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当前共找到 437 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-08-07 |
Association of WHSC1/NSD2 and T-cell infiltration with prostate cancer metastasis and prognosis
2023-12-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-48906-8
PMID:38062230
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研究论文 | 本研究评估了NSD2作为前列腺癌免疫治疗靶点的可行性，并通过免疫组织化学、单细胞RNA测序和基因集富集分析等方法探讨了NSD2与T细胞浸润的关系及其在前列腺癌转移和预后中的作用。 | 首次基于NSD2表达和CD4及CD8 TILs成功对前列腺癌患者进行免疫分类，并发现NSD2在定义前列腺癌免疫浸润中的新作用。 | NA | 评估NSD2作为前列腺癌免疫治疗靶点的可行性。 | NSD2在前列腺癌中的表达模式及其与T细胞浸润的关系。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 免疫组织化学、单细胞RNA测序、基因集富集分析 | NA | 组织样本 | 34例良性前列腺增生、36例前列腺上皮内瘤变、57例前列腺癌（包括19例转移性去势抵抗性前列腺癌） | NA | NA | NA | NA |
| 362 | 2024-08-07 |
Identification and validation of a T cell marker gene-based signature to predict prognosis and immunotherapy response in gastric cancer
2023-12-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-48930-8
PMID:38049463
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研究论文 | 本研究通过分析GSE183904数据集中的单细胞RNA测序数据，使用R包“Seurat”的“FindAllMarkers”方法识别了322个T细胞标记基因，并基于这些基因构建了一个五基因预测签名，用于预测胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | 本研究首次基于T细胞标记基因构建了一个五基因预测签名，用于预测胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | NA | 研究旨在识别和验证基于T细胞标记基因的签名，以预测胃癌的预后和免疫治疗反应 | 胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | TCGA数据库中的STAD患者 | NA | NA | NA | NA |
| 363 | 2024-08-05 |
POSTN Secretion by Extracellular Matrix Cancer-Associated Fibroblasts (eCAFs) Correlates with Poor ICB Response via Macrophage Chemotaxis Activation of Akt Signaling Pathway in Gastric Cancer
2023-Dec-01, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2023.0503
PMID:37199594
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研究论文 | 本研究探讨了胃癌中eCAFs分泌的POSTN与免疫检查点抑制（ICB）反应的关系 | 揭示了CAFs分泌的POSTN通过激活巨噬细胞的Akt信号通路来促进巨噬细胞的趋化作用，从而导致ICB抵抗 | 研究仅依赖于TCGA-STAD和真实世界队列的分析，可能存在样本选择偏倚 | 期望阐明eCAFs与胃癌ICB反应之间的关系及其机制 | 主要研究对象为胃癌患者中的POSTN+FAP+外基质癌相关成纤维细胞（eCAFs）和巨噬细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及TCGA-STAD和真实世界胃癌队列的患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 364 | 2024-08-05 |
IFNγ Transcribed by IRF1 in CD4+ Effector Memory T Cells Promotes Senescence-Associated Pulmonary Fibrosis
2023-Dec-01, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2023.0320
PMID:37199578
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研究论文 | 本研究探讨了生理老化肺部中CD4+效应记忆T细胞转录的IFNγ如何促进与衰老相关的肺纤维化的机制 | 揭示了老化T细胞通过IFNγ信号通路促进AT2细胞衰老和肺纤维化的作用机制 | 未提及样本的具体来源及种类，可能影响研究结果的广泛适用性 | 确定影响肺泡II型上皮细胞的老化T细胞机制和亚型 | 年轻和老年小鼠的肺部单细胞转录组分析，重点是CD4+ T细胞 | 数字病理学 | 衰老相关肺纤维化 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 年轻和老年小鼠的肺部细胞，具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 365 | 2024-08-07 |
Microglia Exhibit Distinct Heterogeneity Rather than M1/M2 Polarization within the Early Stage of Acute Ischemic Stroke
2023-Dec-01, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2023.0505
PMID:37199734
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研究论文 | 本研究通过建立小鼠中大脑动脉闭塞模型，利用单细胞RNA测序技术分析了缺血性中风急性期微胶质细胞的基因表达、细胞亚型和功能变化，揭示了微胶质细胞在急性期的异质性。 | 本研究首次将微胶质细胞在急性缺血性中风早期的异质性进行了详细分类，并发现了多个具有独特功能特征的亚群。 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证。 | 阐明缺血性中风急性期微胶质细胞的异质性，以促进早期有效的神经保护策略的开发。 | 微胶质细胞在急性缺血性中风早期的异质性和功能变化。 | 数字病理学 | 中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 37,614个微胶质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 366 | 2024-08-07 |
Synovial Tissue Heterogeneity in Japanese Patients With Rheumatoid Arthritis Elucidated Using a Cell-Type Deconvolution Approach
2023-12, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42642
PMID:37390361
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研究论文 | 本研究使用细胞类型反卷积方法，阐明了日本类风湿性关节炎患者滑膜组织的异质性 | 首次基于免疫细胞组成对东亚类风湿性关节炎患者的滑膜进行分层，并揭示了不同滑膜表型的炎症驱动因素 | 样本仅来自日本的东亚患者，可能限制了研究结果的普遍性 | 旨在通过免疫细胞组成对东亚类风湿性关节炎患者的滑膜进行分层，并深入了解每种滑膜表型的炎症驱动因素 | 日本类风湿性关节炎患者的滑膜组织 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序技术 | NA | 基因表达数据 | 41例 | NA | NA | NA | NA |
| 367 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing data identifies B cell marker genes signature that predicts prognosis and analysis of immune checkpoints expression in head and neck squamous cell carcinoma
2023-Dec, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e22656
PMID:38125461
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，识别出B细胞标记基因签名，该签名能预测头颈鳞状细胞癌的预后及免疫检查点表达 | 首次通过单细胞RNA测序数据筛选出B细胞标记基因，并验证其在头颈鳞状细胞癌中的预后价值及对免疫治疗反应的潜在影响 | 研究仅限于头颈鳞状细胞癌，且免疫检查点表达与预后的统计学差异不显著 | 探索B细胞标记基因签名在头颈鳞状细胞癌中的预后价值及对免疫治疗反应的影响 | 头颈鳞状细胞癌患者的B细胞标记基因及免疫检查点表达 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 145个B细胞标记基因，TCGA数据集及四个独立数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 368 | 2024-08-07 |
Identification of hub genes based on integrated analysis of single-cell and microarray transcriptome in patients with pulmonary arterial hypertension
2023-Dec-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09892-3
PMID:38110868
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和微阵列转录组数据，识别肺动脉高压患者中的关键基因 | 发现了WDR43和GNL2作为肺动脉高压的新分子机制和潜在治疗靶点 | NA | 揭示肺动脉高压的分子机制和潜在治疗靶点 | 肺动脉高压患者 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），微阵列转录组 | NA | 转录组数据 | 3名健康捐赠者和3名肺动脉高压患者的细胞，共计41,472个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 369 | 2024-08-07 |
Large-scale single-cell RNA sequencing atlases of human immune cells across lifespan: Possibilities and challenges
2023-12, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202250222
PMID:36826421
|
研究论文 | 本文探讨了大规模单细胞RNA测序技术在人类免疫细胞研究中的应用及其面临的挑战 | 介绍了多组学和空间基因组平台在单细胞RNA测序项目中的应用趋势 | 讨论了大规模数据生成、分析和再分析以及数据传播的挑战 | 评估大规模单细胞RNA测序技术在免疫学领域的进展和挑战 | 人类免疫细胞及其在不同生命阶段的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及人类胎儿和成人造血组织的大规模样本 | NA | NA | NA | NA |
| 370 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis of gingivo-buccal oral cancer reveals two dominant cellular programs
