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当前共找到 436 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-08-05 |
Dysregulated Repeat Element Viral-like Immune Response in Hepatocellular Carcinoma
2023-Dec-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.04.570014
PMID:38105940
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研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌中调控失衡的病毒样重复RNA与免疫反应之间的关系 | 首次系统性研究了肝细胞癌中病毒样重复RNA的表达及其与临床结果的相关性 | 本研究样本数量有限，需进一步研究以验证结果 | 了解肝细胞癌中重复RNA的表达如何影响免疫反应和临床结果 | 分析43个切除的肝细胞癌标本中的重复RNA表达及免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA原位杂交（RNA-ISH）、免疫组化（IHC）、空间转录组学 | NA | 组织标本 | 43个切除的肝细胞癌标本和28个空间转录组学样本 | NA | NA | NA | NA |
| 342 | 2024-08-07 |
An inducible genetic tool for tracking and manipulating specific microglial states in development and disease
2023-Dec-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.01.569597
PMID:38106187
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研究论文 | 本文报道了一种可诱导的Cre驱动线Clec7a-CreER，用于追踪和操纵大脑实质中发育和疾病中的特定小胶质细胞状态 | 开发了一种新的工具Clec7a-CreER，用于追踪和操纵特定的小胶质细胞状态，揭示了这些状态的动态性和可塑性 | NA | 研究小胶质细胞在发育和疾病中的特定状态及其功能意义 | 小胶质细胞的特定状态，如增殖区域相关小胶质细胞（PAM）和疾病相关小胶质细胞（DAM） | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 343 | 2024-08-07 |
Leveraging a KRAS-based signature to predict the prognosis and drug sensitivity of colon cancer and identifying SPINK4 as a new biomarker
2023-12-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-48768-0
PMID:38097680
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研究论文 | 本研究利用KRAS相关基因表达特征预测结肠癌患者的预后和药物敏感性，并发现SPINK4作为新的生物标志物 | 首次识别并验证了基于KRAS的80个差异表达基因组成的特征，其中19个基因构建的模型能显著预测结肠癌的预后和药物反应 | NA | 探索基于KRAS的基因表达特征在结肠癌预后和药物敏感性预测中的应用 | 结肠癌患者的预后和药物敏感性 | 数字病理学 | 结肠癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | LASSO cox回归 | 基因表达数据 | 使用TCGA和GEO数据库中的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 344 | 2024-08-05 |
Reconstructing Spatial Transcriptomics at the Single-cell Resolution with BayesDeep
2023-Dec-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.07.570715
PMID:38106214
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研究论文 | 本文介绍了一种新型的贝叶斯层次模型BayesDeep，用于重建单细胞分辨率的空间转录组数据 | 提出了一个结合细胞形态学数据的贝叶斯模型，以单细胞分辨率重构空间转录组数据 | 目前的模型仅在两个真实的SRT数据集上进行了验证，可能需要更多样本以增强鲁棒性 | 提升对组织中生物功能的理解，重建单细胞分辨率的空间转录组数据 | 研究细胞形态与分子特征之间的关联 | 数字病理学 | NA | 贝叶斯模型 | 负二项回归模型 | 转录组数据 | 两个真实的SRT数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 345 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics uncover hub genes and cell-cell crosstalk in patients with hypertensive nephropathy
2023-Dec, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111104
PMID:37897949
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研究论文 | 该文章探讨了高血压肾病患者的关键基因和细胞间相互作用 | 首次利用单细胞转录组学揭示了高血压肾病的病理信号及潜在的细胞沟通机制 | 样本数量较少，仅包含2名健康对照和5名高血压患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨高血压肾病的分子机制和基因靶标 | 研究对象为5名高血压肾病患者和2名健康供体 | 数字病理学 | 高血压肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 7个样本（2个健康供体和5个高血压患者） | NA | NA | NA | NA |
| 346 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing in double-hit lymphoma: IMPDH2 induces the progression of lymphoma by activating the PI3K/AKT/mTOR signaling pathway
2023-Dec, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111125
PMID:37907047
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研究论文 | 研究IMPDH2在双击淋巴瘤中的作用及其机制 | 首次揭示IMPDH2作为促进双击淋巴瘤肿瘤发展的关键因子及其与PI3K/AKT/mTOR信号通路的联系 | 未能完全阐明IMPDH2在所有类型淋巴瘤中的作用机制 | 探索IMPDH2在弥漫性大B细胞淋巴瘤中的潜在机制及其在双击淋巴瘤中的作用 | 双击淋巴瘤(DHL)cases和弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)中的IMPDH2 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞系和组织样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 347 | 2024-08-07 |
Identification of anterior cruciate ligament fibroblasts and their contribution to knee osteoarthritis progression using single-cell analyses
2023-Dec, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111109
PMID:37883816
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞可及染色质测序（scATAC-seq）技术，揭示了前交叉韧带（ACL）在正常和骨关节炎（OA）状态下的转录组和表观基因组特征 | 发现了ACL中的一种新型成纤维细胞亚群，并揭示了其在膝关节稳态和疾病中的作用 | NA | 探究前交叉韧带在膝关节骨性关节炎进展中的作用 | 前交叉韧带的成纤维细胞及其在膝关节骨性关节炎中的作用 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞可及染色质测序（scATAC-seq） | NA | 单细胞数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 348 | 2024-08-07 |
A candidate prognostic biomarker: TFEB inhibits tumor progression via elevating CDKN1A in bladder cancer
2023-Dec, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111016
PMID:37890378
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子EB（TFEB）在膀胱癌中的作用及其作为预后生物标志物的潜力 | 首次揭示了TFEB通过上调CDKN1A表达抑制膀胱癌进展的机制，并发现TFEB表达与免疫细胞浸润呈正相关 | NA | 评估TFEB是否为膀胱癌的生物标志物及治疗靶点 | 膀胱癌组织及细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 549,393例新病例（2018年数据） | NA | NA | NA | NA |
| 349 | 2024-08-07 |
MYO5A overexpression promotes invasion and correlates with low lymphocyte infiltration in head and neck squamous carcinoma
2023-Dec-21, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-11759-5
PMID:38129784
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据结合体外实验，探讨MYO5A在头颈鳞状细胞癌中的作用 | 发现MYO5A在头颈鳞状细胞癌中的过表达促进癌细胞迁移，并通过抑制vimentin表达影响免疫浸润 | NA | 探讨MYO5A在头颈鳞状细胞癌中的作用及其对预后的影响 | MYO5A在头颈鳞状细胞癌中的表达及其对癌细胞迁移和免疫浸润的影响 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 350 | 2024-08-07 |
Interpretation of the Yak Skin Single-Cell Transcriptome Landscape
2023-Dec-11, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani13243818
PMID:38136855
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了牦牛肩胛皮肤在毛囊休止期和生长期的单细胞转录组图谱 | 首次揭示了牦牛皮肤中11种主要细胞类型的转录组特征，并详细分析了DP细胞和成纤维细胞谱系的单细胞图谱 | NA | 探索毛囊形态发生过程中的转录调控机制 | 牦牛皮肤中的单细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 26,573个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 351 | 2024-08-05 |
ATAT: Automated Tissue Alignment and Traversal in Spatial Transcriptomics with Self-Supervised Learning
2023-Dec-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.08.570839
PMID:38106010
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研究论文 | 本研究提出了一个新的计算框架ATAT，用于增强空间转录组学分析 | ATAT利用自我监督对比学习自动对齐和遍历ST数据，填补了当前ST分析方法中的关键空白 | 未在摘要中提及具体的限制 | 旨在提升空间转录组学在多样化和复杂组织结构分析中的应用 | 主要关注胃肠道活检组织样本中的转录组数据 | 数字病理学 | NA | 自我监督对比学习 | NA | H&E染色图像 | 多样本的组织活检数据 | NA | NA | NA | NA |
| 352 | 2024-08-05 |
The Construction and Validation of a Novel Ferroptosis-Related Gene Signature in Parkinson's Disease
2023-Dec-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242417203
PMID:38139032
|
研究论文 | 本文构建并验证了一种与铁死亡相关的基因特征，用于帕金森病的研究 | 提出了一种新的与铁死亡相关的基因特征，并显示其在帕金森病早期诊断中的潜在应用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探讨铁死亡在帕金森病发病机制中的作用 | 分析GSE8397数据集中差异表达基因与铁死亡相关基因的关系 | 数字病理学 | 帕金森病 | Western blotting, 免疫组化, 并利用Cytoscape进行网络图构建 | MPTP诱导的鼠模型 | 基因表达数据 | 使用了GSE8397数据集的相关样本以及MPTP诱导的小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 353 | 2024-08-05 |
Identification and Interpretation of A-to-I RNA Editing Events in Insect Transcriptomes
2023-Dec-05, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242417126
PMID:38138955
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review | 本综述介绍了A-to-I RNA编辑事件在昆虫转录组中的识别和解释 | 系统回顾了RNA编辑的生物学意义，并总结了识别这些编辑事件的方法 | 在小型非模型昆虫中准确识别RNA编辑事件仍然面临一些困难 | 探讨RNA编辑的生物学重要性及其识别方法 | 主要关注小型非模型昆虫中的RNA编辑事件识别 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 354 | 2024-08-07 |
Association of WHSC1/NSD2 and T-cell infiltration with prostate cancer metastasis and prognosis
2023-12-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-48906-8
PMID:38062230
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研究论文 | 本研究评估了NSD2作为前列腺癌免疫治疗靶点的可行性，并通过免疫组织化学、单细胞RNA测序和基因集富集分析等方法探讨了NSD2与T细胞浸润的关系及其在前列腺癌转移和预后中的作用。 | 首次基于NSD2表达和CD4及CD8 TILs成功对前列腺癌患者进行免疫分类，并发现NSD2在定义前列腺癌免疫浸润中的新作用。 | NA | 评估NSD2作为前列腺癌免疫治疗靶点的可行性。 | NSD2在前列腺癌中的表达模式及其与T细胞浸润的关系。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 免疫组织化学、单细胞RNA测序、基因集富集分析 | NA | 组织样本 | 34例良性前列腺增生、36例前列腺上皮内瘤变、57例前列腺癌（包括19例转移性去势抵抗性前列腺癌） | NA | NA | NA | NA |
| 355 | 2024-08-07 |
Identification and validation of a T cell marker gene-based signature to predict prognosis and immunotherapy response in gastric cancer
2023-12-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-48930-8
PMID:38049463
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研究论文 | 本研究通过分析GSE183904数据集中的单细胞RNA测序数据，使用R包“Seurat”的“FindAllMarkers”方法识别了322个T细胞标记基因，并基于这些基因构建了一个五基因预测签名，用于预测胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | 本研究首次基于T细胞标记基因构建了一个五基因预测签名，用于预测胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | NA | 研究旨在识别和验证基于T细胞标记基因的签名，以预测胃癌的预后和免疫治疗反应 | 胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | TCGA数据库中的STAD患者 | NA | NA | NA | NA |
| 356 | 2024-08-05 |
POSTN Secretion by Extracellular Matrix Cancer-Associated Fibroblasts (eCAFs) Correlates with Poor ICB Response via Macrophage Chemotaxis Activation of Akt Signaling Pathway in Gastric Cancer
2023-Dec-01, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2023.0503
PMID:37199594
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研究论文 | 本研究探讨了胃癌中eCAFs分泌的POSTN与免疫检查点抑制（ICB）反应的关系 | 揭示了CAFs分泌的POSTN通过激活巨噬细胞的Akt信号通路来促进巨噬细胞的趋化作用，从而导致ICB抵抗 | 研究仅依赖于TCGA-STAD和真实世界队列的分析，可能存在样本选择偏倚 | 期望阐明eCAFs与胃癌ICB反应之间的关系及其机制 | 主要研究对象为胃癌患者中的POSTN+FAP+外基质癌相关成纤维细胞（eCAFs）和巨噬细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及TCGA-STAD和真实世界胃癌队列的患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 357 | 2024-08-05 |
IFNγ Transcribed by IRF1 in CD4+ Effector Memory T Cells Promotes Senescence-Associated Pulmonary Fibrosis
2023-Dec-01, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2023.0320
PMID:37199578
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研究论文 | 本研究探讨了生理老化肺部中CD4+效应记忆T细胞转录的IFNγ如何促进与衰老相关的肺纤维化的机制 | 揭示了老化T细胞通过IFNγ信号通路促进AT2细胞衰老和肺纤维化的作用机制 | 未提及样本的具体来源及种类，可能影响研究结果的广泛适用性 | 确定影响肺泡II型上皮细胞的老化T细胞机制和亚型 | 年轻和老年小鼠的肺部单细胞转录组分析，重点是CD4+ T细胞 | 数字病理学 | 衰老相关肺纤维化 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 年轻和老年小鼠的肺部细胞，具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 358 | 2024-08-07 |
Microglia Exhibit Distinct Heterogeneity Rather than M1/M2 Polarization within the Early Stage of Acute Ischemic Stroke
2023-Dec-01, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2023.0505
PMID:37199734
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研究论文 | 本研究通过建立小鼠中大脑动脉闭塞模型，利用单细胞RNA测序技术分析了缺血性中风急性期微胶质细胞的基因表达、细胞亚型和功能变化，揭示了微胶质细胞在急性期的异质性。 | 本研究首次将微胶质细胞在急性缺血性中风早期的异质性进行了详细分类，并发现了多个具有独特功能特征的亚群。 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证。 | 阐明缺血性中风急性期微胶质细胞的异质性，以促进早期有效的神经保护策略的开发。 | 微胶质细胞在急性缺血性中风早期的异质性和功能变化。 | 数字病理学 | 中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 37,614个微胶质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 359 | 2024-08-07 |
Synovial Tissue Heterogeneity in Japanese Patients With Rheumatoid Arthritis Elucidated Using a Cell-Type Deconvolution Approach
2023-12, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42642
PMID:37390361
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研究论文 | 本研究使用细胞类型反卷积方法，阐明了日本类风湿性关节炎患者滑膜组织的异质性 | 首次基于免疫细胞组成对东亚类风湿性关节炎患者的滑膜进行分层，并揭示了不同滑膜表型的炎症驱动因素 | 样本仅来自日本的东亚患者，可能限制了研究结果的普遍性 | 旨在通过免疫细胞组成对东亚类风湿性关节炎患者的滑膜进行分层，并深入了解每种滑膜表型的炎症驱动因素 | 日本类风湿性关节炎患者的滑膜组织 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序技术 | NA | 基因表达数据 | 41例 | NA | NA | NA | NA |
| 360 | 2024-08-07 |
Genome-wide identification and expression analysis of heat shock protein gene family in cassava
2023-Dec, The plant genome
DOI:10.1002/tpg2.20407
PMID:37899677
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研究论文 | 本研究在木薯基因组中鉴定了225个MeHsp基因，并分析了它们的遗传结构、染色体分布、复制事件以及在不同组织和细胞亚群中的表达模式 | 首次在木薯中系统地鉴定和分析了热休克蛋白基因家族，揭示了MeHsp基因在植物适应环境中的重要作用 | NA | 旨在理解木薯中热休克蛋白基因的功能特性和进化关系 | 木薯中的热休克蛋白基因家族 | NA | NA | 定量实时聚合酶链反应 (qRT-PCR) | NA | 转录组数据 | 225个MeHsp基因 | NA | NA | NA | NA |