单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 460 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-10-07 |
Smooth muscle-derived adventitial progenitor cells direct atherosclerotic plaque composition complexity in a Klf4-dependent manner
2023-11-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.174639
PMID:37991018
|
研究论文 | 本研究探讨平滑肌来源的外膜祖细胞通过Klf4依赖性方式调控动脉粥样硬化斑块组成复杂性 | 首次揭示AdvSca1-SM祖细胞在慢性动脉粥样硬化中的作用机制及Klf4基因对其分化和斑块组成的调控功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证 | 阐明平滑肌来源外膜祖细胞在动脉粥样硬化中的功能及其分子调控机制 | 血管平滑肌来源的外膜祖细胞(AdvSca1-SM)及其在动脉粥样硬化斑块中的分化命运 | 心血管疾病研究 | 动脉粥样硬化 | scRNA-Seq, 流式细胞术, 组织学分析, 细胞谱系追踪 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 组织学图像 | 野生型和Klf4敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 102 | 2025-10-07 |
Coordinated immune dysregulation in Juvenile Dermatomyositis revealed by single-cell genomics
2023-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.07.566033
PMID:37986917
|
研究论文 | 通过单细胞基因组学揭示幼年皮肌炎中协调的免疫失调机制 | 首次通过单细胞转录组学结合表面蛋白表达分析，发现B细胞区室向幼稚状态偏移是JDM的标志特征，并揭示I型干扰素反应与蛋白质加工失调和细胞死亡程序调控的协调网络 | 研究样本量有限，仅分析了血液样本，未涉及组织特异性免疫反应 | 解析幼年皮肌炎的免疫失调机制 | 幼年皮肌炎患者的外周血单核细胞 | 单细胞基因组学 | 幼年皮肌炎 | 单细胞转录组学，表面蛋白表达分析，免疫表型分析，网络分析 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白表达数据 | 不同疾病活动期的JDM患者血液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 103 | 2025-10-07 |
Virus-specific TRM cells of both donor and recipient origin reside in human kidney transplants
2023-11-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172681
PMID:37751288
|
研究论文 | 本研究表征了人类肾移植组织中组织驻留淋巴细胞的特征及其在抗病毒免疫中的潜在作用 | 首次发现肾移植中存在供体和受体来源的病毒特异性组织驻留记忆T细胞，并证明它们具有相似的转录组特征和共享的TCR克隆型 | 研究样本为肾移植切除组织，可能无法完全代表正常功能移植中的免疫状态 | 表征肾移植中组织驻留淋巴细胞的特征并研究其在抗病毒免疫中的作用 | 人类肾移植切除组织中的组织驻留淋巴细胞 | 免疫学 | 肾脏移植 | 单细胞转录组测序, T细胞受体测序, 病毒dextramer染色 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据, 流式细胞术数据 | 肾移植切除组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | NA |
| 104 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics analysis of proliferative diabetic retinopathy fibrovascular membranes reveals AEBP1 as fibrogenesis modulator
2023-11-02, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172062
PMID:37917183
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析糖尿病视网膜病变纤维血管膜，揭示AEBP1在纤维生成中的调控作用 | 首次在增生性糖尿病视网膜病变纤维血管膜中通过单细胞RNA测序鉴定AEBP1作为周细胞-肌成纤维细胞转化的关键调控因子 | 样本来源仅限于手术切除的纤维血管膜，未涉及更广泛的疾病阶段验证 | 探索糖尿病视网膜病变纤维血管膜的细胞分子特征，寻找新的治疗靶点 | 糖尿病视网膜病变患者的视网膜前纤维血管膜 | 单细胞转录组学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 手术切除的纤维血管膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 105 | 2025-10-07 |
Altered Sox9 and FGF signaling gene expression in Aga2 OI mice negatively affects linear growth
2023-11-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.171984
PMID:37796615
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析Aga2 OI小鼠生长板组织，揭示I型胶原突变对软骨生长板的影响机制 | 首次在OI小鼠模型中通过单细胞RNA测序发现生长板软骨细胞中Sox9和FGF信号通路表达异常 | 研究仅限于Aga2+/-小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究成骨不全症对线性生长的负面影响机制 | Aga2+/-小鼠的胫骨和股骨生长板组织 | 单细胞转录组学 | 成骨不全症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Aga2+/-小鼠生长板组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2025-10-07 |
Plasma cells in human pancreatic ductal adenocarcinoma secrete antibodies against self-antigens
2023-11-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172449
PMID:37751306
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术发现胰腺导管腺癌中的浆细胞能够分泌针对自身抗原的抗体 | 首次系统性地鉴定了胰腺癌中浆细胞产生的自身抗体所针对的三种特异性自身抗原（F-肌动蛋白、RUVBL2和HSPD1） | 样本量较小（仅7例PDAC样本），且抗体反应性的功能意义尚未完全阐明 | 探索胰腺导管腺癌中驱动B细胞反应的抗原特征 | 胰腺导管腺癌患者的肿瘤浸润免疫细胞和血浆样本 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，免疫球蛋白测序，重组抗体技术 | NA | 单细胞转录组数据，免疫球蛋白序列数据，免疫组织化学数据 | 7例原发PDAC样本，41个重组抗体代表235个浆细胞和12个B细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 107 | 2025-10-07 |
Islet-autoreactive CD4+ T cells are linked with response to alefacept in type 1 diabetes
2023-11-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.167881
PMID:37751304
|
研究论文 | 本研究通过分析胰岛自身反应性CD4+ T细胞特征，探索其对阿法赛特治疗1型糖尿病疗效的预测价值 | 首次发现具有特定转录特征（簇3）的记忆表型IAR CD4+ T细胞基线频率与阿法赛特治疗反应呈负相关 | 样本量有限，需在更大队列中验证生物标志物的预测效能 | 寻找能预测1型糖尿病治疗反应的生物标志物 | 新发1型糖尿病患者的胰岛抗原反应性CD4+ T细胞 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | T1DAL临床试验参与者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 108 | 2025-10-07 |
Mutant RB1 enhances therapeutic efficacy of PARPis in lung adenocarcinoma by triggering the cGAS/STING pathway
2023-11-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.165268
PMID:37937640
|
研究论文 | 本研究探讨RB1基因突变如何通过激活cGAS/STING通路增强PARP抑制剂在肺腺癌中的疗效 | 首次揭示RB1突变通过诱导基因组不稳定性和激活cGAS/STING通路增强PARP抑制剂敏感性的机制 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探索PARP抑制剂在肺腺癌中的疗效机制及RB1突变的调控作用 | 肺腺癌细胞系、RB1基因敲除小鼠模型 | 癌症生物学 | 肺腺癌 | 生物信息学筛选、单细胞RNA测序、异种移植实验 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 多个肺腺癌细胞系和RB1-KO小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 109 | 2025-10-07 |
Characterization of Canine Peyer's Patches by Multidimensional Analysis: Insights from Immunofluorescence, Flow Cytometry, and Single-Cell RNA Sequencing
2023-11-01, ImmunoHorizons
DOI:10.4049/immunohorizons.2300091
PMID:38015460
|
研究论文 | 通过多维分析技术表征犬类派尔集合淋巴结的细胞组成和免疫功能 | 首次开发并验证了特异性靶向犬类M细胞的抗体，为研究抗原转运机制提供了新工具 | 研究仅关注稳态条件下的犬类派尔集合淋巴结，未涉及疾病或疫苗接种后的动态变化 | 深入理解犬类肠道相关淋巴组织的结构和功能，以改进口服疫苗策略 | 犬类派尔集合淋巴结的免疫细胞和组织结构 | 免疫学 | NA | 免疫荧光,流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 图像,细胞计数数据,基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 110 | 2025-10-07 |
The role of T cells and shared genes in psoriasis and inflammatory bowel disease based on single-cell RNA and comprehensive analysis
2023-11, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2023.152754
PMID:37806279
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和综合分析探讨T细胞及共享基因在银屑病和炎症性肠病中的作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序、WGCNA和免疫浸润分析系统揭示银屑病与IBD的共享基因和免疫细胞机制 | NA | 探索银屑病和炎症性肠病的共同发病机制及潜在诊断标志物 | 银屑病和炎症性肠病患者 | 生物信息学 | 银屑病,炎症性肠病 | 单细胞RNA测序,差异表达基因分析,GO分析,KEGG分析,加权基因共表达网络分析,免疫浸润分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 111 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptional gene signature analysis identifies IL-17 signaling pathway as the key pathway in sepsis
2023-11, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2023.152763
PMID:38039751
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析鉴定IL-17信号通路为脓毒症的关键致病通路 | 首次通过单细胞转录组技术系统揭示IL-17信号通路在脓毒症不同免疫细胞中的关键作用 | 基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证 | 识别与脓毒症临床严重程度和结局相关的关键通路 | 健康对照和脓毒症患者的外周血单个核细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, t-SNE, UMAP, GO/KEGG富集分析 | 单细胞转录组分析 | 基因表达数据 | 来自三个公共数据库的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2025-10-07 |
Proximal immune-epithelial progenitor interactions drive chronic tissue sequelae post COVID-19
2023-Nov-28, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3587418/v1
PMID:38077031
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和成像技术揭示了COVID-19后遗症中免疫细胞与上皮祖细胞相互作用的机制 | 首次发现肺驻留CD8 T细胞-巨噬细胞相互作用在维持异常上皮祖细胞和驱动纤维化后遗症中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型，需要在人类患者中进一步验证 | 阐明呼吸道COVID-19后遗症的病理生理机制 | PASC患者和小鼠模型中的肺组织 | 空间转录组学 | COVID-19后遗症 | 空间转录组学, 成像技术 | 小鼠疾病模型 | 空间转录组数据, 图像数据 | 三个独立的PASC患者队列 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 113 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomic interrogation of the murine bone marrow signaling landscape
2023-11-06, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-023-00298-1
PMID:37926705
|
研究论文 | 本研究结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术，探索小鼠骨髓中骨骼干细胞和祖细胞的信号调控网络 | 首次将空间转录组学应用于完全矿化组织，并开发结合空间和单细胞转录组学的分析方法 | 研究仅限于成年小鼠股骨组织，尚未验证于其他物种或病理条件 | 解析骨骼干细胞和祖细胞在骨髓微环境中的空间分布和调控机制 | 成年小鼠股骨中的骨骼干细胞和祖细胞及其微环境 | 空间转录组学 | 骨骼疾病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 多重反卷积分析 | 预测建模流程 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 成年小鼠股骨样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2024-12-24 |
High-quality single-cell transcriptomics from ovarian histological sections during folliculogenesis
2023-11, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202301929
PMID:37722727
|
研究论文 | 本文开发了一种名为DRaqL的新方法，用于从卵巢组织切片中进行高质量的单细胞RNA测序，揭示了卵泡发生过程中的转录组异质性 | DRaqL方法实现了从酒精固定组织切片中进行高效的单细胞RNA测序，其效率与新鲜分离细胞的测序相当，并能有效进行外显子-外显子连接分析 | NA | 开发一种高效的方法，用于从组织切片中进行高质量的单细胞RNA测序，以研究卵泡发生过程中的转录组异质性 | 小鼠卵巢组织切片中的卵母细胞和颗粒细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 (RNA-seq) | NA | 转录组数据 | 小鼠卵巢组织切片 | NA | NA | NA | NA |
| 115 | 2024-12-24 |
A targeted sequencing extension for transcript genotyping in single-cell transcriptomics
2023-11, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202301971
PMID:37696578
|
研究论文 | 本文评估了一种直接的靶向测序方法，作为高吞吐量液滴单细胞RNA测序的扩展，用于转录基因分型 | 本文提出了一种新的靶向测序扩展方法，结合了特定基因座分型与高吞吐量单细胞RNA测序，填补了现有方法的空白 | 本文未详细讨论该方法在不同细胞类型或复杂组织中的适用性 | 研究如何通过靶向测序扩展方法，结合基因型信息与基因表达数据，来研究遗传变异的影响 | 单细胞RNA测序中的转录基因分型 | 基因组学 | NA | 靶向测序 | NA | RNA | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 116 | 2024-12-24 |
c-JUN is a barrier in hESC to cardiomyocyte transition
2023-11, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202302121
PMID:37604584
|
研究论文 | 本文研究了c-JUN在人胚胎干细胞向心肌细胞转化中的作用 | 首次揭示了c-JUN通过调节H3K4me3修饰和染色质可及性来调控心肌细胞命运 | NA | 探讨c-JUN在人心肌细胞分化中的调控作用 | 人胚胎干细胞及其向心肌细胞的分化 | NA | NA | ATAC-seq, ChIP-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 117 | 2024-12-15 |
Transitional cell states sculpt tissue topology during lung regeneration
2023-11-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.10.001
PMID:37922879
|
研究论文 | 研究探讨了肺再生过程中过渡细胞状态在组织重塑和重组中的作用 | 发现了SFRP1和RUNX1标记的过渡状态在组织重塑和重组中的关键作用，并揭示了RUNX1是纤维母细胞状态的关键驱动因子 | NA | 揭示肺再生过程中过渡细胞状态的作用及其在组织重塑中的机制 | 肺组织中的过渡细胞状态及其在再生过程中的作用 | 数字病理学 | 肺疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多个损伤模型的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 118 | 2024-12-11 |
Increased spatial coupling of integrin and collagen IV in the immunoresistant clear cell renal cell carcinoma tumor microenvironment
2023-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.16.567457
PMID:38014063
|
研究论文 | 研究探讨了免疫治疗抵抗的透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境中整合素和IV型胶原蛋白的空间耦合增加 | 首次使用细胞分辨率的空间转录组学技术，结合空间基因集富集分析和自相关分析，揭示了免疫治疗暴露的肿瘤微环境中整合素和IV型胶原蛋白的高表达耦合 | 研究样本量较小，仅包括21个患者样本，可能影响结果的普适性 | 探讨免疫治疗抵抗的透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境中分子机制 | 透明细胞肾细胞癌肿瘤及其微环境中的整合素和IV型胶原蛋白 | 数字病理学 | 肾癌 | 空间转录组学、空间分子成像、多重免疫荧光 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | 21个患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 119 | 2024-12-08 |
Single-cell RNA-Seq reveals intracellular microbial diversity within immune cells during SARS-CoV-2 infection and recovery
2023-Nov-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108357
PMID:38026191
|
研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序技术揭示了SARS-CoV-2感染和恢复期间免疫细胞内的微生物多样性 | 首次利用单细胞RNA测序技术探索了免疫细胞内微生物的分布及其对宿主细胞的影响 | 需要进一步研究以理解这些微生物在不同生理状态下的细胞特异性丰度的功能意义 | 揭示SARS-CoV-2感染和恢复期间免疫细胞内的微生物多样性及其对宿主细胞的影响 | 健康个体、SARS-CoV-2阳性患者和康复者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及健康个体、SARS-CoV-2阳性患者和康复者的外周血单核细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 120 | 2024-12-07 |
Flow-induced reprogramming of endothelial cells in atherosclerosis
2023-11, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-023-00883-1
PMID:37225873
|
综述 | 本文讨论了动脉粥样硬化中血流诱导的内皮细胞重编程现象及其潜在的致动脉粥样硬化机制 | 提出了血流诱导的内皮细胞重编程（FIRE）作为潜在的致动脉粥样硬化机制 | NA | 探讨血流诱导的内皮细胞重编程机制及其在动脉粥样硬化中的作用 | 内皮细胞在动脉粥样硬化中的重编程机制 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序和染色质可及性分析 | NA | NA | 使用小鼠模型进行研究 | NA | NA | NA | NA |