单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 437 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-08-07 |
Exploring the role of LIAS-related cuproptosis in systemic lupus erythematosus
2023-Dec, Lupus
IF:1.9Q3
DOI:10.1177/09612033231211429
PMID:37903189
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研究论文 | 本研究探讨了LIAS相关铜死亡在系统性红斑狼疮中的作用机制 | 首次深入研究了铜死亡相关基因在系统性红斑狼疮中的分子机制 | 研究主要基于RNA测序数据，可能需要更多实验验证 | 探索铜死亡及其相关基因在系统性红斑狼疮中的作用机制 | 系统性红斑狼疮患者的外周血单个核细胞 | NA | 系统性红斑狼疮 | RNA测序 | NA | RNA | 系统性红斑狼疮患者和健康个体的外周血单个核细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 302 | 2024-08-07 |
Large-scale analysis of cell-cell communication reveals angiogenin-dependent tumor progression in clear cell renal cell carcinoma
2023-Dec-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108367
PMID:38025776
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，深入分析了透明细胞肾细胞癌中的细胞间通信网络，并揭示了血管生成素依赖的肿瘤进展机制 | 本研究首次识别了50个癌细胞与其他细胞间特定的通信通道，并发现了两个新的血管生成素介导的相互作用 | NA | 揭示透明细胞肾细胞癌中细胞间通信的分子机制 | 透明细胞肾细胞癌中的细胞间通信网络 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 303 | 2024-08-05 |
Hierarchical and automated cell-type annotation and inference of cancer cell of origin with Census
2023-12-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad714
PMID:38011649
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研究论文 | 本研究开发了Census，一种自动化的细胞类型定位和癌细胞源推断方法 | Census提供了对正常细胞的深度注释并能够识别恶性细胞及其最可能的来源细胞，克服了现有方法的多项局限 | 现有的自动注释方法需要大量参考数据集，并且存在高计算时间和浅层注释解析的问题 | 旨在提高单细胞RNA测序数据的细胞类型注释效率和准确性 | 研究对象为来自哺乳动物组织的正常细胞和癌细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 梯度增强决策树 | 文本 | 在44个正常和癌症的人类及小鼠组织数据集中进行了基准测试 | NA | NA | NA | NA |
| 304 | 2024-08-05 |
Hexagonal image segmentation on spatially resolved transcriptomics
2023-12, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2023.11.002
PMID:37931852
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研究论文 | 该文章提出了一种新颖的六边形卷积神经网络用于空间转录组的图像分割 | 引入了六边形卷积网络和监督学习方法，以提高空间转录组数据中的噪声处理和特征识别 | 文章中未提及数据集的多样性或适用性相关的限制 | 研究空间转录组学中空间域的识别问题 | DLPFC数据集中的空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 卷积神经网络 | 六边形卷积神经网络(hexCNN) | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 305 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of Acute Myeloid Leukemia Cells Using Methanol Fixation and Cryopreservation
2023-Dec-20, Diseases (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/diseases12010001
PMID:38275564
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研究论文 | 本研究通过甲醇固定和低温保存的方法，对急性髓系白血病细胞进行单细胞转录组分析 | 提出甲醇固定法作为常规临床使用的替代方法，用于获取难以活检的细胞进行单细胞RNA测序 | 观察到甲醇固定超过一年后会出现遗传性退化 | 探讨甲醇固定法在急性髓系白血病细胞单细胞转录组分析中的应用及其效果 | 急性髓系白血病细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个急性髓系白血病样本 | NA | NA | NA | NA |
| 306 | 2024-08-07 |
PIM kinases regulate early human Th17 cell differentiation
2023-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113469
PMID:38039135
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研究论文 | 本研究探讨了PIM激酶家族在人类Th17细胞分化早期的转录基因调控中的作用 | 首次全面研究了PIM1、PIM2和PIM3在人类Th17细胞分化早期的分子功能 | NA | 探讨PIM激酶在人类Th17细胞分化中的作用及其与自身免疫表型的关联 | PIM激酶家族及其在Th17细胞分化中的调控作用 | 免疫学 | 自身免疫病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 307 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing uncovers the cell type-dependent transcriptomic changes in the retrosplenial cortex after peripheral nerve injury
2023-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113551
PMID:38048224
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了外周神经损伤后后侧皮质（RSC）的细胞类型依赖性转录组变化 | 首次揭示了RSC在疼痛调节中的作用，并展示了通过化学遗传学方法减少特定神经元活动可以缓解神经损伤引起的疼痛 | NA | 探究外周神经损伤后RSC在疼痛调节中的作用及其分子机制 | 小鼠的RSC在神经损伤后的转录组变化 | 数字病理学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 308 | 2024-08-07 |
SPIDE: A single cell potency inference method based on the local cell-specific network entropy
2023-12, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2023.11.006
PMID:37952704
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研究论文 | 本文提出了一种基于细胞特异性网络熵的单细胞潜能推断方法SPIDE，通过引入局部加权细胞特异性网络来保持细胞异质性，并结合基因表达与网络结构计算熵值 | SPIDE方法通过引入局部加权细胞特异性网络，有效解决了现有方法中由于scRNA-seq数据不准确交互和噪声导致的推断不准确问题 | NA | 旨在准确推断单细胞RNA-seq数据中的细胞分化潜能 | 单细胞RNA-seq数据中的细胞分化潜能 | 生物信息学 | 结直肠癌 | scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 八个scRNA-Seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 309 | 2024-08-05 |
Exploring distinct properties of endometrial stem cells through advanced single-cell analysis platforms
2023-12-20, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03616-w
PMID:38124100
|
综述 | 本研究综述了先进的单细胞分析技术在子宫内膜干细胞研究中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组学等新技术在识别和表征子宫内膜干细胞群体方面的创新 | 现有技术仍存在许多需要改进的技术局限性 | 探索子宫内膜干细胞在相关疾病中的重要性 | 子宫内膜干细胞及其在月经周期和分化过程中的动态变化 | 数字病理 | 子宫内膜疾病 | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序，空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 310 | 2024-08-07 |
PD-L1 expression levels in mesenchymal stromal cells predict their therapeutic values for autoimmune hepatitis
2023-12-18, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03594-z
PMID:38111045
|
研究论文 | 本研究探讨了间充质基质细胞中PD-L1表达水平对其治疗自身免疫性肝炎疗效的预测作用 | 首次揭示了PD-L1表达水平与间充质基质细胞治疗自身免疫性肝炎疗效之间的正相关关系 | 研究仅限于从58个人类供体中分离的Wharton's jelly衍生的间充质基质细胞，且使用小鼠模型进行验证 | 探索间充质基质细胞中PD-L1表达水平作为选择治疗自身免疫性肝炎最佳细胞的指标 | 间充质基质细胞（MSCs）及其在自身免疫性肝炎治疗中的应用 | NA | 自身免疫性疾病 | 转录组和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 58个不同供体来源的Wharton's jelly衍生的间充质基质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 311 | 2024-08-05 |
Spatiotemporal transcriptome atlas reveals the regional specification of the developing human brain
2023-12-21, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.11.016
PMID:38091994
|
research paper | 本研究构建了人脑发育的时空转录组图谱，揭示了不同功能区域的特征 | 本研究结合空间转录组学和单细胞RNA测序，探索了人脑发育期间的区域特异性，对于人脑发育的理解具有创新性 | 研究主要集中在妊娠6-23周的时间段，可能未覆盖更早或更晚的发育阶段 | 旨在揭示人脑发育过程中不同区域的特异性 | 研究对象包括在妊娠6-23周内发育的多个人脑区域 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学（scStereo-seq）和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 6-23周妊娠的多个人脑区域样本 | NA | NA | NA | NA |
| 312 | 2024-08-05 |
Choroid plexus mast cells drive tumor-associated hydrocephalus
2023-12-21, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.11.001
PMID:38056463
|
研究论文 | 本研究揭示了脉络丛肥大细胞在肿瘤相关性脑积水中的作用 | 首次确定脉络丛肥大细胞通过特定途径影响脑脊液生成，并提出针对该途径的治疗方法 | 研究主要集中在小鼠模型和类人胚胎干细胞衍生的脉络丛类器官上，缺乏大规模临床试验数据 | 探究导致肿瘤相关性脑积水的具体机制 | 脉络丛肥大细胞及其在肿瘤相关性脑积水中的作用 | 数字病理学 | 脑转移癌 | 单核RNA测序和空间转录组学 | 生物模型 | 生物样本 | 包含小鼠模型和人类脉络丛的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 313 | 2024-08-05 |
Systematic analysis of apoptosis-related genes in the prognosis of lung squamous cell carcinoma: a combined single-cell RNA sequencing study
2023-Dec-30, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-23-1712
PMID:38249925
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研究论文 | 本研究分析了与肺鳞状细胞癌预后相关的凋亡相关基因。 | 构建了一个基于凋亡相关基因的预后风险模型，并通过单细胞RNA测序提供了肿瘤发展新见解。 | 未提及研究的局限性 | 探讨凋亡相关基因在肺鳞状细胞癌预后中的价值。 | 与肺鳞状细胞癌相关的凋亡相关基因。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 314 | 2024-08-07 |
A novel role of TGFBI in macrophage polarization and macrophage-induced pancreatic cancer growth and therapeutic resistance
2023-12-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2023.216457
PMID:37865162
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研究论文 | 本研究探讨了TGFBI在巨噬细胞极化和巨噬细胞诱导的胰腺癌生长及治疗抵抗中的新作用 | 首次发现TGFBI作为肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）产生的因子，在胰腺癌中发挥关键作用，并通过单细胞RNA测序技术验证了其功能 | NA | 揭示TGFBI在胰腺癌发展中的作用，并探索其作为治疗靶点的可能性 | TGFBI在巨噬细胞极化和胰腺癌生长中的作用 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用siRNA和Cre-Lox策略在体外和体内进行了实验 | NA | NA | NA | NA |
| 315 | 2024-08-05 |
Multi-omics analysis in developmental bone biology
2023-Dec, The Japanese dental science review
DOI:10.1016/j.jdsr.2023.10.006
PMID:38022387
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研究论文 | 本文探讨了单细胞组学和多组学在骨生物学中的应用，揭示了骨细胞的多样性和动态过程 | 发现了新的骨骼干细胞亚型，并通过单细胞多组学提供了对细胞未来状态及其分化潜力的预测 | 需要通过组织学方法进行体内验证以解释计算预测 | 研究骨生物学中细胞的分化及其在骨生长和再生中的作用 | 骨骼干细胞及其在复杂组织结构中的动态交互 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达，染色质可及性 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 316 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals spatial distribution of IL34+ cancer-associated fibroblasts in hepatocellular carcinoma tumor microenvironment
2023-Dec-11, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-023-00483-9
PMID:38081923
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术揭示了肝细胞癌肿瘤微环境中IL34+癌症相关成纤维细胞的空间分布特征 | 首次通过单细胞转录组测序技术详细分析了IL34+癌症相关成纤维细胞在肝细胞癌中的作用机制 | 研究主要集中在体外和体内实验验证，可能需要更多的临床数据支持 | 探究IL34+癌症相关成纤维细胞在肝细胞癌肿瘤微环境中的作用及其分子机制 | 肝细胞癌组织中的IL34+癌症相关成纤维细胞及其与T细胞和肝细胞癌细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 涉及肝细胞癌组织的单细胞转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 317 | 2024-08-05 |
Decoding mTOR signalling heterogeneity in the tumour microenvironment using multiplexed imaging and graph convolutional networks
2023-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.30.573693
PMID:38234756
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研究论文 | 这篇文章探讨了肿瘤微环境中mTOR信号的异质性及其对患者预后的影响 | 使用高度多重化的数据集和图卷积网络揭示了mTOR信号在肿瘤和免疫区室中的异质激活模式 | 本文未提及任何限制 | 研究肿瘤微环境中mTOR信号对结直肠肿瘤患者预后的影响 | 746个结直肠肿瘤样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多重成像 | 图神经网络 | 标记数据 | 746个肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 318 | 2024-08-07 |
Phospholipase A2 Group IIA Is Associated with Inflammatory Hepatocellular Adenoma
2023-Dec-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16010159
PMID:38201587
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研究论文 | 本研究旨在全面调查肝细胞腺瘤（HCA）的亚型分类，并比较分析HCA和肝细胞癌（HCC）组织之间的基因表达谱 | 发现磷脂酶A2组IIA（PLA2G2A）mRNA在炎症性HCA中特异性表达，这可能有助于炎症性HCA的新定义 | 研究结果需要通过其他新鲜HCA样本进行验证 | 研究HCA的亚型分类及其与HCC的基因表达差异 | 炎症性HCA、非B非C HCC、乙型肝炎病毒相关HCC及正常肝组织 | NA | 肝细胞腺瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 1个炎症性HCA，3个非B非C HCC，2个乙型肝炎病毒相关HCC，1个正常肝组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 319 | 2024-08-05 |
Biomarkers in Cancer Detection, Diagnosis, and Prognosis
2023-Dec-20, Sensors (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/s24010037
PMID:38202898
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综述 | 该论文描述了在癌症检测和诊断中适用的各种生物标志物 | 该文综述了影像学、血液、细胞成像、组织成像和基因方面的生物标志物在癌症中的应用 | 该文未提及研究的具体限制 | 探讨生物标志物在癌症检测、诊断和预后中的重要性 | 文中涉及的研究对象包括用于癌症检测和诊断的各种生物标志物 | 数字病理学 | 癌症 | 影像学诊断、血基生物标志物、细胞成像、组织成像、基因组测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 320 | 2024-08-07 |
Machine Learning and Single-Cell Analysis Identify Molecular Features of IPF-Associated Fibroblast Subtypes and Their Implications on IPF Prognosis
2023-Dec-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25010094
PMID:38203265
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研究论文 | 本研究旨在系统分类纤维母细胞群体，揭示纤维化肺组织中纤维母细胞亚型的分子和生物学特征，并建立与IPF相关的纤维母细胞相关预测模型 | 本研究首次使用scRNA-seq数据和hdWGCNA技术，识别出与IPF相关的纤维母细胞亚型及其共表达基因模块，并构建了基于机器学习的IPF纤维母细胞相关预测模型 | NA | 系统分类纤维母细胞群体，揭示其分子和生物学特征，并建立IPF相关的预测模型 | 纤维化肺组织中的纤维母细胞亚型及其分子特征 | 数字病理学 | 肺纤维化 | scRNA-seq, hdWGCNA | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 来自正常和IPF患者的肺组织样本 | NA | NA | NA | NA |