单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 461 篇文献,本页显示第 301 - 320 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
301 2024-08-05
Cancer-Associated Fibroblasts in Gastrointestinal Cancers: Unveiling Their Dynamic Roles in the Tumor Microenvironment
2023-Nov-19, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文总结了癌associated成纤维细胞(CAFs)在胃肠癌肿瘤微环境中的动态作用。 揭示了CAFs在肿瘤进展中的多重作用和与免疫系统的动态相互作用 未提及具体的研究限制 探讨胃肠癌中CAFs在肿瘤微环境中的作用 癌associated成纤维细胞及其在肿瘤进展中的角色 数字病理学 胃肠癌 单细胞转录组学 NA 文献数据 NA
302 2024-08-05
Integrative multiomics analysis of neointima proliferation in human saphenous vein: implications for bypass graft disease
2023-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文探讨了人类大隐静脉中新内膜增生的多组学分析及其对旁路移植物疾病的影响 首次揭示了新内膜增生期间基因和蛋白表达的动态变化,识别了新的人类特异性分子和细胞机制 研究主要基于体外组织培养模型,可能无法完全反映体内实际情况 研究人类大隐静脉中新内膜增生的转录组学和蛋白质组学动态 对73名患者的大隐静脉样本进行多组学分析 数字病理 旁路移植物疾病 RNA测序和蛋白质组学分析 NA 组织样本 73个患者样本
303 2024-08-05
CGCom: a framework for inferring Cell-cell Communication based on Graph Neural Network
2023-Nov-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 CGCom是一种基于图神经网络的细胞-细胞通信推断框架 该框架结合了单细胞空间转录组数据和配体-受体信息,以提高细胞间通信推断的准确性 该研究未涉及在其他类型的数据集上验证CGCom的通用性 探索如何利用空间转录组数据推断细胞-细胞通信 研究细胞间通信模式和相互作用的细胞对 数字病理学 NA 空间转录组技术 图神经网络 (GNN) 单细胞空间转录组数据 应用于小鼠胚胎seqFISH数据集的研究
304 2024-08-05
Linking Adiponectin and Its Receptors to Age-Related Macular Degeneration (AMD)
2023-Nov-14, Biomedicines IF:3.9Q1
综述 这篇综述文章探讨了脂联素及其受体与年龄相关性黄斑变性之间的关系 提出了脂联素/受体信号在维持眼部稳态和防治眼病中的关键作用 脂联素抑制性肽APN1用于治疗人类AMD的可能性处于早期阶段,需要更多的临床研究 探讨脂联素在眼部健康中的作用及其与年龄相关性黄斑变性的关系 探讨脂联素及其受体在视网膜功能和视觉敏锐度中的作用 数字病理学 年龄相关性黄斑变性 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA
305 2024-08-07
Intercellular Molecular Crosstalk Networks within Invasive and Immunosuppressive Tumor Microenvironment Subtypes Associated with Clinical Outcomes in Four Cancer Types
2023-Nov-14, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过分析单细胞RNA测序数据,揭示了四种癌症类型中肿瘤微环境亚型的分子特征及其与临床结果的关联 首次在单细胞分辨率下揭示了肿瘤微环境亚型的特定特征和功能,并识别了与患者生存、侵袭和免疫逃逸相关的关键细胞和分子相互作用 研究仅限于四种癌症类型,且依赖于单细胞RNA测序数据,可能无法全面反映所有肿瘤微环境的复杂性 探讨肿瘤微环境亚型在癌症进展中的作用及其与临床结果的关联 乳腺癌、结直肠癌、食管癌和胰腺癌的肿瘤微环境亚型 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 Cox比例风险回归模型 RNA测序数据 250个临床样本,超过200,000个细胞
306 2024-08-05
Insights into the Interaction of Heart Failure with Preserved Ejection Fraction and Sleep-Disordered Breathing
2023-Nov-13, Biomedicines IF:3.9Q1
综述 本文概述了心脏衰竭与保留射血分数(HFpEF)与睡眠障碍呼吸(SDB)之间的相互作用 强调了HFpEF与SDB之间的机械平行,并探索了个性化治疗策略 HFpEF的治疗选择有限,且尚未成功的通用疗法可能无法适用于所有患者 研究HFpEF的常见病因和表型,尤其是在SDB的背景下 主要针对罹患HFpEF的患者及其伴随的SDB病症 心血管疾病 心脏衰竭 单细胞转录组学, CRISPR-Cas9基因编辑 NA NA NA
307 2024-08-05
LMD: Multiscale Marker Identification in Single-cell RNA-seq Data
2023-Nov-13, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 介绍了一种新的工具Localized Marker Detector (LMD),用于识别单细胞RNA-seq数据中的“局部基因” LMD能在不依赖于聚类或差异表达分析的情况下识别细胞亚型或功能状态的细粒度标记 仅在特定数据集中测试,未体现其一般性或在其他数据集中的有效性 旨在提升单细胞RNA-seq数据中细胞标记的准确识别 聚焦于定量分析与其细胞相似性相关的基因表达 数字病理学 NA RNA-seq NA 基因表达数据 使用了Tabula Muris骨髓数据集中的已知细胞类型标记
308 2024-08-05
Spatial proteo-transcriptomic profiling reveals the molecular landscape of borderline ovarian tumors and their invasive progression
2023-Nov-13, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本文探讨了从边缘型卵巢肿瘤到低级别浆液性癌的分子演变及其侵袭进展。 本研究创新性地结合了空间蛋白质组学和空间转录组学,阐明了肿瘤发生的过程和机制。 本研究的局限性在于对特定基因和靶点的药物抑制验证,可能存在样本和环境的特异性。 研究从边缘型卵巢肿瘤向低级别浆液性癌转变的分子机制。 研究对象为边缘型浆液性肿瘤及其向低级别浆液性癌转变的肿瘤细胞。 数字病理学 卵巢癌 空间蛋白质组学和空间转录组学 NA NA NA
309 2024-08-05
Development of a Comprehensive Gene Signature Linking Hypoxia, Glycolysis, Lactylation, and Metabolomic Insights in Gastric Cancer through the Integration of Bulk and Single-Cell RNA-Seq Data
2023-Nov-01, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本文建立了一个综合基因特征模型,连接缺氧、糖酵解、乳酸化和代谢组学在胃癌中的作用 创新点在于首次结合缺氧、糖酵解和乳酸化相关基因进行生存预测以及医疗反应的评估 未明确提及本研究的局限性 研究胃癌中缺氧-糖酵解-乳酸化基因的综合模型 重点关注胃癌患者的生存、代谢特征、药物敏感性和免疫反应 数字病理学 胃癌 RNA-seq Cox回归模型 基因表达数据 使用了TCGA和GEO数据库中的数据,具体样本数量未提供
310 2024-08-07
A novel missense variant in CDK5RAP2 associated with non-obstructive azoospermia
2023-Nov, Taiwanese journal of obstetrics & gynecology IF:2.0Q2
研究论文 本研究通过家系外显子测序和生物信息学分析,发现并验证了一个与非阻塞性无精症相关的CDK5RAP2基因的新错义变异 报道了一个CDK5RAP2基因的新错义变异,该变异在近亲家系中与男性不育和非阻塞性无精症共分离 NA 鉴定可能导致非阻塞性无精症的新单基因突变 一个有三个非阻塞性无精症兄弟和一个生育能力正常的兄弟的近亲家系 NA 男性不育 外显子测序,生物信息学分析,单细胞RNA测序 NA 基因序列,蛋白质模型 一个家系中的四个兄弟
311 2024-08-07
Characterization of Canine Peyer's Patches by Multidimensional Analysis: Insights from Immunofluorescence, Flow Cytometry, and Single-Cell RNA Sequencing
2023-Nov-01, ImmunoHorizons
研究论文 本文通过免疫荧光、流式细胞术和单细胞RNA测序等多维分析方法,对犬类Peyer's patches的结构和功能进行了全面研究 首次在犬类中使用单细胞RNA测序技术研究Peyer's patches中的免疫细胞亚群,并生成了特异性针对犬类M细胞的抗体 NA 深入理解犬类Peyer's patches的结构和功能,以增强疫苗接种策略并阐明疾病机制 犬类Peyer's patches 免疫学 NA 免疫荧光、流式细胞术、单细胞RNA测序 NA 细胞 具体样本数量未提及
312 2024-08-07
A cell abundance analysis based on efficient PAM clustering for a better understanding of the dynamics of endometrial remodelling
2023-Nov-22, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 本文提出了一种基于PAM聚类和负二项回归的差异细胞丰度分析方法,用于研究人类子宫内膜细胞类型在月经周期分泌期的变化 开发了一个新的R包scellpam,包含高效的并行C++实现的PAM,提高了计算速度和内存使用效率 NA 研究细胞丰度变化在组织再生和重塑过程中的作用 人类子宫内膜细胞类型在月经周期分泌期的差异细胞丰度 生物信息学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) PAM(Partitioning Around Medoids) 细胞数据 细胞数量范围从70,000到300,000
313 2024-08-05
Rapid and signal crowdedness-robust in situ sequencing through hybrid block coding
2023-Nov-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本文介绍了一种结合混合区块编码和分子稀释策略的创新性原位测序方法SPRINTseq SPRINTseq允许快速且敏感的高分辨率数据获取,克服了现有方法的分辨率、灵敏度或速度的局限性 暂无相关信息 探讨复杂生物过程和疾病机制 小鼠大脑冠状切片中的细胞及其亚细胞mRNA分布 数字病理学 阿尔茨海默病 下一代测序 NA 转录组数据 从四个小鼠大脑冠状切片中提取了453,843个细胞数据
314 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing unravels the transcriptional network underlying zebrafish retina regeneration
2023-Nov-21, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了斑马鱼视网膜再生过程中Müller胶质细胞、前体细胞及其再生后代的转录网络。 发现了损伤诱导的Müller胶质细胞分化轨迹,以及从混合细胞群出发的胶质自我更新和神经发生轨迹。 NA 研究Müller胶质细胞反应与前体细胞产生及神经元分化之间的分子机制。 斑马鱼视网膜中的Müller胶质细胞、前体细胞及再生后代。 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 未受伤和光照损伤的视网膜中的Müller胶质细胞、前体细胞及再生后代。
315 2024-08-07
How to explore what is hidden? A review of techniques for vascular tissue expression profile analysis
2023-Nov-19, Plant methods IF:4.7Q1
综述 本文综述了用于血管组织表达谱分析的技术方法 讨论了单细胞RNA测序这一高通量技术在转录组分析中的应用及其对传导组织基因表达研究的影响 NA 探讨如何研究血管组织(如木质部和韧皮部)的分子基础及其分化过程 植物的血管组织,特别是木质部和韧皮部 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA NA
316 2024-08-07
CDC7 inhibition induces replication stress-mediated aneuploid cells with an inflammatory phenotype sensitizing tumors to immune checkpoint blockade
2023-11-18, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究探讨了CDC7抑制剂TAK-931的抗肿瘤效果及其对免疫调节的影响 TAK-931通过诱导复制压力产生类似衰老的非整倍体细胞,这些细胞高表达炎症细胞因子和趋化因子,从而增强肿瘤对免疫检查点阻断的敏感性 NA 研究TAK-931的抗肿瘤特性和免疫调节机制 TAK-931对肿瘤细胞的影响及其免疫调节作用 NA NA RNA测序,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据,免疫数据 NA
317 2024-08-07
Single-cell analysis reveals distinct fibroblast plasticity during tenocyte regeneration in zebrafish
2023-11-17, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了斑马鱼中不同类型的纤维母细胞,并探讨了它们在肌腱再生中的作用 首次通过单细胞RNA测序和激光诱导肌腱损伤模型,揭示了斑马鱼中纤维母细胞的多样性和可塑性,并证实了Hedgehog信号通路在纤维母细胞增殖和肌腱再生中的关键作用 NA 研究纤维母细胞在肌腱再生中的多样性和可塑性 斑马鱼中的纤维母细胞及其在肌腱再生中的作用 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA NA
318 2024-08-07
CellDialog: A Computational Framework for Ligand-receptor-mediated Cell-cell Communication Analysis III
2023-Nov-17, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1
研究论文 本文开发了一个名为CellDialog的计算框架,用于重建基于发送和接收细胞中配体和受体组合表达的细胞间连接网络,并通过三点位估计方法测量配体-受体介导的细胞间通信强度 CellDialog通过配体-受体相互作用特征提取、选择和分类来捕获高置信度的配体-受体相互作用,并结合配体-受体过滤和单细胞RNA测序数据来测量细胞间通信强度 NA 开发一种新的计算框架,用于分析配体-受体介导的细胞间通信 配体-受体相互作用及其介导的细胞间通信 生物信息学 肿瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA
319 2024-08-05
A single-cell atlas depicting the cellular and molecular features in human anterior cruciate ligamental degeneration: A single cell combined spatial transcriptomics study
2023-Nov-16, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本文系统性识别了人类韧带的细胞类型,并探讨了其在韧带退化过程中的作用 本文识别了新的成纤维细胞亚群,揭示了韧带退化过程中的空间分布和动态轨迹 NA 研究韧带细胞身份、功能和相互作用如何参与韧带退化过程 大约49,356个健康和退化人类前交叉韧带细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序和空间RNA测序 NA 细胞 大约49,356个细胞
320 2024-08-07
Integrating scRNA-seq to explore novel macrophage infiltration-associated biomarkers for diagnosis of heart failure
2023-11-16, BMC cardiovascular disorders IF:2.0Q3
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术探索与心力衰竭相关的巨噬细胞浸润标志物,以期为心力衰竭的诊断和治疗提供新视角 首次通过单细胞RNA测序技术识别出与心力衰竭相关的五种不同分化状态的巨噬细胞亚群,并鉴定出四种有效的诊断标志物 NA 探索心力衰竭中与免疫细胞相关的诊断标志物,以深入了解其分子机制 心力衰竭患者与正常个体的免疫细胞差异 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 机器学习 基因表达数据 40名正常对照和40名心力衰竭患者
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