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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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221 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-sequencing uncovers the dynamic changes of tumour immune microenvironment in advanced lung adenocarcinoma
2023-12-11, BMJ open respiratory research
IF:3.6Q1
DOI:10.1136/bmjresp-2023-001878
PMID:38081768
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了晚期肺腺癌肿瘤免疫微环境的动态变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了肺腺癌肿瘤微环境中未被充分认识的细胞组成和动态变化 | 研究仅基于34名患者的样本,可能存在样本量不足的问题 | 阐明肺腺癌的细胞组成并揭示其肿瘤微环境的先前未被充分认识的特征 | 肺腺癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 106,829个高质量细胞来自34名患者 |
222 | 2024-08-04 |
Dissecting cellular states of infiltrating microenvironment cells in melanoma by integrating single-cell and bulk transcriptome analysis
2023-12-12, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-023-00587-8
PMID:38082384
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA-seq数据解析黑色素瘤微环境细胞状态的组成 | 首次识别了三种不同的肿瘤微环境免疫表型,并揭示其与临床结果的关系 | 使用的样本仅限于463个黑色素瘤肿瘤样本,可能不具有广泛适用性 | 研究微环境细胞状态对黑色素瘤免疫活动的影响 | 463个皮肤黑色素瘤的肿瘤样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA-seq | CIBERSORT | 基因表达数据 | 463个黑色素瘤样本 |
223 | 2024-08-05 |
Unveiling the hidden AP-1: revealing the crucial role of AP-1 in ccRCC at single-cell resolution
2023-12-19, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-023-01913-9
PMID:38114996
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研究论文 | 研究揭示了AP-1在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中的重要角色 | 首次在单细胞分辨率下分析了AP-1在ccRCC中的作用 | 在普通肾脏和ccRCC样本中未检测到AP-1的差异表达可能受到bulk-RNA测序的混杂效应影响 | 探讨AP-1在ccRCC的肿瘤发生中的作用及其调控机制 | 通过分析单细胞多组学数据集来研究AP-1在透明细胞肾细胞癌细胞与肾小管细胞中的表达差异 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞数据 | 多个研究团队的多个单细胞多组学数据集 |
224 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptomics Reveal Pitfalls and Opportunities for the Detection of Rare High-Plasticity Breast Cancer Subtypes
2023-12, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2023.100258
PMID:37813278
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研究论文 | 该文章研究了高塑性乳腺癌亚型的检测方法及其面临的挑战。 | 提出使用高分辨率空间转录组学分析来识别特定的乳腺癌标记,并揭示了现有检测方法的局限性。 | 研究主要集中在三阴性乳腺肿瘤上,其他亚型的分析不足,可能限制了结果的普遍适用性。 | 探讨高塑性乳腺癌亚型的检测方法及其在临床治疗中的应用。 | 分析11个三阴性乳腺肿瘤,包括3个claudin-low亚型和4个MpBC亚型。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 表达数据 | 11个三阴性乳腺肿瘤样本 |
225 | 2024-08-07 |
Exploring the advances of single-cell RNA sequencing in thyroid cancer: a narrative review
2023-Dec-21, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-023-02260-x
PMID:38129369
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在甲状腺癌研究中的应用 | scRNA-seq技术革新了细胞亚群的鉴定和特征化,细胞间通信和受体相互作用的研究,揭示了前所未有的异质性,并为治疗发现提供了新的生物标志物 | scRNA-seq面临技术偏差、财务障碍和伦理问题等挑战 | 深入理解甲状腺癌的肿瘤微环境免疫学见解,为患者开发有效的个性化治疗 | 甲状腺癌的细胞亚群、细胞间通信和受体相互作用 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA |
226 | 2024-08-04 |
Increased m6A-RNA methylation and demethylase FTO suppression is associated with silica-induced pulmonary inflammation and fibrosis
2023-12, Toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.tox.2023.153673
PMID:37979906
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研究论文 | 该研究探讨了m6A RNA甲基化与硅尘引起的肺部炎症和纤维化的关系 | 首次揭示了m6A甲基化在硅尘引发的早期肺炎和纤维化中的作用及其效应细胞 | 研究主要集中在小鼠模型上,尚未在临床患者中广泛验证 | 研究硅尘引起的肺炎和纤维化中的m6A修饰及其机制 | 小鼠模型和硅尘患者的肺组织及外周血单核细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | m6A点杂交、m6A RNA甲基化定量和单细胞测序 | 小鼠模型 | RNA | 正常小鼠与硅沉积小鼠的对比及硅尘患者的外周血单核细胞 |
227 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Crucial Cell Subsets and Functional Heterogeneity Associated With Carotid Atherosclerosis and Cerebrovascular Events
2023-12, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.318974
PMID:37881939
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研究论文 | 这篇文章揭示了与颈动脉粥样硬化和脑血管事件相关的重要细胞亚群及功能异质性 | 文章提供了来自20名患者的颈动脉斑块及配对外周血单核细胞的前所未有的大数据集,揭示了动脉粥样硬化微环境的超高精度细胞景观 | 未具体提及高通量数据在临床应用中的限制 | 研究颈动脉粥样硬化和脑血管事件相关的免疫和内皮细胞亚群的功能特征 | 研究对象为来自20名颈动脉粥样硬化患者的颈动脉斑块及外周血单核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 20名患者的颈动脉斑块和外周血单核细胞 |
228 | 2024-08-04 |
Clonal Proliferation Within Smooth Muscle Cells in Unstable Human Atherosclerotic Lesions
2023-12, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.319479
PMID:37881937
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研究论文 | 本研究探讨了人类不稳定动脉粥样硬化病变中平滑肌细胞的克隆增殖 | 提出了一种新的方法来检测动脉粥样硬化病变中的平滑肌细胞克隆性 | 本研究的空间分辨率和模型的可转化性受到限制 | 旨在研究人类动脉粥样硬化病变中平滑肌细胞的克隆性 | 研究对象为人类不稳定动脉粥样硬化斑块中的平滑肌细胞 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | RNA原位杂交 | NA | RNA | 来自杂合女性的三种不同类型的冠状动脉斑块 |
229 | 2024-08-07 |
Discovering a Rare Smooth Muscle Cell Population Specific to Men in Ascending Aortic Aneurysm Using Spatial Transcriptomics
2023-12, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320235
PMID:37916413
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
230 | 2024-08-07 |
Generation of Atp6v1g3-Cre mice for investigation of intercalated cells and the collecting duct
2023-12-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00137.2023
PMID:37823193
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研究论文 | 本研究通过CRISPR/CAS技术生成了Atp6v1g3-Cre小鼠,用于研究肾间质细胞和集合管 | 开发了一种新的Atp6v1g3-Cre报告小鼠模型,该模型在肾脏细胞中具有高度特异性,且在其他器官中表达极少或无表达 | NA | 研究肾间质细胞在肾脏先天免疫功能中的作用 | 肾间质细胞和集合管 | NA | 肾脏感染、酸碱失衡和急性肾损伤 | CRISPR/CAS技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA |
231 | 2024-08-04 |
Single-Cell Sequencing of Lung Macrophages and Monocytes Reveals Novel Therapeutic Targets in COPD
2023-12-05, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12242771
PMID:38132091
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研究论文 | 本研究确定了COPD患者肺部巨噬细胞和单核细胞的特征,并识别了新型治疗靶点 | 首次明确了COPD患者肺部巨噬细胞和单核细胞的转录特征,为寻找新的治疗靶点提供了依据 | 样本量相对较小,可能限制了研究结果的广泛适用性 | 探索COPD患者肺部巨噬细胞和单核细胞在炎症过程中的作用 | COPD患者和对照组人类肺组织中的巨噬细胞和单核细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 (COPD) | RNA测序 | NA | 转录组数据 | COPD患者18个样本和对照组28个样本 |
232 | 2024-08-07 |
Pyroptosis-Related Subtypes Predict the Response of Clear Cell Renal Cell Carcinoma to Targeted Therapy
2023-12-08, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2812334
PMID:38179741
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研究论文 | 本研究基于焦亡相关基因的共识聚类对透明细胞肾细胞癌(ccRCC)进行分子分型,并探讨其对靶向治疗的反应预测 | 首次揭示了焦亡相关基因在ccRCC中的作用,并基于此开发了预测ccRCC对靶向治疗反应的分子亚型 | NA | 探讨焦亡在透明细胞肾细胞癌进展中的作用,并开发个性化治疗策略 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC) | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序,CIBERSORT分析,Lasso回归 | NA | 基因组,转录组,蛋白质 | NA |
233 | 2024-08-07 |
Localizing Hormone Receptor Expression to Cellular Compartments in Idiopathic Subglottic Stenosis
2023-12, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.30856
PMID:37382162
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,定位了特发性声门下狭窄(iSGS)患者中雌激素受体(ESR1和ESR2)和孕激素受体(PGR)在特定细胞亚群中的表达 | 首次通过单细胞RNA测序技术,详细分析了iSGS患者中激素受体在不同细胞亚群中的表达模式 | 研究样本量较小,且仅限于iSGS患者,可能影响结果的普遍性 | 探究雌激素和孕激素受体在iSGS病理发生中的作用机制 | 特发性声门下狭窄(iSGS)患者的气道瘢痕和健康黏膜组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | RNA | 25,974个单独测序的细胞,来自7例声门下瘢痕和3例匹配的无影响黏膜的iSGS患者 |
234 | 2024-08-07 |
Predicting drug response from single-cell expression profiles of tumours
2023-12-01, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-023-03182-1
PMID:38041118
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研究论文 | 本文介绍了DREEP方法,用于从肿瘤单细胞表达谱预测药物反应,并验证了其在多个独立单细胞数据集上的准确性和鲁棒性 | DREEP利用公开的药理基因组屏幕数据和功能富集分析,从转录组数据预测单细胞药物敏感性 | NA | 提高癌症治疗的疗效和精确性 | 肿瘤单细胞表达谱和药物反应 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 计算方法 | 转录组数据 | 超过200个癌症细胞系 |
235 | 2024-08-04 |
Deciphering driver regulators of cell fate decisions from single-cell transcriptomics data with CEFCON
2023-Dec-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44103-3
PMID:38123534
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研究论文 | 本文提出了CEFCON,一个以网络为基础的框架,用于从单细胞转录组数据中解析细胞命运决策的驱动调节因子 | CEFCON结合图神经网络和注意机制,从单细胞RNA测序数据中推导出细胞谱系特异的基因调控网络,并通过网络控制理论建模细胞命运动态 | NA | 研究细胞命运决策背后的调控机制 | 小鼠造血干细胞分化数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 图神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | NA |
236 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics identifies adipose tissue CD271+ progenitors for enhanced angiogenesis in limb ischemia
2023-12-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101337
PMID:38118404
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,识别出来自皮下脂肪组织的CD271前体细胞,在肢体缺血中具有增强的血管生成能力 | 指出CD271前体细胞独特的促血管生成基因特征,并展示其在肢体缺血模型中的优越效果 | 未提及具体的局限性 | 研究CD271前体细胞在肢体缺血中的血管生成作用 | 主要研究皮下脂肪组织中的CD271前体细胞 | 数字病理学 | 肢体缺血 | 单细胞转录组分析 | 异种移植物模型 | 基因表达数据 | NA |
237 | 2024-08-04 |
Bexmarilimab-induced macrophage activation leads to treatment benefit in solid tumors: The phase I/II first-in-human MATINS trial
2023-12-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101307
PMID:38056464
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研究论文 | 本研究探讨了bexmarilimab对治疗难治性实体肿瘤患者的安全性和耐受性。 | 首次在人类中研究Clever-1阻断的疗效,并显示了bexmarilimab诱导的巨噬细胞激活对成瘤免疫的积极影响。 | 本研究主要集中于早期的安全性和耐受性评估,缺乏长期疗效的完整数据。 | 评估bexmarilimab对治疗难治性实体肿瘤患者的初步抗肿瘤疗效及免疫相关性。 | 治疗难治性实体肿瘤患者,参与者总数为138。 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤、胃癌、肝细胞癌、雌激素受体阳性乳腺癌和胆道癌 | NA | NA | 临床试验数据 | 138名患者 |
238 | 2024-08-07 |
iPSC-derived hypoimmunogenic tissue resident memory T cells mediate robust anti-tumor activity against cervical cancer
2023-12-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101327
PMID:38091985
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研究论文 | 本文开发了一种HLA-A24&-E双整合的HPV-rejTs,通过消除HLA I类抗原来有效抑制受体免疫排斥,同时保持比原始细胞毒性T淋巴细胞更强的细胞毒性 | 通过单细胞RNA测序发现HPV-rejTs富含组织驻留记忆T细胞,增强了通过TGFβR信号通路对宫颈癌的细胞毒性,并上调了与免疫突触相关的基因,促进了T细胞受体(TCR)的更强激活和TCR介导的目标细胞死亡 | NA | 开发一种可行的“即用型”T细胞疗法,具有强大的抗宫颈癌效果 | 从诱导多能干细胞生成的功能性恢复的人乳头瘤病毒特异性细胞毒性T淋巴细胞(HPV-rejTs) | 免疫学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
239 | 2024-08-07 |
Dapagliflozin protects against chronic heart failure in mice by inhibiting macrophage-mediated inflammation, independent of SGLT2
2023-12-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101334
PMID:38118414
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研究论文 | 本研究使用SGLT2全局敲除小鼠评估SGLT2抑制剂对心力衰竭的作用机制,发现达格列净通过抑制巨噬细胞介导的炎症来保护心脏,且这一作用独立于SGLT2。 | 达格列净对心力衰竭的保护作用独立于SGLT2,主要通过抑制巨噬细胞炎症来实现。 | NA | 阐明SGLT2抑制剂在心力衰竭中的具体作用机制。 | SGLT2全局敲除小鼠及其在心肌梗死和主动脉缩窄诱导的心力衰竭模型中的表现。 | 心血管疾病 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | SGLT2全局敲除小鼠 |
240 | 2024-08-04 |
Genetic and immune determinants of E. coli liver abscess formation
2023-Dec-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2310053120
PMID:38096412
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研究论文 | 本研究分析了小鼠中与大肝脓肿形成相关的遗传和免疫决定因素 | 首次揭示了小鼠肝脓肿的形成过程及其与免疫细胞聚集的关系 | 研究仅在小鼠模型中进行,可能无法直接类推到其他生物 | 确定宿主对肝脓肿形成的易感性决定因素 | C57BL品系小鼠,特别是C57BL/6N雌性小鼠 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |