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当前共找到 437 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 1 | 2026-03-19 |
Single-cell level deconvolution, convolution, and clustering in spatial transcriptomics by aligning spot level transcriptome to nuclear morphology
2023-Dec-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.17.572084
PMID:38187541
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研究论文 | 本文提出了一种名为STIE的算法，通过将空间转录组数据与匹配的组织学图像中的核形态对齐，实现单细胞水平的去卷积、卷积和聚类分析 | STIE算法首次通过核形态相似性和邻域信息，从斑点间高达约70%的间隙区域恢复缺失细胞，实现了真正的单细胞水平分析，超越了现有方法仅关注斑点大小提升的局限 | 算法依赖于匹配的组织学图像和核形态数据，可能受图像质量或配准误差影响，且在处理高度异质或重叠细胞时性能未完全评估 | 旨在解决基于斑点的空间转录组学中无法精确捕获单细胞转录组的问题，实现单细胞水平的分辨率提升 | 真实和模拟的空间转录组学数据，包括低分辨率和高分辨率斑点 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | EM算法 | 图像、文本（转录组数据） | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2 | 2026-03-15 |
Single-Cell Sequencing of Lung Macrophages and Monocytes Reveals Novel Therapeutic Targets in COPD
2023-12-05, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12242771
PMID:38132091
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析COPD患者肺组织中巨噬细胞和单核细胞的转录组特征，揭示了其功能失调和过度炎症状态，并识别出新的治疗靶点 | 首次在COPD患者肺组织中利用单细胞测序技术系统性地鉴定出16个转录组学上不同的巨噬细胞和单核细胞亚群，并发现吸入性皮质类固醇等化合物可调节这些细胞的转录组特征 | 研究样本量相对有限（COPD组18例，对照组28例），且主要基于体外组织分析，体内验证仅通过一项临床试验数据 | 探究COPD患者肺组织中巨噬细胞和单核细胞的转录组特征，识别新的治疗靶点 | COPD患者和对照者的肺组织样本中的巨噬细胞和单核细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | COPD患者18例，对照者28例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-03-14 |
Ghrelin deletion and conditional ghrelin cell ablation increase pancreatic islet size in mice
2023-12-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI169349
PMID:38099492
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研究论文 | 本研究探讨了胃饥饿素缺失或胃饥饿素细胞条件性消融对小鼠胰腺胰岛大小和β细胞质量的影响 | 揭示了胃饥饿素减少通过降低β细胞凋亡来增加胰岛大小和β细胞数量，并利用单细胞转录组学鉴定了相关基因表达变化 | 研究主要基于小鼠模型，对人类糖尿病的直接治疗意义仍需进一步验证 | 确定胃饥饿素是否影响胰岛大小和β细胞质量 | 小鼠胰腺胰岛和β细胞 | NA | 糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 不同年龄和基因型的小鼠（如4周龄、10-12周龄的GKO和WT小鼠） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-03-13 |
scFED: Clustering Identifying Cell Types of scRNA-Seq Data Based on Feature Engineering Denoising
2023-Dec, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-023-00574-y
PMID:37402002
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研究论文 | 本研究提出了一种基于特征工程去噪的单细胞RNA测序数据聚类方法scFED，用于识别细胞类型 | 提出了一种结合特征工程去噪和组织特异性细胞分类参考数据库（CellMatch）的基因选择框架，通过重建方法减少噪声并放大关键信息 | 仅在四个真实单细胞数据集上进行了验证，未提及方法在更大规模或更复杂数据集上的适用性 | 提高单细胞RNA测序数据的聚类效果和细胞类型识别准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 特征工程框架 | 基因表达数据 | 四个真实单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-03-06 |
Anterior Pituitary Transcriptomics Following a High-Fat Diet: Impact of Oxidative Stress on Cell Metabolism
2023-12-23, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad191
PMID:38103263
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研究论文 | 本研究通过高脂饮食诱导肥胖，利用单细胞RNA测序分析前垂体转录组变化，探讨肥胖相关氧化应激对垂体细胞代谢的影响 | 首次在热中性环境中结合高脂饮食和单细胞RNA测序技术，系统比较雄性和雌性小鼠垂体细胞对肥胖应激的差异反应，并识别出雌性中最易受影响的垂体细胞群体 | 研究仅使用FVB.129P小鼠品系，结果可能不适用于其他遗传背景；实验周期最长15周，未能评估长期效应；未深入探讨分子机制 | 探究肥胖引起的氧化应激如何影响前垂体细胞功能，并比较性别差异 | 雄性和雌性FVB.129P小鼠的前垂体细胞 | 单细胞转录组学 | 肥胖相关代谢紊乱 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | FVB.129P小鼠，高脂饮食组10-15周，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-03-06 |
CD8+ lymphocytes are critical for early control of tuberculosis in macaques
2023-12-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230707
PMID:37843832
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研究论文 | 本研究通过耗竭猕猴的CD8+淋巴细胞，揭示了其在结核病早期控制中的关键作用 | 首次在非人灵长类动物模型中系统性地证明了CD8+淋巴细胞（包括先天性和适应性亚群）对结核分枝杆菌早期感染控制的关键作用，并利用单细胞RNA测序技术揭示了肉芽肿中多功能的细胞毒性CD8+淋巴细胞特征 | 研究仅在猕猴模型中进行，结果向人类直接外推需谨慎；CD8耗竭的长期效应和具体分子机制有待进一步阐明 | 阐明CD8+淋巴细胞在结核病免疫防御中的功能作用 | 猕猴（非人灵长类动物） | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，配体-受体分析 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 猕猴感染模型（具体数量未在摘要中明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-03-02 |
Semi-reference based cell type deconvolution with application to human metastatic cancers
2023-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqad109
PMID:38143958
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SECRET的新型去卷积方法，利用单细胞RNA测序数据中的细胞类型特异性基因表达谱，从批量RNA测序数据中准确估计细胞类型比例 | SECRET方法能够适应批量数据中存在的细胞类型在参考数据中未表示的情况，从而提高了参考选择的灵活性 | NA | 开发一种去卷积方法以从批量RNA测序数据中估计细胞类型比例，应用于人类转移性癌症研究 | 人类转移性癌症 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 去卷积方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-02-10 |
Marine Invertebrates One Cell at A Time: Insights from Single-Cell Analysis
2023-12-12, Integrative and comparative biology
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/icb/icad034
PMID:37188638
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在海洋无脊椎动物研究中的应用、关键发现及未来挑战 | 首次系统性地综合了海洋无脊椎动物单细胞RNA测序研究的文献，提供了关于细胞类型组成、动态过程响应及细胞类型进化等方面的关键见解，并讨论了跨实验和跨物种数据比较的挑战 | 本文为综述性文章，不涉及原始数据分析，主要基于现有文献进行综合评述，未提出新的实验方法或模型 | 综述海洋无脊椎动物单细胞RNA测序研究的现状、关键发现、挑战及未来方向 | 海洋无脊椎动物 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-01-29 |
ExAD-GNN: Explainable Graph Neural Network for Alzheimer's Disease State Prediction from Single-cell Data
2023-Dec-06, APSIPA Transactions on Signal and Information Processing
DOI:10.1561/116.00000239
PMID:41584071
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研究论文 | 本文提出了一种名为ExAD-GNN的可解释图神经网络，用于从单细胞测序数据预测阿尔茨海默病状态 | 通过结合KNN图结构分析单细胞表达谱，ExAD-GNN不仅能预测AD病理状态，还能识别细胞类型特异性标记基因，提供分子层面的疾病机制洞察 | 方法依赖于单细胞测序数据的质量和可用性，可能未完全解决大脑复杂异质性的所有方面 | 开发一种可解释的机器学习方法，以从单细胞数据中准确预测阿尔茨海默病状态并识别相关风险基因 | 阿尔茨海默病患者和对照组的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | 单细胞表达谱数据 | 大规模单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-01-13 |
Toll-Like Receptor 4 Agonist Injection With Concurrent Radiotherapy in Patients With Metastatic Soft Tissue Sarcoma: A Phase 1 Nonrandomized Controlled Trial
2023-12-01, JAMA oncology
IF:22.5Q1
DOI:10.1001/jamaoncol.2023.4015
PMID:37824131
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研究论文 | 本研究是一项I期非随机对照试验，评估了瘤内注射TLR4激动剂GLA-SE联合放疗在转移性软组织肉瘤患者中的安全性、疗效和免疫调节作用 | 首次在转移性软组织肉瘤患者中评估瘤内注射TLR4激动剂GLA-SE联合放疗的协同作用，并利用T细胞受体测序和单细胞测序技术揭示了治疗诱导的T细胞克隆扩增和表型变化 | 这是一项I期非随机对照试验，样本量较小（12例患者），且为单中心研究，需要更大规模的随机对照试验来验证疗效 | 评估瘤内注射TLR4激动剂GLA-SE联合放疗在转移性软组织肉瘤患者中的安全性、疗效和免疫调节作用 | 转移性软组织肉瘤患者，具有可注射病灶 | 肿瘤免疫治疗 | 软组织肉瘤 | T细胞受体测序，单细胞测序，免疫组织化学 | NA | 临床数据，测序数据，病理数据 | 12例患者 | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2026-01-10 |
Genome-wide identification and expression analysis of heat shock protein gene family in cassava
2023-12, The plant genome
DOI:10.1002/tpg2.20407
PMID:37899677
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研究论文 | 本研究通过全基因组分析，识别了木薯中的225个热休克蛋白基因，并利用转录组和单细胞转录组数据分析了它们的表达模式 | 首次在木薯中系统鉴定热休克蛋白基因家族，结合单细胞转录组数据揭示基因表达特异性 | 研究主要基于生物信息学预测和表达分析，缺乏直接的实验功能验证 | 探究木薯热休克蛋白基因家族的功能特征和进化关系 | 木薯（Manihot esculenta）中的热休克蛋白基因家族 | 植物分子生物学 | NA | 全基因组鉴定、转录组分析、单细胞转录组测序、qRT-PCR | NA | 基因组序列、转录组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-01-09 |
Deep analysis of CD4 T cells in the rhesus CNS during SIV infection
2023-12, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011844
PMID:38060615
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了SIV感染期间恒河猴中枢神经系统中CD4 T细胞的分布、反应及病毒存在情况 | 首次在SIV感染模型中详细描述了CCR5+ CD4 T细胞在中枢神经系统多个组织中的分布，并揭示了其在急性感染期的高病毒载量和免疫激活状态 | 研究样本量较小（仅10只恒河猴），且ART模拟方案为非最优依从性，可能无法完全反映人类HIV感染情况 | 探究SIV感染期间中枢神经系统中CD4 T细胞的分布、对感染的反应以及ART启动后的潜在恢复情况 | SIVmac251感染的恒河猴中枢神经系统组织 | 单细胞组学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 10只SIV感染的恒河猴（4只急性期，6只慢性期） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-01-09 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals rich pituitary-Immune interactions under systemic inflammation
2023-12, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002403
PMID:38109308
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了系统性炎症下小鼠垂体内分泌细胞与免疫系统之间广泛的相互作用 | 首次在单细胞分辨率上揭示了系统性炎症如何调控垂体内分泌细胞的转录组谱，并发现了非经典生物活性分子（如Nptx2）在调节免疫稳态中的作用 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人体中得到验证；单细胞测序技术本身存在技术限制，如基因捕获效率等 | 探究系统性炎症对垂体内分泌细胞转录组谱的调控机制及其与免疫系统的相互作用 | 小鼠垂体组织 | 单细胞组学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及小鼠垂体组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-01-09 |
Gleaning Euglenozoa-specific DNA polymerases in public single-cell transcriptome data
2023-12, Protist
IF:1.9Q4
DOI:10.1016/j.protis.2023.125997
PMID:38039844
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研究论文 | 本研究通过分析公共单细胞转录组数据，发现了眼虫门中16个新的家族A DNA聚合酶序列，并探讨了这些酶在眼虫门中的多样性和进化 | 利用单细胞转录组数据填补了眼虫门深支系中家族A DNA聚合酶序列的空白，首次从基础分支物种中获取了相关序列数据 | 研究仅基于转录组数据，可能未覆盖所有DNA聚合酶基因；样本数量有限，可能无法完全代表眼虫门的多样性 | 探究眼虫门中家族A DNA聚合酶的多样性和进化历史 | 眼虫门中的吞噬性眼虫和共生虫类 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 33个吞噬性眼虫和2个共生虫类 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-01-07 |
ENPP1 is an innate immune checkpoint of the anticancer cGAMP-STING pathway in breast cancer
2023-12-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2313693120
PMID:38117852
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研究论文 | 本文揭示了ENPP1作为先天免疫检查点，通过抑制细胞外cGAMP-STING通路促进乳腺癌生长和转移的机制 | 首次在单细胞水平证明ENPP1通过水解细胞外cGAMP抑制STING通路，是乳腺癌免疫逃逸的关键因子 | 研究主要基于乳腺癌模型，其他癌症类型中的机制尚未完全阐明 | 探究ENPP1在乳腺癌进展中的分子机制及其作为治疗靶点的潜力 | 乳腺癌细胞、正常组织及患者样本 | 癌症免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量，但包括乳腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-01-07 |
A distinct human cell type expressing MHCII and RORγt with dual characteristics of dendritic cells and type 3 innate lymphoid cells
2023-12-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2318710120
PMID:38109523
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序技术，识别并表征了人类中一种罕见的具有树突状细胞特征的RORγt细胞亚群，称为RORγt DC样细胞 | 首次在人类中识别出一种独特的RORγt DC样细胞亚群，该细胞兼具树突状细胞和3型先天淋巴样细胞的特征，并展示了其增殖潜力和向CD1c DC2样细胞分化的可塑性 | 研究主要基于体外实验，其在体内免疫稳态、炎症和自身免疫中的具体功能和影响仍需进一步探究 | 探究人类中表达RORγt的抗原呈递细胞亚群的特性、功能及其在免疫调节中的作用 | 人类RORγt DC样细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-01-07 |
Genetic and immune determinants of E. coli liver abscess formation
2023-12-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2310053120
PMID:38096412
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了小鼠肝脏脓肿形成的遗传和免疫决定因素，特别是TLR4介导的早期炎症反应在脓肿易感性中的作用 | 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术，系统性地表征了E. coli肝脏脓肿的免疫细胞组成和遗传基础，并发现TLR4介导的先天免疫反应过度激活是脓肿易感性的关键驱动因素 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证；脓肿形成的具体分子机制和遗传位点仍需进一步探索 | 探究E. coli感染后肝脏脓肿形成的宿主遗传和免疫决定因素 | 小鼠（特别是C57BL品系）的肝脏组织及E. coli细菌 | 空间转录组学 | 肝脏感染 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个小鼠品系（包括C57BL/6N雌性等） | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-01-07 |
Interleukin-17-mediated protective cytokine signaling against degeneration of the retinal pigment epithelium
2023-12-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2311647120
PMID:38085785
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脉络膜γδ T细胞通过IL-17信号通路调控视网膜下小胶质细胞代谢重编程，从而保护视网膜色素上皮免受损伤的机制 | 首次在单细胞水平上鉴定脉络膜γδ T细胞为IL-17的主要生产者，并阐明IL-17通过受体介导的级联反应调控小胶质细胞脂质代谢的新保护机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类视网膜疾病中验证；单细胞测序数据可能受样本量和技术限制 | 探究视网膜色素上皮损伤后免疫细胞相互作用的分子机制 | 小鼠脉络膜免疫细胞和视网膜色素上皮细胞 | 单细胞组学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量的小鼠脉络膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-01-07 |
Lymph node stromal cell responses to perinatal T cell waves, a temporal atlas
2023-12-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2316957120
PMID:38079541
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了小鼠早期淋巴结微环境的时序图谱，揭示了围产期T细胞耐受诱导过程中基质细胞的动态变化及其与T细胞的相互作用 | 首次系统描绘了围产期淋巴结微环境的动态演变图谱，并揭示了α:β T细胞功能障碍对基质细胞的急性影响机制 | 研究局限于小鼠模型，人类围产期淋巴结微环境的可比性尚未验证 | 阐明围产期T细胞耐受诱导过程中淋巴结微环境的动态变化机制 | 小鼠淋巴结基质细胞与围产期T细胞（特别是调节性T细胞） | 单细胞组学 | 免疫耐受相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-01-07 |
Single-cell reconstruction and mutation enrichment analysis identifies dysregulated cardiomyocyte and endothelial cells in congenital heart disease
2023-12-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
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研究论文 | 本研究结合基因组学与单细胞转录组学，对先天性心脏病（CHD）进行了综合分析，识别了90个潜在的风险基因，并揭示了心肌细胞和心内膜细胞是主要的CHD相关细胞类型 | 首次将基因组学与CHD单细胞转录组学进行综合分析，识别了6个新的候选CHD基因，并揭示了CHD基因的异质性表达 | NA | 识别先天性心脏病（CHD）的潜在风险基因和相关细胞类型，以理解其表型异质性 | 先天性心脏病（CHD）患者的心脏组织 | 单细胞转录组学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6个CHD组织和4个对照组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |