单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 436 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2024-08-05 |
Single-cell Analysis Reveals Inter- and Intratumour Heterogeneity in Metastatic Breast Cancer
2023-12-08, Journal of mammary gland biology and neoplasia
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10911-023-09551-z
PMID:38066300
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研究论文 | 本研究揭示了转移性乳腺癌中的肿瘤间和肿瘤内异质性 | 首次通过单细胞RNA测序识别了与转移相关的分子机制，尤其是在肿瘤和转移细胞状态之间的平衡 | 未深入探讨所有潜在的分子机制，且样本来源于特定的患者衍生模型 | 识别转移过程中，特别是在肿瘤细胞群体形成过程中分子机制 | 乳腺癌患者衍生异种移植物的肿瘤及匹配的肺宏转移 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | RNA数据 | 来源于五种转移性乳腺癌模型的样本 |
| 282 | 2024-08-07 |
[Research progress of single-cell RNA sequencing in airway type 2 inflammatory diseases]
2023-Dec-07, Zhonghua er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Chinese journal of otorhinolaryngology head and neck surgery
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 283 | 2024-08-07 |
Tobacco smoke exposure recruits inflammatory airspace monocytes that establish permissive lung niches for Mycobacterium tuberculosis
2023-12-06, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg3451
PMID:38055798
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研究论文 | 研究烟草烟雾暴露如何通过招募炎症性肺泡单核细胞，为结核分枝杆菌创造允许的肺部环境 | 通过单细胞RNA测序和流式细胞术，识别出与吸烟相关的肺部单核细胞亚群标记物CD93，并揭示了CCR2结合趋化因子在单核细胞招募中的作用 | 研究主要集中在细胞水平，未来研究可以进一步探讨这些细胞在体内对结核分枝杆菌感染的具体影响 | 探讨吸烟如何促进肺部微环境，使其有利于结核分枝杆菌的生长 | 吸烟者和非吸烟者的支气管肺泡灌洗细胞 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 流式细胞术 | NA | 细胞 | 来自吸烟者和非吸烟者的支气管肺泡灌洗细胞 |
| 284 | 2024-08-07 |
Computational identification of key transcription factors for embryonic and postnatal Sox2+ dental epithelial stem cell
2023-Dec-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.22.573158
PMID:38187542
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研究论文 | 本文通过计算方法识别了胚胎期和出生后Sox2+牙上皮干细胞的关键转录因子 | 利用Smart-Seq2协议和ATAC-seq协议生成P2牙上皮干细胞的转录组和染色质可及性图谱，并系统地识别了E11.5细胞和P2细胞的关键转录因子 | 由于DESC标记物的表达水平过低或DESC在整体牙齿中的比例过低，之前的单细胞RNA测序实验未能明确识别出DESC集群 | 研究牙上皮干细胞的基因表达和染色质可及性特征，以识别关键转录因子 | 胚胎期和出生后Sox2+牙上皮干细胞 | NA | NA | Smart-Seq2, ATAC-seq | NA | 转录组, 染色质可及性图谱 | E11.5 Sox2+牙上皮细胞和P2牙上皮干细胞 |
| 285 | 2024-08-07 |
Transcriptomic Landscape of Prurigo Nodularis Lesional Skin CD3+ T Cells Using Single-Cell RNA Sequencing
2023-12, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.05.011
PMID:37263486
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 286 | 2024-08-05 |
Tumor cell-intrinsic SETD2 inactivation sensitizes cancer cells to immune checkpoint blockade through the NR2F1-STAT1 pathway
2023-12-06, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007678
PMID:38056895
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研究论文 | 这篇文章探讨了SETD2失活对癌细胞免疫检查点抑制剂敏感性的影响 | 揭示了SETD2失活通过NR2F1-STAT1通路调节肿瘤免疫，提出了新的潜在治疗生物标志物 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚需进一步验证在人类中的应用 | 探讨SETD2在免疫治疗中的功能及其对免疫反应的调节 | 小鼠肿瘤模型，特别是SETD2失活的肿瘤细胞 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq, 流式细胞术 | NA | RNA数据，流式细胞术数据 | NA |
| 287 | 2024-08-07 |
Targeting integrin α5 in fibroblasts potentiates colorectal cancer response to PD-L1 blockade by affecting extracellular-matrix deposition
2023-12-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007447
PMID:38040421
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研究论文 | 本研究探讨了整合素α5在成纤维细胞中的作用，以及其如何通过影响细胞外基质沉积来增强结直肠癌对PD-L1阻断治疗的反应 | 首次揭示了整合素α5在成纤维细胞中通过影响细胞外基质沉积来调节抗肿瘤免疫的作用，并展示了α5β1抑制与PD-L1阻断联合治疗的疗效 | 研究样本量较小，仅为29名患者，可能影响结果的普遍性 | 研究整合素α5在成纤维细胞中的作用及其在结直肠癌免疫治疗中的效果 | 结直肠癌中的癌症相关成纤维细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 29名结直肠癌患者 |
| 288 | 2024-08-07 |
Molecular traces of Drosophila hemocytes reveal transcriptomic conservation with vertebrate myeloid cells
2023-Dec, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011077
PMID:38113249
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研究论文 | 本研究通过跨物种比较分析，利用单细胞RNA测序数据，探讨了果蝇血细胞与脊椎动物髓系细胞的转录组保守性 | 首次系统地分析了果蝇血细胞与脊椎动物髓系细胞的转录组保守性，并验证了CG8501（CD59）在果蝇血细胞吞噬作用中的功能 | NA | 探讨果蝇血细胞与脊椎动物髓系细胞的转录组保守性，以及免疫系统的进化 | 果蝇血细胞与脊椎动物免疫细胞 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 289 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-sequencing profiles reveal the developmental landscape of the Manihot esculenta Crantz leaves
2023-Dec-30, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiad500
PMID:37706525
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了木薯叶片的发育景观 | 首次构建了木薯叶片的单细胞转录组图谱，并识别了叶片的三大主要组织及其特性和代谢活性 | NA | 探究木薯叶片的结构和光合特性在细胞水平上的表现 | 木薯叶片的细胞结构和光合特性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11,177个高质量叶片细胞 |
| 290 | 2024-08-07 |
Tr1 Cells Emerge and Suppress Effector Th17 Cells in Glomerulonephritis
2023-12-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300305
PMID:37850963
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研究论文 | 本研究探讨了Tr1细胞在肾小球肾炎（GN）中的出现及其抑制效应Th17细胞的功能 | 首次详细研究了Tr1细胞在肾小球肾炎中的出现及其在疾病中的调控功能 | NA | 验证Tr1细胞在实验性肾小球肾炎中的治疗潜力 | Tr1细胞在肾小球肾炎中的作用及其调控机制 | 免疫学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了实验性新月形肾小球肾炎的小鼠模型和双Foxp3mRFP IL-10eGFP报告小鼠，以及抗中性粒细胞胞浆自身抗体相关肾小球肾炎患者的肾脏样本 |
| 291 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome sequencing of plant leaf expressing anti-HER2 VHH-FcK cancer therapeutic protein
2023-Dec-19, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-023-02833-5
PMID:38114492
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了表达抗HER2 VHH-Fc抗癌治疗蛋白的转基因烟草叶片的基因表达模式 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析转基因植物叶片中特定细胞的基因表达模式，以优化重组抗体的生产 | NA | 研究如何通过优化转基因植物的基因表达来提高生物治疗蛋白的生产效率 | 转基因烟草叶片，表达抗HER2 VHH-Fc抗癌治疗蛋白 | 生物技术 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 转基因烟草叶片的特定细胞 |
| 292 | 2024-08-07 |
Single-Cell Atlas of Neonatal Mouse Hearts Reveals an Unexpected Cardiomyocyte
2023-12-05, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.122.028287
PMID:38014657
|
研究论文 | 本文通过设计新生小鼠心脏细胞的分离程序，提供了出生后四个不同阶段心脏细胞的单细胞分辨率详细图谱 | 本文发现了意外的红细胞样心肌细胞-终末期心肌细胞，并提供了心肌细胞与其他心脏细胞之间全面相互作用的初步蓝图 | NA | 研究心肌细胞的异质性并提供在不同生理条件和疾病中的参考 | 新生小鼠心脏的心肌细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞图谱 | 10,000个心肌细胞 |
| 293 | 2024-08-05 |
Unveiling Hypothalamic Molecular Signatures via Retrograde Viral Tracing and Single-Cell Transcriptomics
2023-12-04, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-023-02789-6
PMID:38049462
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研究论文 | 本研究通过逆行病毒追踪和单细胞转录组学揭示了下丘脑分子的特征 | 本研究创新地结合了多样化数据集进行验证，提供了更细致的下丘脑细胞类型多样性 | 本研究的局限性未在摘要中提及 | 深入理解下丘脑神经回路及其分子身份 | 来自CRH-IRES-Cre小鼠的1,533个下丘脑细胞 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 细胞转录组数据 | 1,533个来自CRH-IRES-Cre小鼠的细胞 |
| 294 | 2024-08-07 |
Convergent differentiation of multiciliated cells
2023-12-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-50077-5
PMID:38155158
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研究论文 | 研究通过跨物种数据整合分析了人类和小鼠的鼻上皮细胞、支气管、输卵管和室下区室管膜细胞的单细胞转录组数据，探讨了多纤毛细胞（MCCs）在不同组织中的相似性和差异性 | 研究确认了MCCs在最终分化步骤中具有收敛的基因集表达，为理解发育过程中的纤毛生成提供了新的见解 | NA | 理解多纤毛细胞在多个组织中的相似性和差异性 | 多纤毛细胞在不同组织中的分化过程 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 人类和小鼠的鼻上皮细胞、支气管、输卵管和室下区室管膜细胞 |
| 295 | 2024-08-07 |
Host CD34+ cells are replacing donor endothelium of transplanted heart
2023-12, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2023.08.015
PMID:37634574
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和诱导性谱系追踪小鼠模型，探讨了心脏移植后供体内皮细胞被宿主CD34+细胞替代的机制 | 首次通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术，揭示了宿主CD34+细胞在心脏移植后替代供体内皮细胞的详细过程和机制 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类心脏移植中的适用性需要进一步验证 | 探讨心脏移植后内皮细胞再生的来源及其机制 | 心脏移植后的内皮细胞再生和宿主CD34+细胞的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠模型 |
| 296 | 2024-08-07 |
Colonic L-cell impairment in aged subjects with type 2 diabetes leads to diminished GLP-1 production
2023-Dec, Diabetes & metabolic syndrome
DOI:10.1016/j.dsx.2023.102907
PMID:37980723
|
研究论文 | 研究探讨了2型糖尿病老年患者结肠L细胞功能障碍及其导致GLP-1分泌减少的机制 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了L细胞功能障碍的分子机制，为改善GLP-1分泌提供了新的靶点 | NA | 解析2型糖尿病条件下L细胞生物学变化的机制，为基于肠道的2型糖尿病治疗策略提供研究支持 | 2型糖尿病老年患者的结肠L细胞及其GLP-1分泌功能 | NA | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括年轻和老年2型糖尿病患者以及非糖尿病患者，以及长期高脂肪高果糖饮食诱导的老年2型糖尿病Wistar大鼠模型 |
| 297 | 2024-08-05 |
Unravelling cancer subtype-specific driver genes in single-cell transcriptomics data with CSDGI
2023-Dec, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011450
PMID:38096269
|
研究论文 | 本文开发了一种新的无监督方法CSDGI，用于推断癌症亚型特异性驱动基因 | CSDGI是首个在癌症亚型层面探讨癌症驱动基因的方法 | NA | 旨在推断癌症亚型特异性驱动基因以理解肿瘤异质性 | 肿瘤单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 低秩残差神经网络的编码器-解码器框架 | 转录组数据 | NA |
| 298 | 2024-08-07 |
cellsig plug-in enhances CIBERSORTx signature selection for multidataset transcriptomes with sparse multilevel modelling
2023-12-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad685
PMID:37952182
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为cellsig的贝叶斯稀疏多级模型，旨在通过调整数据以适应多级效应和基因集稀疏性来改进签名估计 | cellsig模型能够处理大规模、异质性的伪批量和批量RNA测序数据集，特别是具有非重叠基因集的数据 | 目前工具如CIBERSORTx的一个限制是无法处理层次数据结构和跨样本的非重叠基因集 | 提高细胞类型标记基因排序性能，促进细胞类型签名选择 | 大规模的伪批量和批量RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 贝叶斯稀疏多级模型 | 转录组数据 | 1435个样本，涵盖58个数据集 |
| 299 | 2024-08-07 |
Targeting of the CD161 Inhibitory Receptor Enhances T cell-mediated Immunity Against Hematological Malignancies
2023-Dec-28, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023022882
PMID:38153903
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研究论文 | 本文研究了CD161抑制性受体在血液恶性肿瘤中的作用，并开发了高亲和力的人源化单克隆抗体，增强了T细胞介导的免疫反应。 | 开发了高亲和力的人源化CD161单克隆抗体，增强了T细胞的细胞毒性、细胞因子和增殖能力，并在人源化小鼠模型中显著提高了生存率。 | NA | 评估CD161受体在血液恶性肿瘤中的作用，并开发新的免疫治疗策略。 | CD161抑制性受体及其配体CLEC2D在血液恶性肿瘤中的表达和功能。 | 免疫学 | 血液恶性肿瘤 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | mRNA，蛋白质 | 多种血液恶性肿瘤细胞系，包括B细胞和T细胞淋巴瘤以及淋巴细胞和髓系白血病。 |
| 300 | 2024-08-07 |
Integrative analysis reveals the recurrent genetic etiologies in idiopathic pulmonary fibrosis
2023-Dec-27, QJM : monthly journal of the Association of Physicians
DOI:10.1093/qjmed/hcad206
PMID:37688571
|
研究论文 | 本研究通过综合分析全外显子测序、批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，揭示了特发性肺纤维化中的复发性遗传病因 | 本研究采用了综合分析方法，结合全外显子测序、批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，以更全面地理解特发性肺纤维化的分子基础 | NA | 旨在通过综合分析遗传变异和转录组改变，提高对特发性肺纤维化分子基础的理解 | 特发性肺纤维化的遗传和转录组变异 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 全外显子测序（WES）、批量RNA测序（RNA-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA |