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当前共找到 437 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-15 |
Differential detection workflows for multi-sample single-cell RNA-seq data
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.17.572043
PMID:38187695
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研究论文 | 开发用于单细胞转录组数据中差异检测分析的工作流程 | 提出差异检测(DD)概念，关注基因在样本或细胞中被检测到的平均比例差异，而非传统差异基因表达(DE)的平均表达量差异 | NA | 建立联合评估差异基因表达和差异检测的统一工作流程 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2025-10-05 |
Atypical B cells consist of subsets with distinct functional profiles
2023-Dec-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108496
PMID:38098745
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研究论文 | 通过单细胞测序技术识别了非典型B细胞中三个功能各异的亚群 | 首次在慢性疟疾暴露人群中鉴定出三个具有不同转录和功能特征的非典型B细胞新亚群 | 研究聚焦于疟疾慢性感染人群，结果可能不适用于其他免疫激活状态 | 阐明非典型B细胞在人类适应性免疫应答中的具体作用 | 慢性疟疾寄生虫暴露个体的非典型B细胞 | 单细胞生物学 | 疟疾 | 单细胞测序 | NA | 转录组、细胞表面标志物、B细胞受体 | 慢性疟疾暴露个体（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 63 | 2025-10-05 |
A high-throughput single-cell RNA expression profiling method identifies human pericyte markers
2023-12, Neuropathology and applied neurobiology
IF:4.0Q1
DOI:10.1111/nan.12942
PMID:37812061
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研究论文 | 通过高通量单细胞RNA测序方法鉴定人脑周细胞特异性标志物 | 首次使用EasySci单细胞转录组测序技术系统鉴定人脑周细胞特异性基因标志物SLC6A12和SLC19A1 | 在其他人体器官（肾、肺、肝、肌肉）中未观察到相同的周细胞染色模式，组织特异性较强 | 鉴定和优化人脑周细胞的通用组织学标志物 | 人和小鼠不同脑区的周细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 免疫印迹 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 多个人和小鼠脑区样本，以及肾、肺、肝、肌肉等器官探索性样本 | NA | 单细胞RNA-seq | EasySci | 高通量低成本单细胞转录组测序方法 |
| 64 | 2025-10-05 |
Brain-wide correspondence of neuronal epigenomics and distant projections
2023-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06823-w
PMID:38092919
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研究论文 | 通过epi-retro-seq技术将小鼠全脑33,034个神经元的表观基因组与远距离投射联系起来 | 首次在全脑范围内将单细胞表观基因组与神经元远距离投射特征进行系统关联 | 研究仅限于小鼠模型，样本来源区域划分可能不够精细 | 解析神经元表观基因组特征与远距离投射功能之间的关系 | 小鼠全脑33,034个神经元，涉及32个脑区向24个靶区的225种投射组合 | 神经科学 | NA | epi-retro-seq, 空间转录组学 | NA | 表观基因组数据, 转录组数据, 空间定位数据 | 33,034个神经元，32个脑区，24个投射靶区 | NA | 单细胞表观基因组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 65 | 2025-10-05 |
Single-cell DNA methylome and 3D multi-omic atlas of the adult mouse brain
2023-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06805-y
PMID:38092913
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研究论文 | 本研究构建了成年小鼠大脑的单细胞DNA甲基组和3D多组学图谱 | 首次在空间背景下生成全脑单细胞甲基组和染色质构象联合图谱，识别了4673个细胞群和274个跨模态注释亚类 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类或其他物种 | 构建大脑细胞类型及其基因调控景观的完整分子图谱 | 成年小鼠大脑117个解剖区域的细胞 | 表观基因组学 | 神经系统疾病 | 单核甲基组测序(snmC-seq3), 多组学测序(snm3C-seq), 空间转录组学 | NA | 甲基组数据, 染色质构象数据, 转录组数据 | 301,626个甲基组和176,003个染色质构象-甲基组联合图谱 | NA | 单细胞甲基组测序, 单细胞多组学测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 66 | 2025-10-05 |
The molecular cytoarchitecture of the adult mouse brain
2023-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06818-7
PMID:38092915
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组数据构建成年小鼠大脑细胞类型综合图谱 | 首次将高通量单核RNA测序与近细胞分辨率的Slide-seq空间转录组技术相结合，系统绘制全脑细胞类型图谱 | 研究仅限于小鼠模型，人类大脑的细胞架构可能存在差异 | 构建哺乳动物大脑细胞类型的综合空间图谱 | 成年小鼠大脑 | 空间转录组学 | 神经系统疾病 | 单核RNA测序, Slide-seq空间转录组 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 全脑范围样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Slide-seq | 近细胞分辨率的空间转录组方法 |
| 67 | 2025-10-05 |
Molecularly defined and spatially resolved cell atlas of the whole mouse brain
2023-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06808-9
PMID:38092912
|
研究论文 | 本研究通过整合空间分辨单细胞转录组技术，构建了首个全小鼠大脑的高分辨率分子定义细胞图谱 | 首次实现了全脑范围的单细胞空间转录组分析，整合了MERFISH和scRNA-seq数据，系统鉴定了5,000多个转录 distinct 细胞簇和300多种主要细胞类型 | 研究仅针对成年小鼠大脑，人类大脑的复杂性可能有所不同；技术方法可能对某些低表达基因检测灵敏度有限 | 构建全脑范围的分子定义细胞空间图谱，解析大脑细胞类型组成和空间组织规律 | 成年小鼠全脑约1,000万个细胞 | 空间转录组学 | 神经系统疾病 | 多重误差鲁棒荧光原位杂交，单细胞RNA测序 | NA | 空间基因表达数据，单细胞转录组数据 | 约1,000万个细胞，覆盖整个成年小鼠大脑 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 整合MERFISH和scRNA-seq技术的空间分辨单细胞表达谱分析 |
| 68 | 2025-10-05 |
Differences in cell shape, motility, and growth reflect chromosomal number variations that can be visualized with live-cell ChReporters
2023-12-01, Molecular biology of the cell
IF:3.1Q3
DOI:10.1091/mbc.E23-06-0207
PMID:37903225
|
研究论文 | 利用活细胞染色体报告系统研究染色体数目变化对细胞形态、运动和生长的影响 | 开发了活细胞'ChReporter'方法，可实时识别单个染色体缺失的细胞，并揭示染色体数目变化与细胞机械表型的关系 | 染色体报告系统阳性克隆的机械表型-基因型关系较为复杂，研究主要集中于标准癌细胞系 | 理解染色体数目变化如何影响细胞形态、运动能力和生长特性 | 标准癌细胞系及其克隆种群 | 细胞生物学 | 癌症 | 活细胞成像, 单细胞RNA测序, 药物反应测试 | NA | 图像, 基因表达数据, 药物反应数据 | 标准癌细胞系及其克隆种群 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 69 | 2025-10-05 |
A high-resolution transcriptomic and spatial atlas of cell types in the whole mouse brain
2023-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06812-z
PMID:38092916
|
研究论文 | 构建了成年小鼠全脑的高分辨率转录组和空间细胞类型图谱 | 结合700万单细胞RNA测序和430万细胞空间转录组数据，创建了包含5,322个细胞簇的层次分类系统 | 研究仅限于成年小鼠脑部，未涉及其他发育阶段或物种 | 建立哺乳动物大脑细胞类型的综合参考图谱 | 成年小鼠全脑细胞 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, MERFISH | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | 约700万细胞（400万通过质控）scRNA-seq，430万细胞MERFISH | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 多重误差鲁棒荧光原位杂交(MERFISH) |
| 70 | 2025-10-05 |
Predicting the Structural Impact of Human Alternative Splicing
2023-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.21.572928
PMID:38187531
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研究论文 | 本研究使用AlphaFold2预测了超过11,000种人类剪接异构体的结构，系统分析了选择性剪接对蛋白质结构的影响 | 首次大规模预测人类剪接异构体的三维结构，并系统分析剪接变异对结构特征和功能的影响 | 仅基于计算预测，缺乏实验验证；分析范围限于已知的剪接异构体 | 探究选择性剪接对蛋白质结构的影响及其功能意义 | 人类蛋白质剪接异构体 | 计算生物学 | NA | 蛋白质结构预测，单细胞RNA测序 | AlphaFold2 | 蛋白质序列，单细胞RNA-seq数据 | 超过11,000种人类剪接异构体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | Tabula Sapiens项目的单细胞RNA-seq数据 |
| 71 | 2025-10-05 |
Probabilistic cell/domain-type assignment of spatial transcriptomics data with SpatialAnno
2023-12-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1023
PMID:37941153
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研究论文 | 提出一种名为SpatialAnno的空间转录组数据注释方法，能够有效利用非标记基因和标记基因的定性信息 | 通过因子模型估计非标记基因的低维嵌入，同时利用Potts模型促进相邻点间的空间平滑性，无需参考数据集 | NA | 开发空间转录组数据的细胞/区域类型注释方法 | 空间转录组数据中的细胞/点 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | 因子模型, Potts模型 | 空间转录组数据 | 模拟数据和4个真实数据集 | 10x Genomics, ST, Slide-seq, seqFISH | 空间转录组学 | 10x Visium, ST, Slide-seqV1/2, seqFISH | 10x Visium平台, ST平台, Slide-seqV1/2平台, seqFISH平台 |
| 72 | 2025-10-05 |
Hyperactive mTORC1 in lung mesenchyme induces endothelial cell dysfunction and pulmonary vascular remodeling
2023-12-20, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI172116
PMID:38127441
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研究论文 | 本研究探讨了肺间质细胞中过度活跃的mTORC1如何通过旁分泌信号导致内皮细胞功能障碍和肺血管重塑 | 首次揭示了在淋巴管平滑肌瘤病中，间质细胞通过旁分泌信号传导机制与内皮细胞通讯并驱动血管重塑 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本有限且为终末期肺组织 | 阐明LAM疾病中肺间质细胞与内皮细胞之间的通讯机制及其在肺血管重塑中的作用 | 淋巴管平滑肌瘤病(LAM)患者肺组织和Tbx4LME-Cre Tsc2fl/fl基因工程小鼠 | 分子病理学 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 组织形态学数据 | 终末期LAM患者肺组织和不同年龄段的基因工程小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 73 | 2025-10-05 |
Retrospective pharmacogenetic study of psoriasis highlights the role of KLK7 in tumour necrosis factor signalling
2023-12-20, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljad332
PMID:37672660
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研究论文 | 通过回顾性药物遗传学研究探索银屑病治疗反应的遗传基础，发现KLK7基因在肿瘤坏死因子信号通路中的重要作用 | 首次发现rs1991820和rs62264137两个新标记与银屑病治疗反应相关，并证实KLK7表达与抗TNF治疗反应的关联 | 回顾性研究设计，样本量相对有限（1942例患者），自我评估的治疗反应可能存在偏倚 | 探索银屑病治疗药物反应的遗传通路和生物标志物 | 1942例基因分型的银屑病患者 | 药物遗传学 | 银屑病 | 基因分型、线性回归、表观基因组学、转录组学、免疫组织化学、单细胞RNA测序 | 线性回归模型 | 基因型数据、表达数据、临床数据 | 1942例银屑病患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomics stratifies organoid models of metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2023-12-11, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2023113898
PMID:37962490
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析评估了三种不同条件诱导的代谢功能障碍相关脂肪性肝病器官模型 | 首次系统评估MASLD器官模型的转化潜力，并通过单细胞分析揭示不同诱导条件对炎症和纤维化的差异化影响 | 研究仅评估了三种诱导条件，可能未涵盖MASLD所有病理生理机制 | 评估人类肝脏器官模型在代谢功能障碍相关脂肪性肝病研究中的转化潜力 | 人类肝脏器官模型 | 数字病理学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA测序 | 器官模型 | 单细胞转录组数据 | 三种不同诱导条件的器官模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 75 | 2025-10-05 |
GPNMB+ Gal-3+ hepatic parenchymal cells promote immunosuppression and hepatocellular carcinogenesis
2023-12-11, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2023114060
PMID:38009297
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示肝细胞癌进展过程中GPNMB+ Gal-3+肝实质细胞的免疫抑制和促癌作用 | 首次在单细胞水平识别了肝细胞癌进展中的三个关键肝实质细胞亚群，并发现GPNMB+ Gal-3+ MT细胞兼具恶性和免疫抑制特性 | 研究主要基于大鼠模型和有限的患者样本，需要更大规模的临床验证 | 探究肝细胞癌发展中特定细胞群体及其在肿瘤微环境形成中的作用 | 毒素诱导的肝肿瘤大鼠模型和肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 大鼠模型和HCC患者（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 76 | 2025-10-05 |
Hemorrhage-activated NRF2 in tumor-associated macrophages drives cancer growth, invasion, and immunotherapy resistance
2023-12-07, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI174528
PMID:38060331
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤内出血通过激活巨噬细胞中NRF2信号通路促进癌症进展和免疫治疗抵抗的机制 | 首次发现出血激活的NRF2在肿瘤相关巨噬细胞中驱动癌症生长、侵袭和免疫治疗抵抗的新通路 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类临床相关性需要进一步验证 | 探索肿瘤内出血如何影响癌症进展和治疗反应 | 肿瘤相关巨噬细胞和MC38结肠腺癌小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 结肠癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 3D细胞培养球体功能分析 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 77 | 2025-10-05 |
IL-27 produced during acute malaria infection regulates Plasmodium-specific memory CD4+ T cells
2023-12-07, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202317713
PMID:37855243
|
研究论文 | 本研究揭示了IL-27在急性疟疾感染期间通过调控CD4+ T细胞反应影响免疫记忆形成的机制 | 首次发现IL-27在急性疟疾感染期间靶向调控特定CD4+T细胞反应窗口，并鉴定出独特的Th1记忆前体细胞亚群 | 研究主要基于小鼠疟疾模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究IL-27在疟疾感染期间对CD4+ T细胞记忆反应的调控作用 | 疟疾感染小鼠模型中的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，细胞因子检测 | NA | 基因表达数据，细胞表型数据 | 疟疾感染小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 78 | 2025-10-05 |
DNA methylation-mediated Rbpjk suppression protects against fracture nonunion caused by systemic inflammation
2023-12-05, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI168558
PMID:38051594
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研究论文 | 本研究揭示了系统性炎症通过DNA甲基化调控Rbpjk表达导致骨折不愈合的分子机制 | 首次发现NF-κB/Dnmt3b/Rbpjk轴在炎症性骨再生中的作用机制，并证明表观遗传修饰的祖细胞治疗可恢复炎症条件下的骨再生能力 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的可行性和效果需要进一步验证 | 探究系统性炎症导致骨折不愈合的分子机制并开发治疗策略 | 骨折愈合过程中的祖细胞 | 骨骼生物学 | 骨折不愈合 | 单细胞RNA测序，遗传动物模型，表观遗传调控 | 转基因小鼠模型（Ikk2ca，Dnmt3b功能缺失和转基因） | 单细胞转录组数据，遗传表型数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2025-10-05 |
Cephalopod-omics: Emerging Fields and Technologies in Cephalopod Biology
2023-12-29, Integrative and comparative biology
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/icb/icad087
PMID:37370232
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综述 | 总结了头足类动物生物学中新兴研究领域和技术的现状、挑战与前景 | 整合了头足类分子生物学多个新兴领域的最新进展，包括比较基因组学、基因操纵和单细胞技术等 | NA | 探讨头足类分子生物学和进化研究的关键挑战与未来方向 | 头足类动物 | 比较基因组学，基因编辑，单细胞技术 | NA | 测序技术，成像技术，基因操纵技术，单细胞转录组学，宏基因组学 | NA | 基因组数据，转录组数据，微生物组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，宏基因组学 | NA | NA |
| 80 | 2025-10-05 |
Cellular age explains variation in age-related cell-to-cell transcriptome variability
2023-12-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278144.123
PMID:37973195
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研究论文 | 本研究通过分析小鼠单细胞转录组数据，发现细胞年龄能够解释年龄相关转录组变异的大部分差异 | 提出了一个新颖的启发式模型来解释不同细胞类型衰老速率差异的原因 | 研究仅基于小鼠数据，需要在人类和其他物种中进一步验证 | 理解为什么某些细胞类型的转录组会显示衰老迹象而其他细胞类型不会 | 小鼠多种组织和年龄的单细胞转录组数据 | 单细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 启发式模型 | 单细胞转录组数据 | 多种小鼠组织和年龄的单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |