单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 436 篇文献，本页显示第 421 - 436 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2024-08-05 |
Spatial whole transcriptome profiling of primary tumor from patients with metastatic prostate cancer
2023-12-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.34708
PMID:37655984
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研究论文 | 本研究首次利用空间转录组学探索了转移性前列腺癌患者原发肿瘤内的空间基因表达异质性 | 揭示了肿瘤微环境对疾病进展的影响，并确定了潜在的预后生物标志物 | 研究仅包含三个患者样本，样本量较小 | 探讨转移性前列腺癌患者原发肿瘤中基因表达的空间异质性 | 来自三名前列腺癌患者的5459个组织点样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 三名患者，5459个组织点 |
| 422 | 2024-08-05 |
Bacterial single-cell transcriptomics: Recent technical advances and future applications in dentistry
2023-Dec, The Japanese dental science review
DOI:10.1016/j.jdsr.2023.08.001
PMID:37674900
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研究论文 | 本文探讨了细菌单细胞转录组学的最新技术进展及其在牙科的未来应用 | 介绍了单细胞RNA测序在细菌研究中的应用，并突出其在细胞间多样性和宿主-细菌相互作用研究中的重要性 | 目前的研究仍面临捕获单细胞RNA的技术障碍 | 探索细菌在口腔健康中的作用和单细胞研究的未来应用 | 细菌及其与宿主细胞的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 423 | 2024-08-05 |
Emerging technologies in adipose tissue research
2023-12, Adipocyte
IF:3.5Q2
DOI:10.1080/21623945.2023.2248673
PMID:37599422
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综述 | 本文简要概述了新兴技术在脂肪组织研究中的潜在影响 | 讨论了包括单细胞测序、多组学分析和空间转录组学在内的前沿技术在脂肪组织研究中的重要性 | 没有具体提到某一特定技术的详细实施或实验数据 | 识别这些新技术在脂肪组织研究中最显著的贡献领域 | 脂肪组织作为一种复杂和动态的组织 | 生物医学 | NA | 单细胞测序、多组学分析、空间转录组学、活体成像、3D组织工程、微生物组分析 | NA | NA | NA |
| 424 | 2024-08-07 |
Identification of tumor immunophenotypes associated with immunotherapy response in bladder cancer
2023-Dec, International journal of urology : official journal of the Japanese Urological Association
IF:1.8Q3
DOI:10.1111/iju.15276
PMID:37602677
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研究论文 | 本研究旨在揭示与膀胱癌免疫治疗反应相关的免疫表型，识别免疫亚型的特征基因，并为改善免疫治疗反应提供新的分子靶点 | 本研究提供了一种新的肿瘤免疫表型分类方法，并发现膀胱癌免疫表型可以预测免疫检查点阻断的反应 | NA | 揭示与膀胱癌免疫治疗反应相关的免疫表型 | 膀胱癌的免疫表型及其对免疫治疗反应的影响 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用了GSE32894、Imvigor210和GSE145140等多个数据集 |
| 425 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis reveals key differences between early-stage and late-stage systemic sclerosis skin across autoantibody subgroups
2023-12, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224184
PMID:37580109
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了弥漫性皮肤系统性硬化症（dcSSc）患者与健康对照组之间的细胞差异 | 发现了dcSSc患者中抗RNA聚合酶III（ARA）和抗拓扑异构酶抗体（ATA）亚组在疾病早期和晚期皮肤细胞表达谱和细胞间相互作用的差异 | NA | 探究dcSSc患者皮肤在不同疾病阶段和抗体亚组间的细胞差异 | 弥漫性皮肤系统性硬化症患者和健康对照组 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 皮肤活检样本 | 15个前臂皮肤活检样本，包括12名dcSSc患者和3名健康对照组 |
| 426 | 2024-08-05 |
Analysis of single-cell sequencing results of an elderly patient with myeloid leukemia reveals high expression of multiple oncogenes in monocytes and hematopoietic stem cells
2023-Dec, Hematology (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1080/16078454.2023.2240129
PMID:37535066
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研究论文 | 本研究分析了一名老年急性髓性白血病患者的单细胞基因组测序结果 | 该研究发现单核细胞和造血干细胞中多种癌基因的高表达，对急性髓性白血病的进展和治疗提供新见解 | 研究只针对一例老年急性髓性白血病患者，样本量较小，结果可能不具普遍性 | 分析老年急性髓性白血病患者的基因序列以提供新的治疗思路 | 一名64岁的急性髓性白血病患者的外周血和骨髓细胞 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 1名患者的外周血和骨髓细胞 |
| 427 | 2024-08-07 |
The interaction of macrophages and CD8 T cells in bronchoalveolar lavage fluid is associated with latent tuberculosis infection
2023-Dec, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2023.2239940
PMID:37470432
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了支气管肺泡灌洗液中的免疫细胞群体，特别是巨噬细胞和CD8 T细胞在潜伏性结核感染中的相互作用 | 发现巨噬细胞MM-CCL23在潜伏性结核感染中的保护性免疫作用，及其通过CCL20/CCR6招募CD8-CCR6 T细胞的机制 | 对从潜伏性结核感染进展到活动性结核的免疫机制仍定义不明确 | 探究潜伏性结核感染进展到活动性结核的免疫机制 | 支气管肺泡灌洗液中的免疫细胞群体，特别是巨噬细胞和CD8 T细胞 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自潜伏性结核感染或活动性结核患者的支气管肺泡灌洗液样本 |
| 428 | 2024-08-05 |
scFED: Clustering Identifying Cell Types of scRNA-Seq Data Based on Feature Engineering Denoising
2023-Dec, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-023-00574-y
PMID:37402002
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研究论文 | 本文介绍了scFED，一种基于特征工程的基因选择框架，用于消除单细胞RNA-seq数据的噪声波动 | scFED通过工程化的基因选择框架，提高了单细胞聚类和分类的效果 | 计算负担重且高表达基因可能无法提供稳定和预测的特征集 | 研究单细胞RNA-seq数据的特征选择，以改善聚类和细胞类型识别 | 应用scFED方法在四个真实的单细胞数据集上进行分析 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 四个真实的单细胞数据集 |
| 429 | 2024-08-07 |
A spatiotemporal gene expression and cell atlases of the developing rat ovary
2023-Dec, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13516
PMID:37309718
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组测序，构建了发育中的大鼠卵巢的转录组图谱，并分析了颗粒细胞的不同阶段及其转录调控网络。 | 发现了新的卵母细胞到卵丘细胞的生长信号，如JAG1-NOTCH2和FGF9-FGFR2，并观察到卵泡发育过程中的三个卵丘连续阶段。 | NA | 揭示正常卵巢发育过程中卵母细胞发育的不同阶段及其与体细胞的调控关系。 | 大鼠卵巢的发育过程及其细胞类型。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 430 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing in osteoarthritis
2023-Dec, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13517
PMID:37317049
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在骨关节炎病理发生中的应用，总结了关节软骨、半月板、滑膜和软骨下骨的微观结构变化，并探讨了其在靶向药物和组织工程中的潜在应用。 | 单细胞RNA测序提供了超越传统技术的高分辨率视图，有助于深入理解骨关节炎的发病机制和进展。 | 目前关于骨相关生物材料的评估研究有限。 | 探讨单细胞RNA测序在骨关节炎治疗中的潜在临床价值和未来发展方向。 | 骨关节炎相关的关节软骨、半月板、滑膜和软骨下骨。 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 431 | 2024-08-05 |
TGF-β-p-STAT1-LAIR2 axis has a "self-rescue" role for exhausted CD8+ T cells in hepatocellular carcinoma
2023-Dec, Cellular oncology (Dordrecht)
DOI:10.1007/s13402-023-00830-9
PMID:37223874
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研究论文 | 本研究探讨了TGF-β在肝细胞癌中对CD8+ T细胞功能的影响 | 发现TGF-β-p-STAT1-LAIR2轴具有CD8+ T细胞的“自我拯救”机制 | 该“自我拯救”机制在TGF-β刺激下存在时间和剂量限制，容易被更强的抑制信号掩盖 | 研究TGF-β对肝细胞癌中CD8+ T细胞的调控效应及分子机制 | 主要研究肝细胞癌中浸润的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 流式细胞术, 质量细胞术, 免疫组化, RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 高通量测序的可转置酶可接近染色质检测, 染色质免疫沉淀, 双荧光素酶报告基因测定 | NA | NA | NA |
| 432 | 2024-08-08 |
Characterizing the cellular and molecular variabilities of peripheral immune cells in healthy recipients of BBIBP-CorV inactivated SARS-CoV-2 vaccine by single-cell RNA sequencing
2023-Dec, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2023.2187245
PMID:36987861
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了接种BBIBP-CorV灭活SARS-CoV-2疫苗后健康受试者外周免疫细胞的细胞和分子变异性 | 首次通过单细胞RNA和TCR/BCR测序揭示了接种灭活SARS-CoV-2疫苗后免疫细胞功能转录和TCR/BCR谱动态变化 | NA | 探索接种灭活SARS-CoV-2疫苗后免疫细胞的功能转录和TCR/BCR谱动态变化 | 接种BBIBP-CorV灭活SARS-CoV-2疫苗的健康受试者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 四次时间点的外周血单个核细胞样本 |
| 433 | 2024-08-08 |
Integrative exploration of the mutual gene signatures and immune microenvironment between benign prostate hyperplasia and castration-resistant prostate cancer
2023-Dec, The aging male : the official journal of the International Society for the Study of the Aging Male
DOI:10.1080/13685538.2023.2183947
PMID:36974949
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞RNA测序、批量RNA测序和微阵列数据，探索了良性前列腺增生和去势抵抗性前列腺癌之间的共同基因特征和免疫微环境。 | 首次揭示了良性前列腺增生和去势抵抗性前列腺癌之间的共同基因特征和免疫微环境，为前列腺癌的免疫治疗提供了潜在的治疗靶点。 | NA | 探索良性前列腺增生和去势抵抗性前列腺癌之间的共同基因特征和免疫微环境。 | 良性前列腺增生和去势抵抗性前列腺癌的共同基因特征和免疫微环境。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、微阵列数据分析 | WGCNA、lasso回归分析 | RNA测序数据 | NA |
| 434 | 2024-08-08 |
Histone demethylase KDM4B contributes to advanced clear cell renal carcinoma and association with copy number variations and cell cycle progression
2023-12, Epigenetics
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/15592294.2023.2192319
PMID:36952476
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研究论文 | 本文研究了组蛋白去甲基化酶KDM4B在透明细胞肾细胞癌中的作用及其与拷贝数变异和细胞周期进展的关联 | 首次阐明了KDM4B在透明细胞肾细胞癌中的作用，并探讨了其与拷贝数变异和细胞周期进展的关系 | NA | 探讨KDM4B在透明细胞肾细胞癌中的作用及其与疾病进展和预后的关系 | KDM4B在透明细胞肾细胞癌中的表达及其对细胞增殖、迁移和肿瘤生长与转移的影响 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 免疫组化染色, 细胞计数试剂盒-8 (CCK-8) 测定, Transwell 实验, 异种移植模型, 单细胞RNA测序 | NA | 组织, 病理切片, 细胞系 | 新鲜组织和病理切片样本, 多个细胞系, 异种移植模型 |
| 435 | 2024-08-05 |
Identification of long noncoding RNA NEAT1 as a key gene involved in the extramedullary disease of multiple myeloma by bioinformatics analysis
2023-Dec, Hematology (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1080/16078454.2022.2164449
PMID:36657019
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析确定长非编码RNA NEAT1在多发性骨髓瘤的髓外疾病中作为关键基因 | 研究发现长非编码RNA NEAT1可能成为髓外疾病的潜在生物标志物 | 本研究未能确定NEAT1基因表达与多发性骨髓瘤患者的总生存期和无进展生存期的关系 | 探讨长非编码RNA在多发性骨髓瘤髓外疾病中的作用 | 多发性骨髓瘤患者的髓内和髓外细胞样本 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6个多发性骨髓瘤患者（3对） |
| 436 | 2024-08-05 |
TSPAN4 and migrasomes in atherosclerosis regression correlated to myocardial infarction and pan-cancer progression
2023-12, Cell adhesion & migration
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/19336918.2022.2155337
PMID:36513632
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研究论文 | 本文探讨了TSPAN4在动脉粥样硬化逆转和癌症进展中的作用 | 揭示了TSPAN4在动脉粥样硬化和癌症进展中的关键角色 | 关于TSPAN4对迁移体的生理功能了解较少 | 研究TSPAN4在动脉粥样硬化和癌症进展中的作用 | 聚焦于巨噬细胞中的TSPAN4表达及其在动脉粥样硬化中的相关性 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序，GEO 数据集，TCGA 数据库 | MI小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |