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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2024-08-07 |
Single-cell sequencing of multi-region resolves geospatial architecture and therapeutic target of endothelial cells in esophageal squamous cell carcinoma
2023-11, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1487
PMID:37987158
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 202 | 2024-08-04 |
Cerebral organoids derived from patients with Alzheimer's disease with PSEN1/2 mutations have defective tissue patterning and altered development
2023-11-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113310
PMID:37864790
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研究论文 | 本研究创建了一个来自阿尔茨海默病患者的脑类器官模型,探讨了早期事件和病理进程 | 利用来自具有PSEN1/2突变的阿尔茨海默病患者的诱导多能干细胞创建了特定的脑类器官,并发现了组织模式缺陷和发育改变 | 研究主要集中在体外模型上,可能不完全反映体内的病理情况 | 探讨阿尔茨海默病的早期病理事件和进展 | 利用来自家族性阿尔茨海默病患者的诱导多能干细胞生成的脑类器官 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 诱导多能干细胞(iPSC) | 脑类器官(CO) | 单细胞测序数据 | 来自三条阿尔茨海默病-iPSC线的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 203 | 2024-08-07 |
Single-cell dissection, hdWGCNA and deep learning reveal the role of oxidatively stressed plasma cells in ulcerative colitis
2023-11-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2023237
PMID:37814814
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高级加权基因共表达网络分析,揭示了氧化应激浆细胞在溃疡性结肠炎中的作用,并利用深度学习模型进行诊断 | 首次通过单细胞水平分析和多种机器学习方法,识别出氧化应激浆细胞在溃疡性结肠炎中的关键作用,并开发了用于诊断的深度学习模型 | NA | 阐明溃疡性结肠炎在单细胞水平的发病机制及其临床意义 | 溃疡性结肠炎中的氧化应激浆细胞 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | 卷积神经网络 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 204 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling identifies distinct hormonal, immunologic, and inflammatory signatures of endometriosis-constituting cells
2023-11, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6178
PMID:37807404
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了卵巢子宫内膜囊肿、浅表腹膜子宫内膜异位症和深部浸润性子宫内膜异位症患者的细胞类型及其分子特征 | 发现了子宫内膜异位症特有的MUC5B细胞、间皮细胞来源的肌成纤维细胞以及NRG1-ERBB3相互作用,这些可能与子宫内膜异位症的发病机制有关 | NA | 探讨子宫内膜异位症构成细胞与正常子宫内膜的差异及其分子特征与表型表现的关系 | 卵巢子宫内膜囊肿、浅表腹膜子宫内膜异位症和深部浸润性子宫内膜异位症 | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 12名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 205 | 2024-08-07 |
Hepatitis C virus infects and perturbs liver stem cells
2023-Nov-08, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01318-23
PMID:37938000
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研究论文 | 本文研究了丙型肝炎病毒(HCV)感染肝干细胞并干扰其正常功能,导致肝脏损伤和癌症风险增加的情况。 | 首次发现HCV可以感染肝干细胞,并通过转录重编程促进癌细胞发展和免疫反应改变。 | NA | 探讨HCV感染如何导致肝脏疾病进展和增加癌症风险。 | 肝干细胞和由其衍生的3D肝脏类器官。 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自活动性HCV感染个体的肝干细胞衍生的3D肝脏类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 206 | 2024-08-04 |
Amnion responses to intrauterine inflammation and effects of inhibition of TNF signaling in preterm Rhesus macaque
2023-Nov-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108118
PMID:37953944
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研究论文 | 研究了羊膜在子宫内炎症中的反应及TNF信号抑制的影响 | 使用非人类灵长类动物模型与人类队列对比研究了羊膜转录组,揭示了关键的分娩介导基因的调控机制 | 本研究主要基于一个非人类灵长类动物模型,可能存在物种之间的差异 | 阐明子宫内感染/炎症在母胎界面如何调节 | 比较早产猕猴模型与人类病人群体的羊膜转录组 | 数字病理学 | 早产 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 早产猕猴模型与人类病例的比较,即多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 207 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of immunocytes in the spleen of a mouse model of Wiskott-Aldrich syndrome
2023 Nov-Dec, Cellular immunology
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cellimm.2023.104783
PMID:37944382
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,对Wiskott-Aldrich综合征小鼠模型的脾脏免疫细胞进行了全面的转录组分析 | 首次在单细胞分辨率下揭示了WAS-KO小鼠脾脏免疫细胞的转录特征,并鉴定了与疾病病理相关的新基因 | NA | 探究Wiskott-Aldrich综合征小鼠模型脾脏免疫细胞的免疫缺陷机制 | WAS-KO小鼠脾脏的免疫细胞 | 数字病理学 | 免疫缺陷疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11,269个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 208 | 2024-08-05 |
Tumor Niches: Perspectives for Targeted Therapies in Glioblastoma
2023-11, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1089/ars.2022.0187
PMID:37166370
|
review | 本文讨论了胶质母细胞瘤中的五种肿瘤生态位及其相互作用 | 提出了针对胶质母细胞瘤不同肿瘤生态位的治疗策略 | 该研究主要集中在理论探讨,缺乏实验验证 | 阐明肿瘤异质性的机制,为患者开发更有效的治疗方案 | 胶质母细胞瘤及其相关的肿瘤生态位 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 209 | 2024-08-04 |
Cancer-prone Phenotypes and Gene Expression Heterogeneity at Single-cell Resolution in Cigarette-smoking Lungs
2023-11-10, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0195
PMID:37910161
|
研究论文 | 该文章通过单细胞RNA测序技术揭示了吸烟肺部的癌症易感性表型和基因表达异质性 | 提出了两种新的单细胞元分析方法VARIED和AGED,并建立了吸烟肺部图谱,揭示了与吸烟相关的基因表达多样性和衰老差异 | 未提及研究的样本来源和潜在的外部影响因素 | 建立吸烟肺部图谱,以探究吸烟对人类肺部细胞多样性的影响 | 104个肺部单细胞RNA测序样本和相关的临床病理信息 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 104个肺部单细胞RNA测序样本 | NA | NA | NA | NA |
| 210 | 2024-08-05 |
Antigen-presenting autoreactive B cells activate regulatory T cells and suppress autoimmune arthritis in mice
2023-11-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230101
PMID:37695523
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研究论文 | 本研究探讨了自反应性B细胞如何激活调节性T细胞并抑制小鼠中的自身免疫性关节炎 | 揭示了自反应性B细胞通过诱导调节性T细胞扩展的新机制,并区分了它们与IL10分泌B细胞的不同 | 可能未探讨其他类型B细胞在自身免疫中角色的全面影响 | 研究自反应性B细胞在自身免疫性疾病中的作用 | 研究自反应性B细胞及其对T细胞的影响 | 免疫学 | 自身免疫性关节炎 | 单细胞测序 | NA | 生物样本 | 使用了小鼠作为样本 | NA | NA | NA | NA |
| 211 | 2024-08-07 |
Low-density lipoprotein receptor promotes crosstalk between cell stemness and tumor immune microenvironment in breast cancer: a large data-based multi-omics study
2023-11-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04699-y
PMID:38037058
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研究论文 | 本研究通过大规模多组学数据分析,探讨了低密度脂蛋白受体(LDLR)在乳腺癌细胞干性和肿瘤免疫微环境交互作用中的作用 | 首次揭示了LDLR在乳腺癌细胞干性和肿瘤免疫微环境交互作用中的关键作用 | 主要依赖于公共数据库的数据,缺乏体内实验验证 | 识别破坏乳腺癌细胞干性和免疫微环境之间通信的潜在靶点 | 乳腺癌细胞的干性和肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序, 蛋白质组学分析, 单细胞RNA测序 | Lasso回归分析, Cox生存回归模型 | RNA序列数据, 蛋白质数据 | 3132名乳腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 212 | 2024-08-07 |
The construction of a testis transcriptional cell atlas from embryo to adult reveals various somatic cells and their molecular roles
2023-11-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04722-2
PMID:38012716
|
研究论文 | 本文构建了一个从胚胎到成年的睾丸转录细胞图谱,揭示了各种体细胞及其分子作用 | 通过整合单细胞RNA测序数据,构建了跨五个发育阶段的睾丸转录细胞图谱,并使用多种分析技术进行了全面分析 | NA | 更好地理解睾丸从胚胎到成年的发育变化 | 睾丸中的体细胞和生殖细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过26,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 213 | 2024-08-04 |
Talniflumate abrogates mucin immune suppressive barrier improving efficacy of gemcitabine and nab-paclitaxel treatment in pancreatic cancer
2023-11-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04733-z
PMID:37996891
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研究论文 | 本研究探讨了talniflumate如何克服粘蛋白的免疫抑制屏障,从而增强吉西他滨和纳米紫杉醇在胰腺癌治疗中的疗效 | 本研究揭示了GCNT3作为粘蛋白表达的主要调节因子,并提出其作为talniflumate作用的可行靶点 | 研究中使用的样本量较小,仅分析了43个胰腺管内乳头状粘液瘤(IPMN),且主要集中于特定的粘蛋白通路 | 研究旨在识别肿瘤微环境中的免疫抑制机制,并提高对胰腺癌的治疗效果 | 研究对象包括低级和高级胰腺管内乳头状粘液瘤,胰腺癌类器官及T细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学 | 小鼠同种异体模型 | 基因表达数据 | 43个胰腺管内乳头状粘液瘤样本(12个低级,31个高级) | NA | NA | NA | NA |
| 214 | 2024-08-07 |
Human γδ T cell identification from single-cell RNA sequencing datasets by modular TCR expression
2023-11-24, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiad069
PMID:37437101
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于TCR模块基因表达评分策略,用于从单细胞RNA测序数据中准确识别人类γδ T细胞 | 提出了一种新的TCR模块评分策略,无需额外的单细胞γδ T细胞受体测序或CITE-seq数据,即可在大型单细胞RNA测序数据集中识别γδ T细胞 | NA | 开发一种新的方法,用于在大型单细胞RNA测序数据集中准确识别γδ T细胞 | 人类γδ T细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 多个不同组织和不同亚型的γδ T细胞的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 215 | 2024-08-07 |
PD-1 signaling uncovers a pathogenic subset of T cells in inflammatory arthritis
2023-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.16.566893
PMID:38014321
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术和CRISPR/Cas9全基因组筛选分析了类风湿关节炎患者外周血和滑膜液中的T细胞,发现PD-1信号通路相关基因在炎症性关节炎中的作用 | 发现了与PD-1抑制T细胞功能相关的1,112个独特基因,并揭示了PD-1 + HLA-DR HIGH KLRG LOW T细胞作为炎症性T细胞的新亚群 | 需要进一步研究以完全阐明PD-1在滑膜T细胞亚群中的作用 | 探索PD-1信号通路在炎症性关节炎中的作用,并寻找新的治疗靶点 | 类风湿关节炎患者的T细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 流式细胞术,CRISPR/Cas9全基因组筛选 | NA | RNA测序数据 | 来自类风湿关节炎患者的外周血和滑膜液中的T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 216 | 2024-08-07 |
Tumor-derived Endothelial Cell: Important Etiological Factors in Endometriosis
2023-11, Archives of medical research
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.arcmed.2023.102891
PMID:37738888
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了子宫内膜异位症细胞的转录组特征,并分析了肿瘤来源的内皮细胞在疾病中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了子宫内膜异位症中细胞异质性,并发现了肿瘤来源内皮细胞在疾病中的重要作用 | 研究样本量较小,且仅包括了三名患者,可能影响结果的普遍性 | 探究子宫内膜异位症中肿瘤来源内皮细胞的作用及其病理特征 | 子宫内膜异位症患者的异位和正常子宫内膜组织 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三名子宫内膜异位症患者,包括114例回顾性病例 | NA | NA | NA | NA |
| 217 | 2024-08-07 |
Pooled Genome-Scale CRISPR Screens in Single Cells
2023-11-27, Annual review of genetics
IF:8.7Q1
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review | 本文综述了单细胞水平上基于CRISPR的基因筛选技术的原理和实际考虑 | 介绍了利用CRISPR-Cas技术在单细胞中进行基因功能调控和表达控制的创新方法 | NA | 探讨基因功能分配和表达控制的基础,以及其在细胞生物学和治疗开发中的应用 | 基因功能和表达控制 | 基因编辑 | NA | CRISPR-Cas | NA | RNA sequencing, 细胞图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 218 | 2024-08-04 |
FXYD3 functionally demarcates an ancestral breast cancer stem cell subpopulation with features of drug-tolerant persisters
2023-11-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI166666
PMID:37966117
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研究论文 | 该文章研究了FXYD3在三阴性乳腺癌干细胞亚群体中的功能及其耐药特征 | 发现了以FXYD3为标志的乳腺癌干细胞亚群,并揭示了其与药物耐受性持久存活者的关系 | 研究主要集中在三阴性乳腺癌,可能不适用于其他类型的癌症 | 探讨肿瘤中癌症干细胞的异质性及其在化疗中的敏感性 | 三阴性乳腺癌(TNBC)中的癌症干细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 219 | 2024-08-05 |
Type I interferon signature and cycling lymphocytes in macrophage activation syndrome
2023-11-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI165616
PMID:37751296
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研究论文 | 本文研究了与Still病相关的巨噬细胞激活综合征(MAS)中的I型干扰素特征和循环淋巴细胞。 | 该研究揭示了MAS患者中I型干扰素过量产生与IL-15的协同作用,导致CD38+HLA-DR+循环淋巴细胞的生成,这为理解MAS的免疫机制提供了新见解。 | 该研究主要基于对外周血单核细胞的分析,尚需进一步验证其在不同患者群体中的普遍性。 | 旨在更深入地理解Still病和巨噬细胞激活综合征的免疫学特征。 | 研究对象为健康对照组与有或没有MAS的Still病患者。 | 数字病理学 | Still病 | bulk RNA-Seq, single-cell RNA-Seq, 质量细胞术, 流式细胞术 | NA | RNA数据 | 超过65,000个PBMC样本 | NA | NA | NA | NA |
| 220 | 2024-08-04 |
Metabolic predictors of response to immune checkpoint blockade therapy
2023-Nov-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108188
PMID:37965137
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤微环境中免疫细胞代谢与免疫检查点抑制剂反应之间的关系 | 首次对接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者肿瘤微环境中免疫细胞的代谢特征进行了分析,并建立了基于代谢基因特征的预测模型 | 目前只分析了部分代谢基因,可能未涵盖所有相关的代谢途径 | 旨在通过代谢特征预测癌症患者对免疫检查点抑制剂的反应 | 参与研究的对象为大约230例接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约230个样本,涉及超过100万个免疫细胞 | NA | NA | NA | NA |