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当前共找到 437 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-06 |
Data-driven selection of analysis decisions in single-cell RNA-seq trajectory inference
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.18.572214
PMID:38187768
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研究论文 | 开发了Escort框架用于评估单细胞RNA测序数据是否适合轨迹推断并量化分析决策对轨迹特性的影响 | 提出了首个通过数据驱动评估来指导单细胞轨迹分析决策的框架，减少了方法选择和参数优化的不确定性 | 未提及具体的性能验证数据集规模或与其他方法的详细比较结果 | 解决单细胞RNA测序轨迹推断中分析方法选择不确定性的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 轨迹推断方法 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 82 | 2025-10-06 |
Enrichment of a neutrophil-like monocyte transcriptional state in glioblastoma myeloid suppressor cells
2023-Dec-28, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3793353/v1
PMID:38234734
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了胶质母细胞瘤中髓源性抑制细胞的异质性，并发现了一种中性粒细胞样单核细胞转录状态的富集 | 首次在胶质母细胞瘤患者血液M-MDSC中发现中性粒细胞样单核细胞转录状态的富集，并开发了相应的基因表达和去卷积算法进行定量分析 | M-MDSC的个体发育和明确表型标记仍未知，研究样本来源有限 | 解析胶质母细胞瘤中髓源性抑制细胞的异质性和转录特征 | 胶质母细胞瘤、肺癌和头颈癌患者的髓源性抑制细胞 | 单细胞转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 胶质母细胞瘤、肺癌和头颈癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 83 | 2025-10-06 |
Chronic chromosome instability induced by Plk1 results in immune suppression in breast cancer
2023-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113266
PMID:37979172
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研究论文 | 本研究通过过表达Plk1诱导染色体不稳定性，揭示了其在乳腺癌中通过激活SASP、上调PD-L1和CD206以及诱导NF-κβ信号通路促进免疫逃逸的机制 | 首次系统阐明Plk1诱导的慢性染色体不稳定性通过多通路协同作用导致乳腺癌免疫抑制的完整机制 | 研究主要基于Her2乳腺癌模型，在其他亚型中的普适性需进一步验证 | 探究染色体不稳定性相关分子特征如何改变肿瘤进化过程中的免疫识别 | Her2乳腺癌模型和人类乳腺癌肿瘤 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 前病变乳腺组织和人类乳腺癌肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 84 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals variations in monocytes and Tregs between gout flare and remission
2023-12-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.171417
PMID:38063198
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示痛风发作期与缓解期单核细胞和调节性T细胞的差异 | 首次在单细胞水平系统揭示痛风发作期HLA-DQA1+非经典单核细胞上调及Tregs在缓解期的关键抑制作用 | 样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 探究痛风发作与缓解期间免疫细胞变化机制 | 痛风患者的免疫细胞（单核细胞亚群和调节性T细胞） | 单细胞组学 | 痛风 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 包含独立验证队列的患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 85 | 2025-10-06 |
The Novel Checkpoint Target Lymphocyte-Activation Gene 3 Is Highly Expressed in Cutaneous Squamous Cell Carcinoma
2023-12-01, Dermatologic surgery : official publication for American Society for Dermatologic Surgery [et al.]
IF:2.5Q1
DOI:10.1097/DSS.0000000000004006
PMID:37962130
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研究论文 | 本研究首次系统分析了淋巴细胞激活基因3(LAG-3)在皮肤鳞状细胞癌中的表达模式 | 首次发现LAG-3在cSCC浸润淋巴细胞中的表达高于PD-1，并量化了LAG-3 mRNA在不同类型cSCC中的差异表达 | 样本量较小(仅3个SCC肿瘤)，需要更大规模研究验证 | 明确LAG-3在皮肤鳞状细胞癌中的表达模式，探索其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 皮肤鳞状细胞癌组织样本及正常皮肤组织 | 肿瘤免疫学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, NanoString技术 | NA | 基因表达数据, mRNA表达数据 | 3个SCC肿瘤样本及正常皮肤对照 | NanoString | 单细胞RNA-seq, 基因表达分析 | NanoString nCounter | NanoString nCounter基因表达分析系统 |
| 86 | 2025-10-06 |
Tobacco smoke exposure recruits inflammatory airspace monocytes that establish permissive lung niches for Mycobacterium tuberculosis
2023-12-06, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg3451
PMID:38055798
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术揭示了烟草烟雾暴露如何通过招募炎性单核细胞建立有利于结核分枝杆菌生长的肺部微环境 | 首次发现吸烟者肺部存在未成熟炎性单核细胞的富集，并鉴定CD93作为这些新招募单核细胞的标志物，阐明了CCR2信号通路在单核细胞招募中的作用机制 | 研究样本量有限，主要基于支气管肺泡灌洗细胞，未涵盖更广泛的肺部组织样本 | 探究吸烟如何促进肺部微环境对结核分枝杆菌生长的易感性 | 当前吸烟者和从不吸烟者的原发性支气管肺泡灌洗细胞 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 流式细胞术, 功能分析 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 当前吸烟者和从不吸烟者的支气管肺泡灌洗细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 87 | 2025-10-06 |
SINGLE CELL DISSECTION OF DEVELOPMENTAL ORIGINS AND TRANSCRIPTIONAL HETEROGENEITY IN B-CELL ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA
2023-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.04.569954
PMID:38106088
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析B细胞急性淋巴细胞白血病的发育起源和转录异质性 | 首次使用单细胞RNA测序系统分析B-ALL样本，并与正常B细胞发育参考图谱比较，揭示白血病细胞起源和瘤内异质性 | 样本数量相对有限（89个B-ALL样本），部分亚型样本可能代表性不足 | 解析B-ALL的发育起源和转录异质性，改进临床和基因组分类 | B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）患者样本 | 单细胞组学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 89个B-ALL样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2025-10-06 |
A single-cell transposable element atlas of human cell identity
2023-Dec-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.28.573568
PMID:38234829
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研究论文 | 开发了用于单细胞转座子元件位点水平分析的工具Stellarscope，并构建了人类PBMC中转座子元件表达的图谱 | 开发了能够将多重比对reads重新分配到特定基因组位点的工具，首次在单细胞水平系统构建了人类转座子元件表达图谱 | NA | 研究转座子元件在人类细胞身份识别中的作用 | 人类外周血单个核细胞(PBMC) | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 期望最大化算法 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2025-10-06 |
Single-Molecule Spatial Transcriptomics of Human Thoracic Aortic Aneurysms Uncovers Calcification-Related CARTPT-Expressing Smooth Muscle Cells
2023-12, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.319329
PMID:37823268
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研究论文 | 利用单分子空间转录组技术揭示人类胸主动脉瘤中与钙化相关的CARTPT表达平滑肌细胞亚型 | 首次在人类胸主动脉瘤中发现空间分布特异的CARTPT表达平滑肌细胞亚型，并证明其与钙化过程相关 | 样本量有限，仅针对胸主动脉瘤组织进行研究 | 探索人类胸主动脉瘤中平滑肌细胞的异质性和空间分布特征 | 人类胸主动脉瘤组织样本和匹配对照样本 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单分子空间转录组成像，免疫分析，组织染色，体外功能研究 | NA | 空间转录组数据，图像数据，蛋白质表达数据 | 多个人类TAA样本和匹配对照样本，每个样本包含数千个细胞 | NA | 单分子空间转录组成像 | NA | 高分辨率单细胞转录组成像技术 |
| 90 | 2025-10-06 |
Deriving early single-rosette brain organoids from human pluripotent stem cells
2023-12-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.10.020
PMID:37995702
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研究论文 | 开发了一种从人多能干细胞生成早期单玫瑰花结脑类器官的新方法 | 通过从二维单层细胞而非三维拟胚体起始，实现了具有可重复大小和结构的单玫瑰花结皮质类器官的生成 | NA | 开发改进的脑类器官生成方法用于研究人脑发育和疾病建模 | 人多能干细胞生成的脑类器官 | 发育生物学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序,免疫细胞化学 | NA | 基因表达数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2025-10-06 |
Integrative lactylation and tumor microenvironment signature as prognostic and therapeutic biomarkers in skin cutaneous melanoma
2023-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05483-7
PMID:37955686
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研究论文 | 本研究通过整合乳酸化修饰和肿瘤微环境特征，构建了皮肤黑色素瘤的预后预测模型和治疗生物标志物 | 首次将乳酸化修饰与肿瘤微环境特征相结合构建预后模型，并发现CLPB基因在黑色素瘤中的关键功能 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多实验验证和临床样本确认 | 开发皮肤黑色素瘤的预后预测方法和治疗指导策略 | 皮肤黑色素瘤患者和细胞系 | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | RNA测序，单细胞RNA测序，LASSO回归，Cox回归，CIBERSORT算法 | LAC-TME分类器，预后模型 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | TCGA和GTEx数据库中的皮肤黑色素瘤样本 | NA | RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2025-10-06 |
Combined signature of G protein-coupled receptors and tumor microenvironment provides a prognostic and therapeutic biomarker for skin cutaneous melanoma
2023-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05486-4
PMID:38006451
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研究论文 | 本研究通过分析G蛋白偶联受体相关基因和肿瘤微环境构建了皮肤黑色素瘤的预后模型 | 首次结合GPCRs相关基因和肿瘤微环境构建预后分类器，并鉴定出GPR19作为新的生物标志物 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多实验验证和临床样本确认 | 构建皮肤黑色素瘤的预后模型以指导临床治疗策略 | 皮肤黑色素瘤患者和黑色素瘤细胞系(A375, A2058) | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | 差异表达分析, LASSO算法, Cox回归分析, 单细胞RNA测序, 细胞实验 | 预后模型, GPR-TME分类器 | 基因表达数据, 临床信息, 单细胞测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的皮肤黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 93 | 2025-10-06 |
Machine learning- and WGCNA-mediated double analysis based on genes associated with disulfidptosis, cuproptosis and ferroptosis for the construction and validation of the prognostic model for breast cancer
2023-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05378-7
PMID:37712959
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研究论文 | 基于双硫死亡、铜死亡和铁死亡相关基因构建乳腺癌预后模型 | 首次整合双硫死亡相关基因(DRGs)、铜死亡相关基因(CRGs)和铁死亡相关基因(FRGs)构建乳腺癌预后特征 | NA | 构建和验证乳腺癌预后预测模型 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,Cox回归分析 | 无监督聚类分析,Lasso-Cox分析,WGCNA | 基因表达数据 | TCGA-BRCA数据库训练集和验证集,GSE20685和GSE42568外部验证集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 94 | 2025-10-06 |
PGF2α signaling drives fibrotic remodeling and fibroblast population dynamics in mice
2023-12-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172977
PMID:37934604
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示PGF2α信号通路在特发性肺纤维化中的作用机制 | 首次发现PGF2α/FPr信号轴是TGF-β1非依赖性的IPF信号枢纽，并识别出易感的成纤维细胞亚群 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究PGF2α信号在肺纤维化重塑和成纤维细胞群体动态中的作用 | 表达Sftpc基因突变的小鼠模型和Ptgfr基因敲除小鼠 | 病理生物学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序，伪时序分析，体外实验 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据，组织病理数据 | 多组基因型小鼠队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 95 | 2025-10-06 |
Inference after latent variable estimation for single-cell RNA sequencing data
2023-12-15, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxac047
PMID:36511385
