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当前共找到 436 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-12-17 |
Unagi: Deep Generative Model for Deciphering Cellular Dynamics and In-Silico Drug Discovery in Complex Diseases
2023-Dec-18, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3676579/v1
PMID:38196613
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研究论文 | 本文介绍了一种名为UNAGI的深度生成神经网络，用于分析时间序列单细胞转录组数据，以解码复杂疾病中的细胞动态并进行计算机药物发现 | UNAGI是一种专门针对时间序列单细胞转录组数据设计的深度生成模型，能够捕获疾病进展中的复杂细胞动态，并增强药物扰动建模和发现能力 | NA | 开发一种计算工具，用于详细分析疾病进展并进行靶向计算机药物干预 | 时间序列单细胞转录组数据，特别是来自特发性肺纤维化（IPF）患者和COVID数据集的数据 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 单细胞转录组测序 | 深度生成神经网络 | 时间序列单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2025-12-12 |
Cytotoxic CD4+ tissue-resident memory T cells are associated with asthma severity
2023-12-08, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2023.09.003
PMID:37865091
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，揭示了严重哮喘患者气道中CD4+组织驻留记忆T细胞的异质性及其与疾病严重性的关联 | 首次在严重哮喘患者气道中发现CD103+ CD4+ TRM细胞显著增加，并揭示其具有细胞毒性和促炎非TH2细胞因子表达特征 | 样本量相对较小（30例患者），且未明确这些TRM细胞的具体功能机制或治疗靶点 | 探究严重哮喘中除TH2细胞外的其他CD4+ T细胞亚群在气道炎症和重塑中的作用 | 从30名轻度和严重哮喘患者的支气管肺泡灌洗样本中分离的CD4+ T细胞 | 单细胞转录组学 | 哮喘 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 30例患者（轻度和严重哮喘），超过50,000个气道CD4+ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2025-12-12 |
Decreased oxidative stress response and oxidant detoxification of skin during aging
2023-12, Mechanisms of ageing and development
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.mad.2023.111878
PMID:37827221
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和微阵列转录组数据，探讨了皮肤细胞在衰老过程中氧化应激反应和氧化剂解毒能力的变化，并筛选出可能调控皮肤衰老的关键氧化应激相关基因 | 首次在单细胞水平上系统比较了年轻与老年皮肤中不同类型细胞的氧化应激反应和解毒能力差异，并识别出ANXA1和APOE作为潜在的关键调控基因 | 研究主要基于转录组数据分析，缺乏蛋白质水平和功能实验验证；样本量可能有限；未考虑环境因素（如紫外线）的交互影响 | 阐明皮肤衰老过程中氧化应激反应和氧化剂解毒能力的变化机制，识别关键调控基因 | 人类皮肤细胞（包括角质形成细胞、黑色素细胞、血管内皮细胞、成纤维细胞、淋巴管内皮细胞和免疫细胞） | 单细胞组学 | 皮肤衰老 | 单细胞RNA测序, 微阵列转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2025-12-11 |
MLKL deficiency alleviates neuroinflammation and motor deficits in the α-synuclein transgenic mouse model of Parkinson's disease
2023-12-01, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-023-00686-5
PMID:38041169
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研究论文 | 本研究探讨了MLKL蛋白在帕金森病中的神经保护作用，通过基因敲除小鼠模型和单细胞RNA-seq分析，发现MLKL缺乏能减轻神经炎症和运动缺陷 | 首次在α-synuclein转基因小鼠模型中揭示MLKL缺乏对帕金森病神经炎症和运动症状的改善作用，并结合单细胞RNA-seq技术提供了细胞类型特异的转录组证据 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未在人类患者中进行验证，且长期效应和具体分子机制需进一步探索 | 探究MLKL蛋白在帕金森病中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 小鼠模型（Tg-Mlkl）、原代神经元细胞、人iPSC来源的中脑类器官 | 神经科学 | 帕金森病 | 单细胞RNA-seq | 转基因小鼠模型、基因敲除模型 | 基因表达数据、行为数据 | 未明确指定样本数量，但涉及转基因小鼠、原代细胞和类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2025-12-05 |
Neuronal types in the mouse amygdala and their transcriptional response to fear conditioning
2023-12, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01469-3
PMID:37884748
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，详细描绘了成年小鼠杏仁核在恐惧学习和记忆巩固过程中的细胞类型分类，并识别出130种神经元类型及其空间分布 | 首次在恐惧学习背景下，利用单细胞转录组学构建了小鼠杏仁核的详细细胞类型图谱，并揭示了特定神经元亚群在恐惧记忆编码和检索中的转录响应 | 研究仅基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；单细胞测序技术可能无法捕获所有低丰度转录本 | 探究杏仁核在恐惧学习和记忆巩固过程中的神经元类型及其转录响应机制 | 成年小鼠杏仁核的神经元细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括天真和恐惧条件化的小鼠样本，具体数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2025-12-05 |
High-Salt Diet Causes Defective Oocyte Maturation and Embryonic Development to Impair Female Fertility in Mice
2023-12, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.202300401
PMID:37863820
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研究论文 | 本研究探讨高盐饮食对小鼠卵母细胞成熟、胚胎发育及雌性生育力的影响及其机制 | 首次揭示高盐饮食通过破坏卵母细胞自噬、凋亡水平和线粒体功能，导致卵母细胞减数分裂停滞、受精失败和早期胚胎发育缺陷，从而损害雌性生育力 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类或其他哺乳动物中验证；机制研究主要基于转录组数据，需进一步实验验证 | 探究高盐饮食对雌性生殖细胞发育及生育力的影响机制 | C57BL/6雌性小鼠的卵母细胞、胚胎及生育力指标 | 生殖生物学 | 生育力障碍 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | C57BL/6雌性小鼠（对照组与高盐饮食组） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2025-12-04 |
Ursa: A Comprehensive Multiomics Toolbox for High-Throughput Single-Cell Analysis
2023-12-01, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msad267
PMID:38091963
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研究论文 | 本文介绍了一个名为Ursa的自动化单细胞多组学R软件包，旨在为非生物信息学专家提供一站式单细胞分析解决方案 | 开发了首个集成6种自动化单细胞组学和空间转录组学工作流程的综合工具箱，通过自动化流程降低生物信息学分析门槛 | 未提及该工具包在特定疾病数据集上的验证效果，也未说明与现有工具的基准比较结果 | 开发易用的生物信息学工具以加速单细胞多组学研究，弥合生物信息学专家与非专家之间的技术鸿沟 | 单细胞多组学数据分析工具 | 生物信息学 | NA | 单细胞多组学分析 | 自动化分析流程 | 基因组学、转录组学、表观遗传学、蛋白质组学、免疫组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8 | 2025-12-03 |
Global and cell type-specific immunological hallmarks of severe dengue progression identified via a systems immunology approach
2023-12, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01654-3
PMID:37872316
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和靶向蛋白质组学技术，揭示了严重登革热进展的全球和细胞类型特异性免疫学特征 | 首次在自然感染中证明B细胞携带复制性登革病毒，并系统性地识别了严重登革热进展中的免疫细胞迁移、炎症反应及抗原呈递细胞功能受损等关键特征 | 研究主要聚焦于儿童血液样本，可能无法完全代表成人或其他组织中的登革热病理机制 | 定义登革病毒靶细胞并识别严重登革热进展的免疫学标志 | 儿童血液中的免疫细胞和登革病毒 | 系统免疫学 | 登革热 | 病毒包容性单细胞RNA测序（viscRNA-Seq 2）、靶向蛋白质组学、分泌组分析、功能实验 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质组学数据、分泌组数据 | 儿童血液样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-12-02 |
A discrete 'early-responder' stromal-cell subtype orchestrates immunocyte recruitment to injured tissue
2023-12, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01669-w
PMID:37932455
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研究论文 | 本研究通过时间分辨单细胞RNA测序，鉴定出一种在急性损伤后早期响应的间充质基质细胞亚型，该亚型通过表达免疫调节因子（如Cxcl5）协调免疫细胞（如中性粒细胞和巨噬细胞）的招募，从而影响组织再生和炎症进程 | 首次在肌肉间充质基质细胞中识别出一种“早期响应者”亚型，该亚型在损伤后第一天迅速激活，表达独特的免疫调节转录本，并证明其通过Cxcl5等因子在协调免疫细胞招募和组织再生中发挥关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证有限；且未详细探讨该亚型在其他疾病或组织中的具体功能机制 | 探究急性损伤后间充质基质细胞亚型在免疫细胞招募和组织再生中的作用机制 | 小鼠肌肉间充质基质细胞（MmSCs）及其在急性损伤和肌肉萎缩模型中的响应 | 单细胞组学 | 肌肉损伤和肌肉萎缩 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2025-11-27 |
Genetic and immune determinants of E. coli liver abscess formation
2023-Dec-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2310053120
PMID:38096412
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了E. coli肝脓肿形成的宿主遗传和免疫决定因素 | 首次发现肝脓肿易感性是多基因性状并以性别依赖方式遗传，且与早期炎症反应强度相关 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性尚需验证 | 探究E. coli肝脓肿形成的宿主遗传和免疫机制 | 小鼠肝脏组织和免疫细胞 | 空间生物学 | 肝脓肿 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 多种小鼠品系（包括C57BL/6N等） | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2025-11-26 |
Systematic benchmarking of imaging spatial transcriptomics platforms in FFPE tissues
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.07.570603
PMID:38106230
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研究论文 | 对三种商业化成像空间转录组平台在FFPE组织中的性能进行系统性基准测试 | 首次在包含23种肿瘤和正常组织类型的组织芯片上对三种商业iST平台进行全面性能比较 | 研究基于组织芯片样本，可能无法完全代表完整组织切片的情况 | 评估成像空间转录组平台在FFPE组织中的技术和生物学性能 | 包含23种肿瘤和正常组织类型的组织芯片连续切片 | 空间转录组学 | 多种肿瘤类型 | 成像空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 包含23种组织类型的组织芯片 | 10x Genomics | 成像空间转录组学 | 10x Xenium | 三种商业化成像空间转录组平台（包括10x Xenium） |
| 12 | 2025-11-22 |
Identification of tumor immunophenotypes associated with immunotherapy response in bladder cancer
2023-12, International journal of urology : official journal of the Japanese Urological Association
IF:1.8Q3
DOI:10.1111/iju.15276
PMID:37602677
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研究论文 | 本研究通过分析膀胱癌免疫表型，开发了与免疫治疗反应相关的基因特征，并验证了SRRM4、NPHS1和TMEM72作为预测生物标志物的潜力 | 首次基于肿瘤免疫细胞评分系统性地定义了膀胱癌的炎症型和免疫排斥型免疫表型，并建立了可预测免疫检查点抑制剂治疗反应的基因特征模型 | 研究主要基于公共数据集进行回顾性分析，缺乏前瞻性临床验证 | 揭示与膀胱癌免疫治疗反应相关的免疫表型特征，为改善免疫治疗效果提供新的分子靶点 | 膀胱癌患者 | 生物信息学 | 膀胱癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | 风险评分模型 | 基因表达数据，蛋白质表达数据，临床预后数据 | 多个膀胱癌队列数据集（GSE32894、Imvigor210、GSE145140） | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2025-11-18 |
Multiomic analysis of cervical squamous cell carcinoma identifies cellular ecosystems with biological and clinical relevance
2023-12, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-023-01570-0
PMID:37985817
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研究论文 | 通过多组学分析揭示宫颈鳞状细胞癌的肿瘤细胞状态多样性及其与免疫微环境的相互作用 | 首次在宫颈鳞癌中系统绘制高分辨率空间转录组图谱，发现三种肿瘤状态及其特异性免疫微环境，揭示FABP5介导的免疫排斥机制 | 临床样本分析尚属初步，需要更大规模验证 | 解析宫颈鳞癌肿瘤异质性及其对免疫治疗响应的机制 | 宫颈鳞状细胞癌组织样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,空间蛋白质组学,遗传扰动,药理学扰动 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 14 | 2025-11-18 |
East Asian-specific and cross-ancestry genome-wide meta-analyses provide mechanistic insights into peptic ulcer disease
2023-12, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-023-01569-7
PMID:38036781
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研究论文 | 通过跨祖先基因组荟萃分析揭示消化性溃疡疾病的遗传机制 | 首次进行大规模跨祖先（东亚和欧洲）消化性溃疡疾病基因组荟萃分析，发现25个新位点并揭示胃溃疡和十二指肠溃疡的遗传结构差异 | NA | 探索消化性溃疡疾病的遗传基础和发病机制 | 消化性溃疡疾病患者（52,032例）和对照人群（905,344例） | 基因组学 | 消化性溃疡 | 全基因组关联研究（GWAS）、转录组分析 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 52,032病例和905,344对照 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2025-11-16 |
Single-cell transcriptomics reveals the brain evolution of web-building spiders
2023-12, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-023-02238-y
PMID:37919396
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示结网蜘蛛大脑进化机制 | 首次构建结网蜘蛛大脑单细胞图谱，发现蘑菇体样神经元中正选择基因与学习记忆行为的关联 | 仅分析一种结网蜘蛛物种，未涵盖所有蜘蛛多样性 | 探究蜘蛛神经系统如何进化以适应结网捕食策略 | 结网蜘蛛(Hylyphantes graminicola)和两种原始穴居蜘蛛 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序,基因组测序,基因富集分析,RNA干扰实验 | NA | 单细胞转录组数据,基因组数据 | 超过30,000个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq,全基因组测序 | NA | NA |
| 16 | 2025-11-15 |
Apoptosis recognition receptors regulate skin tissue repair in mice
2023-12-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86269
PMID:38127424
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示凋亡识别受体在小鼠皮肤组织修复中的调控机制 | 首次在皮肤伤口炎症期间系统描绘细胞动态图谱，发现Axl和Timd4两种胞葬受体在组织修复中的不同作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类糖尿病足伤口数据有限，TLR3非依赖性机制尚未完全阐明 | 探究凋亡细胞识别与清除机制如何调控组织修复过程 | 小鼠皮肤伤口模型和人类糖尿病足伤口样本 | 单细胞生物学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2025-11-15 |
Single-cell characterization of human GBM reveals regional differences in tumor-infiltrating leukocyte activation
2023-12-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92678
PMID:38127790
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示了人类胶质母细胞瘤中肿瘤浸润白细胞的区域差异 | 首次在配对样本中揭示了GBM肿瘤中心、外周浸润区和血液中免疫细胞的区域特异性转录特征 | 样本量较小（仅5例患者），需要更大规模验证 | 解析胶质母细胞瘤肿瘤微环境中免疫细胞的区域异质性 | 人类胶质母细胞瘤患者 | 单细胞组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5例原发性GBM患者的配对样本（肿瘤中心、外周浸润区、血液） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-11-15 |
Single-cell sequencing highlights heterogeneity and malignant progression in actinic keratosis and cutaneous squamous cell carcinoma
2023-12-15, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.85270
PMID:38099574
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研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示光化性角化病和皮肤鳞状细胞癌的异质性及恶性进展机制 | 首次通过单细胞RNA测序全面描绘从正常皮肤到光化性角化病再到侵袭性皮肤鳞癌的完整进展过程，发现基底细胞恶性亚型并鉴定关键驱动基因 | 样本量较小（仅6名患者的13个样本），需要更大规模研究验证发现 | 解析皮肤鳞状细胞癌的发病机制和恶性进展过程 | 光化性角化病、原位鳞状细胞癌、皮肤鳞状细胞癌患者组织样本 | 单细胞测序 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫组织化学, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 组织图像 | 6名患者的13个样本，共138,982个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 19 | 2025-11-15 |
Neural tube-associated boundary caps are a major source of mural cells in the skin
2023-12-14, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.69413
PMID:38095361
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研究论文 | 本研究揭示神经管相关边界帽细胞是小鼠皮肤血管壁细胞的主要来源 | 首次发现边界帽细胞衍生物沿神经迁移至皮肤并分化为血管周细胞和血管平滑肌细胞 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探索边界帽细胞在皮肤血管发育中的新功能 | 小鼠胚胎和新生小鼠的边界帽细胞及其衍生物 | 发育生物学 | NA | Cre报告基因细胞追踪，单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据，细胞追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2025-11-15 |
Avoiding false discoveries in single-cell RNA-seq by revisiting the first Alzheimer's disease dataset
2023-12-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.90214
PMID:38047913
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研究论文 | 重新分析首个阿尔茨海默病单细胞RNA-seq数据集，通过改进数据处理和差异表达分析方法显著减少假阳性发现 | 采用最佳实践方法重新分析首个AD单核RNA-seq数据，将假发现率0.05下的差异表达基因减少549倍 | 仅针对单个数据集进行重新分析，未涉及其他独立验证数据集 | 评估质量控制和分析方法对疾病相关基因发现的影响，纠正先前研究中的假阳性发现 | 阿尔茨海默病患者脑组织单细胞RNA-seq数据 | 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA-seq | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单核RNA-seq | NA | NA |