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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2024-08-07 |
Transcriptomic analysis of sorted lung cells revealed a proviral activity of the NF-κB pathway toward SARS-CoV-2
2023-Dec-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108449
PMID:38213785
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研究论文 | 本研究通过深度polyA+转录组分析和新型RNA分析,研究了严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)感染的肺上皮细胞的转录组变化 | 本研究首次揭示了NF-κB通路在SARS-CoV-2感染中的促病毒作用,并发现了CYLD作为该通路的负调控因子具有抗病毒活性 | 研究主要集中在细胞水平,未涉及临床样本或动物模型 | 探讨SARS-CoV-2感染肺上皮细胞的转录组响应和相关调控机制 | SARS-CoV-2感染的肺上皮细胞 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 322 | 2024-08-07 |
FEZ1 participates in human embryonic brain development by modulating neuronal progenitor subpopulation specification and migrations
2023-Dec-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108497
PMID:38213789
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研究论文 | 本研究探讨了FEZ1蛋白在人类胚胎大脑发育中的作用,特别是在神经前体细胞亚群的分化和迁移中的作用 | 首次使用人类大脑类器官(hCOs)研究FEZ1在早期大脑发育中的表达及其对神经和突触发育基因表达的影响 | NA | 研究FEZ1在人类胚胎大脑发育中的作用及其对神经发育障碍的影响 | FEZ1蛋白及其在神经前体细胞亚群分化和迁移中的作用 | NA | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 323 | 2024-08-05 |
Uncovering the Genetic Basis of Congenital Heart Disease: Recent Advancements and Implications for Clinical Management
2023-Dec, CJC pediatric and congenital heart disease
DOI:10.1016/j.cjcpc.2023.10.008
PMID:38205435
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研究论文 | 本研究揭示了先天性心脏病的遗传基础及其对临床管理的影响 | 指出了基因组测序技术对理解先天性心脏病遗传基础的变革性影响 | 临床基于这些因素的风险预测仍然面临挑战 | 旨在深入理解先天性心脏病的遗传基础,以改善临床结果 | 分析先天性心脏病相关的遗传变异与临床结果之间的关联 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 下一代测序技术 | 人诱导多能干细胞模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 324 | 2024-08-05 |
Intratumor heterogeneity: models of malignancy emergence and evolution
2023-Dec, Vavilovskii zhurnal genetiki i selektsii
IF:0.9Q3
DOI:10.18699/VJGB-23-94
PMID:38213707
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研究论文 | 本文探讨了癌症内肿瘤异质性的演变及其模型 | 提出了从进化理论的角度理解肿瘤作为复杂生态系统的观点 | 未具体细述不同方法的局限性 | 旨在揭示影响肿瘤异质性的机制以改善癌症治疗 | 探索肿瘤内的遗传和表观遗传变化 | 数字病理学 | 癌症 | 下一代测序,荧光原位杂交,单细胞测序 | 计算模型和算法 | 基因组数据,单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 325 | 2024-08-05 |
TrkA-mediated sensory innervation of injured mouse tendon supports tendon sheath progenitor cell expansion and tendon repair
2023-12-20, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.ade4619
PMID:38117901
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研究论文 | 本研究探讨外周神经在小鼠肌腱损伤与修复中的作用 | 首次揭示外周神经通过调控神经生长因子和TGFβ信号通路促进肌腱细胞的扩展与修复 | 需要进一步研究去神经化对肌腱机械负荷的潜在影响 | 研究外周神经在小鼠肌腱损伤后的修复过程中的作用 | 小鼠肌腱及其神经生长与修复机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 组织样本 | 小鼠以及人类肌腱活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 326 | 2024-08-07 |
Diversity of intratumoral regulatory T cells in B-cell non-Hodgkin lymphoma
2023-12-12, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023010158
PMID:37695745
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序结合高维流式细胞术,解析了弥漫大B细胞淋巴瘤和滤泡淋巴瘤中肿瘤内调节性T细胞的异质性 | 首次揭示了B细胞非霍奇金淋巴瘤中肿瘤内调节性T细胞的三个不同转录状态,并发现激活的调节性T细胞在肿瘤组织中富集,具有更强的免疫抑制活性 | 研究主要集中在弥漫大B细胞淋巴瘤和滤泡淋巴瘤,其他类型的B细胞非霍奇金淋巴瘤的调节性T细胞异质性尚未探讨 | 探讨B细胞非霍奇金淋巴瘤中肿瘤内调节性T细胞的异质性及其对预后的影响 | 弥漫大B细胞淋巴瘤和滤泡淋巴瘤中的肿瘤内调节性T细胞 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序,高维流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 两个独立的滤泡淋巴瘤队列 | NA | NA | NA | NA |
| 327 | 2024-08-07 |
Fibroblast subpopulations in Systemic Sclerosis - Functional implications of individual subpopulations and correlations with clinical features
2023-Dec-24, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.09.288
PMID:38147960
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(bulk RNA-seq)数据以及临床信息,探讨了系统性硬化症(SSc)中个体成纤维细胞亚群的作用及其与临床特征的相关性 | 本研究首次将成纤维细胞亚群的比例纳入机器学习模型,提高了SSc患者皮肤纤维化进展与稳定性的分类准确性 | NA | 研究系统性硬化症中成纤维细胞亚群的功能及其与临床特征的相关性 | 系统性硬化症中的成纤维细胞亚群及其与皮肤纤维化的关系 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序(bulk RNA-seq) | 机器学习模型 | RNA测序数据 | PRESS和GENISOS两个队列的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 328 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis identifies phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase as a target in ulcerative colitis
2023-Dec-28, World journal of gastroenterology
IF:4.3Q1
DOI:10.3748/wjg.v29.i48.6222
PMID:38186864
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析溃疡性结肠炎患者的细胞互作和分子特征,发现磷赖氨酸磷组氨酸无机焦磷酸磷酸酶(LHPP)在炎症调控中的潜在作用。 | 本研究首次揭示了LHPP在溃疡性结肠炎中的下调与炎症反应的负相关性,并提出LHPP作为治疗溃疡性结肠炎的潜在靶点。 | NA | 利用单细胞RNA测序技术解析溃疡性结肠炎病理中的细胞互作和分子特征。 | 溃疡性结肠炎患者的细胞和分子机制。 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 溃疡性结肠炎患者的组织和血浆样本 | NA | NA | NA | NA |
| 329 | 2024-08-05 |
Single-cell Analysis Reveals Inter- and Intratumour Heterogeneity in Metastatic Breast Cancer
2023-12-08, Journal of mammary gland biology and neoplasia
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10911-023-09551-z
PMID:38066300
|
研究论文 | 本研究揭示了转移性乳腺癌中的肿瘤间和肿瘤内异质性 | 首次通过单细胞RNA测序识别了与转移相关的分子机制,尤其是在肿瘤和转移细胞状态之间的平衡 | 未深入探讨所有潜在的分子机制,且样本来源于特定的患者衍生模型 | 识别转移过程中,特别是在肿瘤细胞群体形成过程中分子机制 | 乳腺癌患者衍生异种移植物的肿瘤及匹配的肺宏转移 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | RNA数据 | 来源于五种转移性乳腺癌模型的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 330 | 2024-08-07 |
Computational identification of key transcription factors for embryonic and postnatal Sox2+ dental epithelial stem cell
2023-Dec-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.22.573158
PMID:38187542
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研究论文 | 本文通过计算方法识别了胚胎期和出生后Sox2+牙上皮干细胞的关键转录因子 | 利用Smart-Seq2协议和ATAC-seq协议生成P2牙上皮干细胞的转录组和染色质可及性图谱,并系统地识别了E11.5细胞和P2细胞的关键转录因子 | 由于DESC标记物的表达水平过低或DESC在整体牙齿中的比例过低,之前的单细胞RNA测序实验未能明确识别出DESC集群 | 研究牙上皮干细胞的基因表达和染色质可及性特征,以识别关键转录因子 | 胚胎期和出生后Sox2+牙上皮干细胞 | NA | NA | Smart-Seq2, ATAC-seq | NA | 转录组, 染色质可及性图谱 | E11.5 Sox2+牙上皮细胞和P2牙上皮干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 331 | 2024-08-07 |
Transcriptomic Landscape of Prurigo Nodularis Lesional Skin CD3+ T Cells Using Single-Cell RNA Sequencing
2023-12, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.05.011
PMID:37263486
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 332 | 2024-08-05 |
Tumor cell-intrinsic SETD2 inactivation sensitizes cancer cells to immune checkpoint blockade through the NR2F1-STAT1 pathway
2023-12-06, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007678
PMID:38056895
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研究论文 | 这篇文章探讨了SETD2失活对癌细胞免疫检查点抑制剂敏感性的影响 | 揭示了SETD2失活通过NR2F1-STAT1通路调节肿瘤免疫,提出了新的潜在治疗生物标志物 | 研究主要集中在小鼠模型上,尚需进一步验证在人类中的应用 | 探讨SETD2在免疫治疗中的功能及其对免疫反应的调节 | 小鼠肿瘤模型,特别是SETD2失活的肿瘤细胞 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq, 流式细胞术 | NA | RNA数据,流式细胞术数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 333 | 2024-08-07 |
Targeting integrin α5 in fibroblasts potentiates colorectal cancer response to PD-L1 blockade by affecting extracellular-matrix deposition
2023-12-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007447
PMID:38040421
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研究论文 | 本研究探讨了整合素α5在成纤维细胞中的作用,以及其如何通过影响细胞外基质沉积来增强结直肠癌对PD-L1阻断治疗的反应 | 首次揭示了整合素α5在成纤维细胞中通过影响细胞外基质沉积来调节抗肿瘤免疫的作用,并展示了α5β1抑制与PD-L1阻断联合治疗的疗效 | 研究样本量较小,仅为29名患者,可能影响结果的普遍性 | 研究整合素α5在成纤维细胞中的作用及其在结直肠癌免疫治疗中的效果 | 结直肠癌中的癌症相关成纤维细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 29名结直肠癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 334 | 2024-08-07 |
Tr1 Cells Emerge and Suppress Effector Th17 Cells in Glomerulonephritis
2023-12-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300305
PMID:37850963
|
研究论文 | 本研究探讨了Tr1细胞在肾小球肾炎(GN)中的出现及其抑制效应Th17细胞的功能 | 首次详细研究了Tr1细胞在肾小球肾炎中的出现及其在疾病中的调控功能 | NA | 验证Tr1细胞在实验性肾小球肾炎中的治疗潜力 | Tr1细胞在肾小球肾炎中的作用及其调控机制 | 免疫学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了实验性新月形肾小球肾炎的小鼠模型和双Foxp3mRFP IL-10eGFP报告小鼠,以及抗中性粒细胞胞浆自身抗体相关肾小球肾炎患者的肾脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 335 | 2024-08-07 |
Single-Cell Atlas of Neonatal Mouse Hearts Reveals an Unexpected Cardiomyocyte
2023-12-05, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.122.028287
PMID:38014657
|
研究论文 | 本文通过设计新生小鼠心脏细胞的分离程序,提供了出生后四个不同阶段心脏细胞的单细胞分辨率详细图谱 | 本文发现了意外的红细胞样心肌细胞-终末期心肌细胞,并提供了心肌细胞与其他心脏细胞之间全面相互作用的初步蓝图 | NA | 研究心肌细胞的异质性并提供在不同生理条件和疾病中的参考 | 新生小鼠心脏的心肌细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞图谱 | 10,000个心肌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 336 | 2024-08-05 |
Unveiling Hypothalamic Molecular Signatures via Retrograde Viral Tracing and Single-Cell Transcriptomics
2023-12-04, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-023-02789-6
PMID:38049462
|
研究论文 | 本研究通过逆行病毒追踪和单细胞转录组学揭示了下丘脑分子的特征 | 本研究创新地结合了多样化数据集进行验证,提供了更细致的下丘脑细胞类型多样性 | 本研究的局限性未在摘要中提及 | 深入理解下丘脑神经回路及其分子身份 | 来自CRH-IRES-Cre小鼠的1,533个下丘脑细胞 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序(snRNA-seq) | NA | 细胞转录组数据 | 1,533个来自CRH-IRES-Cre小鼠的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 337 | 2024-08-07 |
Convergent differentiation of multiciliated cells
2023-12-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-50077-5
PMID:38155158
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研究论文 | 研究通过跨物种数据整合分析了人类和小鼠的鼻上皮细胞、支气管、输卵管和室下区室管膜细胞的单细胞转录组数据,探讨了多纤毛细胞(MCCs)在不同组织中的相似性和差异性 | 研究确认了MCCs在最终分化步骤中具有收敛的基因集表达,为理解发育过程中的纤毛生成提供了新的见解 | NA | 理解多纤毛细胞在多个组织中的相似性和差异性 | 多纤毛细胞在不同组织中的分化过程 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 人类和小鼠的鼻上皮细胞、支气管、输卵管和室下区室管膜细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 338 | 2024-08-07 |
Host CD34+ cells are replacing donor endothelium of transplanted heart
2023-12, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2023.08.015
PMID:37634574
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和诱导性谱系追踪小鼠模型,探讨了心脏移植后供体内皮细胞被宿主CD34+细胞替代的机制 | 首次通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术,揭示了宿主CD34+细胞在心脏移植后替代供体内皮细胞的详细过程和机制 | 研究主要基于小鼠模型,其结果在人类心脏移植中的适用性需要进一步验证 | 探讨心脏移植后内皮细胞再生的来源及其机制 | 心脏移植后的内皮细胞再生和宿主CD34+细胞的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 339 | 2024-08-07 |
Colonic L-cell impairment in aged subjects with type 2 diabetes leads to diminished GLP-1 production
2023-Dec, Diabetes & metabolic syndrome
DOI:10.1016/j.dsx.2023.102907
PMID:37980723
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研究论文 | 研究探讨了2型糖尿病老年患者结肠L细胞功能障碍及其导致GLP-1分泌减少的机制 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了L细胞功能障碍的分子机制,为改善GLP-1分泌提供了新的靶点 | NA | 解析2型糖尿病条件下L细胞生物学变化的机制,为基于肠道的2型糖尿病治疗策略提供研究支持 | 2型糖尿病老年患者的结肠L细胞及其GLP-1分泌功能 | NA | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括年轻和老年2型糖尿病患者以及非糖尿病患者,以及长期高脂肪高果糖饮食诱导的老年2型糖尿病Wistar大鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 340 | 2024-08-07 |
cellsig plug-in enhances CIBERSORTx signature selection for multidataset transcriptomes with sparse multilevel modelling
2023-12-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad685
PMID:37952182
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研究论文 | 本文介绍了一种名为cellsig的贝叶斯稀疏多级模型,旨在通过调整数据以适应多级效应和基因集稀疏性来改进签名估计 | cellsig模型能够处理大规模、异质性的伪批量和批量RNA测序数据集,特别是具有非重叠基因集的数据 | 目前工具如CIBERSORTx的一个限制是无法处理层次数据结构和跨样本的非重叠基因集 | 提高细胞类型标记基因排序性能,促进细胞类型签名选择 | 大规模的伪批量和批量RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 贝叶斯稀疏多级模型 | 转录组数据 | 1435个样本,涵盖58个数据集 | NA | NA | NA | NA |