单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 436 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2024-08-05 |
Molecularly defined and spatially resolved cell atlas of the whole mouse brain
2023-Dec, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06808-9
PMID:38092912
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研究论文 | 本文在整合数据的基础上构建了小鼠大脑的全面细胞图谱 | 生成了一个超过5000个转录独特细胞簇和超过300种主要细胞类型的细胞图谱，具有高分辨率的分子和空间数据 | 目前仍缺乏对整个脑区的全面细胞图谱，且无法涵盖所有细胞类型 | 系统映射小鼠大脑中分子定义的细胞类型的空间组织 | 约1000万细胞中的1100个基因的表达分析 | 数字病理学 | NA | 多重错误鲁棒荧光原位杂交和单细胞RNA测序 | NA | 细胞表达数据 | 约1000万个细胞 |
| 322 | 2024-08-07 |
A high-resolution transcriptomic and spatial atlas of cell types in the whole mouse brain
2023-Dec, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06812-z
PMID:38092916
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研究论文 | 本研究报告了整个成年小鼠大脑的综合性和高分辨率转录组和空间细胞类型图谱 | 首次创建了包含约700万个细胞的单细胞RNA测序数据集和约430万个细胞的空间转录组数据集的小鼠大脑细胞类型图谱，并开发了一个在线平台用于可视化这些数据 | NA | 建立一个基准参考图谱和基础资源，用于综合研究哺乳动物大脑的细胞和电路功能、发育和进化 | 小鼠大脑的细胞类型及其空间分布模式 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重误差稳健荧光原位杂交（MERFISH） | NA | 转录组数据 | 约700万个细胞的单细胞RNA测序数据集和约430万个细胞的空间转录组数据集 |
| 323 | 2024-08-05 |
Single-cell multi-omics analysis of human testicular germ cell tumor reveals its molecular features and microenvironment
2023-Dec-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44305-9
PMID:38123589
|
研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了人类睾丸胚细胞肿瘤的分子特征和微环境 | 通过多组学解析，我们识别了根系基因表达程序，并描绘了睾丸胚细胞肿瘤的肿瘤微环境 | 需要更多样本和长时间的随访数据以验证结果的广泛性 | 探讨睾丸胚细胞肿瘤的分子特征及其微环境 | 研究对象为睾丸胚细胞肿瘤样本及相关细胞系 | 数字病理学 | 生殖细胞肿瘤 | 基因组分析，单细胞多组学，空间转录组学 | NA | NA | 包括睾丸胚细胞肿瘤样本及细胞系 |
| 324 | 2024-08-07 |
Reassessing endothelial-to-mesenchymal transition in mouse bone marrow: insights from lineage tracing models
2023-Dec-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44312-w
PMID:38123537
|
研究论文 | 本文评估了在幼年小鼠中内皮细胞向间充质细胞转化的贡献，以生成骨髓基质细胞 | 发现内皮细胞在稳态和骨髓抑制诱导的造血再生过程中几乎不转化为骨髓基质细胞 | 使用Prrx1-Cre和Lepr-Cre转基因小鼠未能验证单细胞RNA测序的结果 | 探讨内皮细胞是否是骨髓基质细胞的来源 | 内皮细胞和骨髓基质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用Cdh5-rtTA-tetO-Cre或Tek-CreERT2的少数骨髓基质细胞 |
| 325 | 2024-08-05 |
Construction of monocyte-related prognosis model based on comprehensive analysis of bulk RNA-seq and single-cell RNA-seq in high-grade serous ovarian cancer
2023-Dec-15, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000036548
PMID:38115318
|
研究论文 | 本文构建了一个基于单细胞和整体RNA-seq综合分析的单核细胞相关预后模型，用于高等级浆液性卵巢癌的研究 | 通过鉴定和分析单核细胞相关的基因，确定了新的潜在生物标志物以用于高等级浆液性卵巢癌的预后评估和治疗 | 研究主要基于现有数据库的数据，可能存在数据质量和样本代表性的问题 | 研究单核细胞在高等级浆液性卵巢癌中的作用及其与预后的关系 | 高等级浆液性卵巢癌患者的单核细胞相关基因 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA-seq | Cox模型 | 基因表达数据 | NA |
| 326 | 2024-08-07 |
Identification of central genes for endometriosis through integration of single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing analysis
2023-Dec-15, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000036707
PMID:38115253
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研究论文 | 本研究旨在通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序分析，识别与子宫内膜异位症发展相关的关键基因，并构建一个准确的预测模型，为子宫内膜异位症的诊断和治疗提供新的方向 | 本研究通过结合单细胞细胞通讯方法、芯片数据整合差异分析、WGCNA分析和LASSO模型，识别了与免疫浸润和功能富集分析相关的关键基因，并发现这些基因在单细胞中显著表达 | NA | 识别与子宫内膜异位症发展相关的关键基因，并构建一个准确的预测模型 | 子宫内膜异位症的关键基因和预测模型 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | LASSO模型 | RNA序列数据 | 1879个差异表达基因, 357个模块基因 |
| 327 | 2024-08-05 |
Autophagy of OTUD5 destabilizes GPX4 to confer ferroptosis-dependent kidney injury
2023-Dec-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44228-5
PMID:38110369
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研究论文 | 本文研究了OTUD5通过降解GPX4来介导铁死亡导致的肾损伤 | 发现OTUD5作为GPX4结合蛋白，通过稳定GPX4抵抗铁死亡，揭示了缺血-再灌注期间的分子机制 | 研究主要集中在肾脏的铁死亡机制，其他器官的影响未被探讨 | 探讨OTUD5在缺血-再灌注相关肾损伤中的作用及其机制 | 研究主要对象为肾脏细胞和铁死亡相关的分子机制 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 328 | 2024-08-07 |
Association of WHSC1/NSD2 and T-cell infiltration with prostate cancer metastasis and prognosis
2023-12-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-48906-8
PMID:38062230
|
研究论文 | 本研究评估了NSD2作为前列腺癌免疫治疗靶点的可行性，并通过免疫组织化学、单细胞RNA测序和基因集富集分析等方法探讨了NSD2与T细胞浸润的关系及其在前列腺癌转移和预后中的作用。 | 首次基于NSD2表达和CD4及CD8 TILs成功对前列腺癌患者进行免疫分类，并发现NSD2在定义前列腺癌免疫浸润中的新作用。 | NA | 评估NSD2作为前列腺癌免疫治疗靶点的可行性。 | NSD2在前列腺癌中的表达模式及其与T细胞浸润的关系。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 免疫组织化学、单细胞RNA测序、基因集富集分析 | NA | 组织样本 | 34例良性前列腺增生、36例前列腺上皮内瘤变、57例前列腺癌（包括19例转移性去势抵抗性前列腺癌） |
| 329 | 2024-08-07 |
Identification and validation of a T cell marker gene-based signature to predict prognosis and immunotherapy response in gastric cancer
2023-12-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-48930-8
PMID:38049463
|
研究论文 | 本研究通过分析GSE183904数据集中的单细胞RNA测序数据，使用R包“Seurat”的“FindAllMarkers”方法识别了322个T细胞标记基因，并基于这些基因构建了一个五基因预测签名，用于预测胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | 本研究首次基于T细胞标记基因构建了一个五基因预测签名，用于预测胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | NA | 研究旨在识别和验证基于T细胞标记基因的签名，以预测胃癌的预后和免疫治疗反应 | 胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | TCGA数据库中的STAD患者 |
| 330 | 2024-08-05 |
POSTN Secretion by Extracellular Matrix Cancer-Associated Fibroblasts (eCAFs) Correlates with Poor ICB Response via Macrophage Chemotaxis Activation of Akt Signaling Pathway in Gastric Cancer
2023-Dec-01, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2023.0503
PMID:37199594
|
研究论文 | 本研究探讨了胃癌中eCAFs分泌的POSTN与免疫检查点抑制（ICB）反应的关系 | 揭示了CAFs分泌的POSTN通过激活巨噬细胞的Akt信号通路来促进巨噬细胞的趋化作用，从而导致ICB抵抗 | 研究仅依赖于TCGA-STAD和真实世界队列的分析，可能存在样本选择偏倚 | 期望阐明eCAFs与胃癌ICB反应之间的关系及其机制 | 主要研究对象为胃癌患者中的POSTN+FAP+外基质癌相关成纤维细胞（eCAFs）和巨噬细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及TCGA-STAD和真实世界胃癌队列的患者样本 |
| 331 | 2024-08-05 |
IFNγ Transcribed by IRF1 in CD4+ Effector Memory T Cells Promotes Senescence-Associated Pulmonary Fibrosis
2023-Dec-01, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2023.0320
PMID:37199578
|
研究论文 | 本研究探讨了生理老化肺部中CD4+效应记忆T细胞转录的IFNγ如何促进与衰老相关的肺纤维化的机制 | 揭示了老化T细胞通过IFNγ信号通路促进AT2细胞衰老和肺纤维化的作用机制 | 未提及样本的具体来源及种类，可能影响研究结果的广泛适用性 | 确定影响肺泡II型上皮细胞的老化T细胞机制和亚型 | 年轻和老年小鼠的肺部单细胞转录组分析，重点是CD4+ T细胞 | 数字病理学 | 衰老相关肺纤维化 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 年轻和老年小鼠的肺部细胞，具体样本数量未提及 |
| 332 | 2024-08-05 |
Toll-Like Receptor 4 Agonist Injection With Concurrent Radiotherapy in Patients With Metastatic Soft Tissue Sarcoma: A Phase 1 Nonrandomized Controlled Trial
2023-Dec-01, JAMA oncology
IF:22.5Q1
DOI:10.1001/jamaoncol.2023.4015
PMID:37824131
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研究论文 | 本研究评估了在转移性软组织肉瘤患者中，注射TLR4激动剂GLA-SE与放疗联合应用的安全性和有效性 | 研究显示GLA-SE联合放疗能够提供比单独放疗更持久的局部控制效果，并促进T细胞克隆扩增 | 该研究为小样本的非随机对照试验，缺乏对照组 | 评估注射GLA-SE与放疗联合使用的安全性和免疫调节效果 | 转移性软组织肉瘤患者 | 肿瘤免疫学 | 软组织肉瘤 | 局部肿瘤注射 | NA | 临床数据 | 12名患者 |
| 333 | 2024-08-07 |
Microglia Exhibit Distinct Heterogeneity Rather than M1/M2 Polarization within the Early Stage of Acute Ischemic Stroke
2023-Dec-01, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2023.0505
PMID:37199734
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研究论文 | 本研究通过建立小鼠中大脑动脉闭塞模型，利用单细胞RNA测序技术分析了缺血性中风急性期微胶质细胞的基因表达、细胞亚型和功能变化，揭示了微胶质细胞在急性期的异质性。 | 本研究首次将微胶质细胞在急性缺血性中风早期的异质性进行了详细分类，并发现了多个具有独特功能特征的亚群。 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证。 | 阐明缺血性中风急性期微胶质细胞的异质性，以促进早期有效的神经保护策略的开发。 | 微胶质细胞在急性缺血性中风早期的异质性和功能变化。 | 数字病理学 | 中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 37,614个微胶质细胞 |
| 334 | 2024-08-07 |
Synovial Tissue Heterogeneity in Japanese Patients With Rheumatoid Arthritis Elucidated Using a Cell-Type Deconvolution Approach
2023-12, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42642
PMID:37390361
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研究论文 | 本研究使用细胞类型反卷积方法，阐明了日本类风湿性关节炎患者滑膜组织的异质性 | 首次基于免疫细胞组成对东亚类风湿性关节炎患者的滑膜进行分层，并揭示了不同滑膜表型的炎症驱动因素 | 样本仅来自日本的东亚患者，可能限制了研究结果的普遍性 | 旨在通过免疫细胞组成对东亚类风湿性关节炎患者的滑膜进行分层，并深入了解每种滑膜表型的炎症驱动因素 | 日本类风湿性关节炎患者的滑膜组织 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序技术 | NA | 基因表达数据 | 41例 |
| 335 | 2024-08-07 |
Genome-wide identification and expression analysis of heat shock protein gene family in cassava
2023-Dec, The plant genome
DOI:10.1002/tpg2.20407
PMID:37899677
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研究论文 | 本研究在木薯基因组中鉴定了225个MeHsp基因，并分析了它们的遗传结构、染色体分布、复制事件以及在不同组织和细胞亚群中的表达模式 | 首次在木薯中系统地鉴定和分析了热休克蛋白基因家族，揭示了MeHsp基因在植物适应环境中的重要作用 | NA | 旨在理解木薯中热休克蛋白基因的功能特性和进化关系 | 木薯中的热休克蛋白基因家族 | NA | NA | 定量实时聚合酶链反应 (qRT-PCR) | NA | 转录组数据 | 225个MeHsp基因 |
| 336 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing data identifies B cell marker genes signature that predicts prognosis and analysis of immune checkpoints expression in head and neck squamous cell carcinoma
2023-Dec, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e22656
PMID:38125461
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，识别出B细胞标记基因签名，该签名能预测头颈鳞状细胞癌的预后及免疫检查点表达 | 首次通过单细胞RNA测序数据筛选出B细胞标记基因，并验证其在头颈鳞状细胞癌中的预后价值及对免疫治疗反应的潜在影响 | 研究仅限于头颈鳞状细胞癌，且免疫检查点表达与预后的统计学差异不显著 | 探索B细胞标记基因签名在头颈鳞状细胞癌中的预后价值及对免疫治疗反应的影响 | 头颈鳞状细胞癌患者的B细胞标记基因及免疫检查点表达 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 145个B细胞标记基因，TCGA数据集及四个独立数据集 |
| 337 | 2024-08-07 |
Identification of hub genes based on integrated analysis of single-cell and microarray transcriptome in patients with pulmonary arterial hypertension
2023-Dec-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09892-3
PMID:38110868
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和微阵列转录组数据，识别肺动脉高压患者中的关键基因 | 发现了WDR43和GNL2作为肺动脉高压的新分子机制和潜在治疗靶点 | NA | 揭示肺动脉高压的分子机制和潜在治疗靶点 | 肺动脉高压患者 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），微阵列转录组 | NA | 转录组数据 | 3名健康捐赠者和3名肺动脉高压患者的细胞，共计41,472个细胞 |
| 338 | 2024-08-07 |
Large-scale single-cell RNA sequencing atlases of human immune cells across lifespan: Possibilities and challenges
2023-12, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202250222
PMID:36826421
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研究论文 | 本文探讨了大规模单细胞RNA测序技术在人类免疫细胞研究中的应用及其面临的挑战 | 介绍了多组学和空间基因组平台在单细胞RNA测序项目中的应用趋势 | 讨论了大规模数据生成、分析和再分析以及数据传播的挑战 | 评估大规模单细胞RNA测序技术在免疫学领域的进展和挑战 | 人类免疫细胞及其在不同生命阶段的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及人类胎儿和成人造血组织的大规模样本 |
| 339 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis of gingivo-buccal oral cancer reveals two dominant cellular programs
2023-Dec, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.15979
PMID:37792582
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析龈颊口癌，揭示了两种主导的细胞程序 | 识别了与口腔黏膜下纤维化相关的独特恶性细胞类型和基质细胞群的表型转变 | NA | 研究龈颊口癌中的细胞异质性 | 12名龈颊口癌患者的口腔肿瘤样本，其中3名患者同时存在口腔黏膜下纤维化 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12名患者 |
| 340 | 2024-08-07 |
The Notch1 signaling pathway directly modulates the human RANKL-induced osteoclastogenesis
2023-12-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-48615-2
PMID:38040752
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研究论文 | 本文研究了Notch1信号通路在人类RANKL诱导的破骨细胞生成中的直接调节作用 | 首次报道了Notch1信号通路在人类破骨细胞生成中的作用，并揭示了Notch1与IL-7R信号通路的相互作用 | NA | 探讨Notch1信号通路在人类破骨细胞生成中的作用及其机制 | 人类单核CD14细胞和破骨细胞前体 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和抗体序列（AbSeq）分析 | NA | 细胞表面标记物数据 | 从外周血单核细胞（PBMCs）中直接分离的人类单核CD14细胞 |