单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 461 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-03-20 |
Hepatic lipid-associated macrophages mediate the beneficial effects of bariatric surgery against MASH
2023-Nov-02, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3446960/v1
PMID:37961666
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研究论文 | 本文探讨了垂直袖状胃切除术（VSG）通过肝脏脂质相关巨噬细胞（LAMs）改善代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）的机制 | 研究发现VSG通过增加表达TREM2的LAMs的溶酶体活性和抑制炎症来改善MASH，且这一过程与体重减轻无关 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 研究旨在揭示VSG改善MASH的免疫调节机制 | 肥胖和代谢综合征患者 | NA | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH） | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠模型 |
| 2 | 2025-03-11 |
Early clinical outcomes and molecular smooth muscle cell phenotyping using a prophylactic aortic arch replacement strategy in Loeys-Dietz syndrome
2023-11, The Journal of thoracic and cardiovascular surgery
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.jtcvs.2023.07.023
PMID:37500053
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研究论文 | 本研究评估了在Loeys-Dietz综合征患者中预防性主动脉弓置换策略的临床风险和血流动力学后果，并表征了Loeys-Dietz综合征动脉瘤和正常大小下游主动脉的平滑肌细胞表型 | 首次在Loeys-Dietz综合征患者中结合预防性主动脉弓置换和保留瓣膜的主动脉根部置换手术，并通过单细胞RNA测序和四维磁共振成像技术详细分析了平滑肌细胞表型和血流动力学变化 | 样本量较小（Loeys-Dietz综合征患者n=8），且随访时间较短（中位随访时间为2年） | 评估预防性主动脉弓置换策略在Loeys-Dietz综合征中的临床效果和血流动力学影响，并研究平滑肌细胞表型的变化 | Loeys-Dietz综合征患者（n=8）、Marfan综合征患者（n=5）和无主动脉病变的对照组患者（n=5） | 心血管疾病 | Loeys-Dietz综合征 | 四维磁共振成像、单细胞RNA测序 | NA | 影像数据、RNA测序数据 | Loeys-Dietz综合征患者8人，Marfan综合征患者5人，无主动脉病变的对照组5人 |
| 3 | 2025-03-04 |
A framework for defining mesenchymal cell types associated with murine periosteal and endosteal bone
2023-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.17.567528
PMID:38014179
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，定义了与小鼠骨膜和骨内膜相关的间充质细胞类型，并创建了一个小鼠骨相关细胞的图谱 | 首次比较了骨膜细胞与骨内膜和骨小梁细胞的差异，并揭示了11个主要的细胞簇，包括新定义的Osteo-X细胞类型 | 现有数据集包含的成熟成骨细胞和骨细胞数量相对较少，且研究仅限于小鼠模型 | 增加成骨细胞和骨细胞的单细胞RNA测序数据量，比较骨膜细胞与骨内细胞的差异，明确与小鼠骨相关的主要细胞类型 | 小鼠骨膜和骨内膜的间充质细胞 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 超过100,000个间充质细胞 |
| 4 | 2025-02-23 |
Steatosis drives monocyte-derived macrophage accumulation in human metabolic dysfunction-associated fatty liver disease
2023-Nov, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100877
PMID:37869071
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研究论文 | 本文研究了代谢功能障碍相关脂肪肝病（MAFLD）中脂肪变性如何驱动单核细胞来源的巨噬细胞在人类肝脏中的积累 | 揭示了人类MAFLD早期阶段巨噬细胞亚群的异质性，并发现这些变化与小鼠模型中的变化相似，建立了小鼠与人类疾病模型之间的转化联系 | 样本量较小（n=21），且单细胞RNA测序仅在3个样本中进行，可能限制了结果的普遍性 | 探讨MAFLD中肝脏巨噬细胞异质性与肝脏脂肪变性之间的关系 | 人类肝脏组织和小鼠模型 | 数字病理学 | 脂肪肝病 | 流式细胞术、免疫荧光、H&E显微镜、单细胞RNA测序、MRI | NA | 组织样本、图像、RNA测序数据 | 21名参与者的肝脏组织，其中3个样本进行了单细胞RNA测序 |
| 5 | 2025-02-20 |
Integrative single-cell meta-analysis reveals disease-relevant vascular cell states and markers in human atherosclerosis
2023-11-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113380
PMID:37950869
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研究论文 | 本文通过整合22个单细胞RNA测序库的数据，生成了一个包含118,578个细胞的人类动脉粥样硬化综合图谱，揭示了疾病相关的血管细胞状态和标志物 | 首次整合多个单细胞RNA测序数据集，创建了一个全面的人类动脉粥样硬化细胞图谱，并揭示了平滑肌细胞表型在冠状动脉疾病中的关键作用 | 研究依赖于已有的单细胞RNA测序数据，可能受到数据质量和样本选择的限制 | 揭示人类动脉粥样硬化的细胞状态和标志物，以促进心血管疾病的机制和转化研究 | 人类动脉粥样硬化中的血管和免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 118,578个细胞 |
| 6 | 2025-02-19 |
Gut Isolation from Zebrafish Larvae for Single-cell RNA Sequencing
2023-11-10, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/65876
PMID:38009742
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研究论文 | 本文介绍了一种从斑马鱼幼虫中分离肠道细胞的方法，用于单细胞RNA测序分析 | 提出了一种新的斑马鱼幼虫肠道细胞分离方法，适用于单细胞RNA测序 | NA | 研究斑马鱼肠道发育和功能障碍的分子机制 | 斑马鱼幼虫的肠道细胞 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 斑马鱼幼虫的肠道细胞 |
| 7 | 2025-02-12 |
Cellular underpinnings of the selective vulnerability to tauopathic insults in Alzheimer's disease
2023-Nov-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.06.548027
PMID:38076913
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研究论文 | 本文探讨了阿尔茨海默病（AD）中tau病理选择性脆弱性的细胞基础，通过单细胞RNA测序（scRNAseq）数据和转基因小鼠模型，揭示了不同细胞类型对tau病理的脆弱性和抗性 | 首次在全脑水平上探索了细胞类型对tau病理选择性脆弱性的影响，并发现细胞类型分布比区域基因表达更能预测tau病理 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类AD的复杂性 | 揭示阿尔茨海默病中tau病理选择性脆弱性的细胞基础 | 小鼠脑中的神经元和非神经元细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据 | 12种不同的PS19小鼠模型 |
| 8 | 2025-02-01 |
Latent human herpesvirus 6 is reactivated in CAR T cells
2023-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06704-2
PMID:37938768
|
研究论文 | 本文通过大规模病毒基因组挖掘，研究了人类潜在病毒再激活的景观，并证明了HHV-6B可以在人类CD4 T细胞培养中被再激活 | 发现了HHV-6 '超级表达者'这一罕见细胞群体，并证实了其在接受细胞治疗的患者体内存在 | 研究主要基于实验室培养的细胞和临床数据，未涉及大规模临床试验 | 探讨细胞治疗产品中潜在病毒再激活的机制及其对临床的影响 | 人类CD4 T细胞和CAR T细胞 | 基因组学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 研究级异体CAR T细胞和接受细胞治疗的患者 |
| 9 | 2024-08-07 |
The role of T cells and shared genes in psoriasis and inflammatory bowel disease based on single-cell RNA and comprehensive analysis
2023-11, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2023.152754
PMID:37806279
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和综合分析，探讨了银屑病和炎症性肠病中T细胞和共享基因的作用 | 本文通过单细胞RNA分析和免疫浸润分析，发现了在疾病中显著升高的CD4 T和γδ T细胞，并确定了具有优异诊断特性的共享基因 | NA | 研究银屑病和炎症性肠病中T细胞和共享基因的作用及其在疾病机制中的重要性 | 银屑病和炎症性肠病中的T细胞和共享基因 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 10 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptional gene signature analysis identifies IL-17 signaling pathway as the key pathway in sepsis
2023-11, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2023.152763
PMID:38039751
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组基因特征分析，识别出IL-17信号通路在脓毒症中的关键作用 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了IL-17信号通路在脓毒症中的重要作用，并验证了该通路相关基因在脓毒症患者中的上调表达 | 研究仅基于公开数据库的数据，未进行实验验证 | 旨在识别与脓毒症临床严重程度和预后相关的关键通路，为脓毒症的诊断和治疗提供潜在的生物标志物和治疗靶点 | 健康对照人群和脓毒症患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞转录组测序 | t-SNE和UMAP降维分析 | 转录组数据 | 使用了来自脓毒症数据库GSE167363、GSE100159和GSE133822的血液样本数据 |
| 11 | 2025-01-22 |
Proximal immune-epithelial progenitor interactions drive chronic tissue sequelae post COVID-19
2023-Nov-28, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3587418/v1
PMID:38077031
|
研究论文 | 本文研究了COVID-19后急性后遗症（PASC）的长期生理后果，特别是呼吸系统PASC的病理生理机制 | 通过空间转录组学和成像技术，发现了免疫细胞与上皮祖细胞之间的失调近端相互作用，这在呼吸系统PASC中独特存在，而在急性COVID-19或特发性肺纤维化（IPF）中不存在 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证 | 探讨COVID-19后急性后遗症（PASC）的病理生理机制，特别是呼吸系统PASC的驱动因素 | PASC患者的肺功能异常和/或病毒感染介导的肺纤维化 | 病理生理学 | COVID-19后遗症 | 空间转录组学、成像技术 | 小鼠模型 | 转录组数据、图像数据 | 三个独立的PASC患者临床队列 |
| 12 | 2025-01-04 |
Unique activities of two overlapping PAX6 retinal enhancers
2023-11, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202302126
PMID:37643867
|
研究论文 | 本文研究了两个重叠的PAX6视网膜增强子HS5和NRE的精确细胞类型和调控活性 | 通过活体成像和单细胞RNA测序的独特组合，揭示了这些增强子在时空活动上的差异 | 研究仅限于斑马鱼胚胎，未涉及其他模型或人类样本 | 探讨PAX6视网膜增强子的功能差异及其在眼发育中的作用 | 斑马鱼胚胎中的HS5和NRE增强子 | 发育生物学 | NA | 活体成像、单细胞RNA测序 | NA | 图像、RNA测序数据 | 斑马鱼胚胎 |
| 13 | 2024-12-24 |
High-quality single-cell transcriptomics from ovarian histological sections during folliculogenesis
2023-11, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202301929
PMID:37722727
|
研究论文 | 本文开发了一种名为DRaqL的新方法，用于从卵巢组织切片中进行高质量的单细胞RNA测序，揭示了卵泡发生过程中的转录组异质性 | DRaqL方法实现了从酒精固定组织切片中进行高效的单细胞RNA测序，其效率与新鲜分离细胞的测序相当，并能有效进行外显子-外显子连接分析 | NA | 开发一种高效的方法，用于从组织切片中进行高质量的单细胞RNA测序，以研究卵泡发生过程中的转录组异质性 | 小鼠卵巢组织切片中的卵母细胞和颗粒细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 (RNA-seq) | NA | 转录组数据 | 小鼠卵巢组织切片 |
| 14 | 2024-12-24 |
A targeted sequencing extension for transcript genotyping in single-cell transcriptomics
2023-11, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202301971
PMID:37696578
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研究论文 | 本文评估了一种直接的靶向测序方法，作为高吞吐量液滴单细胞RNA测序的扩展，用于转录基因分型 | 本文提出了一种新的靶向测序扩展方法，结合了特定基因座分型与高吞吐量单细胞RNA测序，填补了现有方法的空白 | 本文未详细讨论该方法在不同细胞类型或复杂组织中的适用性 | 研究如何通过靶向测序扩展方法，结合基因型信息与基因表达数据，来研究遗传变异的影响 | 单细胞RNA测序中的转录基因分型 | 基因组学 | NA | 靶向测序 | NA | RNA | 未具体说明样本数量 |
| 15 | 2024-12-24 |
c-JUN is a barrier in hESC to cardiomyocyte transition
2023-11, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202302121
PMID:37604584
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研究论文 | 本文研究了c-JUN在人胚胎干细胞向心肌细胞转化中的作用 | 首次揭示了c-JUN通过调节H3K4me3修饰和染色质可及性来调控心肌细胞命运 | NA | 探讨c-JUN在人心肌细胞分化中的调控作用 | 人胚胎干细胞及其向心肌细胞的分化 | NA | NA | ATAC-seq, ChIP-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 16 | 2024-12-15 |
Transitional cell states sculpt tissue topology during lung regeneration
2023-11-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.10.001
PMID:37922879
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研究论文 | 研究探讨了肺再生过程中过渡细胞状态在组织重塑和重组中的作用 | 发现了SFRP1和RUNX1标记的过渡状态在组织重塑和重组中的关键作用，并揭示了RUNX1是纤维母细胞状态的关键驱动因子 | NA | 揭示肺再生过程中过渡细胞状态的作用及其在组织重塑中的机制 | 肺组织中的过渡细胞状态及其在再生过程中的作用 | 数字病理学 | 肺疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多个损伤模型的样本 |
| 17 | 2024-12-13 |
Single-cell, whole-embryo phenotyping of mammalian developmental disorders
2023-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06548-w
PMID:37968388
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研究论文 | 本文开发了一种基于单细胞RNA测序的全胚胎表型分析平台，用于系统性地表征小鼠遗传模型的发育异常 | 首次将单细胞RNA测序应用于全胚胎表型分析，提供了前所未有的广度和分辨率 | 研究仅限于胚胎发育的特定阶段（胚胎第13.5天），且样本量相对较小 | 建立一种可扩展的平台，用于系统性地表征小鼠遗传模型的发育异常 | 22种突变型和4种野生型小鼠胚胎的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 101个胚胎，包括22种突变型和4种野生型 |
| 18 | 2024-12-11 |
Increased spatial coupling of integrin and collagen IV in the immunoresistant clear cell renal cell carcinoma tumor microenvironment
2023-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.16.567457
PMID:38014063
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研究论文 | 研究探讨了免疫治疗抵抗的透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境中整合素和IV型胶原蛋白的空间耦合增加 | 首次使用细胞分辨率的空间转录组学技术，结合空间基因集富集分析和自相关分析，揭示了免疫治疗暴露的肿瘤微环境中整合素和IV型胶原蛋白的高表达耦合 | 研究样本量较小，仅包括21个患者样本，可能影响结果的普适性 | 探讨免疫治疗抵抗的透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境中分子机制 | 透明细胞肾细胞癌肿瘤及其微环境中的整合素和IV型胶原蛋白 | 数字病理学 | 肾癌 | 空间转录组学、空间分子成像、多重免疫荧光 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | 21个患者样本 |
| 19 | 2024-12-08 |
Single-cell RNA-Seq reveals intracellular microbial diversity within immune cells during SARS-CoV-2 infection and recovery
2023-Nov-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108357
PMID:38026191
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研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序技术揭示了SARS-CoV-2感染和恢复期间免疫细胞内的微生物多样性 | 首次利用单细胞RNA测序技术探索了免疫细胞内微生物的分布及其对宿主细胞的影响 | 需要进一步研究以理解这些微生物在不同生理状态下的细胞特异性丰度的功能意义 | 揭示SARS-CoV-2感染和恢复期间免疫细胞内的微生物多样性及其对宿主细胞的影响 | 健康个体、SARS-CoV-2阳性患者和康复者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及健康个体、SARS-CoV-2阳性患者和康复者的外周血单核细胞样本 |
| 20 | 2024-12-07 |
Flow-induced reprogramming of endothelial cells in atherosclerosis
2023-11, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-023-00883-1
PMID:37225873
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综述 | 本文讨论了动脉粥样硬化中血流诱导的内皮细胞重编程现象及其潜在的致动脉粥样硬化机制 | 提出了血流诱导的内皮细胞重编程（FIRE）作为潜在的致动脉粥样硬化机制 | NA | 探讨血流诱导的内皮细胞重编程机制及其在动脉粥样硬化中的作用 | 内皮细胞在动脉粥样硬化中的重编程机制 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序和染色质可及性分析 | NA | NA | 使用小鼠模型进行研究 |