单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 436 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing data identifies B cell marker genes signature that predicts prognosis and analysis of immune checkpoints expression in head and neck squamous cell carcinoma
2023-Dec, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e22656
PMID:38125461
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，识别出B细胞标记基因签名，该签名能预测头颈鳞状细胞癌的预后及免疫检查点表达 | 首次通过单细胞RNA测序数据筛选出B细胞标记基因，并验证其在头颈鳞状细胞癌中的预后价值及对免疫治疗反应的潜在影响 | 研究仅限于头颈鳞状细胞癌，且免疫检查点表达与预后的统计学差异不显著 | 探索B细胞标记基因签名在头颈鳞状细胞癌中的预后价值及对免疫治疗反应的影响 | 头颈鳞状细胞癌患者的B细胞标记基因及免疫检查点表达 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 145个B细胞标记基因，TCGA数据集及四个独立数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 362 | 2024-08-07 |
Identification of hub genes based on integrated analysis of single-cell and microarray transcriptome in patients with pulmonary arterial hypertension
2023-Dec-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09892-3
PMID:38110868
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和微阵列转录组数据，识别肺动脉高压患者中的关键基因 | 发现了WDR43和GNL2作为肺动脉高压的新分子机制和潜在治疗靶点 | NA | 揭示肺动脉高压的分子机制和潜在治疗靶点 | 肺动脉高压患者 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），微阵列转录组 | NA | 转录组数据 | 3名健康捐赠者和3名肺动脉高压患者的细胞，共计41,472个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 363 | 2024-08-07 |
Large-scale single-cell RNA sequencing atlases of human immune cells across lifespan: Possibilities and challenges
2023-12, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202250222
PMID:36826421
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研究论文 | 本文探讨了大规模单细胞RNA测序技术在人类免疫细胞研究中的应用及其面临的挑战 | 介绍了多组学和空间基因组平台在单细胞RNA测序项目中的应用趋势 | 讨论了大规模数据生成、分析和再分析以及数据传播的挑战 | 评估大规模单细胞RNA测序技术在免疫学领域的进展和挑战 | 人类免疫细胞及其在不同生命阶段的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及人类胎儿和成人造血组织的大规模样本 | NA | NA | NA | NA |
| 364 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis of gingivo-buccal oral cancer reveals two dominant cellular programs
2023-Dec, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.15979
PMID:37792582
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析龈颊口癌，揭示了两种主导的细胞程序 | 识别了与口腔黏膜下纤维化相关的独特恶性细胞类型和基质细胞群的表型转变 | NA | 研究龈颊口癌中的细胞异质性 | 12名龈颊口癌患者的口腔肿瘤样本，其中3名患者同时存在口腔黏膜下纤维化 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 365 | 2024-08-07 |
The Notch1 signaling pathway directly modulates the human RANKL-induced osteoclastogenesis
2023-12-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-48615-2
PMID:38040752
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研究论文 | 本文研究了Notch1信号通路在人类RANKL诱导的破骨细胞生成中的直接调节作用 | 首次报道了Notch1信号通路在人类破骨细胞生成中的作用，并揭示了Notch1与IL-7R信号通路的相互作用 | NA | 探讨Notch1信号通路在人类破骨细胞生成中的作用及其机制 | 人类单核CD14细胞和破骨细胞前体 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和抗体序列（AbSeq）分析 | NA | 细胞表面标记物数据 | 从外周血单核细胞（PBMCs）中直接分离的人类单核CD14细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 366 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals rich pituitary-Immune interactions under systemic inflammation
2023-Dec, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002403
PMID:38109308
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠垂体在系统性炎症下的转录组特征，揭示了垂体与免疫系统的丰富相互作用 | 首次揭示了系统性炎症如何调控垂体激素产生细胞的转录组特征，并发现了非经典的生物活性分子Nptx2的产生和释放 | NA | 探究系统性炎症对垂体激素产生细胞转录组的影响及其与免疫系统的相互作用 | 小鼠垂体激素产生细胞在系统性炎症下的转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠垂体样本 | NA | NA | NA | NA |
| 367 | 2024-08-05 |
scInterpreter: a knowledge-regularized generative model for interpretably integrating scRNA-seq data
2023-Dec-16, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05579-4
PMID:38104057
|
研究论文 | 本研究提出了一种基于深度学习的可解释模型scInterpreter，用于整合和注释scRNA-seq数据。 | scInterpreter显著优于其他最新模型，并通过知识先验加速训练过程，同时提供可解释的细胞表示。 | 未提及具体的局限性 | 研究旨在提供一个有效且可解释的单细胞转录组数据整合工具。 | 本研究的对象为单细胞RNA-seq数据。 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 多个基准数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 368 | 2024-08-07 |
Bioinformatics identification of a T-cell-related signature for predicting prognosis and drug sensitivity in hepatocellular carcinoma
2023-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.12082
PMID:37935646
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法识别出与T细胞相关的预后和药物敏感性标志物，用于肝细胞癌的预测 | 开发了一种综合使用10种机器学习算法的T细胞相关预后标志物（TRPS），并验证了其在肝细胞癌中的独立风险因素作用 | NA | 开发和验证一种新的生物标志物，用于预测肝细胞癌患者的预后和药物敏感性 | 肝细胞癌患者及其T细胞相关的预后和药物敏感性 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | RNA序列数据 | 使用Cancer Genome Atlas队列中的7个T细胞相关标记物进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 369 | 2024-08-07 |
Empagliflozin targets Mfn1 and Opa1 to attenuate microglia-mediated neuroinflammation in retinal ischemia and reperfusion injury
2023-Dec-12, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-023-02982-9
PMID:38082266
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研究论文 | 本研究评估了抗糖尿病药物恩格列净（EMPA）在视网膜缺血再灌注损伤中的治疗效果，发现其通过调节Mfn1和Opa1基因表达来减轻由小胶质细胞介导的神经炎症 | 本研究首次揭示了EMPA通过下调NLRP3信号通路和上调线粒体融合相关基因Mfn1和Opa1的表达，来恢复线粒体动态平衡，从而减轻视网膜缺血再灌注损伤中的神经炎症 | NA | 评估EMPA在视网膜缺血再灌注损伤中的治疗效果 | 视网膜缺血再灌注损伤中的神经炎症和线粒体功能障碍 | NA | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠模型，体外实验使用BV2小胶质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 370 | 2024-08-05 |
SingleScan: a comprehensive resource for single-cell sequencing data processing and mining
2023-Dec-07, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05590-9
PMID:38062357
|
研究论文 | 本研究开发了一个名为SingleScan的在线资源，以便更便捷地获取单细胞测序方法和数据处理流程的详细信息 | 提供了分类的单细胞转录组/基因组分析工具和流程，并总结了单细胞数据分析的典型工作流程 | 尚未提及特定的实验验证或工具有效性的评估 | 旨在为研究人员提供一个便利用于单细胞测序数据处理的资源 | 该资源旨在帮助没有计算经验的研究人员进入单细胞测序领域 | 数字病理 | NA | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 371 | 2024-08-07 |
Gleaning Euglenozoa-specific DNA polymerases in public single-cell transcriptome data
2023-Dec, Protist
IF:1.9Q4
DOI:10.1016/j.protis.2023.125997
PMID:38039844
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研究论文 | 本研究从公共单细胞转录组数据中鉴定了16个新的家族A DNA聚合酶序列，并讨论了其在Euglenozoa门中的多样性和进化 | 利用单细胞转录组数据填补了Euglenozoa门中深层分支物种的家族A DNA聚合酶数据的空白 | NA | 探讨Euglenozoa门中家族A DNA聚合酶的多样性和进化 | Euglenozoa门中的家族A DNA聚合酶 | NA | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 33个吞噬性Euglenozoa和2个共生体 | NA | NA | NA | NA |
| 372 | 2024-08-07 |
A postmeiotically bifurcated roadmap of honeybee spermatogenesis marked by phylogenetically restricted genes
2023-Dec, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011081
PMID:38048317
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研究论文 | 本文通过蜜蜂（Apis mellifera）雄性3天和14天龄的睾丸单细胞RNA测序数据，揭示了蜜蜂精子发生过程中转录图谱的后减数分裂分支现象 | 发现了蜜蜂精子发生中后减数分裂的转录分支，以及小精子细胞（sSPT）中表达的膜翅目特异性基因和较高的突变负荷 | NA | 探究蜜蜂精子发生过程中后减数分裂的分子特征 | 蜜蜂的精子发生过程及其分子机制 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 3天和14天龄的蜜蜂雄性睾丸样本 | NA | NA | NA | NA |
| 373 | 2024-08-07 |
The role of single-cell RNA sequencing in cardiac tumour - a case report
2023-Dec, JPMA. The Journal of the Pakistan Medical Association
DOI:10.47391/JPMA.7776
PMID:38083933
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病例报告 | 本文报告了一例65岁女性心脏肿瘤患者的病例，通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析肿瘤性质 | 使用scRNA-seq技术分析心脏肿瘤的生长模式，有助于区分肿瘤的性质 | NA | 探讨单细胞RNA测序在心脏肿瘤中的应用 | 心脏肿瘤的细胞成分及相关的信号通路 | 数字病理学 | 心脏肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 一例心脏肿瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 374 | 2024-08-07 |
Spatial transcriptomics drives a new era in plant research
2023-Dec, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16437
PMID:37651723
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 375 | 2024-08-07 |
Targeted single-cell RNA sequencing analysis reveals metabolic reprogramming and the ferroptosis-resistant state in hematologic malignancies
2023-Dec, Cell biochemistry and function
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/cbf.3869
PMID:37823726
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）与靶向致癌基因面板，对急性髓系白血病进行转录组测序，揭示了血液恶性肿瘤中的代谢重编程和铁死亡抵抗状态 | 本研究克服了scRNA-seq在检测致癌突变方面的局限性，通过靶向方法识别了骨髓样本中每种细胞类型的致癌IDH1、IDH2和KRAS突变分布 | NA | 探讨血液恶性肿瘤中的代谢重编程和铁死亡抵抗状态的机制 | 急性髓系白血病患者的骨髓细胞 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 多个患者的骨髓样本 | NA | NA | NA | NA |
| 376 | 2024-08-07 |
Integrated single cell transcriptome sequencing analysis reveals species-specific genes and molecular pathways for pig spermiogenesis
2023-Dec, Reproduction in domestic animals = Zuchthygiene
DOI:10.1111/rda.14493
PMID:37874861
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研究论文 | 本文通过综合睾丸单细胞RNA测序分析，比较了人类和猪的精子发生过程，特别是精子形成阶段，揭示了物种特异性的基因和分子通路 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了猪和人类的精子形成过程，识别了特定类型的精子细胞的标记基因和分子通路 | NA | 研究人类和猪的精子形成过程中特异性的基因和分子通路 | 人类和猪的精子形成过程 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 人类和猪的睾丸细胞被分为26个不同的组 | NA | NA | NA | NA |
| 377 | 2024-08-05 |
Visium spatial transcriptomics reveals intratumor heterogeneity and profiles of Gleason score progression in prostate cancer
2023-Dec-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108429
PMID:38077153
|
研究论文 | 本研究利用Visium空间转录组学分析前列腺癌组织的转录组特征，揭示了肿瘤内异质性及Gleason评分的进展特征 | 首次通过空间转录组学系统分析前列腺癌不同Gleason评分的组织异质性和基因表达模式 | 样本数量较少，可能影响结果的普适性和可靠性 | 研究前列腺癌Gleason评分进展过程中的转录组表达模式 | 四个具有不同Gleason评分的前列腺癌组织样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 四个前列腺癌组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 378 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of the peripheral immune response in patients with influenza A virus infection
2023-Dec-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108507
PMID:38089584
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了流感A病毒感染患者外周血免疫反应的细胞亚型和分子特征 | 首次详细描述了流感A病毒感染患者中特定免疫细胞亚群的IFN-α诱导蛋白27（IFI27）的显著上调，并识别出与IFN信号相关的特定中性粒细胞亚群 | NA | 深入理解流感A病毒感染患者外周血免疫反应的细胞亚型和分子特征 | 流感A病毒感染患者的外周血免疫细胞 | 数字病理学 | 流感 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞全血（scWB） | 来自不同人群的单细胞全血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 379 | 2024-08-07 |
Deciphering the role of immunoglobulin secreting malignant lineages in the invasive frontiers of small cell lung cancer by scRNA-seq and spatial transcriptomics analysis
2023-Dec-12, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00621-4
PMID:38081849
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 380 | 2024-08-05 |
Increased PAFAH1B3 was associated with poor prognosis and T-cell exhaustion microenvironment in hepatocellular carcinoma
2023-Dec-08, Discover. Oncology
DOI:10.1007/s12672-023-00845-6
PMID:38063949
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研究论文 | 这篇文章探讨了PAFAH1B3与肝细胞癌中的T细胞耗竭的关系。 | 提出PAFAH1B3是肝细胞癌患者预后不良的独立效应因子，并与肿瘤微环境中的T细胞耗竭密切相关。 | 可能未涵盖所有相关的生物标志物或者机制。 | 研究PAFAH1B3在肝细胞癌中的作用以及其与T细胞耗竭的关联。 | 肝细胞癌患者的临床样本和公共数据集中的肿瘤样本。 | 数字病理学 | 肝癌 | qRT-PCR, 免疫组化, 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 50对临床组织切片样本 | NA | NA | NA | NA |