单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202312-202312] [清除筛选条件]
当前共找到 437 篇文献,本页显示第 41 - 60 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2025-12-05
High-Salt Diet Causes Defective Oocyte Maturation and Embryonic Development to Impair Female Fertility in Mice
2023-12, Molecular nutrition & food research IF:4.5Q1
研究论文 本研究探讨高盐饮食对小鼠卵母细胞成熟、胚胎发育及雌性生育力的影响及其机制 首次揭示高盐饮食通过破坏卵母细胞自噬、凋亡水平和线粒体功能,导致卵母细胞减数分裂停滞、受精失败和早期胚胎发育缺陷,从而损害雌性生育力 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类或其他哺乳动物中验证;机制研究主要基于转录组数据,需进一步实验验证 探究高盐饮食对雌性生殖细胞发育及生育力的影响机制 C57BL/6雌性小鼠的卵母细胞、胚胎及生育力指标 生殖生物学 生育力障碍 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 C57BL/6雌性小鼠(对照组与高盐饮食组) NA 单细胞RNA-seq NA NA
42 2025-12-04
Ursa: A Comprehensive Multiomics Toolbox for High-Throughput Single-Cell Analysis
2023-12-01, Molecular biology and evolution IF:11.0Q1
研究论文 本文介绍了一个名为Ursa的自动化单细胞多组学R软件包,旨在为非生物信息学专家提供一站式单细胞分析解决方案 开发了首个集成6种自动化单细胞组学和空间转录组学工作流程的综合工具箱,通过自动化流程降低生物信息学分析门槛 未提及该工具包在特定疾病数据集上的验证效果,也未说明与现有工具的基准比较结果 开发易用的生物信息学工具以加速单细胞多组学研究,弥合生物信息学专家与非专家之间的技术鸿沟 单细胞多组学数据分析工具 生物信息学 NA 单细胞多组学分析 自动化分析流程 基因组学、转录组学、表观遗传学、蛋白质组学、免疫组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 NA NA
43 2025-12-03
Global and cell type-specific immunological hallmarks of severe dengue progression identified via a systems immunology approach
2023-12, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和靶向蛋白质组学技术,揭示了严重登革热进展的全球和细胞类型特异性免疫学特征 首次在自然感染中证明B细胞携带复制性登革病毒,并系统性地识别了严重登革热进展中的免疫细胞迁移、炎症反应及抗原呈递细胞功能受损等关键特征 研究主要聚焦于儿童血液样本,可能无法完全代表成人或其他组织中的登革热病理机制 定义登革病毒靶细胞并识别严重登革热进展的免疫学标志 儿童血液中的免疫细胞和登革病毒 系统免疫学 登革热 病毒包容性单细胞RNA测序(viscRNA-Seq 2)、靶向蛋白质组学、分泌组分析、功能实验 NA 单细胞RNA测序数据、蛋白质组学数据、分泌组数据 儿童血液样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
44 2025-12-02
A discrete 'early-responder' stromal-cell subtype orchestrates immunocyte recruitment to injured tissue
2023-12, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本研究通过时间分辨单细胞RNA测序,鉴定出一种在急性损伤后早期响应的间充质基质细胞亚型,该亚型通过表达免疫调节因子(如Cxcl5)协调免疫细胞(如中性粒细胞和巨噬细胞)的招募,从而影响组织再生和炎症进程 首次在肌肉间充质基质细胞中识别出一种“早期响应者”亚型,该亚型在损伤后第一天迅速激活,表达独特的免疫调节转录本,并证明其通过Cxcl5等因子在协调免疫细胞招募和组织再生中发挥关键作用 研究主要基于小鼠模型,人类样本的验证有限;且未详细探讨该亚型在其他疾病或组织中的具体功能机制 探究急性损伤后间充质基质细胞亚型在免疫细胞招募和组织再生中的作用机制 小鼠肌肉间充质基质细胞(MmSCs)及其在急性损伤和肌肉萎缩模型中的响应 单细胞组学 肌肉损伤和肌肉萎缩 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
45 2025-11-26
Systematic benchmarking of imaging spatial transcriptomics platforms in FFPE tissues
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 对三种商业化成像空间转录组平台在FFPE组织中的性能进行系统性基准测试 首次在包含23种肿瘤和正常组织类型的组织芯片上对三种商业iST平台进行全面性能比较 研究基于组织芯片样本,可能无法完全代表完整组织切片的情况 评估成像空间转录组平台在FFPE组织中的技术和生物学性能 包含23种肿瘤和正常组织类型的组织芯片连续切片 空间转录组学 多种肿瘤类型 成像空间转录组学 NA 空间转录组数据 包含23种组织类型的组织芯片 10x Genomics 成像空间转录组学 10x Xenium 三种商业化成像空间转录组平台(包括10x Xenium)
46 2025-11-22
Identification of tumor immunophenotypes associated with immunotherapy response in bladder cancer
2023-12, International journal of urology : official journal of the Japanese Urological Association IF:1.8Q3
研究论文 本研究通过分析膀胱癌免疫表型,开发了与免疫治疗反应相关的基因特征,并验证了SRRM4、NPHS1和TMEM72作为预测生物标志物的潜力 首次基于肿瘤免疫细胞评分系统性地定义了膀胱癌的炎症型和免疫排斥型免疫表型,并建立了可预测免疫检查点抑制剂治疗反应的基因特征模型 研究主要基于公共数据集进行回顾性分析,缺乏前瞻性临床验证 揭示与膀胱癌免疫治疗反应相关的免疫表型特征,为改善免疫治疗效果提供新的分子靶点 膀胱癌患者 生物信息学 膀胱癌 RNA测序,单细胞RNA测序 风险评分模型 基因表达数据,蛋白质表达数据,临床预后数据 多个膀胱癌队列数据集(GSE32894、Imvigor210、GSE145140) NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
47 2025-11-18
Multiomic analysis of cervical squamous cell carcinoma identifies cellular ecosystems with biological and clinical relevance
2023-12, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 通过多组学分析揭示宫颈鳞状细胞癌的肿瘤细胞状态多样性及其与免疫微环境的相互作用 首次在宫颈鳞癌中系统绘制高分辨率空间转录组图谱,发现三种肿瘤状态及其特异性免疫微环境,揭示FABP5介导的免疫排斥机制 临床样本分析尚属初步,需要更大规模验证 解析宫颈鳞癌肿瘤异质性及其对免疫治疗响应的机制 宫颈鳞状细胞癌组织样本 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,空间蛋白质组学,遗传扰动,药理学扰动 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据,蛋白质组数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学,空间蛋白质组学 NA NA
48 2025-11-18
East Asian-specific and cross-ancestry genome-wide meta-analyses provide mechanistic insights into peptic ulcer disease
2023-12, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 通过跨祖先基因组荟萃分析揭示消化性溃疡疾病的遗传机制 首次进行大规模跨祖先(东亚和欧洲)消化性溃疡疾病基因组荟萃分析,发现25个新位点并揭示胃溃疡和十二指肠溃疡的遗传结构差异 NA 探索消化性溃疡疾病的遗传基础和发病机制 消化性溃疡疾病患者(52,032例)和对照人群(905,344例) 基因组学 消化性溃疡 全基因组关联研究(GWAS)、转录组分析 NA 基因组数据、转录组数据 52,032病例和905,344对照 NA 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq NA NA
49 2025-11-16
Single-cell transcriptomics reveals the brain evolution of web-building spiders
2023-12, Nature ecology & evolution IF:13.9Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示结网蜘蛛大脑进化机制 首次构建结网蜘蛛大脑单细胞图谱,发现蘑菇体样神经元中正选择基因与学习记忆行为的关联 仅分析一种结网蜘蛛物种,未涵盖所有蜘蛛多样性 探究蜘蛛神经系统如何进化以适应结网捕食策略 结网蜘蛛(Hylyphantes graminicola)和两种原始穴居蜘蛛 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序,基因组测序,基因富集分析,RNA干扰实验 NA 单细胞转录组数据,基因组数据 超过30,000个单细胞转录组 NA 单细胞RNA-seq,全基因组测序 NA NA
50 2025-11-15
Apoptosis recognition receptors regulate skin tissue repair in mice
2023-12-21, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示凋亡识别受体在小鼠皮肤组织修复中的调控机制 首次在皮肤伤口炎症期间系统描绘细胞动态图谱,发现Axl和Timd4两种胞葬受体在组织修复中的不同作用机制 研究主要基于小鼠模型,人类糖尿病足伤口数据有限,TLR3非依赖性机制尚未完全阐明 探究凋亡细胞识别与清除机制如何调控组织修复过程 小鼠皮肤伤口模型和人类糖尿病足伤口样本 单细胞生物学 糖尿病足溃疡 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
51 2025-11-15
Single-cell characterization of human GBM reveals regional differences in tumor-infiltrating leukocyte activation
2023-12-21, eLife IF:6.4Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示了人类胶质母细胞瘤中肿瘤浸润白细胞的区域差异 首次在配对样本中揭示了GBM肿瘤中心、外周浸润区和血液中免疫细胞的区域特异性转录特征 样本量较小(仅5例患者),需要更大规模验证 解析胶质母细胞瘤肿瘤微环境中免疫细胞的区域异质性 人类胶质母细胞瘤患者 单细胞组学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 5例原发性GBM患者的配对样本(肿瘤中心、外周浸润区、血液) NA 单细胞RNA测序 NA NA
52 2025-11-15
Single-cell sequencing highlights heterogeneity and malignant progression in actinic keratosis and cutaneous squamous cell carcinoma
2023-12-15, eLife IF:6.4Q1
研究论文 通过单细胞测序技术揭示光化性角化病和皮肤鳞状细胞癌的异质性及恶性进展机制 首次通过单细胞RNA测序全面描绘从正常皮肤到光化性角化病再到侵袭性皮肤鳞癌的完整进展过程,发现基底细胞恶性亚型并鉴定关键驱动基因 样本量较小(仅6名患者的13个样本),需要更大规模研究验证发现 解析皮肤鳞状细胞癌的发病机制和恶性进展过程 光化性角化病、原位鳞状细胞癌、皮肤鳞状细胞癌患者组织样本 单细胞测序 皮肤鳞状细胞癌 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫组织化学, 免疫荧光 NA 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 组织图像 6名患者的13个样本,共138,982个细胞 NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA NA
53 2025-11-15
Neural tube-associated boundary caps are a major source of mural cells in the skin
2023-12-14, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究揭示神经管相关边界帽细胞是小鼠皮肤血管壁细胞的主要来源 首次发现边界帽细胞衍生物沿神经迁移至皮肤并分化为血管周细胞和血管平滑肌细胞 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证 探索边界帽细胞在皮肤血管发育中的新功能 小鼠胚胎和新生小鼠的边界帽细胞及其衍生物 发育生物学 NA Cre报告基因细胞追踪,单细胞转录组测序 NA 基因表达数据,细胞追踪数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
54 2025-11-15
Avoiding false discoveries in single-cell RNA-seq by revisiting the first Alzheimer's disease dataset
2023-12-04, eLife IF:6.4Q1
研究论文 重新分析首个阿尔茨海默病单细胞RNA-seq数据集,通过改进数据处理和差异表达分析方法显著减少假阳性发现 采用最佳实践方法重新分析首个AD单核RNA-seq数据,将假发现率0.05下的差异表达基因减少549倍 仅针对单个数据集进行重新分析,未涉及其他独立验证数据集 评估质量控制和分析方法对疾病相关基因发现的影响,纠正先前研究中的假阳性发现 阿尔茨海默病患者脑组织单细胞RNA-seq数据 单细胞转录组学 阿尔茨海默病 单核RNA-seq NA 单细胞基因表达数据 NA NA 单核RNA-seq NA NA
55 2025-11-15
Epicardioid single-cell genomics uncovers principles of human epicardium biology in heart development and disease
2023-12, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 本研究通过人类多能干细胞衍生的心外膜类器官揭示人类心外膜在心脏发育和疾病中的生物学原理 开发了自组织人类多能干细胞衍生的心外膜类器官模型,首次实现了左心室壁典型的心外膜和心肌形态、分子和功能模式 类器官模型可能无法完全模拟体内真实心脏环境的复杂性 探索人类心外膜在心脏发育和疾病中的生物学功能和作用机制 人类多能干细胞衍生的心外膜类器官 单细胞基因组学 心脏疾病 谱系追踪, 单细胞转录组测序, 染色质可及性分析 类器官模型 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA NA
56 2025-11-15
SEACells infers transcriptional and epigenomic cellular states from single-cell genomics data
2023-12, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 提出SEACells算法,可从单细胞基因组学数据中推断转录和表观基因组细胞状态 克服单细胞数据稀疏性,同时保留传统细胞聚类所掩盖的异质性 NA 从单细胞测序数据中识别代表高度细粒度细胞状态的元细胞 单细胞RNA和ATAC测序数据 单细胞基因组学 COVID-19, 造血系统疾病 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 SEACells算法 单细胞基因组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
57 2025-11-15
Multimodal spatiotemporal phenotyping of human retinal organoid development
2023-12, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 本研究通过多模态时空表型分析探索人类视网膜类器官发育过程 开发了可视化工具包整合多组学数据,构建了首个整合空间分割细胞核的多模态视网膜类器官发育图谱 NA 研究人类视网膜类器官发育过程中的空间尺度和分子模态特征 人类多能干细胞生成的视网膜类器官和原代成人视网膜组织 数字病理学 NA 单细胞转录组测序,染色质可及性测序,多重蛋白成像 基因调控网络 空间蛋白质组数据,单细胞转录组数据,表观基因组数据 视网膜类器官时间序列样本和原代成人视网膜组织 NA 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq,空间蛋白质组学 NA NA
58 2025-11-15
Genomic and immune signatures predict clinical outcome in newly diagnosed multiple myeloma treated with immunotherapy regimens
2023-12, Nature cancer IF:23.5Q1
研究论文 本研究通过整合肿瘤全基因组和微环境单细胞RNA测序数据,揭示了基因组驱动因素和免疫特征对新诊断多发性骨髓瘤患者免疫治疗临床结局的预测价值 首次在包含达雷妥尤单抗的免疫治疗方案中,系统整合肿瘤基因组与微环境单细胞测序数据,发现APOBEC突变活性、特定基因缺失和免疫细胞动态变化对治疗反应的预测作用 研究基于二期临床试验数据,样本量有限,需要更大规模验证 探索影响新诊断多发性骨髓瘤患者接受含达雷妥尤单抗免疫治疗方案临床结局的预测因素 新诊断的多发性骨髓瘤患者 基因组学 多发性骨髓瘤 全基因组测序,单细胞RNA测序 NA 基因组数据,转录组数据 二期临床试验患者队列 NA 全基因组测序,单细胞RNA测序 NA NA
59 2025-11-15
Microglia promote anti-tumour immunity and suppress breast cancer brain metastasis
2023-12, Nature cell biology IF:17.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和基因工程小鼠模型揭示了小胶质细胞在乳腺癌脑转移中发挥促炎和抑瘤作用 首次明确区分小胶质细胞与其他肿瘤相关巨噬细胞,并发现其在脑转移中独特的免疫促进作用 小胶质细胞与其他巨噬细胞的区分在技术上具有挑战性 探究小胶质细胞在乳腺癌脑转移中的免疫调节作用 小鼠模型和人类小胶质细胞 单细胞生物学 乳腺癌脑转移 单细胞RNA测序,基因工程小鼠模型 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
60 2025-11-14
Clonally expanded memory CD8+ T cells accumulate in atherosclerotic plaques and are pro-atherogenic in aged mice
2023-12, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 本研究揭示了衰老过程中记忆CD8+ T细胞在动脉粥样硬化斑块中的克隆性扩增及其促动脉粥样硬化作用 首次发现衰老相关的记忆CD8+ T细胞亚群在动脉粥样硬化斑块中克隆性扩增并具有促动脉粥样硬化功能 研究仅使用雌性小鼠,未涉及雄性动物模型 探究衰老对CD8 T细胞在动脉粥样硬化发生过程中的作用机制 年轻和年老雌性小鼠的CD8 T细胞及动脉粥样硬化斑块 免疫学 心血管疾病 单细胞RNA测序,适应性转移实验,细胞清除实验 NA 单细胞转录组数据 年轻和年老雌性小鼠群体 NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部