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当前共找到 437 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-02 |
Vimentin promotes glioma progression and maintains glioma cell resistance to oxidative phosphorylation inhibition
2023-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00844-3
PMID:37646965
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研究论文 | 本研究揭示了波形蛋白在胶质瘤进展中的作用及其维持肿瘤细胞对氧化磷酸化抑制耐药性的机制 | 首次系统阐明VIM在胶质瘤中通过调节氧化磷酸化抑制敏感性影响肿瘤进展和免疫浸润，并提出联合靶向VIM的免疫治疗新策略 | 未提及临床样本验证及具体分子机制的深入探讨 | 探究VIM在胶质瘤进展及氧化磷酸化抑制敏感性中的作用，为胶质瘤治疗提供潜在靶点 | 胶质瘤细胞及公共数据库中的胶质瘤患者样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA测序, 单细胞测序 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 甲基化数据 | 基于TCGA、HPA、CGGA等多个公共数据库的胶质瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-05-02 |
TGF-β-p-STAT1-LAIR2 axis has a "self-rescue" role for exhausted CD8+ T cells in hepatocellular carcinoma
2023-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00830-9
PMID:37223874
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研究论文 | 本研究揭示了TGF-β在肝细胞癌中通过TGF-β-p-STAT1-LAIR2轴对耗竭CD8+ T细胞产生“自我救援”作用 | 首次发现TGF-β在诱导CD8+ T细胞耗竭的同时，通过TGF-β-p-STAT1-LAIR2轴启动细胞内在的抗耗竭机制，即“自我救援” | “自我救援”行为对TGF-β刺激具有时间和剂量限制，易被更强的抑制信号掩盖 | 研究TGF-β对肝细胞癌浸润CD8+ T细胞功能的调控效应及分子机制 | 肝细胞癌中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 流式细胞术, 质谱流式细胞术, 免疫组织化学, RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 染色质免疫沉淀, 双荧光素酶报告基因实验 | NA | 图像, 文本, 序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-04-28 |
Temporal recording of mammalian development and precancer
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.18.572260
PMID:38187699
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研究论文 | 利用NSC-seq分子时钟记录哺乳动物发育和癌前病变的细胞事件时序 | 首次开发并验证了一种多用途单细胞CRISPR平台NSC-seq，将分子时钟与细胞状态和谱系信息相结合，实现了对细胞事件时序和克隆性的精准记录 | 未提及具体局限性，但可能包括对CRISPR编辑效率的依赖性以及人类癌前样本分析中的样本代表性 | 开发一种能够记录细胞事件时序和克隆性的分子时钟方法，并应用于哺乳动物发育和癌前病变的研究 | 小鼠胚胎、小鼠腺瘤、人结肠癌前病变 | 数字病理学 | 结肠癌前病变 | NSC-seq（单细胞CRISPR平台）、单细胞多组学分析 | 分子时钟模型 | 单细胞RNA测序数据、克隆分析数据 | 116个单细胞RNA测序数据集和418个人类息肉 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | 10x Chromium | NSC-seq平台 |
| 4 | 2026-04-23 |
Single-cell transcriptomics reveals long noncoding RNAs associated with tumor biology and the microenvironment in pancreatic cancer
2023-Dec, NAR cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/narcan/zcad055
PMID:38023733
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了胰腺导管腺癌中与肿瘤生物学和微环境相关的长链非编码RNA | 首次在单细胞分辨率下全面评估了PDAC中的lncRNA景观，揭示了在批量分析中被掩盖的、与肿瘤异质性、突变、治疗反应及肿瘤微环境相关的lncRNA | 研究主要基于转录组数据，lncRNA的功能机制仍需后续实验验证 | 探究胰腺导管腺癌中长链非编码RNA在单细胞水平上的表达特征及其与肿瘤生物学和微环境的关系 | 21名胰腺导管腺癌患者的73个多区域样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 21名患者的73个多区域样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-04-14 |
Transcriptomic research in atherosclerosis: Unravelling plaque phenotype and overcoming methodological challenges
2023-Dec, Journal of molecular and cellular cardiology plus
DOI:10.1016/j.jmccpl.2023.100048
PMID:39802625
