单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 461 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2024-08-07 |
Integrating single-cell imaging and RNA sequencing datasets links differentiation and morphogenetic dynamics of human pancreatic endocrine progenitors
2023-11-06, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.07.019
PMID:37591246
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research paper | 本文通过监测NEUROG3基因表达和蛋白质在单细胞水平上的动态变化，结合单细胞转录组数据，研究了人类胰腺内分泌前体细胞的分化和形态发生动力学 | 提出了将单细胞转录组数据与活细胞动态行为统计整合的数据映射方法，并发现了KLK12在NEUROG3表达初期对细胞迁移的作用 | NA | 研究人类胰腺内分泌前体细胞的分化和形态发生动力学 | NEUROG3基因在人类胰腺内分泌前体细胞中的表达和功能 | digital pathology | NA | RNA sequencing | NA | image | 单细胞水平的数据 |
| 422 | 2024-08-05 |
Integrated single-cell and bulk sequencing analyses with experimental validation identify the prognostic and immunological implications of CD226 in pan-cancer
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05268-y
PMID:37580402
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研究论文 | 本研究探讨了CD226在泛癌中的生物功能、肿瘤免疫作用及其作为预后和免疫治疗反应预测因子的潜力 | CD226被提出作为一种创新生物标志物，能预测患者预后和免疫治疗反应 | CD226在多种癌症类型中的具体机制仍需进一步深入研究 | 研究CD226在肿瘤免疫中的作用及其预后预测潜力 | CD226在肿瘤浸润的CD8+和NK细胞中的表达及其功能 | 数字病理学 | 泛癌 | 单细胞和整体测序分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 423 | 2024-08-07 |
Aging impairs the ability of vascular endothelial stem cells to generate endothelial cells in mice
2023-11, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-023-09891-8
PMID:37563497
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研究论文 | 本研究比较了年轻和老年小鼠的血管内皮干细胞（VESCs）在体外和体内分化为内皮细胞的潜力 | 首次阐明了衰老如何影响血管内皮干细胞（VESCs） | NA | 探讨衰老对血管内皮干细胞功能的影响 | 年轻和老年小鼠的血管内皮干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 年轻（2-3个月大）和老年（27-28个月大）小鼠的血管内皮干细胞 |
| 424 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals prominent expression of IL-14, IL-18, and IL-32 in psoriasis
2023-11, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202250354
PMID:37540729
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组分析揭示了牛皮癣中IL-14、IL-18和IL-32的重要表达。 | 首次在牛皮癣的不同细胞类型中部分确定IL-14、IL-18和IL-32的突出表达。 | 样本量仅限于八名患者，可能影响结果的普遍性。 | 深入描述牛皮癣中免疫细胞及其炎症介质的类型。 | 本研究的对象为牛皮癣患者的皮肤损伤及其相关免疫细胞。 | 数字病理学 | 牛皮癣 | 单细胞技术 | NA | 人类和小鼠的组织样本 | 8名牛皮癣患者的皮肤损伤样本 |
| 425 | 2024-08-05 |
Transcriptome-wide association study-derived genes as potential visceral adipose tissue-specific targets for type 2 diabetes
2023-11, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-023-05978-5
PMID:37540242
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研究论文 | 本研究评估了内脏肥胖与2型糖尿病之间的因果关系，并筛选了针对2型糖尿病的内脏脂肪组织特异性靶点 | 本研究通过转录组广泛关联研究筛选了10个与2型糖尿病相关的内脏脂肪特异性候选基因 | 本研究的限制在于尚需通过进一步的功能研究验证这些候选基因 | 研究内脏脂肪组织与2型糖尿病之间的因果关系 | 分析2型糖尿病患者及其对照组的数据 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | Mendelian随机化，转录组广泛关联研究（TWAS） | 无 | 基因组数据 | 74,124例病例和824,006例对照 |
| 426 | 2024-08-05 |
Exploring the human microbiome - A step forward for precision medicine in breast cancer
2023-11, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.1877
PMID:37539732
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综述 | 这篇综述文章探讨了微生物失调对乳腺癌发生的影响及其与乳腺癌特定分子亚型的相互作用 | 文章创新地讨论了微生物组作为癌症生物标志物的潜力，并整合了最新的微生物组研究技术和人工智能的进展 | 文章可能没有提供具体的实验数据和临床案例来支持其假设 | 旨在描述微生物失调如何影响乳腺癌的发生以及其与肿瘤微生物群的关系 | 主要研究肠道微生物群与乳腺癌发生之间的关系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 下一代测序(NGS)、基因组测序、单细胞测序、微生物代谢组学 | NA | NA | NA |
| 427 | 2024-08-05 |
A novel coiled-coil domain containing-related gene signature for predicting prognosis and treatment effect of breast cancer
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05222-y
PMID:37558766
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研究论文 | 本研究开发了一种基因特征用于预测乳腺癌的预后和治疗效果。 | 本研究首次利用旋 coils 结构域相关基因建立乳腺癌预后风险模型，并与免疫通路相关性进行了分析。 | 该研究可能受限于使用的数据来源，且未讨论模型在不同种族或人群中的适用性。 | 研究旨在通过构建基因特征模型来预测乳腺癌患者的预后和治疗反应。 | 研究对象为乳腺癌患者的基因表达和临床数据。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 基因表达分析、单细胞测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据、临床数据 | 样本量未提供，包含来自TCGA、METABRIC和GEO数据库的数据 |
| 428 | 2024-08-07 |
Integration of scRNA-seq and bulk RNA-seq constructs a stemness-related signature for predicting prognosis and immunotherapy responses in hepatocellular carcinoma
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05202-2
PMID:37535162
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，构建了一个与干细胞特性相关的标志物，用于预测肝细胞癌（HCC）的预后和免疫治疗反应 | 本研究创新性地构建了一个新的干细胞特性相关预后模型，该模型包含十个基因，能够独立预测肝细胞癌的总体生存率，并有助于预测化疗药物敏感性和免疫治疗反应 | NA | 研究目的是开发一个新的干细胞特性相关标志物，用于改善肝细胞癌的预后预测和免疫治疗反应评估 | 研究对象是肝细胞癌患者及其干细胞特性相关基因标志物 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | LASSO, Cox回归 | 基因表达数据 | NA |
| 429 | 2024-08-07 |
A comprehensive analysis of the potential role of necroptosis in hepatocellular carcinoma using single-cell RNA Seq and bulk RNA Seq
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05208-w
PMID:37535163
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析了坏死在肝细胞癌中的潜在作用，并构建了一个基于坏死相关基因的预后预测模型 | 本研究首次揭示了肝细胞癌中两种不同的坏死亚型，并开发了一个具有出色预测准确性的预后模型 | NA | 研究坏死在肝细胞癌发展和进展中的作用 | 肝细胞癌患者及坏死相关基因 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | CIBERSORT算法 | 基因表达数据 | 使用来自TCGA数据库的数据 |
| 430 | 2024-08-07 |
Myofibroblasts: A New Factor Affecting the Hyperlipidemia-Induced Elastic Abnormality of Corpus Cavernosum in Rabbits Detected by 2-D Shear Wave Elastography
2023-11, Ultrasound in medicine & biology
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研究论文 | 本研究使用二维剪切波弹性成像（2-D SWE）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）探讨了高脂血症诱导的兔阴茎海绵体弹性异常及其细胞学因素。 | 发现了高脂血症组中一种新的成纤维细胞亚型——肌成纤维细胞，并通过免疫荧光染色和基因本体分析验证了其存在。 | NA | 研究高脂血症对兔阴茎海绵体弹性的影响及其细胞学机制。 | 兔阴茎海绵体的弹性异常及其细胞学因素。 | 数字病理学 | 高脂血症 | 二维剪切波弹性成像（2-D SWE），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 图像 | 新西兰白兔被随机分为高脂血症组和对照组 |
| 431 | 2024-08-07 |
Single cell RNA-seq in phytohormone signaling: a promising future
2023-Nov, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2023.07.010
PMID:37550122
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在植物激素信号传导中的应用 | 利用scRNA-seq技术揭示了激素介导的时空基因调控网络 | NA | 研究植物激素信号传导机制 | 植物细胞中的激素信号网络 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 时间序列的单细胞样本 |
| 432 | 2024-08-07 |
Uncovering the prominent role of satellite cells in paravertebral muscle development and aging by single-nucleus RNA sequencing
2023-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2023.01.005
PMID:37554180
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序构建了小鼠棘旁肌在胚胎至老年阶段的单核转录组图谱，揭示了卫星细胞在肌肉发育和衰老中的作用 | 首次构建了涵盖胚胎至老年阶段的小鼠棘旁肌单核转录组图谱，并发现了与肌肉能量代谢相关的基因集在卫星细胞中的富集 | NA | 揭示卫星细胞在棘旁肌发育和衰老中的作用 | 小鼠棘旁肌的卫星细胞、快肌细胞和慢肌细胞 | 数字病理学 | 骨骼肌疾病 | 单核RNA测序 | NA | 转录组 | 630,040个骨骼肌细胞 |
| 433 | 2024-08-07 |
Guided Differentiation of Pluripotent Stem Cells for Cardiac Cell Diversity
2023-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.21.550072
PMID:37502898
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研究论文 | 本文开发了一种引导多能干细胞向心脏细胞多样性分化的协议 | 提出了一个快速生成多种心脏相关细胞类型的引导iPSC分化协议 | NA | 研究调控数量性状位点（QTLs）及其在个体间表型变异中的作用 | 多能干细胞分化为心脏细胞的多样性 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞类型 | 在8-10天内生成多种心脏相关细胞类型 |
| 434 | 2024-08-05 |
The role of KPNA2 as a monotonically changing differentially expressed gene in the diagnosis, risk stratification, and chemotherapy sensitivity of chronic hepatitis B-liver cirrhosis-hepatocellular carcinoma
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05213-z
PMID:37526663
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研究论文 | 这篇文章探讨了KPNA2在慢性乙型肝炎-肝硬化-肝细胞癌的诊断和风险分层中的作用 | 发现KPNA2作为一种新的血清生物标志物，可用于监测慢性乙型肝炎到肝细胞癌的动态演变 | 研究限于中国的特定人群，结果可能对其他地区的适用性有限 | 旨在识别CLH阶段中KPNA2的作用及其在HCC早期诊断中的潜力 | 关注慢性乙型肝炎患者、肝硬化患者和肝细胞癌患者的KPNA2表达特征 | 数字病理学 | 肝癌 | ELISA，单细胞RNA-seq，和常规RNA-seq | Cox回归模型 | 血清样本 | 研究样本涉及慢性乙型肝炎、肝硬化及肝细胞癌患者 |
| 435 | 2024-08-07 |
Tumor-infiltrating gamma delta T-cells reveal exhausted subsets with remarkable heterogeneity in colorectal cancer
2023-11-01, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.34669
PMID:37531161
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研究论文 | 研究肿瘤浸润性γδT细胞在结直肠癌微环境中的耗竭表型和功能状态 | 揭示了结直肠癌微环境中肿瘤浸润性γδT细胞的耗竭表型，并发现其比肿瘤浸润性CD8 T细胞或NK细胞表现出更严重的功能耗竭 | NA | 探究肿瘤浸润性γδT细胞在结直肠癌微环境中的抑制受体表达模式和功能状态 | 肿瘤浸润性γδT细胞在结直肠癌微环境中的耗竭特征 | 免疫学 | 结直肠癌 | scRNA-seq | NA | 细胞数据 | NA |
| 436 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of anoikis-related genes in prognosis and immune infiltration of gastric cancer based on bulk and single-cell RNA sequencing data
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05157-4
PMID:37474682
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研究论文 | 本研究基于批量和单细胞RNA测序数据，全面分析了与胃癌预后和免疫浸润相关的凋亡相关基因 | 建立了基于七个凋亡相关基因的预后风险模型，该模型在多个数据集中表现良好，并能指导药物治疗 | NA | 探索凋亡抵抗在胃癌细胞转移中的关键作用，并开发新的胃癌治疗方法 | 胃癌患者的预后和免疫细胞浸润情况 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | Cox回归模型 | RNA测序数据 | 涉及多个数据集的胃癌样本 |
| 437 | 2024-08-07 |
Invariant natural killer T cells drive hepatic homeostasis in nonalcoholic fatty liver disease via sustained IL-10 expression in CD170+ Kupffer cells
2023-11, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350474
PMID:37489253
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研究论文 | 通过高维单细胞RNA测序技术，研究了胚胎来源的枯否细胞（KCs）在非酒精性脂肪肝病（NAFLD）中的作用，并揭示了不变自然杀伤T细胞（iNKT）通过维持CD170+枯否细胞中的IL-10表达来驱动肝脏稳态的机制 | 首次鉴定了两种具有不同基因表达谱的枯否细胞亚群（KC-1和KC-2），并揭示了iNKT细胞与KC-1细胞之间的CD206介导的交叉对话对IL-10表达的影响 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人类样本中验证这些发现 | 探讨枯否细胞亚群在非酒精性脂肪肝病中的作用及其与iNKT细胞的相互作用 | 枯否细胞亚群、iNKT细胞、IL-10表达 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 高维单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎来源的枯否细胞 |
| 438 | 2024-08-07 |
MTHFD2 ablation in T cells protects against heart transplant rejection by perturbing IRF4/PD-1 pathway through the metabolic-epigenetic nexus
2023-Nov, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2023.07.009
PMID:37495036
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研究论文 | 本研究探讨了一碳代谢酶MTHFD2在T细胞中的缺失如何通过代谢-表观遗传机制影响IRF4/PD-1通路，从而保护心脏移植免受排斥反应。 | 首次揭示了一碳代谢酶MTHFD2在心脏移植排斥反应中的作用，并阐明了其通过代谢-表观遗传机制影响IRF4/PD-1通路的机制。 | NA | 研究一碳代谢酶MTHFD2在心脏移植排斥反应中的作用及其机制。 | 心脏移植排斥反应中的T细胞和一碳代谢酶MTHFD2。 | NA | 心血管疾病 | 转录组学、代谢组学、单细胞RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、酶联免疫吸附试验、Cleavage Under Targets and Tagmentation assay | NA | 转录组数据、代谢数据、单细胞RNA数据 | 人类和小鼠心脏移植受者的组织样本 |
| 439 | 2024-08-05 |
Construction of a hepatocytes-related and protein kinase-related gene signature in HCC based on ScRNA-Seq analysis and machine learning algorithm
2023-Nov, Journal of physiology and biochemistry
IF:3.7Q1
DOI:10.1007/s13105-023-00973-1
PMID:37458958
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序和机器学习算法构建了一个与肝细胞相关的蛋白激酶相关基因特征 | 该研究通过机器学习算法建立了PKRG预测模型，并识别出潜在的HCC治疗靶点 | 该研究没有提及样本的多样性和外部验证的结果 | 分析HCC的单细胞数据并构建预测模型，以促进个性化医学 | 肝细胞癌患者的单细胞数据，重点研究蛋白激酶相关基因 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 来自多个数据集（如TCGA、ICGC和GEO）的大量HCC患者样本 |
| 440 | 2024-08-05 |
Multi-omics analysis of expression profile and prognostic values of connexin family in LUAD
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05075-5
PMID:37458803
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研究论文 | 本研究首次探讨了连接蛋白家族在肺腺癌（LUAD）中的表达差异和预后意义 | 开发了一个综合预后模型，揭示了GJB2-5在LUAD患者预后中的关键作用 | NA | 全面分析连接蛋白基因家族在LUAD中的表达谱和预后意义 | 连接蛋白基因家族及其在LUAD中的表达和功能 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | 风险模型 | NA | NA |