单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 436 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-08-05 |
Multi-omics analysis in developmental bone biology
2023-Dec, The Japanese dental science review
DOI:10.1016/j.jdsr.2023.10.006
PMID:38022387
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研究论文 | 本文探讨了单细胞组学和多组学在骨生物学中的应用，揭示了骨细胞的多样性和动态过程 | 发现了新的骨骼干细胞亚型，并通过单细胞多组学提供了对细胞未来状态及其分化潜力的预测 | 需要通过组织学方法进行体内验证以解释计算预测 | 研究骨生物学中细胞的分化及其在骨生长和再生中的作用 | 骨骼干细胞及其在复杂组织结构中的动态交互 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达，染色质可及性 | NA |
| 262 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals variations in monocytes and Tregs between gout flare and remission
2023-Dec-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.171417
PMID:38063198
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研究论文 | 这项研究揭示了痛风发作与缓解过程中单细胞转录组中单核细胞和调节性T细胞的变化 | 识别了与痛风发作相关的HLA-DQA1+非经典单核细胞，上调与抗原处理和呈递相关 | 缺乏对痛风发作机制的全面理解与其他炎性疾病的比较 | 研究痛风发作与缓解中免疫细胞反应和系统性炎症模式 | 对比分析了痛风发作和缓解阶段的单核细胞及调节性T细胞 | 数字病理学 | 痛风 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用独立验证队列进行分析 |
| 263 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals spatial distribution of IL34+ cancer-associated fibroblasts in hepatocellular carcinoma tumor microenvironment
2023-Dec-11, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-023-00483-9
PMID:38081923
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术揭示了肝细胞癌肿瘤微环境中IL34+癌症相关成纤维细胞的空间分布特征 | 首次通过单细胞转录组测序技术详细分析了IL34+癌症相关成纤维细胞在肝细胞癌中的作用机制 | 研究主要集中在体外和体内实验验证，可能需要更多的临床数据支持 | 探究IL34+癌症相关成纤维细胞在肝细胞癌肿瘤微环境中的作用及其分子机制 | 肝细胞癌组织中的IL34+癌症相关成纤维细胞及其与T细胞和肝细胞癌细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 涉及肝细胞癌组织的单细胞转录组数据集 |
| 264 | 2024-08-05 |
Decoding mTOR signalling heterogeneity in the tumour microenvironment using multiplexed imaging and graph convolutional networks
2023-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.30.573693
PMID:38234756
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研究论文 | 这篇文章探讨了肿瘤微环境中mTOR信号的异质性及其对患者预后的影响 | 使用高度多重化的数据集和图卷积网络揭示了mTOR信号在肿瘤和免疫区室中的异质激活模式 | 本文未提及任何限制 | 研究肿瘤微环境中mTOR信号对结直肠肿瘤患者预后的影响 | 746个结直肠肿瘤样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多重成像 | 图神经网络 | 标记数据 | 746个肿瘤样本 |
| 265 | 2024-08-05 |
Pancancer analysis reveals the role of disulfidptosis in predicting prognosis, immune infiltration and immunotherapy response in tumors
2023-Dec-29, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000036830
PMID:38206694
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研究论文 | 本研究构建了多组学数据分析，揭示了二硫化死亡在肿瘤中的作用。 | 提出了二硫化死亡作为癌症治疗的新策略，并系统分析了其在多种肿瘤中的作用。 | 样本规模和数据库选择可能影响结果的普遍性。 | 探讨二硫化死亡在预测肿瘤预后、免疫浸润和免疫治疗反应中的作用。 | 33种肿瘤的数据以及与二硫化死亡相关的基因。 | 数字病理学 | NA | 多组学数据分析 | NA | 基因表达数据 | 33种肿瘤 |
| 266 | 2024-08-05 |
Neural tube-associated boundary caps are a major source of mural cells in the skin
2023-Dec-14, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.69413
PMID:38095361
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研究论文 | 本文研究了神经管相关的边界帽细胞在皮肤血管中作为重要的壁细胞来源的作用 | 揭示了边界帽细胞衍生物的多样性及其在小鼠皮肤中的壁细胞来源的潜力 | 研究主要基于小鼠模型，结果的普遍适用性仍需进一步验证 | 探讨边界帽细胞在皮肤血管发育中的作用 | 小鼠中的边界帽细胞衍生物 | NA | NA | Cre基础报告细胞追踪和单细胞转录组学 | NA | NA | 小鼠模型中涉及的数量未具体说明 |
| 267 | 2024-08-07 |
Phospholipase A2 Group IIA Is Associated with Inflammatory Hepatocellular Adenoma
2023-Dec-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16010159
PMID:38201587
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研究论文 | 本研究旨在全面调查肝细胞腺瘤（HCA）的亚型分类，并比较分析HCA和肝细胞癌（HCC）组织之间的基因表达谱 | 发现磷脂酶A2组IIA（PLA2G2A）mRNA在炎症性HCA中特异性表达，这可能有助于炎症性HCA的新定义 | 研究结果需要通过其他新鲜HCA样本进行验证 | 研究HCA的亚型分类及其与HCC的基因表达差异 | 炎症性HCA、非B非C HCC、乙型肝炎病毒相关HCC及正常肝组织 | NA | 肝细胞腺瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 1个炎症性HCA，3个非B非C HCC，2个乙型肝炎病毒相关HCC，1个正常肝组织样本 |
| 268 | 2024-08-05 |
Biomarkers in Cancer Detection, Diagnosis, and Prognosis
2023-Dec-20, Sensors (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/s24010037
PMID:38202898
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综述 | 该论文描述了在癌症检测和诊断中适用的各种生物标志物 | 该文综述了影像学、血液、细胞成像、组织成像和基因方面的生物标志物在癌症中的应用 | 该文未提及研究的具体限制 | 探讨生物标志物在癌症检测、诊断和预后中的重要性 | 文中涉及的研究对象包括用于癌症检测和诊断的各种生物标志物 | 数字病理学 | 癌症 | 影像学诊断、血基生物标志物、细胞成像、组织成像、基因组测序 | NA | NA | NA |
| 269 | 2024-08-07 |
Machine Learning and Single-Cell Analysis Identify Molecular Features of IPF-Associated Fibroblast Subtypes and Their Implications on IPF Prognosis
2023-Dec-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25010094
PMID:38203265
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研究论文 | 本研究旨在系统分类纤维母细胞群体，揭示纤维化肺组织中纤维母细胞亚型的分子和生物学特征，并建立与IPF相关的纤维母细胞相关预测模型 | 本研究首次使用scRNA-seq数据和hdWGCNA技术，识别出与IPF相关的纤维母细胞亚型及其共表达基因模块，并构建了基于机器学习的IPF纤维母细胞相关预测模型 | NA | 系统分类纤维母细胞群体，揭示其分子和生物学特征，并建立IPF相关的预测模型 | 纤维化肺组织中的纤维母细胞亚型及其分子特征 | 数字病理学 | 肺纤维化 | scRNA-seq, hdWGCNA | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 来自正常和IPF患者的肺组织样本 |
| 270 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing highlights heterogeneity and malignant progression in actinic keratosis and cutaneous squamous cell carcinoma
2023-Dec-15, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.85270
PMID:38099574
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序揭示了光敏性角化病和皮肤鳞状细胞癌的异质性和恶性进展 | 首次全面描绘了从正常皮肤到AK再到侵袭性cSCC的整个进展机制，并识别出多个关键驱动基因 | 样本量较小，仅涉及六名患者的13个样本 | 研究光敏性角化病和皮肤鳞状细胞癌的进展机制 | 138,982个来自不同病理状态（AK、SCCIS、cSCC及其匹配正常组织）细胞的转录组 | 数字病理 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞转录组数据 | 六名患者的13个样本 |
| 271 | 2024-08-07 |
Transcriptomic analysis of sorted lung cells revealed a proviral activity of the NF-κB pathway toward SARS-CoV-2
2023-Dec-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108449
PMID:38213785
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研究论文 | 本研究通过深度polyA+转录组分析和新型RNA分析，研究了严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）感染的肺上皮细胞的转录组变化 | 本研究首次揭示了NF-κB通路在SARS-CoV-2感染中的促病毒作用，并发现了CYLD作为该通路的负调控因子具有抗病毒活性 | 研究主要集中在细胞水平，未涉及临床样本或动物模型 | 探讨SARS-CoV-2感染肺上皮细胞的转录组响应和相关调控机制 | SARS-CoV-2感染的肺上皮细胞 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 272 | 2024-08-07 |
FEZ1 participates in human embryonic brain development by modulating neuronal progenitor subpopulation specification and migrations
2023-Dec-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108497
PMID:38213789
|
研究论文 | 本研究探讨了FEZ1蛋白在人类胚胎大脑发育中的作用，特别是在神经前体细胞亚群的分化和迁移中的作用 | 首次使用人类大脑类器官（hCOs）研究FEZ1在早期大脑发育中的表达及其对神经和突触发育基因表达的影响 | NA | 研究FEZ1在人类胚胎大脑发育中的作用及其对神经发育障碍的影响 | FEZ1蛋白及其在神经前体细胞亚群分化和迁移中的作用 | NA | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 273 | 2024-08-05 |
Uncovering the Genetic Basis of Congenital Heart Disease: Recent Advancements and Implications for Clinical Management
2023-Dec, CJC pediatric and congenital heart disease
DOI:10.1016/j.cjcpc.2023.10.008
PMID:38205435
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研究论文 | 本研究揭示了先天性心脏病的遗传基础及其对临床管理的影响 | 指出了基因组测序技术对理解先天性心脏病遗传基础的变革性影响 | 临床基于这些因素的风险预测仍然面临挑战 | 旨在深入理解先天性心脏病的遗传基础，以改善临床结果 | 分析先天性心脏病相关的遗传变异与临床结果之间的关联 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 下一代测序技术 | 人诱导多能干细胞模型 | NA | NA |
| 274 | 2024-08-05 |
Intratumor heterogeneity: models of malignancy emergence and evolution
2023-Dec, Vavilovskii zhurnal genetiki i selektsii
IF:0.9Q3
DOI:10.18699/VJGB-23-94
PMID:38213707
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研究论文 | 本文探讨了癌症内肿瘤异质性的演变及其模型 | 提出了从进化理论的角度理解肿瘤作为复杂生态系统的观点 | 未具体细述不同方法的局限性 | 旨在揭示影响肿瘤异质性的机制以改善癌症治疗 | 探索肿瘤内的遗传和表观遗传变化 | 数字病理学 | 癌症 | 下一代测序，荧光原位杂交，单细胞测序 | 计算模型和算法 | 基因组数据，单细胞数据 | NA |
| 275 | 2024-08-05 |
TrkA-mediated sensory innervation of injured mouse tendon supports tendon sheath progenitor cell expansion and tendon repair
2023-12-20, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.ade4619
PMID:38117901
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研究论文 | 本研究探讨外周神经在小鼠肌腱损伤与修复中的作用 | 首次揭示外周神经通过调控神经生长因子和TGFβ信号通路促进肌腱细胞的扩展与修复 | 需要进一步研究去神经化对肌腱机械负荷的潜在影响 | 研究外周神经在小鼠肌腱损伤后的修复过程中的作用 | 小鼠肌腱及其神经生长与修复机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 组织样本 | 小鼠以及人类肌腱活检样本 |
| 276 | 2024-08-07 |
Autologous Airway Basal Cell Transplantation Alleviates Airway Epithelium Defect in Recurrent Benign Tracheal Stenosis
2023-Dec-18, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szad062
PMID:37804518
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研究论文 | 本文研究了自体气道基底细胞移植在恢复良性复发性气管狭窄中气道稳态的作用 | 首次探讨了自体气道基底细胞移植与生物胶结合使用在犬模型中的治疗效果 | 研究仅在犬模型中进行，尚未在人类中验证 | 探索自体气道基底细胞移植在治疗良性复发性气管狭窄中的应用 | 良性复发性气管狭窄患者及犬模型 | NA | 良性气管狭窄 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 研究包括多个犬模型组别，具体数量未详细说明 |
| 277 | 2024-08-07 |
Diversity of intratumoral regulatory T cells in B-cell non-Hodgkin lymphoma
2023-12-12, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023010158
PMID:37695745
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序结合高维流式细胞术，解析了弥漫大B细胞淋巴瘤和滤泡淋巴瘤中肿瘤内调节性T细胞的异质性 | 首次揭示了B细胞非霍奇金淋巴瘤中肿瘤内调节性T细胞的三个不同转录状态，并发现激活的调节性T细胞在肿瘤组织中富集，具有更强的免疫抑制活性 | 研究主要集中在弥漫大B细胞淋巴瘤和滤泡淋巴瘤，其他类型的B细胞非霍奇金淋巴瘤的调节性T细胞异质性尚未探讨 | 探讨B细胞非霍奇金淋巴瘤中肿瘤内调节性T细胞的异质性及其对预后的影响 | 弥漫大B细胞淋巴瘤和滤泡淋巴瘤中的肿瘤内调节性T细胞 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序，高维流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 两个独立的滤泡淋巴瘤队列 |
| 278 | 2024-08-07 |
Fibroblast subpopulations in Systemic Sclerosis - Functional implications of individual subpopulations and correlations with clinical features
2023-Dec-24, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.09.288
PMID:38147960
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据以及临床信息，探讨了系统性硬化症（SSc）中个体成纤维细胞亚群的作用及其与临床特征的相关性 | 本研究首次将成纤维细胞亚群的比例纳入机器学习模型，提高了SSc患者皮肤纤维化进展与稳定性的分类准确性 | NA | 研究系统性硬化症中成纤维细胞亚群的功能及其与临床特征的相关性 | 系统性硬化症中的成纤维细胞亚群及其与皮肤纤维化的关系 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | 机器学习模型 | RNA测序数据 | PRESS和GENISOS两个队列的样本 |
| 279 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis identifies phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase as a target in ulcerative colitis
2023-Dec-28, World journal of gastroenterology
IF:4.3Q1
DOI:10.3748/wjg.v29.i48.6222
PMID:38186864
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析溃疡性结肠炎患者的细胞互作和分子特征，发现磷赖氨酸磷组氨酸无机焦磷酸磷酸酶（LHPP）在炎症调控中的潜在作用。 | 本研究首次揭示了LHPP在溃疡性结肠炎中的下调与炎症反应的负相关性，并提出LHPP作为治疗溃疡性结肠炎的潜在靶点。 | NA | 利用单细胞RNA测序技术解析溃疡性结肠炎病理中的细胞互作和分子特征。 | 溃疡性结肠炎患者的细胞和分子机制。 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 溃疡性结肠炎患者的组织和血浆样本 |
| 280 | 2024-08-07 |
High-Quality Brain and Bone Marrow Nuclei Preparation for Single Nuclei Multiome Assays
2023-Dec-22, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/65715
PMID:38189499
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研究论文 | 本文描述了两种用于准备脑和骨髓样本以进行下游10X Genomics多组学分析的协议 | 提供了适用于特定生物组织的标准化样本制备协议，确保生成高质量的细胞和核悬液 | NA | 开发适用于脑和骨髓样本的高质量单核多组学分析的样本制备协议 | 脑和骨髓样本的单细胞分析 | 生物技术 | NA | 10X Genomics滴液法单细胞分析技术 | NA | 单细胞转录组和表观遗传信息 | NA |