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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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401 | 2024-08-05 |
Biomarkers for immunotherapy of hepatocellular carcinoma
2023-11, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/s41571-023-00816-4
PMID:37726418
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评论 | 这篇综述总结了肝细胞癌免疫治疗中的生物标志物数据 | 提出了新的生物标志物开发概念,包括生物标志物驱动的试验和空间转录组学 | 没有明确说明生物标志物的临床应用限制 | 旨在识别最有可能从免疫检查点抑制剂中受益的患者 | 探讨了肝细胞癌患者在免疫检查点抑制剂治疗中的免疫学和结果 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、放射组学、微生物组分析 | NA | NA | NA |
402 | 2024-08-05 |
MAIT cells confer resistance to Lenvatinib plus anti-PD1 antibodies in hepatocellular carcinoma through TNF-TNFRSF1B pathway
2023-11, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2023.109770
PMID:37717672
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研究论文 | 本文探讨了MAIT细胞通过TNF-TNFRSF1B通路,在肝细胞癌中对Lenvatinib及抗PD1抗体的耐药性提供的抵抗力 | 研究揭示了MAIT细胞分泌TNF对调节性T细胞的作用,提供了Lenvatinib联合抗PD1治疗的潜在机制 | 研究样本数量较少,仅涉及六名肝细胞癌患者 | 探索Lenvatinib与抗PD1抗体联合治疗的耐药机制 | 肝细胞癌患者的单细胞样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞样本 | 六名肝细胞癌患者的样本 |
403 | 2024-08-05 |
Multi-omics analysis defines a cuproptosis-related prognostic model for ovarian cancer: Implication of WASF2 in cuproptosis resistance
2023-Nov-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2023.122081
PMID:37717621
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研究论文 | 本研究定义了一个与铜死亡相关的卵巢癌预后模型,并探讨了WASF2在铜死亡抗性中的作用 | 首次将铜死亡相关特征应用于卵巢癌的预后模型中,并识别出WASF2与铜死亡抗性相关 | 未能全面探讨其他可能影响铜死亡的因子,实验样本量可能不足以完全代表卵巢癌患者群体 | 目标是建立一个能够准确预测卵巢癌患者预后的铜死亡相关预后模型 | 研究对象为卵巢癌患者,主要包括378名来自TCGA数据库的患者及其他多个数据集的患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA-seq | 随机森林 | 基因组数据,单细胞测序 | 共涉及379名卵巢癌患者和173名卵巢肿瘤患者的临床数据 |
404 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the effectiveness of cytokine priming irrespective of heterogeneity in mesenchymal stromal cells
2023-11, Cytotherapy
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.jcyt.2023.08.006
PMID:37715776
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研究论文 | 本研究通过分析从原始状态到细胞因子预刺激状态的人骨髓间充质干细胞的单细胞转录组图谱,阐明了细胞因子预刺激间充质干细胞的潜在机制 | 研究发现细胞因子预刺激的间充质干细胞具有独特的转录组图谱,尽管存在显著的异质性,但细胞因子预刺激增强了与治疗效果相关的多个间充质干细胞特征 | NA | 探讨间充质干细胞在细胞因子预刺激下的治疗潜力及其机制 | 人骨髓间充质干细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
405 | 2024-08-07 |
Sanguisorba officinalis ethyl acetate extract attenuates ulcerative colitis through inhibiting PI3K-AKT/NF-κB/ STAT3 pathway uncovered by single-cell RNA sequencing
2023-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2023.155052
PMID:37717310
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研究论文 | 研究了丹参乙酸乙酯提取物通过抑制PI3K-AKT/NF-κB/STAT3通路减轻溃疡性结肠炎的作用及其分子机制 | 首次揭示了丹参乙酸乙酯提取物在治疗溃疡性结肠炎中的显著疗效,并通过抑制PI3K-AKT/NF-κB/STAT3通路改善临床症状和炎症反应 | NA | 全面探索丹参活性成分的药理作用及其分子机制,并生成其化学基础和作用机制的综合新指南图 | 丹参乙酸乙酯提取物对溃疡性结肠炎的影响及其分子机制 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 溃疡性结肠炎模型小鼠 |
406 | 2024-08-07 |
Extracellular shuttling miR-21 contributes to esophageal cancers and human umbilical vein endothelial cell communication in the tumor microenvironment and promotes tumor angiogenesis by targeting phosphatase and tensinhomolog
2023-11, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15103
PMID:37726969
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研究论文 | 本研究探讨了外泌体miR-21在肿瘤微环境中对食管鳞状细胞癌(ESCC)和人类脐静脉内皮细胞(HUVECs)间通讯的影响及其促进肿瘤血管生成的机制 | 本研究首次揭示了外泌体miR-21在食管鳞状细胞癌中的作用及其通过靶向磷酸酶和张力蛋白同源物(PTEN)促进血管生成的具体机制 | NA | 探索外泌体miR-21在肿瘤微环境中对食管鳞状细胞癌和内皮细胞间通讯的影响及其促进肿瘤血管生成的机制 | 食管鳞状细胞癌(ESCC)和人类脐静脉内皮细胞(HUVECs) | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序(ScRNA-Seq)和批量RNA测序(Bulk RNA-Seq) | NA | RNA | 3842个内皮细胞 |
407 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of human dermal fibroblasts isolated from a single male donor over 35 years
2023-11, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.14929
PMID:37727050
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研究论文 | 本研究旨在基于同一供体的样本,探讨年龄对皮肤成纤维细胞异质性的影响 | 通过单细胞RNA测序分析,揭示了随着年龄增长,衰老成纤维细胞的增加以及与细胞外基质重塑相关基因的下调 | 仅基于单一供体的样本进行研究,可能限制了结果的普遍性 | 研究皮肤老化过程中成纤维细胞的行为 | 从同一健康男性供体分离的皮肤成纤维细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从36岁和72岁两个时间点采集的成纤维细胞样本 |
408 | 2024-08-05 |
Creation of a High-Throughput Microfluidic Platform for Single-Cell Transcriptome Sequencing of Cell-Cell Interactions
2023-11, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202300730
PMID:37712212
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研究论文 | 提出了一种基于液滴的微流体平台用于细胞间相互作用的转录组测序 | 开发了高通量液滴微流体平台以研究细胞间相互作用的影响 | 尚未明确提及具体的限制 | 探讨细胞间相互作用对癌症治疗的影响 | 主要研究抗原呈递细胞与T细胞之间的相互作用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
409 | 2024-08-05 |
Architecture of skin inflammation in psoriasis revealed by spatial transcriptomics
2023-11, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2023.109771
PMID:37708923
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研究论文 | 本文创建了牛皮癣皮肤炎症的全面图谱,探讨了炎症的组织模式。 | 揭示了牛皮癣中存在的三大主要炎症区域及其独特的细胞因子回路和趋化因子。 | 只在四位中度至重度患者的病变皮肤上进行了空间转录组测序,样本数量有限。 | 研究牛皮癣中皮肤炎症的空间异质性及相关分子机制。 | 四名中度至重度牛皮癣患者的病变皮肤样本。 | 数字病理学 | 牛皮癣 | 空间转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 四名患者的病变皮肤样本 |
410 | 2024-08-07 |
Urinary SPP1 has potential as a non-invasive diagnostic marker for focal segmental glomerulosclerosis
2023-11, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.13704
PMID:37696527
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研究论文 | 研究探讨尿液中的SPP1蛋白作为非侵入性诊断标记物在局灶节段性肾小球硬化症(FSGS)中的潜力 | 首次报道尿液SPP1蛋白与FSGS的诊断相关性,并探讨了其在肾功能评估中的作用 | 研究样本量较小,需要进一步的大规模验证 | 探索尿液生物标志物作为非侵入性诊断工具在FSGS中的应用 | 尿液细胞和肾脏组织中的EP-Genes | 数字病理学 | 肾脏疾病 | scRNA-seq, 免疫组化染色, bulk RNA sequencing | NA | RNA | 20个尿液细胞样本和3个肾脏组织样本 |
411 | 2024-08-07 |
Mesenchymal stem cell attenuates spinal cord injury by inhibiting mitochondrial quality control-associated neuronal ferroptosis
2023-11, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2023.102871
PMID:37699320
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研究论文 | 本文研究了间充质干细胞通过抑制与线粒体质量控制相关的神经元铁死亡来减轻脊髓损伤的作用 | 首次阐明了线粒体质量控制在神经元铁死亡中的作用,并揭示了间充质干细胞通过线粒体转移抑制铁死亡的分子机制 | NA | 探讨间充质干细胞在脊髓损伤中通过抑制神经元铁死亡的作用及其分子机制 | 脊髓损伤中的神经元铁死亡及线粒体质量控制 | 细胞生物学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
412 | 2024-08-07 |
scNanoCOOL-seq: a long-read single-cell sequencing method for multi-omics profiling within individual cells
2023-11, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-023-00873-5
PMID:37700167
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
413 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing of Coronary Perivascular Adipose Tissue From End-Stage Heart Failure Patients Identifies SPP1+ Macrophage Subpopulation as a Target for Alleviating Fibrosis
2023-11, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.319828
PMID:37706320
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了终末期心衰患者冠状动脉周围脂肪组织中的细胞类型和分子特征,发现SPP1+巨噬细胞亚群在促进冠状动脉纤维化中起关键作用。 | 首次揭示了SPP1+巨噬细胞在冠状动脉周围脂肪组织中的积累及其通过OPN-CD44/整合素途径促进纤维化 progenitor 细胞迁移和增殖的作用。 | 研究样本量较小,且仅限于心移植接受者,可能限制了结果的普遍性。 | 探究冠状动脉周围脂肪组织在冠状动脉粥样硬化中的功能障碍机制。 | 终末期心衰患者冠状动脉周围脂肪组织中的细胞类型和分子特征。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 共分析了来自10名患者的67,936个细胞 |
414 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of the miRNA activities in tuberculous meningitis (TBM) model mice injected with the BCG vaccine
2023-Nov, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110871
PMID:37708706
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,深入探索了结核性脑膜炎(TBM)模型小鼠中特定细胞类型的miRNA活性及其靶mRNA表达 | 首次在单细胞分辨率下探索了TBM中miRNA的活性,并构建了miRNA-mRNA功能网络 | NA | 研究结核性脑膜炎(TBM)模型小鼠中特定细胞类型的miRNA活性及其对疾病进展的影响 | 结核性脑膜炎(TBM)模型小鼠中的miRNA活性及其靶mRNA | 数字病理学 | 结核性脑膜炎 | scRNA-Seq | NA | 转录组数据 | 15种细胞类型 |
415 | 2024-08-07 |
scGAMNN: Graph Antoencoder-Based Single-Cell RNA Sequencing Data Integration Algorithm Using Mutual Nearest Neighbors
2023-11, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2023.3311340
PMID:37656653
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研究论文 | 本文提出了一种基于图自编码器的深度学习模型scGAMNN,用于同时实现批量校正和拓扑保留的维度降低,以正确组装高维单细胞RNA测序数据集 | scGAMNN模型能够在消除数据集间的批次效应的同时,保持细胞间的拓扑关系 | NA | 开发一种新的算法,用于高维单细胞RNA测序数据集的集成和降维 | 单细胞RNA测序数据集 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 图自编码器 | 数据集 | NA |
416 | 2024-08-07 |
Unravelling the imbalanced Th17-like cell differentiation by single-cell RNA sequencing in multiple myeloma
2023-Nov, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110852
PMID:37657245
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了多发性骨髓瘤患者和健康个体骨髓样本中CD4 T细胞的转录组特征,揭示了Th17样细胞分化的不平衡现象及其与多发性骨髓瘤的关联。 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了多发性骨髓瘤中Th17样细胞分化的不平衡现象,并探讨了相关的分子机制和细胞间相互作用。 | 研究样本量较小,仅包括3名健康个体和10名多发性骨髓瘤患者,可能影响结果的普遍性。 | 揭示多发性骨髓瘤中Th17样细胞分化的不平衡模式及其与免疫抑制特征的关联。 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓样本中的CD4 T细胞。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3名健康个体和10名多发性骨髓瘤患者的骨髓样本 |
417 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling reveals the heterogeneity of NK cells during anti-PD-1 therapy in non-small-cell lung cancer
2023-Nov, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110743
PMID:37657247
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,揭示了非小细胞肺癌中自然杀伤细胞在抗PD-1治疗期间的异质性 | 首次详细描述了非小细胞肺癌患者在接受抗PD-1治疗期间,自然杀伤细胞的不同亚群及其与治疗反应的关系 | 研究仅基于单细胞转录组数据,未涉及其他类型的生物标志物或临床数据 | 探讨自然杀伤细胞在非小细胞肺癌抗PD-1治疗中的作用及其对治疗效果的影响 | 非小细胞肺癌患者在接受抗PD-1治疗期间的自然杀伤细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 来自接受抗PD-1治疗的非小细胞肺癌患者的活检样本 |
418 | 2024-08-07 |
VDR is an essential regulator of hair follicle regression through the progression of cell death
2023-11, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202302014
PMID:37673445
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研究论文 | 研究探讨了维生素D受体(VDR)在调控毛囊退化过程中的作用 | 首次揭示了VDR在毛囊退化阶段的关键作用,并通过单细胞RNA测序分析了其机制 | NA | 探究VDR在毛囊退化过程中的作用机制 | VDR缺陷小鼠的毛囊退化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | VDR缺陷小鼠的毛囊样本 |
419 | 2024-08-07 |
A single-cell transcriptomic atlas characterizes age-related changes of murine cranial stem cell niches
2023-11, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13980
PMID:37681346
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了小鼠颅骨干细胞微环境随年龄变化的情况 | 首次在单细胞分辨率下全面研究了两种不同的颅骨干细胞微环境,并揭示了与年龄相关的变化 | NA | 研究颅骨干细胞微环境随年龄的变化,以加深对颅骨和缝合生物学的理解,并为抗衰老和再生医学提供治疗靶点 | 小鼠颅骨干细胞微环境 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
420 | 2024-08-07 |
Maternal and embryonic signals cause functional differentiation of luminal epithelial cells and receptivity establishment
2023-11-06, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.08.004
PMID:37643613
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了怀孕小鼠子宫内膜上皮细胞在受精后2.5至4.5天的功能分化,并探讨了母体和胚胎信号对这一过程的影响。 | 首次揭示了母体和胚胎信号如何促进子宫内膜上皮细胞分化为粘附性上皮细胞和支持性上皮细胞,并探讨了这些细胞在人类和鼠类中的保守性。 | NA | 研究母体和胚胎信号如何影响子宫内膜上皮细胞的功能分化,以及这一过程在人类和鼠类中的保守性。 | 怀孕小鼠的子宫内膜上皮细胞及其在胚胎植入过程中的功能分化。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 怀孕小鼠的子宫内膜上皮细胞样本 |