单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 438 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing in pancreatic cancer research: A deeper understanding of heterogeneity and therapy
2023-Dec, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.115664
PMID:37837881
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评论 | 该文章概述了单细胞测序技术在胰腺癌研究中的应用 | 介绍了单细胞测序在探讨肿瘤微环境、治疗抵抗和新疗法中的潜力 | 无 | 提供对胰腺癌精确治疗潜力的新见解 | 胰腺导管腺癌及其异质性研究 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 382 | 2024-08-05 |
PLK1 regulating chemoradiotherapy sensitivity of esophageal squamous cell carcinoma through pentose phosphate pathway/ferroptosis
2023-Dec, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.115711
PMID:37879213
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研究论文 | 本研究探讨了PLK1如何通过五碳磷酸途径和铁死亡调节食管鳞状细胞癌（ESCC）对化疗放疗的敏感性 | 本研究首次揭示了PLK1在ESCC中的作用机制，特别是在铁死亡和五碳磷酸途径的调节方面 | 研究主要集中在细胞系模型上，尚未在大规模临床样本中验证 | 探索PLK1对食管鳞状细胞癌化疗放疗敏感性的影响 | 研究对象为食管鳞状细胞癌细胞系KYSE150和ECA109 | 数字病理学 | 食管癌 | CRISPR/Cas9、流式细胞术、转录电子显微镜、CCK-8测定 | NA | 细胞实验数据、单细胞测序数据 | 超过300个ESCC病例来自GEO数据库和本中心 |
| 383 | 2024-08-07 |
Machine learning- and WGCNA-mediated double analysis based on genes associated with disulfidptosis, cuproptosis and ferroptosis for the construction and validation of the prognostic model for breast cancer
2023-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05378-7
PMID:37712959
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研究论文 | 本研究通过机器学习和加权基因共表达网络分析（WGCNA）的双重分析，基于与二硫化物死亡、铜死亡和铁死亡相关的基因，构建并验证了乳腺癌的预后模型。 | 首次整合二硫化物死亡相关基因（DRGs）、铜死亡相关基因（CRGs）和铁死亡相关基因（FRGs）来构建乳腺癌的预后特征。 | NA | 开发基于DRGs、CRGs和FRGs的乳腺癌临床预后工具和免疫治疗方案。 | 乳腺癌的预后模型及其在肿瘤微环境中的作用。 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序分析 | Lasso-Cox分析 | 基因表达数据 | 内部训练集和验证集来自TCGA-BRCA数据库，外部验证集包括GSE20685和GSE42568。 |
| 384 | 2024-08-07 |
Early life adversity shapes social subordination and cell type-specific transcriptomic patterning in the ventral hippocampus
2023-12, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj3793
PMID:38039370
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研究论文 | 本研究探讨了早期生活逆境（ELA）对小鼠社会从属地位及海马腹侧特定细胞类型转录组模式的影响 | 首次揭示了ELA导致小鼠社会从属地位的细胞类型特异性脆弱性，并通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）识别了海马腹侧谷氨酸能和GABA能神经元在转录状态上的特定变化 | NA | 探究早期生活逆境对成年后应激反应及精神疾病风险的分子机制 | 小鼠的早期生活逆境及其对社会从属地位和细胞类型特异性转录组模式的影响 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 385 | 2024-08-07 |
A Comparative Study of Endoderm Differentiation Between Activin A and Small Molecules
2023-Dec, Experimental and clinical endocrinology & diabetes : official journal, German Society of Endocrinology [and] German Diabetes Association
IF:1.6Q4
DOI:10.1055/a-2182-8936
PMID:38056491
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研究论文 | 本研究比较了Activin A和小分子化合物在诱导内胚层分化中的效果 | 发现CHIR99021能有效促进内胚层分化，且IDE1和CHIR99021的协同作用下，实验细胞中有43.4%为SOX17阳性 | IDE1和CHIR99021协同作用下内胚层分化的能力仍不足 | 验证小分子化合物对内胚层分化的促进作用 | 内胚层分化 | NA | NA | Western blot分析，单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 实验涉及的细胞数量未明确提及 |
| 386 | 2024-08-05 |
Vimentin promotes glioma progression and maintains glioma cell resistance to oxidative phosphorylation inhibition
2023-Dec, Cellular oncology (Dordrecht)
DOI:10.1007/s13402-023-00844-3
PMID:37646965
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研究论文 | 本研究探讨了粘附蛋白VIM在胶质瘤进展及其对氧化磷酸化抑制的耐药性中的作用 | 揭示了VIM在胶质瘤细胞中的高表达与氧化磷酸化抑制耐药性之间的关系 | 该研究主要依赖于生物信息学数据和细胞实验，缺乏临床试验验证 | 研究VIM在胶质瘤中的作用，尤其是在氧化磷酸化抑制敏感性方面 | 黏附蛋白VIM及其在胶质瘤细胞中的表达与功能 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA测序，单细胞测序，DNA甲基化分析 | NA | 基因表达数据 | 从TCGA数据库获取胶质瘤患者和正常样本的数据进行分析 |
| 387 | 2024-08-07 |
Meta-Analysis of COVID-19 BAL Single-Cell RNA Sequencing Reveals Alveolar Epithelial Transitions and Unique Alveolar Epithelial Cell Fates
2023-12, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0077OC
PMID:37523502
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meta-分析 | 本研究对COVID-19患者的BAL单细胞RNA测序数据进行meta分析，揭示了肺泡上皮细胞的转变和独特的肺泡上皮细胞命运 | 发现了先前未描述的肺泡上皮细胞I型状态，并确认了SPRR3在COVID-19中的上调 | 研究受限于小规模患者队列 | 通过meta分析探讨COVID-19中BAL单细胞RNA测序数据的特征 | COVID-19患者的BAL细胞 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 167,280个高质量细胞，来自13名健康对照和20名COVID-19患者 |
| 388 | 2024-08-07 |
Molecular subtyping and characterization of clear cell renal cell carcinoma by tumor differentiation trajectories
2023-Dec-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108370
PMID:38034348
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序数据，对透明细胞肾细胞癌进行分子亚型分类和特征分析 | 利用单细胞RNA测序技术，将透明细胞肾细胞癌细胞分为三个具有不同分子特征的亚群，并探讨了它们与治疗反应的关系 | NA | 深入理解透明细胞肾细胞癌的发病机制，并为基于分子亚型分析的优化治疗方案提供线索 | 透明细胞肾细胞癌的分子亚型及其特征 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 11个原发性透明细胞肾细胞癌样本 |
| 389 | 2024-08-07 |
Development of a prognostic model to predict BLCA based on anoikis-related gene signature: preliminary findings
2023-Dec-04, BMC urology
IF:1.7Q3
DOI:10.1186/s12894-023-01382-8
PMID:38049825
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研究论文 | 本研究开发了一种基于anoikis相关基因签名的预测膀胱尿路上皮癌（BLCA）的预后模型 | 利用单细胞RNA测序技术，通过多变量Cox回归分析和风险评分模型，量化评估基因签名的预测能力 | NA | 提高膀胱尿路上皮癌患者的生存率 | 膀胱尿路上皮癌及其anoikis相关基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 数据来自TCGA和GEO数据库，具体样本数量未在摘要中明确 |
| 390 | 2024-08-05 |
Discovery of a novel lipid metabolism-related gene signature to predict outcomes and the tumor immune microenvironment in gastric cancer by integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing
2023-Dec-02, Lipids in health and disease
IF:3.9Q2
DOI:10.1186/s12944-023-01977-y
PMID:38042786
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和大规模RNA测序，发现了一种新的脂质代谢相关基因特征以预测胃癌的结果和肿瘤免疫微环境 | 本文创新性地识别了258个与生存相关的差异表达脂质代谢相关基因，并开发了基于GPX3和NNMT的预测风险评分 | 研究可能受到样本大小和选择偏差的限制 | 本研究旨在发现胃癌的预测标志并研究其与肿瘤免疫微环境的相关性 | 研究对象为胃癌患者的转录组数据及临床信息 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA-seq | LASSO回归 | 基因组数据 | 来源于TCGA和GSE84437数据集的GC样本 |
| 391 | 2024-08-05 |
MLKL deficiency alleviates neuroinflammation and motor deficits in the α-synuclein transgenic mouse model of Parkinson's disease
2023-Dec-01, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-023-00686-5
PMID:38041169
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研究论文 | 本研究探讨了MLKL缺失对帕金森病小鼠模型中的神经炎症和运动缺陷的影响 | 揭示了MLKL在帕金森病中的神经保护作用，并指出其作为潜在治疗靶点的重要性 | 未具体阐明MLKL在PD其他机制中的作用 | 研究MLKL缺失对帕金森病模型小鼠的影响 | 使用MLKL缺失的小鼠模型（Tg-Mlkl）进行研究 | 神经科学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据 | 包括多个Tg-Mlkl小鼠及经典A53T转基因小鼠的样本 |
| 392 | 2024-08-05 |
Glucose transporter 3 (GLUT3) promotes lactylation modifications by regulating lactate dehydrogenase A (LDHA) in gastric cancer
2023-Dec-01, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-023-03162-8
PMID:38041125
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研究论文 | 这项研究探讨了GLUT3在胃癌中通过调节LDHA促进乳酸化修饰的作用 | 研究首次揭示了GLUT3和组蛋白乳酸化之间的关系，提出GLUT3作为胃癌的新诊断标志物和治疗靶点 | 研究主要依赖于细胞系和动物模型，临床验证不足 | 调查GLUT3与胃癌发生发展中组蛋白乳酸化的关系 | 主要肿瘤、肿瘤旁正常组织及转移肿瘤组织中的GLUT3和LDHA表达 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序、免疫组化、转筛和划痕实验、西方印迹 | NA | 细胞和组织样本 | 包括初级肿瘤、肿瘤旁正常组织和转移肿瘤组织的样本 |
| 393 | 2024-08-05 |
Predictive and prognostic biomarkers of bone metastasis in breast cancer: current status and future directions
2023-Dec-01, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-023-01171-8
PMID:38041134
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综述 | 本文回顾了乳腺癌骨转移的流行病学、诊断工具和治疗方法，并讨论了几个具有预测和预后价值的生物标志物 | 提出了一些新生物标志物，特别适合与液体活检结合，具有临床应用潜力 | 没有明确提到具体的实验数据和样本分析 | 探讨乳腺癌骨转移的生物标志物及其临床应用前景 | 以乳腺癌骨转移的生物标志物为研究对象 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序，类器官模型 | 动物模型 | NA | NA |
| 394 | 2024-08-05 |
Transformation of non-neuritic into neuritic plaques during AD progression drives cortical spread of tau pathology via regenerative failure
2023-12-01, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-023-01688-6
PMID:38037144
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研究论文 | 该文章探讨了非神经性淀粉样斑块在阿尔茨海默病进展中的转变如何通过再生失败驱动tau病理的皮层传播 | 文章提出非神经性斑块向神经性斑块的转变是阿尔茨海默病进展中的关键事件，并暗示再生失败可能是这一过程的驱动因素 | 研究主要基于尸检样本，可能存在样本偏倚以及区域特异性的差异 | 旨在揭示阿尔茨海默病中淀粉样蛋白和tau蛋白的相互作用机制 | 研究对象为阿尔茨海默病患者的尸检脑标本 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 脑标本 | 来自阿尔茨海默病患者的尸检脑样本，具体数量不详 |
| 395 | 2024-08-05 |
Urinary single-cell sequence analysis of the urinary macrophage in different outcomes of membranous nephropathy
2023-Dec, Clinical kidney journal
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/ckj/sfad132
PMID:38046013
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研究论文 | 本研究分析了不同结果的膜性肾病患者尿液中的单细胞序列。 | 首次描绘了健康个体与膜性肾病患者在尿液细胞图谱上的差异。 | 样本量较小，仅限于12名健康对照和15名膜性肾病患者。 | 研究膜性肾病不同结果的机制。 | 分析了12名健康对照和15名膜性肾病患者的尿液细胞。 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 27个样本（12名健康对照和15名膜性肾病患者） |
| 396 | 2024-08-05 |
scPipe: an extended preprocessing pipeline for comprehensive single-cell ATAC-Seq data integration in R/Bioconductor
2023-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqad105
PMID:38046273
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研究论文 | scPipe是一个灵活的R/Bioconductor软件包，用于分析单细胞ATAC-Seq数据。 | 扩展了scPipe的预处理能力，以处理新的单细胞技术，包括单细胞ATAC-Seq和多模态数据。 | NA | 旨在提供一个全面的单细胞ATAC-Seq数据预处理流程。 | 单细胞ATAC-Seq数据。 | 数字病理学 | NA | ATAC-Seq | NA | 计数矩阵 | NA |
| 397 | 2024-08-07 |
Unraveling FOXO3a and USP18 Functions in Idiopathic Pulmonary Fibrosis through Single-Cell RNA Sequencing of Mouse and Human Lungs
2023-Dec, Global medical genetics
IF:1.2Q4
DOI:10.1055/s-0043-1776697
PMID:38025194
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了FOXO3a和USP18在特发性肺纤维化中的作用及其对成纤维细胞功能的影响 | 揭示了FOXO3a和USP18在成纤维细胞中的协同失调对特发性肺纤维化的病理改变的重要贡献，为该疾病的治疗提供了新的潜在途径 | NA | 阐明FOXO3a和USP18在特发性肺纤维化中的作用，探索其对成纤维细胞功能的调控机制 | FOXO3a和USP18在特发性肺纤维化中的作用及其对成纤维细胞功能的影响 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及小鼠和人类的肺部样本 |
| 398 | 2024-08-07 |
Molecular characteristics of circulating B cells and kidney cells at the single-cell level in special types of primary membranous nephropathy
2023-Dec, Clinical kidney journal
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/ckj/sfad215
PMID:38046035
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和单细胞B细胞受体测序，分析了特定类型原发性膜性肾病（pMN）患者循环B细胞和肾细胞的分子特征 | 发现了NEG患者中CD38+幼稚B细胞的扩增及其激活功能特征，以及免疫球蛋白M/D与IgG1之间的转换增加 | 研究仅基于一名NEG pMN患儿的样本，可能存在样本量不足的问题 | 揭示特定类型原发性膜性肾病患者循环B细胞和肾细胞的细胞类型特异性分子特征 | 特定类型原发性膜性肾病患者的循环B细胞和肾细胞 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞转录组测序，单细胞B细胞受体测序 | NA | 单细胞数据 | 一名NEG pMN患儿及POS患者和健康对照个体的单细胞数据 |
| 399 | 2024-08-05 |
The role of LSM1 in breast cancer: Shaping metabolism and tumor-associated macrophage infiltration
2023-Dec, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2023.107008
PMID:37995895
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研究论文 | 本研究探讨了LSM1在乳腺癌中的角色，尤其是在代谢和肿瘤相关巨噬细胞浸润方面 | 发现LSM1作为晚期乳腺癌的诊断标志物，并揭示其与免疫细胞和能量代谢的联系 | 需要进一步研究以确认LSM1在乳腺癌临床病理和精确肿瘤学中的潜力 | 探讨LSM1在乳腺癌进展中的角色及其作为潜在诊断和预后标志物的可能性 | 研究对象为乳腺癌及其相关的免疫微环境和代谢变化 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学和单细胞RNA测序 | NA | 组织活检样本和组织微阵列 | 54例乳腺癌患者的活检 |
| 400 | 2024-08-05 |
How single-cell transcriptomics provides insight on hepatic responses to TCDD
2023-Dec, Current opinion in toxicology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.cotox.2023.100441
PMID:37981901
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综述 | 本研究探讨了单细胞转录组学技术在研究TCDD对肝脏反应中的应用 | 文章创新性地运用了单细胞转录组学技术提供了对TCDD诱导的肝脏疾病特异性机制的新认识 | NA | 研究TCDD诱导的肝脏反应及其机制 | 肝细胞及其对TCDD暴露的反应 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单核RNA测序(snRNAseq)、空间转录组学(STx) | NA | NA | NA |