
IF:4.0Q1
DOI:10.1111/nan.12942
PMID:37812061
|
研究论文 | 本文通过高吞吐量的单细胞RNA表达谱分析方法，识别了人类大脑中周细胞的标记基因 | 本文采用了一种高吞吐量且低成本的单细胞转录组测序方法EasySci，成功识别了先前未被表征的周细胞特异性基因标记 | NA | 旨在识别并优化一个普遍可用的组织学标记，用于人类大脑中的周细胞 | 人类大脑中的周细胞及其标记基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | RNA表达谱 | 涉及不同人类和鼠类大脑区域的单细胞RNA表达数据 |
| 150 | 2024-08-05 |
Single-cell genomics reveals new rozellid lineages and supports their sister relationship to Microsporidia
2023-12, Biology letters
IF:2.8Q2
DOI:10.1098/rsbl.2023.0398
PMID:38087939
|
研究论文 | 本研究揭示了新发现的rozellid谱系，并支持其与微孢子虫的姐妹关系 | 首次通过单细胞测序提供三种新的rozellid谱系的基因组数据 | 目前尚未完全理解rozellids与微孢子虫之间的系统发育关系 | 探讨rozellid谱系的系统发育及其与微孢子虫的关系 | 新发现的三种rozellid谱系 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 来自环境样本的三个新rozellid谱系 |
| 151 | 2024-08-05 |
Tissue-specific Cre driver mice to study vascular diseases
2023-12, Vascular pharmacology
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.vph.2023.107241
PMID:37923099
|
研究论文 | 本文探讨了组织特异性Cre驱动小鼠在血管疾病研究中的应用 | 介绍了革命性的单细胞RNA测序和双重重组酶系统对于组织特异性Cre驱动小鼠的未来发展 | 未提及具体实验局限性 | 扩展对血管疾病的理解 | 主要研究血管壁的主要细胞类型及相关的Cre驱动小鼠 | 数字病理学 | NA | Cre-loxP系统 | 条件性基因敲除小鼠 | NA | NA |
| 152 | 2024-08-04 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal POSTN+ cancer-associated fibroblasts correlated with immune suppression and tumour progression in non-small cell lung cancer
2023-12, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1515
PMID:38115703
|
研究论文 | 本研究揭示了POSTN+癌症相关成纤维细胞与非小细胞肺癌中的免疫抑制和肿瘤进展的相关性 | 识别了POSTN+成纤维细胞亚群，与肿瘤进展和免疫抑制相关 | 研究局限于16例NSCLC患者的样本，且仅分析特定的CAF亚群 | 探讨癌症相关成纤维细胞在非小细胞肺癌进展中的作用 | 对16例非小细胞肺癌患者的肿瘤及其相邻样本进行单细胞转录组测序 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序，SpaTial增强分辨率组学测序，免疫组化 | NA | RNA数据 | 16名非小细胞肺癌患者的肿瘤和相邻样本 |
| 153 | 2024-08-07 |
Immunological link between periodontitis and type 2 diabetes deciphered by single-cell RNA analysis
2023-12, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1503
PMID:38082425
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了牙周炎与2型糖尿病之间的免疫学联系 | 首次揭示了2型糖尿病如何加剧T/NK细胞免疫的恶化以及牙周炎与糖尿病之间的免疫学基础 | 样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 旨在比较单纯牙周炎患者与同时患有牙周炎和2型糖尿病患者的免疫反应，以扩展对牙周炎与糖尿病复杂联系的理解 | 外周血单个核细胞 | NA | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 11名健康对照者，10名单纯牙周炎患者，6名同时患有牙周炎和2型糖尿病的患者 |
| 154 | 2024-08-04 |
Differential developmental blueprints of organ-intrinsic nervous systems
2023-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.12.571306
PMID:38168446
|
研究论文 | 本文描述了肠道神经系统与心脏内在神经系统之间实现器官特异性组织的不同策略 | 揭示了内脏器官特异性神经元分化路径受其宿主器官影响的基本原则 | 对心脏内在神经系统的了解仍然较少，可能影响研究深入性 | 探讨内在神经系统的发展蓝图及其器官特异性 | 研究对象包括肠道神经系统和心脏内在神经系统的前体细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 高分辨率全胚胎成像、单细胞基因组学、空间转录组学、蛋白质组学和生物信息学 | NA | NA | NA |
| 155 | 2024-08-05 |
Human monoclonal antibodies against Staphylococcus aureus A protein identified by high-throughput single-cell sequencing of phase I clinical volunteers' B cells
2023-12, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2023.109843
PMID:37981106
|
研究论文 | 本研究通过高通量单细胞测序识别出对抗金黄色葡萄球菌A蛋白的人源单克隆抗体 | 发现了一种特异性针对金黄色葡萄球菌A蛋白的高表达的人单克隆抗体IgG-6 | 本研究仅在I期临床试验中进行，样本量相对较小，长期效果尚未验证 | 研究人源单克隆抗体作为对付金黄色葡萄球菌感染的新策略 | 从64名志愿者的外周血淋巴细胞中分离的抗原特异性记忆B细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | 64名临床志愿者的外周血淋巴细胞 |
| 156 | 2024-08-07 |
Ruxolitinib attenuates acute rejection and can serve as an immune induction therapy in heart transplantation
2023-12, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2023.109851
PMID:38008145
|
研究论文 | 研究探讨了IL2RA拮抗剂在心脏移植患者中的效果，并发现鲁索利替尼可能是一种新的免疫诱导治疗药物 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了IL2RA拮抗剂治疗后免疫细胞的动态变化，并发现鲁索利替尼可作为新的免疫诱导治疗药物，不影响调节性T细胞的激活 | 研究主要基于小鼠模型，需要在人体中进一步验证 | 阐明IL2RA拮抗剂的效果并寻找优于IL2RA拮抗剂的治疗目标 | 心脏移植患者及IL2RA拮抗剂治疗后的免疫细胞 | NA | 心脏移植 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 十九种细胞类型 |
| 157 | 2024-08-07 |
Identification of antigen-presentation related B cells as a key player in Crohn's disease using single-cell dissecting, hdWGCNA, and deep learning
2023-Dec, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-023-01145-7
PMID:37550553
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，结合高维加权基因共表达网络分析和深度学习方法，识别出与克罗恩病发病机制相关的抗原呈递相关B细胞亚群 | 首次揭示了抗原呈递相关B细胞在克罗恩病发病机制中的潜在促进作用，并开发了一种基于基因-免疫卷积神经网络的深度学习模型，有效区分疾病与正常黏膜 | NA | 探究克罗恩病的发病机制及其临床意义 | 克罗恩病中的B细胞亚群及其在疾病中的作用 | 机器学习 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | 卷积神经网络 | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 158 | 2024-08-07 |
COX5A as a potential biomarker for disease activity and organ damage in lupus
2023-Dec, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-023-01215-w
PMID:37891386
|
研究论文 | 本研究通过综合分析RNA-seq数据和单细胞RNA测序数据，探讨了系统性红斑狼疮（SLE）中的关键通路和驱动基因，并评估了COX5A作为SLE疾病活动和器官损伤的潜在生物标志物的价值 | 本研究首次发现氧化磷酸化（OXPHOS）是SLE中最显著改变的代谢途径，并识别了与OXPHOS相关的酶COX5A，其表达与SLE的疾病活动、器官损伤和皮质类固醇治疗相关 | NA | 旨在深入了解SLE的免疫学途径和预后生物标志物 | SLE的免疫细胞类型、关键通路和驱动基因，以及COX5A作为生物标志物的潜在价值 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据, 单细胞RNA测序数据 | 64例SLE患者和62例健康对照 |
| 159 | 2024-08-04 |
Direct Male Development in Chromosomally ZZ Zebrafish
2023-Dec-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.27.573483
PMID:38234788
|
研究论文 | 该文章研究了NA斑马鱼的性别决定和生殖腺发展机制 | 揭示了NA斑马鱼在生殖腺发育中直接形成睾丸而非经过幼年卵巢阶段的机制 | 未明确提及该研究的局限性 | 理解NA斑马鱼的性别决定和生殖腺发育机制 | ZZ和ZW斑马鱼的生殖腺发育过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 肝脏组织样本 | 涉及19天和30天后生殖腺的样本 |
| 160 | 2024-08-07 |
Hedgehog signalling in Foxd1+ embryonic kidney stromal progenitors controls nephron formation via Cxcl12 and Wnt5a
2023-12, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6195
PMID:37772431
|
研究论文 | 研究揭示了胚胎肾脏间质祖细胞中Hedgehog信号通路在通过Cxcl12和Wnt5a调控肾单位形成中的主要致病作用 | 首次确定了Hedgehog信号通路在胚胎肾脏间质细胞中的过度激活导致先天性肾单位数量减少的机制，并发现Cxcl12和Wnt5a是其下游关键分子 | 研究主要基于小鼠模型和人类肾脏类器官，可能需要进一步的人体研究来验证这些发现 | 探讨先天性肾脏和尿道异常（CAKUT）中肾单位数量减少的病理机制 | 胚胎肾脏间质祖细胞中的Hedgehog信号通路及其对肾单位形成的影响 | 数字病理学 | 先天性肾脏和尿道异常 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织 | 小鼠模型和人类肾脏类器官 |