2023-Dec, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.15979
PMID:37792582
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析龈颊口癌，揭示了两种主导的细胞程序 | 识别了与口腔黏膜下纤维化相关的独特恶性细胞类型和基质细胞群的表型转变 | NA | 研究龈颊口癌中的细胞异质性 | 12名龈颊口癌患者的口腔肿瘤样本，其中3名患者同时存在口腔黏膜下纤维化 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 371 | 2024-08-07 |
The Notch1 signaling pathway directly modulates the human RANKL-induced osteoclastogenesis
2023-12-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-48615-2
PMID:38040752
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研究论文 | 本文研究了Notch1信号通路在人类RANKL诱导的破骨细胞生成中的直接调节作用 | 首次报道了Notch1信号通路在人类破骨细胞生成中的作用，并揭示了Notch1与IL-7R信号通路的相互作用 | NA | 探讨Notch1信号通路在人类破骨细胞生成中的作用及其机制 | 人类单核CD14细胞和破骨细胞前体 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和抗体序列（AbSeq）分析 | NA | 细胞表面标记物数据 | 从外周血单核细胞（PBMCs）中直接分离的人类单核CD14细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 372 | 2024-08-05 |
scInterpreter: a knowledge-regularized generative model for interpretably integrating scRNA-seq data
2023-Dec-16, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05579-4
PMID:38104057
|
研究论文 | 本研究提出了一种基于深度学习的可解释模型scInterpreter，用于整合和注释scRNA-seq数据。 | scInterpreter显著优于其他最新模型，并通过知识先验加速训练过程，同时提供可解释的细胞表示。 | 未提及具体的局限性 | 研究旨在提供一个有效且可解释的单细胞转录组数据整合工具。 | 本研究的对象为单细胞RNA-seq数据。 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 多个基准数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 373 | 2024-08-07 |
Bioinformatics identification of a T-cell-related signature for predicting prognosis and drug sensitivity in hepatocellular carcinoma
2023-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.12082
PMID:37935646
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学方法识别出与T细胞相关的预后和药物敏感性标志物，用于肝细胞癌的预测 | 开发了一种综合使用10种机器学习算法的T细胞相关预后标志物（TRPS），并验证了其在肝细胞癌中的独立风险因素作用 | NA | 开发和验证一种新的生物标志物，用于预测肝细胞癌患者的预后和药物敏感性 | 肝细胞癌患者及其T细胞相关的预后和药物敏感性 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | RNA序列数据 | 使用Cancer Genome Atlas队列中的7个T细胞相关标记物进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 374 | 2024-08-07 |
Empagliflozin targets Mfn1 and Opa1 to attenuate microglia-mediated neuroinflammation in retinal ischemia and reperfusion injury
2023-Dec-12, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-023-02982-9
PMID:38082266
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研究论文 | 本研究评估了抗糖尿病药物恩格列净（EMPA）在视网膜缺血再灌注损伤中的治疗效果，发现其通过调节Mfn1和Opa1基因表达来减轻由小胶质细胞介导的神经炎症 | 本研究首次揭示了EMPA通过下调NLRP3信号通路和上调线粒体融合相关基因Mfn1和Opa1的表达，来恢复线粒体动态平衡，从而减轻视网膜缺血再灌注损伤中的神经炎症 | NA | 评估EMPA在视网膜缺血再灌注损伤中的治疗效果 | 视网膜缺血再灌注损伤中的神经炎症和线粒体功能障碍 | NA | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠模型，体外实验使用BV2小胶质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 375 | 2024-08-05 |
SingleScan: a comprehensive resource for single-cell sequencing data processing and mining
2023-Dec-07, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05590-9
PMID:38062357
|
研究论文 | 本研究开发了一个名为SingleScan的在线资源，以便更便捷地获取单细胞测序方法和数据处理流程的详细信息 | 提供了分类的单细胞转录组/基因组分析工具和流程，并总结了单细胞数据分析的典型工作流程 | 尚未提及特定的实验验证或工具有效性的评估 | 旨在为研究人员提供一个便利用于单细胞测序数据处理的资源 | 该资源旨在帮助没有计算经验的研究人员进入单细胞测序领域 | 数字病理 | NA | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 376 | 2024-08-07 |
The role of single-cell RNA sequencing in cardiac tumour - a case report
2023-Dec, JPMA. The Journal of the Pakistan Medical Association
DOI:10.47391/JPMA.7776
PMID:38083933
|
病例报告 | 本文报告了一例65岁女性心脏肿瘤患者的病例，通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析肿瘤性质 | 使用scRNA-seq技术分析心脏肿瘤的生长模式，有助于区分肿瘤的性质 | NA | 探讨单细胞RNA测序在心脏肿瘤中的应用 | 心脏肿瘤的细胞成分及相关的信号通路 | 数字病理学 | 心脏肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 一例心脏肿瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 377 | 2024-08-07 |
Targeted single-cell RNA sequencing analysis reveals metabolic reprogramming and the ferroptosis-resistant state in hematologic malignancies
2023-Dec, Cell biochemistry and function
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/cbf.3869
PMID:37823726
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）与靶向致癌基因面板，对急性髓系白血病进行转录组测序，揭示了血液恶性肿瘤中的代谢重编程和铁死亡抵抗状态 | 本研究克服了scRNA-seq在检测致癌突变方面的局限性，通过靶向方法识别了骨髓样本中每种细胞类型的致癌IDH1、IDH2和KRAS突变分布 | NA | 探讨血液恶性肿瘤中的代谢重编程和铁死亡抵抗状态的机制 | 急性髓系白血病患者的骨髓细胞 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 多个患者的骨髓样本 | NA | NA | NA | NA |
| 378 | 2024-08-07 |
Integrated single cell transcriptome sequencing analysis reveals species-specific genes and molecular pathways for pig spermiogenesis
2023-Dec, Reproduction in domestic animals = Zuchthygiene
DOI:10.1111/rda.14493
PMID:37874861
|
研究论文 | 本文通过综合睾丸单细胞RNA测序分析，比较了人类和猪的精子发生过程，特别是精子形成阶段，揭示了物种特异性的基因和分子通路 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了猪和人类的精子形成过程，识别了特定类型的精子细胞的标记基因和分子通路 | NA | 研究人类和猪的精子形成过程中特异性的基因和分子通路 | 人类和猪的精子形成过程 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 人类和猪的睾丸细胞被分为26个不同的组 | NA | NA | NA | NA |
| 379 | 2024-08-05 |
Visium spatial transcriptomics reveals intratumor heterogeneity and profiles of Gleason score progression in prostate cancer
2023-Dec-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108429
PMID:38077153
|
研究论文 | 本研究利用Visium空间转录组学分析前列腺癌组织的转录组特征，揭示了肿瘤内异质性及Gleason评分的进展特征 | 首次通过空间转录组学系统分析前列腺癌不同Gleason评分的组织异质性和基因表达模式 | 样本数量较少，可能影响结果的普适性和可靠性 | 研究前列腺癌Gleason评分进展过程中的转录组表达模式 | 四个具有不同Gleason评分的前列腺癌组织样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 四个前列腺癌组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 380 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of the peripheral immune response in patients with influenza A virus infection
2023-Dec-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108507
PMID:38089584
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了流感A病毒感染患者外周血免疫反应的细胞亚型和分子特征 | 首次详细描述了流感A病毒感染患者中特定免疫细胞亚群的IFN-α诱导蛋白27（IFI27）的显著上调，并识别出与IFN信号相关的特定中性粒细胞亚群 | NA | 深入理解流感A病毒感染患者外周血免疫反应的细胞亚型和分子特征 | 流感A病毒感染患者的外周血免疫细胞 | 数字病理学 | 流感 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞全血（scWB） | 来自不同人群的单细胞全血样本 | NA | NA | NA | NA |