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研究论文 | 提出了一种称为计数分割的灵活框架，用于在单细胞RNA测序数据分析中进行有效的统计推断 | 开发了计数分割方法，能够在潜在变量估计后实现有效的统计推断，解决了标准方法无法控制I型错误的问题 | 方法基于泊松假设，可能不适用于不符合此假设的数据类型 | 解决单细胞RNA测序数据分析中潜在变量估计后的统计推断问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计推断框架 | 基因表达数据 | 多能干细胞向心肌细胞分化的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 96 | 2025-10-06 |
Imputation for Single-cell RNA-seq Data with Non-negative Matrix Factorization and Transfer Learning
2023-12, Journal of bioinformatics and computational biology
IF:0.9Q4
DOI:10.1142/S0219720023500294
PMID:38248911
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研究论文 | 提出一种结合非负矩阵分解和迁移学习的方法来填补单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 首次将迁移学习与非负矩阵分解相结合用于scRNA-seq数据填补，通过引入图正则化项和迁移项来保持数据固有几何结构并提高表达值估计精度 | NA | 开发更准确的单细胞RNA测序数据填补方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解, 迁移学习 | 基因表达矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 97 | 2025-10-06 |
Comprehensive single-cell analysis demonstrates radiotherapy-induced infiltration of macrophages expressing immunosuppressive genes into tumor in esophageal squamous cell carcinoma
2023-12-15, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adh9069
PMID:38091397
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研究论文 | 通过综合空间和单细胞分析揭示放疗后食管鳞状细胞癌中表达免疫抑制基因的巨噬细胞浸润现象 | 首次采用CODEX多重免疫染色、VISIUM空间转录组和单细胞RNA测序的整合分析方法，系统揭示放疗后肿瘤微环境中免疫细胞的动态变化特征 | 研究样本量有限，需要在更大队列中验证发现 | 探索放疗后肿瘤免疫微环境的动态变化特征，为联合免疫治疗提供新靶点 | 食管鳞状细胞癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 多重免疫染色 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 免疫染色图像 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | 10x Visium | VISIUM空间转录组技术 |
| 98 | 2025-10-06 |
Opportunities for High-plex Spatial Transcriptomics in Solid Organ Transplantation
2023-12-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004587
PMID:36944604
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综述 | 探讨高plex空间转录组技术在实体器官移植领域的应用潜力 | 首次系统阐述空间转录组技术从神经科学和肿瘤学领域向移植科学拓展的应用前景 | 目前该技术在移植领域尚未实际应用，主要基于理论探讨 | 探索空间转录组技术在移植诊断、监测和研究中的潜在价值 | 移植患者群体及其相关器官组织 | 空间转录组学 | 器官移植相关疾病 | 空间转录组技术，下一代测序 | NA | mRNA转录组空间数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 99 | 2025-10-06 |
Mapping inherited genetic variation with opposite effects on autoimmune disease and cancer identifies candidate drug targets associated with the anti-tumor immune response
2023-Dec-28, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.12.23.23300491
PMID:38234717
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研究论文 | 通过分析自身免疫性疾病与癌症风险呈相反效应的遗传变异，识别出5个潜在的癌症免疫治疗靶点基因 | 首次系统性识别对自身免疫性疾病和癌症风险具有相反效应的遗传变异，并整合多组学数据验证其功能 | 研究主要基于欧洲人群数据，结果在其他人群中的普适性需要进一步验证 | 识别对自身免疫性疾病和癌症风险具有相反效应的遗传变异，发现新的癌症免疫治疗靶点 | 乳腺癌、前列腺癌、卵巢癌、子宫内膜癌患者及七种自身免疫/自身炎症性疾病患者 | 遗传学 | 癌症 | GWAS, RNA-seq, 单细胞RNA-seq, eQTL分析 | 固定效应跨疾病荟萃分析 | 基因组数据, 转录组数据 | 240,540例癌症患者/317,000例对照，112,631例自身免疫疾病患者/895,386例对照 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 100 | 2025-10-06 |
Gene module reconstruction elucidates cellular differentiation processes and the regulatory logic of specialized secretion
2023-Dec-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.29.573643
PMID:38234833
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序重建分化过程，揭示分泌组织中基因模块的调控逻辑 | 提出整合表达和功能相似性的基因模块识别方法，发现未折叠蛋白反应转录因子在调控通用和特化分泌功能中的新作用 | 研究仅基于斑马鱼脊索和孵化腺两种分泌组织，在其他组织中的普适性需进一步验证 | 解析细胞分化过程中基因模块重建和分泌功能调控机制 | 斑马鱼脊索和孵化腺组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼胚胎（功能缺失和功能获得突变体） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |