单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 460 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2024-08-07 |
Intercellular Molecular Crosstalk Networks within Invasive and Immunosuppressive Tumor Microenvironment Subtypes Associated with Clinical Outcomes in Four Cancer Types
2023-Nov-14, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11113057
PMID:38002057
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据，揭示了四种癌症类型中肿瘤微环境亚型的分子特征及其与临床结果的关联 | 首次在单细胞分辨率下揭示了肿瘤微环境亚型的特定特征和功能，并识别了与患者生存、侵袭和免疫逃逸相关的关键细胞和分子相互作用 | 研究仅限于四种癌症类型，且依赖于单细胞RNA测序数据，可能无法全面反映所有肿瘤微环境的复杂性 | 探讨肿瘤微环境亚型在癌症进展中的作用及其与临床结果的关联 | 乳腺癌、结直肠癌、食管癌和胰腺癌的肿瘤微环境亚型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | Cox比例风险回归模型 | RNA测序数据 | 250个临床样本，超过200,000个细胞 |
| 322 | 2024-08-05 |
Insights into the Interaction of Heart Failure with Preserved Ejection Fraction and Sleep-Disordered Breathing
2023-Nov-13, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11113038
PMID:38002038
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综述 | 本文概述了心脏衰竭与保留射血分数（HFpEF）与睡眠障碍呼吸（SDB）之间的相互作用 | 强调了HFpEF与SDB之间的机械平行，并探索了个性化治疗策略 | HFpEF的治疗选择有限，且尚未成功的通用疗法可能无法适用于所有患者 | 研究HFpEF的常见病因和表型，尤其是在SDB的背景下 | 主要针对罹患HFpEF的患者及其伴随的SDB病症 | 心血管疾病 | 心脏衰竭 | 单细胞转录组学, CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | NA | NA |
| 323 | 2024-08-05 |
Development of a Comprehensive Gene Signature Linking Hypoxia, Glycolysis, Lactylation, and Metabolomic Insights in Gastric Cancer through the Integration of Bulk and Single-Cell RNA-Seq Data
2023-Nov-01, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11112948
PMID:38001949
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研究论文 | 本文建立了一个综合基因特征模型，连接缺氧、糖酵解、乳酸化和代谢组学在胃癌中的作用 | 创新点在于首次结合缺氧、糖酵解和乳酸化相关基因进行生存预测以及医疗反应的评估 | 未明确提及本研究的局限性 | 研究胃癌中缺氧-糖酵解-乳酸化基因的综合模型 | 重点关注胃癌患者的生存、代谢特征、药物敏感性和免疫反应 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA-seq | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 使用了TCGA和GEO数据库中的数据，具体样本数量未提供 |
| 324 | 2024-08-07 |
A novel missense variant in CDK5RAP2 associated with non-obstructive azoospermia
2023-Nov, Taiwanese journal of obstetrics & gynecology
IF:2.0Q2
DOI:10.1016/j.tjog.2023.03.015
PMID:38008501
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研究论文 | 本研究通过家系外显子测序和生物信息学分析，发现并验证了一个与非阻塞性无精症相关的CDK5RAP2基因的新错义变异 | 报道了一个CDK5RAP2基因的新错义变异，该变异在近亲家系中与男性不育和非阻塞性无精症共分离 | NA | 鉴定可能导致非阻塞性无精症的新单基因突变 | 一个有三个非阻塞性无精症兄弟和一个生育能力正常的兄弟的近亲家系 | NA | 男性不育 | 外显子测序，生物信息学分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因序列，蛋白质模型 | 一个家系中的四个兄弟 |
| 325 | 2024-08-07 |
Characterization of Canine Peyer's Patches by Multidimensional Analysis: Insights from Immunofluorescence, Flow Cytometry, and Single-Cell RNA Sequencing
2023-Nov-01, ImmunoHorizons
DOI:10.4049/immunohorizons.2300091
PMID:38015460
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研究论文 | 本文通过免疫荧光、流式细胞术和单细胞RNA测序等多维分析方法，对犬类Peyer's patches的结构和功能进行了全面研究 | 首次在犬类中使用单细胞RNA测序技术研究Peyer's patches中的免疫细胞亚群，并生成了特异性针对犬类M细胞的抗体 | NA | 深入理解犬类Peyer's patches的结构和功能，以增强疫苗接种策略并阐明疾病机制 | 犬类Peyer's patches | 免疫学 | NA | 免疫荧光、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未提及 |
| 326 | 2024-08-07 |
A cell abundance analysis based on efficient PAM clustering for a better understanding of the dynamics of endometrial remodelling
2023-Nov-22, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05569-6
PMID:37990148
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研究论文 | 本文提出了一种基于PAM聚类和负二项回归的差异细胞丰度分析方法，用于研究人类子宫内膜细胞类型在月经周期分泌期的变化 | 开发了一个新的R包scellpam，包含高效的并行C++实现的PAM，提高了计算速度和内存使用效率 | NA | 研究细胞丰度变化在组织再生和重塑过程中的作用 | 人类子宫内膜细胞类型在月经周期分泌期的差异细胞丰度 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | PAM（Partitioning Around Medoids） | 细胞数据 | 细胞数量范围从70,000到300,000 |
| 327 | 2024-08-05 |
Rapid and signal crowdedness-robust in situ sequencing through hybrid block coding
2023-Nov-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2309227120
PMID:37963245
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研究论文 | 本文介绍了一种结合混合区块编码和分子稀释策略的创新性原位测序方法SPRINTseq | SPRINTseq允许快速且敏感的高分辨率数据获取，克服了现有方法的分辨率、灵敏度或速度的局限性 | 暂无相关信息 | 探讨复杂生物过程和疾病机制 | 小鼠大脑冠状切片中的细胞及其亚细胞mRNA分布 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 下一代测序 | NA | 转录组数据 | 从四个小鼠大脑冠状切片中提取了453,843个细胞数据 |
| 328 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing unravels the transcriptional network underlying zebrafish retina regeneration
2023-Nov-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86507
PMID:37988404
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了斑马鱼视网膜再生过程中Müller胶质细胞、前体细胞及其再生后代的转录网络。 | 发现了损伤诱导的Müller胶质细胞分化轨迹，以及从混合细胞群出发的胶质自我更新和神经发生轨迹。 | NA | 研究Müller胶质细胞反应与前体细胞产生及神经元分化之间的分子机制。 | 斑马鱼视网膜中的Müller胶质细胞、前体细胞及再生后代。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未受伤和光照损伤的视网膜中的Müller胶质细胞、前体细胞及再生后代。 |
| 329 | 2024-08-07 |
How to explore what is hidden? A review of techniques for vascular tissue expression profile analysis
2023-Nov-19, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-023-01109-8
PMID:37981669
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综述 | 本文综述了用于血管组织表达谱分析的技术方法 | 讨论了单细胞RNA测序这一高通量技术在转录组分析中的应用及其对传导组织基因表达研究的影响 | NA | 探讨如何研究血管组织（如木质部和韧皮部）的分子基础及其分化过程 | 植物的血管组织，特别是木质部和韧皮部 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 330 | 2024-08-07 |
CDC7 inhibition induces replication stress-mediated aneuploid cells with an inflammatory phenotype sensitizing tumors to immune checkpoint blockade
2023-11-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43274-3
PMID:37980406
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研究论文 | 本研究探讨了CDC7抑制剂TAK-931的抗肿瘤效果及其对免疫调节的影响 | TAK-931通过诱导复制压力产生类似衰老的非整倍体细胞，这些细胞高表达炎症细胞因子和趋化因子，从而增强肿瘤对免疫检查点阻断的敏感性 | NA | 研究TAK-931的抗肿瘤特性和免疫调节机制 | TAK-931对肿瘤细胞的影响及其免疫调节作用 | NA | NA | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，免疫数据 | NA |
| 331 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis reveals distinct fibroblast plasticity during tenocyte regeneration in zebrafish
2023-11-17, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi5771
PMID:37967180
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了斑马鱼中不同类型的纤维母细胞，并探讨了它们在肌腱再生中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序和激光诱导肌腱损伤模型，揭示了斑马鱼中纤维母细胞的多样性和可塑性，并证实了Hedgehog信号通路在纤维母细胞增殖和肌腱再生中的关键作用 | NA | 研究纤维母细胞在肌腱再生中的多样性和可塑性 | 斑马鱼中的纤维母细胞及其在肌腱再生中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 332 | 2024-08-07 |
CellDialog: A Computational Framework for Ligand-receptor-mediated Cell-cell Communication Analysis III
2023-Nov-17, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2023.3333828
PMID:37976192
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研究论文 | 本文开发了一个名为CellDialog的计算框架，用于重建基于发送和接收细胞中配体和受体组合表达的细胞间连接网络，并通过三点位估计方法测量配体-受体介导的细胞间通信强度 | CellDialog通过配体-受体相互作用特征提取、选择和分类来捕获高置信度的配体-受体相互作用，并结合配体-受体过滤和单细胞RNA测序数据来测量细胞间通信强度 | NA | 开发一种新的计算框架，用于分析配体-受体介导的细胞间通信 | 配体-受体相互作用及其介导的细胞间通信 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 333 | 2024-08-05 |
A single-cell atlas depicting the cellular and molecular features in human anterior cruciate ligamental degeneration: A single cell combined spatial transcriptomics study
2023-Nov-16, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.85700
PMID:37970848
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研究论文 | 本文系统性识别了人类韧带的细胞类型，并探讨了其在韧带退化过程中的作用 | 本文识别了新的成纤维细胞亚群，揭示了韧带退化过程中的空间分布和动态轨迹 | NA | 研究韧带细胞身份、功能和相互作用如何参与韧带退化过程 | 大约49,356个健康和退化人类前交叉韧带细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和空间RNA测序 | NA | 细胞 | 大约49,356个细胞 |
| 334 | 2024-08-07 |
Integrating scRNA-seq to explore novel macrophage infiltration-associated biomarkers for diagnosis of heart failure
2023-11-16, BMC cardiovascular disorders
IF:2.0Q3
DOI:10.1186/s12872-023-03593-1
PMID:37974098
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索与心力衰竭相关的巨噬细胞浸润标志物，以期为心力衰竭的诊断和治疗提供新视角 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出与心力衰竭相关的五种不同分化状态的巨噬细胞亚群，并鉴定出四种有效的诊断标志物 | NA | 探索心力衰竭中与免疫细胞相关的诊断标志物，以深入了解其分子机制 | 心力衰竭患者与正常个体的免疫细胞差异 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 40名正常对照和40名心力衰竭患者 |
| 335 | 2024-08-07 |
The molecular landscape of neurological disorders: insights from single-cell RNA sequencing in neurology and neurosurgery
2023-Nov-16, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-023-01504-w
PMID:37974227
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在神经学和神经外科研究中的应用，特别是在脑肿瘤、神经退行性疾病、癫痫和脊髓疾病等领域的分子层面发现 | scRNA-seq技术揭示了神经系统和神经外科疾病中的细胞异质性、肿瘤微环境、治疗抵抗性和侵袭模式，以及神经退行性疾病和癫痫中的分子亚型和失调通路 | 数据分析、标准化、样本获取、可扩展性和成本效益等方面的挑战需要解决 | 探讨scRNA-seq在神经学和神经外科研究中的应用，以指导精准医学方法、识别临床生物标志物和促进治疗发现 | 脑肿瘤、神经退行性疾病（如阿尔茨海默病、帕金森病和肌萎缩侧索硬化症）、癫痫和脊髓疾病 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 336 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing reveals the reproductive variations between primiparous and multiparous Hu ewes
2023-Nov-14, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-023-00941-1
PMID:37964337
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研究论文 | 本研究揭示了在单胎和多胎胡羊之间的生殖差异的分子机制 | 研究识别并分析了高产和低产组胡羊卵巢颗粒细胞的基因表达差异 | 样本量较小，仅为3只羊，可能影响结果的广泛适用性 | 研究胡羊生殖性能的遗传机制，以促进高产量羊的选择和育种 | 研究对象为高产和低产的胡羊，及其卵巢颗粒细胞 | 数字病理学 | NA | 10× Genomics单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6只羊(每组3只) |
| 337 | 2024-08-07 |
Similarity-assisted variational autoencoder for nonlinear dimension reduction with application to single-cell RNA sequencing data
2023-Nov-14, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05552-1
PMID:37964243
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研究论文 | 本文提出了一种新的方法，将相似性信息引入变分自编码器（VAE）框架中，用于非线性降维，特别是在单细胞RNA测序数据中的应用 | 本文的创新点在于将相似性信息融入VAE框架，并扩展到条件VAE以考虑协变量效应，从而在降维步骤中产生更清晰的聚类结构 | VAE在没有额外注释信息的情况下，通常不能清晰地显示聚类模式 | 研究目的是开发一种新的非线性降维方法，以更好地可视化和分析大规模数据集，如单细胞RNA测序数据 | 研究对象是单细胞RNA测序数据，旨在揭示潜在的聚类模式或识别异常值 | 机器学习 | NA | RNA-seq | VAE | 数据 | NA |
| 338 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq unravels the heterogeneity of cancer-associated fibroblasts in TNBC
2023-11-13, Aging
DOI:10.18632/aging.205205
PMID:37963845
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研究论文 | 本研究分析了三阴性乳腺癌（TNBC）中癌相关成纤维细胞的异质性 | 首次通过单细胞RNA测序和散装RNA测序的整合分析揭示TNBC中CAFs的亚群及其功能特征 | 样本数量相对较少，仅包括6个TNBC患者和3个正常乳腺组织，有待进一步验证 | 探讨三阴性乳腺癌中的异质性及其潜在来源 | TNBC患者的单细胞RNA数据和正常乳腺样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 无 | 基因表达数据 | 9个样本（6个TNBC患者和3个正常乳腺组织） |
| 339 | 2024-08-05 |
Single-Nucleus RNA-Sequencing in Brain Tissue
2023-Nov, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.919
PMID:37987152
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研究论文 | 本研究提供了一种用于脑组织单核RNA测序的实验协议 | 提出了单核RNA测序的方法，以克服单细胞悬液准备中的技术挑战 | 文中没有详细讨论样本规模的限制 | 研究脑组织细胞类型特异性转录分析 | 脑组织中的单核 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 340 | 2024-08-07 |
Integrative single-cell transcriptome analysis provides new insights into post-COVID-19 pulmonary fibrosis and potential therapeutic targets
2023-11, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29201
PMID:37966390
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，分析了COVID-19患者、特发性肺纤维化（IPF）患者及接受抗纤维化药物治疗的转化生长因子β1诱导的纤维化模型大鼠的肺组织，旨在发现PCPF的新治疗靶点 | 研究揭示了巨噬细胞在IPF和COVID-19发展及进展中的关键作用，并发现纤维化和炎症相关基因在两种情况下均上调 | NA | 识别PCPF的新治疗靶点 | COVID-19患者、IPF患者及大鼠纤维化模型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | COVID-19患者、IPF患者及大鼠纤维化模型的肺组织样本 |