单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 415 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-07 |
STAligner enables the integration and alignment of multiple spatial transcriptomics datasets
2023-Oct, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-023-00543-x
PMID:38177765
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 162 | 2024-08-05 |
Metformin potentiates nephrotoxicity by promoting NETosis in response to renal ferroptosis
2023-Oct-17, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00595-3
PMID:37848438
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研究论文 | 这篇文章研究了二甲双胍如何通过促进肾脏铁死亡中的中性粒细胞死亡而加剧肾小管损伤。 | 揭示了二甲双胍加重肾脏损伤的全新机制，强调了铁、铁死亡和中性粒细胞死亡在急性肾损伤中的关系 | 尚未探讨二甲双胍对不同年龄段患者的影响 | 探索和阐明二甲双胍对肾功能的影响及其机制 | 小鼠模型，研究实验性急性肾损伤中的二甲双胍作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 生物样本数据 | 涉及多只小鼠 |
| 163 | 2024-08-07 |
Elimination of senescent cells by treatment with Navitoclax/ABT263 reverses whole brain irradiation-induced blood-brain barrier disruption in the mouse brain
2023-10, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-023-00870-x
PMID:37642933
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研究论文 | 本研究测试了全脑照射（WBI）诱导的内皮细胞衰老对血脑屏障（BBB）破坏和微血管稀疏的影响，并通过使用Navitoclax/ABT263消除衰老细胞来逆转这些效应。 | 本研究首次使用Navitoclax/ABT263消除衰老细胞，以逆转全脑照射诱导的血脑屏障破坏和微血管稀疏。 | 研究仅在转基因p16-3MR小鼠模型中进行，结果的普遍性和临床应用尚需进一步验证。 | 测试全脑照射诱导的内皮细胞衰老对血脑屏障破坏和微血管稀疏的影响，并探索消除衰老细胞的治疗方法。 | 转基因p16-3MR小鼠，接受全脑照射治疗。 | NA | NA | 两光子显微镜、成像流式细胞术、免疫标记和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 图像 | 转基因p16-3MR小鼠 |
| 164 | 2024-08-07 |
Hnf4 activates mimetic-cell enhancers to recapitulate gut and liver development within the thymus
2023-10-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230461
PMID:37399024
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研究论文 | 研究通过Hnf4α和Hnf4γ转录因子激活模拟细胞增强子，重现胸腺中的肠道和肝脏发育 | 揭示了Hnf4在胸腺中的基因调控机制，并发现了Hnf4γ在肠道微褶细胞和IgA反应中的作用 | NA | 探讨Hnf4在胸腺中模拟细胞的基因调控机制 | 胸腺中的模拟细胞（mTECs）及其在肠道和肝脏发育中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 165 | 2024-08-05 |
Spatiotemporal molecular dynamics of the developing human thalamus
2023-10-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adf9941
PMID:37824646
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研究论文 | 本研究探讨了人类丘脑发育过程中分子动态的时空特征 | 首次使用单细胞和多重空间转录组技术描绘人类丘脑神经元的分子轨迹 | 尚未深入了解丘脑发育的分子架构 | 阐明人类正在发育的丘脑中细胞命运特征和组织的分子轨迹 | 人类发育中的丘脑神经元及其分子特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞空间转录组 | NA | 转录组数据 | NA |
| 166 | 2024-08-05 |
Multiparity increases the risk of diabetes by impairing the proliferative capacity of pancreatic β cells
2023-10, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-023-01100-2
PMID:37903900
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研究论文 | 本研究评估了多次怀孕对母体产后糖尿病风险的影响 | 揭示了多次怀孕如何通过损害胰腺β细胞的增殖能力来增加糖尿病风险 | 缺乏长期跟踪研究数据以验证结果 | 探讨多次怀孕对母体代谢和胰腺β细胞功能的影响 | 人类和小鼠模型中的多次妊娠对代谢的影响 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 生物样本和血浆数据 | 人类样本未具体说明，小鼠样本涉及多次妊娠组和对照组 |
| 167 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics in neuroscience
2023-10, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-023-01093-y
PMID:37779145
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综述 | 本文总结了空间转录组学工具及其在神经科学中的应用 | 提供了新的工具和方法来解析大脑细胞类型的空间组织及其连接性 | 未提及具体的实验数据或案例研究 | 探讨如何将单细胞RNA测序与空间信息结合以理解大脑功能 | 各种细胞类型及其在大脑中的功能 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 168 | 2024-08-07 |
Distinct mononuclear diploid cardiac subpopulation with minimal cell-cell communications persists in embryonic and adult mammalian heart
