本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2024-08-07 |
Localizing Hormone Receptor Expression to Cellular Compartments in Idiopathic Subglottic Stenosis
2023-12, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.30856
PMID:37382162
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,定位了特发性声门下狭窄(iSGS)患者中雌激素受体(ESR1和ESR2)和孕激素受体(PGR)在特定细胞亚群中的表达 | 首次通过单细胞RNA测序技术,详细分析了iSGS患者中激素受体在不同细胞亚群中的表达模式 | 研究样本量较小,且仅限于iSGS患者,可能影响结果的普遍性 | 探究雌激素和孕激素受体在iSGS病理发生中的作用机制 | 特发性声门下狭窄(iSGS)患者的气道瘢痕和健康黏膜组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | RNA | 25,974个单独测序的细胞,来自7例声门下瘢痕和3例匹配的无影响黏膜的iSGS患者 | NA | NA | NA | NA |
| 282 | 2024-08-07 |
Predicting drug response from single-cell expression profiles of tumours
2023-12-01, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-023-03182-1
PMID:38041118
|
研究论文 | 本文介绍了DREEP方法,用于从肿瘤单细胞表达谱预测药物反应,并验证了其在多个独立单细胞数据集上的准确性和鲁棒性 | DREEP利用公开的药理基因组屏幕数据和功能富集分析,从转录组数据预测单细胞药物敏感性 | NA | 提高癌症治疗的疗效和精确性 | 肿瘤单细胞表达谱和药物反应 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 计算方法 | 转录组数据 | 超过200个癌症细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 283 | 2024-08-04 |
Bexmarilimab-induced macrophage activation leads to treatment benefit in solid tumors: The phase I/II first-in-human MATINS trial
2023-12-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101307
PMID:38056464
|
研究论文 | 本研究探讨了bexmarilimab对治疗难治性实体肿瘤患者的安全性和耐受性。 | 首次在人类中研究Clever-1阻断的疗效,并显示了bexmarilimab诱导的巨噬细胞激活对成瘤免疫的积极影响。 | 本研究主要集中于早期的安全性和耐受性评估,缺乏长期疗效的完整数据。 | 评估bexmarilimab对治疗难治性实体肿瘤患者的初步抗肿瘤疗效及免疫相关性。 | 治疗难治性实体肿瘤患者,参与者总数为138。 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤、胃癌、肝细胞癌、雌激素受体阳性乳腺癌和胆道癌 | NA | NA | 临床试验数据 | 138名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 284 | 2024-08-07 |
iPSC-derived hypoimmunogenic tissue resident memory T cells mediate robust anti-tumor activity against cervical cancer
2023-12-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101327
PMID:38091985
|
研究论文 | 本文开发了一种HLA-A24&-E双整合的HPV-rejTs,通过消除HLA I类抗原来有效抑制受体免疫排斥,同时保持比原始细胞毒性T淋巴细胞更强的细胞毒性 | 通过单细胞RNA测序发现HPV-rejTs富含组织驻留记忆T细胞,增强了通过TGFβR信号通路对宫颈癌的细胞毒性,并上调了与免疫突触相关的基因,促进了T细胞受体(TCR)的更强激活和TCR介导的目标细胞死亡 | NA | 开发一种可行的“即用型”T细胞疗法,具有强大的抗宫颈癌效果 | 从诱导多能干细胞生成的功能性恢复的人乳头瘤病毒特异性细胞毒性T淋巴细胞(HPV-rejTs) | 免疫学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 285 | 2024-08-07 |
Dapagliflozin protects against chronic heart failure in mice by inhibiting macrophage-mediated inflammation, independent of SGLT2
2023-12-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101334
PMID:38118414
|
研究论文 | 本研究使用SGLT2全局敲除小鼠评估SGLT2抑制剂对心力衰竭的作用机制,发现达格列净通过抑制巨噬细胞介导的炎症来保护心脏,且这一作用独立于SGLT2。 | 达格列净对心力衰竭的保护作用独立于SGLT2,主要通过抑制巨噬细胞炎症来实现。 | NA | 阐明SGLT2抑制剂在心力衰竭中的具体作用机制。 | SGLT2全局敲除小鼠及其在心肌梗死和主动脉缩窄诱导的心力衰竭模型中的表现。 | 心血管疾病 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | SGLT2全局敲除小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 286 | 2024-08-04 |
CD4+ T cells are homeostatic regulators during Mtb reinfection
2023-Dec-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.20.572669
PMID:38187598
|
研究论文 | 该文研究了CD4+ T细胞在Mtb再感染期间的调节作用 | 研究表明CD4 T细胞在再感染环境中通过减少肺部炎症和调节CD8 T细胞活性来提供长期的保护作用 | 目前对再感染后肺部细胞环境的变化了解仍然有限 | 探讨CD4 T细胞在Mtb再感染中的作用及其对疾病严重性的影响 | 采用非人灵长类动物的再感染模型观察CD4 T细胞对保护反应的影响 | 免疫学 | 结核病 | PET-CT、流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 临床和微生物学数据 | 非人灵长类动物模型 | NA | NA | NA | NA |
| 287 | 2024-08-07 |
Single-cell morphological and transcriptome analysis unveil inhibitors of polyploid giant breast cancer cells in vitro
2023-12-21, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05674-5
PMID:38129519
|
研究论文 | 本文通过单细胞形态学和转录组分析,识别了抑制体外多倍体巨型乳腺癌细胞的化合物 | 建立了高吞吐量和精确度的单细胞形态学分析流程,并结合scRNA-Seq技术,揭示了乳腺癌多倍体巨型细胞的细胞周期、代谢和铁死亡敏感性的变化 | NA | 发现有效的抗多倍体巨型癌细胞化合物 | 多倍体巨型乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-Seq | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 288 | 2024-08-04 |
A neuronal coping mechanism linking stress-induced anxiety to motivation for reward
2023-12-08, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adh9620
PMID:38055830
|
研究论文 | 这篇文章展示了急性压力如何通过激活小鼠的GABA能神经元影响焦虑和奖励动机。 | 研究揭示了应激、焦虑与动机之间的神经基础,并首次探索IPN GABA能神经元在应激应对机制中的作用。 | 研究主要在小鼠模型中进行,是否适用于其他物种尚不明确。 | 本研究旨在揭示压力如何通过神经机制影响焦虑和奖励动机。 | 本研究的对象为小鼠,特别是研究其GABA能神经元的活动。 | 神经科学 | 焦虑症 | 光遗传学,单细胞测序,光纤光度测定 | NA | 生物体实验数据 | 使用多个小鼠进行实验,具体样本数量未在摘要中明确 | NA | NA | NA | NA |
| 289 | 2024-08-04 |
Spatial gene expression in the adult rat patellar tendon
2023-Dec, Matrix biology plus
DOI:10.1016/j.mbplus.2023.100138
PMID:38124714
|
研究论文 | 本研究探讨了成年大鼠髌腱的空间基因表达特征 | 发现了一个新的空间调控基因(AABR07000398.1),其功能尚不明确 | 仅使用了两份雄性大鼠髌腱样本,样本量较小 | 确定髌腱的基因表达谱及其空间分布 | 雄性大鼠的髌腱样本 | 数字病理 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 2个雄性大鼠髌腱样本 | NA | NA | NA | NA |
| 290 | 2024-08-04 |
Semi-reference based cell type deconvolution with application to human metastatic cancers
2023-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqad109
PMID:38143958
|
研究论文 | 本研究介绍了一种新颖的解卷积方法SECRET,用于从大规模RNA-seq数据中准确估计细胞类型比例 | SECRET方法允许在参考数据中未代表的细胞类型情况下灵活选择参考数据,并且在合成数据上表现出优越的准确性 | 未提及具体的限制信息 | 研究如何从大规模RNA-seq数据中提取细胞类型特异性信息 | 研究以人类转移性癌症为对象 | 数字病理学 | 癌症 | RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 291 | 2024-08-07 |
Antibody dependent cell-mediated cytotoxicity selection pressure induces diverse mechanisms of resistance
2023-12-31, Cancer biology & therapy
IF:4.4Q2
DOI:10.1080/15384047.2023.2269637
PMID:37878417
|
研究论文 | 本研究探讨了抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)选择压力下肿瘤细胞的抗性机制 | 揭示了ADCC选择压力下肿瘤细胞的共享和独特抗性机制,并利用单细胞RNA测序和蛋白质组筛选探究了分子抗性机制 | ADCC抗性无法通过组合治疗策略逆转 | 研究ADCC选择压力下的肿瘤细胞抗性机制 | ADCC抗性机制及肿瘤细胞的免疫逃逸策略 | NA | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组筛选 | NA | RNA,蛋白质 | 多个ADCC选择压力模型中的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 292 | 2024-08-07 |
FGFR3 Alterations in Bladder Cancer Stimulate Serine Synthesis to Induce Immune-Inert Macrophages That Suppress T-cell Recruitment and Activation
2023-12-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1065
PMID:37768887
|
研究论文 | 本文研究了膀胱癌中FGFR3突变如何通过增加丝氨酸合成诱导免疫惰性巨噬细胞,从而抑制T细胞招募和激活 | 发现FGFR3突变通过增加丝氨酸合成在膀胱癌细胞中诱导免疫惰性巨噬细胞,为改善治疗反应提供了新策略 | NA | 探讨FGFR3突变在膀胱癌中的免疫抑制机制,并评估联合治疗策略的有效性 | 膀胱癌中的FGFR3突变、巨噬细胞和T细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 293 | 2024-08-05 |
Identification and targeting of cancer-associated fibroblast signature genes for prognosis and therapy in Cutaneous melanoma
2023-12, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107597
PMID:37875042
|
研究论文 | 本研究探讨了与皮肤黑素瘤相关的癌症相关成纤维细胞(CAF)标志基因,并提出潜在的治疗靶点 | 首次识别了FBLN1和COL5A1作为皮肤黑素瘤的CAF特异性生物标志物,提供了新的治疗方向 | 尚需更多临床数据验证所识别的CAF标志基因与预后的相关性 | 探索皮肤黑素瘤中CAF标志基因的潜力并提出治疗靶点 | 癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 数字病理学 | 皮肤黑素瘤 | 加权基因共表达网络分析、单细胞测序分析、空间转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 294 | 2024-08-07 |
Thymic Carcinoma: Unraveling Neuroendocrine Differentiation and Epithelial Cell Identity Loss
2023-12-25, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16010115
PMID:38201543
|
研究论文 | 本文探讨了胸腺癌的神经内分泌分化及上皮细胞身份丧失的基因表达特征 | 发现胸腺癌表现出偏向于簇细胞和离子细胞的神经内分泌表型,并鉴定了HDAC9和NFATC1作为神经内分泌组在成人胸腺上皮细胞和胸腺癌中的特征性表达 | 需要进一步研究HDAC9和NFATC1在胸腺上皮中的作用及其作为胸腺上皮肿瘤治疗靶点的潜力 | 探索胸腺癌的神经内分泌分化及上皮细胞身份丧失的机制 | 胸腺癌的基因表达特征及其与簇细胞、离子细胞和神经内分泌细胞的关系 | 数字病理学 | 胸腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自正常人胸腺的单细胞RNA测序数据集,并分析了公开的胸腺上皮细胞和肺癌的mRNA表达及甲基化状态数据 | NA | NA | NA | NA |
| 295 | 2024-08-05 |
RENGE infers gene regulatory networks using time-series single-cell RNA-seq data with CRISPR perturbations
2023-12-28, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05594-4
PMID:38155269
|
research paper | 本研究提出了RENG,利用时间序列单细胞CRISPR数据推断基因调控网络 | RENG能够区分直接和间接调控,超越当前方法在基因调控网络推断的准确性 | 该方法的局限性在于依赖于时间序列单细胞数据 | 研究目的是推断基因调控网络 | 研究对象为人诱导多能干细胞的单细胞RNA-seq数据 | 数字病理 | NA | CRISPR扰动 | NA | 单细胞RNA-seq | 来自人诱导多能干细胞的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 296 | 2024-08-05 |
scPML: pathway-based multi-view learning for cell type annotation from single-cell RNA-seq data
2023-12-14, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05634-z
PMID:38097699
|
研究论文 | 本文提出了scPML模型,该模型通过不同的基因信号通路数据来进行细胞类型注释 | scPML模型利用基因信号通路数据来分割细胞的遗传特征,改善了细胞注释的泛化能力和鲁棒性 | 现有方法在细胞注释任务中缺乏良好的泛化性和鲁棒性,尤其在技术差异和基因异质性方面存在挑战 | 本文旨在提升单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性 | 研究对象为不同物种、平台和组织中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因信号通路数据 | 涉及多个物种和组织的细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 297 | 2024-08-07 |
Single-cell map of dynamic cellular microenvironment of radiation-induced intestinal injury
2023-12-09, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05645-w
PMID:38071238
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,描绘了辐射诱导肠道损伤(RIII)及其再生过程中肠道微环境的动态变化图谱 | 揭示了肠道不同细胞类型的异质性辐射敏感性,以及肠道干细胞(ISCs)的动态变化模式和细胞间的复杂转换模式 | NA | 探究辐射诱导肠道损伤及其再生过程中肠道微环境的动态变化 | 肠道微环境中的细胞类型及其在辐射损伤后的动态变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 298 | 2024-08-05 |
Iron inhibits glioblastoma cell migration and polarization
2023-12, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202202157RR
PMID:37983646
|
研究论文 | 这篇文章探讨了铁如何影响胶质母细胞瘤细胞的迁移能力和极性。 | 本研究首次系统性地调查了细胞内铁含量对胶质母细胞瘤细胞迁移能力的影响。 | 该研究未能全面探讨铁对胶质母细胞瘤细胞其他生物学特性的影响。 | 研究细胞内铁含量对胶质母细胞瘤细胞迁移及极性建立的影响。 | 人类胶质母细胞瘤细胞及其在肿瘤微环境中的行为。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 使用了人类胶质母细胞瘤样本的单细胞RNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 299 | 2024-08-07 |
Exploring the Functional Heterogeneity of Directly Reprogrammed Neural Stem Cell-Derived Neurons via Single-Cell RNA Sequencing
2023-12-11, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12242818
PMID:38132138
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术探索了直接重编程神经干细胞衍生神经元的功能异质性 | 本文首次通过单细胞RNA测序分析了直接重编程神经干细胞及其衍生神经元的功能异质性,并揭示了细胞命运调控因子 | 本文未详细讨论直接重编程神经干细胞在临床应用中的具体挑战和解决方案 | 研究直接重编程神经干细胞衍生神经元的功能异质性,以提高其在神经退行性疾病治疗中的应用质量 | 直接重编程神经干细胞及其衍生神经元 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及人纤维母细胞、直接重编程神经干细胞及其衍生神经元的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 300 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis of corneal organoids during development
2023-12-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.10.022
PMID:38039970
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人诱导多能干细胞(iPSC)衍生的角膜类器官在1至4个月发育过程中的细胞异质性 | 首次详细描述了角膜类器官在成熟过程中的细胞组成和分化动态 | NA | 研究角膜类器官在不同发育阶段的细胞异质性及其与胎儿角膜发育的比较 | 人诱导多能干细胞衍生的角膜类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 1至4个月大的角膜类器官样本 | NA | NA | NA | NA |