单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 436 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-08-04 |
Protocol for isolation of signet ring cells from human gastric mucosa
2023-Dec-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102695
PMID:37925632
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研究论文 | 本文介绍了一种从人类胃黏膜中分离信封细胞的方法。 | 该研究提供了一种高生存率的信封细胞悬浮液制备方案，可能用于进一步的研究和临床应用。 | 未提及研究的样本数量和其他可能的实验限制。 | 研究旨在开发一种有效提取信封细胞的方法以用于进一步分析。 | 研究对象为人类胃黏膜中的信封细胞。 | 数字病理学 | NA | 免疫组化染色，流式细胞术，单细胞测序 | NA | 细胞悬浮液 | NA |
| 182 | 2024-08-04 |
Protocol to combine brain sections from multiple mice into a single block for spatial transcriptomic analyses
2023-Dec-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102617
PMID:37742175
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研究论文 | 这篇文章介绍了一种将多个小鼠的脑部切片合并为单个块的方法，以进行空间转录组分析 | 创新点在于提出了一种能够减少试剂消耗并同时处理多鼠样本的协议 | 没有提及具体的实验验证结果或对该协议的局限性分析 | 研究多个小鼠大脑样本的空间转录组特征 | 多个小鼠的海马切片 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 切片 | 多个小鼠 |
| 183 | 2024-08-07 |
Protocol for PPP1R15A-inhibited mouse model establishment with subcutaneous B16F1 tumor and single-cell analysis
2023-Dec-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102616
PMID:37756156
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研究论文 | 本文介绍了一种探索PPP1R15A抑制剂Sephin1对小鼠B16F1皮下肿瘤抗肿瘤免疫影响的实验方案 | 提出了构建单细胞转录组和TCR文库的方法，并详细描述了基因分化、调控子和细胞间通信分析的步骤 | NA | 探索PPP1R15A抑制剂Sephin1对小鼠B16F1皮下肿瘤抗肿瘤免疫的影响 | 小鼠B16F1皮下肿瘤 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 184 | 2024-08-07 |
Protocol for isolating single cells from human pancreatic cancer tissues and analyzing major immune cell populations using flow cytometry
2023-Dec-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102679
PMID:37910511
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研究论文 | 本文介绍了一种从人胰腺癌组织中分离单细胞并使用流式细胞术分析主要免疫细胞群体的协议 | 提供了从胰腺癌组织中分离免疫细胞并进行流式细胞术分析的详细方法 | NA | 开发和描述一种用于从胰腺癌组织中分离和分析免疫细胞的方法 | 人胰腺癌组织中的免疫细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 185 | 2024-08-07 |
TimiGP: An R package to depict the tumor microenvironment from bulk transcriptomics
2023-Dec-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102742
PMID:38019649
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研究论文 | 本文介绍了一种基于基因对的R包TimiGP，用于从大量转录组数据中描绘肿瘤微环境，推断细胞间相互作用，并揭示免疫细胞相对丰度与患者预后之间的关系 | 提出了一种新的方法，通过基因对来描绘肿瘤免疫微环境，并结合单细胞RNA测序数据来映射不同癌症类型的肿瘤免疫微环境 | NA | 探索肿瘤微环境中不同免疫细胞类型的临床相关性，以揭示癌症复杂性并开发治疗方案 | 肿瘤微环境中的免疫细胞类型及其与患者预后的关联 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 186 | 2024-08-07 |
Protocol for nuclear dissociation of the adult C. elegans for single-nucleus RNA sequencing and its application for mapping environmental responses
2023-Dec-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102756
PMID:38043054
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研究论文 | 本文介绍了一种用于成年C. elegans单核RNA测序的核解离协议，并应用于环境响应的映射 | 提出了针对C. elegans的单核RNA测序（snRNA-seq）协议，克服了单细胞RNA测序中的困难 | NA | 旨在克服C. elegans中单细胞RNA测序的困难，并应用于环境响应的研究 | 成年C. elegans的核解离和单核RNA测序 | 分子生物学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | RNA | 未具体说明样本数量 |
| 187 | 2024-08-07 |
Chronic chromosome instability induced by Plk1 results in immune suppression in breast cancer
2023-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113266
PMID:37979172
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研究论文 | 本研究通过在Her2乳腺癌模型中过度表达Polo样激酶1（Plk1），探讨了染色体不稳定（CIN）相关的分子特征如何改变肿瘤进化过程中的免疫识别 | 发现高CIN肿瘤通过激活衰老相关分泌表型（SASP）、上调PD-L1和CD206以及诱导非细胞自主核因子κB（NF-κβ）信号，促进免疫逃逸 | NA | 理解CIN相关的分子特征如何影响肿瘤进化过程中的免疫识别 | Her2乳腺癌模型中过度表达Plk1的高CIN肿瘤 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自癌前乳腺组织的单细胞RNA测序数据 |
| 188 | 2024-08-04 |
Division-Independent Differentiation of Muscle Stem Cells During a Growth Stimulus
2023-Dec-08, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxad091
PMID:38066665
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研究论文 | 这篇文章探讨了成体肌肉干细胞在生长刺激下是否与细胞分裂相关的分化过程 | 提出了一种新的小鼠模型，用于跟踪肌肉干细胞衍生的肌肉细胞核，发现了一种与细胞分裂无关的肌肉干细胞分化和融合 | 研究仅限于小鼠模型，可能无法完全适用于人类肌肉干细胞 | 研究成体肌肉干细胞对生长刺激的反应及其分化机制 | 成体肌肉干细胞的不同转录亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 在小鼠中进行了5天的生长刺激实验 |
| 189 | 2024-08-04 |
Opportunities for High-plex Spatial Transcriptomics in Solid Organ Transplantation
2023-Dec-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004587
PMID:36944604
|
review | 本文讨论了高通量空间转录组技术在固体器官移植中的应用 | 探讨了空间转录组技术在移植科学中的潜在应用，以识别新的治疗干预和生物标志物 | 对现有技术的应用于移植的具体案例缺乏深入研究 | 研究高通量空间转录组技术在移植科学中的应用潜力 | 探讨移植患者及其与拒绝、耐受、感染等病理过程相关的情况 | 数字病理 | NA | 高通量空间转录组技术 | NA | mRNA转录组 | NA |
| 190 | 2024-08-04 |
Identification of biomarkers of renal ischemia-reperfusion injury by bioinformatics analysis and single-cell sequencing analysis combined with in vivo validation
2023-12, Transplant immunology
IF:1.6Q3
DOI:10.1016/j.trim.2023.101928
PMID:37704087
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研究论文 | 本文研究了与肾缺血再灌注损伤相关的中心基因和通路 | 本研究识别了cyp1a1和pdk4作为肾缺血的潜在生物标志物，并展示了其良好的诊断价值 | 未提及该研究的局限性 | 探索肾缺血再灌注损伤的生物标志物 | 小鼠肾缺血样本 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞分析、qRT-PCR | NA | 转录组表达数据 | 小鼠肾缺血样本的转录组数据，共发现157个差异表达基因 |
| 191 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-sequencing uncovers the dynamic changes of tumour immune microenvironment in advanced lung adenocarcinoma
2023-12-11, BMJ open respiratory research
IF:3.6Q1
DOI:10.1136/bmjresp-2023-001878
PMID:38081768
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了晚期肺腺癌肿瘤免疫微环境的动态变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了肺腺癌肿瘤微环境中未被充分认识的细胞组成和动态变化 | 研究仅基于34名患者的样本，可能存在样本量不足的问题 | 阐明肺腺癌的细胞组成并揭示其肿瘤微环境的先前未被充分认识的特征 | 肺腺癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 106,829个高质量细胞来自34名患者 |
| 192 | 2024-08-04 |
Dissecting cellular states of infiltrating microenvironment cells in melanoma by integrating single-cell and bulk transcriptome analysis
2023-12-12, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-023-00587-8
PMID:38082384
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA-seq数据解析黑色素瘤微环境细胞状态的组成 | 首次识别了三种不同的肿瘤微环境免疫表型，并揭示其与临床结果的关系 | 使用的样本仅限于463个黑色素瘤肿瘤样本，可能不具有广泛适用性 | 研究微环境细胞状态对黑色素瘤免疫活动的影响 | 463个皮肤黑色素瘤的肿瘤样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA-seq | CIBERSORT | 基因表达数据 | 463个黑色素瘤样本 |
| 193 | 2024-08-07 |
Screening of four lysosome-related genes in sepsis based on RNA sequencing technology
2023-12-06, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-023-00588-7
PMID:38057716
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研究论文 | 本研究通过RNA测序技术筛选脓毒症患者中的溶酶体相关基因，以指导溶酶体靶向治疗 | 本研究首次通过RNA测序和单细胞RNA测序技术，筛选出与脓毒症预后密切相关的四个溶酶体相关基因GNLY、GZMB、PRF1和RASGRP1，并证实这些基因在正常对照组中的表达水平显著高于脓毒症组 | 本研究仅基于22名脓毒症患者和10名正常对照的样本进行分析，样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 筛选脓毒症患者中的溶酶体相关基因，为溶酶体靶向治疗提供方向 | 脓毒症患者的外周血样本 | NA | 脓毒症 | RNA测序 | NA | RNA | 22名脓毒症患者和10名正常对照 |
| 194 | 2024-08-05 |
Unveiling the hidden AP-1: revealing the crucial role of AP-1 in ccRCC at single-cell resolution
2023-12-19, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-023-01913-9
PMID:38114996
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研究论文 | 研究揭示了AP-1在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的重要角色 | 首次在单细胞分辨率下分析了AP-1在ccRCC中的作用 | 在普通肾脏和ccRCC样本中未检测到AP-1的差异表达可能受到bulk-RNA测序的混杂效应影响 | 探讨AP-1在ccRCC的肿瘤发生中的作用及其调控机制 | 通过分析单细胞多组学数据集来研究AP-1在透明细胞肾细胞癌细胞与肾小管细胞中的表达差异 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞数据 | 多个研究团队的多个单细胞多组学数据集 |
| 195 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptomics Reveal Pitfalls and Opportunities for the Detection of Rare High-Plasticity Breast Cancer Subtypes
2023-12, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2023.100258
PMID:37813278
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研究论文 | 该文章研究了高塑性乳腺癌亚型的检测方法及其面临的挑战。 | 提出使用高分辨率空间转录组学分析来识别特定的乳腺癌标记，并揭示了现有检测方法的局限性。 | 研究主要集中在三阴性乳腺肿瘤上，其他亚型的分析不足，可能限制了结果的普遍适用性。 | 探讨高塑性乳腺癌亚型的检测方法及其在临床治疗中的应用。 | 分析11个三阴性乳腺肿瘤，包括3个claudin-low亚型和4个MpBC亚型。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 表达数据 | 11个三阴性乳腺肿瘤样本 |
| 196 | 2024-08-07 |
Exploring the advances of single-cell RNA sequencing in thyroid cancer: a narrative review
2023-Dec-21, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-023-02260-x
PMID:38129369
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在甲状腺癌研究中的应用 | scRNA-seq技术革新了细胞亚群的鉴定和特征化，细胞间通信和受体相互作用的研究，揭示了前所未有的异质性，并为治疗发现提供了新的生物标志物 | scRNA-seq面临技术偏差、财务障碍和伦理问题等挑战 | 深入理解甲状腺癌的肿瘤微环境免疫学见解，为患者开发有效的个性化治疗 | 甲状腺癌的细胞亚群、细胞间通信和受体相互作用 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 197 | 2024-08-04 |
Increased m6A-RNA methylation and demethylase FTO suppression is associated with silica-induced pulmonary inflammation and fibrosis
2023-12, Toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.tox.2023.153673
PMID:37979906
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研究论文 | 该研究探讨了m6A RNA甲基化与硅尘引起的肺部炎症和纤维化的关系 | 首次揭示了m6A甲基化在硅尘引发的早期肺炎和纤维化中的作用及其效应细胞 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在临床患者中广泛验证 | 研究硅尘引起的肺炎和纤维化中的m6A修饰及其机制 | 小鼠模型和硅尘患者的肺组织及外周血单核细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | m6A点杂交、m6A RNA甲基化定量和单细胞测序 | 小鼠模型 | RNA | 正常小鼠与硅沉积小鼠的对比及硅尘患者的外周血单核细胞 |
| 198 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Crucial Cell Subsets and Functional Heterogeneity Associated With Carotid Atherosclerosis and Cerebrovascular Events
2023-12, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.318974
PMID:37881939
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研究论文 | 这篇文章揭示了与颈动脉粥样硬化和脑血管事件相关的重要细胞亚群及功能异质性 | 文章提供了来自20名患者的颈动脉斑块及配对外周血单核细胞的前所未有的大数据集，揭示了动脉粥样硬化微环境的超高精度细胞景观 | 未具体提及高通量数据在临床应用中的限制 | 研究颈动脉粥样硬化和脑血管事件相关的免疫和内皮细胞亚群的功能特征 | 研究对象为来自20名颈动脉粥样硬化患者的颈动脉斑块及外周血单核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 20名患者的颈动脉斑块和外周血单核细胞 |
| 199 | 2024-08-04 |
Clonal Proliferation Within Smooth Muscle Cells in Unstable Human Atherosclerotic Lesions
2023-12, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.319479
PMID:37881937
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研究论文 | 本研究探讨了人类不稳定动脉粥样硬化病变中平滑肌细胞的克隆增殖 | 提出了一种新的方法来检测动脉粥样硬化病变中的平滑肌细胞克隆性 | 本研究的空间分辨率和模型的可转化性受到限制 | 旨在研究人类动脉粥样硬化病变中平滑肌细胞的克隆性 | 研究对象为人类不稳定动脉粥样硬化斑块中的平滑肌细胞 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | RNA原位杂交 | NA | RNA | 来自杂合女性的三种不同类型的冠状动脉斑块 |
| 200 | 2024-08-07 |
Discovering a Rare Smooth Muscle Cell Population Specific to Men in Ascending Aortic Aneurysm Using Spatial Transcriptomics
2023-12, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320235
PMID:37916413
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |