单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 461 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-08-07 |
Mapping Cell-to-cell Interactions from Spatially Resolved Transcriptomics Data
2023-Nov-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.18.558298
PMID:37781617
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研究论文 | 本文介绍了一种基于贝叶斯多实例学习框架spacia，用于从空间解析转录组学数据中检测细胞间通信 | spacia框架能够利用空间解析转录组学数据的空间模态，克服了基于单细胞RNA测序工具在推断细胞间通信时的单细胞分辨率丢失和高假阳性率问题 | NA | 推进细胞通信的定量理论 | 细胞间通信在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间解析转录组学 | 贝叶斯多实例学习框架 | 转录组学数据 | 3,354名患者 |
| 382 | 2024-08-07 |
MAGNETO: Cell type marker panel generator from single-cell transcriptomic data
2023-11, Journal of biomedical informatics
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbi.2023.104510
PMID:37797704
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研究论文 | 本文提出了一种名为MAGNETO的全自动框架，用于从单细胞转录组数据中生成细胞类型标记面板 | MAGNETO框架通过解决特定的双目标优化问题，能够构建出优化的标记面板，有效地区分特定细胞类型 | NA | 开发一种全自动框架，用于从单细胞转录组数据中生成细胞类型标记面板 | 单细胞转录组数据中的细胞类型标记面板生成 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 双目标优化问题 | 基因表达矩阵 | 三个公共数据集 |
| 383 | 2024-08-07 |
Sex differences in the genetic and molecular mechanisms of coronary artery disease
2023-11, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
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研究论文 | 本文通过回顾遗传和表观遗传学研究，探讨了冠状动脉疾病（CAD）中性别差异的遗传和分子机制 | 识别了超过40个性别差异候选基因，并强调了平滑肌细胞表型转换在女性动脉粥样硬化中的关键作用 | 需要增加统计效力和调整研究设计及分析策略，以更深入地解析CAD中性别差异的复杂机制 | 揭示冠状动脉疾病中性别差异的遗传和分子机制 | 性别差异在冠状动脉疾病中的表现、风险因素和预后 | 遗传学 | 心血管疾病 | 转录组学和单细胞RNA测序 | NA | 基因和表观遗传数据 | 涉及超过40个性别差异候选基因的研究 |
| 384 | 2024-08-05 |
Understanding cervical cancer at single-cell resolution
2023-Nov-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2023.216408
PMID:37769795
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综述 | 本文概述了单细胞测序在解析宫颈癌生态系统异质性方面的最新进展 | 突出单细胞水平的高分辨率解析对靶向治疗和个性化医学发展的推动潜力 | NA | 增强对宫颈癌患者预后的理解 | 宫颈癌的肿瘤生态系统 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 385 | 2024-08-07 |
scTOP: physics-inspired order parameters for cellular identification and visualization
2023-11-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201873
PMID:37756586
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研究论文 | 本文介绍了一种名为'单细胞类型顺序参数'（scTOP）的统计物理启发方法，用于在给定细胞类型参考基础的情况下量化细胞身份，并展示了其在细胞分类、发育轨迹可视化和工程细胞忠实度评估中的应用 | scTOP方法无需特征选择、统计拟合或维度降低，能够准确分类细胞并可视化发育轨迹 | NA | 开发新的理论和计算框架，以分析细胞分化的动态并整合细胞图谱的知识 | 单细胞RNA测序数据，包括人鼠数据集和肺部细胞移植数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据 | 包括人鼠数据集和肺部细胞移植数据 |
| 386 | 2024-08-07 |
The Critical Role of The Piezo1/β-catenin/ATF4 Axis on The Stemness of Gli1+ BMSCs During Simulated Microgravity-Induced Bone Loss
2023-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303375
PMID:37759400
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研究论文 | 本研究探讨了Piezo1/β-catenin/ATF4轴在模拟微重力诱导的Gli1+ BMSCs骨丢失中的关键作用 | 首次揭示了Piezo1激活通过促进Gli1 BMSCs的增殖和成骨分化，从而改善模拟微重力下的骨丢失 | 研究主要集中在模拟微重力模型上，实际微重力环境下的效果需要进一步验证 | 探讨Piezo1在异常机械刺激导致的骨丢失中的作用及潜在治疗策略 | 骨髓间充质干细胞(BMSCs)和Piezo1通道 | NA | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了后肢卸载模型模拟微重力环境 |
| 387 | 2024-08-07 |
Thymosin α1 modulated the immune landscape of COVID-19 patients revealed by single-cell RNA and TCR sequencing
2023-Nov, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110983
PMID:37769533
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序分析了胸腺素α1（Tα1）对COVID-19患者免疫景观的调节作用 | 首次详细探讨了Tα1治疗COVID-19患者的免疫调节机制，发现Tα1能增加特定免疫细胞的比例并刺激TCR克隆的多样性 | 研究样本量相对较小，需要更大规模的研究来验证结果 | 探究Tα1在COVID-19治疗中的免疫调节作用 | COVID-19患者和健康对照组的免疫细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和T细胞受体测序（TCR-seq） | NA | 单细胞RNA和T细胞受体数据 | 33名COVID-19患者和11名健康对照 |
| 388 | 2024-08-07 |
The multi-omics single-cell landscape of sinus mucosa in uncontrolled severe chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2023-11, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2023.109791
PMID:37769787
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、转录组学、表面蛋白质组学以及T细胞和B细胞受体测序，分析了不受控制的严重慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）患者的鼻息肉组织与健康对照组鼻黏膜的细胞类型和免疫反应差异 | 本研究首次揭示了CRSwNP患者鼻息肉组织中细胞类型的转变，以及T细胞和B细胞受体谱的偏斜，这些发现有助于理解疾病的发病机制 | NA | 研究不受控制的严重慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）的免疫反应和重塑机制 | CRSwNP患者的鼻息肉组织与健康对照组的鼻黏膜 | 数字病理学 | 鼻窦炎 | 单细胞RNA测序、转录组学、表面蛋白质组学、T细胞和B细胞受体测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 389 | 2024-08-07 |
Learning single-cell perturbation responses using neural optimal transport
2023-Nov, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01969-x
PMID:37770709
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研究论文 | 本文提出了一种名为CellOT的框架，利用最优传输理论和输入凸神经网络结构，学习单细胞对特定扰动的响应 | CellOT框架通过映射未配对的扰动和非扰动细胞分布，能够预测单细胞药物响应，并在多个未见场景中表现出良好的泛化能力 | NA | 理解和预测单细胞在化学、遗传或机械扰动下的分子响应 | 单细胞对特定扰动的响应 | 生物学 | NA | 最优传输理论，输入凸神经网络 | 输入凸神经网络 | 单细胞RNA测序数据，多重蛋白质成像技术数据 | 未具体说明样本数量 |
| 390 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of CD19 chimeric antigen receptor T cells
2023-11-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.08.015
PMID:37738975
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研究论文 | Li等人通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，分析了复发或难治性大B细胞淋巴瘤（rrLBCL）患者接受标准治疗axicabtagene ciloleucel后的CD19嵌合抗原受体T细胞，并识别了在3个月随访期间通过PET/CT评估的应答者和非应答者之间显著不同的特征。 | 该研究利用单细胞RNA测序技术，首次详细描述了CD19 CAR-T细胞在rrLBCL患者中的特征，并区分了应答者和非应答者的差异。 | NA | 研究CD19 CAR-T细胞在rrLBCL患者中的特征及其对应答者和非应答者的区分。 | 复发或难治性大B细胞淋巴瘤患者的CD19 CAR-T细胞。 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 来自复发或难治性大B细胞淋巴瘤患者的CD19 CAR-T细胞样本 |
| 391 | 2024-08-05 |
Biomarkers for immunotherapy of hepatocellular carcinoma
2023-11, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/s41571-023-00816-4
PMID:37726418
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评论 | 这篇综述总结了肝细胞癌免疫治疗中的生物标志物数据 | 提出了新的生物标志物开发概念，包括生物标志物驱动的试验和空间转录组学 | 没有明确说明生物标志物的临床应用限制 | 旨在识别最有可能从免疫检查点抑制剂中受益的患者 | 探讨了肝细胞癌患者在免疫检查点抑制剂治疗中的免疫学和结果 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、放射组学、微生物组分析 | NA | NA | NA |
| 392 | 2024-08-05 |
MAIT cells confer resistance to Lenvatinib plus anti-PD1 antibodies in hepatocellular carcinoma through TNF-TNFRSF1B pathway
2023-11, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2023.109770
PMID:37717672
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研究论文 | 本文探讨了MAIT细胞通过TNF-TNFRSF1B通路，在肝细胞癌中对Lenvatinib及抗PD1抗体的耐药性提供的抵抗力 | 研究揭示了MAIT细胞分泌TNF对调节性T细胞的作用，提供了Lenvatinib联合抗PD1治疗的潜在机制 | 研究样本数量较少，仅涉及六名肝细胞癌患者 | 探索Lenvatinib与抗PD1抗体联合治疗的耐药机制 | 肝细胞癌患者的单细胞样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞样本 | 六名肝细胞癌患者的样本 |
| 393 | 2024-08-05 |
Multi-omics analysis defines a cuproptosis-related prognostic model for ovarian cancer: Implication of WASF2 in cuproptosis resistance
2023-Nov-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2023.122081
PMID:37717621
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研究论文 | 本研究定义了一个与铜死亡相关的卵巢癌预后模型，并探讨了WASF2在铜死亡抗性中的作用 | 首次将铜死亡相关特征应用于卵巢癌的预后模型中，并识别出WASF2与铜死亡抗性相关 | 未能全面探讨其他可能影响铜死亡的因子，实验样本量可能不足以完全代表卵巢癌患者群体 | 目标是建立一个能够准确预测卵巢癌患者预后的铜死亡相关预后模型 | 研究对象为卵巢癌患者，主要包括378名来自TCGA数据库的患者及其他多个数据集的患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA-seq | 随机森林 | 基因组数据，单细胞测序 | 共涉及379名卵巢癌患者和173名卵巢肿瘤患者的临床数据 |
| 394 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the effectiveness of cytokine priming irrespective of heterogeneity in mesenchymal stromal cells
2023-11, Cytotherapy
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.jcyt.2023.08.006
PMID:37715776
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研究论文 | 本研究通过分析从原始状态到细胞因子预刺激状态的人骨髓间充质干细胞的单细胞转录组图谱，阐明了细胞因子预刺激间充质干细胞的潜在机制 | 研究发现细胞因子预刺激的间充质干细胞具有独特的转录组图谱，尽管存在显著的异质性，但细胞因子预刺激增强了与治疗效果相关的多个间充质干细胞特征 | NA | 探讨间充质干细胞在细胞因子预刺激下的治疗潜力及其机制 | 人骨髓间充质干细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 395 | 2024-08-07 |
Sanguisorba officinalis ethyl acetate extract attenuates ulcerative colitis through inhibiting PI3K-AKT/NF-κB/ STAT3 pathway uncovered by single-cell RNA sequencing
2023-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2023.155052
PMID:37717310
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研究论文 | 研究了丹参乙酸乙酯提取物通过抑制PI3K-AKT/NF-κB/STAT3通路减轻溃疡性结肠炎的作用及其分子机制 | 首次揭示了丹参乙酸乙酯提取物在治疗溃疡性结肠炎中的显著疗效，并通过抑制PI3K-AKT/NF-κB/STAT3通路改善临床症状和炎症反应 | NA | 全面探索丹参活性成分的药理作用及其分子机制，并生成其化学基础和作用机制的综合新指南图 | 丹参乙酸乙酯提取物对溃疡性结肠炎的影响及其分子机制 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 溃疡性结肠炎模型小鼠 |
| 396 | 2024-08-07 |
Extracellular shuttling miR-21 contributes to esophageal cancers and human umbilical vein endothelial cell communication in the tumor microenvironment and promotes tumor angiogenesis by targeting phosphatase and tensinhomolog
2023-11, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15103
PMID:37726969
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研究论文 | 本研究探讨了外泌体miR-21在肿瘤微环境中对食管鳞状细胞癌（ESCC）和人类脐静脉内皮细胞（HUVECs）间通讯的影响及其促进肿瘤血管生成的机制 | 本研究首次揭示了外泌体miR-21在食管鳞状细胞癌中的作用及其通过靶向磷酸酶和张力蛋白同源物（PTEN）促进血管生成的具体机制 | NA | 探索外泌体miR-21在肿瘤微环境中对食管鳞状细胞癌和内皮细胞间通讯的影响及其促进肿瘤血管生成的机制 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）和人类脐静脉内皮细胞（HUVECs） | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序（ScRNA-Seq）和批量RNA测序（Bulk RNA-Seq） | NA | RNA | 3842个内皮细胞 |
| 397 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of human dermal fibroblasts isolated from a single male donor over 35 years
2023-11, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.14929
PMID:37727050
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研究论文 | 本研究旨在基于同一供体的样本，探讨年龄对皮肤成纤维细胞异质性的影响 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示了随着年龄增长，衰老成纤维细胞的增加以及与细胞外基质重塑相关基因的下调 | 仅基于单一供体的样本进行研究，可能限制了结果的普遍性 | 研究皮肤老化过程中成纤维细胞的行为 | 从同一健康男性供体分离的皮肤成纤维细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从36岁和72岁两个时间点采集的成纤维细胞样本 |
| 398 | 2024-08-05 |
Creation of a High-Throughput Microfluidic Platform for Single-Cell Transcriptome Sequencing of Cell-Cell Interactions
2023-11, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202300730
PMID:37712212
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研究论文 | 提出了一种基于液滴的微流体平台用于细胞间相互作用的转录组测序 | 开发了高通量液滴微流体平台以研究细胞间相互作用的影响 | 尚未明确提及具体的限制 | 探讨细胞间相互作用对癌症治疗的影响 | 主要研究抗原呈递细胞与T细胞之间的相互作用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 399 | 2024-08-05 |
Architecture of skin inflammation in psoriasis revealed by spatial transcriptomics
2023-11, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2023.109771
PMID:37708923
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研究论文 | 本文创建了牛皮癣皮肤炎症的全面图谱，探讨了炎症的组织模式。 | 揭示了牛皮癣中存在的三大主要炎症区域及其独特的细胞因子回路和趋化因子。 | 只在四位中度至重度患者的病变皮肤上进行了空间转录组测序，样本数量有限。 | 研究牛皮癣中皮肤炎症的空间异质性及相关分子机制。 | 四名中度至重度牛皮癣患者的病变皮肤样本。 | 数字病理学 | 牛皮癣 | 空间转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 四名患者的病变皮肤样本 |
| 400 | 2024-08-07 |
Urinary SPP1 has potential as a non-invasive diagnostic marker for focal segmental glomerulosclerosis
2023-11, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.13704
PMID:37696527
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研究论文 | 研究探讨尿液中的SPP1蛋白作为非侵入性诊断标记物在局灶节段性肾小球硬化症（FSGS）中的潜力 | 首次报道尿液SPP1蛋白与FSGS的诊断相关性，并探讨了其在肾功能评估中的作用 | 研究样本量较小，需要进一步的大规模验证 | 探索尿液生物标志物作为非侵入性诊断工具在FSGS中的应用 | 尿液细胞和肾脏组织中的EP-Genes | 数字病理学 | 肾脏疾病 | scRNA-seq, 免疫组化染色, bulk RNA sequencing | NA | RNA | 20个尿液细胞样本和3个肾脏组织样本 |