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当前共找到 413 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-07 |
Matrisome gene-based subclassification of patients with liver fibrosis identifies clinical and molecular heterogeneities
2023-10-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000423
PMID:37098756
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研究论文 | 本文通过分析肝纤维化患者的转录组数据，识别并验证了与肝纤维化相关的基质基因（LFMGs），并探讨了这些基因在临床和生物学上的相关性 | 本文首次识别了与病因无关的肝纤维化特异性基质基因（LFMGs），并揭示了这些基因在肝纤维化进展和逆转中的表达模式和细胞景观 | NA | 旨在揭示与病因无关的基质基因，这些基因在临床上与肝纤维化相关 | 肝纤维化患者的转录组数据和临床特征 | 数字病理学 | 肝纤维化 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 35个肝纤维化特异性基质基因（LFMGs） | NA | NA | NA | NA |
| 162 | 2024-08-07 |
Characterization of the Limbal Epithelial Stem Cell Niche
2023-10-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.64.13.48
PMID:37906057
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研究论文 | 本文研究了角膜缘上皮干细胞微环境的主要成分，特别是透明质酸（HA）及其复合物在维持干细胞状态中的作用 | 首次详细描述了透明质酸/重链复合物在角膜缘上皮干细胞微环境中的存在及其表达情况 | 研究主要基于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 鉴定角膜缘上皮干细胞微环境的关键成分，特别是透明质酸特异性微环境的组成部分 | 角膜和角膜缘边缘的mRNA提取物 | NA | NA | 单细胞RNA测序、实时PCR、Western blotting、免疫组织化学 | NA | mRNA | 小鼠和人类的角膜样本 | NA | NA | NA | NA |
| 163 | 2024-08-07 |
Correction: iDESC: identifying differential expression in single-cell RNA sequencing data with multiple subjects
2023-Oct-19, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05523-6
PMID:37858060
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 164 | 2024-08-07 |
Integrated genomic and single-cell transcriptomic analyses reveal clonal evolution and immune signature in donor cell leukemia after haploidentical allogeneic hematopoietic stem cell transplantation
2023-10, Leukemia & lymphoma
IF:2.2Q3
DOI:10.1080/10428194.2023.2232493
PMID:37424322
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研究论文 | 本文报道了一例罕见的在同种异体造血干细胞移植后发生的供者细胞白血病病例，通过全基因组测序和单细胞RNA测序揭示了克隆进化和免疫特征。 | 首次通过全基因组测序和单细胞RNA测序技术，揭示了供者细胞白血病中的克隆进化和免疫特征，为理解其发病机制提供了新的视角。 | 研究基于单一病例，其普遍性和可重复性有待进一步验证。 | 探讨同种异体造血干细胞移植后供者细胞白血病的发病机制。 | 供者细胞白血病中的克隆进化和免疫特征。 | 数字病理学 | 白血病 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 单一病例 | NA | NA | NA | NA |
| 165 | 2024-08-07 |
AP-1/c-Fos supports SIV and HIV-1 latency in CD4 T cells infected in vivo
2023-Oct-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108015
PMID:37860759
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了未治疗的SIV感染猕猴的CD4 T细胞中的病毒RNA，发现Activator protein 1 (AP-1)转录因子在病毒潜伏建立和维持中的作用，并提出其作为治疗HIV-1潜伏库的潜在靶点。 | 首次揭示了AP-1在HIV-1和SIV潜伏中的作用，并提出其作为治疗靶点的可能性。 | 文章未详细讨论实验的具体限制，如样本量、实验重复性等。 | 阐明宿主细胞基因表达模式如何调控病毒基因表达，并探索治疗HIV-1潜伏库的新策略。 | SIV感染的猕猴CD4 T细胞和HIV-1治疗患者的感染细胞。 | NA | HIV-1感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 166 | 2024-08-07 |
Cross-species analysis of transcriptome emphasizes a critical role of TNF-α in mediating MAP2K7/AKT2 signaling in zearalenone-induced apoptosis
2023-10-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2023.132226
PMID:37549580
|
研究论文 | 本研究通过跨物种转录组分析，探讨了玉米赤霉烯酮（ZEN）诱导的细胞凋亡中TNF-α介导的MAP2K7/AKT2信号通路的关键作用 | 首次综合运用比较转录组分析、单细胞转录组分析和加权基因共表达网络分析（WGCNA），结合体内基因敲除和体外RNA干扰技术，揭示了ZEN诱导的细胞凋亡中TNF-α-MAP2K7/AKT2轴的主要信号通路 | NA | 探究ZEN诱导的细胞凋亡机制，并为因ZEN导致的畜牧业和人类生殖健康损失提供新的潜在治疗靶点 | 猪和鼠的颗粒细胞（pGCs和mGCs） | 数字病理学 | 生殖健康风险 | 比较转录组分析、单细胞转录组分析、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、基因敲除、RNA干扰 | NA | 转录组数据 | 涉及猪和鼠的颗粒细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 167 | 2024-08-04 |
Genetic vulnerability to Crohn's disease reveals a spatially resolved epithelial restitution program
2023-10-25, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg5252
PMID:37878672
|
研究论文 | 本文解剖了肠黏膜愈合反应，通过单细胞分辨率绘制细胞间通信图谱并与空间转录组学结合 | 揭示了与克罗恩病相关的遗传变异如何破坏损伤感知通路，在愈合机制上提供了空间分辨的生物学模型 | 主要使用小鼠模型进行研究，可能与人类的生物学过程存在差异 | 研究肠道组织修复过程中的细胞间通信与信号传导机制 | 研究对象为克罗恩病相关的HGFAC基因变异及其在小鼠模型中的表现 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 空间转录组学，单细胞转录组学 | 器官oid共培养模型 | 细胞数据 | 使用R509H小鼠模型进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 168 | 2024-08-04 |
A comparative atlas of single-cell chromatin accessibility in the human brain
2023-10-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adf7044
PMID:37824643
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研究论文 | 本文探讨了人脑中单细胞的染色质可及性及其对神经精神障碍的影响 | 通过snATAC-seq技术，揭示了107种不同细胞类型及其在基因组中使用的候选顺式调控DNA元素 | 研究仅限于三名成年人的样本，可能影响结果的普遍性 | 研究人脑中细胞身份和功能的调控程序 | 分析来自三名成人的42个脑区的111万个细胞 | 数字病理学 | 神经精神疾病 | snATAC-seq | 深度学习模型 | 细胞数据 | 3名成年人的42个脑区，合计111万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 169 | 2024-08-04 |
Ancestry-specific regulatory and disease architectures are likely due to cell-type-specific gene-by-environment interactions
2023-Oct-21, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.10.20.23297214
PMID:37905038
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA-seq数据，分析了东亚和欧洲血缘个体的基因表达差异，探讨了这些差异对疾病变异的影响 | 首次通过单细胞层面的分析阐明了血缘特异的基因表达和疾病变异之间的相互作用 | 研究仅限于少数血缘背景，需要更多样本来验证结果 | 研究血缘特异性基因与环境交互对疾病变异的影响 | 21名东亚血缘和23名欧洲血缘个体的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 复杂性疾病 | 单细胞RNA-seq | NA | 细胞数据 | 44个个体的172K单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 170 | 2024-08-04 |
Sibling chimerism among microglia in marmosets
2023-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.16.562516
PMID:37904944
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研究论文 | 本研究分析了在绒猴中微胶质细胞的兄弟嵌合现象 | 揭示了绒猴中微胶质细胞的兄弟来源嵌合性是由血液来源细胞引起的，且这种现象在不同脑区之间存在显著变异 | 只分析了特定几种组织和动物，可能限制了结果的普适性 | 研究兄弟嵌合对绒猴中微胶质细胞的影响及其与局部环境的关系 | 绒猴的血液、肝脏、肾脏和多个脑区的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 多只绒猴的多个组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 171 | 2024-08-07 |
Increased epithelial mTORC1 activity in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2023-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.13.562288
PMID:37904989
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研究论文 | 本研究探讨了慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）中上皮细胞mTORC1活性的增加及其在炎症维持中的作用 | 首次揭示了mTORC1在CRSwNP中调控糖酵解程序的作用，并发现上皮细胞表达的细胞因子和伤口愈合相关基因可能是其后续效应 | NA | 旨在通过转录组评估不同分化阶段的上皮细胞，定义上皮细胞维持气道炎症的机制 | 成人慢性鼻窦炎患者的筛窦上皮细胞 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 来自慢性鼻窦炎患者的筛窦上皮细胞被分为3个子集进行分析 | NA | NA | NA | NA |
| 172 | 2024-08-05 |
Single-cell profiling coupled with lineage analysis reveals vagal and sacral neural crest contributions to the developing enteric nervous system
2023-10-25, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.79156
PMID:37877560
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研究论文 | 本研究揭示了迷走和骶神经嵴对发育中的肠神经系统的贡献 | 首次结合单细胞转录组学与特定轴水平的谱系追踪比较了鸡胚中两种神经嵴细胞的贡献 | 研究集中于鸟类胚胎，可能无法直接推导到其他物种 | 研究迷走神经嵴和骶神经嵴在肠神经系统中的贡献 | 鸡胚胎中的迷走和骶神经嵴细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 173 | 2024-08-07 |
CRISPR/Cas9-based depletion of 16S ribosomal RNA improves library complexity of single-cell RNA-sequencing in planarians
2023-Oct-20, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09724-4
PMID:37864134
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研究论文 | 本文研究了使用CRISPR/Cas9技术去除16S核糖体RNA对扁形动物单细胞RNA测序文库复杂性的影响 | 首次证明了物理去除16S核糖体RNA能有效提高单细胞RNA测序文库的复杂性，并优于计算机方法去除 | NA | 探讨物理去除16S核糖体RNA对单细胞RNA测序文库复杂性的影响 | 扁形动物的单细胞RNA测序文库 | 基因组学 | NA | CRISPR/Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 30个单引导RNA | NA | NA | NA | NA |
| 174 | 2024-08-05 |
GoM DE: interpreting structure in sequence count data with differential expression analysis allowing for grades of membership
2023-10-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03067-9
PMID:37858253
|
研究论文 | 本研究提出了一种新的差异表达分析方法，用于从单细胞测序数据集中识别结构 | 引入了允许细胞部分归属多个组的差异表达分析方法，称为GoM DE | 对单个部分的解释仍然是一个挑战 | 旨在改善单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据集中的结构识别和注释 | 单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据集中的细胞 | 数字病理学 | NA | 非负矩阵分解和主题建模 | NA | 序列计数数据 | 多个单细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 175 | 2024-08-07 |
High-dimensional deconstruction of pancreatic cancer identifies tumor microenvironmental and developmental stemness features that predict survival
2023-Oct-19, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-023-00455-z
PMID:37857854
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胰腺导管腺癌（PDAC）的肿瘤微环境（TME），揭示了与患者生存相关的肿瘤微环境和发育干细胞特征 | 首次通过高维基因表达分析，结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，揭示了PDAC中与预后特别差的恶性细胞、促肿瘤的SPP1+巨噬细胞和肌成纤维细胞性癌症相关成纤维细胞相关的肿瘤微环境社区，以及存在于恶性细胞和癌症相关成纤维细胞中的发育干细胞连续体 | NA | 旨在通过高维基因表达分析，揭示胰腺导管腺癌的肿瘤微环境和发育干细胞特征，以改善患者的风险分层和个性化临床决策 | 胰腺导管腺癌（PDAC）的肿瘤微环境和发育干细胞特征 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 25个未经治疗的PDAC诊断时内镜超声引导下细针穿刺（EUS-FNB）样本，6个手术切除样本，以及80个公开可用样本，共计268个批量RNA-seq样本 | NA | NA | NA | NA |
| 176 | 2024-08-05 |
A spatial sequencing atlas of age-induced changes in the lung during influenza infection
2023-10-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-42021-y
PMID:37852965
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研究论文 | 本研究揭示了老年小鼠在流感感染过程中肺部的年龄诱导变化. | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学，识别了与年龄相关的新型纤维化和抗纤维化标记. | 研究仅使用了女性小鼠, 可能限制了结果的普遍适用性. | 研究年龄相关的免疫反应变化如何影响老年人对流感病毒的反应. | 年轻和老年雌性小鼠的肺组织. | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 整体RNA测序 | NA | 组织样本 | 多组小鼠样本, 包括年轻和老年的肺组织 | NA | NA | NA | NA |
| 177 | 2024-08-07 |
Mycobacterium tuberculosis infection drives differential responses in the bone marrow hematopoietic stem and progenitor cells
2023-10-17, Infection and immunity
IF:2.9Q2
DOI:10.1128/iai.00201-23
PMID:37754680
|
研究论文 | 研究了结核分枝杆菌感染对骨髓造血干细胞和祖细胞的不同反应 | 首次揭示了耐药突变对结核分枝杆菌感染后造血系统反应的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨结核分枝杆菌感染对造血干细胞和祖细胞的影响 | 骨髓中的造血干细胞和祖细胞 | NA | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型中的造血干细胞和祖细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 178 | 2024-08-07 |
The mycosis fungoides cutaneous microenvironment shapes dysfunctional cell trafficking, antitumor immunity, matrix interactions, and angiogenesis
2023-10-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.170015
PMID:37669110
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，全面分析了晚期蕈样肉芽肿皮肤肿瘤的肿瘤微环境（TME）中的转录组，揭示了恶性T淋巴细胞与皮肤微环境中的非恶性免疫和基质细胞、细胞因子及其他免疫调节因子的相互作用。 | 研究首次通过单细胞RNA测序技术，详细描绘了蕈样肉芽肿皮肤肿瘤微环境中的细胞类型组成、细胞功能及细胞间的相互作用，这些发现与健康皮肤及良性皮肤病有显著差异。 | 研究主要集中在晚期蕈样肉芽肿的皮肤肿瘤微环境，可能不适用于疾病早期或其他阶段的分析。 | 探索蕈样肉芽肿中恶性T淋巴细胞与皮肤肿瘤微环境之间的相互作用，并识别具有治疗潜力的候选分子。 | 蕈样肉芽肿的皮肤肿瘤微环境及其中的免疫和基质细胞。 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个晚期蕈样肉芽肿患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 179 | 2024-08-07 |
Single-cell allele-specific expression analysis reveals dynamic and cell-type-specific regulatory effects
2023-10-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-42016-9
PMID:37813843
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研究论文 | 本文介绍了DAESC方法，用于分析单细胞RNA测序数据中的差异等位特异性表达，并通过模拟和实际数据验证了其统计行为。 | DAESC方法能够处理来自同一个体的细胞间的非独立性，并整合隐式单体型分相，为单细胞等位特异性表达分析提供了一种强大的工具。 | NA | 研究单细胞水平上的差异等位特异性表达，揭示基因表达调控的动态和细胞类型特异性效应。 | 单细胞RNA测序数据中的差异等位特异性表达。 | 基因组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 105个诱导多能干细胞（iPSC）系和2型糖尿病患者及对照组的胰腺内分泌细胞。 | NA | NA | NA | NA |
| 180 | 2024-08-04 |
Lineage commitment of dermal fibroblast progenitors is controlled by Kdm6b-mediated chromatin demethylation
2023-10-04, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2023113880
PMID:37602956
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研究论文 | 本研究阐明了真皮成纤维细胞前体的分化机制 | 首次揭示了Kdm6b介导的染色质去甲基化在真皮成纤维细胞前体分化中的作用 | 尚未探讨其他潜在的表观遗传机制对DFP分化的影响 | 定义真皮成纤维细胞前体状态及其分化潜力的调控机制 | 真皮成纤维细胞前体及其分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq, ChIP-seq, 同种异体移植 | 小鼠 | 基因表达数据 | 多个小鼠样本，具体数量未提及 | NA | NA | NA | NA |