单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 461 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-08-07 |
DNA-binding protein PfAP2-P regulates parasite pathogenesis during malaria parasite blood stages
2023-Nov, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-023-01497-6
PMID:37884813
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研究论文 | 本文研究了DNA结合蛋白PfAP2-P在疟原虫红细胞阶段发育中的作用及其对病原性的调控 | 首次详细描述了PfAP2-P在疟原虫红细胞阶段发育中的两个表达高峰期，并揭示了其在trophozoite发育、var基因调控、merozoite发育和寄生虫出胞中的关键作用 | NA | 探讨PfAP2-P在疟原虫红细胞阶段发育中的分子调控机制 | Plasmodium falciparum中的PfAP2-P蛋白及其在疟原虫红细胞阶段的作用 | NA | 疟疾 | 染色质免疫沉淀测序, 单细胞RNA测序, 荧光激活细胞分选 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 182 | 2024-08-05 |
Integrative multi-omic profiling of adult mouse brain endothelial cells and potential implications in Alzheimer's disease
2023-11-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113392
PMID:37925638
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研究论文 | 本文生成了成年小鼠脑内皮细胞的综合分子图谱，探讨其在阿尔茨海默病中的潜在影响 | 研究首次整合了多组学数据，以揭示脑内皮细胞的功能异质性及其分子基础 | 该研究主要基于小鼠模型，可能限制了结果在人的适用性 | 研究血脑屏障的分子基础及其在神经疾病中的作用 | 成年小鼠脑内皮细胞及其在阿尔茨海默病中的变化 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序和蛋白质组学 | 单细胞RNA测序 | 分子数据 | 涉及成年小鼠和人脑组织 |
| 183 | 2024-08-07 |
BHLHE40 drives protective polyfunctional CD4 T cell differentiation in the female reproductive tract against Chlamydia
2023-Nov-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.02.565369
PMID:37961221
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研究论文 | 研究探讨了BHLHE40蛋白在女性生殖道中对沙眼衣原体感染的保护性T细胞反应中的作用 | 首次揭示了BHLHE40在调节CD4 T细胞多功能性分化中的关键作用 | NA | 研究BHLHE40在女性生殖道中对沙眼衣原体感染的保护性T细胞反应中的作用 | BHLHE40蛋白在女性生殖道中对沙眼衣原体感染的保护性T细胞反应中的作用 | 免疫学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序结合TCR分析 | NA | RNA | 使用BHLHE40缺陷小鼠进行实验 |
| 184 | 2024-08-05 |
Exercise Training Reduces the Inflammatory Response and Promotes Intestinal Mucosa-Associated Immunity in Lynch Syndrome
2023-11-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-0088
PMID:37724990
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研究论文 | 本研究评估了一项为期12个月的有氧运动干预对林奇综合症患者免疫系统的影响 | 首次明确了运动对高癌症风险群体免疫系统的生物学影响 | 研究为非随机和序贯干预分配，样本量较小 | 探讨运动干预在林奇综合症患者中的潜在益处 | 21名患有林奇综合症的患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 代谢组学、mRNA测序、空间转录组学 | NA | 生物标志物数据 | 21名患者 |
| 185 | 2024-08-07 |
Metastases and treatment-resistant lineages in patient-derived cancer cells of colorectal cancer
2023-11-24, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05562-y
PMID:37996567
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研究论文 | 本研究旨在揭示结直肠癌中促进转移的关键细胞，并识别治疗抵抗的细胞谱系 | 首次使用EGFP表达的类器官在二维培养中研究POU5F1表达细胞的转移促进能力和治疗抵抗性 | 研究主要集中在体外实验和动物模型中，尚未在临床试验中验证 | 揭示结直肠癌中促进转移的关键细胞和治疗抵抗的细胞谱系 | 结直肠癌患者的循环肿瘤细胞和类器官 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及多个临床患者的血液样本和类器官 |
| 186 | 2024-08-07 |
Single-cell and spatial architecture of primary liver cancer
2023-11-20, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05455-0
PMID:37985711
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序、空间转录组学和批量多组学技术，详细阐述了三种原发性肝癌（肝细胞癌、肝内胆管癌和混合型肝细胞-胆管癌）的分子结构 | 揭示了混合型肝细胞-胆管癌细胞内部不一致的表型，以及肝内胆管癌和肝细胞癌的特定肿瘤特征，并发现了肿瘤-肿瘤周围交界区存在的多种中间状态细胞 | NA | 探索原发性肝癌的同质性和异质性，并揭示其分子特征 | 原发性肝癌的三种类型：肝细胞癌、肝内胆管癌和混合型肝细胞-胆管癌 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学 | NA | 转录组数据 | 三种原发性肝癌类型的样本 |
| 187 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptomics Reveals Signatures of Histopathological Changes in Muscular Sarcoidosis
2023-11-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12232747
PMID:38067175
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学揭示了肌肉肉芽肿病的组织病理学变化特征 | 首次探索了肉芽肿与骨骼肌之间的相互作用，提供了有关免疫细胞对肌肉影响的新见解 | 研究对象仅包括两名患者，样本量较小，结果的普适性有待验证 | 揭示肉芽肿免疫细胞对骨骼肌的影响及其病理机制 | 研究对象为两名肌肉肉芽肿病患者 | 数字病理学 | 肌肉肉芽肿病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 2名肌肉肉芽肿病患者 |
| 188 | 2024-08-05 |
Sex and Age Impact CD4+ T Cell Susceptibility to HIV In Vitro through Cell Activation Dynamics
2023-11-23, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12232689
PMID:38067117
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研究论文 | 本研究探讨了性别和年龄如何通过细胞激活动态影响CD4+ T细胞对HIV的易感性 | 首次在体外验证了性别和年龄对CD4+ T细胞对HIV易感性的影响，并进行了深入的表面标记物表达评估 | 研究中未观察到根据性别区分的细胞亚型富集 | 研究细胞级别的因素如何影响HIV复制，特别是与性别和年龄相关的因素 | 从二十名供体提取的初级CD4+ T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 20名供体的CD4+ T细胞 |
| 189 | 2024-08-05 |
CellTICS: an explainable neural network for cell-type identification and interpretation based on single-cell RNA-seq data
2023-11-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad449
PMID:38061196
|
研究论文 | CellTICS是一个用于基于单细胞RNA-seq数据的细胞类型识别和解释的可解释神经网络 | CellTICS通过优先考虑细胞特异性表达的标记基因和生物路径层次结构，提供了一种生物学上可解释的方法，并能揭示定义细胞类型的通路 | 目前尚未提及该方法的具体局限性 | 旨在理解细胞类型的功能单位及其共享功能的生物学基础 | 研究对象是细胞类型及相关的生物路径 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | RNA-seq数据 | NA |
| 190 | 2024-08-07 |
Tick extracellular vesicles impair epidermal homeostasis through immune-epithelial networks during hematophagy
2023-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.10.566612
PMID:37986907
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研究论文 | 研究通过结合单细胞RNA测序、流式细胞术、小鼠遗传学和活体显微镜等方法，探讨了蜱虫外泌体如何通过干扰组织修复相关网络来破坏表皮稳态。 | 首次揭示了蜱虫外泌体通过影响表皮γδ T细胞频率和共受体表达，进而影响角质形成细胞功能，从而干扰组织修复过程。 | 研究主要集中在小鼠模型和特定的蜱虫种类，可能不完全适用于所有蜱虫种类或人类。 | 探讨蜱虫外泌体如何影响表皮稳态和组织修复过程。 | 蜱虫外泌体、表皮稳态、组织修复过程、γδ T细胞、角质形成细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq）、流式细胞术、活体显微镜 | NA | RNA | 涉及三种具有医学重要性的蜱虫种类和野生型动物的皮肤表皮样本 |
| 191 | 2024-08-05 |
A rat liver cell atlas reveals intrahepatic myeloid heterogeneity
2023-Nov-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108213
PMID:38026201
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研究论文 | 这项研究使用单细胞转录组学来了解大鼠肝脏的复杂细胞网络 | 该文章揭示了不同大鼠品系之间的肝脏转录组差异 | 没有提及关于样本的长期跟踪研究和功能验证的局限性 | 的本研究旨在解开大鼠肝脏中细胞和分子来源的变异 | 该研究对象为健康的暗黑阿古提和刘易斯大鼠品系 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 健康的暗黑阿古提和刘易斯大鼠品系的肝脏样本 |
| 192 | 2024-08-07 |
Late fetal hematopoietic failure results from ZBTB11 deficiency despite abundant HSC specification
2023-11-14, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022009580
PMID:37567157
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研究论文 | 本文研究了锌指和宽域、tramtrak、bric-a-brac结构域包含11（ZBTB11）转录因子在哺乳动物造血中的作用，发现Zbtb11基因缺失导致胚胎在胚胎日18.5时出现造血失败。 | 首次揭示了ZBTB11在维持造血干细胞和前体细胞成熟能力中的细胞内在需求，以及其在细胞周期调控和增殖中的作用。 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未探讨ZBTB11在人类造血系统中的具体作用。 | 探讨ZBTB11转录因子在哺乳动物造血系统中的作用及其对造血干细胞的影响。 | ZBTB11基因缺失的小鼠造血干细胞（HSCs）及其在胚胎发育中的表现。 | 血液学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Zbtb11基因缺失的小鼠胚胎及对照组 |
| 193 | 2024-08-05 |
Hypoxia-sensitive cells trigger NK cell activation via the KLF4-ASH1L-ICAM-1 axis, contributing to impairment in the rat epididymis
2023-11-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113442
PMID:37952156
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研究论文 | 该研究探讨了缺氧对大鼠附睾细胞的影响及其在不孕症中的作用 | 首次识别了缺氧敏感的附睾细胞，并阐明了通过KLF4-ASH1L-ICAM-1轴激活自然杀伤细胞的机制 | 研究主要在大鼠模型中进行，未必能完全适用于人类 | 探讨缺氧环境对附睾功能和不孕症的影响 | 大鼠附睾细胞在不同氧气条件下的变化 | 数字病理学 | 不孕症 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞数据 | NA |
| 194 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics of human traumatic brain injury reveals activation of endogenous retroviruses in oligodendroglia
2023-11-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113395
PMID:37967557
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研究论文 | 本研究揭示了创伤性脑损伤中寡突胶质细胞内源性逆转录病毒的激活。 | 本研究首次展示了在创伤性脑损伤后寡突胶质细胞在神经炎症中的重要作用和内源性逆转录病毒的转录上调。 | 该研究的限制包括其结果基于急性样本，可能无法完全代表长期的神经反应。 | 本研究旨在探讨创伤性脑损伤后神经炎症反应的启动事件。 | 研究对象为人类脑组织中不同细胞群体的转录组变化。 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 (snRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 人类脑组织样本，具体数量未提及 |
| 195 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics identifies a WNT7A-FZD5 signaling axis that maintains fallopian tube stem cells in patient-derived organoids
2023-11-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113354
PMID:37917586
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研究论文 | 该研究揭示了WNT7A-FZD5信号轴在患者衍生的类器官中维持输卵管干细胞的作用 | 研究首次通过优化的类器官培养条件深入表征了输卵管干细胞及其自我更新的分子要求 | 研究中对输卵管干细胞的知识仍有限，且模型可能无法完全模拟生理状态 | 揭示输卵管干细胞的功能及其在健康和疾病中的作用 | 输卵管干细胞及其在类器官中的表现 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 196 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing-guided fate-mapping toolkit delineates the contribution of yolk sac erythro-myeloid progenitors
2023-11-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113364
PMID:37922312
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了卵黄囊中的红系髓系前体细胞（EMPs）的异质性，并建立了多种命运图谱工具来追踪不同EMP亚群的贡献 | 首次详细描述了卵黄囊EMPs的异质性，并利用单细胞RNA测序技术建立了命运图谱工具来追踪其贡献 | NA | 阐明卵黄囊EMPs在胚胎发育至成年阶段的贡献 | 卵黄囊中的红系髓系前体细胞（EMPs）及其亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个卵黄囊EMP亚群 |
| 197 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics of the ocular anterior segment: a comprehensive review
2023-11, Eye (London, England)
DOI:10.1038/s41433-023-02539-3
PMID:37138096
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综述 | 本文全面回顾了眼前节的单细胞转录组学，探讨了相关技术和应用 | 提供了眼前节相关的单细胞RNA测序数据集的概述，并强调了其在靶向治疗中的重要性 | 技术限制及目前大部分研究集中在视网膜组织上 | 阐明眼组织的细胞和遗传组成，以揭示眼病的病理生理机制 | 主要研究眼前节相关的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 198 | 2024-08-07 |
Brain-to-gut trafficking of alpha-synuclein by CD11c+ cells in a mouse model of Parkinson's disease
2023-Nov-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43224-z
PMID:37981650
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研究论文 | 本文研究了帕金森病小鼠模型中α-突触核蛋白通过CD11c+细胞从大脑到肠道的转运机制 | 首次展示了α-突触核蛋白在小鼠模型中从大脑到回肠的转运，并揭示了这一过程涉及CD11c细胞 | NA | 理解α-突触核蛋白聚集体的传播机制，以开发疾病修饰疗法 | 帕金森病小鼠模型中的α-突触核蛋白转运 | 神经科学 | 帕金森病 | 免疫组织化学，单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 雄性小鼠 |
| 199 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of human epidermis identifies Lunatic fringe as a novel regulator of the stem cell compartment
2023-11-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.09.007
PMID:37832539
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了健康成人表皮数据集，确认了基底层细胞的异质性，并识别出三个非分裂细胞亚群 | 发现Lunatic fringe（LFNG）作为干细胞区室的新调控因子，并展示了其在培养的角质形成细胞中的过表达效应 | NA | 验证体外实验模型的观察结果，并提出可测试的新假设 | 人类表皮细胞及其分子调控机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 健康成人表皮细胞数据集 |
| 200 | 2024-08-07 |
Identification of glioblastoma stem cell-associated lncRNAs using single-cell RNA sequencing datasets
2023-11-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.10.004
PMID:37922916
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据集，识别与胶质母细胞瘤干细胞相关的长非编码RNA（lncRNA） | 首次进行了全面的单细胞分析，以识别胶质母细胞瘤干细胞（GSCs）中高度表达的lncRNA，并揭示了特定lncRNA在GSCs中的功能 | NA | 识别与胶质母细胞瘤干细胞相关的lncRNA，并探讨其在胶质母细胞瘤病理中的作用及作为生物标志物或治疗靶点的潜力 | 胶质母细胞瘤干细胞及其相关的lncRNA | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 包括成人胶质母细胞瘤肿瘤、胶质母细胞瘤类器官、GSC富集的胶质母细胞瘤肿瘤和发育中的人脑样本 |