单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202312-202312] [清除筛选条件]
当前共找到 437 篇文献,本页显示第 81 - 100 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2025-10-05
Single-cell transcriptome sequencing of plant leaf expressing anti-HER2 VHH-FcK cancer therapeutic protein
2023-12-19, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序分析表达抗HER2 VHH-FcK癌症治疗蛋白的转基因烟草叶片 首次在植物系统中应用单细胞RNA测序技术分析重组治疗蛋白的组织特异性表达模式 仅针对烟草叶片进行研究,未验证其他植物组织或物种 优化植物生物质中重组治疗蛋白的生产效率 转基因烟草(Nicotiana tabacum)叶片细胞 植物生物技术 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 转基因烟草叶片细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
82 2025-10-05
Autologous Airway Basal Cell Transplantation Alleviates Airway Epithelium Defect in Recurrent Benign Tracheal Stenosis
2023-12-18, Stem cells translational medicine IF:5.4Q1
研究论文 本研究通过自体气道基底细胞移植联合生物凝胶治疗复发性良性气管狭窄,探索其在气道再上皮化中的治疗效果 首次将自体气道基底细胞移植与生物凝胶涂层相结合,应用于气管狭窄的再生治疗 研究仅在犬类动物模型中进行,尚未进行人体临床试验 探索自体基底细胞移植在恢复气道稳态和治疗气管狭窄中的治疗效果 复发性良性气管狭窄患者的气道黏膜和建立气管狭窄模型的犬类 单细胞测序 气管狭窄 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 犬类动物模型,分为4个实验组,随访16周 NA 单细胞RNA测序 NA NA
83 2025-10-05
Single-Cell RNA-Seq Analysis Identifies Angiotensinogen and Galanin as Unique Molecular Markers of Acinar Cells in Murine Salivary Glands
2023-12, Stem cells and development IF:2.5Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序分析鉴定小鼠唾液腺腺泡细胞的独特分子标记物 首次发现血管紧张素原和甘丙肽分别作为颌下腺浆液性腺泡细胞和舌下腺黏液性腺泡细胞的特异性标记物 研究仅使用4周龄小鼠,未涵盖其他发育阶段 鉴定小鼠颌下腺和舌下腺腺泡细胞的分子标记物 小鼠颌下腺和舌下腺组织 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 免疫组织化学, 免疫荧光 NA 单细胞转录组数据 4周龄小鼠 10x Genomics single-cell RNA-seq 10x Chromium 10x单细胞测序平台
84 2025-10-06
Melanoma differentiation associated gene-9/syndecan binding protein promotes hepatocellular carcinoma
2023-12-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究通过构建肝细胞特异性过表达MDA-9的转基因小鼠模型,揭示MDA-9通过NF-κB和Spp1信号通路促进肝细胞癌发展的机制 首次构建肝细胞特异性MDA-9过表达转基因小鼠模型,并发现MDA-9通过NF-κB-Spp1轴驱动肝癌发生的新机制 研究主要基于小鼠模型,人类肝癌中的验证尚不充分 探究MDA-9基因在肝细胞癌发生发展中的作用机制 转基因小鼠模型(Alb/MDA-9)和野生型对照小鼠的肝细胞及非实质细胞 癌症生物学 肝细胞癌 RNA测序, 单细胞RNA测序, 转基因技术 转基因小鼠模型 基因表达数据 转基因小鼠与野生型对照小鼠 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
85 2025-10-06
Integrative Analyses of scRNA-seq, Bulk mRNA-seq, and DNA Methylation Profiling in Depressed Suicide Brain Tissues
2023-12-18, The international journal of neuropsychopharmacology
研究论文 通过整合分析抑郁症自杀患者脑组织的单细胞RNA测序、批量mRNA测序和DNA甲基化数据,揭示自杀行为的生物学机制 首次整合单细胞转录组、批量转录组和DNA甲基化数据,在抑郁症自杀患者脑组织中进行跨组学分析,并发现少突胶质前体细胞在自杀行为中的关键作用 样本量有限,仅分析了特定脑区组织,动物模型与人类样本的对应关系需要进一步验证 探索自杀行为的生物学机制和表观遗传调控 抑郁症自杀患者的脑组织样本和氟西汀处理的大鼠脑组织 生物信息学 抑郁症 scRNA-seq, bulk mRNA-seq, DNA甲基化微阵列 差异表达分析, 差异甲基化分析, 反卷积分析 基因组学数据, 表观基因组学数据 抑郁症自杀患者脑组织样本和氟西汀处理大鼠脑组织 NA 单细胞RNA测序, 批量mRNA测序, DNA甲基化分析 NA NA
86 2025-10-06
Neural stem cells persist to generate new neurons in the hippocampus of adult and aged human brain - Fiction or accurate?
2023-12, Ageing research reviews IF:12.5Q1
综述 回顾四十年来关于成人神经发生的研究进展,重点关注海马体神经发生在成年和老年人类大脑中的持续性问题 系统梳理了成人神经发生研究领域的关键里程碑、方法学进展和争议焦点 成人海马体神经发生的存在性和功能贡献仍需通过大规模单细胞测序等技术验证 探讨成人神经发生的证据、机制及其在神经系统疾病中的作用 人类海马体神经发生过程 神经科学 神经系统疾病 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 NA 文献资料 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
87 2025-10-06
Identification and validation of key biomarkers and potential therapeutic targets for primary open-angle glaucoma
2023-12, Science China. Life sciences
研究论文 通过生物信息学分析识别原发性开角型青光眼的关键生物标志物和潜在治疗靶点 整合多个基因表达数据集,结合单细胞RNA测序技术筛选并验证POAG关键基因 需要进一步研究揭示这些基因表达变化的具体机制 识别POAG的新型生物标志物和潜在治疗靶点 原发性开角型青光眼相关基因表达数据 生物信息学 青光眼 mRNA表达微阵列,单细胞RNA测序,功能富集分析,蛋白质相互作用网络分析,加权基因共表达网络分析,免疫荧光,实时定量PCR NA 基因表达数据 三个数据集(GSE27276,GSE138125,GSE148371) NA 单细胞RNA测序,微阵列 NA NA
88 2025-10-06
Data-driven selection of analysis decisions in single-cell RNA-seq trajectory inference
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了Escort框架用于评估单细胞RNA测序数据是否适合轨迹推断并量化分析决策对轨迹特性的影响 提出了首个通过数据驱动评估来指导单细胞轨迹分析决策的框架,减少了方法选择和参数优化的不确定性 未提及具体的性能验证数据集规模或与其他方法的详细比较结果 解决单细胞RNA测序轨迹推断中分析方法选择不确定性的问题 单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 轨迹推断方法 基因表达数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
89 2025-10-06
Enrichment of a neutrophil-like monocyte transcriptional state in glioblastoma myeloid suppressor cells
2023-Dec-28, Research square
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了胶质母细胞瘤中髓源性抑制细胞的异质性,并发现了一种中性粒细胞样单核细胞转录状态的富集 首次在胶质母细胞瘤患者血液M-MDSC中发现中性粒细胞样单核细胞转录状态的富集,并开发了相应的基因表达和去卷积算法进行定量分析 M-MDSC的个体发育和明确表型标记仍未知,研究样本来源有限 解析胶质母细胞瘤中髓源性抑制细胞的异质性和转录特征 胶质母细胞瘤、肺癌和头颈癌患者的髓源性抑制细胞 单细胞转录组学 胶质母细胞瘤 单细胞转录组测序 NA 单细胞RNA测序数据 胶质母细胞瘤、肺癌和头颈癌患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
90 2025-10-06
Chronic chromosome instability induced by Plk1 results in immune suppression in breast cancer
2023-12-26, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过过表达Plk1诱导染色体不稳定性,揭示了其在乳腺癌中通过激活SASP、上调PD-L1和CD206以及诱导NF-κβ信号通路促进免疫逃逸的机制 首次系统阐明Plk1诱导的慢性染色体不稳定性通过多通路协同作用导致乳腺癌免疫抑制的完整机制 研究主要基于Her2乳腺癌模型,在其他亚型中的普适性需进一步验证 探究染色体不稳定性相关分子特征如何改变肿瘤进化过程中的免疫识别 Her2乳腺癌模型和人类乳腺癌肿瘤 癌症生物学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 前病变乳腺组织和人类乳腺癌肿瘤样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
91 2025-10-06
Single-cell transcriptomics reveals variations in monocytes and Tregs between gout flare and remission
2023-12-08, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示痛风发作期与缓解期单核细胞和调节性T细胞的差异 首次在单细胞水平系统揭示痛风发作期HLA-DQA1+非经典单核细胞上调及Tregs在缓解期的关键抑制作用 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 探究痛风发作与缓解期间免疫细胞变化机制 痛风患者的免疫细胞(单核细胞亚群和调节性T细胞) 单细胞组学 痛风 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 包含独立验证队列的患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
92 2025-10-06
The Novel Checkpoint Target Lymphocyte-Activation Gene 3 Is Highly Expressed in Cutaneous Squamous Cell Carcinoma
2023-12-01, Dermatologic surgery : official publication for American Society for Dermatologic Surgery [et al.] IF:2.5Q1
研究论文 本研究首次系统分析了淋巴细胞激活基因3(LAG-3)在皮肤鳞状细胞癌中的表达模式 首次发现LAG-3在cSCC浸润淋巴细胞中的表达高于PD-1,并量化了LAG-3 mRNA在不同类型cSCC中的差异表达 样本量较小(仅3个SCC肿瘤),需要更大规模研究验证 明确LAG-3在皮肤鳞状细胞癌中的表达模式,探索其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 皮肤鳞状细胞癌组织样本及正常皮肤组织 肿瘤免疫学 皮肤鳞状细胞癌 流式细胞术, 单细胞RNA测序, NanoString技术 NA 基因表达数据, mRNA表达数据 3个SCC肿瘤样本及正常皮肤对照 NanoString 单细胞RNA-seq, 基因表达分析 NanoString nCounter NanoString nCounter基因表达分析系统
93 2025-10-06
Tobacco smoke exposure recruits inflammatory airspace monocytes that establish permissive lung niches for Mycobacterium tuberculosis
2023-12-06, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等技术揭示了烟草烟雾暴露如何通过招募炎性单核细胞建立有利于结核分枝杆菌生长的肺部微环境 首次发现吸烟者肺部存在未成熟炎性单核细胞的富集,并鉴定CD93作为这些新招募单核细胞的标志物,阐明了CCR2信号通路在单核细胞招募中的作用机制 研究样本量有限,主要基于支气管肺泡灌洗细胞,未涵盖更广泛的肺部组织样本 探究吸烟如何促进肺部微环境对结核分枝杆菌生长的易感性 当前吸烟者和从不吸烟者的原发性支气管肺泡灌洗细胞 免疫学 结核病 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 流式细胞术, 功能分析 NA 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 当前吸烟者和从不吸烟者的支气管肺泡灌洗细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
94 2025-10-06
SINGLE CELL DISSECTION OF DEVELOPMENTAL ORIGINS AND TRANSCRIPTIONAL HETEROGENEITY IN B-CELL ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA
2023-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过单细胞RNA测序分析B细胞急性淋巴细胞白血病的发育起源和转录异质性 首次使用单细胞RNA测序系统分析B-ALL样本,并与正常B细胞发育参考图谱比较,揭示白血病细胞起源和瘤内异质性 样本数量相对有限(89个B-ALL样本),部分亚型样本可能代表性不足 解析B-ALL的发育起源和转录异质性,改进临床和基因组分类 B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)患者样本 单细胞组学 B细胞急性淋巴细胞白血病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 89个B-ALL样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
95 2025-10-06
A single-cell transposable element atlas of human cell identity
2023-Dec-28, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了用于单细胞转座子元件位点水平分析的工具Stellarscope,并构建了人类PBMC中转座子元件表达的图谱 开发了能够将多重比对reads重新分配到特定基因组位点的工具,首次在单细胞水平系统构建了人类转座子元件表达图谱 NA 研究转座子元件在人类细胞身份识别中的作用 人类外周血单个核细胞(PBMC) 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 期望最大化算法 RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
96 2025-10-06
Single-Molecule Spatial Transcriptomics of Human Thoracic Aortic Aneurysms Uncovers Calcification-Related CARTPT-Expressing Smooth Muscle Cells
2023-12, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 利用单分子空间转录组技术揭示人类胸主动脉瘤中与钙化相关的CARTPT表达平滑肌细胞亚型 首次在人类胸主动脉瘤中发现空间分布特异的CARTPT表达平滑肌细胞亚型,并证明其与钙化过程相关 样本量有限,仅针对胸主动脉瘤组织进行研究 探索人类胸主动脉瘤中平滑肌细胞的异质性和空间分布特征 人类胸主动脉瘤组织样本和匹配对照样本 空间转录组学 心血管疾病 单分子空间转录组成像,免疫分析,组织染色,体外功能研究 NA 空间转录组数据,图像数据,蛋白质表达数据 多个人类TAA样本和匹配对照样本,每个样本包含数千个细胞 NA 单分子空间转录组成像 NA 高分辨率单细胞转录组成像技术
97 2025-10-06
Deriving early single-rosette brain organoids from human pluripotent stem cells
2023-12-12, Stem cell reports IF:5.9Q2
研究论文 开发了一种从人多能干细胞生成早期单玫瑰花结脑类器官的新方法 通过从二维单层细胞而非三维拟胚体起始,实现了具有可重复大小和结构的单玫瑰花结皮质类器官的生成 NA 开发改进的脑类器官生成方法用于研究人脑发育和疾病建模 人多能干细胞生成的脑类器官 发育生物学 神经发育障碍 单细胞RNA测序,免疫细胞化学 NA 基因表达数据,图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
98 2025-10-06
Integrative lactylation and tumor microenvironment signature as prognostic and therapeutic biomarkers in skin cutaneous melanoma
2023-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
研究论文 本研究通过整合乳酸化修饰和肿瘤微环境特征,构建了皮肤黑色素瘤的预后预测模型和治疗生物标志物 首次将乳酸化修饰与肿瘤微环境特征相结合构建预后模型,并发现CLPB基因在黑色素瘤中的关键功能 研究主要基于公共数据库数据,需要更多实验验证和临床样本确认 开发皮肤黑色素瘤的预后预测方法和治疗指导策略 皮肤黑色素瘤患者和细胞系 生物信息学 皮肤黑色素瘤 RNA测序,单细胞RNA测序,LASSO回归,Cox回归,CIBERSORT算法 LAC-TME分类器,预后模型 基因表达数据,单细胞测序数据 TCGA和GTEx数据库中的皮肤黑色素瘤样本 NA RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
99 2025-10-06
Combined signature of G protein-coupled receptors and tumor microenvironment provides a prognostic and therapeutic biomarker for skin cutaneous melanoma
2023-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
研究论文 本研究通过分析G蛋白偶联受体相关基因和肿瘤微环境构建了皮肤黑色素瘤的预后模型 首次结合GPCRs相关基因和肿瘤微环境构建预后分类器,并鉴定出GPR19作为新的生物标志物 研究主要基于公共数据库数据,需要更多实验验证和临床样本确认 构建皮肤黑色素瘤的预后模型以指导临床治疗策略 皮肤黑色素瘤患者和黑色素瘤细胞系(A375, A2058) 生物信息学 皮肤黑色素瘤 差异表达分析, LASSO算法, Cox回归分析, 单细胞RNA测序, 细胞实验 预后模型, GPR-TME分类器 基因表达数据, 临床信息, 单细胞测序数据 来自TCGA和GEO数据库的皮肤黑色素瘤样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
100 2025-10-06
Machine learning- and WGCNA-mediated double analysis based on genes associated with disulfidptosis, cuproptosis and ferroptosis for the construction and validation of the prognostic model for breast cancer
2023-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
研究论文 基于双硫死亡、铜死亡和铁死亡相关基因构建乳腺癌预后模型 首次整合双硫死亡相关基因(DRGs)、铜死亡相关基因(CRGs)和铁死亡相关基因(FRGs)构建乳腺癌预后特征 NA 构建和验证乳腺癌预后预测模型 乳腺癌患者 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA测序,免疫荧光,Cox回归分析 无监督聚类分析,Lasso-Cox分析,WGCNA 基因表达数据 TCGA-BRCA数据库训练集和验证集,GSE20685和GSE42568外部验证集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部