单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 460 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics of a giant pilomatricoma
2023-Nov, Journal of cutaneous pathology
IF:1.6Q3
DOI:10.1111/cup.14524
PMID:37649312
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研究论文 | 主张通过空间转录组学分析描述一个巨型毛乳头瘤病例 | 首次通过10X空间基因表达分析揭示了巨型毛乳头瘤的转录组簇特征 | 只描述了一个患者的个案，缺乏更多样本的验证 | 探索巨型毛乳头瘤的分子特征及其转录组的异质性 | 一名67岁男性的8cm巨型毛乳头瘤 | 数字病理学 | NA | 10X空间基因表达分析 | NA | 转录组数据 | 1个样本 |
| 422 | 2024-08-07 |
Prognostic and immunological role of cancer-associated fibroblasts-derived exosomal protein in esophageal squamous cell carcinoma
2023-Nov, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110837
PMID:37634448
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研究论文 | 本研究探讨了癌症相关成纤维细胞（CAFs）衍生的外泌体蛋白在食管鳞状细胞癌（ESCC）中的预后和免疫学作用。 | 首次揭示了CAFs衍生的外泌体蛋白在ESCC中的具体功能和预后意义。 | 研究主要基于体外实验和数据库分析，未来需要更多的临床验证。 | 研究CAFs衍生的外泌体蛋白在ESCC中的影响及其预后意义。 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）和食管鳞状细胞癌（ESCC）。 | 数字病理学 | 食管癌 | 液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS） | Lasso回归分析 | 蛋白质 | 842种差异表达的外泌体蛋白 |
| 423 | 2024-08-05 |
A robust platform for integrative spatial multi-omics analysis to map immune responses to SARS-CoV-2 infection in lung tissues
2023-Nov, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13679
PMID:37605469
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研究论文 | 开发了一种创新的空间多组学平台以研究COVID-19感染的肺组织 | 结合了五种组织分析技术与新颖的计算映射方法以深度表征肺部对病毒感染的反应 | 研究中对于深层组织特征描绘的局限性尚未被完全消除 | 深入理解SARS-CoV-2对肺部细胞环境的影响 | COVID-19感染和未感染的肺组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学与蛋白质组学 | NA | 组织样本 | 包含COVID-19感染和未感染的肺组织样本的比较 |
| 424 | 2024-08-07 |
GPR109A expressed on medullary thymic epithelial cells affects thymic Treg development
2023-11, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350521
PMID:37595951
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研究论文 | 本研究探讨了GPR109A在胸腺髓质上皮细胞中的表达对胸腺Treg细胞发育的影响 | 首次发现GPR109A在胸腺髓质上皮细胞中的表达影响胸腺Treg细胞的发育 | NA | 研究GPR109A在胸腺Treg细胞发育中的作用 | GPR109A在胸腺髓质上皮细胞中的表达及其对Treg细胞发育的影响 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | RNA | 小鼠和人类样本 |
| 425 | 2024-08-07 |
Fasting-Mimicking Diet Drives Antitumor Immunity against Colorectal Cancer by Reducing IgA-Producing Cells
2023-11-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0323
PMID:37602826
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研究论文 | 本研究探讨了模拟禁食饮食（FMD）通过减少产生IgA的细胞来驱动结直肠癌的抗肿瘤免疫的作用机制 | 首次揭示了FMD通过抑制B细胞向IgA类别转换来延缓肿瘤生长，并通过增强脂肪酸氧化（FAO）触发RUNX3乙酰化，从而抑制Cα基因转录和IgA类别转换 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体临床试验来验证FMD在人类结直肠癌治疗中的效果 | 阐明FMD诱导的代谢重编程在激活结直肠癌抗肿瘤免疫中的作用 | 结直肠癌及其免疫细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠结直肠癌模型 |
| 426 | 2024-08-07 |
Expressed Barcoding Enables High-Resolution Tracking of the Evolution of Drug Tolerance
2023-11-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0144
PMID:37603596
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研究论文 | 本研究利用表达条形码系统结合单细胞RNA测序技术，高分辨率地追踪了非小细胞肺癌患者中EGFR突变细胞对EGFR抑制剂耐药性的起源和克隆进化 | 首次使用表达条形码系统结合单细胞RNA测序技术，实现对药物耐受细胞克隆进化的纵向基因表达和药物敏感性分析 | NA | 阐明敏感细胞与耐药存活细胞之间的生物学差异，以及耐药细胞如何响应治疗，以提高EGFR抑制剂的疗效 | 非小细胞肺癌中EGFR突变细胞对EGFR抑制剂的耐药性 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 表达条形码系统 | 基因表达数据 | 大量克隆 |
| 427 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of spinal cord injury reveals functional heterogeneity of oligodendrocyte lineage cells
2023-Nov-30, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2023.147713
PMID:37579960
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研究论文 | 本研究揭示了脊髓损伤后少突胶质细胞谱系细胞的功能异质性 | 首次揭示了Junb在成熟少突胶质细胞中的独特作用，并预测了可能的转录因子 | 尚缺乏对脊髓损伤后少突胶质细胞状态和细胞间相互作用的深入研究 | 探讨脊髓损伤后少突胶质细胞谱系细胞的功能变化和相互作用 | 脊髓损伤后的少突胶质细胞谱系细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞转录组数据 | NA |
| 428 | 2024-08-07 |
Integrating single-cell imaging and RNA sequencing datasets links differentiation and morphogenetic dynamics of human pancreatic endocrine progenitors
2023-11-06, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.07.019
PMID:37591246
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research paper | 本文通过监测NEUROG3基因表达和蛋白质在单细胞水平上的动态变化，结合单细胞转录组数据，研究了人类胰腺内分泌前体细胞的分化和形态发生动力学 | 提出了将单细胞转录组数据与活细胞动态行为统计整合的数据映射方法，并发现了KLK12在NEUROG3表达初期对细胞迁移的作用 | NA | 研究人类胰腺内分泌前体细胞的分化和形态发生动力学 | NEUROG3基因在人类胰腺内分泌前体细胞中的表达和功能 | digital pathology | NA | RNA sequencing | NA | image | 单细胞水平的数据 |
| 429 | 2024-08-07 |
Aging impairs the ability of vascular endothelial stem cells to generate endothelial cells in mice
2023-11, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-023-09891-8
PMID:37563497
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研究论文 | 本研究比较了年轻和老年小鼠的血管内皮干细胞（VESCs）在体外和体内分化为内皮细胞的潜力 | 首次阐明了衰老如何影响血管内皮干细胞（VESCs） | NA | 探讨衰老对血管内皮干细胞功能的影响 | 年轻和老年小鼠的血管内皮干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 年轻（2-3个月大）和老年（27-28个月大）小鼠的血管内皮干细胞 |
| 430 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals prominent expression of IL-14, IL-18, and IL-32 in psoriasis
2023-11, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202250354
PMID:37540729
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组分析揭示了牛皮癣中IL-14、IL-18和IL-32的重要表达。 | 首次在牛皮癣的不同细胞类型中部分确定IL-14、IL-18和IL-32的突出表达。 | 样本量仅限于八名患者，可能影响结果的普遍性。 | 深入描述牛皮癣中免疫细胞及其炎症介质的类型。 | 本研究的对象为牛皮癣患者的皮肤损伤及其相关免疫细胞。 | 数字病理学 | 牛皮癣 | 单细胞技术 | NA | 人类和小鼠的组织样本 | 8名牛皮癣患者的皮肤损伤样本 |
| 431 | 2024-08-05 |
Transcriptome-wide association study-derived genes as potential visceral adipose tissue-specific targets for type 2 diabetes
2023-11, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-023-05978-5
PMID:37540242
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研究论文 | 本研究评估了内脏肥胖与2型糖尿病之间的因果关系，并筛选了针对2型糖尿病的内脏脂肪组织特异性靶点 | 本研究通过转录组广泛关联研究筛选了10个与2型糖尿病相关的内脏脂肪特异性候选基因 | 本研究的限制在于尚需通过进一步的功能研究验证这些候选基因 | 研究内脏脂肪组织与2型糖尿病之间的因果关系 | 分析2型糖尿病患者及其对照组的数据 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | Mendelian随机化，转录组广泛关联研究（TWAS） | 无 | 基因组数据 | 74,124例病例和824,006例对照 |
| 432 | 2024-08-05 |
Exploring the human microbiome - A step forward for precision medicine in breast cancer
2023-11, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.1877
PMID:37539732
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综述 | 这篇综述文章探讨了微生物失调对乳腺癌发生的影响及其与乳腺癌特定分子亚型的相互作用 | 文章创新地讨论了微生物组作为癌症生物标志物的潜力，并整合了最新的微生物组研究技术和人工智能的进展 | 文章可能没有提供具体的实验数据和临床案例来支持其假设 | 旨在描述微生物失调如何影响乳腺癌的发生以及其与肿瘤微生物群的关系 | 主要研究肠道微生物群与乳腺癌发生之间的关系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 下一代测序(NGS)、基因组测序、单细胞测序、微生物代谢组学 | NA | NA | NA |
| 433 | 2024-08-07 |
Myofibroblasts: A New Factor Affecting the Hyperlipidemia-Induced Elastic Abnormality of Corpus Cavernosum in Rabbits Detected by 2-D Shear Wave Elastography
2023-11, Ultrasound in medicine & biology
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研究论文 | 本研究使用二维剪切波弹性成像（2-D SWE）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）探讨了高脂血症诱导的兔阴茎海绵体弹性异常及其细胞学因素。 | 发现了高脂血症组中一种新的成纤维细胞亚型——肌成纤维细胞，并通过免疫荧光染色和基因本体分析验证了其存在。 | NA | 研究高脂血症对兔阴茎海绵体弹性的影响及其细胞学机制。 | 兔阴茎海绵体的弹性异常及其细胞学因素。 | 数字病理学 | 高脂血症 | 二维剪切波弹性成像（2-D SWE），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 图像 | 新西兰白兔被随机分为高脂血症组和对照组 |
| 434 | 2024-08-07 |
Single cell RNA-seq in phytohormone signaling: a promising future
2023-Nov, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2023.07.010
PMID:37550122
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在植物激素信号传导中的应用 | 利用scRNA-seq技术揭示了激素介导的时空基因调控网络 | NA | 研究植物激素信号传导机制 | 植物细胞中的激素信号网络 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 时间序列的单细胞样本 |
| 435 | 2024-08-07 |
Uncovering the prominent role of satellite cells in paravertebral muscle development and aging by single-nucleus RNA sequencing
2023-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2023.01.005
PMID:37554180
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序构建了小鼠棘旁肌在胚胎至老年阶段的单核转录组图谱，揭示了卫星细胞在肌肉发育和衰老中的作用 | 首次构建了涵盖胚胎至老年阶段的小鼠棘旁肌单核转录组图谱，并发现了与肌肉能量代谢相关的基因集在卫星细胞中的富集 | NA | 揭示卫星细胞在棘旁肌发育和衰老中的作用 | 小鼠棘旁肌的卫星细胞、快肌细胞和慢肌细胞 | 数字病理学 | 骨骼肌疾病 | 单核RNA测序 | NA | 转录组 | 630,040个骨骼肌细胞 |
| 436 | 2024-08-07 |
Guided Differentiation of Pluripotent Stem Cells for Cardiac Cell Diversity
2023-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.21.550072
PMID:37502898
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研究论文 | 本文开发了一种引导多能干细胞向心脏细胞多样性分化的协议 | 提出了一个快速生成多种心脏相关细胞类型的引导iPSC分化协议 | NA | 研究调控数量性状位点（QTLs）及其在个体间表型变异中的作用 | 多能干细胞分化为心脏细胞的多样性 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞类型 | 在8-10天内生成多种心脏相关细胞类型 |
| 437 | 2024-08-07 |
Tumor-infiltrating gamma delta T-cells reveal exhausted subsets with remarkable heterogeneity in colorectal cancer
2023-11-01, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.34669
PMID:37531161
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研究论文 | 研究肿瘤浸润性γδT细胞在结直肠癌微环境中的耗竭表型和功能状态 | 揭示了结直肠癌微环境中肿瘤浸润性γδT细胞的耗竭表型，并发现其比肿瘤浸润性CD8 T细胞或NK细胞表现出更严重的功能耗竭 | NA | 探究肿瘤浸润性γδT细胞在结直肠癌微环境中的抑制受体表达模式和功能状态 | 肿瘤浸润性γδT细胞在结直肠癌微环境中的耗竭特征 | 免疫学 | 结直肠癌 | scRNA-seq | NA | 细胞数据 | NA |
| 438 | 2024-08-07 |
Invariant natural killer T cells drive hepatic homeostasis in nonalcoholic fatty liver disease via sustained IL-10 expression in CD170+ Kupffer cells
2023-11, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350474
PMID:37489253
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研究论文 | 通过高维单细胞RNA测序技术，研究了胚胎来源的枯否细胞（KCs）在非酒精性脂肪肝病（NAFLD）中的作用，并揭示了不变自然杀伤T细胞（iNKT）通过维持CD170+枯否细胞中的IL-10表达来驱动肝脏稳态的机制 | 首次鉴定了两种具有不同基因表达谱的枯否细胞亚群（KC-1和KC-2），并揭示了iNKT细胞与KC-1细胞之间的CD206介导的交叉对话对IL-10表达的影响 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人类样本中验证这些发现 | 探讨枯否细胞亚群在非酒精性脂肪肝病中的作用及其与iNKT细胞的相互作用 | 枯否细胞亚群、iNKT细胞、IL-10表达 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 高维单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎来源的枯否细胞 |
| 439 | 2024-08-07 |
MTHFD2 ablation in T cells protects against heart transplant rejection by perturbing IRF4/PD-1 pathway through the metabolic-epigenetic nexus
2023-Nov, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2023.07.009
PMID:37495036
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研究论文 | 本研究探讨了一碳代谢酶MTHFD2在T细胞中的缺失如何通过代谢-表观遗传机制影响IRF4/PD-1通路，从而保护心脏移植免受排斥反应。 | 首次揭示了一碳代谢酶MTHFD2在心脏移植排斥反应中的作用，并阐明了其通过代谢-表观遗传机制影响IRF4/PD-1通路的机制。 | NA | 研究一碳代谢酶MTHFD2在心脏移植排斥反应中的作用及其机制。 | 心脏移植排斥反应中的T细胞和一碳代谢酶MTHFD2。 | NA | 心血管疾病 | 转录组学、代谢组学、单细胞RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、酶联免疫吸附试验、Cleavage Under Targets and Tagmentation assay | NA | 转录组数据、代谢数据、单细胞RNA数据 | 人类和小鼠心脏移植受者的组织样本 |
| 440 | 2024-08-05 |
Construction of a hepatocytes-related and protein kinase-related gene signature in HCC based on ScRNA-Seq analysis and machine learning algorithm
2023-Nov, Journal of physiology and biochemistry
IF:3.7Q1
DOI:10.1007/s13105-023-00973-1
PMID:37458958
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序和机器学习算法构建了一个与肝细胞相关的蛋白激酶相关基因特征 | 该研究通过机器学习算法建立了PKRG预测模型，并识别出潜在的HCC治疗靶点 | 该研究没有提及样本的多样性和外部验证的结果 | 分析HCC的单细胞数据并构建预测模型，以促进个性化医学 | 肝细胞癌患者的单细胞数据，重点研究蛋白激酶相关基因 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 来自多个数据集（如TCGA、ICGC和GEO）的大量HCC患者样本 |