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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2025-10-05
A mouse model of ZTTK syndrome reveals indispensable SON functions in organ development and hematopoiesis
2023-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过建立ZTTK综合征小鼠模型,揭示了SON基因在器官发育和造血过程中的关键作用 首次建立SON单倍体不足小鼠模型,成功模拟人类ZTTK综合征症状,并通过单细胞转录组分析揭示了造血发育异常机制 未明确说明样本量大小,且为动物模型研究,结果向人类临床转化的有效性需要进一步验证 研究SON基因在器官发育和造血过程中的功能,探索ZTTK综合征的发病机制 SON单倍体不足小鼠模型及其造血干细胞和祖细胞 发育生物学 ZTTK综合征 单细胞转录组测序,表面标志物分析 小鼠疾病模型 基因表达数据,表型数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
42 2025-10-06
Cytomulate: accurate and efficient simulation of CyTOF data
2023-11-16, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 开发了一种准确高效的CyTOF数据模拟算法Cytomulate 能够捕捉CyTOF数据的多种特征,在整体数据分布学习上优于scDesign2、Splatter等单细胞RNA-seq导向方法和LAMBDA等生成模型 NA 为流式飞行时间质谱数据分析方法的开发和评估提供基础 CyTOF数据 机器学习 NA 流式飞行时间质谱 生成模型 质谱数据 NA NA 质谱流式细胞术 NA NA
43 2025-10-06
Unified Mouse and Human Kidney Single-Cell Expression Atlas Reveal Commonalities and Differences in Disease States
2023-11-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本研究构建了统一的小鼠和人类肾脏单细胞表达图谱,揭示了疾病状态的共性和差异 首次系统性地比较了18种不同小鼠肾脏疾病模型的单细胞和批量基因表达数据,并直接对比了小鼠糖尿病肾病模型与人类患者的单细胞表达特征 小鼠糖尿病肾病模型与人类患者在单细胞水平的基因表达变化重叠较小 系统分析小鼠肾脏疾病模型的基因表达特征,并与人类疾病状态进行比较 18种小鼠肾脏疾病模型和人类糖尿病肾病患者的肾脏组织 单细胞组学 肾脏疾病 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 批量基因表达分析 张量分解分析 基因表达数据 36个单细胞RNA测序样本, 42个批量基因表达样本, 近300,000个细胞 NA 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 NA NA
44 2025-10-06
Integrative single-cell meta-analysis reveals disease-relevant vascular cell states and markers in human atherosclerosis
2023-11-28, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 通过整合22个单细胞RNA测序库的元分析,构建了包含118,578个细胞的人类动脉粥样硬化综合图谱 首次通过大规模单细胞元分析揭示血管细胞状态与动脉粥样硬化的关联,并发现LTBP1和CRTAC1作为疾病进展标志物 基于已有数据集的元分析,可能受原始研究技术差异的限制 解析人类动脉粥样硬化中血管细胞状态与疾病关联机制 人类动脉粥样硬化组织中的血管和免疫细胞 单细胞基因组学 心血管疾病 scRNA-seq, 全基因组关联研究, 空间成像分析 整合元分析 单细胞转录组数据, 基因组数据, 空间成像数据 118,578个细胞来自22个scRNA-seq文库 NA 单细胞RNA测序 NA NA
45 2025-10-06
Spatial proteo-transcriptomic profiling reveals the molecular landscape of borderline ovarian tumors and their invasive progression
2023-Nov-13, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究通过空间蛋白质组学和空间转录组学整合分析,揭示了卵巢交界性肿瘤向低级别浆液性癌侵袭进展的分子机制 首次整合空间蛋白质组学和空间转录组学技术,在分子水平上解析了卵巢交界性肿瘤向侵袭性癌转化的全过程 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 阐明卵巢交界性肿瘤向低级别浆液性癌侵袭进展的分子机制 卵巢交界性肿瘤(SBT)和低级别浆液性癌(LGSC)患者组织样本 数字病理学 卵巢癌 空间蛋白质组学, 空间转录组学, 基因敲低, 药物抑制 NA 空间蛋白质组数据, 空间转录组数据 NA NA 空间蛋白质组学, 空间转录组学 NA NA
46 2025-10-06
CGCom: a framework for inferring Cell-cell Communication based on Graph Neural Network
2023-Nov-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出基于图神经网络的细胞间通讯推断框架CGCom,利用空间转录组数据预测细胞间通讯 首次将图神经网络与空间转录组数据结合,利用细胞邻近信息和配体-受体信号下游分子调控信息来推断细胞间通讯 仅在小鼠胚胎seqFISH数据集上进行了验证,尚未在其他生物系统或技术平台上测试 开发能够准确推断细胞间通讯的计算方法 小鼠胚胎细胞 生物信息学 NA 空间转录组学,单细胞转录组测序 图神经网络(GNN) 空间转录组数据,单细胞基因表达数据 小鼠胚胎seqFISH数据集 NA 空间转录组学,seqFISH seqFISH NA
47 2025-10-06
Proteostasis governs differential temperature sensitivity across embryonic cell types
2023-11-09, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本研究通过全动物单细胞RNA测序揭示了不同胚胎细胞类型对温度敏感性的差异机制 首次使用全动物单细胞RNA测序技术系统分析温度胁迫下斑马鱼胚胎发育,发现脊索鞘细胞因蛋白质稳态失衡导致发育缺陷 研究仅针对斑马鱼胚胎,结果在其他物种中的普适性需要进一步验证 探究胚胎发育过程中不同细胞类型对温度敏感性的分子基础 斑马鱼胚胎 发育生物学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 数百个斑马鱼胚胎 NA 单细胞RNA-seq NA 全动物单细胞RNA测序
48 2025-10-06
Complement C1q essential for aeroallergen sensitization via CSF1R+ conventional dendritic cells type 2
2023-11, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 本研究揭示了补体C1q通过CSF1R+传统2型树突状细胞在气源性过敏原致敏中的关键作用 首次发现C1q特异性富集于肺CSF1R+cDC2s细胞,并证明C1q-LRP1轴在过敏原识别和哮喘发病中的核心机制 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 阐明CSF1R+cDC2s识别吸入过敏原的分子机制 小鼠肺树突状细胞和人类支气管肺泡灌洗样本 免疫学 哮喘 单细胞RNA测序,基因敲除模型,过敏原激发试验 NA 基因表达数据,蛋白质检测数据 小鼠模型和人类BAL样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
49 2025-10-06
Defining the cellular complexity of the zebrafish bipotential gonad
2023-11-15, Biology of reproduction IF:3.1Q2
研究论文 本研究通过转基因报告基因和单细胞测序分析定义了斑马鱼双潜能性腺中关键细胞类型的出现时间 首次发现斑马鱼性腺动脉的形成过程,揭示了血管和淋巴管在双潜能性腺中的同步发育,并识别了卵巢周细胞特有的215个基因 研究主要基于斑马鱼模型,结果向其他物种的推广需要进一步验证 阐明斑马鱼早期双潜能性腺发育过程中关键细胞类型的出现和功能 斑马鱼双潜能性腺中的内皮细胞、周细胞和巨噬细胞 发育生物学 生殖系统疾病 单细胞测序, 转基因报告基因, 光转换蛋白技术 NA 基因表达数据, 细胞成像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
50 2025-10-06
Anti-PD-1 immunotherapy with androgen deprivation therapy induces robust immune infiltration in metastatic castration-sensitive prostate cancer
2023-11-13, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析转移性去势敏感性前列腺癌患者在接受抗PD-1免疫治疗联合雄激素剥夺治疗后的肿瘤微环境免疫浸润变化 首次在转移性去势敏感性前列腺癌中开展纵向单细胞RNA测序分析,揭示跨多个转移部位保守的免疫亚群及其与治疗反应和临床结局的关联 样本来源于单一二期临床试验,样本量有限,需要更大规模研究验证 探究转移性去势敏感性前列腺癌肿瘤微环境的免疫特征及治疗反应机制 转移性去势敏感性前列腺癌患者的转移部位组织样本 数字病理 前列腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 二期临床试验(NCT03951831)参与者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
51 2025-10-06
Transcriptomes and metabolism define mouse and human MAIT cell populations
2023-11-10, Science immunology IF:17.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和代谢分析定义了小鼠和人类MAIT细胞在不同器官中的群体特征及发育途径 首次系统比较了小鼠和人类MAIT细胞的转录组和代谢特征,揭示了物种间MAIT细胞功能的差异及环境对MAIT细胞的影响 研究主要关注MAIT17和MAIT1亚群,可能未完全覆盖所有MAIT细胞亚型;人类样本仅限于肺和血液 阐明小鼠和人类MAIT细胞在不同组织中的转录组和代谢特征差异 小鼠和人类黏膜相关恒定T细胞(MAIT细胞) 免疫学 NA 单细胞RNA测序, 表型分析, 代谢分析 NA 转录组数据, 代谢数据 多器官组织样本(包括胸腺、肺、血液) NA 单细胞RNA测序 NA NA
52 2025-10-06
IFNɣ but not IFNα increases recognition of insulin defective ribosomal product-derived antigen to amplify islet autoimmunity
2023-11, Diabetologia IF:8.4Q1
研究论文 本研究探讨了干扰素γ通过诱导免疫蛋白酶体亚基表达增强胰岛素缺陷核糖体产物衍生抗原呈递的机制 首次揭示IFNγ通过诱导PSMB10表达增强胰岛素DRiP衍生抗原呈递,并发现该基因在1型糖尿病患者胰岛β细胞中特异性上调 研究主要使用人β细胞系EndoC-βH1,未在原发性人胰岛中完全验证 研究早期先天细胞因子和晚期免疫适应性事件在胰岛素DRiP衍生肽呈递中的作用 人胰岛β细胞、EndoC-βH1细胞系、糖尿病源性CD8+ T细胞 免疫学 1型糖尿病 单细胞转录组测序、siRNA干扰、抗原肽呈递检测 NA 单细胞RNA测序数据、基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
53 2025-10-06
Spatial enrichment of the type 1 interferon signature in the brain of a neuropsychiatric lupus murine model
2023-11, Brain, behavior, and immunity
研究论文 本研究通过验证神经精神性狼疮小鼠模型,揭示大脑中1型干扰素信号的空间富集特征及其对细胞通讯通路的抑制作用 首次发现1型干扰素特征在大脑实质中形成空间分区的斑块状富集,并通过单核测序揭示其对神经元发育通路的普遍抑制 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类患者中验证 探究1型干扰素在中枢神经系统中介导神经精神性狼疮症状的机制 神经精神性狼疮小鼠模型的大脑组织 空间转录组学 神经精神性狼疮 单核RNA测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 空间定位数据 NA NA 单核RNA测序, 空间转录组学 NA NA
54 2025-10-06
Machine learning and single-cell sequencing reveal the potential regulatory factors of mitochondrial autophagy in the progression of gastric cancer
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
研究论文 通过机器学习和单细胞测序技术分析线粒体自噬相关基因在胃癌进展中的潜在调控因子 结合机器学习算法与单细胞RNA测序技术系统分析胃癌中线粒体自噬的调控网络 研究样本量有限(13个GC样本),需要进一步实验验证 全面分析线粒体自噬相关基因在胃癌进展中的作用 胃癌细胞和组织 机器学习 胃癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序 支持向量机, 随机森林 基因表达数据 13个GC样本中的28,836个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
55 2025-10-06
A novel coiled-coil domain containing-related gene signature for predicting prognosis and treatment effect of breast cancer
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
研究论文 开发了一个基于卷曲螺旋结构域相关基因的预后特征模型,用于预测乳腺癌患者的预后和治疗效果 首次系统研究CCDC蛋白家族在乳腺癌中的预后价值,并构建了包含5个基因的风险预测模型 研究基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证 建立乳腺癌预后预测模型并评估其治疗指导价值 乳腺癌患者 生物信息学 乳腺癌 单细胞测序,基因表达分析,药物敏感性分析 Cox回归,LASSO回归,风险评分模型 基因表达数据,临床数据 来自TCGA、METABRIC和GEO数据库的乳腺癌样本 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
56 2025-10-06
The role of KPNA2 as a monotonically changing differentially expressed gene in the diagnosis, risk stratification, and chemotherapy sensitivity of chronic hepatitis B-liver cirrhosis-hepatocellular carcinoma
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
研究论文 本研究探讨KPNA2基因在慢性乙型肝炎-肝硬化-肝细胞癌演变过程中的诊断、风险分层和化疗敏感性价值 首次发现KPNA2作为单调变化差异表达基因在CLH演变过程中的动态表达规律,并构建了预测HCC发生风险的列线图模型 研究样本量有限,需要更大规模的前瞻性研究验证KPNA2的临床应用价值 探索KPNA2在慢性乙型肝炎-肝硬化-肝细胞癌演变过程中的诊断和预后价值 慢性乙型肝炎患者、肝硬化患者和肝细胞癌患者 生物信息学 肝细胞癌 ELISA, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 生物信息学分析 列线图模型, Cox回归模型 基因表达数据, 临床病理数据 未明确具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
57 2025-10-06
Multi-omics analysis of expression profile and prognostic values of connexin family in LUAD
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
研究论文 本研究通过多组学分析探讨了连接蛋白家族在肺腺癌中的表达谱和预后价值 首次在泛癌和肺腺癌中系统分析连接蛋白家族的表达差异和预后意义,并构建了结合风险评分和临床特征的预后模型 NA 全面分析连接蛋白基因家族在肺腺癌中的表达谱、预后意义、遗传改变、潜在生物学功能和药物敏感性 连接蛋白基因家族,特别是GJB2-5基因 生物信息学 肺腺癌 单细胞测序,多组学分析 预后风险模型,列线图 基因表达数据,临床数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
58 2025-10-06
Integrated single-cell and bulk sequencing analyses with experimental validation identify the prognostic and immunological implications of CD226 in pan-cancer
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
研究论文 通过整合单细胞和批量测序分析结合实验验证,研究CD226在泛癌中的预后和免疫学意义 首次在泛癌水平系统研究CD226的表达特征、预后价值和免疫调控功能,并验证其作为免疫治疗生物标志物的潜力 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于小鼠黑色素瘤模型,需要更多临床样本验证 探究CD226在泛癌中的生物学功能、肿瘤免疫作用及其预测预后和免疫治疗反应的潜力 多种癌症类型、肿瘤浸润免疫细胞(CD8+T细胞、NK细胞) 生物信息学 泛癌 单细胞测序, 批量测序, 基因集富集分析, 流式细胞术 NA 基因表达数据, 单细胞数据, 临床预后数据 多种癌症类型的批量测序数据和单细胞测序数据 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
59 2025-10-06
Selenium metabolism heterogeneity in pan-cancer: insights from bulk and single-cell RNA sequencing
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
研究论文 通过批量和单细胞RNA测序分析泛癌中硒代谢异质性及其与免疫反应和癌症生物学的关联 首次在泛癌水平系统描绘硒代谢景观,结合单细胞分辨率揭示细胞间通讯机制 基于公共数据库的回顾性分析,需要实验验证硒代谢的具体分子机制 探究硒代谢在癌症发生发展和免疫调节中的作用 多种癌症类型和细胞类型(包括上皮细胞、成纤维细胞和巨噬细胞) 生物信息学 泛癌 RNA测序, 基因集富集分析(GSEA), 机器学习, 细胞间通讯分析 机器学习模型 基因表达数据 TCGA、GTEx、CCLE和单细胞数据集整合分析 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
60 2025-10-06
Identification an innovative classification and nomogram for predicting the prognosis of thyroid carcinoma patients and providing therapeutic schedules
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
研究论文 本研究基于程序性细胞死亡模式开发甲状腺癌预后预测模型和分子分型 首次系统分析程序性细胞死亡模式与甲状腺癌预后的关联,开发了基于机器学习的预后特征和分子分型 研究数据主要来自公共数据库,需要进一步实验验证 探讨程序性细胞死亡模式与甲状腺癌预后的关系并开发预后预测模型 甲状腺癌患者 机器学习 甲状腺癌 机器学习算法,非负矩阵分解,单细胞转录组分析 SVM,多变量Cox回归,逻辑回归 基因表达谱,临床数据,单细胞转录组数据 568名甲状腺癌患者(来自TCGA数据库)和GSE184362单细胞数据集 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
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