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当前共找到 437 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-10-06 |
PGF2α signaling drives fibrotic remodeling and fibroblast population dynamics in mice
2023-12-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172977
PMID:37934604
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示PGF2α信号通路在特发性肺纤维化中的作用机制 | 首次发现PGF2α/FPr信号轴是TGF-β1非依赖性的IPF信号枢纽，并识别出易感的成纤维细胞亚群 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究PGF2α信号在肺纤维化重塑和成纤维细胞群体动态中的作用 | 表达Sftpc基因突变的小鼠模型和Ptgfr基因敲除小鼠 | 病理生物学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序，伪时序分析，体外实验 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据，组织病理数据 | 多组基因型小鼠队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 102 | 2025-10-06 |
Inference after latent variable estimation for single-cell RNA sequencing data
2023-12-15, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxac047
PMID:36511385
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研究论文 | 提出了一种称为计数分割的灵活框架，用于在单细胞RNA测序数据分析中进行有效的统计推断 | 开发了计数分割方法，能够在潜在变量估计后实现有效的统计推断，解决了标准方法无法控制I型错误的问题 | 方法基于泊松假设，可能不适用于不符合此假设的数据类型 | 解决单细胞RNA测序数据分析中潜在变量估计后的统计推断问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计推断框架 | 基因表达数据 | 多能干细胞向心肌细胞分化的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2025-10-06 |
Imputation for Single-cell RNA-seq Data with Non-negative Matrix Factorization and Transfer Learning
2023-12, Journal of bioinformatics and computational biology
IF:0.9Q4
DOI:10.1142/S0219720023500294
PMID:38248911
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研究论文 | 提出一种结合非负矩阵分解和迁移学习的方法来填补单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 首次将迁移学习与非负矩阵分解相结合用于scRNA-seq数据填补，通过引入图正则化项和迁移项来保持数据固有几何结构并提高表达值估计精度 | NA | 开发更准确的单细胞RNA测序数据填补方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解, 迁移学习 | 基因表达矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 104 | 2025-10-06 |
Comprehensive single-cell analysis demonstrates radiotherapy-induced infiltration of macrophages expressing immunosuppressive genes into tumor in esophageal squamous cell carcinoma
2023-12-15, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adh9069
PMID:38091397
|
研究论文 | 通过综合空间和单细胞分析揭示放疗后食管鳞状细胞癌中表达免疫抑制基因的巨噬细胞浸润现象 | 首次采用CODEX多重免疫染色、VISIUM空间转录组和单细胞RNA测序的整合分析方法，系统揭示放疗后肿瘤微环境中免疫细胞的动态变化特征 | 研究样本量有限，需要在更大队列中验证发现 | 探索放疗后肿瘤免疫微环境的动态变化特征，为联合免疫治疗提供新靶点 | 食管鳞状细胞癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 多重免疫染色 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 免疫染色图像 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | 10x Visium | VISIUM空间转录组技术 |
| 105 | 2025-10-06 |
Opportunities for High-plex Spatial Transcriptomics in Solid Organ Transplantation
2023-12-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004587
PMID:36944604
|
综述 | 探讨高plex空间转录组技术在实体器官移植领域的应用潜力 | 首次系统阐述空间转录组技术从神经科学和肿瘤学领域向移植科学拓展的应用前景 | 目前该技术在移植领域尚未实际应用，主要基于理论探讨 | 探索空间转录组技术在移植诊断、监测和研究中的潜在价值 | 移植患者群体及其相关器官组织 | 空间转录组学 | 器官移植相关疾病 | 空间转录组技术，下一代测序 | NA | mRNA转录组空间数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 106 | 2025-10-06 |
Mapping inherited genetic variation with opposite effects on autoimmune disease and cancer identifies candidate drug targets associated with the anti-tumor immune response
2023-Dec-28, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.12.23.23300491
PMID:38234717
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研究论文 | 通过分析自身免疫性疾病与癌症风险呈相反效应的遗传变异，识别出5个潜在的癌症免疫治疗靶点基因 | 首次系统性识别对自身免疫性疾病和癌症风险具有相反效应的遗传变异，并整合多组学数据验证其功能 | 研究主要基于欧洲人群数据，结果在其他人群中的普适性需要进一步验证 | 识别对自身免疫性疾病和癌症风险具有相反效应的遗传变异，发现新的癌症免疫治疗靶点 | 乳腺癌、前列腺癌、卵巢癌、子宫内膜癌患者及七种自身免疫/自身炎症性疾病患者 | 遗传学 | 癌症 | GWAS, RNA-seq, 单细胞RNA-seq, eQTL分析 | 固定效应跨疾病荟萃分析 | 基因组数据, 转录组数据 | 240,540例癌症患者/317,000例对照，112,631例自身免疫疾病患者/895,386例对照 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 107 | 2025-10-06 |
Gene module reconstruction elucidates cellular differentiation processes and the regulatory logic of specialized secretion
2023-Dec-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.29.573643
PMID:38234833
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序重建分化过程，揭示分泌组织中基因模块的调控逻辑 | 提出整合表达和功能相似性的基因模块识别方法，发现未折叠蛋白反应转录因子在调控通用和特化分泌功能中的新作用 | 研究仅基于斑马鱼脊索和孵化腺两种分泌组织，在其他组织中的普适性需进一步验证 | 解析细胞分化过程中基因模块重建和分泌功能调控机制 | 斑马鱼脊索和孵化腺组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼胚胎（功能缺失和功能获得突变体） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 108 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics identifies adipose tissue CD271+ progenitors for enhanced angiogenesis in limb ischemia
2023-12-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101337
PMID:38118404
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析识别出脂肪组织CD271+祖细胞在肢体缺血模型中具有增强血管生成的能力 | 首次通过单细胞转录组技术从皮下脂肪组织中鉴定出CD271+祖细胞群体，并证明其在肢体缺血模型中具有优于传统脂肪基质细胞的血管生成能力 | 研究中使用了异种移植模型，可能无法完全模拟人类疾病环境；胰岛素抵抗供体中CD271祖细胞数量和功能下降的机制需要进一步研究 | 寻找更有效的细胞疗法用于治疗严重肢体缺血 | 人类组织中的CD271+祖细胞，特别是皮下脂肪组织来源的细胞群体 | 单细胞生物学 | 肢体缺血 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 109 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomics and In Vitro Lineage Tracing Reveals Differential Susceptibility of Human iPSC-Derived Midbrain Dopaminergic Neurons in a Cellular Model of Parkinson's Disease
2023-12-18, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12242860
PMID:38132179
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和体外谱系追踪技术，揭示了人类iPSC来源的中脑多巴胺能神经元在帕金森病细胞模型中的差异性易感性 | 开发了能够通过BFP表达纯化和追踪新生中脑多巴胺能祖细胞及其分化后代的人类iPSC系，结合CRISPR/Cas9基因编辑和单细胞RNA测序技术 | 研究基于体外细胞模型，可能无法完全模拟体内帕金森病的复杂病理环境 | 建立帕金森病的干细胞模型并研究疾病相关细胞类型的易感性 | 人类诱导多能干细胞(iPSC)分化的中脑多巴胺能神经元 | 干细胞生物学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因编辑, 免疫细胞化学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 110 | 2025-10-06 |
Early human lung immune cell development and its role in epithelial cell fate
2023-12-15, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adf9988
PMID:38100545
|
研究论文 | 通过单细胞技术研究人类胚胎和胎儿肺脏免疫细胞的发育过程及其对上皮细胞命运的影响 | 首次系统揭示人类胚胎肺脏免疫细胞的发育时序和多样性，发现免疫细胞可能通过IL-1β信号通路指导上皮细胞发育 | 研究主要基于发育早期样本，缺乏出生后肺脏免疫发育的追踪数据 | 探究人类肺脏发育过程中免疫细胞的作用机制 | 人类胚胎和胎儿肺脏组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 单分子荧光原位杂交, 免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 人类胚胎和胎儿肺脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组技术 | NA | NA |
| 111 | 2025-10-06 |
Preleukemic single-cell landscapes reveal mutation-specific mechanisms and gene programs predictive of AML patient outcomes
2023-12-13, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100426
PMID:38116120
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析八种小鼠模型的269,048个单细胞图谱，揭示前白血病突变对细胞适应性、谱系命运和代谢的影响，并开发可预测AML患者预后的11基因评分系统 | 首次在单细胞分辨率下系统解析前白血病突变对造血干祖细胞的异质性影响，并建立基于前白血病转录特征的预后预测模型 | 研究基于小鼠模型，在人类AML中的直接适用性需要进一步验证 | 解析前白血病突变对造血干祖细胞的影响机制并开发AML预后预测方法 | 携带髓系恶性肿瘤驱动突变的八种小鼠模型的造血干祖细胞 | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据 | 269,048个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2025-10-06 |
Early cellular mechanisms of type I interferon-driven susceptibility to tuberculosis
2023-12-07, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.11.002
PMID:38029747
|
研究论文 | 本研究揭示了浆细胞样树突状细胞产生的I型干扰素通过作用于间质巨噬细胞促进结核分枝杆菌复制的早期细胞机制 | 首次发现间质巨噬细胞和浆细胞样树突状细胞是结核感染中I型干扰素的主要生产者，并阐明了I型干扰素通过抑制IFNγ反应促进细菌复制的机制 | 研究主要基于小鼠和非人灵长类动物模型，人类数据有限 | 探究I型干扰素驱动结核病易感性的早期细胞机制 | 结核分枝杆菌感染的小鼠、非人灵长类动物和人类肉芽肿组织 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 113 | 2025-10-06 |
Neural plate progenitors give rise to both anterior and posterior pituitary cells
2023-12-04, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.08.018
PMID:37683631
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学发现神经板前体细胞可同时分化为垂体前叶和后叶细胞 | 挑战了垂体前叶细胞仅来源于非神经外胚层的传统观点，揭示了神经板前体对垂体双叶的贡献 | 研究主要基于斑马鱼和小鼠模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究垂体发育的细胞谱系来源和分化机制 | 斑马鱼和小鼠的垂体细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学，遗传谱系追踪 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼和小鼠垂体细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2025-10-06 |
Effect of stretching on inflammation in a subcutaneous carrageenan mouse model analyzed at single-cell resolution
2023-12, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31133
PMID:37909412
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析拉伸对小鼠皮下角叉菜胶炎症模型的影响 | 首次在单细胞分辨率下揭示拉伸对炎症反应的分子机制，发现拉伸同时调节促炎和促消退基因表达 | 研究仅限于小鼠皮下炎症模型，结果可能不直接适用于其他物种或炎症类型 | 探索拉伸在细胞/分子水平对炎症反应的影响机制 | 小鼠皮下角叉菜胶诱导的炎症模型 | 单细胞生物学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2025-10-06 |
Meta-Analysis of COVID-19 BAL Single-Cell RNA Sequencing Reveals Alveolar Epithelial Transitions and Unique Alveolar Epithelial Cell Fates
2023-12, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0077OC
PMID:37523502
|
荟萃分析 | 通过对COVID-19患者支气管肺泡灌洗液单细胞RNA测序数据的荟萃分析，揭示肺泡上皮细胞的异常分化状态 | 首次发现并描述了一种新的AT-I细胞状态，其特征是表皮分化复合体基因的诱导表达，包括SPRR3蛋白和多种角蛋白基因的上调 | 样本量相对有限（健康对照13例，COVID-19患者20例），且为观察性研究，无法确定因果关系 | 通过单细胞RNA测序荟萃分析揭示COVID-19患者肺泡上皮细胞的异常分化和细胞命运 | 支气管肺泡灌洗液细胞，重点关注肺泡上皮II型细胞和I型细胞 | 单细胞转录组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，细胞培养实验 | 伪时间序列分析 | 单细胞RNA测序数据，免疫组织化学图像 | 33个样本（13个健康对照，20个COVID-19患者），共167,280个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 116 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis reveals key differences between early-stage and late-stage systemic sclerosis skin across autoantibody subgroups
2023-12, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224184
PMID:37580109
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析弥漫性皮肤系统性硬化症患者皮肤组织的细胞差异 | 首次在单细胞水平揭示不同自身抗体亚组（ATA+和ARA+）和疾病阶段（早期和晚期）的系统性硬化症皮肤细胞差异 | 样本量较小（12例患者和3例健康对照），仅分析了前臂皮肤活检 | 研究弥漫性皮肤系统性硬化症不同自身抗体亚组和疾病阶段的皮肤细胞差异 | 弥漫性皮肤系统性硬化症患者和健康对照的皮肤组织 | 单细胞生物学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 15例前臂皮肤活检（12例患者，3例健康对照） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 基于液滴的单细胞测序技术 |
| 117 | 2025-10-06 |
Protocol for isolation of signet ring cells from human gastric mucosa
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102695
PMID:37925632
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研究论文 | 本文介绍了一种从人胃黏膜中分离印戒细胞的高活性悬浮方案 | 开发了专门针对胃黏膜印戒细胞的高活性分离方案，并支持多种下游应用 | NA | 建立标准化的印戒细胞分离技术流程 | 人胃黏膜组织中的印戒细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 组织解离、免疫组织化学染色、流式细胞术、单细胞测序 | NA | 组织样本 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 118 | 2025-10-06 |
Protocol to combine brain sections from multiple mice into a single block for spatial transcriptomic analyses
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102617
PMID:37742175
|
研究论文 | 提出一种将多只小鼠脑组织切片整合到单个空间转录组学载玻片上的实验方案 | 开发了将不同小鼠海马体冷冻切片合并成单个冷冻块的方法，可在单个捕获区域分析多个样本 | NA | 提高空间转录组学分析的样本通量和成本效益 | 小鼠海马体脑组织切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 多只小鼠脑组织切片 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 119 | 2025-10-06 |
Single-cell isolation from full-thickness human intestinal tissue resections for single-cell RNA sequencing
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102686
PMID:37925636
|
研究论文 | 本文提出了一种从全层人肠道组织切除样本中分离单细胞的实验方案 | 开发了针对全层肠道组织的单细胞分离标准化流程，包括固有层和肌层的分离处理 | NA | 建立肠道组织单细胞分离的实验方法 | 人全层肠道组织切除样本 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium平台 |
| 120 | 2025-10-06 |
Protocol for multispectral imaging on cryosections to map myeloid cell heterogeneity in its spatial context
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102601
PMID:37742177
|
研究论文 | 本文提出了一种用于在组织冰冻切片上进行多光谱成像以绘制髓系细胞异质性的实验方案 | 开发了在原位通过多光谱成像技术保留细胞空间背景来研究髓系细胞异质性的方法 | NA | 建立一种能够在空间背景下分析髓系细胞异质性的成像方案 | 组织冰冻切片中的髓系细胞 | 数字病理学 | NA | 多光谱成像 | NA | 图像 | NA | NA | 多光谱成像 | NA | NA |