单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 461 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2024-08-07 |
Interactions of Indoleamine 2,3-dioxygenase-expressing LAMP3+ dendritic cells with CD4+ regulatory T cells and CD8+ exhausted T cells: synergistically remodeling of the immunosuppressive microenvironment in cervical cancer and therapeutic implications
2023-11, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12486
PMID:37794698
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研究论文 | 本研究探讨了表达吲哚胺2,3-双加氧酶的LAMP3+树突状细胞与CD4+调节T细胞和CD8+耗竭T细胞之间的相互作用，以及这些相互作用在宫颈癌免疫抑制微环境重塑中的作用及其治疗意义。 | 研究揭示了LAMP3+树突状细胞与CD4+调节T细胞和CD8+耗竭T细胞之间的协同作用，形成了一个恶性的免疫抑制循环，并介导了宫颈癌的免疫逃逸。 | 研究主要基于小鼠模型和临床样本的单细胞RNA测序，需要进一步的临床试验来验证这些发现。 | 旨在探讨宫颈癌免疫重塑的机制并探索潜在的治疗靶点。 | 研究对象包括正常宫颈组织、高级别鳞状上皮内病变和宫颈癌组织。 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 17个临床样本 |
| 282 | 2024-08-05 |
Identification of a novel cuproptosis-related gene signature for rheumatoid arthritis-A prospective study
2023-Nov, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3535
PMID:37338187
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研究论文 | 本研究旨在识别与类风湿性关节炎（RA）发病机制相关的中心铜死亡基因。 | 首次将铜死亡基因与类风湿性关节炎的免疫细胞浸润关联起来，并识别了中心基因DLAT。 | 样本规模和实验条件可能限制了结果的普遍适用性。 | 识别与类风湿性关节炎相关的铜死亡基因。 | 针对类风湿性关节炎患者的基因表达和免疫细胞浸润进行分析。 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | 类风湿性关节炎患者样本和细胞实验样本 |
| 283 | 2024-08-07 |
Integrating imaging-based classification and transcriptomics for quality assessment of human oocytes according to their reproductive efficiency
2023-Nov, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-023-02911-y
PMID:37610606
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研究论文 | 本文通过结合基于影像的分类和转录组学，评估人类卵母细胞的生殖效率 | 开发了一种使用影像数据和单细胞RNA测序的排名工具，用于预测卵母细胞的受精、发育和植入率 | 排名工具的特异性有限，需要进一步的多中心研究验证 | 利用非侵入性影像参数评估人类卵母细胞的受精、发育和植入，并研究其对转录组学的影响 | 人类卵母细胞的影像数据和转录组学 | 数字病理学 | NA | Hoffman调制对比显微镜，单细胞RNA测序 | 二元逻辑回归 | 影像，转录组 | 957个中期II阶段卵母细胞，23个成熟卵母细胞 |
| 284 | 2024-08-07 |
Range of chromatin accessibility configurations are permissive of GABAergic fate acquisition in developing mouse brain
2023-Nov-30, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09836-x
PMID:38036964
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术研究了发育中的小鼠大脑中GABA能神经元的染色质可及性和mRNA表达，以理解不同空间来源的GABA能神经元中基因组特征激活的变异性 | 本文首次定义了开放染色质区域的参考集，并整合了scATAC-seq和scRNA-seq数据，形成了一个统一的转录组和染色质可及性图谱资源 | NA | 研究不同空间来源的GABA能神经元中基因组特征激活的变异性 | 发育中的小鼠大脑中的GABA能神经元 | 数字病理学 | NA | scATAC-seq, scRNA-seq | NA | 单细胞数据 | E14.5小鼠胚胎的端脑、中脑和前后脑的细胞类型 |
| 285 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing unveils Lrg1's role in cerebral ischemia‒reperfusion injury by modulating various cells
2023-Nov-30, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-023-02941-4
PMID:38037097
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了Lrg1在脑缺血-再灌注损伤中的作用及其对多种细胞类型的调节机制 | 首次揭示了Lrg1通过调节多种细胞类型在脑缺血-再灌注损伤中的病理过程 | NA | 探索Lrg1在脑缺血-再灌注损伤中的作用及其机制，以寻找新的预防和治疗策略 | 野生型和Lrg1敲除小鼠的脑组织 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 野生型和Lrg1敲除小鼠 |
| 286 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis unveils activation of mast cells in colorectal cancer microenvironment
2023-Nov-29, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-023-01144-x
PMID:38031173
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研究论文 | 本研究揭示了结肠直肠癌微环境中肥大细胞的激活情况 | 首次进行了对结肠直肠癌中肥大细胞的综合单细胞研究，发现肥大细胞表型的转变及其在肿瘤微环境中的作用 | 尚未明确肥大细胞在结肠直肠癌中的具体作用机制 | 探讨肥大细胞在结肠直肠癌中的异质性和影响 | 结肠直肠癌中的肥大细胞及其特征 | 数字病理学 | 结肠直肠癌 | 单细胞测序，空间转录组学，整体组织测序 | NA | NA | CRC和正常组织样本的比较，但具体样本数量未提及 |
| 287 | 2024-08-07 |
FastCAR: fast correction for ambient RNA to facilitate differential gene expression analysis in single-cell RNA-sequencing datasets
2023-Nov-29, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09822-3
PMID:38030970
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FastCAR的计算方法，用于校正单细胞RNA测序数据中的环境RNA污染，以促进细胞类型特异性差异基因表达分析 | FastCAR是专门为单细胞差异基因表达分析设计的，能够更有效地校正环境RNA带来的信号，减少假阳性结果 | NA | 开发和验证一种新的方法来校正单细胞RNA测序数据中的环境RNA污染 | 单细胞RNA测序数据中的环境RNA污染 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 288 | 2024-08-05 |
Comprehensive Transcriptomic Investigation of Rett Syndrome Reveals Increasing Complexity Trends from Induced Pluripotent Stem Cells to Neurons with Implications for Enriched Pathways
2023-Nov-21, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.3c06448
PMID:38027357
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研究论文 | 本研究对Rett综合症进行了全面的转录组调查，揭示了从诱导多能干细胞到神经元的复杂性趋势及其与富集通路的影响 | 该文章创新性地使用不同样本类型的转录组数据，揭示了基因表达的特定趋势和相关基因的差异表达 | 本研究的限制在于获取足够的患者数据的挑战 | 研究Rett综合症患者样本中基因表达的变化及其潜在的治疗策略 | 研究对象包括Rett综合症患者的四种不同样本类型，如诱导多能干细胞、分化神经祖细胞、分化神经元和死后脑组织 | 数字病理学 | Rett综合症 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 四种不同样本类型 |
| 289 | 2024-08-07 |
Integrating bulk and single-cell RNA sequencing data to establish necroptosis-related lncRNA risk model and analyze the immune microenvironment in hepatocellular carcinoma
2023-Nov, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e22083
PMID:38034714
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研究论文 | 本研究通过整合大量和单细胞RNA测序数据，建立了与坏死性凋亡相关的长非编码RNA（lncRNA）风险模型，并分析了肝细胞癌中的免疫微环境 | 构建了一个基于8个坏死性凋亡相关lncRNA的预后标志物，该模型显示出良好的预测准确性 | NA | 探讨坏死性凋亡相关lncRNA作为肝细胞癌预后生物标志物的潜力 | 肝细胞癌中的坏死性凋亡相关lncRNA及免疫微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | LASSO算法和多元Cox回归分析 | RNA测序数据 | 使用了TCGA数据库中的肝细胞癌lncRNA表达谱数据及单细胞RNA测序数据 |
| 290 | 2024-08-07 |
Single-cell and bulk RNA-sequencing analysis to predict the role and clinical value of CD36 in lung squamous cell carcinoma
2023-Nov, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e22201
PMID:38034730
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序数据，探讨CD36在肺鳞状细胞癌中的作用及其临床价值 | 首次验证CD36在肺鳞状细胞癌检测中的作用，并发现其在癌症检测中具有高特异性和敏感性 | NA | 揭示CD36在肺鳞状细胞癌中的作用及其作为早期诊断标志物的潜力 | CD36在肺鳞状细胞癌中的表达及其与肿瘤预后、免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 肺鳞状细胞癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自癌症基因组图谱（TCGA）、基因表达综合图谱（GEO）、人类蛋白质图谱（HPA）等资源的数据 |
| 291 | 2024-08-07 |
Genome resequencing reveals the evolutionary history of garlic reproduction traits
2023-Nov, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhad208
PMID:38046855
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研究论文 | 本研究通过基因组重测序分析了134个具有广泛多样性的大蒜样本，探讨了大蒜两个主要与繁殖相关的性状——抽薹和花分化——的进化历史 | 研究发现了2.728亿个基因组变异，其中1.98亿个是新变异，并识别出与繁殖转变和花发育相关的多个候选基因，这些基因显示出明显的选择特征 | NA | 旨在深入了解通过无性繁殖的大蒜中繁殖性状的进化变化 | 大蒜的抽薹和花分化两个繁殖相关性状 | NA | NA | 基因组重测序 | NA | 基因组数据 | 134个大蒜样本 |
| 292 | 2024-08-07 |
Identification of potential diagnostic biomarkers for tenosynovial giant cell tumour by integrating microarray and single-cell RNA sequencing data
2023-Nov-29, Journal of orthopaedic surgery and research
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s13018-023-04279-2
PMID:38017559
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研究论文 | 本文通过整合微阵列和单细胞RNA测序数据，识别了腱鞘巨细胞瘤的潜在诊断生物标志物 | 本文首次通过单细胞RNA测序和微阵列数据的整合分析，识别了腱鞘巨细胞瘤中的骨吸收细胞特异性上调基因 | 研究依赖于已有的公开数据集，未进行体内外实验验证 | 旨在识别高灵敏度和特异性的生物标志物，以辅助诊断腱鞘巨细胞瘤 | 腱鞘巨细胞瘤的诊断生物标志物 | 数字病理学 | 腱鞘巨细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | 基因表达数据 | 两个单细胞RNA测序数据集和两个微阵列数据集 |
| 293 | 2024-08-07 |
Mouse gingival single-cell transcriptomic atlas identified a novel fibroblast subpopulation activated to guide oral barrier immunity in periodontitis
2023-Nov-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.88183
PMID:38015204
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术构建了小鼠牙周炎模型中的牙龈细胞图谱，并鉴定出一种新型纤维母细胞亚群，该亚群在牙周炎中引导口腔屏障免疫。 | 首次鉴定出一种新型纤维母细胞亚群（AG纤维母细胞），并揭示了其在牙周炎中引导口腔炎症的机制。 | NA | 揭示牙周炎中异常口腔屏障免疫的启动机制。 | 小鼠牙周炎模型中的牙龈细胞。 | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自小鼠牙周炎模型的牙龈细胞 |
| 294 | 2024-08-05 |
LncPCD: a manually curated database of experimentally supported associations between lncRNA-mediated programmed cell death and diseases
2023-11-27, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baad087
PMID:38011720
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研究论文 | LncPCD是一个手动整理的数据库，提供lncRNA介导的程序性细胞死亡与疾病之间的实验支持关联信息 | 建立了一个专门的数据库LncPCD，记录了lncRNA介导的程序性细胞死亡与多种疾病之间的关系 | 数据库的当前版本可能不包含所有潜在的lncRNA与PCD的关联，且需要持续更新 | 提供关于lncRNA介导的程序性细胞死亡与疾病之间关联的全面信息 | 记录lncRNA与五种主要PCD形式及331种疾病之间的6666个关联 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 数据库 | 331种疾病，1222个lncRNA |
| 295 | 2024-08-05 |
Deciphering tumor-infiltrating dendritic cells in the single-cell era
2023-Nov-27, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-023-00459-2
PMID:38012715
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综述 | 本文概述了肿瘤微环境中树突状细胞的亚型及其功能。 | 采用单细胞测序技术对树突状细胞的异质性进行高分辨率特征描述，揭示了以前未被认识的树突状细胞群体的多样性。 | 未提及具体的实验数据和样本大小 | 旨在总结肿瘤微环境中树突状细胞的知识，以帮助了解肿瘤免疫。 | 不同人类肿瘤中树突状细胞的亚型及其功能和相互作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 296 | 2024-08-05 |
Role of arachidonic acid metabolism in intervertebral disc degeneration: identification of potential biomarkers and therapeutic targets via multi-omics analysis and artificial intelligence strategies
2023-Nov-25, Lipids in health and disease
IF:3.9Q2
DOI:10.1186/s12944-023-01962-5
PMID:38007425
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研究论文 | 该研究探讨了花生四烯酸代谢在椎间盘退变中的作用，识别了潜在的生物标志物和治疗靶点 | 首次通过多组学分析和人工智能策略识别IVDD相关的枢纽基因并开发预测模型 | 需要在更大规模的临床样本中验证所识别的生物标志物和治疗靶点的有效性 | 探讨花生四烯酸代谢与椎间盘退变的关系，识别早期生物标志物及治疗靶点 | 主要针对椎间盘退变及其相关的生物标志物和靶向药物 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序，机器学习，人工神经网络 | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 297 | 2024-08-07 |
Comprehensive clinicopathological significance and putative transcriptional mechanisms of Forkhead box M1 factor in hepatocellular carcinoma
2023-Nov-25, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-023-03250-z
PMID:38001498
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研究论文 | 本研究探讨了Forkhead box M1因子（FOXM1）在肝细胞癌（HCC）中的临床病理意义及其潜在的转录机制 | 本研究首次在大规模多中心研究中证实了FOXM1在HCC中的上调，并揭示了其在细胞周期途径中通过激活其他转录因子促进HCC进展的潜在机制 | NA | 探讨FOXM1在HCC中的临床病理意义及其转录机制 | FOXM1因子在肝细胞癌中的表达及其转录机制 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 组织微阵列、免疫组化染色、基因芯片、高通量测序、染色质免疫沉淀后测序（ChIP-seq）、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本、基因表达数据 | 4235个HCC组织样本和3461个非HCC组织样本 |
| 298 | 2024-08-05 |
Pregnancy-responsive pools of adult neural stem cells for transient neurogenesis in mothers
2023-11-24, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abo5199
PMID:37995223
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研究论文 | 本文探讨了妊娠期间母体中成人神经干细胞的响应及其对神经发生的影响 | 研究发现多个区域特异的成人神经干细胞会在妊娠期间被招募，产生短期的嗅球间神经元波 | 未提及具体的局限性 | 研究妊娠如何影响成人神经干细胞的激活及神经发生 | 研究对象为成年小鼠的神经干细胞及其在妊娠期间的反应 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 成年小鼠 |
| 299 | 2024-08-07 |
Molecular subtyping based on immune cell marker genes predicts prognosis and therapeutic response in patients with lung adenocarcinoma
2023-Nov-24, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-11579-7
PMID:38001428
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研究论文 | 本研究利用免疫细胞标记基因对肺腺癌进行分子亚型分类，并探讨其与临床结果和治疗反应的关系 | 通过单细胞RNA测序识别的免疫细胞标记基因，构建了肺腺癌免疫差异评分模型，用于预测患者的预后和治疗反应 | NA | 探索肺腺癌的分子亚型特征，明确免疫微环境、临床结果和治疗反应之间的关联 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归分析 | 基因数据 | 1441个免疫细胞标记基因，GSE72094队列的患者 |
| 300 | 2024-08-05 |
A Mendelian Randomization-Based Causal Investigation on Bacterial Infection-Related Genes and Neurodegenerative Diseases
2023-Nov-23, Studies in health technology and informatics
DOI:10.3233/SHTI230893
PMID:38007792
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研究论文 | 本研究探讨了细菌感染相关基因与神经退行性疾病之间的因果关系 | 通过孟德尔随机化，确定了7个与细菌感染途径相关的基因在阿尔茨海默病和帕金森病中的因果关联 | 尚未深入研究细菌慢性感染与神经退行性疾病的关系 | 分析细菌感染基因与神经退行性疾病之间的因果关系 | 阿尔茨海默病和帕金森病相关基因 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 孟德尔随机化 | NA | 基因组数据 | 根据全基因组关联研究（GWAS）的数据 |