单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 460 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-08-07 |
The change of Siglec-9 expression in peripheral blood NK cells of SFTS patients can affect the function of NK cells
2023-11, Immunology letters
IF:3.3Q3
DOI:10.1016/j.imlet.2023.10.004
PMID:37865296
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研究论文 | 研究SFTS患者外周血NK细胞上Siglec-9表达的变化及其对NK细胞功能的影响 | 发现Siglec-9在SFTS患者NK细胞上的表达减少，可能作为SFTS患者功能性NK细胞亚群的潜在标志 | NA | 探讨SFTS患者外周血NK细胞上Siglec-9的变化及其机制 | SFTS患者外周血NK细胞上的Siglec-9表达 | NA | SFTS | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | SFTS患者和健康对照组的外周血单个核细胞(PBMCs) |
| 382 | 2024-08-07 |
Single cell RNA-sequencing analysis reveals that N-acetylcysteine partially reverses hepatic immune dysfunction in biliary atresia
2023-Nov, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100908
PMID:37869073
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，评估了N-乙酰半胱氨酸（NAC）治疗在胆道闭锁（BA）中的临床疗效，并揭示了NAC对肝脏免疫细胞的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了NAC治疗对胆道闭锁患者肝脏免疫细胞的影响，并揭示了其对免疫功能的部分逆转作用 | 研究样本量较小，需要进一步的大规模临床研究来验证NAC治疗的效果 | 评估NAC治疗在胆道闭锁中的临床疗效，并通过单细胞RNA测序分析其对肝脏免疫细胞的影响 | 胆道闭锁患者的肝脏免疫细胞 | 数字病理学 | 胆道疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 控制组4例，胆道闭锁组6例，胆道闭锁+NAC治疗组6例 |
| 383 | 2024-08-05 |
STAMarker: determining spatial domain-specific variable genes with saliency maps in deep learning
2023-11-10, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad801
PMID:37811885
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研究论文 | STAMarker是一个用于确定空间领域特异性可变基因的分析工具 | 提出了一种三阶段集成框架，通过关注图自编码器、全连接分类器和反向传播梯度计算显著性图来识别空间可变基因 | 现有方法仅关注单个基因，没有建模基因之间的相互依赖性 | 通过空间转录组学分析空间可变基因以了解细胞系统 | 不同平台生成的各种空间转录组数据中的空间领域特异性可变基因 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | 图注意力自编码器，MLP分类器 | 空间转录组数据 | 多种平台生成的多个空间转录组数据 |
| 384 | 2024-08-05 |
Phenotype predictions of two-person mixture using single cell analysis
2023-11, Forensic science international. Genetics
DOI:10.1016/j.fsigen.2023.102938
PMID:37832204
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研究论文 | 本研究探讨了利用单细胞分析进行两人DNA混合物的表型预测 | 提出了使用单细胞测序作为可靠的表型预测工具，特别是在DNA混合物中 | 在日常工作中的实施仍然面临障碍，尚需进一步方法开发 | 开发一种可靠的技术，以从DNA混合物中进行表型预测 | 分析两种不同外貌的贡献者在DNA混合物中的单细胞数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 两个模拟混合物，包含各两名贡献者 |
| 385 | 2024-08-07 |
Early Progression of Abdominal Aortic Aneurysm is Decelerated by Improved Endothelial Barrier Function via ALDH2-LIN28B-ELK3 Signaling
2023-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202302231
PMID:37822152
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研究论文 | 本研究探讨了腹主动脉瘤（AAA）中内皮屏障功能及其上游调控因子的作用，发现ALDH2通过LIN28B-ELK3信号通路改善内皮屏障功能，从而减缓AAA的早期进展 | 首次揭示了ALDH2通过LIN28B-ELK3信号通路调控内皮屏障功能，对早期AAA的进展有抑制作用 | NA | 研究腹主动脉瘤中内皮屏障功能及其上游调控因子的作用 | 腹主动脉瘤（AAA）的内皮细胞及其相关基因和信号通路 | 心血管疾病 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类主动脉夹层组织样本及AAA样本 |
| 386 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis of the germ cells and somatic cells during mitotic quiescence stage in goats
2023-11, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202301278
PMID:37823602
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了山羊在有丝分裂静止阶段生殖细胞和体细胞的转录特征 | 首次在山羊中揭示了有丝分裂静止阶段生殖细胞和体细胞的转录特征，并分析了细胞类型间的共同和特异的基因本体类别、转录因子调控网络及细胞间相互作用 | NA | 探究山羊有丝分裂静止阶段生殖细胞和体细胞的调控机制及其功能重要性 | 山羊在E85、E105和E125时期的生殖细胞和体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 山羊在E85、E105和E125时期的生殖细胞和体细胞样本 |
| 387 | 2024-08-07 |
Butylparaben weakens female fertility via causing oocyte meiotic arrest and fertilization failure in mice
2023-Nov-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2023.115561
PMID:37837697
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研究论文 | 本研究探讨了丁基对羟基苯甲酸酯（butylparaben）对雌性小鼠生殖能力的影响，特别是对卵母细胞质量和受精能力的影响 | 首次报道了丁基对羟基苯甲酸酯通过影响卵母细胞的减数分裂能力和受精潜力来削弱雌性小鼠的生育能力 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证这些发现 | 探究丁基对羟基苯甲酸酯对雌性小鼠生殖能力的影响 | 雌性小鼠的卵母细胞质量和受精能力 | NA | 生殖疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 388 | 2024-08-07 |
GPCR signaling contributes to immune characteristics of microenvironment and process of EBV-induced lymphomagenesis
2023-11-15, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2023.09.029
PMID:37798178
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研究论文 | 本研究首次全面分析了自然杀伤/T细胞淋巴瘤（NKTCL）的蛋白质组学特征，揭示了EB病毒（EBV）基因模式与免疫相关致癌信号的关系，并探讨了GPCR信号在EBV诱导的淋巴瘤发生中的作用。 | 本研究首次揭示了GPCR介导的恶性进展，并将病毒分子传感器转化为EBV特异性抗癌疗法。 | NA | 探讨EB病毒与癌症免疫相互作用的机制及其在疾病发病过程中的作用。 | 自然杀伤/T细胞淋巴瘤（NKTCL） | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 蛋白质组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据 | NA |
| 389 | 2024-08-07 |
Detection of cell-type-enriched long noncoding RNAs in atherosclerosis using single-cell techniques: A brief review
2023-Nov-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2023.122138
PMID:37805167
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综述 | 本文综述了利用单细胞技术在动脉粥样硬化中检测细胞类型特异性长非编码RNA（LncRNAs）的研究进展 | 强调了四种在单细胞RNA测序数据中检测到的新型LncRNAs（lncRNA CARMN, LINC00607, PCAT19, LINC01235）及其在动脉粥样硬化中的功能 | NA | 探讨动脉粥样硬化中细胞类型特异性LncRNAs的功能及其在临床治疗和诊断中的潜在应用 | 动脉粥样硬化中的细胞类型特异性长非编码RNA | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 390 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq of maize meiocytes and pollen grains
2023-Nov, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-023-00889-6
PMID:37783945
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研究论文 | 本文介绍了一种分离单个玉米配子母细胞和花粉粒进行RNA-seq的协议 | 创新点在于能够有效分离稀有植物生殖细胞并进行单细胞RNA测序，从而解析细胞间异质性 | 未提及研究的局限性 | 探讨植物生殖细胞的发育途径及突变表型的影响 | 单个玉米配子母细胞和花粉粒 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | RNA数据 | 最多可采集200个细胞 |
| 391 | 2024-08-07 |
Mapping Cell-to-cell Interactions from Spatially Resolved Transcriptomics Data
2023-Nov-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.18.558298
PMID:37781617
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研究论文 | 本文介绍了一种基于贝叶斯多实例学习框架spacia，用于从空间解析转录组学数据中检测细胞间通信 | spacia框架能够利用空间解析转录组学数据的空间模态，克服了基于单细胞RNA测序工具在推断细胞间通信时的单细胞分辨率丢失和高假阳性率问题 | NA | 推进细胞通信的定量理论 | 细胞间通信在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间解析转录组学 | 贝叶斯多实例学习框架 | 转录组学数据 | 3,354名患者 |
| 392 | 2024-08-07 |
MAGNETO: Cell type marker panel generator from single-cell transcriptomic data
2023-11, Journal of biomedical informatics
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbi.2023.104510
PMID:37797704
|
研究论文 | 本文提出了一种名为MAGNETO的全自动框架，用于从单细胞转录组数据中生成细胞类型标记面板 | MAGNETO框架通过解决特定的双目标优化问题，能够构建出优化的标记面板，有效地区分特定细胞类型 | NA | 开发一种全自动框架，用于从单细胞转录组数据中生成细胞类型标记面板 | 单细胞转录组数据中的细胞类型标记面板生成 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 双目标优化问题 | 基因表达矩阵 | 三个公共数据集 |
| 393 | 2024-08-07 |
Sex differences in the genetic and molecular mechanisms of coronary artery disease
2023-11, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
|
研究论文 | 本文通过回顾遗传和表观遗传学研究，探讨了冠状动脉疾病（CAD）中性别差异的遗传和分子机制 | 识别了超过40个性别差异候选基因，并强调了平滑肌细胞表型转换在女性动脉粥样硬化中的关键作用 | 需要增加统计效力和调整研究设计及分析策略，以更深入地解析CAD中性别差异的复杂机制 | 揭示冠状动脉疾病中性别差异的遗传和分子机制 | 性别差异在冠状动脉疾病中的表现、风险因素和预后 | 遗传学 | 心血管疾病 | 转录组学和单细胞RNA测序 | NA | 基因和表观遗传数据 | 涉及超过40个性别差异候选基因的研究 |
| 394 | 2024-08-05 |
Understanding cervical cancer at single-cell resolution
2023-Nov-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2023.216408
PMID:37769795
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综述 | 本文概述了单细胞测序在解析宫颈癌生态系统异质性方面的最新进展 | 突出单细胞水平的高分辨率解析对靶向治疗和个性化医学发展的推动潜力 | NA | 增强对宫颈癌患者预后的理解 | 宫颈癌的肿瘤生态系统 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 395 | 2024-08-07 |
scTOP: physics-inspired order parameters for cellular identification and visualization
2023-11-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201873
PMID:37756586
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研究论文 | 本文介绍了一种名为'单细胞类型顺序参数'（scTOP）的统计物理启发方法，用于在给定细胞类型参考基础的情况下量化细胞身份，并展示了其在细胞分类、发育轨迹可视化和工程细胞忠实度评估中的应用 | scTOP方法无需特征选择、统计拟合或维度降低，能够准确分类细胞并可视化发育轨迹 | NA | 开发新的理论和计算框架，以分析细胞分化的动态并整合细胞图谱的知识 | 单细胞RNA测序数据，包括人鼠数据集和肺部细胞移植数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据 | 包括人鼠数据集和肺部细胞移植数据 |
| 396 | 2024-08-07 |
The Critical Role of The Piezo1/β-catenin/ATF4 Axis on The Stemness of Gli1+ BMSCs During Simulated Microgravity-Induced Bone Loss
2023-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303375
PMID:37759400
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研究论文 | 本研究探讨了Piezo1/β-catenin/ATF4轴在模拟微重力诱导的Gli1+ BMSCs骨丢失中的关键作用 | 首次揭示了Piezo1激活通过促进Gli1 BMSCs的增殖和成骨分化，从而改善模拟微重力下的骨丢失 | 研究主要集中在模拟微重力模型上，实际微重力环境下的效果需要进一步验证 | 探讨Piezo1在异常机械刺激导致的骨丢失中的作用及潜在治疗策略 | 骨髓间充质干细胞(BMSCs)和Piezo1通道 | NA | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了后肢卸载模型模拟微重力环境 |
| 397 | 2024-08-07 |
Thymosin α1 modulated the immune landscape of COVID-19 patients revealed by single-cell RNA and TCR sequencing
2023-Nov, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110983
PMID:37769533
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序分析了胸腺素α1（Tα1）对COVID-19患者免疫景观的调节作用 | 首次详细探讨了Tα1治疗COVID-19患者的免疫调节机制，发现Tα1能增加特定免疫细胞的比例并刺激TCR克隆的多样性 | 研究样本量相对较小，需要更大规模的研究来验证结果 | 探究Tα1在COVID-19治疗中的免疫调节作用 | COVID-19患者和健康对照组的免疫细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和T细胞受体测序（TCR-seq） | NA | 单细胞RNA和T细胞受体数据 | 33名COVID-19患者和11名健康对照 |
| 398 | 2024-08-07 |
The multi-omics single-cell landscape of sinus mucosa in uncontrolled severe chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2023-11, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2023.109791
PMID:37769787
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、转录组学、表面蛋白质组学以及T细胞和B细胞受体测序，分析了不受控制的严重慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）患者的鼻息肉组织与健康对照组鼻黏膜的细胞类型和免疫反应差异 | 本研究首次揭示了CRSwNP患者鼻息肉组织中细胞类型的转变，以及T细胞和B细胞受体谱的偏斜，这些发现有助于理解疾病的发病机制 | NA | 研究不受控制的严重慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）的免疫反应和重塑机制 | CRSwNP患者的鼻息肉组织与健康对照组的鼻黏膜 | 数字病理学 | 鼻窦炎 | 单细胞RNA测序、转录组学、表面蛋白质组学、T细胞和B细胞受体测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 399 | 2024-08-07 |
Learning single-cell perturbation responses using neural optimal transport
2023-Nov, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01969-x
PMID:37770709
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研究论文 | 本文提出了一种名为CellOT的框架，利用最优传输理论和输入凸神经网络结构，学习单细胞对特定扰动的响应 | CellOT框架通过映射未配对的扰动和非扰动细胞分布，能够预测单细胞药物响应，并在多个未见场景中表现出良好的泛化能力 | NA | 理解和预测单细胞在化学、遗传或机械扰动下的分子响应 | 单细胞对特定扰动的响应 | 生物学 | NA | 最优传输理论，输入凸神经网络 | 输入凸神经网络 | 单细胞RNA测序数据，多重蛋白质成像技术数据 | 未具体说明样本数量 |
| 400 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of CD19 chimeric antigen receptor T cells
2023-11-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.08.015
PMID:37738975
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研究论文 | Li等人通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，分析了复发或难治性大B细胞淋巴瘤（rrLBCL）患者接受标准治疗axicabtagene ciloleucel后的CD19嵌合抗原受体T细胞，并识别了在3个月随访期间通过PET/CT评估的应答者和非应答者之间显著不同的特征。 | 该研究利用单细胞RNA测序技术，首次详细描述了CD19 CAR-T细胞在rrLBCL患者中的特征，并区分了应答者和非应答者的差异。 | NA | 研究CD19 CAR-T细胞在rrLBCL患者中的特征及其对应答者和非应答者的区分。 | 复发或难治性大B细胞淋巴瘤患者的CD19 CAR-T细胞。 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 来自复发或难治性大B细胞淋巴瘤患者的CD19 CAR-T细胞样本 |