单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 436 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-06 |
Preleukemic single-cell landscapes reveal mutation-specific mechanisms and gene programs predictive of AML patient outcomes
2023-12-13, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100426
PMID:38116120
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析八种小鼠模型的269,048个单细胞图谱，揭示前白血病突变对细胞适应性、谱系命运和代谢的影响，并开发可预测AML患者预后的11基因评分系统 | 首次在单细胞分辨率下系统解析前白血病突变对造血干祖细胞的异质性影响，并建立基于前白血病转录特征的预后预测模型 | 研究基于小鼠模型，在人类AML中的直接适用性需要进一步验证 | 解析前白血病突变对造血干祖细胞的影响机制并开发AML预后预测方法 | 携带髓系恶性肿瘤驱动突变的八种小鼠模型的造血干祖细胞 | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据 | 269,048个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 82 | 2025-10-06 |
Early cellular mechanisms of type I interferon-driven susceptibility to tuberculosis
2023-12-07, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.11.002
PMID:38029747
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研究论文 | 本研究揭示了浆细胞样树突状细胞产生的I型干扰素通过作用于间质巨噬细胞促进结核分枝杆菌复制的早期细胞机制 | 首次发现间质巨噬细胞和浆细胞样树突状细胞是结核感染中I型干扰素的主要生产者，并阐明了I型干扰素通过抑制IFNγ反应促进细菌复制的机制 | 研究主要基于小鼠和非人灵长类动物模型，人类数据有限 | 探究I型干扰素驱动结核病易感性的早期细胞机制 | 结核分枝杆菌感染的小鼠、非人灵长类动物和人类肉芽肿组织 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 83 | 2025-10-06 |
Neural plate progenitors give rise to both anterior and posterior pituitary cells
2023-12-04, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.08.018
PMID:37683631
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学发现神经板前体细胞可同时分化为垂体前叶和后叶细胞 | 挑战了垂体前叶细胞仅来源于非神经外胚层的传统观点，揭示了神经板前体对垂体双叶的贡献 | 研究主要基于斑马鱼和小鼠模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究垂体发育的细胞谱系来源和分化机制 | 斑马鱼和小鼠的垂体细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学，遗传谱系追踪 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼和小鼠垂体细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2025-10-06 |
Effect of stretching on inflammation in a subcutaneous carrageenan mouse model analyzed at single-cell resolution
2023-12, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31133
PMID:37909412
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析拉伸对小鼠皮下角叉菜胶炎症模型的影响 | 首次在单细胞分辨率下揭示拉伸对炎症反应的分子机制，发现拉伸同时调节促炎和促消退基因表达 | 研究仅限于小鼠皮下炎症模型，结果可能不直接适用于其他物种或炎症类型 | 探索拉伸在细胞/分子水平对炎症反应的影响机制 | 小鼠皮下角叉菜胶诱导的炎症模型 | 单细胞生物学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2025-10-06 |
Meta-Analysis of COVID-19 BAL Single-Cell RNA Sequencing Reveals Alveolar Epithelial Transitions and Unique Alveolar Epithelial Cell Fates
2023-12, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0077OC
PMID:37523502
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荟萃分析 | 通过对COVID-19患者支气管肺泡灌洗液单细胞RNA测序数据的荟萃分析，揭示肺泡上皮细胞的异常分化状态 | 首次发现并描述了一种新的AT-I细胞状态，其特征是表皮分化复合体基因的诱导表达，包括SPRR3蛋白和多种角蛋白基因的上调 | 样本量相对有限（健康对照13例，COVID-19患者20例），且为观察性研究，无法确定因果关系 | 通过单细胞RNA测序荟萃分析揭示COVID-19患者肺泡上皮细胞的异常分化和细胞命运 | 支气管肺泡灌洗液细胞，重点关注肺泡上皮II型细胞和I型细胞 | 单细胞转录组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，细胞培养实验 | 伪时间序列分析 | 单细胞RNA测序数据，免疫组织化学图像 | 33个样本（13个健康对照，20个COVID-19患者），共167,280个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 86 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis reveals key differences between early-stage and late-stage systemic sclerosis skin across autoantibody subgroups
2023-12, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224184
PMID:37580109
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析弥漫性皮肤系统性硬化症患者皮肤组织的细胞差异 | 首次在单细胞水平揭示不同自身抗体亚组（ATA+和ARA+）和疾病阶段（早期和晚期）的系统性硬化症皮肤细胞差异 | 样本量较小（12例患者和3例健康对照），仅分析了前臂皮肤活检 | 研究弥漫性皮肤系统性硬化症不同自身抗体亚组和疾病阶段的皮肤细胞差异 | 弥漫性皮肤系统性硬化症患者和健康对照的皮肤组织 | 单细胞生物学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 15例前臂皮肤活检（12例患者，3例健康对照） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 基于液滴的单细胞测序技术 |
| 87 | 2025-10-06 |
Transcription factor NFYa controls cardiomyocyte metabolism and proliferation during mouse fetal heart development
2023-12-18, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.10.012
PMID:37972593
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子NFYa在小鼠胎儿心脏发育过程中协调心肌细胞代谢与增殖的关键作用 | 首次发现NFYa通过与辅助因子SP2相互作用，在转录水平激活连接代谢与增殖的基因，揭示了一种先前未被认识的心脏代谢转录调控机制 | 研究仅限于小鼠胎儿心脏发育阶段，未涉及成年期心脏再生过程 | 探究转录因子NFYa在协调心肌细胞代谢与增殖过程中的分子机制 | 小鼠胎儿心脏发育过程中的心肌细胞 | 发育生物学 | 心脏发育缺陷 | 空间转录组分析,单细胞转录组分析 | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据 | 小鼠胎儿心脏组织 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 88 | 2025-10-06 |
Protocol for isolation of signet ring cells from human gastric mucosa
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102695
PMID:37925632
|
研究论文 | 本文介绍了一种从人胃黏膜中分离印戒细胞的高活性悬浮方案 | 开发了专门针对胃黏膜印戒细胞的高活性分离方案，并支持多种下游应用 | NA | 建立标准化的印戒细胞分离技术流程 | 人胃黏膜组织中的印戒细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 组织解离、免疫组织化学染色、流式细胞术、单细胞测序 | NA | 组织样本 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 89 | 2025-10-06 |
Protocol to combine brain sections from multiple mice into a single block for spatial transcriptomic analyses
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102617
PMID:37742175
|
研究论文 | 提出一种将多只小鼠脑组织切片整合到单个空间转录组学载玻片上的实验方案 | 开发了将不同小鼠海马体冷冻切片合并成单个冷冻块的方法，可在单个捕获区域分析多个样本 | NA | 提高空间转录组学分析的样本通量和成本效益 | 小鼠海马体脑组织切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 多只小鼠脑组织切片 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 90 | 2025-10-06 |
Single-cell isolation from full-thickness human intestinal tissue resections for single-cell RNA sequencing
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102686
PMID:37925636
|
研究论文 | 本文提出了一种从全层人肠道组织切除样本中分离单细胞的实验方案 | 开发了针对全层肠道组织的单细胞分离标准化流程，包括固有层和肌层的分离处理 | NA | 建立肠道组织单细胞分离的实验方法 | 人全层肠道组织切除样本 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium平台 |
| 91 | 2025-10-06 |
Protocol for multispectral imaging on cryosections to map myeloid cell heterogeneity in its spatial context
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102601
PMID:37742177
|
研究论文 | 本文提出了一种用于在组织冰冻切片上进行多光谱成像以绘制髓系细胞异质性的实验方案 | 开发了在原位通过多光谱成像技术保留细胞空间背景来研究髓系细胞异质性的方法 | NA | 建立一种能够在空间背景下分析髓系细胞异质性的成像方案 | 组织冰冻切片中的髓系细胞 | 数字病理学 | NA | 多光谱成像 | NA | 图像 | NA | NA | 多光谱成像 | NA | NA |
| 92 | 2025-10-06 |
Protocol for PPP1R15A-inhibited mouse model establishment with subcutaneous B16F1 tumor and single-cell analysis
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102616
PMID:37756156
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研究论文 | 本文介绍了一种建立PPP1R15A抑制小鼠模型并利用单细胞技术分析B16F1皮下肿瘤抗肿瘤免疫反应的实验方案 | 开发了结合PPP1R15A抑制剂Sephin1处理与单细胞转录组和TCR测序的整合分析流程 | NA | 探索PPP1R15A抑制剂对小鼠B16F1皮下肿瘤抗肿瘤免疫的影响 | 小鼠B16F1皮下肿瘤模型 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据，TCR数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 93 | 2025-10-06 |
Protocol for isolating single cells from human pancreatic cancer tissues and analyzing major immune cell populations using flow cytometry
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102679
PMID:37910511
|
研究论文 | 介绍从人类胰腺癌组织中分离单细胞并通过流式细胞术分析主要免疫细胞群的实验方案 | 提供标准化的胰腺癌组织免疫细胞分离和分析流程 | NA | 建立胰腺癌组织免疫细胞分离和分析的实验方案 | 人类胰腺癌组织中的免疫细胞 | NA | 胰腺癌 | 流式细胞术 | NA | 细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 94 | 2025-10-06 |
TimiGP: An R package to depict the tumor microenvironment from bulk transcriptomics
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102742
PMID:38019649
|
研究论文 | 介绍TimiGP R软件包，用于从批量转录组数据推断肿瘤微环境中免疫细胞间的相互作用及其与患者预后的关联 | 开发基于基因对的肿瘤免疫微环境分析方法，能够从批量基因表达数据推断细胞间相互作用 | NA | 开发分析肿瘤微环境中免疫细胞相互作用及其临床意义的计算工具 | 肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序，批量转录组测序 | NA | 基因表达数据，生存数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 95 | 2025-10-06 |
Protocol for nuclear dissociation of the adult C. elegans for single-nucleus RNA sequencing and its application for mapping environmental responses
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102756
PMID:38043054
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研究论文 | 本文介绍了一种适用于成年秀丽隐杆线虫的单核RNA测序实验方案 | 开发了针对成年秀丽隐杆线虫的单核RNA测序方案，克服了单细胞RNA测序在该模型生物中遇到的困难 | NA | 建立适用于秀丽隐杆线虫的单核RNA测序方法，用于研究环境刺激响应 | 成年秀丽隐杆线虫 | 单细胞测序 | NA | 单核RNA测序(snRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 96 | 2025-10-06 |
Heterogeneous murine peribiliary glands orchestrate compartmentalized epithelial renewal
2023-12-04, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.10.004
PMID:37909044
|
研究论文 | 本研究揭示了小鼠肝外胆管中异质性胆管周围腺体通过分区化机制协调上皮更新的细胞层次结构 | 首次通过无标记和靶向克隆命运图谱证明肝外胆管存在分区化更新机制，不同位置的胆管细胞承担不同的更新功能 | 研究仅限于小鼠模型，人类胆管系统可能存在差异 | 探索肝外胆管上皮稳态更新的细胞身份和多重性机制 | 小鼠肝外胆管及其周围腺体 | 单细胞生物学 | 胆道疾病 | 单细胞测序, 克隆命运图谱, 轨迹分析 | NA | 单细胞基因表达数据, 命运图谱数据 | 小鼠胆管组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 97 | 2025-10-07 |
SMARCB1 loss activates patient-specific distal oncogenic enhancers in malignant rhabdoid tumors
2023-12-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43498-3
PMID:38040699
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研究论文 | 本研究揭示了SMARCB1基因缺失通过激活患者特异性远端致癌增强子驱动恶性横纹肌样瘤发生的机制 | 首次发现SMARCB1缺失导致患者特异性远端增强子与MYC癌基因启动子形成染色质环，揭示了MRT肿瘤发生中的表观遗传重编程机制 | 研究主要基于患者来源的类器官模型，需要在更广泛的临床样本中验证 | 探究SMARCB1缺失在恶性横纹肌样瘤中如何改变调控景观并驱动肿瘤发生 | 恶性横纹肌样瘤患者来源的类器官组织和患者MRT组织 | 表观遗传学 | 恶性横纹肌样瘤 | 多组学分析、染色体构象捕获、单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq | NA | 基因组学数据、表观遗传学数据、转录组数据 | 患者来源的MRT类器官和患者组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 98 | 2025-10-07 |
Construction of monocyte-related prognosis model based on comprehensive analysis of bulk RNA-seq and single-cell RNA-seq in high-grade serous ovarian cancer
2023-Dec-15, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000036548
PMID:38115318
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研究论文 | 基于批量RNA-seq和单细胞RNA-seq综合分析构建高级别浆液性卵巢癌的单核细胞相关预后模型 | 首次结合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据识别单核细胞相关基因并构建HGSOC预后风险模型 | 研究依赖于公共数据库数据，缺乏独立验证队列 | 开发高级别浆液性卵巢癌的预后预测模型并探索单核细胞在肿瘤发展中的作用机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者 | 生物信息学 | 卵巢癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 生物信息学分析 | Cox风险比例模型 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的HGSOC样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 99 | 2025-10-07 |
Identification of central genes for endometriosis through integration of single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing analysis
2023-Dec-15, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000036707
PMID:38115253
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序分析识别子宫内膜异位症的核心基因并构建预测模型 | 首次结合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据，采用细胞通讯分析识别关键细胞亚型，并通过LASSO模型筛选出4个核心基因 | NA | 识别子宫内膜异位症发展的关键基因并构建诊断预测模型 | 子宫内膜异位症相关基因和细胞亚型 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,生物信息学分析 | LASSO模型,WGCNA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 100 | 2025-10-07 |
Secretory GFP reconstitution labeling of neighboring cells interrogates cell-cell interactions in metastatic niches
2023-12-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43855-2
PMID:38052804
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研究论文 | 开发了一种名为sGRAPHIC的分泌型GFP重组标记系统，用于研究转移灶中癌细胞与邻近组织驻留细胞的相互作用 | 改进了基于分裂GFP的基因编码系统，开发出能高效标记深部组织中与癌细胞相邻的组织驻留细胞的sGRAPHIC技术 | 研究基于小鼠肝脏转移模型，在人类临床应用的转化价值仍需进一步验证 | 阐明转移灶中细胞间相互作用的机制 | 转移灶中的癌细胞和邻近组织驻留细胞（特别是肝细胞） | 单细胞生物学 | 癌症转移 | 单细胞RNA测序，基因编码荧光标记系统 | NA | 单细胞转录组数据，荧光成像数据 | 小鼠肝脏转移模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |