单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 436 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-08-07 |
Identification of the role of MCM6 in bladder cancer prognosis, immunotherapy response, and in vitro experimental investigation using multi-omics analysis
2023-Dec-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2023.122253
PMID:37951536
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了MCM6在膀胱癌中的作用及其对预后和免疫治疗反应的影响，并通过体外实验验证了MCM6的功能。 | 首次详细探讨了MCM6在膀胱癌中的具体作用，并通过多组学分析和体外实验验证了其对膀胱癌预后和免疫治疗反应的影响。 | 研究主要基于公共数据库数据和体外实验，可能需要进一步的临床试验来验证MCM6作为膀胱癌预后和免疫治疗标志物的有效性。 | 探索MCM6在膀胱癌中的作用及其对预后和免疫治疗反应的影响。 | MCM6在膀胱癌中的作用及其对患者预后和免疫治疗反应的影响。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | 使用了TCGA和GEO数据库中的数据，具体样本数量未在摘要中明确提及。 |
| 402 | 2024-08-05 |
Optomicrofluidic detection of cancer cells in peripheral blood via metabolic glycoengineering
2023-12-05, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d3lc00678f
PMID:37955355
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研究论文 | 本文报道了一种基于代谢糖工程的癌细胞监测新方法 | 此技术通过代谢标记手段显著提高了癌细胞的标记效率和荧光信号强度 | 研究中未提及与其他细胞类型标记的对比结果与可能的干扰因素 | 探索一种新的技术用于周边血液中癌细胞的检测 | 研究对象为在外周血单核细胞中通过代谢标记的多种癌细胞系 | 数字病理学 | 肺癌 | 代谢糖工程 | NA | 荧光信号数据 | 涉及三种不同的癌细胞系 |
| 403 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq reveals novel immune-associated biomarkers for predicting prognosis in AML patients with RUNX1::RUNX1T1
2023-Dec, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111178
PMID:37951201
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研究论文 | 本研究揭示了AHCY可能作为预测具有RUNX1::RUNX1T1的急性髓性白血病患者预后和T细胞增殖活化效率的新指标 | 通过单细胞转录组数据发现AHCY与急性髓性白血病患者的预后相关，提出其作为新生物标志物的潜力 | 未在研究中详细讨论AHCY的机制及其在临床应用中的具体验证 | 揭示有关急性髓性白血病患者T细胞增殖和激活相关基因的表达情况 | 以RUNX1::RUNX1T1的急性髓性白血病患者为研究对象 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 来自三个研究的数据，包含TCGA LAML (n = 145) 和 GEO 数据集 (n = 104) |
| 404 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic architecture and cellular communication circuits of parametrial adipose tissue in pregnant mice
2023-Dec-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2023.122214
PMID:37907153
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了怀孕小鼠参数脂肪组织中的细胞组成和功能转变 | 定义了具有独特性质的脂肪细胞亚群Adipo_5，并揭示了参数脂肪组织在建立母胎免疫耐受中的潜在贡献 | NA | 探讨参数脂肪组织在怀孕相关免疫、高血压和代谢紊乱中的作用 | 怀孕小鼠的参数脂肪组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 18,074个脂肪组织细胞 |
| 405 | 2024-08-05 |
Abnormal lactate metabolism is linked to albuminuria and kidney injury in diabetic nephropathy
2023-12, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.08.006
PMID:37843477
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研究论文 | 该文章探讨了异常乳酸代谢与糖尿病肾病中白蛋白尿和肾损伤之间的关联 | 创新点在于发现乳酸水平的增加与糖尿病肾病的病理变化相关，并指出尿液乳酸水平可能成为肾病进展风险的潜在生物标志物 | 局限性在于研究主要基于小鼠模型，临床验证仍需更多人群研究 | 研究糖尿病肾病发病机制中的代谢异常及其对疾病进展的影响 | 研究对象为糖尿病小鼠模型及东南亚糖尿病患者队列 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 针对性代谢组学分析 | NA | 尿液样本及血清生物标志物 | 涉及小鼠模型和东南亚患者队列 |
| 406 | 2024-08-07 |
High-Salt Diet Causes Defective Oocyte Maturation and Embryonic Development to Impair Female Fertility in Mice
2023-Dec, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.202300401
PMID:37863820
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研究论文 | 本研究探讨了高盐饮食对小鼠卵母细胞成熟和胚胎发育的影响，以及其对雌性生育能力的损害机制 | 首次揭示了高盐饮食通过影响卵母细胞的自噬、凋亡水平和线粒体功能，导致卵母细胞和胚胎质量下降，从而损害雌性生育能力 | NA | 研究高盐饮食对雌性小鼠生育能力的影响及其机制 | 小鼠的卵母细胞成熟、受精率、胚胎发育和雌性生育能力 | NA | NA | 单细胞转录组数据分析 | NA | 转录组数据 | C57BL/6雌性小鼠 |
| 407 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis Identifies Angiotensinogen and Galanin as Unique Molecular Markers of Acinar Cells in Murine Salivary Glands
2023-Dec, Stem cells and development
IF:2.5Q2
DOI:10.1089/scd.2023.0125
PMID:37823745
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析识别了小鼠唾液腺中腺泡细胞的独特分子标记物。 | 揭示了唾液腺腺泡细胞多样性的特定标记物，以往研究未能发现。 | 本研究主要集中在四周龄小鼠，结果可能不适用于其他年龄段。 | 识别小鼠唾液腺腺泡细胞的分子标记物。 | 小鼠的下颌腺和舌下腺中的腺泡细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 4周龄小鼠 |
| 408 | 2024-08-05 |
scFseCluster: a feature selection-enhanced clustering for single-cell RNA-seq data
2023-12, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202302103
PMID:37788907
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研究论文 | 本研究建立了一个新的计算框架scFseCluster，用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 引入基于量子松鼠搜索算法的特征选择来提取最佳基因集，从而显著提高细胞聚类的性能 | 虽然该方法表现良好，但可能在特定数据集上仍存在一些适用性限制 | 提高单细胞RNA-seq数据分析中的细胞聚类性能 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 八个基准单细胞RNA-seq数据集 |
| 409 | 2024-08-07 |
CD74 deficiency reduces trophoblast invasion and proliferation mediated by SIRT1 in preeclampsia
2023-12-01, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-23-0202
PMID:37796743
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研究论文 | 本研究探讨了CD74在子痫前期中通过SIRT1介导的滋养层细胞侵袭和增殖中的作用 | 研究首次揭示了CD74通过调节MAPK信号通路在子痫前期发病机制中的保护作用，并发现SIRT1对此有正向调控作用 | NA | 研究子痫前期的发病机制及其相关基因的作用 | 子痫前期患者的胎盘和SIRT1杂合子敲除小鼠模型 | 数字病理学 | 妊娠疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 134个差异表达基因(DEGs)，使用CD74敲低的HTR8/SVneo细胞进行实验 |
| 410 | 2024-08-05 |
Understanding the pathogenesis of brain arteriovenous malformation: genetic variations, epigenetics, signaling pathways, and immune inflammation
2023-Dec, Human genetics
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s00439-023-02605-6
PMID:37768356
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综述 | 本文综合分析了与脑动静脉畸形相关的关键通路和炎症因子，并探讨其与表观遗传调控和遗传学的相互作用 | 本文揭示了表观遗传调控、基因变异及其信号通路在脑动静脉畸形中的作用，及其与免疫炎症的关系 | 目前缺乏针对脑动静脉畸形的特定药物，且临床上缺乏相关生物标志物 | 阐明脑动静脉畸形的发病机制并开发潜在治疗策略 | 分析揭示影响脑动静脉畸形的基因、表观遗传调控和免疫炎症因子 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 411 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing and UPHLC-MS/MS targeted metabolomics offer new insights into the etiological basis for male cattle-yak sterility
2023-Dec-31, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2023.126831
PMID:37716658
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和UPHLC-MS/MS靶向代谢组学方法，对比分析了4岁雄性牦牛和4岁雄性牛牦杂交后代睾丸组织的差异，以探索牛牦杂交后代雄性不育的病因基础。 | 首次系统地对牛牦杂交后代雄性不育现象进行了细胞层面的分析，提供了全面的见解。 | NA | 探索牛牦杂交后代雄性不育的病因基础 | 4岁雄性牦牛和4岁雄性牛牦杂交后代的睾丸组织 | NA | 雄性不育 | 单细胞RNA测序，UPHLC-MS/MS靶向代谢组学 | NA | 细胞类型数据 | 4岁雄性牦牛和4岁雄性牛牦杂交后代的睾丸组织样本 |
| 412 | 2024-08-05 |
Functional enrichment analysis of LYSET and identification of related hub gene signatures as novel biomarkers to predict prognosis and immune infiltration status of clear cell renal cell carcinoma
2023-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05280-2
PMID:37740762
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研究论文 | 本研究探讨了LYSET在透明细胞肾细胞癌中的潜在途径，并基于这些途径中的核心基因建立相关预测模型 | 文章首次识别了与LYSET相关的核心基因签名，作为透明细胞肾细胞癌的预后和免疫浸润状态的新生物标志物 | 研究结果需要更多的实验验证以确认其有效性 | 旨在探索TMEM251在透明细胞肾细胞癌中的潜在作用及其相关的预测模型 | 研究对象为透明细胞肾细胞癌样本及其相关临床信息 | 数字病理学 | 肾癌 | mRNA表达数据分析、单细胞测序、免疫组化 | LASSO回归、Cox回归模型 | 文本、基因表达数据 | 使用了来自TCGA、E-MATE-1980和免疫治疗队列的透明细胞肾细胞癌样本 |
| 413 | 2024-08-07 |
Machine-learning based integrating bulk and single-cell RNA sequencing reveals the SLC38A5-CCL5 signaling as a promising target for clear cell renal cell carcinoma treatment
2023-Dec, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2023.101790
PMID:37722291
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研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞RNA测序数据，揭示了SLC38A5-CCL5信号通路作为透明细胞肾细胞癌治疗的有前景靶点 | 本研究首次建立了基于ETS1和MEF2C的高激活 regulons 的CAF衍生通信签名，并据此将ccRCC的肿瘤微环境分为两种分子亚型，该模型在预测预后和ICI治疗反应方面表现出高准确性和鲁棒性 | NA | 揭示癌症相关成纤维细胞在透明细胞肾细胞癌中的机制，并寻找新的治疗靶点 | 透明细胞肾细胞癌中的癌症相关成纤维细胞和恶性细胞 | 机器学习 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 414 | 2024-08-07 |
Post-ovulatory aging affects mitochondria, spindle and protein metabolism in mouse oocytes
2023-12-01, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-23-0130
PMID:37732584
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研究论文 | 本研究首次提供了新鲜和老化卵母细胞的全面mRNA表达谱，并探讨了卵泡后期老化对卵母细胞质量和胚胎发育潜力的影响。 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了老化卵母细胞中差异表达基因的富集情况，特别是在线粒体功能、纺锤体功能和蛋白质代谢方面。 | 研究主要集中在小鼠卵母细胞上，其结果在人类中的适用性需要进一步验证。 | 探讨卵泡后期老化对卵母细胞质量和胚胎发育潜力的分子机制。 | 新鲜和老化的小鼠卵母细胞。 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | mRNA表达谱 | 921个差异表达基因，其中569个基因下调，356个基因上调 |
| 415 | 2024-08-07 |
Integrated analysis of tumor microenvironment features to establish a diagnostic model for papillary thyroid cancer using bulk and single-cell RNA sequencing technology
2023-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05420-8
PMID:37733241
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research paper | 本研究通过整合肿瘤微环境特征，利用批量和单细胞RNA测序技术，建立了一个用于诊断乳头状甲状腺癌的模型 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术探索乳头状甲状腺癌的肿瘤微环境特征，并识别出潜在的诊断生物标志物 | NA | 探索乳头状甲状腺癌的肿瘤微环境特征，并建立诊断模型 | 乳头状甲状腺癌的肿瘤微环境特征及诊断生物标志物 | digital pathology | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 416 | 2024-08-07 |
A Novel Scoring Model of Deubiquitination Patterns Predicts Prognosis and Immunotherapeutic Response in Hepatocellular Carcinoma
2023-Dec, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2023.101789
PMID:37734237
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研究论文 | 本研究通过全面分析肝细胞癌中与总生存期相关的26种去泛素化酶的转录和遗传改变，利用共识聚类算法识别不同的去泛素化模式，并建立DUBscore模型来量化个体肝细胞癌患者的去泛素化模式，进一步通过加权基因共表达网络分析确定关键去泛素化酶，揭示了去泛素化模式在塑造肿瘤微环境复杂性和多样性中的重要作用。 | 本研究首次建立了DUBscore模型，用于量化肝细胞癌患者的去泛素化模式，并发现其可作为独立的预后因素和预测免疫治疗反应的指标。此外，研究还确定了BRCC3作为潜在的治疗靶点和预测免疫治疗反应的标志物。 | NA | 研究去泛素化模式在肝细胞癌中的作用及其对肿瘤微环境和免疫治疗反应的影响。 | 肝细胞癌患者的去泛素化模式及其对肿瘤微环境和免疫治疗反应的影响。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 主成分分析(PCA) | 转录组数据 | 26种与总生存期相关的去泛素化酶 |
| 417 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals dynamic changes of the preclinical A549 cancer models, and the mechanism of dacomitinib
2023-Dec-05, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2023.176046
PMID:37708985
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了A549细胞和A549异种移植模型在达可替尼处理后的转录组动态变化及其机制 | 首次揭示了两种经典模型的异质性，并探讨了达可替尼在更广泛患者群体中的转化潜力 | NA | 研究A549细胞和A549异种移植模型在达可替尼处理后的生物学和分子特征及其转录组动态变化 | A549细胞和A549异种移植模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 418 | 2024-08-05 |
Microbial stimulation of oxytocin release from the intestinal epithelium via secretin signaling
2023-12, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2023.2256043
PMID:37698879
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研究论文 | 本文报告了肠上皮细胞中通过促胆囊收缩素信号通路刺激催产素释放的过程 | 揭示了肠道微生物促进催产素分泌的机制，并确定催产素作为肠道激素 | 研究的具体适应症和在体内其他途径的影响尚不明确 | 探讨肠道微生物与催产素分泌之间的关系 | 人类肠道组织及其类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 人类和小鼠肠道组织 |
| 419 | 2024-08-05 |
Microfluidic-based technologies in cancer liquid biopsy: Unveiling the role of horizontal gene transfer (HGT) materials
2023-12-01, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2023.117083
PMID:37690629
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综述 | 该文审视了微流体技术在癌症液体活检中横向基因转移材料的作用 | 提出了微流体技术与癌症液体活检中横向基因转移材料研究的结合，提供了高灵敏度和快速分析的优势 | 对微流体技术应用于HGT研究的挑战和机会进行了讨论，但未提供具体的实验数据支持 | 旨在探讨微流体技术在癌症液体活检中对横向基因转移的影响 | 关注癌细胞及其周围基质细胞之间的基因材料转移 | 数字病理学 | 癌症 | 微流体技术 | NA | 生物样本 | NA |
| 420 | 2024-08-07 |
Corrigendum to "Single-cell RNA sequencing of mouse lower respiratory tract epithelial cells: A meta-analysis" [Cells Dev. 174C (2023) 203847]
2023-Dec, Cells & development
IF:2.1Q3
DOI:10.1016/j.cdev.2023.203877
PMID:37699263
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |