单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 436 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-05 |
Retrospective pharmacogenetic study of psoriasis highlights the role of KLK7 in tumour necrosis factor signalling
2023-12-20, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljad332
PMID:37672660
|
研究论文 | 通过回顾性药物遗传学研究探索银屑病治疗反应的遗传基础，发现KLK7基因在肿瘤坏死因子信号通路中的重要作用 | 首次发现rs1991820和rs62264137两个新标记与银屑病治疗反应相关，并证实KLK7表达与抗TNF治疗反应的关联 | 回顾性研究设计，样本量相对有限（1942例患者），自我评估的治疗反应可能存在偏倚 | 探索银屑病治疗药物反应的遗传通路和生物标志物 | 1942例基因分型的银屑病患者 | 药物遗传学 | 银屑病 | 基因分型、线性回归、表观基因组学、转录组学、免疫组织化学、单细胞RNA测序 | 线性回归模型 | 基因型数据、表达数据、临床数据 | 1942例银屑病患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 42 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomics stratifies organoid models of metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2023-12-11, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2023113898
PMID:37962490
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析评估了三种不同条件诱导的代谢功能障碍相关脂肪性肝病器官模型 | 首次系统评估MASLD器官模型的转化潜力，并通过单细胞分析揭示不同诱导条件对炎症和纤维化的差异化影响 | 研究仅评估了三种诱导条件，可能未涵盖MASLD所有病理生理机制 | 评估人类肝脏器官模型在代谢功能障碍相关脂肪性肝病研究中的转化潜力 | 人类肝脏器官模型 | 数字病理学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA测序 | 器官模型 | 单细胞转录组数据 | 三种不同诱导条件的器官模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2025-10-05 |
GPNMB+ Gal-3+ hepatic parenchymal cells promote immunosuppression and hepatocellular carcinogenesis
2023-12-11, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2023114060
PMID:38009297
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示肝细胞癌进展过程中GPNMB+ Gal-3+肝实质细胞的免疫抑制和促癌作用 | 首次在单细胞水平识别了肝细胞癌进展中的三个关键肝实质细胞亚群，并发现GPNMB+ Gal-3+ MT细胞兼具恶性和免疫抑制特性 | 研究主要基于大鼠模型和有限的患者样本，需要更大规模的临床验证 | 探究肝细胞癌发展中特定细胞群体及其在肿瘤微环境形成中的作用 | 毒素诱导的肝肿瘤大鼠模型和肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 大鼠模型和HCC患者（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 44 | 2025-10-05 |
Hemorrhage-activated NRF2 in tumor-associated macrophages drives cancer growth, invasion, and immunotherapy resistance
2023-12-07, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI174528
PMID:38060331
|
研究论文 | 本研究揭示了肿瘤内出血通过激活巨噬细胞中NRF2信号通路促进癌症进展和免疫治疗抵抗的机制 | 首次发现出血激活的NRF2在肿瘤相关巨噬细胞中驱动癌症生长、侵袭和免疫治疗抵抗的新通路 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类临床相关性需要进一步验证 | 探索肿瘤内出血如何影响癌症进展和治疗反应 | 肿瘤相关巨噬细胞和MC38结肠腺癌小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 结肠癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 3D细胞培养球体功能分析 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2025-10-05 |
IL-27 produced during acute malaria infection regulates Plasmodium-specific memory CD4+ T cells
2023-12-07, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202317713
PMID:37855243
|
研究论文 | 本研究揭示了IL-27在急性疟疾感染期间通过调控CD4+ T细胞反应影响免疫记忆形成的机制 | 首次发现IL-27在急性疟疾感染期间靶向调控特定CD4+T细胞反应窗口，并鉴定出独特的Th1记忆前体细胞亚群 | 研究主要基于小鼠疟疾模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究IL-27在疟疾感染期间对CD4+ T细胞记忆反应的调控作用 | 疟疾感染小鼠模型中的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，细胞因子检测 | NA | 基因表达数据，细胞表型数据 | 疟疾感染小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 46 | 2025-10-05 |
DNA methylation-mediated Rbpjk suppression protects against fracture nonunion caused by systemic inflammation
2023-12-05, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI168558
PMID:38051594
|
研究论文 | 本研究揭示了系统性炎症通过DNA甲基化调控Rbpjk表达导致骨折不愈合的分子机制 | 首次发现NF-κB/Dnmt3b/Rbpjk轴在炎症性骨再生中的作用机制，并证明表观遗传修饰的祖细胞治疗可恢复炎症条件下的骨再生能力 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的可行性和效果需要进一步验证 | 探究系统性炎症导致骨折不愈合的分子机制并开发治疗策略 | 骨折愈合过程中的祖细胞 | 骨骼生物学 | 骨折不愈合 | 单细胞RNA测序，遗传动物模型，表观遗传调控 | 转基因小鼠模型（Ikk2ca，Dnmt3b功能缺失和转基因） | 单细胞转录组数据，遗传表型数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2025-10-05 |
Cephalopod-omics: Emerging Fields and Technologies in Cephalopod Biology
2023-12-29, Integrative and comparative biology
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/icb/icad087
PMID:37370232
|
综述 | 总结了头足类动物生物学中新兴研究领域和技术的现状、挑战与前景 | 整合了头足类分子生物学多个新兴领域的最新进展，包括比较基因组学、基因操纵和单细胞技术等 | NA | 探讨头足类分子生物学和进化研究的关键挑战与未来方向 | 头足类动物 | 比较基因组学，基因编辑，单细胞技术 | NA | 测序技术，成像技术，基因操纵技术，单细胞转录组学，宏基因组学 | NA | 基因组数据，转录组数据，微生物组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，宏基因组学 | NA | NA |
| 48 | 2025-10-05 |
Marine Invertebrates One Cell at A Time: Insights from Single-Cell Analysis
2023-12-12, Integrative and comparative biology
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/icb/icad034
PMID:37188638
|
综述 | 本文综述了海洋无脊椎动物单细胞RNA测序研究的现状与进展 | 系统整合了海洋无脊椎动物单细胞分析领域的最新研究成果，并提出了跨实验和跨物种数据比较的重要考量 | 海洋无脊椎动物细胞类型的完整多样性仍未知晓，存在数据整合和比较的技术挑战 | 探讨单细胞分析技术在海洋无脊椎动物研究中的应用与前景 | 海洋无脊椎动物 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2025-10-05 |
Cellular age explains variation in age-related cell-to-cell transcriptome variability
2023-12-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278144.123
PMID:37973195
|
研究论文 | 本研究通过分析小鼠单细胞转录组数据，发现细胞年龄能够解释年龄相关转录组变异的大部分差异 | 提出了一个新颖的启发式模型来解释不同细胞类型衰老速率差异的原因 | 研究仅基于小鼠数据，需要在人类和其他物种中进一步验证 | 理解为什么某些细胞类型的转录组会显示衰老迹象而其他细胞类型不会 | 小鼠多种组织和年龄的单细胞转录组数据 | 单细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 启发式模型 | 单细胞转录组数据 | 多种小鼠组织和年龄的单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 50 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptome sequencing of plant leaf expressing anti-HER2 VHH-FcK cancer therapeutic protein
2023-12-19, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-023-02833-5
PMID:38114492
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析表达抗HER2 VHH-FcK癌症治疗蛋白的转基因烟草叶片 | 首次在植物系统中应用单细胞RNA测序技术分析重组治疗蛋白的组织特异性表达模式 | 仅针对烟草叶片进行研究，未验证其他植物组织或物种 | 优化植物生物质中重组治疗蛋白的生产效率 | 转基因烟草（Nicotiana tabacum）叶片细胞 | 植物生物技术 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 转基因烟草叶片细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 51 | 2025-10-05 |
Autologous Airway Basal Cell Transplantation Alleviates Airway Epithelium Defect in Recurrent Benign Tracheal Stenosis
2023-12-18, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szad062
PMID:37804518
|
研究论文 | 本研究通过自体气道基底细胞移植联合生物凝胶治疗复发性良性气管狭窄，探索其在气道再上皮化中的治疗效果 | 首次将自体气道基底细胞移植与生物凝胶涂层相结合，应用于气管狭窄的再生治疗 | 研究仅在犬类动物模型中进行，尚未进行人体临床试验 | 探索自体基底细胞移植在恢复气道稳态和治疗气管狭窄中的治疗效果 | 复发性良性气管狭窄患者的气道黏膜和建立气管狭窄模型的犬类 | 单细胞测序 | 气管狭窄 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 犬类动物模型，分为4个实验组，随访16周 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 52 | 2025-10-05 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis Identifies Angiotensinogen and Galanin as Unique Molecular Markers of Acinar Cells in Murine Salivary Glands
2023-12, Stem cells and development
IF:2.5Q2
DOI:10.1089/scd.2023.0125
PMID:37823745
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析鉴定小鼠唾液腺腺泡细胞的独特分子标记物 | 首次发现血管紧张素原和甘丙肽分别作为颌下腺浆液性腺泡细胞和舌下腺黏液性腺泡细胞的特异性标记物 | 研究仅使用4周龄小鼠，未涵盖其他发育阶段 | 鉴定小鼠颌下腺和舌下腺腺泡细胞的分子标记物 | 小鼠颌下腺和舌下腺组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 免疫组织化学, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据 | 4周龄小鼠 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x单细胞测序平台 |
| 53 | 2025-10-06 |
Melanoma differentiation associated gene-9/syndecan binding protein promotes hepatocellular carcinoma
2023-12-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.32797
PMID:36120720
|
研究论文 | 本研究通过构建肝细胞特异性过表达MDA-9的转基因小鼠模型，揭示MDA-9通过NF-κB和Spp1信号通路促进肝细胞癌发展的机制 | 首次构建肝细胞特异性MDA-9过表达转基因小鼠模型，并发现MDA-9通过NF-κB-Spp1轴驱动肝癌发生的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类肝癌中的验证尚不充分 | 探究MDA-9基因在肝细胞癌发生发展中的作用机制 | 转基因小鼠模型（Alb/MDA-9）和野生型对照小鼠的肝细胞及非实质细胞 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 转基因技术 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据 | 转基因小鼠与野生型对照小鼠 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 54 | 2025-10-06 |
Deep analysis of CD4 T cells in the rhesus CNS during SIV infection
2023-Dec, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011844
PMID:38060615
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序深入分析SIV感染期间恒河猴中枢神经系统中的CD4 T细胞分布和功能 | 首次系统揭示CCR5+ CD4 T细胞在中枢神经系统不同区域（包括脑实质和边界组织）的分布特征及其在SIV感染中的功能状态 | 样本量较小（10只恒河猴），ART方案模拟的是依从性不佳的情况，可能无法完全反映临床实际情况 | 探究SIV感染期间中枢神经系统中CD4 T细胞的分布、功能和病毒存在情况 | SIVmac251感染的恒河猴 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 10只SIV感染的恒河猴（4只急性期，6只慢性期） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 55 | 2025-10-06 |
Integrative Analyses of scRNA-seq, Bulk mRNA-seq, and DNA Methylation Profiling in Depressed Suicide Brain Tissues
2023-12-18, The international journal of neuropsychopharmacology
DOI:10.1093/ijnp/pyad057
PMID:37774423
|
研究论文 | 通过整合分析抑郁症自杀患者脑组织的单细胞RNA测序、批量mRNA测序和DNA甲基化数据，揭示自杀行为的生物学机制 | 首次整合单细胞转录组、批量转录组和DNA甲基化数据，在抑郁症自杀患者脑组织中进行跨组学分析，并发现少突胶质前体细胞在自杀行为中的关键作用 | 样本量有限，仅分析了特定脑区组织，动物模型与人类样本的对应关系需要进一步验证 | 探索自杀行为的生物学机制和表观遗传调控 | 抑郁症自杀患者的脑组织样本和氟西汀处理的大鼠脑组织 | 生物信息学 | 抑郁症 | scRNA-seq, bulk mRNA-seq, DNA甲基化微阵列 | 差异表达分析, 差异甲基化分析, 反卷积分析 | 基因组学数据, 表观基因组学数据 | 抑郁症自杀患者脑组织样本和氟西汀处理大鼠脑组织 | NA | 单细胞RNA测序, 批量mRNA测序, DNA甲基化分析 | NA | NA |
| 56 | 2025-10-06 |
Neural stem cells persist to generate new neurons in the hippocampus of adult and aged human brain - Fiction or accurate?
2023-12, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2023.102133
PMID:38000512
|
综述 | 回顾四十年来关于成人神经发生的研究进展，重点关注海马体神经发生在成年和老年人类大脑中的持续性问题 | 系统梳理了成人神经发生研究领域的关键里程碑、方法学进展和争议焦点 | 成人海马体神经发生的存在性和功能贡献仍需通过大规模单细胞测序等技术验证 | 探讨成人神经发生的证据、机制及其在神经系统疾病中的作用 | 人类海马体神经发生过程 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 57 | 2025-10-06 |
Identification and validation of key biomarkers and potential therapeutic targets for primary open-angle glaucoma
2023-12, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-022-2344-5
PMID:37610681
|
研究论文 | 通过生物信息学分析识别原发性开角型青光眼的关键生物标志物和潜在治疗靶点 | 整合多个基因表达数据集，结合单细胞RNA测序技术筛选并验证POAG关键基因 | 需要进一步研究揭示这些基因表达变化的具体机制 | 识别POAG的新型生物标志物和潜在治疗靶点 | 原发性开角型青光眼相关基因表达数据 | 生物信息学 | 青光眼 | mRNA表达微阵列，单细胞RNA测序，功能富集分析，蛋白质相互作用网络分析，加权基因共表达网络分析，免疫荧光，实时定量PCR | NA | 基因表达数据 | 三个数据集（GSE27276，GSE138125，GSE148371） | NA | 单细胞RNA测序，微阵列 | NA | NA |
| 58 | 2025-10-06 |
Data-driven selection of analysis decisions in single-cell RNA-seq trajectory inference
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.18.572214
PMID:38187768
|
研究论文 | 开发了Escort框架用于评估单细胞RNA测序数据是否适合轨迹推断并量化分析决策对轨迹特性的影响 | 提出了首个通过数据驱动评估来指导单细胞轨迹分析决策的框架，减少了方法选择和参数优化的不确定性 | 未提及具体的性能验证数据集规模或与其他方法的详细比较结果 | 解决单细胞RNA测序轨迹推断中分析方法选择不确定性的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 轨迹推断方法 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 59 | 2025-10-06 |
Enrichment of a neutrophil-like monocyte transcriptional state in glioblastoma myeloid suppressor cells
2023-Dec-28, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3793353/v1
PMID:38234734
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了胶质母细胞瘤中髓源性抑制细胞的异质性，并发现了一种中性粒细胞样单核细胞转录状态的富集 | 首次在胶质母细胞瘤患者血液M-MDSC中发现中性粒细胞样单核细胞转录状态的富集，并开发了相应的基因表达和去卷积算法进行定量分析 | M-MDSC的个体发育和明确表型标记仍未知，研究样本来源有限 | 解析胶质母细胞瘤中髓源性抑制细胞的异质性和转录特征 | 胶质母细胞瘤、肺癌和头颈癌患者的髓源性抑制细胞 | 单细胞转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 胶质母细胞瘤、肺癌和头颈癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 60 | 2025-10-06 |
Chronic chromosome instability induced by Plk1 results in immune suppression in breast cancer
2023-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113266
PMID:37979172
|
研究论文 | 本研究通过过表达Plk1诱导染色体不稳定性，揭示了其在乳腺癌中通过激活SASP、上调PD-L1和CD206以及诱导NF-κβ信号通路促进免疫逃逸的机制 | 首次系统阐明Plk1诱导的慢性染色体不稳定性通过多通路协同作用导致乳腺癌免疫抑制的完整机制 | 研究主要基于Her2乳腺癌模型，在其他亚型中的普适性需进一步验证 | 探究染色体不稳定性相关分子特征如何改变肿瘤进化过程中的免疫识别 | Her2乳腺癌模型和人类乳腺癌肿瘤 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 前病变乳腺组织和人类乳腺癌肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |