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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-10-07 |
Altered Sox9 and FGF signaling gene expression in Aga2 OI mice negatively affects linear growth
2023-11-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.171984
PMID:37796615
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析Aga2 OI小鼠生长板组织,揭示I型胶原突变对软骨生长板的影响机制 | 首次在OI小鼠模型中通过单细胞RNA测序发现生长板软骨细胞中Sox9和FGF信号通路表达异常 | 研究仅限于Aga2+/-小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究成骨不全症对线性生长的负面影响机制 | Aga2+/-小鼠的胫骨和股骨生长板组织 | 单细胞转录组学 | 成骨不全症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Aga2+/-小鼠生长板组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 122 | 2025-10-07 |
Plasma cells in human pancreatic ductal adenocarcinoma secrete antibodies against self-antigens
2023-11-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172449
PMID:37751306
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术发现胰腺导管腺癌中的浆细胞能够分泌针对自身抗原的抗体 | 首次系统性地鉴定了胰腺癌中浆细胞产生的自身抗体所针对的三种特异性自身抗原(F-肌动蛋白、RUVBL2和HSPD1) | 样本量较小(仅7例PDAC样本),且抗体反应性的功能意义尚未完全阐明 | 探索胰腺导管腺癌中驱动B细胞反应的抗原特征 | 胰腺导管腺癌患者的肿瘤浸润免疫细胞和血浆样本 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫球蛋白测序,重组抗体技术 | NA | 单细胞转录组数据,免疫球蛋白序列数据,免疫组织化学数据 | 7例原发PDAC样本,41个重组抗体代表235个浆细胞和12个B细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 123 | 2025-10-07 |
Islet-autoreactive CD4+ T cells are linked with response to alefacept in type 1 diabetes
2023-11-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.167881
PMID:37751304
|
研究论文 | 本研究通过分析胰岛自身反应性CD4+ T细胞特征,探索其对阿法赛特治疗1型糖尿病疗效的预测价值 | 首次发现具有特定转录特征(簇3)的记忆表型IAR CD4+ T细胞基线频率与阿法赛特治疗反应呈负相关 | 样本量有限,需在更大队列中验证生物标志物的预测效能 | 寻找能预测1型糖尿病治疗反应的生物标志物 | 新发1型糖尿病患者的胰岛抗原反应性CD4+ T细胞 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | T1DAL临床试验参与者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 124 | 2025-10-07 |
Mutant RB1 enhances therapeutic efficacy of PARPis in lung adenocarcinoma by triggering the cGAS/STING pathway
2023-11-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.165268
PMID:37937640
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研究论文 | 本研究探讨RB1基因突变如何通过激活cGAS/STING通路增强PARP抑制剂在肺腺癌中的疗效 | 首次揭示RB1突变通过诱导基因组不稳定性和激活cGAS/STING通路增强PARP抑制剂敏感性的机制 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探索PARP抑制剂在肺腺癌中的疗效机制及RB1突变的调控作用 | 肺腺癌细胞系、RB1基因敲除小鼠模型 | 癌症生物学 | 肺腺癌 | 生物信息学筛选、单细胞RNA测序、异种移植实验 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 多个肺腺癌细胞系和RB1-KO小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 125 | 2025-10-07 |
Characterization of Canine Peyer's Patches by Multidimensional Analysis: Insights from Immunofluorescence, Flow Cytometry, and Single-Cell RNA Sequencing
2023-11-01, ImmunoHorizons
DOI:10.4049/immunohorizons.2300091
PMID:38015460
|
研究论文 | 通过多维分析技术表征犬类派尔集合淋巴结的细胞组成和免疫功能 | 首次开发并验证了特异性靶向犬类M细胞的抗体,为研究抗原转运机制提供了新工具 | 研究仅关注稳态条件下的犬类派尔集合淋巴结,未涉及疾病或疫苗接种后的动态变化 | 深入理解犬类肠道相关淋巴组织的结构和功能,以改进口服疫苗策略 | 犬类派尔集合淋巴结的免疫细胞和组织结构 | 免疫学 | NA | 免疫荧光,流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 图像,细胞计数数据,基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 126 | 2025-10-07 |
The role of T cells and shared genes in psoriasis and inflammatory bowel disease based on single-cell RNA and comprehensive analysis
2023-11, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2023.152754
PMID:37806279
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和综合分析探讨T细胞及共享基因在银屑病和炎症性肠病中的作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序、WGCNA和免疫浸润分析系统揭示银屑病与IBD的共享基因和免疫细胞机制 | NA | 探索银屑病和炎症性肠病的共同发病机制及潜在诊断标志物 | 银屑病和炎症性肠病患者 | 生物信息学 | 银屑病,炎症性肠病 | 单细胞RNA测序,差异表达基因分析,GO分析,KEGG分析,加权基因共表达网络分析,免疫浸润分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 127 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptional gene signature analysis identifies IL-17 signaling pathway as the key pathway in sepsis
2023-11, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2023.152763
PMID:38039751
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析鉴定IL-17信号通路为脓毒症的关键致病通路 | 首次通过单细胞转录组技术系统揭示IL-17信号通路在脓毒症不同免疫细胞中的关键作用 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 识别与脓毒症临床严重程度和结局相关的关键通路 | 健康对照和脓毒症患者的外周血单个核细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, t-SNE, UMAP, GO/KEGG富集分析 | 单细胞转录组分析 | 基因表达数据 | 来自三个公共数据库的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 128 | 2025-10-07 |
Proximal immune-epithelial progenitor interactions drive chronic tissue sequelae post COVID-19
2023-Nov-28, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3587418/v1
PMID:38077031
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和成像技术揭示了COVID-19后遗症中免疫细胞与上皮祖细胞相互作用的机制 | 首次发现肺驻留CD8 T细胞-巨噬细胞相互作用在维持异常上皮祖细胞和驱动纤维化后遗症中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型,需要在人类患者中进一步验证 | 阐明呼吸道COVID-19后遗症的病理生理机制 | PASC患者和小鼠模型中的肺组织 | 空间转录组学 | COVID-19后遗症 | 空间转录组学, 成像技术 | 小鼠疾病模型 | 空间转录组数据, 图像数据 | 三个独立的PASC患者队列 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 129 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomic interrogation of the murine bone marrow signaling landscape
2023-11-06, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-023-00298-1
PMID:37926705
|
研究论文 | 本研究结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术,探索小鼠骨髓中骨骼干细胞和祖细胞的信号调控网络 | 首次将空间转录组学应用于完全矿化组织,并开发结合空间和单细胞转录组学的分析方法 | 研究仅限于成年小鼠股骨组织,尚未验证于其他物种或病理条件 | 解析骨骼干细胞和祖细胞在骨髓微环境中的空间分布和调控机制 | 成年小鼠股骨中的骨骼干细胞和祖细胞及其微环境 | 空间转录组学 | 骨骼疾病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 多重反卷积分析 | 预测建模流程 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 成年小鼠股骨样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 130 | 2024-12-24 |
High-quality single-cell transcriptomics from ovarian histological sections during folliculogenesis
2023-11, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202301929
PMID:37722727
|
研究论文 | 本文开发了一种名为DRaqL的新方法,用于从卵巢组织切片中进行高质量的单细胞RNA测序,揭示了卵泡发生过程中的转录组异质性 | DRaqL方法实现了从酒精固定组织切片中进行高效的单细胞RNA测序,其效率与新鲜分离细胞的测序相当,并能有效进行外显子-外显子连接分析 | NA | 开发一种高效的方法,用于从组织切片中进行高质量的单细胞RNA测序,以研究卵泡发生过程中的转录组异质性 | 小鼠卵巢组织切片中的卵母细胞和颗粒细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 (RNA-seq) | NA | 转录组数据 | 小鼠卵巢组织切片 | NA | NA | NA | NA |
| 131 | 2024-12-24 |
A targeted sequencing extension for transcript genotyping in single-cell transcriptomics
2023-11, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202301971
PMID:37696578
|
研究论文 | 本文评估了一种直接的靶向测序方法,作为高吞吐量液滴单细胞RNA测序的扩展,用于转录基因分型 | 本文提出了一种新的靶向测序扩展方法,结合了特定基因座分型与高吞吐量单细胞RNA测序,填补了现有方法的空白 | 本文未详细讨论该方法在不同细胞类型或复杂组织中的适用性 | 研究如何通过靶向测序扩展方法,结合基因型信息与基因表达数据,来研究遗传变异的影响 | 单细胞RNA测序中的转录基因分型 | 基因组学 | NA | 靶向测序 | NA | RNA | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 132 | 2024-12-24 |
c-JUN is a barrier in hESC to cardiomyocyte transition
2023-11, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202302121
PMID:37604584
|
研究论文 | 本文研究了c-JUN在人胚胎干细胞向心肌细胞转化中的作用 | 首次揭示了c-JUN通过调节H3K4me3修饰和染色质可及性来调控心肌细胞命运 | NA | 探讨c-JUN在人心肌细胞分化中的调控作用 | 人胚胎干细胞及其向心肌细胞的分化 | NA | NA | ATAC-seq, ChIP-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 133 | 2024-12-15 |
Transitional cell states sculpt tissue topology during lung regeneration
2023-11-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.10.001
PMID:37922879
|
研究论文 | 研究探讨了肺再生过程中过渡细胞状态在组织重塑和重组中的作用 | 发现了SFRP1和RUNX1标记的过渡状态在组织重塑和重组中的关键作用,并揭示了RUNX1是纤维母细胞状态的关键驱动因子 | NA | 揭示肺再生过程中过渡细胞状态的作用及其在组织重塑中的机制 | 肺组织中的过渡细胞状态及其在再生过程中的作用 | 数字病理学 | 肺疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多个损伤模型的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 134 | 2024-12-08 |
Single-cell RNA-Seq reveals intracellular microbial diversity within immune cells during SARS-CoV-2 infection and recovery
2023-Nov-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108357
PMID:38026191
|
研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序技术揭示了SARS-CoV-2感染和恢复期间免疫细胞内的微生物多样性 | 首次利用单细胞RNA测序技术探索了免疫细胞内微生物的分布及其对宿主细胞的影响 | 需要进一步研究以理解这些微生物在不同生理状态下的细胞特异性丰度的功能意义 | 揭示SARS-CoV-2感染和恢复期间免疫细胞内的微生物多样性及其对宿主细胞的影响 | 健康个体、SARS-CoV-2阳性患者和康复者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及健康个体、SARS-CoV-2阳性患者和康复者的外周血单核细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 135 | 2024-12-07 |
Flow-induced reprogramming of endothelial cells in atherosclerosis
2023-11, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-023-00883-1
PMID:37225873
|
综述 | 本文讨论了动脉粥样硬化中血流诱导的内皮细胞重编程现象及其潜在的致动脉粥样硬化机制 | 提出了血流诱导的内皮细胞重编程(FIRE)作为潜在的致动脉粥样硬化机制 | NA | 探讨血流诱导的内皮细胞重编程机制及其在动脉粥样硬化中的作用 | 内皮细胞在动脉粥样硬化中的重编程机制 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序和染色质可及性分析 | NA | NA | 使用小鼠模型进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 136 | 2024-11-25 |
Spatial transcriptomics reveals distinct tissue niches linked with steroid responsiveness in acute gastrointestinal GVHD
2023-11-23, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023020644
PMID:37699201
|
研究论文 | 研究利用空间转录组技术揭示了急性胃肠道GVHD中与类固醇反应性相关的不同组织微环境 | 首次利用空间转录组技术分析了急性胃肠道GVHD患者的组织微环境,并发现了与类固醇反应性相关的独特基因表达特征 | 样本量较小,仅包括32名患者,可能影响结果的普适性 | 揭示急性胃肠道GVHD中与类固醇反应性相关的组织微环境,并识别潜在的预后生物标志物 | 急性胃肠道GVHD患者的组织样本 | 数字病理学 | 造血系统疾病 | 空间转录组技术 | NA | 基因表达数据 | 32名急性胃肠道GVHD患者 | NA | NA | NA | NA |
| 137 | 2024-11-23 |
An Anterior Second Heart Field Enhancer Regulates the Gene Regulatory Network of the Cardiac Outflow Tract
2023-11-21, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 研究通过CRISPR-Cas9基因编辑技术删除心脏增强子,探讨其在心脏流出道基因调控网络中的作用 | 揭示了前第二心场增强子在连接GATA6与NKX2-5依赖的旋转和隔膜基因程序中的关键作用 | NA | 探讨心脏流出道发育异常的基因调控网络 | 心脏流出道、前第二心场增强子、GATA6、NKX2-5 | NA | 心血管疾病 | CRISPR-Cas9基因编辑、RNA测序、单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀测序、转座酶可及染色质测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 小鼠模型、人类诱导多能干细胞衍生的心肌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 138 | 2024-11-21 |
Dissecting mammalian reproduction with spatial transcriptomics
2023-11-02, Human reproduction update
IF:14.8Q1
DOI:10.1093/humupd/dmad017
PMID:37353907
|
综述 | 本文综述了空间转录组学技术在哺乳动物生殖系统研究中的应用,重点介绍了其在配子发生、胚胎发生和生殖病理学方面的生物学新见解 | 空间转录组学技术通过保留细胞在原生组织环境中的空间背景,揭示了细胞状态如何通过与邻近体细胞的相互作用进行调控 | 当前的空间转录组学技术在应用于生殖研究时仍面临实验和计算上的挑战 | 综述空间转录组学技术在哺乳动物生殖系统研究中的最新进展,并讨论其在未来的应用前景 | 哺乳动物生殖系统中的配子发生、胚胎发生和生殖病理学 | 空间转录组学 | 生殖系统疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 139 | 2024-11-17 |
Ezh2-dependent methylation in oral epithelia promotes secondary palatogenesis
2023-11-15, Birth defects research
IF:1.6Q4
DOI:10.1002/bdr2.2216
PMID:37435868
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研究论文 | 研究Ezh2依赖的甲基化在口腔上皮中对次级腭发育的影响 | 首次揭示了Ezh2在口腔上皮中的甲基化对次级腭发育的作用 | 研究仅限于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类 | 探讨Ezh2依赖的甲基化在次级腭发育中的上皮作用 | 小鼠胚胎的口腔上皮 | NA | NA | 单细胞RNA测序、免疫荧光、RT-qPCR | NA | RNA | 小鼠胚胎的口腔上皮样本 | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2024-11-17 |
ScRNAPip: A systematic and dynamic pipeline for single-cell RNA sequencing analysis
2023-Nov, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.132
PMID:38868218
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研究论文 | 本文开发了一个可重复的计算工作流程,用于单细胞RNA测序数据分析 | 提出了一个系统化和动态的单细胞RNA测序分析管道ScRNAPip | NA | 为研究人员提供一个全面的教程,帮助他们构建和优化自己的分析管道 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用公开数据集进行演示 | NA | NA | NA | NA |