2023-Oct, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-023-0987-9
PMID:37294383
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胚胎和成年哺乳动物心脏中的单核二倍体心肌细胞（MNDCMs）的异质性及其在发育过程中的变化 | 揭示了一种新的非增殖性MNDCM亚群，该亚群具有最小的细胞间通讯，并强调了微环境对心肌细胞成熟过程中命运的重要性 | NA | 阐明单核二倍体心肌细胞的异质性及其在心脏发育过程中的变化 | 胚胎和成年哺乳动物心脏中的单核二倍体心肌细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 12645个心脏细胞 |
| 169 | 2024-08-07 |
Cell Type Catalog of Middle Turbinate Epithelium (Cell Catalog of Turbinate Epithelium)
2023 Oct-Dec, OTO open
IF:1.8Q2
DOI:10.1002/oto2.91
PMID:38093720
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术创建了人类中鼻甲黏膜的首个单细胞转录组目录 | 首次为中鼻甲黏膜创建了单细胞转录组目录 | NA | 揭示健康中鼻甲上皮的细胞层级基因表达谱，为鼻窦疾病的分子发病机制和靶向治疗研究奠定基础 | 中鼻甲黏膜的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自一名健康志愿者的中鼻甲头部样本 |
| 170 | 2024-08-07 |
Recent insights into the pathogenesis and therapeutic targets of chronic liver diseases
2023-Oct, eGastroenterology
DOI:10.1136/egastro-2023-100020
PMID:38074919
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综述 | 本文综述了慢性肝病的发病机制和治疗靶点，特别是酒精相关性肝病（ALD）、非酒精性脂肪肝病（NAFLD）和肝癌的研究进展 | 讨论了非编码RNA、自噬、肝外信号传导、巨噬细胞等在肝病中的作用，并探讨了单细胞RNA测序在肝病研究中的应用 | NA | 深入了解慢性肝病的发病机制和寻找有效的治疗靶点 | 酒精相关性肝病（ALD）、非酒精性脂肪肝病（NAFLD）和肝癌 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 171 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics illuminates regulatory steps driving anterior-posterior patterning of Drosophila embryonic mesoderm
2023-10-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113289
PMID:37858470
|
研究论文 | 本研究应用单细胞技术和遗传分析探讨果蝇胚胎中胚层形态发生的动态转录变化 | 揭示了转录状态的空间调控时间过渡，以及ecdysone信号在胚层的上皮-间质转变中的早期作用 | 未提及具体样本数量的限制 | 研究果蝇胚胎发育过程中转录程序如何驱动前后轴模式的调控步骤 | 果蝇胚胎中的细胞谱系和转录状态 | 生物学 | NA | 单细胞转录组技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 172 | 2024-08-05 |
Exosome and lipid metabolism-related genes in pancreatic adenocarcinoma: a prognosis analysis
2023-10-18, Aging
DOI:10.18632/aging.205130
PMID:37857015
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研究论文 | 本研究旨在探讨外泌体和脂质代谢相关基因在胰腺腺癌中的诊断和预后的作用 | 创新点在于构建了基于EALMRGs的预后模型，并验证其在多种癌症中的预后价值 | 研究的样本来源主要依赖于TCGA和GEO数据库，可能存在样本偏倚 | 研究胰腺腺癌中外泌体和脂质代谢相关基因的mRNA水平与疾病的诊断和预后的关系 | 胰腺腺癌及其他类型的癌症患者的基因表达数据 | 数字病理学 | 胰腺癌 | LASSO回归 | COX回归分析 | 基因表达数据 | NA |
| 173 | 2024-08-07 |
S100P as a potential biomarker for immunosuppressive microenvironment in pancreatic cancer: a bioinformatics analysis and in vitro study
2023-Oct-18, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-11490-1
PMID:37853345
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研究论文 | 本研究探讨了S100P蛋白在胰腺癌肿瘤微环境中的作用及其作为免疫抑制微环境标志物的潜力 | 发现S100P与免疫细胞浸润呈负相关，特别是CD8+ T细胞，并且与免疫治疗相关基因表达水平和肿瘤突变负荷有显著关联 | NA | 研究S100P在胰腺癌肿瘤微环境中的作用及其作为免疫抑制微环境标志物的潜力 | S100P蛋白在胰腺癌中的表达及其对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA-Seq, 微阵列, scRNA-Seq, DNA甲基化分析, 逆转录PCR, 免疫组化 | NA | RNA序列, 微阵列数据, 单细胞RNA序列, DNA甲基化数据, 组织样本 | 五个胰腺癌细胞系和60个胰腺癌组织样本 |
| 174 | 2024-08-05 |
Identification of novel therapeutic target and prognostic biomarker in matrix metalloproteinase gene family in pancreatic cancer
2023-10-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-44506-8
PMID:37821678
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研究论文 | 本文探讨了基质金属蛋白酶基因家族在胰腺癌中的新治疗靶点和预后生物标志物 | 本研究发现MMP28在胰腺导管腺癌中的表达与患者预后及临床特征密切相关，提出了其作为潜在生物标志物的可能性 | 本研究未探讨MMP28与免疫细胞浸润之间的相关性 | 探究基质金属蛋白酶在胰腺导管腺癌中的表达模式及其预后和免疫学价值 | 主要研究对象为与胰腺导管腺癌相关的基质金属蛋白酶基因 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 实时定量PCR | NA | 基因表达数据 | 研究涉及多个胰腺癌细胞系和正常胰腺细胞的样本 |
