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当前共找到 436 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-11-15 |
Epicardioid single-cell genomics uncovers principles of human epicardium biology in heart development and disease
2023-12, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01718-7
PMID:37012447
|
研究论文 | 本研究通过人类多能干细胞衍生的心外膜类器官揭示人类心外膜在心脏发育和疾病中的生物学原理 | 开发了自组织人类多能干细胞衍生的心外膜类器官模型，首次实现了左心室壁典型的心外膜和心肌形态、分子和功能模式 | 类器官模型可能无法完全模拟体内真实心脏环境的复杂性 | 探索人类心外膜在心脏发育和疾病中的生物学功能和作用机制 | 人类多能干细胞衍生的心外膜类器官 | 单细胞基因组学 | 心脏疾病 | 谱系追踪, 单细胞转录组测序, 染色质可及性分析 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 22 | 2025-11-15 |
SEACells infers transcriptional and epigenomic cellular states from single-cell genomics data
2023-12, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01716-9
PMID:36973557
|
研究论文 | 提出SEACells算法，可从单细胞基因组学数据中推断转录和表观基因组细胞状态 | 克服单细胞数据稀疏性，同时保留传统细胞聚类所掩盖的异质性 | NA | 从单细胞测序数据中识别代表高度细粒度细胞状态的元细胞 | 单细胞RNA和ATAC测序数据 | 单细胞基因组学 | COVID-19, 造血系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | SEACells算法 | 单细胞基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 23 | 2025-11-15 |
Multimodal spatiotemporal phenotyping of human retinal organoid development
2023-12, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01747-2
PMID:37156914
|
研究论文 | 本研究通过多模态时空表型分析探索人类视网膜类器官发育过程 | 开发了可视化工具包整合多组学数据，构建了首个整合空间分割细胞核的多模态视网膜类器官发育图谱 | NA | 研究人类视网膜类器官发育过程中的空间尺度和分子模态特征 | 人类多能干细胞生成的视网膜类器官和原代成人视网膜组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序,染色质可及性测序,多重蛋白成像 | 基因调控网络 | 空间蛋白质组数据,单细胞转录组数据,表观基因组数据 | 视网膜类器官时间序列样本和原代成人视网膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq,空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 24 | 2025-11-15 |
Genomic and immune signatures predict clinical outcome in newly diagnosed multiple myeloma treated with immunotherapy regimens
2023-12, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-023-00657-1
PMID:37945755
|
研究论文 | 本研究通过整合肿瘤全基因组和微环境单细胞RNA测序数据，揭示了基因组驱动因素和免疫特征对新诊断多发性骨髓瘤患者免疫治疗临床结局的预测价值 | 首次在包含达雷妥尤单抗的免疫治疗方案中，系统整合肿瘤基因组与微环境单细胞测序数据，发现APOBEC突变活性、特定基因缺失和免疫细胞动态变化对治疗反应的预测作用 | 研究基于二期临床试验数据，样本量有限，需要更大规模验证 | 探索影响新诊断多发性骨髓瘤患者接受含达雷妥尤单抗免疫治疗方案临床结局的预测因素 | 新诊断的多发性骨髓瘤患者 | 基因组学 | 多发性骨髓瘤 | 全基因组测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 二期临床试验患者队列 | NA | 全基因组测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2025-11-15 |
Microglia promote anti-tumour immunity and suppress breast cancer brain metastasis
2023-12, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-023-01273-y
PMID:37957324
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基因工程小鼠模型揭示了小胶质细胞在乳腺癌脑转移中发挥促炎和抑瘤作用 | 首次明确区分小胶质细胞与其他肿瘤相关巨噬细胞，并发现其在脑转移中独特的免疫促进作用 | 小胶质细胞与其他巨噬细胞的区分在技术上具有挑战性 | 探究小胶质细胞在乳腺癌脑转移中的免疫调节作用 | 小鼠模型和人类小胶质细胞 | 单细胞生物学 | 乳腺癌脑转移 | 单细胞RNA测序，基因工程小鼠模型 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2025-11-14 |
Clonally expanded memory CD8+ T cells accumulate in atherosclerotic plaques and are pro-atherogenic in aged mice
2023-12, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-023-00515-w
PMID:37996758
|
研究论文 | 本研究揭示了衰老过程中记忆CD8+ T细胞在动脉粥样硬化斑块中的克隆性扩增及其促动脉粥样硬化作用 | 首次发现衰老相关的记忆CD8+ T细胞亚群在动脉粥样硬化斑块中克隆性扩增并具有促动脉粥样硬化功能 | 研究仅使用雌性小鼠，未涉及雄性动物模型 | 探究衰老对CD8 T细胞在动脉粥样硬化发生过程中的作用机制 | 年轻和年老雌性小鼠的CD8 T细胞及动脉粥样硬化斑块 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，适应性转移实验，细胞清除实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和年老雌性小鼠群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2025-10-15 |
Differential detection workflows for multi-sample single-cell RNA-seq data
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.17.572043
PMID:38187695
|
研究论文 | 开发用于单细胞转录组数据中差异检测分析的工作流程 | 提出差异检测(DD)概念，关注基因在样本或细胞中被检测到的平均比例差异，而非传统差异基因表达(DE)的平均表达量差异 | NA | 建立联合评估差异基因表达和差异检测的统一工作流程 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2025-10-05 |
Atypical B cells consist of subsets with distinct functional profiles
2023-Dec-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108496
PMID:38098745
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术识别了非典型B细胞中三个功能各异的亚群 | 首次在慢性疟疾暴露人群中鉴定出三个具有不同转录和功能特征的非典型B细胞新亚群 | 研究聚焦于疟疾慢性感染人群，结果可能不适用于其他免疫激活状态 | 阐明非典型B细胞在人类适应性免疫应答中的具体作用 | 慢性疟疾寄生虫暴露个体的非典型B细胞 | 单细胞生物学 | 疟疾 | 单细胞测序 | NA | 转录组、细胞表面标志物、B细胞受体 | 慢性疟疾暴露个体（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2025-10-05 |
A high-throughput single-cell RNA expression profiling method identifies human pericyte markers
2023-12, Neuropathology and applied neurobiology
IF:4.0Q1
DOI:10.1111/nan.12942
PMID:37812061
|
研究论文 | 通过高通量单细胞RNA测序方法鉴定人脑周细胞特异性标志物 | 首次使用EasySci单细胞转录组测序技术系统鉴定人脑周细胞特异性基因标志物SLC6A12和SLC19A1 | 在其他人体器官（肾、肺、肝、肌肉）中未观察到相同的周细胞染色模式，组织特异性较强 | 鉴定和优化人脑周细胞的通用组织学标志物 | 人和小鼠不同脑区的周细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 免疫印迹 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 多个人和小鼠脑区样本，以及肾、肺、肝、肌肉等器官探索性样本 | NA | 单细胞RNA-seq | EasySci | 高通量低成本单细胞转录组测序方法 |
| 30 | 2025-10-05 |
Deep scRNA sequencing reveals a broadly applicable Regeneration Classifier and implicates antioxidant response in corticospinal axon regeneration
2023-12-20, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.09.019
PMID:37848024
|
研究论文 | 通过深度单细胞RNA测序揭示了一个广泛适用的再生分类器，并证明抗氧化反应在皮质脊髓轴突再生中的重要作用 | 开发了可广泛应用的再生分类器，首次发现抗氧化反应和线粒体生物合成在皮质脊髓轴突再生中的关键作用 | 仅对数百个表型鉴定的神经元进行测序，样本规模有限 | 研究中枢神经系统轴突再生的分子机制，特别是皮质脊髓束的再生潜力 | 皮质脊髓束神经元，特别是在PTEN和SOCS3缺失后的再生神经元 | 单细胞基因组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | 监督分类(Garnett) | 单细胞转录组数据 | 数百个表型鉴定的神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基于patch的单细胞RNA测序 |
| 31 | 2025-10-05 |
Brain-wide correspondence of neuronal epigenomics and distant projections
2023-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06823-w
PMID:38092919
|
研究论文 | 通过epi-retro-seq技术将小鼠全脑33,034个神经元的表观基因组与远距离投射联系起来 | 首次在全脑范围内将单细胞表观基因组与神经元远距离投射特征进行系统关联 | 研究仅限于小鼠模型，样本来源区域划分可能不够精细 | 解析神经元表观基因组特征与远距离投射功能之间的关系 | 小鼠全脑33,034个神经元，涉及32个脑区向24个靶区的225种投射组合 | 神经科学 | NA | epi-retro-seq, 空间转录组学 | NA | 表观基因组数据, 转录组数据, 空间定位数据 | 33,034个神经元，32个脑区，24个投射靶区 | NA | 单细胞表观基因组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 32 | 2025-10-05 |
Single-cell DNA methylome and 3D multi-omic atlas of the adult mouse brain
2023-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06805-y
PMID:38092913
|
研究论文 | 本研究构建了成年小鼠大脑的单细胞DNA甲基组和3D多组学图谱 | 首次在空间背景下生成全脑单细胞甲基组和染色质构象联合图谱，识别了4673个细胞群和274个跨模态注释亚类 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类或其他物种 | 构建大脑细胞类型及其基因调控景观的完整分子图谱 | 成年小鼠大脑117个解剖区域的细胞 | 表观基因组学 | 神经系统疾病 | 单核甲基组测序(snmC-seq3), 多组学测序(snm3C-seq), 空间转录组学 | NA | 甲基组数据, 染色质构象数据, 转录组数据 | 301,626个甲基组和176,003个染色质构象-甲基组联合图谱 | NA | 单细胞甲基组测序, 单细胞多组学测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 33 | 2025-10-05 |
The molecular cytoarchitecture of the adult mouse brain
2023-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06818-7
PMID:38092915
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组数据构建成年小鼠大脑细胞类型综合图谱 | 首次将高通量单核RNA测序与近细胞分辨率的Slide-seq空间转录组技术相结合，系统绘制全脑细胞类型图谱 | 研究仅限于小鼠模型，人类大脑的细胞架构可能存在差异 | 构建哺乳动物大脑细胞类型的综合空间图谱 | 成年小鼠大脑 | 空间转录组学 | 神经系统疾病 | 单核RNA测序, Slide-seq空间转录组 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 全脑范围样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Slide-seq | 近细胞分辨率的空间转录组方法 |
| 34 | 2025-10-05 |
Molecularly defined and spatially resolved cell atlas of the whole mouse brain
2023-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06808-9
PMID:38092912
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研究论文 | 本研究通过整合空间分辨单细胞转录组技术，构建了首个全小鼠大脑的高分辨率分子定义细胞图谱 | 首次实现了全脑范围的单细胞空间转录组分析，整合了MERFISH和scRNA-seq数据，系统鉴定了5,000多个转录 distinct 细胞簇和300多种主要细胞类型 | 研究仅针对成年小鼠大脑，人类大脑的复杂性可能有所不同；技术方法可能对某些低表达基因检测灵敏度有限 | 构建全脑范围的分子定义细胞空间图谱，解析大脑细胞类型组成和空间组织规律 | 成年小鼠全脑约1,000万个细胞 | 空间转录组学 | 神经系统疾病 | 多重误差鲁棒荧光原位杂交，单细胞RNA测序 | NA | 空间基因表达数据，单细胞转录组数据 | 约1,000万个细胞，覆盖整个成年小鼠大脑 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 整合MERFISH和scRNA-seq技术的空间分辨单细胞表达谱分析 |
| 35 | 2025-10-05 |
Differences in cell shape, motility, and growth reflect chromosomal number variations that can be visualized with live-cell ChReporters
2023-12-01, Molecular biology of the cell
IF:3.1Q3
DOI:10.1091/mbc.E23-06-0207
PMID:37903225
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研究论文 | 利用活细胞染色体报告系统研究染色体数目变化对细胞形态、运动和生长的影响 | 开发了活细胞'ChReporter'方法，可实时识别单个染色体缺失的细胞，并揭示染色体数目变化与细胞机械表型的关系 | 染色体报告系统阳性克隆的机械表型-基因型关系较为复杂，研究主要集中于标准癌细胞系 | 理解染色体数目变化如何影响细胞形态、运动能力和生长特性 | 标准癌细胞系及其克隆种群 | 细胞生物学 | 癌症 | 活细胞成像, 单细胞RNA测序, 药物反应测试 | NA | 图像, 基因表达数据, 药物反应数据 | 标准癌细胞系及其克隆种群 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2025-10-05 |
A high-resolution transcriptomic and spatial atlas of cell types in the whole mouse brain
2023-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06812-z
PMID:38092916
|
研究论文 | 构建了成年小鼠全脑的高分辨率转录组和空间细胞类型图谱 | 结合700万单细胞RNA测序和430万细胞空间转录组数据，创建了包含5,322个细胞簇的层次分类系统 | 研究仅限于成年小鼠脑部，未涉及其他发育阶段或物种 | 建立哺乳动物大脑细胞类型的综合参考图谱 | 成年小鼠全脑细胞 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, MERFISH | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | 约700万细胞（400万通过质控）scRNA-seq，430万细胞MERFISH | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 多重误差鲁棒荧光原位杂交(MERFISH) |
| 37 | 2025-10-05 |
Predicting the Structural Impact of Human Alternative Splicing
2023-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.21.572928
PMID:38187531
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研究论文 | 本研究使用AlphaFold2预测了超过11,000种人类剪接异构体的结构，系统分析了选择性剪接对蛋白质结构的影响 | 首次大规模预测人类剪接异构体的三维结构，并系统分析剪接变异对结构特征和功能的影响 | 仅基于计算预测，缺乏实验验证；分析范围限于已知的剪接异构体 | 探究选择性剪接对蛋白质结构的影响及其功能意义 | 人类蛋白质剪接异构体 | 计算生物学 | NA | 蛋白质结构预测，单细胞RNA测序 | AlphaFold2 | 蛋白质序列，单细胞RNA-seq数据 | 超过11,000种人类剪接异构体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | Tabula Sapiens项目的单细胞RNA-seq数据 |
| 38 | 2025-10-05 |
Probabilistic cell/domain-type assignment of spatial transcriptomics data with SpatialAnno
2023-12-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1023
PMID:37941153
|
研究论文 | 提出一种名为SpatialAnno的空间转录组数据注释方法，能够有效利用非标记基因和标记基因的定性信息 | 通过因子模型估计非标记基因的低维嵌入，同时利用Potts模型促进相邻点间的空间平滑性，无需参考数据集 | NA | 开发空间转录组数据的细胞/区域类型注释方法 | 空间转录组数据中的细胞/点 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | 因子模型, Potts模型 | 空间转录组数据 | 模拟数据和4个真实数据集 | 10x Genomics, ST, Slide-seq, seqFISH | 空间转录组学 | 10x Visium, ST, Slide-seqV1/2, seqFISH | 10x Visium平台, ST平台, Slide-seqV1/2平台, seqFISH平台 |
| 39 | 2025-10-05 |
Anterior Pituitary Transcriptomics Following a High-Fat Diet: Impact of Oxidative Stress on Cell Metabolism
2023-12-23, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad191
PMID:38103263
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析高脂饮食对小鼠垂体转录组的影响，揭示性别差异在氧化应激反应中的作用 | 首次在热中性环境中结合高脂饮食和单细胞转录组学分析垂体细胞对肥胖应激的性别特异性反应 | 研究仅使用FVB.129P小鼠品系，结果可能不适用于其他遗传背景 | 探究肥胖引起的氧化应激对垂体细胞功能的性别特异性影响 | FVB.129P品系雄性和雌性小鼠 | 单细胞转录组学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10-15周高脂饮食处理的雄性和雌性小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2025-10-05 |
Hyperactive mTORC1 in lung mesenchyme induces endothelial cell dysfunction and pulmonary vascular remodeling
2023-12-20, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI172116
PMID:38127441
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研究论文 | 本研究探讨了肺间质细胞中过度活跃的mTORC1如何通过旁分泌信号导致内皮细胞功能障碍和肺血管重塑 | 首次揭示了在淋巴管平滑肌瘤病中，间质细胞通过旁分泌信号传导机制与内皮细胞通讯并驱动血管重塑 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本有限且为终末期肺组织 | 阐明LAM疾病中肺间质细胞与内皮细胞之间的通讯机制及其在肺血管重塑中的作用 | 淋巴管平滑肌瘤病(LAM)患者肺组织和Tbx4LME-Cre Tsc2fl/fl基因工程小鼠 | 分子病理学 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 组织形态学数据 | 终末期LAM患者肺组织和不同年龄段的基因工程小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |