单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 436 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-08-07 |
Decreased oxidative stress response and oxidant detoxification of skin during aging
2023-Dec, Mechanisms of ageing and development
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.mad.2023.111878
PMID:37827221
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据和微阵列转录组数据，探讨了皮肤细胞在老化过程中氧化应激反应和抗氧化能力的改变，并寻找可能参与调控皮肤老化的氧化应激相关基因 | 首次详细分析了不同类型皮肤细胞在老化过程中的氧化应激反应和抗氧化能力的改变，并识别了可能的关键氧化应激相关基因 | NA | 探究皮肤细胞在老化过程中的氧化应激反应和抗氧化能力的改变及其相关基因 | 皮肤细胞及其氧化应激反应和抗氧化能力 | NA | 老年病 | 单细胞RNA测序, 微阵列转录组 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 362 | 2024-08-07 |
Integrated single cell transcriptome sequencing analysis reveals species-specific genes and molecular pathways for pig spermiogenesis
2023-Dec, Reproduction in domestic animals = Zuchthygiene
DOI:10.1111/rda.14493
PMID:37874861
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研究论文 | 本文通过综合睾丸单细胞RNA测序分析，比较了人类和猪的精子发生过程，特别是精子形成阶段，揭示了物种特异性的基因和分子通路 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了猪和人类的精子形成过程，识别了特定类型的精子细胞的标记基因和分子通路 | NA | 研究人类和猪的精子形成过程中特异性的基因和分子通路 | 人类和猪的精子形成过程 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 人类和猪的睾丸细胞被分为26个不同的组 |
| 363 | 2024-08-05 |
Visium spatial transcriptomics reveals intratumor heterogeneity and profiles of Gleason score progression in prostate cancer
2023-Dec-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108429
PMID:38077153
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研究论文 | 本研究利用Visium空间转录组学分析前列腺癌组织的转录组特征，揭示了肿瘤内异质性及Gleason评分的进展特征 | 首次通过空间转录组学系统分析前列腺癌不同Gleason评分的组织异质性和基因表达模式 | 样本数量较少，可能影响结果的普适性和可靠性 | 研究前列腺癌Gleason评分进展过程中的转录组表达模式 | 四个具有不同Gleason评分的前列腺癌组织样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 四个前列腺癌组织样本 |
| 364 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of the peripheral immune response in patients with influenza A virus infection
2023-Dec-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108507
PMID:38089584
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了流感A病毒感染患者外周血免疫反应的细胞亚型和分子特征 | 首次详细描述了流感A病毒感染患者中特定免疫细胞亚群的IFN-α诱导蛋白27（IFI27）的显著上调，并识别出与IFN信号相关的特定中性粒细胞亚群 | NA | 深入理解流感A病毒感染患者外周血免疫反应的细胞亚型和分子特征 | 流感A病毒感染患者的外周血免疫细胞 | 数字病理学 | 流感 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞全血（scWB） | 来自不同人群的单细胞全血样本 |
| 365 | 2024-08-07 |
Deciphering the role of immunoglobulin secreting malignant lineages in the invasive frontiers of small cell lung cancer by scRNA-seq and spatial transcriptomics analysis
2023-Dec-12, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00621-4
PMID:38081849
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 366 | 2024-08-05 |
Increased PAFAH1B3 was associated with poor prognosis and T-cell exhaustion microenvironment in hepatocellular carcinoma
2023-Dec-08, Discover. Oncology
DOI:10.1007/s12672-023-00845-6
PMID:38063949
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研究论文 | 这篇文章探讨了PAFAH1B3与肝细胞癌中的T细胞耗竭的关系。 | 提出PAFAH1B3是肝细胞癌患者预后不良的独立效应因子，并与肿瘤微环境中的T细胞耗竭密切相关。 | 可能未涵盖所有相关的生物标志物或者机制。 | 研究PAFAH1B3在肝细胞癌中的作用以及其与T细胞耗竭的关联。 | 肝细胞癌患者的临床样本和公共数据集中的肿瘤样本。 | 数字病理学 | 肝癌 | qRT-PCR, 免疫组化, 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 50对临床组织切片样本 |
| 367 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing in cancer research: discovering novel biomarkers and therapeutic targets for immune checkpoint blockade
2023-Dec-08, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-023-03158-4
PMID:38066642
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在癌症研究中的应用，特别是在发现免疫检查点阻断疗法的新生物标志物和治疗靶点方面 | 单细胞RNA测序技术能够揭示单个细胞的基因表达谱，有助于高分辨率地研究肿瘤微环境的异质性 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在免疫检查点阻断疗法中的应用，以发现新的生物标志物和治疗靶点 | 癌症患者的肿瘤微环境及其对免疫检查点阻断疗法的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 368 | 2024-08-07 |
Characterization of the cellular heterogeneity and bone regenerative potential of cultured human periosteal cells
2023-Dec, Regenerative therapy
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.reth.2023.11.006
PMID:38074190
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了培养的人骨膜细胞的细胞异质性及其骨再生潜力 | 首次揭示了培养的人骨膜细胞在不同培养区域的组成多样性及其不同的成骨能力 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术表征培养的人骨膜细胞的异质性，并研究其在体内的成骨潜力 | 培养的人骨膜细胞 | 细胞生物学 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了通过组织移植方法培养的人骨膜细胞，并在大鼠皮下植入模型中进行了实验 |
| 369 | 2024-08-05 |
IL-27 produced during acute malaria infection regulates Plasmodium-specific memory CD4+ T cells
2023-Dec-07, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202317713
PMID:37855243
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研究论文 | 该文章探讨了IL-27在急性疟疾感染中对特定CD4+ T细胞记忆的调节作用 | 文章揭示了IL-27如何抑制特定Th1记忆前体CD4 T细胞的发展，为疫苗研发提供了新的启示 | 没有提及实验的具体局限性 | 研究IL-27对急性疟疾感染中CD4 T细胞反应的影响 | 主要研究Plasmodium特异性CD4 T细胞的反应和功能 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | IL-27中和的鼠模型 |
| 370 | 2024-08-05 |
Ex vivo tissue perturbations coupled to single-cell RNA-seq reveal multilineage cell circuit dynamics in human lung fibrogenesis
2023-12-06, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adh0908
PMID:38055803
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和组织扰动揭示了人类肺纤维化中的多谱系细胞电路动态 | 本研究结合了人类精密切割肺片的细胞因子和药物扰动，以单细胞RNA测序为基础，首次证实了肺纤维化中多谱系细胞状态的动态变化 | 组织模型的构建和分析技术的局限性可能影响对肺纤维化机制的全面理解 | 探究人类肺组织中的再生和纤维化机制 | 研究对象主要是人类肺组织切片，以及不同阶段的肺纤维化患者组织 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织切片 | 涉及多个临床队列的肺纤维化患者组织 |
| 371 | 2024-08-05 |
Single-cell histone chaperones patterns guide intercellular communication of tumor microenvironment that contribute to breast cancer metastases
2023-Dec-06, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-023-03166-4
PMID:38057779
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研究论文 | 本研究探讨了组蛋白伴随蛋白在肿瘤微环境中的作用及其对乳腺癌转移的影响 | 首次揭示了组蛋白伴随蛋白主导的肿瘤微环境细胞间通讯对乳腺癌转移的贡献 | 未具体提及多种肿瘤微环境因素的交互作用 | 研究组蛋白伴随蛋白在乳腺癌转移中的作用及其机制 | 乳腺癌患者的肿瘤微环境细胞群 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 来自6名乳腺癌患者的样本 |
| 372 | 2024-08-07 |
Immune checkpoints are predominantly co-expressed by clonally expanded CD4+FoxP3+ intratumoral T-cells in primary human cancers
2023-Dec-06, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02897-6
PMID:38057799
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研究论文 | 本文通过多参数流式细胞术和单细胞RNA测序（scRNA-Seq）结合TCR测序，研究了原发性人类肿瘤中肿瘤浸润T细胞的免疫检查点蛋白表达情况 | 本文揭示了免疫检查点蛋白主要由肿瘤内克隆扩增的CD4+FoxP3+ T细胞共表达，这一发现有助于设计未来的新辅助癌症免疫治疗试验 | 本文的研究主要基于流式细胞术和scRNA-Seq技术，这些技术在评估免疫细胞亚群的膜蛋白表达方面可能不够敏感和特异 | 描述原发性实体瘤中肿瘤内T细胞的免疫检查点蛋白表达，以更好地设计新辅助癌症免疫治疗试验 | 原发性人类肿瘤中的肿瘤内T细胞 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术，单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 细胞 | 多种组织类型的原发性人类肿瘤样本 |
| 373 | 2024-08-05 |
Senescence-associated secretory phenotypes in mesenchymal cells contribute to cytotoxic immune response in oral lichen planus
2023-Dec-05, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-023-00400-5
PMID:38053160
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研究论文 | 这项研究提供了老年相关分泌表型在口腔扁平苔藓中对细胞毒性免疫反应的贡献的证据 | 首次证明了老年间充质细胞在口腔扁平苔藓中的积累对CD8+ T细胞和自然杀伤细胞的影响 | 该研究主要基于数据库分析，尚需进一步验证实验证明这些发现 | 探讨口腔扁平苔藓中老年相关分泌表型的作用及其对免疫反应的影响 | 口腔扁平苔藓患者的组织样本 | 数字病理学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | NA |
| 374 | 2024-08-07 |
Secretory GFP reconstitution labeling of neighboring cells interrogates cell-cell interactions in metastatic niches
2023-Dec-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43855-2
PMID:38052804
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研究论文 | 本文改进了一种基于绿色荧光蛋白（GFP）的遗传编码系统，开发了分泌型糖基磷脂酰肌醇锚定的重组激活蛋白，用于高效标记与癌细胞相邻并可能相互作用的组织驻留细胞。 | 开发了sGRAPHIC系统，用于在深部组织中高效标记与癌细胞相邻的组织驻留细胞，并利用单细胞RNA测序平台对其进行特征分析。 | NA | 揭示转移微环境中与癌细胞相互作用的组织驻留细胞的基因表达模式。 | 转移微环境中与癌细胞相互作用的组织驻留细胞。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 375 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing in pancreatic cancer research: A deeper understanding of heterogeneity and therapy
2023-Dec, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.115664
PMID:37837881
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评论 | 该文章概述了单细胞测序技术在胰腺癌研究中的应用 | 介绍了单细胞测序在探讨肿瘤微环境、治疗抵抗和新疗法中的潜力 | 无 | 提供对胰腺癌精确治疗潜力的新见解 | 胰腺导管腺癌及其异质性研究 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 376 | 2024-08-05 |
PLK1 regulating chemoradiotherapy sensitivity of esophageal squamous cell carcinoma through pentose phosphate pathway/ferroptosis
2023-Dec, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.115711
PMID:37879213
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研究论文 | 本研究探讨了PLK1如何通过五碳磷酸途径和铁死亡调节食管鳞状细胞癌（ESCC）对化疗放疗的敏感性 | 本研究首次揭示了PLK1在ESCC中的作用机制，特别是在铁死亡和五碳磷酸途径的调节方面 | 研究主要集中在细胞系模型上，尚未在大规模临床样本中验证 | 探索PLK1对食管鳞状细胞癌化疗放疗敏感性的影响 | 研究对象为食管鳞状细胞癌细胞系KYSE150和ECA109 | 数字病理学 | 食管癌 | CRISPR/Cas9、流式细胞术、转录电子显微镜、CCK-8测定 | NA | 细胞实验数据、单细胞测序数据 | 超过300个ESCC病例来自GEO数据库和本中心 |
| 377 | 2024-08-07 |
Machine learning- and WGCNA-mediated double analysis based on genes associated with disulfidptosis, cuproptosis and ferroptosis for the construction and validation of the prognostic model for breast cancer
2023-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05378-7
PMID:37712959
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研究论文 | 本研究通过机器学习和加权基因共表达网络分析（WGCNA）的双重分析，基于与二硫化物死亡、铜死亡和铁死亡相关的基因，构建并验证了乳腺癌的预后模型。 | 首次整合二硫化物死亡相关基因（DRGs）、铜死亡相关基因（CRGs）和铁死亡相关基因（FRGs）来构建乳腺癌的预后特征。 | NA | 开发基于DRGs、CRGs和FRGs的乳腺癌临床预后工具和免疫治疗方案。 | 乳腺癌的预后模型及其在肿瘤微环境中的作用。 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序分析 | Lasso-Cox分析 | 基因表达数据 | 内部训练集和验证集来自TCGA-BRCA数据库，外部验证集包括GSE20685和GSE42568。 |
| 378 | 2024-08-07 |
Early life adversity shapes social subordination and cell type-specific transcriptomic patterning in the ventral hippocampus
2023-12, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj3793
PMID:38039370
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研究论文 | 本研究探讨了早期生活逆境（ELA）对小鼠社会从属地位及海马腹侧特定细胞类型转录组模式的影响 | 首次揭示了ELA导致小鼠社会从属地位的细胞类型特异性脆弱性，并通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）识别了海马腹侧谷氨酸能和GABA能神经元在转录状态上的特定变化 | NA | 探究早期生活逆境对成年后应激反应及精神疾病风险的分子机制 | 小鼠的早期生活逆境及其对社会从属地位和细胞类型特异性转录组模式的影响 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 379 | 2024-08-07 |
A Comparative Study of Endoderm Differentiation Between Activin A and Small Molecules
2023-Dec, Experimental and clinical endocrinology & diabetes : official journal, German Society of Endocrinology [and] German Diabetes Association
IF:1.6Q4
DOI:10.1055/a-2182-8936
PMID:38056491
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研究论文 | 本研究比较了Activin A和小分子化合物在诱导内胚层分化中的效果 | 发现CHIR99021能有效促进内胚层分化，且IDE1和CHIR99021的协同作用下，实验细胞中有43.4%为SOX17阳性 | IDE1和CHIR99021协同作用下内胚层分化的能力仍不足 | 验证小分子化合物对内胚层分化的促进作用 | 内胚层分化 | NA | NA | Western blot分析，单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 实验涉及的细胞数量未明确提及 |
| 380 | 2024-08-05 |
Vimentin promotes glioma progression and maintains glioma cell resistance to oxidative phosphorylation inhibition
2023-Dec, Cellular oncology (Dordrecht)
DOI:10.1007/s13402-023-00844-3
PMID:37646965
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研究论文 | 本研究探讨了粘附蛋白VIM在胶质瘤进展及其对氧化磷酸化抑制的耐药性中的作用 | 揭示了VIM在胶质瘤细胞中的高表达与氧化磷酸化抑制耐药性之间的关系 | 该研究主要依赖于生物信息学数据和细胞实验，缺乏临床试验验证 | 研究VIM在胶质瘤中的作用，尤其是在氧化磷酸化抑制敏感性方面 | 黏附蛋白VIM及其在胶质瘤细胞中的表达与功能 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA测序，单细胞测序，DNA甲基化分析 | NA | 基因表达数据 | 从TCGA数据库获取胶质瘤患者和正常样本的数据进行分析 |