单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 436 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-12-13 |
Single-cell transcriptomics reveals long noncoding RNAs associated with tumor biology and the microenvironment in pancreatic cancer
2023-Dec, NAR cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/narcan/zcad055
PMID:38023733
|
研究论文 | 研究通过单细胞转录组学揭示了与胰腺癌肿瘤生物学和微环境相关的长链非编码RNA | 首次使用单细胞转录组数据全面评估了胰腺导管腺癌中的长链非编码RNA景观，并揭示了肿瘤内在生物学和肿瘤微环境中lncRNA的作用 | 研究仅限于胰腺导管腺癌，且样本量相对较小 | 探讨长链非编码RNA在胰腺导管腺癌中的作用及其与肿瘤内在生物学和微环境的关系 | 胰腺导管腺癌患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 21名胰腺导管腺癌患者的73个多区域样本 |
| 2 | 2024-12-12 |
scMIC: A Deep Multi-Level Information Fusion Framework for Clustering Single-Cell Multi-Omics Data
2023-12, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2023.3317272
PMID:37725723
|
研究论文 | 提出了一种名为scMIC的深度多层次信息融合框架，用于聚类单细胞多组学数据 | 该框架能够整合细胞的属性信息和潜在的结构关系，减少不同组学之间的冗余信息，并通过多重协同监督聚类策略提高聚类精度 | NA | 提高单细胞多组学数据聚类的准确性 | 单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 深度学习框架 | 多组学数据 | 七个单细胞多组学数据集 |
| 3 | 2024-12-12 |
scGCC: Graph Contrastive Clustering With Neighborhood Augmentations for scRNA-Seq Data Analysis
2023-12, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2023.3319551
PMID:37751336
|
研究论文 | 本文提出了一种名为scGCC的图对比聚类模型，用于单细胞RNA测序数据分析，旨在解决高维度、稀疏性和批次效应等问题 | 引入图注意力网络（GAT）进行细胞表示学习，并提出了五种数据增强方法以提高聚类性能和鲁棒性 | 未提及具体局限性 | 开发一种新的图自监督对比学习模型，用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型和亚型识别 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 图对比学习模型 | 数据 | 14个真实世界数据集 |
| 4 | 2024-12-11 |
CD8+ lymphocytes are critical for early control of tuberculosis in macaques
2023-12-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230707
PMID:37843832
|
研究论文 | 研究探讨了CD8+淋巴细胞在结核病早期控制中的关键作用 | 首次通过实验证明CD8+淋巴细胞在结核病早期控制中的重要性，并揭示了其在肺部和淋巴结中的作用机制 | 实验仅在猕猴模型中进行，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨CD8+淋巴细胞在结核病早期控制中的功能 | 猕猴体内的CD8+淋巴细胞及其在结核病早期控制中的作用 | 免疫学 | 结核病 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、配体-受体分析 | NA | 细胞、基因表达数据 | 猕猴样本 |
| 5 | 2024-12-10 |
Cytotoxic CD4+ tissue-resident memory T cells are associated with asthma severity
2023-Dec-08, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2023.09.003
PMID:37865091
|
研究论文 | 研究探讨了细胞毒性CD4+组织驻留记忆T细胞与哮喘严重程度之间的关系 | 发现了在严重哮喘患者中，CD4+组织驻留记忆T细胞（TRM）显著增加，并且这些细胞表达与细胞毒性和炎症相关的基因 | 研究样本仅包括30名患者，可能不足以代表所有哮喘患者的情况 | 探讨不同CD4+ T细胞亚群在哮喘发病机制中的作用 | 从30名轻度和重度哮喘患者中提取的50,000多个气道CD4+ T细胞 | NA | 哮喘 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 30名轻度和重度哮喘患者 |
| 6 | 2024-12-06 |
Heterogeneous murine peribiliary glands orchestrate compartmentalized epithelial renewal
2023-Dec-04, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.10.004
PMID:37909044
|
研究论文 | 研究了小鼠胆管外分支中的异质性腺体如何调控分隔化的上皮更新 | 首次揭示了胆管外分支上皮更新的细胞层次结构，并展示了不同位置的胆管细胞在维持腺体和表面上皮中的不同作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探究胆管外分支上皮更新的细胞机制 | 小鼠胆管外分支的腺体和上皮细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 7 | 2024-12-01 |
Spatial Transcriptomics Resolve an Emphysema-specific Lymphoid Follicle B Cell Signature in COPD
2023-Dec-08, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202303-0507OC
PMID:38064378
|
研究论文 | 研究分析了慢性阻塞性肺疾病（COPD）中与肺气肿相关的淋巴滤泡（LF）的转录组特征 | 揭示了肺气肿患者淋巴滤泡中B细胞活化的独特转录组特征 | 研究样本仅限于40名COPD患者和吸烟者，可能无法代表所有COPD患者的情况 | 探讨COPD患者中肺气肿与淋巴滤泡B细胞免疫成分的关系 | COPD患者和吸烟者的肺组织中的淋巴滤泡 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 40名COPD患者和吸烟者的肺组织样本 |
| 8 | 2024-11-22 |
Transcription factor NFYa controls cardiomyocyte metabolism and proliferation during mouse fetal heart development
2023-Dec-18, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.10.012
PMID:37972593
|
研究论文 | 研究转录因子NFYa在小鼠胎儿心脏发育中对心肌细胞代谢和增殖的调控作用 | 首次揭示了NFYa在调节胎儿心脏生长中的关键作用，并发现了一种新的心脏代谢转录调控机制 | NA | 探讨NFYa在心肌细胞代谢和增殖中的作用及其对心脏发育的影响 | 小鼠胎儿心脏中的心肌细胞 | NA | NA | 空间和单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 9 | 2024-11-22 |
Single-cell transcriptomics stratifies organoid models of metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2023-Dec-11, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2023113898
PMID:37962490
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析，评估了三种不同条件下的人类肝脏类器官模型在代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）中的表现 | 首次系统评估了人类肝脏类器官模型在MASLD中的转化潜力，并提供了单细胞参考数据以基准未来的类器官损伤模型 | NA | 评估人类肝脏类器官模型在代谢功能障碍相关脂肪性肝病中的表现，并提供单细胞参考数据 | 人类肝脏类器官模型在不同条件下的MASLD表现 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 三种不同条件下的肝脏类器官模型 |
| 10 | 2024-11-20 |
The testicular microvasculature in Klinefelter syndrome is immature with compromised integrity and characterized by excessive inflammatory cross-talk
2023-12-04, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/dead224
PMID:37910660
|
研究论文 | 研究探讨了Klinefelter综合征（KS）患者的睾丸微血管在单细胞水平上的基因表达模式，揭示了微血管功能障碍的潜在机制 | 首次在单细胞水平上揭示了KS患者睾丸微血管相关细胞的独特基因表达模式，表明内皮细胞过度激活、血管形成紊乱和血管完整性受损 | 研究样本量不平衡，各组样本数量和细胞数量不同，且缺乏临床信息的限制，无法推断基因表达变化可能导致的生物学后果，未包含青春期前年龄组限制了研究结果的普遍性 | 探讨KS是否会导致睾丸中独特的基因表达模式，从而揭示报道的睾丸微血管功能障碍 | Klinefelter综合征（KS）、非阻塞性无精子症（NOA）、隐匿性精子症和对照组的睾丸细胞 | NA | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | KS组6例，NOA组5例，隐匿性精子症3例，对照组15例 |
| 11 | 2024-11-17 |
Retrospective pharmacogenetic study of psoriasis highlights the role of KLK7 in tumour necrosis factor signalling
2023-12-20, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljad332
PMID:37672660
|
研究论文 | 本研究通过回顾性药物基因组学研究，探讨了银屑病治疗中药物反应相关的潜在遗传途径 | 揭示了两个与治疗反应相关的新的遗传标记，并强调了KLK7在肿瘤坏死因子信号传导中的作用 | 研究基于回顾性数据，样本量有限，且未涵盖所有可能的治疗选项 | 利用回顾性数据进行药物基因组学研究，探索银屑病治疗中药物反应的潜在遗传途径 | 1942名银屑病患者及其治疗反应 | 药物基因组学 | 银屑病 | 线性回归分析 | NA | 基因型数据 | 1942名银屑病患者 |
| 12 | 2024-11-14 |
Inference after latent variable estimation for single-cell RNA sequencing data
2023-12-15, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxac047
PMID:36511385
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为count splitting的灵活框架，用于在单细胞RNA测序数据分析中进行有效的推断 | 提出了count splitting方法，解决了在单细胞RNA测序数据分析中使用相同数据进行潜在变量估计和基因关联测试时无法控制第一类错误的问题 | 仅在泊松假设下有效 | 开发一种新的方法，以在单细胞RNA测序数据分析中实现有效的统计推断 | 单细胞RNA测序数据中的潜在变量估计和基因关联测试 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多能干细胞分化为心肌细胞的数据集 |
| 13 | 2024-11-13 |
Single-cell reconstruction and mutation enrichment analysis identifies dysregulated cardiomyocyte and endothelial cells in congenital heart disease
2023-Dec-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组重构和突变富集分析，识别出先天性心脏病中失调的心肌细胞和内皮细胞 | 首次综合分析了基因组学和先天性心脏病的单细胞转录组学，识别出最常突变的先天性心脏病基因，并展示了先天性心脏病基因的异质性 | NA | 鉴定先天性心脏病的潜在风险基因 | 先天性心脏病病例中的心肌细胞和内皮细胞 | 基因组学 | 先天性心脏病 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因变异数据 | 3166例先天性心脏病病例 |
| 14 | 2024-11-07 |
Genomic and immune signatures predict clinical outcome in newly diagnosed multiple myeloma treated with immunotherapy regimens
2023-Dec, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-023-00657-1
PMID:37945755
|
研究论文 | 研究通过整合肿瘤全基因组和微环境单细胞RNA测序数据，探讨了新诊断的多发性骨髓瘤患者在接受包含达雷妥尤单抗的免疫治疗方案后的临床结果预测因素 | 首次通过整合肿瘤全基因组和微环境单细胞RNA测序数据，揭示了特定的基因驱动因素和免疫细胞变化对临床结果的影响 | 研究仅基于前瞻性2期试验数据，样本量有限，可能影响结果的普适性 | 探讨新诊断的多发性骨髓瘤患者在接受包含达雷妥尤单抗的免疫治疗方案后的临床结果预测因素 | 新诊断的多发性骨髓瘤患者及其在接受免疫治疗后的临床结果 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 全基因组测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、RNA数据 | NA |
| 15 | 2024-11-06 |
ENPP1 is an innate immune checkpoint of the anticancer cGAMP-STING pathway in breast cancer
2023-Dec-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2313693120
PMID:38117852
|
研究论文 | 研究探讨了ENPP1在乳腺癌中作为cGAMP-STING通路的固有免疫检查点的机制 | 首次揭示了ENPP1通过抑制cGAMP-STING信号通路促进乳腺癌生长和转移的机制 | 研究主要集中在ENPP1的功能和其在乳腺癌中的作用，未涉及其他癌症类型的验证 | 探讨ENPP1在乳腺癌中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | ENPP1在乳腺癌中的表达及其对cGAMP-STING通路的影响 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及癌症和正常组织的单细胞RNA测序数据 |
| 16 | 2024-11-06 |
Temporal recording of mammalian development and precancer
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.18.572260
PMID:38187699
|
研究论文 | 本文利用NSC-seq平台记录哺乳动物发育和癌前病变中的细胞事件时间顺序 | 开发了一种新的分子时钟方法，结合细胞状态和谱系信息，记录细胞事件的时间和克隆性 | NA | 研究哺乳动物胚胎发育和癌前病变中细胞事件的时间顺序 | 小鼠胚胎发育中的组织特异性细胞扩张和人类癌前病变中的多祖先起源 | 数字病理学 | NA | NSC-seq | NA | 单细胞多组学数据 | 116个scRNA-seq数据集和418个人类息肉样本 |
| 17 | 2024-10-30 |
Randomized Phase II Trial of Dendritic Cell/Myeloma Fusion Vaccine with Lenalidomide Maintenance after Upfront Autologous Hematopoietic Cell Transplantation for Multiple Myeloma: BMT CTN 1401
2023-12-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-0235
PMID:37463058
|
研究论文 | 本文评估了在自体造血干细胞移植后使用树突状细胞/多发性骨髓瘤融合疫苗与来那度胺维持治疗对多发性骨髓瘤患者临床反应率和特异性免疫诱导的影响 | 本文首次在多发性骨髓瘤患者中评估了树突状细胞/多发性骨髓瘤融合疫苗与来那度胺维持治疗的联合应用效果，并展示了个性化细胞疗法在多中心合作研究中的成功实施 | 尽管疫苗接种显著增加了多发性骨髓瘤特异性淋巴细胞的扩增，但在1年后的完全缓解率上并未显示出统计学上的显著增加 | 评估树突状细胞/多发性骨髓瘤融合疫苗与来那度胺维持治疗对多发性骨髓瘤患者临床反应率和特异性免疫诱导的影响 | 多发性骨髓瘤患者 | NA | 多发性骨髓瘤 | 树突状细胞/多发性骨髓瘤融合疫苗 | NA | NA | 203名患者，其中140名在移植后随机分配 |
| 18 | 2024-10-21 |
Mapping inherited genetic variation with opposite effects on autoimmune disease and cancer identifies candidate drug targets associated with the anti-tumor immune response
2023-Dec-28, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.12.23.23300491
PMID:38234717
|
研究论文 | 本文通过系统搜索具有相反效应的遗传变异，识别出与抗肿瘤免疫反应相关的潜在药物靶点 | 本文首次通过大规模的基因组关联研究，结合跨疾病的元分析，识别出与癌症和自身免疫疾病相反效应的遗传变异，并将其映射到潜在的免疫治疗靶点 | 本文主要依赖于基因组关联研究和元分析，未进行体内或体外实验验证 | 通过遗传证据识别潜在的癌症免疫治疗靶点 | 乳腺癌、前列腺癌、卵巢癌、子宫内膜癌以及七种自身免疫/自身炎症疾病 | 生物信息学 | 癌症 | 全基因组关联研究 (GWAS) | NA | 基因组数据 | 240,540 例癌症病例和 317,000 例对照，以及 112,631 例自身免疫/自身炎症疾病病例和 895,386 例对照 |
| 19 | 2024-10-21 |
CellBiAge: Improved single-cell age classification using data binarization
2023-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113500
PMID:38032797
|
研究论文 | 本文开发了一种名为CellBiAge的机器学习管道，用于通过单细胞转录组学对小鼠脑细胞的年龄进行分类 | 通过基因表达值的二值化显著提高了不同模型、技术和脑区的测试性能，并识别了潜在的与年龄相关的基因 | NA | 开发一种准确的方法来预测特定细胞类型的年龄，以理解衰老的异质性和评估 rejuvenation 策略 | 小鼠脑细胞的年龄分类 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | NA |
| 20 | 2024-10-20 |
Insect Insights at the Single-Cell Level: Technologies and Applications
2023-12-31, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13010091
PMID:38201295
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在昆虫研究中的应用，重点介绍了其在生物学应用中的进展、当前挑战及未来机遇 | scRNA-seq技术在昆虫研究中揭示了细胞类型的复杂性和异质性，发现了新的细胞类型及其相互关系 | 当前挑战包括技术复杂性和数据分析的难度 | 探讨单细胞RNA测序技术在昆虫研究中的应用及其未来发展 | 昆虫细胞类型及其功能 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |