单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 461 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2024-08-07 |
Mouse gingival single-cell transcriptomic atlas identified a novel fibroblast subpopulation activated to guide oral barrier immunity in periodontitis
2023-Nov-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.88183
PMID:38015204
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术构建了小鼠牙周炎模型中的牙龈细胞图谱，并鉴定出一种新型纤维母细胞亚群，该亚群在牙周炎中引导口腔屏障免疫。 | 首次鉴定出一种新型纤维母细胞亚群（AG纤维母细胞），并揭示了其在牙周炎中引导口腔炎症的机制。 | NA | 揭示牙周炎中异常口腔屏障免疫的启动机制。 | 小鼠牙周炎模型中的牙龈细胞。 | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自小鼠牙周炎模型的牙龈细胞 |
| 282 | 2024-08-05 |
LncPCD: a manually curated database of experimentally supported associations between lncRNA-mediated programmed cell death and diseases
2023-11-27, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baad087
PMID:38011720
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研究论文 | LncPCD是一个手动整理的数据库，提供lncRNA介导的程序性细胞死亡与疾病之间的实验支持关联信息 | 建立了一个专门的数据库LncPCD，记录了lncRNA介导的程序性细胞死亡与多种疾病之间的关系 | 数据库的当前版本可能不包含所有潜在的lncRNA与PCD的关联，且需要持续更新 | 提供关于lncRNA介导的程序性细胞死亡与疾病之间关联的全面信息 | 记录lncRNA与五种主要PCD形式及331种疾病之间的6666个关联 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 数据库 | 331种疾病，1222个lncRNA |
| 283 | 2024-08-05 |
scDREAMER for atlas-level integration of single-cell datasets using deep generative model paired with adversarial classifier
2023-Nov-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43590-8
PMID:38012145
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研究论文 | 该文章介绍了scDREAMER，一个用于单细胞数据集集成的深度生成模型框架 | scDREAMER结合了深度生成模型和对抗性训练，实现了无监督和监督的多批次数据集成 | 没有提到特定的局限性 | 旨在整合多个组织位置、时间和条件下生成的异质单细胞测序数据集 | 涉及六个真实的基准数据集 | 数字病理学 | NA | 深度生成模型 | 对抗性分类器 | 单细胞测序数据 | 100万个细胞 |
| 284 | 2024-08-05 |
Deciphering tumor-infiltrating dendritic cells in the single-cell era
2023-Nov-27, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-023-00459-2
PMID:38012715
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综述 | 本文概述了肿瘤微环境中树突状细胞的亚型及其功能。 | 采用单细胞测序技术对树突状细胞的异质性进行高分辨率特征描述，揭示了以前未被认识的树突状细胞群体的多样性。 | 未提及具体的实验数据和样本大小 | 旨在总结肿瘤微环境中树突状细胞的知识，以帮助了解肿瘤免疫。 | 不同人类肿瘤中树突状细胞的亚型及其功能和相互作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 285 | 2024-08-05 |
Robust mapping of spatiotemporal trajectories and cell-cell interactions in healthy and diseased tissues
2023-Nov-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43120-6
PMID:38007580
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研究论文 | 本研究开发了三种计算统计算法，以整合不同数据类型并深入理解细胞过程 | 提出了空间图基的方法和新的细胞间互动分析测试，显著降低假发现率 | 没有提及具体的数据源和实验验证细节 | 提升对健康和疾病组织中细胞过程的理解 | 健康和疾病组织中的细胞 | 数字病理学 | 癌症进展 | 空间转录组学（ST） | 空间图模型 | 基因表达、物理距离、组织形态 | NA |
| 286 | 2024-08-05 |
Role of arachidonic acid metabolism in intervertebral disc degeneration: identification of potential biomarkers and therapeutic targets via multi-omics analysis and artificial intelligence strategies
2023-Nov-25, Lipids in health and disease
IF:3.9Q2
DOI:10.1186/s12944-023-01962-5
PMID:38007425
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研究论文 | 该研究探讨了花生四烯酸代谢在椎间盘退变中的作用，识别了潜在的生物标志物和治疗靶点 | 首次通过多组学分析和人工智能策略识别IVDD相关的枢纽基因并开发预测模型 | 需要在更大规模的临床样本中验证所识别的生物标志物和治疗靶点的有效性 | 探讨花生四烯酸代谢与椎间盘退变的关系，识别早期生物标志物及治疗靶点 | 主要针对椎间盘退变及其相关的生物标志物和靶向药物 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序，机器学习，人工神经网络 | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 287 | 2024-08-07 |
Comprehensive clinicopathological significance and putative transcriptional mechanisms of Forkhead box M1 factor in hepatocellular carcinoma
2023-Nov-25, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-023-03250-z
PMID:38001498
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研究论文 | 本研究探讨了Forkhead box M1因子（FOXM1）在肝细胞癌（HCC）中的临床病理意义及其潜在的转录机制 | 本研究首次在大规模多中心研究中证实了FOXM1在HCC中的上调，并揭示了其在细胞周期途径中通过激活其他转录因子促进HCC进展的潜在机制 | NA | 探讨FOXM1在HCC中的临床病理意义及其转录机制 | FOXM1因子在肝细胞癌中的表达及其转录机制 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 组织微阵列、免疫组化染色、基因芯片、高通量测序、染色质免疫沉淀后测序（ChIP-seq）、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本、基因表达数据 | 4235个HCC组织样本和3461个非HCC组织样本 |
| 288 | 2024-08-05 |
Pregnancy-responsive pools of adult neural stem cells for transient neurogenesis in mothers
2023-11-24, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abo5199
PMID:37995223
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研究论文 | 本文探讨了妊娠期间母体中成人神经干细胞的响应及其对神经发生的影响 | 研究发现多个区域特异的成人神经干细胞会在妊娠期间被招募，产生短期的嗅球间神经元波 | 未提及具体的局限性 | 研究妊娠如何影响成人神经干细胞的激活及神经发生 | 研究对象为成年小鼠的神经干细胞及其在妊娠期间的反应 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 成年小鼠 |
| 289 | 2024-08-07 |
The extrafollicular B cell response is a hallmark of childhood idiopathic nephrotic syndrome
2023-Nov-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43504-8
PMID:37996443
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了儿童特发性肾病综合征（INS）中B细胞的转录程序，表明外滤泡B细胞反应是主要的免疫扰动。 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了INS患儿血液样本中B细胞的转录特征，并证实了外滤泡B细胞反应的存在。 | 研究样本量较小，仅包括13名INS患儿和24名健康对照，可能影响结果的普遍性。 | 探讨B细胞在儿童特发性肾病综合征发病机制中的作用。 | 儿童特发性肾病综合征（INS）患儿的B细胞。 | NA | 儿童特发性肾病综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 13名INS患儿和24名健康对照 |
| 290 | 2024-08-07 |
Mouse models of pediatric high-grade gliomas with MYCN amplification reveal intratumoral heterogeneity and lineage signatures
2023-Nov-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43564-w
PMID:38001143
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研究论文 | 本文通过培育hGFAP-cre::Trp53::lsl-MYCN小鼠，生成了一个遗传工程小鼠模型，用于研究MYCN扩增的儿童高级别胶质瘤的肿瘤发生和分子特征 | 首次揭示了MYCN扩增的儿童高级别胶质瘤的肿瘤内异质性和神经元及少突胶质细胞谱系特征 | NA | 研究MYCN扩增的儿童高级别胶质瘤的生物学特性和临床特征，并提出替代治疗方案 | MYCN扩增的儿童高级别胶质瘤 | 数字病理学 | 儿童疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 291 | 2024-08-07 |
Molecular subtyping based on immune cell marker genes predicts prognosis and therapeutic response in patients with lung adenocarcinoma
2023-Nov-24, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-11579-7
PMID:38001428
|
研究论文 | 本研究利用免疫细胞标记基因对肺腺癌进行分子亚型分类，并探讨其与临床结果和治疗反应的关系 | 通过单细胞RNA测序识别的免疫细胞标记基因，构建了肺腺癌免疫差异评分模型，用于预测患者的预后和治疗反应 | NA | 探索肺腺癌的分子亚型特征，明确免疫微环境、临床结果和治疗反应之间的关联 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归分析 | 基因数据 | 1441个免疫细胞标记基因，GSE72094队列的患者 |
| 292 | 2024-08-05 |
A Mendelian Randomization-Based Causal Investigation on Bacterial Infection-Related Genes and Neurodegenerative Diseases
2023-Nov-23, Studies in health technology and informatics
DOI:10.3233/SHTI230893
PMID:38007792
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研究论文 | 本研究探讨了细菌感染相关基因与神经退行性疾病之间的因果关系 | 通过孟德尔随机化，确定了7个与细菌感染途径相关的基因在阿尔茨海默病和帕金森病中的因果关联 | 尚未深入研究细菌慢性感染与神经退行性疾病的关系 | 分析细菌感染基因与神经退行性疾病之间的因果关系 | 阿尔茨海默病和帕金森病相关基因 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 孟德尔随机化 | NA | 基因组数据 | 根据全基因组关联研究（GWAS）的数据 |
| 293 | 2024-08-05 |
Single Cell Sequencing Analysis for Blood Tissue
2023-Nov-23, Studies in health technology and informatics
DOI:10.3233/SHTI230872
PMID:38007772
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析血液组织样本 | 首次在血液组织中使用单细胞测序揭示细胞异质性 | 研究仅限于血液组织样本，可能无法广泛应用于其他组织类型 | 探索不同细胞类型在生理和病理条件下的分子特征和功能差异 | 血液组织样本中的单个细胞 | 数字病理学 | 老年性疾病 | 单细胞测序 | 主成分分析（PCA）和莱顿聚类 | 基因组、转录组和表观基因组数据 | 血液组织样本中的细胞 |
| 294 | 2024-08-07 |
Vector-borne Trypanosoma brucei parasites develop in artificial human skin and persist as skin tissue forms
2023-Nov-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43437-2
PMID:37996412
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研究论文 | 研究介绍了先进的人工皮肤模型，并使用采采蝇自然感染该皮肤模型，通过单细胞RNA测序详细描述了寄生虫在皮肤中的发育过程 | 首次展示了Trypanosoma brucei在人工人类皮肤中的发育过程，并发现了寄生虫进入可逆静止状态的新型皮肤组织形式 | NA | 研究Trypanosoma brucei在人工人类皮肤中的发育及其在感染维持中的作用 | Trypanosoma brucei寄生虫及其在人工皮肤中的发育过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 295 | 2024-08-05 |
Single-cell epigenomics and spatiotemporal transcriptomics reveal human cerebellar development
2023-Nov-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43568-6
PMID:37993461
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研究论文 | 本文结合单细胞转录组学、空间转录组学和单细胞染色质可及性状态系统描绘了人类胎儿小脑发育的整合时空景观 | 揭示了转录因子和顺式调控元件（CREs）在祖细胞分化和细胞命运决定中的分层作用，并提供了基因表达调控图 | NA | 阐明人类小脑发育的分子调控网络及其时空特征 | 人类胎儿小脑发育过程中不同区域的颗粒细胞 | 数字病理学 | 神经精神疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 296 | 2024-08-05 |
Transfer learning for clustering single-cell RNA-seq data crossing-species and batch, case on uterine fibroids
2023-11-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad426
PMID:37991248
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研究论文 | 本文提出了一种新的图基深度嵌入聚类方法，利用跨物种和批次的迁移学习来聚类单细胞RNA-seq数据 | 创新地提出了GDEC方法，通过图卷积网络及DEC，改善了稀疏基因表达矩阵带来的挑战，并在多种细胞群体中发现了新的细胞类型 | NA | 旨在通过迁移学习提高单细胞RNA-seq数据的聚类效果 | 单细胞RNA-seq数据，特别是子宫肌瘤数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 图卷积网络 | 单细胞RNA-seq数据 | NA |
| 297 | 2024-08-05 |
A rapid and sensitive, multiplex, whole mount RNA fluorescence in situ hybridization and immunohistochemistry protocol
2023-Nov-22, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-023-01108-9
PMID:37993896
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研究论文 | 本研究提出了一种快速、灵敏的全挂RNA荧光原位杂交和免疫组化协议 | 该研究适应了一种基于混合先前协议的三天全挂RNA-FISH方法，增强了探针信号，并实现了三种转录本的同时检测 | 目前尚未报告易于可靠应用的全挂FISH协议 | 探讨植物组织中的基因表达空间特征 | 研究对象为拟南芥花序和单子叶植物根的基因转录本 | 数字病理学 | NA | RNA荧光原位杂交（FISH） | 无抗体的杂交链反应（HCR） | NA | NA |
| 298 | 2024-08-07 |
Liver cancer stem cell dissemination and metastasis: uncovering the role of NRCAM in hepatocellular carcinoma
2023-Nov-22, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02893-w
PMID:37993901
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研究论文 | 本研究探讨了NRCAM在肝癌干细胞（LCSCs）功能和肝细胞癌（HCC）转移中的作用及其机制 | 首次揭示了NRCAM通过激活上皮-间质转化（EMT）和转移相关基质金属蛋白酶（MMPs）促进LCSCs迁移和侵袭的机制 | NA | 揭示NRCAM对LCSCs功能和HCC转移的贡献及其详细机制 | 肝癌干细胞（LCSCs）和肝细胞癌（HCC） | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 117例HCC患者和29例非HCC患者 |
| 299 | 2024-08-05 |
The Promotion of Humoral Immune Responses in Humans via SOCS1-Mediated Th2-Bias Following SARS-CoV-2 Vaccination
2023-Nov-20, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines11111730
PMID:38006062
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研究论文 | 本研究揭示了SARS-CoV-2疫苗接种后通过SOCS1介导的Th2偏倚促进人类体液免疫反应的机制 | 研究首次指出SOCS1在T细胞中的变化与Th2偏倚及抗SARS-CoV-2抗体产生之间的关联 | 研究只关注了抗体变化的高低分组，可能未能全面反映所有个体的免疫反应 | 探讨SARS-CoV-2疫苗接种后Th1/Th2偏倚对宿主免疫反应的影响 | 接种三剂SARS-CoV-2疫苗后的抗体变化显著的个体 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 血液样本 | 三个剂量接种后的样本，具体数量未提及 |
| 300 | 2024-08-05 |
Cancer-Associated Fibroblasts in Gastrointestinal Cancers: Unveiling Their Dynamic Roles in the Tumor Microenvironment
2023-Nov-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242216505
PMID:38003695
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综述 | 本文总结了癌associated成纤维细胞（CAFs）在胃肠癌肿瘤微环境中的动态作用。 | 揭示了CAFs在肿瘤进展中的多重作用和与免疫系统的动态相互作用 | 未提及具体的研究限制 | 探讨胃肠癌中CAFs在肿瘤微环境中的作用 | 癌associated成纤维细胞及其在肿瘤进展中的角色 | 数字病理学 | 胃肠癌 | 单细胞转录组学 | NA | 文献数据 | NA |