单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 460 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2024-08-05 |
Single Cell Sequencing Analysis for Blood Tissue
2023-Nov-23, Studies in health technology and informatics
DOI:10.3233/SHTI230872
PMID:38007772
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析血液组织样本 | 首次在血液组织中使用单细胞测序揭示细胞异质性 | 研究仅限于血液组织样本，可能无法广泛应用于其他组织类型 | 探索不同细胞类型在生理和病理条件下的分子特征和功能差异 | 血液组织样本中的单个细胞 | 数字病理学 | 老年性疾病 | 单细胞测序 | 主成分分析（PCA）和莱顿聚类 | 基因组、转录组和表观基因组数据 | 血液组织样本中的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 322 | 2024-08-05 |
Transfer learning for clustering single-cell RNA-seq data crossing-species and batch, case on uterine fibroids
2023-11-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad426
PMID:37991248
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研究论文 | 本文提出了一种新的图基深度嵌入聚类方法，利用跨物种和批次的迁移学习来聚类单细胞RNA-seq数据 | 创新地提出了GDEC方法，通过图卷积网络及DEC，改善了稀疏基因表达矩阵带来的挑战，并在多种细胞群体中发现了新的细胞类型 | NA | 旨在通过迁移学习提高单细胞RNA-seq数据的聚类效果 | 单细胞RNA-seq数据，特别是子宫肌瘤数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 图卷积网络 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 323 | 2024-08-05 |
A rapid and sensitive, multiplex, whole mount RNA fluorescence in situ hybridization and immunohistochemistry protocol
2023-Nov-22, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-023-01108-9
PMID:37993896
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研究论文 | 本研究提出了一种快速、灵敏的全挂RNA荧光原位杂交和免疫组化协议 | 该研究适应了一种基于混合先前协议的三天全挂RNA-FISH方法，增强了探针信号，并实现了三种转录本的同时检测 | 目前尚未报告易于可靠应用的全挂FISH协议 | 探讨植物组织中的基因表达空间特征 | 研究对象为拟南芥花序和单子叶植物根的基因转录本 | 数字病理学 | NA | RNA荧光原位杂交（FISH） | 无抗体的杂交链反应（HCR） | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 324 | 2024-08-07 |
Liver cancer stem cell dissemination and metastasis: uncovering the role of NRCAM in hepatocellular carcinoma
2023-Nov-22, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02893-w
PMID:37993901
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研究论文 | 本研究探讨了NRCAM在肝癌干细胞（LCSCs）功能和肝细胞癌（HCC）转移中的作用及其机制 | 首次揭示了NRCAM通过激活上皮-间质转化（EMT）和转移相关基质金属蛋白酶（MMPs）促进LCSCs迁移和侵袭的机制 | NA | 揭示NRCAM对LCSCs功能和HCC转移的贡献及其详细机制 | 肝癌干细胞（LCSCs）和肝细胞癌（HCC） | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 117例HCC患者和29例非HCC患者 | NA | NA | NA | NA |
| 325 | 2024-08-05 |
The Promotion of Humoral Immune Responses in Humans via SOCS1-Mediated Th2-Bias Following SARS-CoV-2 Vaccination
2023-Nov-20, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines11111730
PMID:38006062
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研究论文 | 本研究揭示了SARS-CoV-2疫苗接种后通过SOCS1介导的Th2偏倚促进人类体液免疫反应的机制 | 研究首次指出SOCS1在T细胞中的变化与Th2偏倚及抗SARS-CoV-2抗体产生之间的关联 | 研究只关注了抗体变化的高低分组，可能未能全面反映所有个体的免疫反应 | 探讨SARS-CoV-2疫苗接种后Th1/Th2偏倚对宿主免疫反应的影响 | 接种三剂SARS-CoV-2疫苗后的抗体变化显著的个体 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 血液样本 | 三个剂量接种后的样本，具体数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 326 | 2024-08-05 |
Cancer-Associated Fibroblasts in Gastrointestinal Cancers: Unveiling Their Dynamic Roles in the Tumor Microenvironment
2023-Nov-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242216505
PMID:38003695
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综述 | 本文总结了癌associated成纤维细胞（CAFs）在胃肠癌肿瘤微环境中的动态作用。 | 揭示了CAFs在肿瘤进展中的多重作用和与免疫系统的动态相互作用 | 未提及具体的研究限制 | 探讨胃肠癌中CAFs在肿瘤微环境中的作用 | 癌associated成纤维细胞及其在肿瘤进展中的角色 | 数字病理学 | 胃肠癌 | 单细胞转录组学 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 327 | 2024-08-05 |
Integrative multiomics analysis of neointima proliferation in human saphenous vein: implications for bypass graft disease
2023-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.14.567053
PMID:38014255
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研究论文 | 本文探讨了人类大隐静脉中新内膜增生的多组学分析及其对旁路移植物疾病的影响 | 首次揭示了新内膜增生期间基因和蛋白表达的动态变化，识别了新的人类特异性分子和细胞机制 | 研究主要基于体外组织培养模型，可能无法完全反映体内实际情况 | 研究人类大隐静脉中新内膜增生的转录组学和蛋白质组学动态 | 对73名患者的大隐静脉样本进行多组学分析 | 数字病理 | 旁路移植物疾病 | RNA测序和蛋白质组学分析 | NA | 组织样本 | 73个患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 328 | 2024-08-05 |
Linking Adiponectin and Its Receptors to Age-Related Macular Degeneration (AMD)
2023-Nov-14, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11113044
PMID:38002042
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综述 | 这篇综述文章探讨了脂联素及其受体与年龄相关性黄斑变性之间的关系 | 提出了脂联素/受体信号在维持眼部稳态和防治眼病中的关键作用 | 脂联素抑制性肽APN1用于治疗人类AMD的可能性处于早期阶段，需要更多的临床研究 | 探讨脂联素在眼部健康中的作用及其与年龄相关性黄斑变性的关系 | 探讨脂联素及其受体在视网膜功能和视觉敏锐度中的作用 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 329 | 2024-08-07 |
Intercellular Molecular Crosstalk Networks within Invasive and Immunosuppressive Tumor Microenvironment Subtypes Associated with Clinical Outcomes in Four Cancer Types
2023-Nov-14, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11113057
PMID:38002057
|
研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据，揭示了四种癌症类型中肿瘤微环境亚型的分子特征及其与临床结果的关联 | 首次在单细胞分辨率下揭示了肿瘤微环境亚型的特定特征和功能，并识别了与患者生存、侵袭和免疫逃逸相关的关键细胞和分子相互作用 | 研究仅限于四种癌症类型，且依赖于单细胞RNA测序数据，可能无法全面反映所有肿瘤微环境的复杂性 | 探讨肿瘤微环境亚型在癌症进展中的作用及其与临床结果的关联 | 乳腺癌、结直肠癌、食管癌和胰腺癌的肿瘤微环境亚型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | Cox比例风险回归模型 | RNA测序数据 | 250个临床样本，超过200,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 330 | 2024-08-05 |
Insights into the Interaction of Heart Failure with Preserved Ejection Fraction and Sleep-Disordered Breathing
2023-Nov-13, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11113038
PMID:38002038
|
综述 | 本文概述了心脏衰竭与保留射血分数（HFpEF）与睡眠障碍呼吸（SDB）之间的相互作用 | 强调了HFpEF与SDB之间的机械平行，并探索了个性化治疗策略 | HFpEF的治疗选择有限，且尚未成功的通用疗法可能无法适用于所有患者 | 研究HFpEF的常见病因和表型，尤其是在SDB的背景下 | 主要针对罹患HFpEF的患者及其伴随的SDB病症 | 心血管疾病 | 心脏衰竭 | 单细胞转录组学, CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 331 | 2024-08-05 |
Development of a Comprehensive Gene Signature Linking Hypoxia, Glycolysis, Lactylation, and Metabolomic Insights in Gastric Cancer through the Integration of Bulk and Single-Cell RNA-Seq Data
2023-Nov-01, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11112948
PMID:38001949
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研究论文 | 本文建立了一个综合基因特征模型，连接缺氧、糖酵解、乳酸化和代谢组学在胃癌中的作用 | 创新点在于首次结合缺氧、糖酵解和乳酸化相关基因进行生存预测以及医疗反应的评估 | 未明确提及本研究的局限性 | 研究胃癌中缺氧-糖酵解-乳酸化基因的综合模型 | 重点关注胃癌患者的生存、代谢特征、药物敏感性和免疫反应 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA-seq | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 使用了TCGA和GEO数据库中的数据，具体样本数量未提供 | NA | NA | NA | NA |
| 332 | 2024-08-07 |
A novel missense variant in CDK5RAP2 associated with non-obstructive azoospermia
2023-Nov, Taiwanese journal of obstetrics & gynecology
IF:2.0Q2
DOI:10.1016/j.tjog.2023.03.015
PMID:38008501
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研究论文 | 本研究通过家系外显子测序和生物信息学分析，发现并验证了一个与非阻塞性无精症相关的CDK5RAP2基因的新错义变异 | 报道了一个CDK5RAP2基因的新错义变异，该变异在近亲家系中与男性不育和非阻塞性无精症共分离 | NA | 鉴定可能导致非阻塞性无精症的新单基因突变 | 一个有三个非阻塞性无精症兄弟和一个生育能力正常的兄弟的近亲家系 | NA | 男性不育 | 外显子测序，生物信息学分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因序列，蛋白质模型 | 一个家系中的四个兄弟 | NA | NA | NA | NA |
| 333 | 2024-08-07 |
A cell abundance analysis based on efficient PAM clustering for a better understanding of the dynamics of endometrial remodelling
2023-Nov-22, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05569-6
PMID:37990148
|
研究论文 | 本文提出了一种基于PAM聚类和负二项回归的差异细胞丰度分析方法，用于研究人类子宫内膜细胞类型在月经周期分泌期的变化 | 开发了一个新的R包scellpam，包含高效的并行C++实现的PAM，提高了计算速度和内存使用效率 | NA | 研究细胞丰度变化在组织再生和重塑过程中的作用 | 人类子宫内膜细胞类型在月经周期分泌期的差异细胞丰度 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | PAM（Partitioning Around Medoids） | 细胞数据 | 细胞数量范围从70,000到300,000 | NA | NA | NA | NA |
| 334 | 2024-08-07 |
How to explore what is hidden? A review of techniques for vascular tissue expression profile analysis
2023-Nov-19, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-023-01109-8
PMID:37981669
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综述 | 本文综述了用于血管组织表达谱分析的技术方法 | 讨论了单细胞RNA测序这一高通量技术在转录组分析中的应用及其对传导组织基因表达研究的影响 | NA | 探讨如何研究血管组织（如木质部和韧皮部）的分子基础及其分化过程 | 植物的血管组织，特别是木质部和韧皮部 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 335 | 2024-08-07 |
CDC7 inhibition induces replication stress-mediated aneuploid cells with an inflammatory phenotype sensitizing tumors to immune checkpoint blockade
2023-11-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43274-3
PMID:37980406
|
研究论文 | 本研究探讨了CDC7抑制剂TAK-931的抗肿瘤效果及其对免疫调节的影响 | TAK-931通过诱导复制压力产生类似衰老的非整倍体细胞，这些细胞高表达炎症细胞因子和趋化因子，从而增强肿瘤对免疫检查点阻断的敏感性 | NA | 研究TAK-931的抗肿瘤特性和免疫调节机制 | TAK-931对肿瘤细胞的影响及其免疫调节作用 | NA | NA | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，免疫数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 336 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis reveals distinct fibroblast plasticity during tenocyte regeneration in zebrafish
2023-11-17, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi5771
PMID:37967180
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了斑马鱼中不同类型的纤维母细胞，并探讨了它们在肌腱再生中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序和激光诱导肌腱损伤模型，揭示了斑马鱼中纤维母细胞的多样性和可塑性，并证实了Hedgehog信号通路在纤维母细胞增殖和肌腱再生中的关键作用 | NA | 研究纤维母细胞在肌腱再生中的多样性和可塑性 | 斑马鱼中的纤维母细胞及其在肌腱再生中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 337 | 2024-08-07 |
CellDialog: A Computational Framework for Ligand-receptor-mediated Cell-cell Communication Analysis III
2023-Nov-17, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2023.3333828
PMID:37976192
|
研究论文 | 本文开发了一个名为CellDialog的计算框架，用于重建基于发送和接收细胞中配体和受体组合表达的细胞间连接网络，并通过三点位估计方法测量配体-受体介导的细胞间通信强度 | CellDialog通过配体-受体相互作用特征提取、选择和分类来捕获高置信度的配体-受体相互作用，并结合配体-受体过滤和单细胞RNA测序数据来测量细胞间通信强度 | NA | 开发一种新的计算框架，用于分析配体-受体介导的细胞间通信 | 配体-受体相互作用及其介导的细胞间通信 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 338 | 2024-08-07 |
Integrating scRNA-seq to explore novel macrophage infiltration-associated biomarkers for diagnosis of heart failure
2023-11-16, BMC cardiovascular disorders
IF:2.0Q3
DOI:10.1186/s12872-023-03593-1
PMID:37974098
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索与心力衰竭相关的巨噬细胞浸润标志物，以期为心力衰竭的诊断和治疗提供新视角 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出与心力衰竭相关的五种不同分化状态的巨噬细胞亚群，并鉴定出四种有效的诊断标志物 | NA | 探索心力衰竭中与免疫细胞相关的诊断标志物，以深入了解其分子机制 | 心力衰竭患者与正常个体的免疫细胞差异 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 40名正常对照和40名心力衰竭患者 | NA | NA | NA | NA |
| 339 | 2024-08-07 |
The molecular landscape of neurological disorders: insights from single-cell RNA sequencing in neurology and neurosurgery
2023-Nov-16, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-023-01504-w
PMID:37974227
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在神经学和神经外科研究中的应用，特别是在脑肿瘤、神经退行性疾病、癫痫和脊髓疾病等领域的分子层面发现 | scRNA-seq技术揭示了神经系统和神经外科疾病中的细胞异质性、肿瘤微环境、治疗抵抗性和侵袭模式，以及神经退行性疾病和癫痫中的分子亚型和失调通路 | 数据分析、标准化、样本获取、可扩展性和成本效益等方面的挑战需要解决 | 探讨scRNA-seq在神经学和神经外科研究中的应用，以指导精准医学方法、识别临床生物标志物和促进治疗发现 | 脑肿瘤、神经退行性疾病（如阿尔茨海默病、帕金森病和肌萎缩侧索硬化症）、癫痫和脊髓疾病 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 340 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing reveals the reproductive variations between primiparous and multiparous Hu ewes
2023-Nov-14, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-023-00941-1
PMID:37964337
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研究论文 | 本研究揭示了在单胎和多胎胡羊之间的生殖差异的分子机制 | 研究识别并分析了高产和低产组胡羊卵巢颗粒细胞的基因表达差异 | 样本量较小，仅为3只羊，可能影响结果的广泛适用性 | 研究胡羊生殖性能的遗传机制，以促进高产量羊的选择和育种 | 研究对象为高产和低产的胡羊，及其卵巢颗粒细胞 | 数字病理学 | NA | 10× Genomics单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6只羊(每组3只) | NA | NA | NA | NA |