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当前共找到 460 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-05-09 |
Robust mapping of spatiotemporal trajectories and cell-cell interactions in healthy and diseased tissues
2023-11-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43120-6
PMID:38007580
|
研究论文 | 开发了三种计算统计算法，整合空间转录组学的多种数据类型，以增强对健康与疾病组织中细胞过程的理解 | 提出了基于空间图的方法PSTS、空间约束的两级置换测试SCTP以及基于神经网络的插补方法stSME，用于建模细胞间相互作用和纠正技术噪声 | NA | 增强对健康与疾病组织中细胞过程的理解 | 细胞过程、细胞间相互作用 | 空间转录组学 | 癌症、脑损伤 | 空间转录组学 | 神经网络、基于图的方法 | 基因表达数据、物理距离数据、组织形态数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 102 | 2025-05-09 |
The extrafollicular B cell response is a hallmark of childhood idiopathic nephrotic syndrome
2023-11-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43504-8
PMID:37996443
|
research paper | 该研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术，揭示了儿童特发性肾病综合征（INS）中B细胞的异常反应特征 | 首次在儿童INS中发现了以非滤泡性B细胞反应为主的免疫扰动，并识别了特定的B细胞亚群扩增 | 样本量较小（13名INS患儿和24名健康对照），且仅分析了血液样本 | 探究儿童特发性肾病综合征的免疫发病机制 | 儿童特发性肾病综合征患者和健康对照的B细胞 | 免疫学 | 肾病综合征 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 13名INS患儿和24名健康对照的血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 103 | 2025-05-09 |
Mouse models of pediatric high-grade gliomas with MYCN amplification reveal intratumoral heterogeneity and lineage signatures
2023-11-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43564-w
PMID:38001143
|
research paper | 该研究通过构建基因工程小鼠模型，模拟人类MYCN扩增的儿童高级别胶质瘤，揭示了肿瘤的分子特征和潜在治疗选项 | 首次构建了模拟人类HGG-MYCN的小鼠模型，并通过单细胞RNA测序揭示了肿瘤内异质性和谱系特征 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证 | 探索MYCN扩增的儿童高级别胶质瘤的肿瘤发生机制和分子特征，寻找潜在治疗选项 | 基因工程小鼠模型和人类肿瘤细胞 | 肿瘤生物学 | 儿童高级别胶质瘤 | 单细胞RNA测序，高通量药物筛选 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据，药物反应数据 | 未明确说明小鼠数量，但使用了小鼠和人类肿瘤细胞进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 104 | 2025-05-09 |
Vector-borne Trypanosoma brucei parasites develop in artificial human skin and persist as skin tissue forms
2023-11-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43437-2
PMID:37996412
|
研究论文 | 该研究通过人工人类皮肤模型和采采蝇自然感染，详细描述了布氏锥虫在皮肤中的发育过程及其进入可逆静止状态的特性 | 首次使用先进的人工人类皮肤模型和单细胞RNA测序技术，揭示了布氏锥虫在皮肤中的发育时序及其可逆静止状态 | 研究依赖于人工皮肤模型，可能无法完全模拟自然感染环境 | 探究布氏锥虫在人类皮肤中的发育过程及其持久感染机制 | 布氏锥虫及其在人工人类皮肤中的发育 | 寄生虫学 | 锥虫病 | 单细胞RNA测序 | 人工人类皮肤模型 | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 105 | 2025-05-09 |
Single-cell epigenomics and spatiotemporal transcriptomics reveal human cerebellar development
2023-11-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43568-6
PMID:37993461
|
研究论文 | 通过单细胞表观基因组学和时空转录组学揭示人类小脑发育的分子调控网络 | 结合单细胞转录组学、空间转录组学和单细胞染色质可及性状态，系统描绘了人类胎儿小脑发育的时空景观 | 研究主要关注人类胎儿小脑发育，可能不适用于其他物种或成体小脑 | 揭示人类小脑发育的分子调控机制及其与神经精神疾病的关联 | 人类胎儿小脑 | 基因组学 | 神经精神疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学、单细胞染色质可及性分析 | NA | 单细胞RNA-seq数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | 人类胎儿小脑样本 | NA | NA | NA | NA |
| 106 | 2025-10-07 |
PD-1- CD45RA+ effector-memory CD8 T cells and CXCL10+ macrophages are associated with response to atezolizumab plus bevacizumab in advanced hepatocellular carcinoma
2023-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43381-1
PMID:38030622
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析阿特珠单抗联合贝伐珠单抗治疗晚期肝细胞癌的免疫反应机制 | 首次在单细胞水平揭示PD-1-CD45RA+效应记忆CD8 T细胞和CXCL10+巨噬细胞与治疗反应的相关性 | 样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 探索阿特珠单抗联合贝伐珠单抗治疗晚期肝细胞癌的免疫机制 | 晚期肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 107 | 2025-10-07 |
Integrating spatial and single-cell transcriptomics data using deep generative models with SpatialScope
2023-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43629-w
PMID:38030617
|
研究论文 | 提出一种整合空间转录组和单细胞转录组数据的深度生成模型方法SpatialScope | 通过创新的模型和算法设计，能够同时提升测序型ST数据的单细胞分辨率并准确推断成像型ST数据的全转录组表达水平 | NA | 解决当前空间转录组技术在细胞分辨率或全转录组分析方面的局限性 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序参考数据 | 计算生物学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 深度生成模型 | 空间转录组数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 108 | 2025-10-07 |
Cellular underpinnings of the selective vulnerability to tauopathic insults in Alzheimer's disease
2023-Nov-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.06.548027
PMID:38076913
|
研究论文 | 本研究通过细胞类型定位技术探索阿尔茨海默病中tau病理选择性易感性的细胞基础 | 首次在全脑水平系统研究细胞类型分布与tau病理选择性易感性的关系，发现细胞类型组成比风险基因更能预测tau病理 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 揭示阿尔茨海默病中tau病理区域性易感性的细胞机制 | 小鼠脑组织中的神经元和非神经元细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，细胞类型定位分析，基因本体分析 | MISS（矩阵逆和子集选择）细胞类型定位流程 | 单细胞RNA测序数据，转基因小鼠模型数据 | 12种不同的PS19小鼠模型，5项转基因小鼠研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 109 | 2025-10-07 |
DeMixSC: a deconvolution framework that uses single-cell sequencing plus a small benchmark dataset for improved analysis of cell-type ratios in complex tissue samples
2023-Nov-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.10.561733
PMID:37873318
|
研究论文 | 提出一种名为DeMixSC的去卷积框架，通过结合单细胞测序数据和小型基准数据集来提高复杂组织样本中细胞类型比例的分析精度 | 引入匹配跨平台生物信号的实验设计，开发基于加权非负最小二乘法的新框架，能够识别和调整技术差异高的基因 | NA | 解决跨测序平台技术差异对细胞类型去卷积分析精度限制的问题 | 复杂生物样本中的细胞类型比例分析 | 生物信息学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | 加权非负最小二乘法 | 基因表达数据 | 453名年龄相关性黄斑变性患者队列加上健康视网膜基准数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 110 | 2025-10-07 |
Differential chromatin accessibility and transcriptional dynamics define breast cancer subtypes and their lineages
2023-Nov-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.31.565031
PMID:37961519
|
研究论文 | 本研究通过多组学技术分析乳腺癌亚型与起源细胞之间的染色质可及性和转录动态特征 | 首次在单细胞水平整合染色质可及性和转录组数据，系统揭示乳腺癌亚型与特定起源细胞的谱系关系 | 样本量相对有限（37例患者），部分分子机制仍需进一步验证 | 阐明乳腺癌不同亚型的细胞起源及其转录调控网络 | 37名乳腺癌患者的61个样本（包括肿瘤和正常组织） | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,单核ATAC测序,空间转录组学,多重成像 | PAM50亚型分析算法,轨迹分析,调控网络分析 | 基因组,转录组,表观基因组,空间定位数据 | 37例乳腺癌患者的61个样本 | NA | 单细胞RNA-seq,单核ATAC-seq,空间转录组学,多重成像, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 111 | 2025-10-07 |
Early clinical outcomes and molecular smooth muscle cell phenotyping using a prophylactic aortic arch replacement strategy in Loeys-Dietz syndrome
2023-11, The Journal of thoracic and cardiovascular surgery
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.jtcvs.2023.07.023
PMID:37500053
|
研究论文 | 本研究评估了Loeys-Dietz综合征患者预防性主动脉弓置换术的临床风险和血流动力学后果，并通过单细胞RNA测序表征平滑肌细胞表型 | 首次结合预防性主动脉弓置换术的临床评估与单细胞RNA测序分析，揭示Loeys-Dietz综合征主动脉平滑肌细胞的表型连续变化谱 | 样本量较小（Loeys-Dietz综合征患者n=8），随访时间较短（中位2年） | 评估预防性主动脉弓置换术在Loeys-Dietz综合征中的安全性和有效性，并探究疾病相关的平滑肌细胞分子表型 | Loeys-Dietz综合征患者、马凡综合征患者、无主动脉病变的对照患者及器官捐献者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，四维血流磁共振成像，组织学评估 | NA | 基因表达数据，医学影像数据，组织学数据 | 8例Loeys-Dietz综合征患者，5例马凡综合征患者，5例对照患者，2例器官捐献者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 112 | 2025-10-07 |
A framework for defining mesenchymal cell types associated with murine periosteal and endosteal bone
2023-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.17.567528
PMID:38014179
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据建立了小鼠骨相关间充质细胞类型的分类框架 | 首次比较了骨膜和骨内膜/骨小梁的细胞差异，定义了11个主要细胞簇，包括新发现的osteo-X细胞类型 | 研究仅针对小鼠模型，人类骨细胞的适用性需要进一步验证 | 增加骨细胞单细胞RNA测序数据量，比较骨膜与骨内细胞差异，明确小鼠骨相关细胞类型主要类别 | 小鼠骨相关间充质细胞 | 单细胞转录组学 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 超过100,000个间充质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 113 | 2025-10-07 |
Steatosis drives monocyte-derived macrophage accumulation in human metabolic dysfunction-associated fatty liver disease
2023-Nov, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100877
PMID:37869071
|
研究论文 | 本研究探讨了代谢功能障碍相关脂肪肝病中巨噬细胞异质性与肝脏脂肪变性的关系 | 首次在人类MAFLD中系统描述巨噬细胞亚群组成，发现单核细胞源性巨噬细胞与肝脏脂肪变性程度相关，并揭示其在脂质摄取中的独特作用 | 样本量较小（n=21），单细胞RNA测序仅对3个样本进行，缺乏长期随访数据 | 研究人类MAFLD早期阶段巨噬细胞异质性及其与肝脏脂肪变性的关系 | 接受减重手术的21名参与者的肝组织样本及小鼠肝脂肪变性模型 | 单细胞生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫荧光，H&E显微镜，MRI，电子显微镜 | NA | 基因表达数据，图像数据，临床数据 | 21名人类参与者，其中3个样本进行单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 114 | 2025-10-07 |
Gut Isolation from Zebrafish Larvae for Single-cell RNA Sequencing
2023-11-10, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/65876
PMID:38009742
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研究论文 | 开发了一种从斑马鱼幼体中分离肠道细胞用于单细胞RNA测序的方法 | 建立了斑马鱼幼体肠道活细胞分离和单细胞RNA测序的完整实验方案 | 方法依赖于手动解剖，可能受操作者技术水平影响 | 研究胃肠道发育和功能障碍的分子机制 | 斑马鱼幼体（受精后5天）的肠道细胞 | 单细胞组学 | 肠道神经肌肉疾病 | 单细胞RNA测序，荧光激活细胞分选 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 斑马鱼幼体肠道细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2025-10-07 |
Multiplex Immunohistochemistry Staining for Paraffin-embedded Lung Cancer Tissue
2023-11-21, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/65850
PMID:38078595
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研究论文 | 本文开发了用于石蜡包埋肺癌组织的多重免疫组化染色实验方案 | 通过优化实验方案解决了肺组织自发荧光和通道串扰问题，实现了标记靶细胞和蛋白的多重免疫组化染色 | NA | 开发有效的多重免疫组化染色方法以解析肺癌肿瘤微环境中细胞间关系 | 临床来源的肺鳞状细胞癌石蜡包埋组织切片 | 数字病理学 | 肺癌 | 多重免疫组化，酪胺信号放大技术 | NA | 图像 | NA | NA | 多重免疫组化染色 | NA | 基于酪胺信号放大技术的多重免疫组化染色方法 |
| 116 | 2025-10-07 |
Functional Pdgfra fibroblast heterogeneity in normal and fibrotic mouse lung
2023-11-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.164380
PMID:37824216
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了正常和纤维化小鼠肺中Pdgfra+成纤维细胞的功能异质性 | 首次在单细胞水平上描述了肺损伤后Pdgfra+脂成纤维细胞的转录组变化，并发现其获得促纤维化特性同时保留脂源性身份 | 研究仅限于小鼠模型，且观察时间点为损伤后14天，未涵盖纤维化全过程 | 探究肺损伤对Pdgfra+脂成纤维细胞功能的影响及其在肺纤维化中的作用机制 | 小鼠肺组织中的Pdgfra+成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序，PdgfraGFP谱系追踪，3D类器官模型 | NA | 单细胞转录组数据 | 正常和博来霉素损伤后14天的小鼠肺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2025-10-07 |
Smooth muscle-derived adventitial progenitor cells direct atherosclerotic plaque composition complexity in a Klf4-dependent manner
2023-11-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.174639
PMID:37991018
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研究论文 | 本研究探讨平滑肌来源的外膜祖细胞通过Klf4依赖性方式调控动脉粥样硬化斑块组成复杂性 | 首次揭示AdvSca1-SM祖细胞在慢性动脉粥样硬化中的作用机制及Klf4基因对其分化和斑块组成的调控功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证 | 阐明平滑肌来源外膜祖细胞在动脉粥样硬化中的功能及其分子调控机制 | 血管平滑肌来源的外膜祖细胞(AdvSca1-SM)及其在动脉粥样硬化斑块中的分化命运 | 心血管疾病研究 | 动脉粥样硬化 | scRNA-Seq, 流式细胞术, 组织学分析, 细胞谱系追踪 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 组织学图像 | 野生型和Klf4敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 118 | 2025-10-07 |
Coordinated immune dysregulation in Juvenile Dermatomyositis revealed by single-cell genomics
2023-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.07.566033
PMID:37986917
|
研究论文 | 通过单细胞基因组学揭示幼年皮肌炎中协调的免疫失调机制 | 首次通过单细胞转录组学结合表面蛋白表达分析，发现B细胞区室向幼稚状态偏移是JDM的标志特征，并揭示I型干扰素反应与蛋白质加工失调和细胞死亡程序调控的协调网络 | 研究样本量有限，仅分析了血液样本，未涉及组织特异性免疫反应 | 解析幼年皮肌炎的免疫失调机制 | 幼年皮肌炎患者的外周血单核细胞 | 单细胞基因组学 | 幼年皮肌炎 | 单细胞转录组学，表面蛋白表达分析，免疫表型分析，网络分析 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白表达数据 | 不同疾病活动期的JDM患者血液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 119 | 2025-10-07 |
Virus-specific TRM cells of both donor and recipient origin reside in human kidney transplants
2023-11-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172681
PMID:37751288
|
研究论文 | 本研究表征了人类肾移植组织中组织驻留淋巴细胞的特征及其在抗病毒免疫中的潜在作用 | 首次发现肾移植中存在供体和受体来源的病毒特异性组织驻留记忆T细胞，并证明它们具有相似的转录组特征和共享的TCR克隆型 | 研究样本为肾移植切除组织，可能无法完全代表正常功能移植中的免疫状态 | 表征肾移植中组织驻留淋巴细胞的特征并研究其在抗病毒免疫中的作用 | 人类肾移植切除组织中的组织驻留淋巴细胞 | 免疫学 | 肾脏移植 | 单细胞转录组测序, T细胞受体测序, 病毒dextramer染色 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据, 流式细胞术数据 | 肾移植切除组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | NA |
| 120 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics analysis of proliferative diabetic retinopathy fibrovascular membranes reveals AEBP1 as fibrogenesis modulator
2023-11-02, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172062
PMID:37917183
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析糖尿病视网膜病变纤维血管膜，揭示AEBP1在纤维生成中的调控作用 | 首次在增生性糖尿病视网膜病变纤维血管膜中通过单细胞RNA测序鉴定AEBP1作为周细胞-肌成纤维细胞转化的关键调控因子 | 样本来源仅限于手术切除的纤维血管膜，未涉及更广泛的疾病阶段验证 | 探索糖尿病视网膜病变纤维血管膜的细胞分子特征，寻找新的治疗靶点 | 糖尿病视网膜病变患者的视网膜前纤维血管膜 | 单细胞转录组学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 手术切除的纤维血管膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |