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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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361 | 2024-08-07 |
Combined signature of G protein-coupled receptors and tumor microenvironment provides a prognostic and therapeutic biomarker for skin cutaneous melanoma
2023-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05486-4
PMID:38006451
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研究论文 | 本研究分析了皮肤皮肤黑色素瘤(SKCM)中G蛋白偶联受体(GPCRs)相关基因(GPRGs)和肿瘤微环境(TME),构建了一个预测模型,以帮助SKCM患者获得准确的临床治疗策略 | 本研究首次结合GPCRs和肿瘤微环境构建了一个新的预测模型,并验证了关键基因GPR19的功能 | NA | 探索GPCRs和肿瘤微环境在皮肤皮肤黑色素瘤发展中的作用,并构建预测模型 | 皮肤皮肤黑色素瘤(SKCM)患者 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | LASSO算法,多元和单变量Cox回归分析 | NA | 基因表达数据 | 数据来自TCGA和GEO数据库,具体样本数量未提及 |
362 | 2024-08-07 |
East Asian-specific and cross-ancestry genome-wide meta-analyses provide mechanistic insights into peptic ulcer disease
2023-Dec, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-023-01569-7
PMID:38036781
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研究论文 | 本研究通过大规模跨祖先的元分析,结合日本和欧洲的基因组关联研究,探讨了消化性溃疡病的遗传机制 | 发现了25个新的高度一致的遗传位点,并揭示了胃溃疡和十二指肠溃疡的遗传结构差异 | NA | 探究消化性溃疡病的遗传机制 | 消化性溃疡病,包括胃溃疡和十二指肠溃疡 | 遗传学 | 消化性溃疡病 | 基因组关联研究 | NA | 基因组数据 | 52,032例病例和905,344例对照 |
363 | 2024-08-07 |
Gleaning Euglenozoa-specific DNA polymerases in public single-cell transcriptome data
2023-Dec, Protist
IF:1.9Q4
DOI:10.1016/j.protis.2023.125997
PMID:38039844
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研究论文 | 本研究从公共单细胞转录组数据中鉴定了16个新的家族A DNA聚合酶序列,并讨论了其在Euglenozoa门中的多样性和进化 | 利用单细胞转录组数据填补了Euglenozoa门中深层分支物种的家族A DNA聚合酶数据的空白 | NA | 探讨Euglenozoa门中家族A DNA聚合酶的多样性和进化 | Euglenozoa门中的家族A DNA聚合酶 | NA | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 33个吞噬性Euglenozoa和2个共生体 |
364 | 2024-08-07 |
A postmeiotically bifurcated roadmap of honeybee spermatogenesis marked by phylogenetically restricted genes
2023-Dec, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011081
PMID:38048317
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研究论文 | 本文通过蜜蜂(Apis mellifera)雄性3天和14天龄的睾丸单细胞RNA测序数据,揭示了蜜蜂精子发生过程中转录图谱的后减数分裂分支现象 | 发现了蜜蜂精子发生中后减数分裂的转录分支,以及小精子细胞(sSPT)中表达的膜翅目特异性基因和较高的突变负荷 | NA | 探究蜜蜂精子发生过程中后减数分裂的分子特征 | 蜜蜂的精子发生过程及其分子机制 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 3天和14天龄的蜜蜂雄性睾丸样本 |
365 | 2024-08-07 |
The role of single-cell RNA sequencing in cardiac tumour - a case report
2023-Dec, JPMA. The Journal of the Pakistan Medical Association
DOI:10.47391/JPMA.7776
PMID:38083933
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病例报告 | 本文报告了一例65岁女性心脏肿瘤患者的病例,通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析肿瘤性质 | 使用scRNA-seq技术分析心脏肿瘤的生长模式,有助于区分肿瘤的性质 | NA | 探讨单细胞RNA测序在心脏肿瘤中的应用 | 心脏肿瘤的细胞成分及相关的信号通路 | 数字病理学 | 心脏肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 一例心脏肿瘤患者 |
366 | 2024-08-07 |
Spatial transcriptomics drives a new era in plant research
2023-Dec, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16437
PMID:37651723
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
367 | 2024-08-07 |
Targeted single-cell RNA sequencing analysis reveals metabolic reprogramming and the ferroptosis-resistant state in hematologic malignancies
2023-Dec, Cell biochemistry and function
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/cbf.3869
PMID:37823726
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序(scRNA-seq)与靶向致癌基因面板,对急性髓系白血病进行转录组测序,揭示了血液恶性肿瘤中的代谢重编程和铁死亡抵抗状态 | 本研究克服了scRNA-seq在检测致癌突变方面的局限性,通过靶向方法识别了骨髓样本中每种细胞类型的致癌IDH1、IDH2和KRAS突变分布 | NA | 探讨血液恶性肿瘤中的代谢重编程和铁死亡抵抗状态的机制 | 急性髓系白血病患者的骨髓细胞 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 多个患者的骨髓样本 |
368 | 2024-08-07 |
Decreased oxidative stress response and oxidant detoxification of skin during aging
2023-Dec, Mechanisms of ageing and development
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.mad.2023.111878
PMID:37827221
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据和微阵列转录组数据,探讨了皮肤细胞在老化过程中氧化应激反应和抗氧化能力的改变,并寻找可能参与调控皮肤老化的氧化应激相关基因 | 首次详细分析了不同类型皮肤细胞在老化过程中的氧化应激反应和抗氧化能力的改变,并识别了可能的关键氧化应激相关基因 | NA | 探究皮肤细胞在老化过程中的氧化应激反应和抗氧化能力的改变及其相关基因 | 皮肤细胞及其氧化应激反应和抗氧化能力 | NA | 老年病 | 单细胞RNA测序, 微阵列转录组 | NA | RNA测序数据 | NA |
369 | 2024-08-07 |
Integrated single cell transcriptome sequencing analysis reveals species-specific genes and molecular pathways for pig spermiogenesis
2023-Dec, Reproduction in domestic animals = Zuchthygiene
DOI:10.1111/rda.14493
PMID:37874861
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研究论文 | 本文通过综合睾丸单细胞RNA测序分析,比较了人类和猪的精子发生过程,特别是精子形成阶段,揭示了物种特异性的基因和分子通路 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了猪和人类的精子形成过程,识别了特定类型的精子细胞的标记基因和分子通路 | NA | 研究人类和猪的精子形成过程中特异性的基因和分子通路 | 人类和猪的精子形成过程 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列 | 人类和猪的睾丸细胞被分为26个不同的组 |
370 | 2024-08-05 |
Visium spatial transcriptomics reveals intratumor heterogeneity and profiles of Gleason score progression in prostate cancer
2023-Dec-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108429
PMID:38077153
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研究论文 | 本研究利用Visium空间转录组学分析前列腺癌组织的转录组特征,揭示了肿瘤内异质性及Gleason评分的进展特征 | 首次通过空间转录组学系统分析前列腺癌不同Gleason评分的组织异质性和基因表达模式 | 样本数量较少,可能影响结果的普适性和可靠性 | 研究前列腺癌Gleason评分进展过程中的转录组表达模式 | 四个具有不同Gleason评分的前列腺癌组织样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 四个前列腺癌组织样本 |
371 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of the peripheral immune response in patients with influenza A virus infection
2023-Dec-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108507
PMID:38089584
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了流感A病毒感染患者外周血免疫反应的细胞亚型和分子特征 | 首次详细描述了流感A病毒感染患者中特定免疫细胞亚群的IFN-α诱导蛋白27(IFI27)的显著上调,并识别出与IFN信号相关的特定中性粒细胞亚群 | NA | 深入理解流感A病毒感染患者外周血免疫反应的细胞亚型和分子特征 | 流感A病毒感染患者的外周血免疫细胞 | 数字病理学 | 流感 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞全血(scWB) | 来自不同人群的单细胞全血样本 |
372 | 2024-08-07 |
Deciphering the role of immunoglobulin secreting malignant lineages in the invasive frontiers of small cell lung cancer by scRNA-seq and spatial transcriptomics analysis
2023-Dec-12, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00621-4
PMID:38081849
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
373 | 2024-08-05 |
Increased PAFAH1B3 was associated with poor prognosis and T-cell exhaustion microenvironment in hepatocellular carcinoma
2023-Dec-08, Discover. Oncology
DOI:10.1007/s12672-023-00845-6
PMID:38063949
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研究论文 | 这篇文章探讨了PAFAH1B3与肝细胞癌中的T细胞耗竭的关系。 | 提出PAFAH1B3是肝细胞癌患者预后不良的独立效应因子,并与肿瘤微环境中的T细胞耗竭密切相关。 | 可能未涵盖所有相关的生物标志物或者机制。 | 研究PAFAH1B3在肝细胞癌中的作用以及其与T细胞耗竭的关联。 | 肝细胞癌患者的临床样本和公共数据集中的肿瘤样本。 | 数字病理学 | 肝癌 | qRT-PCR, 免疫组化, 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 50对临床组织切片样本 |
374 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing in cancer research: discovering novel biomarkers and therapeutic targets for immune checkpoint blockade
2023-Dec-08, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-023-03158-4
PMID:38066642
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在癌症研究中的应用,特别是在发现免疫检查点阻断疗法的新生物标志物和治疗靶点方面 | 单细胞RNA测序技术能够揭示单个细胞的基因表达谱,有助于高分辨率地研究肿瘤微环境的异质性 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在免疫检查点阻断疗法中的应用,以发现新的生物标志物和治疗靶点 | 癌症患者的肿瘤微环境及其对免疫检查点阻断疗法的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
375 | 2024-08-07 |
Characterization of the cellular heterogeneity and bone regenerative potential of cultured human periosteal cells
2023-Dec, Regenerative therapy
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.reth.2023.11.006
PMID:38074190
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了培养的人骨膜细胞的细胞异质性及其骨再生潜力 | 首次揭示了培养的人骨膜细胞在不同培养区域的组成多样性及其不同的成骨能力 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术表征培养的人骨膜细胞的异质性,并研究其在体内的成骨潜力 | 培养的人骨膜细胞 | 细胞生物学 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了通过组织移植方法培养的人骨膜细胞,并在大鼠皮下植入模型中进行了实验 |
376 | 2024-08-05 |
IL-27 produced during acute malaria infection regulates Plasmodium-specific memory CD4+ T cells
2023-Dec-07, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202317713
PMID:37855243
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研究论文 | 该文章探讨了IL-27在急性疟疾感染中对特定CD4+ T细胞记忆的调节作用 | 文章揭示了IL-27如何抑制特定Th1记忆前体CD4 T细胞的发展,为疫苗研发提供了新的启示 | 没有提及实验的具体局限性 | 研究IL-27对急性疟疾感染中CD4 T细胞反应的影响 | 主要研究Plasmodium特异性CD4 T细胞的反应和功能 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | IL-27中和的鼠模型 |
377 | 2024-08-05 |
Ex vivo tissue perturbations coupled to single-cell RNA-seq reveal multilineage cell circuit dynamics in human lung fibrogenesis
2023-12-06, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adh0908
PMID:38055803
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和组织扰动揭示了人类肺纤维化中的多谱系细胞电路动态 | 本研究结合了人类精密切割肺片的细胞因子和药物扰动,以单细胞RNA测序为基础,首次证实了肺纤维化中多谱系细胞状态的动态变化 | 组织模型的构建和分析技术的局限性可能影响对肺纤维化机制的全面理解 | 探究人类肺组织中的再生和纤维化机制 | 研究对象主要是人类肺组织切片,以及不同阶段的肺纤维化患者组织 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织切片 | 涉及多个临床队列的肺纤维化患者组织 |
378 | 2024-08-05 |
Single-cell histone chaperones patterns guide intercellular communication of tumor microenvironment that contribute to breast cancer metastases
2023-Dec-06, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-023-03166-4
PMID:38057779
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研究论文 | 本研究探讨了组蛋白伴随蛋白在肿瘤微环境中的作用及其对乳腺癌转移的影响 | 首次揭示了组蛋白伴随蛋白主导的肿瘤微环境细胞间通讯对乳腺癌转移的贡献 | 未具体提及多种肿瘤微环境因素的交互作用 | 研究组蛋白伴随蛋白在乳腺癌转移中的作用及其机制 | 乳腺癌患者的肿瘤微环境细胞群 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 来自6名乳腺癌患者的样本 |
379 | 2024-08-07 |
Immune checkpoints are predominantly co-expressed by clonally expanded CD4+FoxP3+ intratumoral T-cells in primary human cancers
2023-Dec-06, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02897-6
PMID:38057799
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研究论文 | 本文通过多参数流式细胞术和单细胞RNA测序(scRNA-Seq)结合TCR测序,研究了原发性人类肿瘤中肿瘤浸润T细胞的免疫检查点蛋白表达情况 | 本文揭示了免疫检查点蛋白主要由肿瘤内克隆扩增的CD4+FoxP3+ T细胞共表达,这一发现有助于设计未来的新辅助癌症免疫治疗试验 | 本文的研究主要基于流式细胞术和scRNA-Seq技术,这些技术在评估免疫细胞亚群的膜蛋白表达方面可能不够敏感和特异 | 描述原发性实体瘤中肿瘤内T细胞的免疫检查点蛋白表达,以更好地设计新辅助癌症免疫治疗试验 | 原发性人类肿瘤中的肿瘤内T细胞 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术,单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 细胞 | 多种组织类型的原发性人类肿瘤样本 |
380 | 2024-08-05 |
Senescence-associated secretory phenotypes in mesenchymal cells contribute to cytotoxic immune response in oral lichen planus
2023-Dec-05, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-023-00400-5
PMID:38053160
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研究论文 | 这项研究提供了老年相关分泌表型在口腔扁平苔藓中对细胞毒性免疫反应的贡献的证据 | 首次证明了老年间充质细胞在口腔扁平苔藓中的积累对CD8+ T细胞和自然杀伤细胞的影响 | 该研究主要基于数据库分析,尚需进一步验证实验证明这些发现 | 探讨口腔扁平苔藓中老年相关分泌表型的作用及其对免疫反应的影响 | 口腔扁平苔藓患者的组织样本 | 数字病理学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | NA |