| 175 | 2024-08-05 |
Identifying Subpopulations of Cells in Single-Cell Transcriptomic Data: A Bayesian Mixture Modeling Approach to Zero Inflation of Counts
2023-10, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2022.0273
PMID:37871291
|
研究论文 | 本文开发了一种新的贝叶斯混合模型，用于在单细胞转录组数据中识别细胞亚群。 | 提出了一种新的Dirichlet过程混合模型，结合细胞水平的混合和转录本水平的零膨胀负二项混合模型，以更好地处理scRNA-Seq数据中的计数膨胀现象。 | 本文未提及可能存在的具体限制。 | 研究的目的是通过建模基因表达来识别单细胞数据中的细胞亚群。 | 研究对象是来自小鼠皮层和海马体的多个细胞类型的scRNA-Seq计数数据。 | 数字病理学 | NA | scRNA-Seq | Dirichlet过程混合模型 | 计数数据 | 来自小鼠皮层和海马体的多个细胞类型的公开可用scRNA-Seq计数数据 |
| 176 | 2024-08-07 |
Single-cell mapping reveals several immune subsets associated with liver metastasis of pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-Oct-13, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2023.07.010
PMID:37633269
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了胰腺导管腺癌肝转移相关的免疫细胞亚群 | 首次通过高维单细胞分析揭示了胰腺导管腺癌微环境中与肝转移相关的免疫细胞变化 | 研究样本量较小，且仅限于特定阶段的病人样本 | 识别胰腺导管腺癌肿瘤微环境中与转移相关的免疫细胞组成，以开发新的治疗策略 | 胰腺导管腺癌患者的肿瘤组织、血液和淋巴结样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 26个样本来自11名患者 |
| 177 | 2024-08-05 |
Pan-cancer analysis of the oncogenic effects of G-protein-coupled receptor kinase-interacting protein-1 and validation on liver hepatocellular carcinoma
2023-Oct, Advances in clinical and experimental medicine : official organ Wroclaw Medical University
IF:2.1Q3
DOI:10.17219/acem/161157
PMID:36994687
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研究论文 | 该文章探讨了G-蛋白偶联受体激酶相互作用蛋白-1（GIT1）在泛癌症及肝细胞癌中的肿瘤促进作用 | 该研究首次系统性揭示了GIT1在多种人类癌症中的肿瘤促进机制 | 本研究缺乏临床试验的数据来验证GIT1作为生物标志物的实用性 | 阐明GIT1在泛癌症及肝细胞癌中的分子机制 | 研究对象为人类的多种类型癌症，包括肝细胞癌 | 数字病理学 | 肝癌 | 生物信息学方法 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 178 | 2024-08-05 |
Spatially Resolved Multi-Omics Single-Cell Analyses Inform Mechanisms of Immune Dysfunction in Pancreatic Cancer
2023-10, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.05.036
PMID:37263303
|
研究论文 | 本文揭示了胰腺癌中免疫微环境的详细视图 | 采用空间分辨的多组学单细胞方法，首次详细描绘了胰腺癌中的免疫景观 | 研究主要集中于治疗未干预的PDAC肿瘤，可能不适用于已有治疗的情况 | 深入了解胰腺癌中的免疫微环境，以指导免疫疗法的研究 | 胰腺导管腺癌（PDAC）和与之匹配的正常胰腺组织以及循环系统中的免疫成分 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，多重免疫组化，质谱细胞分析 | NA | 免疫表型数据 | 治疗未干预的PDAC肿瘤及其相邻正常胰腺组织的样本 |
| 179 | 2024-08-07 |
Mature tertiary lymphoid structures are key niches of tumour-specific immune responses in pancreatic ductal adenocarcinomas
2023-10, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2022-328697
PMID:37230755
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研究论文 | 本文探讨了胰腺导管腺癌（PDAC）中三级淋巴结构（TLSs）对局部抗肿瘤免疫的作用 | 发现PDAC中成熟TLSs支持T细胞活性和肿瘤特异性T细胞的富集，以及肿瘤特异性T细胞通过产生CXCL13作为TLS组织者 | NA | 更好地理解胰腺导管腺癌的免疫微环境 | 胰腺导管腺癌中的T细胞和B细胞及其在三级淋巴结构中的功能状态和空间组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、多色免疫荧光 | NA | RNA | 涉及八种癌症类型的肿瘤浸润T细胞数据以及PDAC患者的批量RNA-seq数据 |
| 180 | 2024-08-07 |
LncRNAs associated with vascular mimicry establish a novel molecular subtype and prognostic model for pancreatic cancer
2023-Oct, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05015-3
PMID:37400573
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研究论文 | 本研究通过差异分析和Spearman相关性分析，从文献中收集的血管拟态相关基因中识别出胰腺癌中的关键长非编码RNA（lncRNA）特征，并利用非负矩阵分解（NMF）算法确定最佳聚类，比较了不同聚类间的临床病理特征和预后差异。 | 本研究首次基于血管拟态相关lncRNA特征开发了一种新的三聚类分子亚型，并构建了基于这些特征的新型预后风险模型。 | NA | 探索血管拟态在胰腺癌中的作用，并开发新的分子亚型和预后模型。 | 胰腺癌中的血管拟态相关lncRNA特征及其在肿瘤微环境中的作用。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 非负矩阵分解（NMF） | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |