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当前共找到 460 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2024-08-07 |
Non-Negative Low-Rank Representation With Similarity Correction for Cell Type Identification in scRNA-Seq Data
2023 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2023.3319375
PMID:37751340
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研究论文 | 本文提出了一种新的非负低秩相似性校正模型（NLRSIM），用于单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别，该模型通过子空间聚类保留细胞间的全局结构 | 引入了一种新的流形学习过程来解决细胞间邻域空间密度不平衡的问题，并使用位置敏感哈希算法构建数据图结构 | NA | 旨在改进单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负低秩相似性校正模型（NLRSIM） | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 282 | 2024-08-07 |
Investigation of a UPR-Related Gene Signature Identifies the Pro-Fibrotic Effects of Thrombospondin-1 by Activating CD47/ROS/Endoplasmic Reticulum Stress Pathway in Lung Fibroblasts
2023-Nov-21, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox12122024
PMID:38136144
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析，探讨了未折叠蛋白反应（UPR）状态与特发性肺纤维化（IPF）患者肺功能之间的关系，并发现血小板反应蛋白-1（TSP-1）通过激活CD47/ROS/内质网应激途径在肺成纤维细胞中发挥促纤维化作用。 | 本研究首次揭示了TSP-1在肺纤维化中的病理作用，并证明了TSP-1通过CD47依赖的ROS产生促进内质网应激和成纤维细胞活化。 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，未来需要进一步的临床试验和体内实验来验证这些发现。 | 探讨UPR状态与IPF患者肺功能及预后的关系，并研究TSP-1在肺纤维化中的作用机制。 | 特发性肺纤维化患者，肺成纤维细胞。 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 基因集富集分析（GSEA） | NA | RNA测序数据 | 使用了大量的RNA测序和单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 283 | 2024-08-07 |
Temporal genomic analysis of melanoma rejection identifies regulators of tumor immune evasion
2023-Nov-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.29.569032
PMID:38077050
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研究论文 | 研究探讨了低肿瘤内异质性（ITH）的鼠类肿瘤免疫逃逸机制，通过单细胞RNA测序和免疫表型分析比较了被拒绝和未被拒绝移植的单细胞克隆的时间生长情况。 | 通过比较分析拒绝相关基因表达程序和CRISPR敲除筛选候选介质，确定了巨噬细胞迁移抑制因子（MIF）作为免疫排斥的调节因子。 | 研究主要集中在鼠类肿瘤模型，需要在更多种类的肿瘤和更广泛的患者数据中验证结果。 | 研究肿瘤免疫逃逸的机制及其与肿瘤内异质性的关系。 | 低肿瘤内异质性的鼠类肿瘤及其免疫逃逸机制。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | CRISPR | 基因表达数据 | 涉及被拒绝和未被拒绝移植的单细胞克隆 | NA | NA | NA | NA |
| 284 | 2024-08-07 |
Molecular basis of retinal remodeling in a zebrafish model of retinitis pigmentosa
2023-Nov-18, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-023-05021-1
PMID:37979052
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研究论文 | 本文通过分析成年斑马鱼视网膜的单细胞转录组数据，研究了视网膜色素变性（RP）模型中视网膜重塑的分子基础 | 提供了斑马鱼视网膜细胞类型转录组的基准图谱，并深入探讨了P23H模型中每种视网膜细胞类型的影响 | NA | 理解视网膜重塑的分子基础 | 斑马鱼视网膜的结构和功能重塑 | 数字病理学 | 视网膜色素变性 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 包括野生型AB株（WT）和P23H突变视紫红质转基因RP模型的成年斑马鱼视网膜，数据来自雌性和雄性鱼类 | NA | NA | NA | NA |
| 285 | 2024-08-07 |
Machine Learning-Based Integration Develops a Macrophage-Related Index for Predicting Prognosis and Immunotherapy Response in Lung Adenocarcinoma
2023-11, Archives of medical research
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.arcmed.2023.102897
PMID:37865004
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研究论文 | 本研究利用机器学习方法整合多个数据集，构建了一个与巨噬细胞相关的指数（MRI），用于预测肺腺癌的预后和免疫治疗反应 | 首次使用10种机器学习算法构建了肺腺癌的共识MRI，该指数有助于风险分层、预后评估和治疗方案选择 | NA | 开发一个基于机器学习的巨噬细胞相关指数，用于预测肺腺癌的预后和免疫治疗反应 | 肺腺癌中的巨噬细胞相关标志物及其在免疫微环境中的作用 | 机器学习 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | Lasso算法和plsRCox | RNA序列数据 | 使用了来自TCGA、GSE30219、GSE31210和GSE72094数据集的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 286 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis reveals diversity of tumor-associated macrophages and their interactions with T lymphocytes in glioblastoma
2023-11-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-48116-2
PMID:38012322
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析了胶质母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）与T淋巴细胞的多样性和相互作用 | 本研究超越了传统的M1/M2巨噬细胞极化模型，探索了TAMs在胶质母细胞瘤中的连续状态及其与T细胞的相互作用 | NA | 旨在解析胶质母细胞瘤微环境中7种TAM亚型与T细胞的细胞间相互作用 | 胶质母细胞瘤中的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）与T淋巴细胞 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 成年IDH野生型胶质母细胞瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 287 | 2024-08-05 |
Human Plaque Myofibroblasts to Study Mechanisms of Atherosclerosis
2023-11-07, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.123.030243
PMID:37889192
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研究论文 | 本研究提出了一种分离和培养斑块肌成纤维细胞的方法，以研究动脉粥样硬化的机制 | 创新性地展示了从斑块中分离和培养肌成纤维细胞的方法，这些细胞保持了增殖能力和特征表达 | 本研究样本主要来源于颈动脉和股动脉，可能限制了研究结果的广泛适用性 | 旨在提供一种合适的体外模型以研究动脉粥样硬化的特定机制 | 研究对象为来自27名供体的斑块肌成纤维细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序，染色质免疫沉淀测序 | NA | 细胞 | 27个供体的斑块细胞（24个颈动脉和3个股动脉） | NA | NA | NA | NA |
| 288 | 2024-08-05 |
Leveraging diverse cell-death patterns to predict the prognosis, immunotherapy and drug sensitivity of clear cell renal cell carcinoma
2023-11-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-46577-z
PMID:37985807
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研究论文 | 本文提出了一种新的程序性细胞死亡相关特征（PRS）用于评估透明细胞肾癌的预后和药物敏感性 | 研究推出了一种结合多种细胞死亡模式的PCD模型，用于准确预测临床结果和免疫特征 | NA | 探讨透明细胞肾癌的预后、免疫疗法和药物敏感性 | 透明细胞肾癌患者和相关样本 | 数字病理学 | 肾癌 | qRT-PCR, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 分析了来自E-MTAB-1980数据集和其他公共数据库的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 289 | 2024-08-05 |
Isolation, Purification, and Application of Protoplasts and Transient Expression Systems in Plants
2023-Nov-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242316892
PMID:38069215
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综述 | 本文提供了原生质体的分离、纯化及其瞬时表达系统在植物中的应用的全面概述 | 文章创新性地总结了原生质体在多种植物物种中的应用及其分离和瞬时表达系统的建立 | 文章未具体涉及不同植物物种在原生质体应用中的具体差异 | 旨在为植物科学社区提供关于原生质体分离和瞬时表达系统建立的有效资源 | 研究原生质体及其在植物中的应用 | 植物生物技术 | NA | 原生质体分离和瞬时表达系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 290 | 2024-08-07 |
Integrative Analysis of Machine Learning and Molecule Docking Simulations for Ischemic Stroke Diagnosis and Therapy
2023-Nov-22, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules28237704
PMID:38067435
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研究论文 | 本研究利用加权基因共表达网络分析（WGCNA）和maSigPro R包确定与中风相关的基因模块和时间依赖性基因，结合三种机器学习算法识别中风特征基因，并构建诺模图模型评估中风患者。通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析中风中的小胶质细胞亚群，利用RNA速度、伪时间和基因集富集分析（GSEA）研究小胶质细胞亚群的关系，并通过连接图（CMap）分析和分子对接筛选中风的治疗药物。 | 本研究首次结合机器学习算法和分子对接模拟，构建了用于中风诊断的诺模图模型，并筛选出潜在的治疗分子AZ_628。 | NA | 研究中风的诊断和治疗方法 | 中风及其相关基因和小胶质细胞亚群 | 机器学习 | 中风 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、分子对接 | 诺模图模型 | 基因数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 291 | 2024-08-07 |
A deep lung cell atlas reveals cytokine-mediated lineage switching of a rare cell progenitor of the human airway epithelium
2023-Nov-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.28.569028
PMID:38076853
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研究论文 | 本研究通过构建深度肺细胞图谱，分析了311,748个单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，揭示了人类气道中罕见的细胞前体及其在成熟tuft细胞分化中的作用 | 发现了罕见的双能前体细胞，即tuft-ionocyte前体细胞（TIP细胞），并揭示了其在哮喘和囊性纤维化中的免疫信号通路对细胞分化的影响 | 研究样本来自无法用于器官移植的捐赠肺，可能存在一定的局限性 | 识别人类气道中的罕见细胞前体并定义其与成熟tuft细胞的谱系关系 | 人类气道中的罕见上皮细胞及其在呼吸疾病中的作用 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 311,748个单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 292 | 2024-08-07 |
Spatial Distribution of Non-Immune Cells Expressing Glycoprotein A Repetitions Predominant in Human and Murine Metastatic Lymph Nodes
2023-Nov-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15235621
PMID:38067325
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研究论文 | 本文研究了人及小鼠转移性淋巴结中表达糖蛋白A重复序列主要成分（GARP）的非免疫细胞的空间分布 | 首次提供了人及小鼠淋巴结中GARP的分布图 | NA | 探讨GARP在非免疫细胞中的表达及其在转移性淋巴结中的分布 | 人及小鼠转移性淋巴结中的非免疫细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-Seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人及小鼠的转移性淋巴结样本 | NA | NA | NA | NA |
| 293 | 2024-08-05 |
Exploring the Prognostic Significance and Immunotherapeutic Potential of Single-Cell Sequencing-Identified Long Noncoding RNA (LncRNA) in Patients With Non-small Cell Lung Cancer
2023-Nov, Cureus
DOI:10.7759/cureus.48436
PMID:38074028
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研究论文 | 本研究分析了非小细胞肺癌患者的长非编码RNA与免疫治疗之间的关系 | 本研究首次识别出28个具有预后风险特征的lncRNA，并探讨了它们在非小细胞肺癌中的免疫逃逸与免疫治疗的潜在作用 | 研究中未观察到干细胞指数mRNAsi与总体生存之间的强相关性 | 探索单细胞测序识别的长非编码RNA在非小细胞肺癌患者中的预后意义及免疫治疗潜力 | 研究对象为非小细胞肺癌患者，分析其lncRNA与预后风险的关系 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 数据来自癌症基因组图谱（TCGA），具体样本数量未明确说明 | NA | NA | NA | NA |
| 294 | 2024-08-07 |
Resident regulatory T cells reflect the immune history of individual lymph nodes
2023-11-24, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adj5789
PMID:37874251
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研究论文 | 本文通过使用稳定的光可转换蛋白进行原位标记，揭示了淋巴结中调节性T细胞的转换率，并发现其中一部分具有记忆样特性的驻留细胞 | 首次揭示了淋巴结中调节性T细胞的驻留记忆样群体，并展示了这些细胞在局部慢性炎症治疗中的潜在应用 | 文章未明确提及研究的具体限制 | 研究淋巴结中调节性T细胞的动态及其在免疫反应中的作用 | 淋巴结中的调节性T细胞及其亚群 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 10至20%的淋巴结中的调节性T细胞为记忆样驻留细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 295 | 2024-08-07 |
Combining single-cell RNA sequencing data and transcriptomic data to unravel potential mechanisms and signature genes of the progression of idiopathic pulmonary fibrosis to lung adenocarcinoma and predict therapeutic agents
2023-Nov-24, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01274-y
PMID:37996625
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序数据和转录组数据，揭示特发性肺纤维化向肺腺癌进展的潜在机制和特征基因，并预测治疗药物 | 本研究首次通过整合单细胞RNA测序和转录组数据，识别了特发性肺纤维化和肺腺癌共有的特征基因，并构建了TF-基因-miRNA调控网络，预测了潜在的治疗药物 | 本研究主要基于公共数据库的数据，需要进一步的实验验证 | 揭示特发性肺纤维化向肺腺癌进展的潜在机制和特征基因，并预测治疗药物 | 特发性肺纤维化和肺腺癌的特征基因及治疗药物 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 转录组数据 | 涉及650个差异表达基因和1773个模块特征基因 | NA | NA | NA | NA |
| 296 | 2024-08-07 |
Intestinal Paneth cell differentiation relies on asymmetric regulation of Wnt signaling by Daam1/2
2023-11-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adh9673
PMID:38000028
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研究论文 | 本文研究了肠道Paneth细胞分化依赖于Daam1/2不对称调控Wnt信号通路 | 首次报道Daam1和Daam2不对称调节Wnt信号通路的机制，并揭示其对Paneth细胞分化的影响 | NA | 探究Daam1/2在肠道Paneth细胞分化中的作用及其对Wnt信号通路的调控机制 | 肠道Paneth细胞的分化及Wnt信号通路的调控 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 297 | 2024-08-07 |
Neurodevelopmental defects in human cortical organoids with N-acetylneuraminic acid synthase mutation
2023-11-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adf2772
PMID:38000033
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研究论文 | 本文研究了N-乙酰神经氨酸合酶（NANS）突变对人类皮质类器官神经发育缺陷的影响。 | 首次揭示了NANS介导的内源性唾液酸生物合成在调节人类皮质发育中的关键作用，并将其与临床相关的神经发育障碍联系起来。 | NA | 探讨NANS突变对神经发育的影响及其机制。 | 人类皮质类器官和NANS突变。 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 298 | 2024-08-07 |
The cellular trajectories of tumor-associated macrophages decipher the heterogeneity of pancreatic cancer
2023-Nov-22, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01266-y
PMID:37991591
|
research paper | 本研究利用单细胞RNA测序数据，通过Seurat和Monocle算法分析肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)在胰腺癌中的细胞轨迹，揭示其异质性并探索潜在的治疗策略。 | 首次详细分析了胰腺癌中TAMs的进化轨迹，并根据其分子分类和免疫景观预测了治疗敏感性。 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，可能需要进一步的体外和体内实验验证。 | 揭示胰腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性，并探索针对性的治疗策略。 | 胰腺癌中的肿瘤相关巨噬细胞及其在肿瘤微环境中的作用。 | digital pathology | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 非负矩阵分解(NMF) | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 299 | 2024-08-05 |
Temporal and spatial analysis of astrocytes following stroke identifies novel drivers of reactivity
2023-Nov-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.12.566710
PMID:38014211
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研究论文 | 本研究探讨了中风后星形胶质细胞的时间和空间变化 | 识别出了一些独特的星形胶质细胞亚群体及其反应性的驱动因素 | 研究中使用的是小鼠模型，可能无法完全代表人类情况 | 了解中风后星形胶质细胞的反应机制及其异质性 | 约138,000个小鼠前脑星形胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约138,000个小鼠前脑星形胶质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 300 | 2024-08-07 |
Investigating EGF and PAG1 as necroptosis-related biomarkers for diabetic nephropathy: an in silico and in vitro validation study
2023-11-20, Aging
DOI:10.18632/aging.205233
PMID:37988198
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研究论文 | 本研究旨在通过生物信息学和实验验证，探讨糖尿病肾病中调控细胞死亡（RCD）的机制并识别相关生物标志物 | 本研究通过基因集变异分析（GSVA）和加权基因共表达网络分析（WGCNA），结合实验验证，首次识别出EGF和PAG1作为糖尿病肾病中与坏死性凋亡相关的生物标志物 | NA | 理解糖尿病肾病中调控细胞死亡的机制并识别相关生物标志物 | 糖尿病肾病中的调控细胞死亡机制及相关生物标志物 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 基因集变异分析（GSVA），加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | RNA测序数据 | 独立队列和HK-2细胞 | NA | NA | NA | NA |