单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
441	2024-08-05	Targeting histone deacetylase suppresses tumor growth through eliciting METTL14-modified m6 A RNA methylation in ocular melanoma 2023-11, Cancer communications (London, England) DOI:10.1002/cac2.12471 PMID:37466203	研究论文	本研究探讨了组蛋白去乙酰化酶抑制剂如何通过调控METTL14修饰的m6 A RNA甲基化抑制眼黑色素瘤的肿瘤生长	揭示了HDAC/METTL14/FAT4表观遗传级联中的组蛋白和RNA之间的相互作用	研究主要集中在眼黑色素瘤细胞，对其他癌症类型的适用性尚待验证	探讨组蛋白乙酰化和m6 A修饰在眼黑色素瘤肿瘤发生调控中的作用	眼黑色素瘤细胞及其相关的分子机制	数字病理学	眼黑色素瘤	RNA测序, 免疫沉淀-qPCR, 单细胞测序等	细胞模型和正位异种移植模型	RNA数据	NA
442	2024-08-07	Establishment of a prognostic model based on m6A regulatory factors and stemness of hepatocellular carcinoma using RNA-seq data and scRNA-seq data 2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3 DOI:10.1007/s00432-023-05045-x PMID:37466793	研究论文	本研究基于m6A调控因子和肝细胞癌的干细胞特性，利用RNA-seq和scRNA-seq数据建立了一个预测肝细胞癌预后的模型	研究首次综合分析了m6A调控因子与肝细胞癌干细胞之间的关系，并建立了一个临床工具来预测肝细胞癌的预后	NA	旨在建立一个预测肝细胞癌预后的临床工具	肝细胞癌的m6A调控因子和干细胞特性	数字病理学	肝癌	RNA-seq, scRNA-seq	NA	基因表达数据	使用了ICGC和TCGA数据集
443	2024-08-07	Discovery and Validation of Novel Genes in a Large Chinese Autism Spectrum Disorder Cohort 2023-11-15, Biological psychiatry IF:9.6Q1 DOI:10.1016/j.biopsych.2023.06.025 PMID:37393044	研究论文	本文通过对中国大规模自闭症谱系障碍（ASD）群体进行全外显子测序和单细胞RNA测序，发现并验证了新的ASD候选基因	本文首次在东亚人群中进行大规模ASD遗传分析，并发现了9个未在当前ASD基因数据库中的新候选基因	研究主要集中在中国ASD群体，未来需要更多不同种族背景的ASD群体进行验证	旨在发现和验证中国ASD群体中的新基因，并探讨不同种族背景下的ASD遗传结构	中国ASD群体及其遗传变异	遗传学	自闭症谱系障碍	全外显子测序，单细胞RNA测序	NA	基因数据	1141个中国ASD三联体样本
444	2024-08-07	SKIL/SnoN attenuates TGF-β1/SMAD signaling-dependent collagen synthesis in hepatic fibrosis 2023-Nov-03, Biomolecules & biomedicine DOI:10.17305/bb.2023.9000 PMID:37389959	研究论文	本研究探讨了SKIL/SnoN在肝纤维化中的作用及其对TGF-β1/SMAD信号通路的调控	首次综合运用bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析肝纤维化患者样本，验证了SKIL/SnoN在肝纤维化中的作用	研究主要基于动物模型和细胞系，需要进一步的人体临床研究验证	评估SnoN在肝纤维化中的作用及其对TGF-β1信号通路的调控	肝星状细胞（HSC）和肝纤维化	NA	肝纤维化	RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, PCR, 蛋白质印迹	NA	RNA	包括肝纤维化患者样本和转染的HSC-T6及LX-2细胞系的大鼠肝样本
445	2024-08-07	Cancer-associated fibroblasts contribute to the immunosuppressive landscape and influence the efficacy of the combination therapy of PD-1 inhibitors and antiangiogenic agents in hepatocellular carcinoma 2023-Nov-01, Cancer IF:6.1Q1 DOI:10.1002/cncr.34935 PMID:37395148	研究论文	本研究探讨了癌症相关成纤维细胞（CAFs）在肝细胞癌（HCC）肿瘤微环境中的作用及其对PD-1抑制剂和抗血管生成药物联合治疗效果的影响	研究揭示了CAFs丰度对HCC患者预后和治疗反应的影响，并证实了PD-1抑制剂和抗血管生成药物联合治疗在CAFs高丰度患者中的潜在价值	NA	研究CAFs在HCC肿瘤微环境中的作用及其对特定治疗方案疗效的影响	肝细胞癌患者及其肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	基于39个与CAFs相关的基因对HCC患者的单细胞RNA测序数据进行无监督聚类，将患者分为CAFs低丰度群和高丰度群
446	2024-08-07	mTORC2 acts as a gatekeeper for mTORC1 deficiency-mediated impairments in ILC3 development 2023-Nov, Acta pharmacologica Sinica IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41401-023-01120-8 PMID:37407703	研究论文	本研究探讨了mTORC1在ILC3发育中的关键作用及其与mTORC2的相互作用	首次揭示了mTORC1缺乏通过mTORC2介导的机制影响ILC3发育和肠道稳态	研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证结果	探究mTORC1和mTORC2在ILC3发育和肠道免疫中的作用	先天性淋巴细胞3组（ILC3s）及其在肠道免疫和屏障功能中的作用	免疫学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	小鼠模型
447	2024-08-05	Single-cell RNA-seq reveals actinic keratosis-specific keratinocyte subgroups and their crosstalk with secretory-papillary fibroblasts 2023-Nov, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV IF:8.4Q1 DOI:10.1111/jdv.19289 PMID:37357444	研究论文	这项研究探讨了与日光角化症相关的角质形成细胞亚群及其与分泌性乳头状成纤维细胞之间的相互作用。	研究揭示了特定于日光角化症的角质形成细胞簇以及其功能，特别是IL1R2+WFDC2+聚类在AK发展中的重要性。	研究未详细探讨不同细胞间相互作用的全部机制和其他可能的信号通路。	研究的目的是调查角质形成细胞的异质性及其在日光角化症发展中的作用。	研究对象为日光角化症组织和其邻近正常皮肤中的角质形成细胞和成纤维细胞簇。	数字病理	日光角化症	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	NA	细胞数据	13个角质形成细胞亚群
448	2024-08-05	Single-cell RNA-seq reveals abnormal differentiation of keratinocytes and increased inflammatory differentiated keratinocytes in atopic dermatitis 2023-Nov, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV IF:8.4Q1 DOI:10.1111/jdv.19256 PMID:37326015	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序分析了中国群体特应性皮炎中角质形成细胞的异常分化和炎症表型	发现了特应性皮炎损伤中IL19+ IGFL1+角质形成细胞的新亚群，并探讨了IL19在角质形成细胞中的作用	研究样本数量有限，仅涉及五名特应性皮炎患者	深入分析特应性皮炎在中国人群中的转录组特征	来自五名成人特应性皮炎患者和四名健康对照的真皮活检样本	数字病理学	特应性皮炎	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	细胞数据	五名特应性皮炎患者和四名健康对照
449	2024-08-05	Clonal expansion of intra-epithelial T cells in breast cancer revealed by spatial transcriptomics 2023-11-01, International journal of cancer IF:5.7Q1 DOI:10.1002/ijc.34620 PMID:37306359	研究论文	这篇文章提出了一种空间转录组学方法ST-FFPE，用于分析乳腺癌中肿瘤浸润淋巴细胞的空间分布	该研究展示了ST-FFPE方法能够分析福尔马林固定石蜡包埋样本，为涉及历史组织的研究提供了可能	本研究可能在样本数量和类型上有局限性，需要进一步验证其广泛适用性	旨在研究乳腺癌尤其是三阴性乳腺癌中的T细胞克隆扩增现象	主要研究肿瘤微环境中的T细胞、B细胞、树突状细胞、成纤维细胞和内皮细胞	数字病理学	乳腺癌	空间转录组学	NA	RNA	分析了来自不同肿瘤区室的样本
450	2024-08-07	A novel phenotype of B cells associated with enhanced phagocytic capability and chemotactic function after ischemic stroke 2023-Nov, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/1673-5374.371365 PMID:37282471	研究论文	本研究识别了一种与缺血性中风后增强的吞噬能力和趋化功能相关的新型B细胞表型	发现了具有巨噬细胞样特性的B细胞，这些细胞表现出增强的吞噬和趋化功能，并上调了与吞噬作用相关的基因表达	NA	探讨B细胞在缺血性中风中的作用及其潜在的免疫治疗价值	B细胞在缺血性中风中的表型及其功能	NA	缺血性中风	单细胞RNA测序	NA	细胞	包括小鼠和人类创伤性脑损伤、阿尔茨海默病和胶质母细胞瘤的脑组织样本
451	2024-08-07	Exploration of s new biomarker in osteosarcoma and association with clinical outcomes: TOP2A+ cancer associated fibroblasts 2023-Nov, The journal of gene medicine IF:3.2Q2 DOI:10.1002/jgm.3528 PMID:37246449	研究论文	本研究探索了骨肉瘤中的新型生物标志物TOP2A+癌症相关成纤维细胞及其与临床结果的关联	首次系统研究了癌症相关成纤维细胞（CAFs）在骨肉瘤中的作用，并识别出TOP2A+ CAFs作为致癌CAFs的亚群	研究样本量较小，仅基于6名骨肉瘤患者的单细胞RNA测序数据	旨在探索骨肉瘤中的新型生物标志物并评估其对临床结果的影响	骨肉瘤及其相关成纤维细胞	数字病理学	骨肉瘤	单细胞RNA测序	LASSO回归模型	基因表达数据	6名骨肉瘤患者的单细胞RNA测序数据及88个骨肉瘤样本的转录组数据
452	2024-08-05	Differential Effects of Ontamalimab Versus Vedolizumab on Immune Cell Trafficking in Intestinal Inflammation and Inflammatory Bowel Disease 2023-Nov-24, Journal of Crohn's & colitis DOI:10.1093/ecco-jcc/jjad088 PMID:37208197	研究论文	本研究探讨了Ontamalimab与Vedolizumab在肠道炎症和炎症性肠病中的免疫细胞迁移的不同影响	Ontamalimab展现出独特且更广泛的作用机制，超出Vedolizumab的机制	研究的结果基于小鼠实验模型，可能无法完全预测临床应用中的效果	探索Ontamalimab的作用机制并与Vedolizumab进行比较	研究对象包括活跃的炎症性肠病患者中的MAdCAM-1表达及其在小鼠模型中的作用	数字病理学	炎症性肠病	RNA测序, 免疫组化, 荧光显微镜	NA	单细胞RNA测序	使用了小鼠模型进行实验，具体样本数量未明确说明
453	2024-08-07	Engineered human Diamond-Blackfan anemia disease model confirms therapeutic effects of clinically applicable lentiviral vector at single-cell resolution 2023-11-01, Haematologica IF:8.2Q1 DOI:10.3324/haematol.2022.282068 PMID:37199130	研究论文	本研究利用CRISPR-Cas9和同源定向修复技术生成可追踪的RPS19缺陷细胞模型，以单细胞分辨率研究临床适用慢病毒载体的治疗效果	开发了一种温和的纳米吸管递送平台，用于编辑人类脐带血来源的CD34+造血干细胞和祖细胞中的RPS19基因，并首次通过单细胞RNA测序分析鉴定了特定的红系祖细胞及其异常细胞周期状态	NA	验证临床适用慢病毒载体在单细胞分辨率下的治疗效果	RPS19缺陷细胞模型及人类脐带血来源的CD34+造血干细胞和祖细胞	基因编辑	骨髓衰竭症	CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	人类脐带血来源的CD34+造血干细胞和祖细胞
454	2024-08-08	Fibroblast growth factor receptor 1 as a potential marker of terminal effector peripheral T helper cells in rheumatoid arthritis patients 2023-11-02, Rheumatology (Oxford, England) DOI:10.1093/rheumatology/kead220 PMID:37184877	研究论文	本研究旨在探讨纤维母细胞生长因子受体1（FGFR1）在类风湿性关节炎（RA）患者CD4+ T细胞中的表达及其在疾病发病机制中的作用	首次揭示了FGFR1在RA患者外周血和滑膜中CD4+ T细胞的表达情况，并发现FGFR1阳性Tph细胞具有终末效应细胞表型	NA	研究FGFR1在RA患者CD4+ T细胞中的表达及其在疾病发病机制中的作用	RA患者的CD4+ T细胞	免疫学	类风湿性关节炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	细胞	RA患者和健康对照组的外周血和滑膜CD4+ T细胞
455	2024-08-08	scRNA-seq and proteomics reveal the distinction of M2-like macrophages between primary and recurrent malignant glioma and its critical role in the recurrence 2023-11, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1 DOI:10.1111/cns.14269 PMID:37194413	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析，揭示了原发性和复发性恶性胶质瘤中M2样肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的差异及其在复发中的关键作用	本研究首次详细描述了原发性和复发性恶性胶质瘤中M2样TAMs的差异，并揭示了其在肿瘤复发中的动态基因表达变化和细胞间相互作用机制	研究样本仅来自6名患者，可能限制了结果的普遍性和广泛适用性	探讨原发性和复发性恶性胶质瘤中M2样TAMs的差异及其在复发中的作用	原发性和复发性恶性胶质瘤中的M2样肿瘤相关巨噬细胞	数字病理学	脑肿瘤	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	23,010个单细胞来自6名患者
456	2024-08-05	An interferon gamma response signature links myocardial aging and immunosenescence 2023-11-15, Cardiovascular research IF:10.2Q1 DOI:10.1093/cvr/cvad068 PMID:37141306	研究论文	本研究探讨了衰老的T细胞与老年小鼠心肌细胞生物学变化之间的关系	揭示了衰老与心肌IFN-γ信号增强之间的关系，以及这对心力衰竭中的炎症和代谢变化的影响	研究主要在小鼠模型中进行，可能限制了结果向人类的翻译相关性	研究衰老如何影响心脏的免疫及代谢环境	聚焦于不同年龄段C57BL/6J小鼠心脏内的T细胞及心肌细胞	数字病理学	心脏病	单细胞RNA/T细胞受体测序	NA	单细胞基因组数据	使用2、6、12和18个月龄的C57BL/6J小鼠
457	2024-08-05	AAFL: automatic association feature learning for gene signature identification of cancer subtypes in single-cell RNA-seq data 2023-11-10, Briefings in functional genomics IF:2.5Q3 DOI:10.1093/bfgp/elac047 PMID:37122141	研究论文	本研究提出了一种新的基因选择方法，自动关联特征学习（AAFL），用于单细胞RNA测序数据中癌症亚型的基因特征识别	AAFL方法能够同时为不同的细胞亚群识别不同的基因特征，克服了以往只选择相同基因的问题	本研究未讨论AAFL方法在其他类型癌症或其他数据集上的适用性	探讨如何通过基因特征识别改善癌症亚型的精确分类	单细胞RNA测序数据中的癌细胞亚群和基因特征	数字病理学	皮肤癌	RNA-seq	残差网络与低秩网络相结合的模型	基因表达数据	涉及真实的黑色素瘤癌症的单细胞RNA测序数据集
458	2024-08-08	Mapping Genetic Susceptibility to Stenosis in the Proximal Airway 2023-11, The Laryngoscope DOI:10.1002/lary.30718 PMID:37102306	研究论文	本研究旨在识别与近端气道狭窄（SGS）相关的候选风险基因，并探索其生物学功能和表达富集的细胞类型	首次通过单细胞RNA测序和通路富集分析，详细研究了与SGS相关的基因及其在不同细胞类型中的表达模式	研究未发现免疫细胞在候选风险基因中的显著富集，这可能是研究的局限之一	识别与近端气道狭窄相关的候选风险基因，并探索其生物学功能和细胞类型特异性表达	近端气道狭窄（SGS）的遗传基础	遗传学	呼吸道疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	通路富集分析（PEA）	基因表达数据	20个与SGS表型相关的基因
459	2024-08-05	Single-cell RNA sequencing reveals new subtypes of lens superficial tissue in humans 2023-Nov, Cell proliferation IF:5.9Q2 DOI:10.1111/cpr.13477 PMID:37057399	研究论文	本文通过单细胞RNA测序揭示了人眼透镜表层组织的新亚型	识别了特定表达C8orf4和ADAMTSL4的透镜上皮细胞亚型，以及与上皮细胞邻近的新类型纤维细胞	未明确人透镜干/祖细胞在上皮细胞中的分类及其分子特征	探讨人眼透镜上皮细胞的亚型及其分化的分子特征	人眼透镜表层组织中18,596个细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	细胞数据	18,596个细胞
460	2024-08-08	Effect of age on the risk of immune-related adverse events in patients receiving immune checkpoint inhibitors 2023-Nov, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2 DOI:10.1007/s10238-023-01055-8 PMID:37016065	研究论文	本研究旨在探讨年龄对接受免疫检查点抑制剂治疗患者免疫相关不良事件风险的影响，并识别潜在的年龄相关机制	首次详细分析了年龄与免疫相关不良事件风险之间的关系，并利用单细胞RNA测序技术揭示了与年龄相关的基因和通路变化	研究基于回顾性数据，可能存在选择偏倚；未涵盖所有年龄段的患者	确定年龄对接受免疫检查点抑制剂治疗患者免疫相关不良事件风险的影响	接受免疫检查点抑制剂治疗的患者	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	文本	分析了从2014年7月1日至2021年9月30日的FDA不良事件报告系统数据