单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 460 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2024-08-05 |
tauFisher accurately predicts circadian time from a single sample of bulk and single-cell transcriptomic data
2023-Nov-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.04.535473
PMID:37066246
|
研究论文 | 本文介绍了tauFisher，这是一种能从单个转录组样本中准确预测生物钟时间的计算管道 | tauFisher通过寻找样本中节律基因之间的相关性，提供了一种新的方法来预测生物钟时间 | 未提及具体的局限性 | 本研究旨在提高对生物钟时间的预测，以促进生物钟医学和研究 | 研究对象是来自多个组织类型和实验设置的转录组数据 | 计算生物学 | NA | 转录组测序 | NA | 转录组数据 | 使用了来自多个组织类型的单个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 202 | 2024-08-05 |
Disruption of cholangiocyte-B cell crosstalk by blocking the CXCL12-CXCR4 axis alleviates liver fibrosis
2023-Nov-27, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-023-05032-y
PMID:38010435
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研究论文 | 本研究探讨了阻断CXCL12-CXCR4轴如何通过破坏胆管细胞与B细胞的相互作用来减轻肝纤维化 | 提出了通过干扰胆管细胞和B细胞之间的通讯来减轻肝纤维化的新机制 | 未评估其他潜在的机制或临床应用环境 | 研究B细胞在肝纤维化中的作用及干预策略 | 以小鼠模型为基础，分析了B细胞和胆管细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | RNA序列 | 使用小鼠模型进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 203 | 2024-08-05 |
Macrophage activation drives ovarian failure and masculinization in zebrafish
2023-11-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adg7488
PMID:37992158
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研究论文 | 该文章探讨了巨噬细胞活化如何驱动斑马鱼的卵巢衰退和男性化 | 通过建立巨噬细胞活化与卵巢衰退之间的因果关系，确定了促进卵巢衰退和性别逆转的生殖细胞-体细胞信号轴 | 对人类卵巢衰退机制的适用性可能受到限制，因为研究是在斑马鱼模型中进行的 | 研究BMP15突变引起的卵巢衰退和免疫因素的细胞机制 | 主要研究对象为斑马鱼，特别是涉及到巨噬细胞和卵巢细胞的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 204 | 2024-08-04 |
Single cell and spatial transcriptomics analysis of kidney double negative T lymphocytes in normal and ischemic mouse kidneys
2023-11-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-48213-2
PMID:38017015
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研究论文 | 本文探讨了小鼠正常和缺血性肾脏中双阴性T淋巴细胞的单细胞与空间转录组学分析 | 研究首次揭示了相比传统CD4和CD8T细胞，DN T细胞在急性肾损伤中的分子特征和空间动态 | 对于DN T细胞的研究信息仍然非常有限，与CD4和CD8细胞的比较尚需进一步研究 | 阐明急性肾损伤期间DN T细胞的分子特征和空间动态 | 小鼠的DN、CD4和CD8 T细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和空间转录组学 | NA | RNA数据 | 排序的小鼠DN、CD4和CD8细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 205 | 2024-08-05 |
Trem2 promotes foamy macrophage lipid uptake and survival in atherosclerosis
2023-Nov, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-023-00354-3
PMID:38646596
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研究论文 | 本研究揭示了Trem2在动脉粥样硬化中对泡沫巨噬细胞分化和生存的调节作用 | 首次确定Trem2作为泡沫巨噬细胞特性的调节因子，并揭示其作为动脉粥样硬化潜在治疗靶点的可能性 | 本研究可能未能充分考虑动脉粥样硬化中其他潜在调节因子的影响 | 探讨Trem2在动脉粥样硬化中泡沫巨噬细胞的角色 | 泡沫巨噬细胞及其在动脉粥样硬化中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，基因组范围的CRISPR筛选 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 206 | 2024-08-05 |
Cell-type specific molecular architecture for mu opioid receptor function in pain and addiction circuits
2023-11-01, Neuropharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.neuropharm.2023.109597
PMID:37271281
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研究论文 | 该文章描述了在疼痛和成瘾电路中，特定细胞类型的μ阿片受体功能的分子结构。 | 研究中使用单细胞RNA测序技术识别了整个神经系统中表达μ阿片受体的细胞类型，提供了将阿片类药物影响映射到新发现细胞类型的新机会。 | 该研究可能在细胞特征与阿片类药物作用之间的因果关系上存在探索的局限性 | 阐明与阿片类药物相关的细胞类型和神经电路，以促进安全的疼痛管理和阿片使用障碍的治疗。 | 研究对象为表达μ阿片受体的神经元细胞类型。 | 数字病理学 | 阿片类药物使用障碍 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 207 | 2024-08-04 |
Crosstalk between alternative splicing and inflammatory bowel disease: Basic mechanisms, biotechnological progresses and future perspectives
2023-11, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1479
PMID:37983927
|
综述 | 这篇文章总结了替代剪接与炎症性肠病之间的关系，以及相关的生物技术进展和未来的前景 | 这是首个评估替代剪接事件在炎症性肠病中潜在调控机制的综述 | 文章未详细讨论所有潜在的异常剪接基因及其机制 | 探讨替代剪接在炎症性肠病发病机制中的作用 | 涉及炎症性肠病中的异常替代剪接事件及其相关分子 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 下一代测序（NGS）、微阵列、第三代测序（TGS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 208 | 2024-08-07 |
Single-cell sequencing of multi-region resolves geospatial architecture and therapeutic target of endothelial cells in esophageal squamous cell carcinoma
2023-11, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1487
PMID:37987158
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 209 | 2024-08-04 |
Cerebral organoids derived from patients with Alzheimer's disease with PSEN1/2 mutations have defective tissue patterning and altered development
2023-11-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113310
PMID:37864790
|
研究论文 | 本研究创建了一个来自阿尔茨海默病患者的脑类器官模型，探讨了早期事件和病理进程 | 利用来自具有PSEN1/2突变的阿尔茨海默病患者的诱导多能干细胞创建了特定的脑类器官，并发现了组织模式缺陷和发育改变 | 研究主要集中在体外模型上，可能不完全反映体内的病理情况 | 探讨阿尔茨海默病的早期病理事件和进展 | 利用来自家族性阿尔茨海默病患者的诱导多能干细胞生成的脑类器官 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 诱导多能干细胞(iPSC) | 脑类器官(CO) | 单细胞测序数据 | 来自三条阿尔茨海默病-iPSC线的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 210 | 2024-08-07 |
Single-cell dissection, hdWGCNA and deep learning reveal the role of oxidatively stressed plasma cells in ulcerative colitis
2023-11-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2023237
PMID:37814814
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高级加权基因共表达网络分析，揭示了氧化应激浆细胞在溃疡性结肠炎中的作用，并利用深度学习模型进行诊断 | 首次通过单细胞水平分析和多种机器学习方法，识别出氧化应激浆细胞在溃疡性结肠炎中的关键作用，并开发了用于诊断的深度学习模型 | NA | 阐明溃疡性结肠炎在单细胞水平的发病机制及其临床意义 | 溃疡性结肠炎中的氧化应激浆细胞 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | 卷积神经网络 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 211 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling identifies distinct hormonal, immunologic, and inflammatory signatures of endometriosis-constituting cells
2023-11, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6178
PMID:37807404
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了卵巢子宫内膜囊肿、浅表腹膜子宫内膜异位症和深部浸润性子宫内膜异位症患者的细胞类型及其分子特征 | 发现了子宫内膜异位症特有的MUC5B细胞、间皮细胞来源的肌成纤维细胞以及NRG1-ERBB3相互作用，这些可能与子宫内膜异位症的发病机制有关 | NA | 探讨子宫内膜异位症构成细胞与正常子宫内膜的差异及其分子特征与表型表现的关系 | 卵巢子宫内膜囊肿、浅表腹膜子宫内膜异位症和深部浸润性子宫内膜异位症 | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 12名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 212 | 2024-08-07 |
Hepatitis C virus infects and perturbs liver stem cells
2023-Nov-08, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01318-23
PMID:37938000
|
研究论文 | 本文研究了丙型肝炎病毒（HCV）感染肝干细胞并干扰其正常功能，导致肝脏损伤和癌症风险增加的情况。 | 首次发现HCV可以感染肝干细胞，并通过转录重编程促进癌细胞发展和免疫反应改变。 | NA | 探讨HCV感染如何导致肝脏疾病进展和增加癌症风险。 | 肝干细胞和由其衍生的3D肝脏类器官。 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自活动性HCV感染个体的肝干细胞衍生的3D肝脏类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 213 | 2024-08-04 |
Amnion responses to intrauterine inflammation and effects of inhibition of TNF signaling in preterm Rhesus macaque
2023-Nov-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108118
PMID:37953944
|
研究论文 | 研究了羊膜在子宫内炎症中的反应及TNF信号抑制的影响 | 使用非人类灵长类动物模型与人类队列对比研究了羊膜转录组，揭示了关键的分娩介导基因的调控机制 | 本研究主要基于一个非人类灵长类动物模型，可能存在物种之间的差异 | 阐明子宫内感染/炎症在母胎界面如何调节 | 比较早产猕猴模型与人类病人群体的羊膜转录组 | 数字病理学 | 早产 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 早产猕猴模型与人类病例的比较，即多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 214 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of immunocytes in the spleen of a mouse model of Wiskott-Aldrich syndrome
2023 Nov-Dec, Cellular immunology
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cellimm.2023.104783
PMID:37944382
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对Wiskott-Aldrich综合征小鼠模型的脾脏免疫细胞进行了全面的转录组分析 | 首次在单细胞分辨率下揭示了WAS-KO小鼠脾脏免疫细胞的转录特征，并鉴定了与疾病病理相关的新基因 | NA | 探究Wiskott-Aldrich综合征小鼠模型脾脏免疫细胞的免疫缺陷机制 | WAS-KO小鼠脾脏的免疫细胞 | 数字病理学 | 免疫缺陷疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11,269个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 215 | 2024-08-05 |
Tumor Niches: Perspectives for Targeted Therapies in Glioblastoma
2023-11, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1089/ars.2022.0187
PMID:37166370
|
review | 本文讨论了胶质母细胞瘤中的五种肿瘤生态位及其相互作用 | 提出了针对胶质母细胞瘤不同肿瘤生态位的治疗策略 | 该研究主要集中在理论探讨，缺乏实验验证 | 阐明肿瘤异质性的机制，为患者开发更有效的治疗方案 | 胶质母细胞瘤及其相关的肿瘤生态位 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 216 | 2024-08-04 |
Cancer-prone Phenotypes and Gene Expression Heterogeneity at Single-cell Resolution in Cigarette-smoking Lungs
2023-11-10, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0195
PMID:37910161
|
研究论文 | 该文章通过单细胞RNA测序技术揭示了吸烟肺部的癌症易感性表型和基因表达异质性 | 提出了两种新的单细胞元分析方法VARIED和AGED，并建立了吸烟肺部图谱，揭示了与吸烟相关的基因表达多样性和衰老差异 | 未提及研究的样本来源和潜在的外部影响因素 | 建立吸烟肺部图谱，以探究吸烟对人类肺部细胞多样性的影响 | 104个肺部单细胞RNA测序样本和相关的临床病理信息 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 104个肺部单细胞RNA测序样本 | NA | NA | NA | NA |
| 217 | 2024-08-05 |
Antigen-presenting autoreactive B cells activate regulatory T cells and suppress autoimmune arthritis in mice
2023-11-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230101
PMID:37695523
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研究论文 | 本研究探讨了自反应性B细胞如何激活调节性T细胞并抑制小鼠中的自身免疫性关节炎 | 揭示了自反应性B细胞通过诱导调节性T细胞扩展的新机制，并区分了它们与IL10分泌B细胞的不同 | 可能未探讨其他类型B细胞在自身免疫中角色的全面影响 | 研究自反应性B细胞在自身免疫性疾病中的作用 | 研究自反应性B细胞及其对T细胞的影响 | 免疫学 | 自身免疫性关节炎 | 单细胞测序 | NA | 生物样本 | 使用了小鼠作为样本 | NA | NA | NA | NA |
| 218 | 2024-08-07 |
Low-density lipoprotein receptor promotes crosstalk between cell stemness and tumor immune microenvironment in breast cancer: a large data-based multi-omics study
2023-11-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04699-y
PMID:38037058
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研究论文 | 本研究通过大规模多组学数据分析，探讨了低密度脂蛋白受体（LDLR）在乳腺癌细胞干性和肿瘤免疫微环境交互作用中的作用 | 首次揭示了LDLR在乳腺癌细胞干性和肿瘤免疫微环境交互作用中的关键作用 | 主要依赖于公共数据库的数据，缺乏体内实验验证 | 识别破坏乳腺癌细胞干性和免疫微环境之间通信的潜在靶点 | 乳腺癌细胞的干性和肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序, 蛋白质组学分析, 单细胞RNA测序 | Lasso回归分析, Cox生存回归模型 | RNA序列数据, 蛋白质数据 | 3132名乳腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 219 | 2024-08-07 |
The construction of a testis transcriptional cell atlas from embryo to adult reveals various somatic cells and their molecular roles
2023-11-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04722-2
PMID:38012716
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研究论文 | 本文构建了一个从胚胎到成年的睾丸转录细胞图谱，揭示了各种体细胞及其分子作用 | 通过整合单细胞RNA测序数据，构建了跨五个发育阶段的睾丸转录细胞图谱，并使用多种分析技术进行了全面分析 | NA | 更好地理解睾丸从胚胎到成年的发育变化 | 睾丸中的体细胞和生殖细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过26,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 220 | 2024-08-04 |
Talniflumate abrogates mucin immune suppressive barrier improving efficacy of gemcitabine and nab-paclitaxel treatment in pancreatic cancer
2023-11-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04733-z
PMID:37996891
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研究论文 | 本研究探讨了talniflumate如何克服粘蛋白的免疫抑制屏障，从而增强吉西他滨和纳米紫杉醇在胰腺癌治疗中的疗效 | 本研究揭示了GCNT3作为粘蛋白表达的主要调节因子，并提出其作为talniflumate作用的可行靶点 | 研究中使用的样本量较小，仅分析了43个胰腺管内乳头状粘液瘤（IPMN），且主要集中于特定的粘蛋白通路 | 研究旨在识别肿瘤微环境中的免疫抑制机制，并提高对胰腺癌的治疗效果 | 研究对象包括低级和高级胰腺管内乳头状粘液瘤，胰腺癌类器官及T细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学 | 小鼠同种异体模型 | 基因表达数据 | 43个胰腺管内乳头状粘液瘤样本（12个低级，31个高级） | NA | NA | NA | NA |