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综述 | 本文综述了转录组学在动脉粥样硬化研究中的应用，重点探讨了其在揭示斑块表型、克服方法学挑战以及未来研究方向方面的价值 | 系统总结了转录组学在动脉粥样硬化斑块表型研究中的最新进展，包括单细胞测序等新技术的应用价值，并强调了研究方法标准化与多组学数据整合的重要性 | 作为综述文章，未提出新的实验数据或模型，主要基于现有文献进行总结和展望 | 探讨转录组学如何帮助理解动脉粥样硬化斑块的不同表型，并解决该领域研究方法可重复性低、缺乏标准化等挑战 | 动脉粥样硬化斑块 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 转录组测序 | 机器学习 | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-04-12 |
Deep scRNA sequencing reveals a broadly applicable Regeneration Classifier and implicates antioxidant response in corticospinal axon regeneration
2023-12-20, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.09.019
PMID:37848024
|
研究论文 | 本研究通过深度单细胞RNA测序揭示了适用于多种神经元类型的再生分类器，并强调了抗氧化反应在皮质脊髓轴突再生中的关键作用 | 开发了一个广泛适用的再生分类器，能够预测不同神经元类型在发育阶段或损伤后的再生潜力，并通过条件基因删除验证了NRF2在皮质脊髓束再生中的作用 | 仅对数百个表型鉴定的神经元进行了深度测序，样本规模相对较小，可能限制了结果的普适性 | 探究中枢神经系统轴突再生的生物学机制，特别是皮质脊髓束在脊髓损伤后的再生潜力 | 皮质脊髓束神经元，特别是经过PTEN和SOCS3删除处理的再生神经元 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | 监督分类（使用Garnett） | 单细胞转录组数据 | 数百个表型鉴定的神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-04-11 |
Transcription factor NFYa controls cardiomyocyte metabolism and proliferation during mouse fetal heart development
2023-12-18, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.10.012
PMID:37972593
|
研究论文 | 本研究探讨了转录因子NFYa在小鼠胎儿心脏发育过程中调控心肌细胞代谢和增殖的作用 | 揭示了NFYa通过与辅因子SP2相互作用，在转录水平激活连接代谢和增殖的基因，这是先前未被识别的心脏代谢转录调控机制 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类，且未深入探讨NFYa在成年心脏再生中的具体作用 | 探究NFYa在协调心肌细胞代谢和增殖中的机制，以理解胎儿心脏发育和再生的调控 | 小鼠胎儿心脏中的心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组分析，单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 8 | 2026-04-01 |
A time-resolved meta-analysis of consensus gene expression profiles during human T-cell activation
2023-12-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03120-7
PMID:38098113
|
研究论文 | 本文通过时间分辨的元分析，识别并验证了人类T细胞激活过程中的共识基因表达特征 | 首次描述了跨T细胞群体的时间分辨基因表达模式，并开发了用于稳健评估T细胞激活的共识生物标志物特征 | NA | 分析不同T细胞群体在激活过程中的时间模式，以开发T细胞激活的共识基因特征 | 人类T细胞 | 自然语言处理 | NA | 元分析，基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 9 | 2026-03-19 |
Single-cell level deconvolution, convolution, and clustering in spatial transcriptomics by aligning spot level transcriptome to nuclear morphology
2023-Dec-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.17.572084
PMID:38187541
|
研究论文 | 本文提出了一种名为STIE的算法，通过将空间转录组数据与匹配的组织学图像中的核形态对齐，实现单细胞水平的去卷积、卷积和聚类分析 | STIE算法首次通过核形态相似性和邻域信息，从斑点间高达约70%的间隙区域恢复缺失细胞，实现了真正的单细胞水平分析，超越了现有方法仅关注斑点大小提升的局限 | 算法依赖于匹配的组织学图像和核形态数据，可能受图像质量或配准误差影响，且在处理高度异质或重叠细胞时性能未完全评估 | 旨在解决基于斑点的空间转录组学中无法精确捕获单细胞转录组的问题，实现单细胞水平的分辨率提升 | 真实和模拟的空间转录组学数据，包括低分辨率和高分辨率斑点 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | EM算法 | 图像、文本（转录组数据） | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 10 | 2026-03-15 |
Single-Cell Sequencing of Lung Macrophages and Monocytes Reveals Novel Therapeutic Targets in COPD
2023-12-05, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12242771
PMID:38132091
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析COPD患者肺组织中巨噬细胞和单核细胞的转录组特征，揭示了其功能失调和过度炎症状态，并识别出新的治疗靶点 | 首次在COPD患者肺组织中利用单细胞测序技术系统性地鉴定出16个转录组学上不同的巨噬细胞和单核细胞亚群，并发现吸入性皮质类固醇等化合物可调节这些细胞的转录组特征 | 研究样本量相对有限（COPD组18例，对照组28例），且主要基于体外组织分析，体内验证仅通过一项临床试验数据 | 探究COPD患者肺组织中巨噬细胞和单核细胞的转录组特征，识别新的治疗靶点 | COPD患者和对照者的肺组织样本中的巨噬细胞和单核细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | COPD患者18例，对照者28例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-03-14 |
Ghrelin deletion and conditional ghrelin cell ablation increase pancreatic islet size in mice
2023-12-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI169349
PMID:38099492
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研究论文 | 本研究探讨了胃饥饿素缺失或胃饥饿素细胞条件性消融对小鼠胰腺胰岛大小和β细胞质量的影响 | 揭示了胃饥饿素减少通过降低β细胞凋亡来增加胰岛大小和β细胞数量，并利用单细胞转录组学鉴定了相关基因表达变化 | 研究主要基于小鼠模型，对人类糖尿病的直接治疗意义仍需进一步验证 | 确定胃饥饿素是否影响胰岛大小和β细胞质量 | 小鼠胰腺胰岛和β细胞 | NA | 糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 不同年龄和基因型的小鼠（如4周龄、10-12周龄的GKO和WT小鼠） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-03-13 |
scFED: Clustering Identifying Cell Types of scRNA-Seq Data Based on Feature Engineering Denoising
2023-Dec, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-023-00574-y
PMID:37402002
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研究论文 | 本研究提出了一种基于特征工程去噪的单细胞RNA测序数据聚类方法scFED，用于识别细胞类型 | 提出了一种结合特征工程去噪和组织特异性细胞分类参考数据库（CellMatch）的基因选择框架，通过重建方法减少噪声并放大关键信息 | 仅在四个真实单细胞数据集上进行了验证，未提及方法在更大规模或更复杂数据集上的适用性 | 提高单细胞RNA测序数据的聚类效果和细胞类型识别准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 特征工程框架 | 基因表达数据 | 四个真实单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-03-06 |
Anterior Pituitary Transcriptomics Following a High-Fat Diet: Impact of Oxidative Stress on Cell Metabolism
2023-12-23, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad191
PMID:38103263
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研究论文 | 本研究通过高脂饮食诱导肥胖，利用单细胞RNA测序分析前垂体转录组变化，探讨肥胖相关氧化应激对垂体细胞代谢的影响 | 首次在热中性环境中结合高脂饮食和单细胞RNA测序技术，系统比较雄性和雌性小鼠垂体细胞对肥胖应激的差异反应，并识别出雌性中最易受影响的垂体细胞群体 | 研究仅使用FVB.129P小鼠品系，结果可能不适用于其他遗传背景；实验周期最长15周，未能评估长期效应；未深入探讨分子机制 | 探究肥胖引起的氧化应激如何影响前垂体细胞功能，并比较性别差异 | 雄性和雌性FVB.129P小鼠的前垂体细胞 | 单细胞转录组学 | 肥胖相关代谢紊乱 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | FVB.129P小鼠，高脂饮食组10-15周，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-03-06 |
CD8+ lymphocytes are critical for early control of tuberculosis in macaques
2023-12-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230707
PMID:37843832
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研究论文 | 本研究通过耗竭猕猴的CD8+淋巴细胞，揭示了其在结核病早期控制中的关键作用 | 首次在非人灵长类动物模型中系统性地证明了CD8+淋巴细胞（包括先天性和适应性亚群）对结核分枝杆菌早期感染控制的关键作用，并利用单细胞RNA测序技术揭示了肉芽肿中多功能的细胞毒性CD8+淋巴细胞特征 | 研究仅在猕猴模型中进行，结果向人类直接外推需谨慎；CD8耗竭的长期效应和具体分子机制有待进一步阐明 | 阐明CD8+淋巴细胞在结核病免疫防御中的功能作用 | 猕猴（非人灵长类动物） | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，配体-受体分析 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 猕猴感染模型（具体数量未在摘要中明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-03-02 |
Semi-reference based cell type deconvolution with application to human metastatic cancers
2023-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqad109
PMID:38143958
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SECRET的新型去卷积方法，利用单细胞RNA测序数据中的细胞类型特异性基因表达谱，从批量RNA测序数据中准确估计细胞类型比例 | SECRET方法能够适应批量数据中存在的细胞类型在参考数据中未表示的情况，从而提高了参考选择的灵活性 | NA | 开发一种去卷积方法以从批量RNA测序数据中估计细胞类型比例，应用于人类转移性癌症研究 | 人类转移性癌症 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 去卷积方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-02-10 |
Marine Invertebrates One Cell at A Time: Insights from Single-Cell Analysis
2023-12-12, Integrative and comparative biology
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/icb/icad034
PMID:37188638
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在海洋无脊椎动物研究中的应用、关键发现及未来挑战 | 首次系统性地综合了海洋无脊椎动物单细胞RNA测序研究的文献，提供了关于细胞类型组成、动态过程响应及细胞类型进化等方面的关键见解，并讨论了跨实验和跨物种数据比较的挑战 | 本文为综述性文章，不涉及原始数据分析，主要基于现有文献进行综合评述，未提出新的实验方法或模型 | 综述海洋无脊椎动物单细胞RNA测序研究的现状、关键发现、挑战及未来方向 | 海洋无脊椎动物 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-01-29 |
ExAD-GNN: Explainable Graph Neural Network for Alzheimer's Disease State Prediction from Single-cell Data
2023-Dec-06, APSIPA Transactions on Signal and Information Processing
DOI:10.1561/116.00000239
PMID:41584071
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研究论文 | 本文提出了一种名为ExAD-GNN的可解释图神经网络，用于从单细胞测序数据预测阿尔茨海默病状态 | 通过结合KNN图结构分析单细胞表达谱，ExAD-GNN不仅能预测AD病理状态，还能识别细胞类型特异性标记基因，提供分子层面的疾病机制洞察 | 方法依赖于单细胞测序数据的质量和可用性，可能未完全解决大脑复杂异质性的所有方面 | 开发一种可解释的机器学习方法，以从单细胞数据中准确预测阿尔茨海默病状态并识别相关风险基因 | 阿尔茨海默病患者和对照组的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | 单细胞表达谱数据 | 大规模单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-01-13 |
Toll-Like Receptor 4 Agonist Injection With Concurrent Radiotherapy in Patients With Metastatic Soft Tissue Sarcoma: A Phase 1 Nonrandomized Controlled Trial
2023-12-01, JAMA oncology
IF:22.5Q1
DOI:10.1001/jamaoncol.2023.4015
PMID:37824131
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研究论文 | 本研究是一项I期非随机对照试验，评估了瘤内注射TLR4激动剂GLA-SE联合放疗在转移性软组织肉瘤患者中的安全性、疗效和免疫调节作用 | 首次在转移性软组织肉瘤患者中评估瘤内注射TLR4激动剂GLA-SE联合放疗的协同作用，并利用T细胞受体测序和单细胞测序技术揭示了治疗诱导的T细胞克隆扩增和表型变化 | 这是一项I期非随机对照试验，样本量较小（12例患者），且为单中心研究，需要更大规模的随机对照试验来验证疗效 | 评估瘤内注射TLR4激动剂GLA-SE联合放疗在转移性软组织肉瘤患者中的安全性、疗效和免疫调节作用 | 转移性软组织肉瘤患者，具有可注射病灶 | 肿瘤免疫治疗 | 软组织肉瘤 | T细胞受体测序，单细胞测序，免疫组织化学 | NA | 临床数据，测序数据，病理数据 | 12例患者 | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2026-01-10 |
Genome-wide identification and expression analysis of heat shock protein gene family in cassava
2023-12, The plant genome
DOI:10.1002/tpg2.20407
PMID:37899677
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研究论文 | 本研究通过全基因组分析，识别了木薯中的225个热休克蛋白基因，并利用转录组和单细胞转录组数据分析了它们的表达模式 | 首次在木薯中系统鉴定热休克蛋白基因家族，结合单细胞转录组数据揭示基因表达特异性 | 研究主要基于生物信息学预测和表达分析，缺乏直接的实验功能验证 | 探究木薯热休克蛋白基因家族的功能特征和进化关系 | 木薯（Manihot esculenta）中的热休克蛋白基因家族 | 植物分子生物学 | NA | 全基因组鉴定、转录组分析、单细胞转录组测序、qRT-PCR | NA | 基因组序列、转录组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-01-09 |
Deep analysis of CD4 T cells in the rhesus CNS during SIV infection
2023-12, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011844
PMID:38060615
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了SIV感染期间恒河猴中枢神经系统中CD4 T细胞的分布、反应及病毒存在情况 | 首次在SIV感染模型中详细描述了CCR5+ CD4 T细胞在中枢神经系统多个组织中的分布，并揭示了其在急性感染期的高病毒载量和免疫激活状态 | 研究样本量较小（仅10只恒河猴），且ART模拟方案为非最优依从性，可能无法完全反映人类HIV感染情况 | 探究SIV感染期间中枢神经系统中CD4 T细胞的分布、对感染的反应以及ART启动后的潜在恢复情况 | SIVmac251感染的恒河猴中枢神经系统组织 | 单细胞组学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 10只SIV感染的恒河猴（4只急性期，6只慢性期） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |