单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 413 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-07 |
A Drosophila glial cell atlas reveals a mismatch between transcriptional and morphological diversity
2023-Oct, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002328
PMID:37862379
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研究论文 | 本文通过分析果蝇中枢神经系统中胶质细胞的单细胞RNA测序数据，探讨了胶质细胞形态与转录特征之间的关系 | 发现了新的形态学和转录学上独特的表面胶质细胞群体，并揭示了胶质细胞在形态学上的多样性超过转录学上的多样性 | 许多胶质细胞的形态学类别无法通过转录学区分，且胚胎和成年星形胶质细胞在转录学上相似 | 研究胶质细胞形态与转录特征之间的关系 | 果蝇中枢神经系统中的胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包含胚胎腹部神经索和成年视叶两个不同发育阶段的组织 |
| 162 | 2024-08-07 |
S100a9 Protects Against the Effects of Repeated Social Defeat Stress
2023-Oct, Biological psychiatry global open science
DOI:10.1016/j.bpsgos.2022.12.002
PMID:37881565
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研究论文 | 本研究探讨了S100a9在重复社交挫败应激（RSDS）模型中对炎症和氧化还原状态的影响 | 发现缺失钙卫蛋白显著增强了T淋巴细胞的代谢需求，表明该蛋白可能在线粒体调控中发挥未被描述的作用 | 研究仅限于小鼠模型，未来需在人类中验证这些发现 | 探究心理创伤后炎症和氧化还原状态的机制 | S100a9基因和钙卫蛋白在心理创伤后的作用 | NA | 创伤后应激障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 186只小鼠（93只对照，93只RSDS） |
| 163 | 2024-08-07 |
Virally encoded interleukin-6 facilitates KSHV replication in monocytes and induction of dysfunctional macrophages
2023-Oct, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011703
PMID:37883374
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研究论文 | 本研究探讨了卡波西肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）通过其编码的病毒性白细胞介素-6（vIL-6）在单核细胞中促进病毒复制和诱导功能失调的巨噬细胞的机制 | 首次展示了vIL-6在KSHV感染单核细胞中的关键作用，以及其如何通过诱导功能失调的巨噬细胞来维持病毒池 | NA | 揭示KSHV如何通过vIL-6增加感染细胞数量，为治疗KSHV相关疾病提供关键机制 | KSHV感染的单核细胞及其向巨噬细胞的分化 | NA | 卡波西肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 164 | 2024-08-07 |
Identification of Cell Type-Specific Effects of DNMT3A Mutations on Relapse in Acute Myeloid Leukemia
2023-Oct-31, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2023.0093
PMID:37853686
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了急性髓系白血病（AML）不同阶段（诊断、完全缓解和复发）的骨髓单个核细胞，以探索DNMT3A突变在细胞类型特异性效应及其对AML复发的影响 | 本研究通过改进R882突变的靶向单细胞RNA测序检测，发现了从完全缓解到复发期间主要残留的突变细胞类型，并揭示了这些细胞与AML和白血病细胞相关的基因特征 | NA | 探索DNMT3A突变在急性髓系白血病中的细胞类型特异性效应及其对复发的影响 | 急性髓系白血病患者的骨髓单个核细胞 | 数字病理学 | 血液病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自同一患者在不同AML阶段的骨髓单个核细胞 |
| 165 | 2024-08-05 |
DNA-GPS: A theoretical framework for optics-free spatial genomics and synthesis of current methods
2023-10-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2023.08.005
PMID:37751737
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研究论文 | 本文提出了一种名为DNA-GPS的理论框架，用于无光学的空间基因组学 | 提出DNA-GPS这一新框架，结合数学制图和位置索引的思路，实现了大规模的无光学空间基因组学 | 讨论了当前空间基因组学技术在分辨率和规模上的权衡及其局限性 | 旨在为大规模无光学空间基因组学提供理论基础 | 对现有空间基因组学技术进行分类并进行分析 | 数字病理学 | NA | NA | 数学制图 | 分子特征数据 | NA |
| 166 | 2024-08-07 |
Landscape of mast cell populations across organs in mice and humans
2023-10-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230570
PMID:37462672
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research paper | 本文通过结合全组织成像和单细胞RNA测序数据，对小鼠和人类在稳态下的MCs进行了跨器官分析 | 首次在全器官水平上分析了小鼠和人类的MCs亚型，并揭示了不同亚型的转录组核心特征 | NA | 研究小鼠和人类不同器官中肥大细胞（MCs）的分布和特征 | 小鼠和人类的肥大细胞（MCs）及其亚型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠和人类的多个器官 |
| 167 | 2024-08-07 |
miR-126 identifies a quiescent and chemo-resistant human B-ALL cell subset that correlates with minimal residual disease
2023-10, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-023-02009-5
PMID:37640845
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研究论文 | 研究探讨了微小RNA-126（miR-126）在B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）中的作用，发现miR-126高表达的细胞亚群具有化疗抵抗和静止状态的特征，与最小残留病相关。 | 首次揭示了miR-126在B-ALL中的作用，及其与化疗抵抗和疾病持续的关系。 | 研究主要基于患者来源的异种移植模型，可能与临床实际情况存在差异。 | 探究miR-126在B-ALL中的作用及其与化疗抵抗和疾病持续的关系。 | B细胞急性淋巴细胞白血病细胞及其亚群。 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 8/9个患者来源的异种移植模型，多个成人和儿童B-ALL队列。 |
| 168 | 2024-08-05 |
Integrated Machine Learning and Bioinformatic Analyses Constructed a Network Between Mitochondrial Dysfunction and Immune Microenvironment of Periodontitis
2023-Oct, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-023-01851-0
PMID:37311930
|
研究论文 | 这项研究揭示了线粒体功能障碍与牙周炎免疫微环境之间的相互作用 | 首次通过集成机器学习和生物信息学分析建立了线粒体功能障碍与牙周炎免疫微环境之间的网络 | 研究依赖公共数据库，可能受到数据质量和选择的限制 | 揭示线粒体功能障碍与牙周炎免疫微环境的交互作用 | 重点研究牙周炎患者中的线粒体功能障碍与免疫细胞浸润 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞测序，集成机器学习算法，人工神经网络 | 人工神经网络 | 公共数据，单细胞测序数据 | NA |
| 169 | 2024-08-07 |
Multimodal single-cell datasets characterize antigen-specific CD8+ T cells across SARS-CoV-2 vaccination and infection
2023-Oct, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01608-9
PMID:37735591
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研究论文 | 本研究利用多模态测序技术对mRNA疫苗BNT162b2接种前后循环人白细胞进行纵向分析，以表征和量化T细胞反应 | 本研究定义了CD8 T细胞的转录组、可及染色质景观和免疫表型，并识别了每种模态中的独特生物标志物 | NA | 研究SARS-CoV-2感染或疫苗接种后抗原特异性CD8+ T细胞的特征 | SARS-CoV-2疫苗接种和感染后的抗原特异性CD8+ T细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 多模态测序技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 接种mRNA疫苗BNT162b2前后收集的循环人白细胞样本 |
| 170 | 2024-08-05 |
Single-cell profiling reveals unique features of diabetogenic T cells in anti-PD-1-induced type 1 diabetes mice
2023-10-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221920
PMID:37432393
|
研究论文 | 该文章探讨了抗PD-1诱导的1型糖尿病小鼠中糖尿病T细胞的独特特征 | 首次比较了抗PD-1诱导的1型糖尿病与自发性1型糖尿病之间的差异 | 研究结果主要基于小鼠模型，可能无法完全转化到人类 | 了解抗PD-1治疗引发的免疫相关不良事件的特征 | 使用非肥胖型糖尿病小鼠的胰腺、胰腺引流淋巴结和血液中的T细胞 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序和TCR测序 | NA | 细胞 | 使用了NOD小鼠的多种样本，包括来自胰腺和血液的T细胞 |
| 171 | 2024-08-05 |
Integrating spatial transcriptomics data across different conditions, technologies and developmental stages
2023-Oct, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-023-00528-w
PMID:38177758
|
研究论文 | 本文介绍了一种称为STAligner的图注意神经网络，用于整合和对齐空间转录组数据集 | 创新点在于STAligner能够实现空间意识的数据整合和下游比较分析 | 本文未提及特定的局限性 | 研究不同条件、技术和发育阶段下的空间转录组数据整合 | 研究对象包括人类皮层切片、小鼠嗅球切片、小鼠海马组织切片以及小鼠器官发生的时空图集 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | 图注意神经网络 | 切片数据 | 涉及人类和小鼠的多个样本切片 |
| 172 | 2024-08-07 |
STAligner enables the integration and alignment of multiple spatial transcriptomics datasets
2023-Oct, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-023-00543-x
PMID:38177765
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 173 | 2024-08-05 |
Metformin potentiates nephrotoxicity by promoting NETosis in response to renal ferroptosis
2023-Oct-17, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00595-3
PMID:37848438
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研究论文 | 这篇文章研究了二甲双胍如何通过促进肾脏铁死亡中的中性粒细胞死亡而加剧肾小管损伤。 | 揭示了二甲双胍加重肾脏损伤的全新机制，强调了铁、铁死亡和中性粒细胞死亡在急性肾损伤中的关系 | 尚未探讨二甲双胍对不同年龄段患者的影响 | 探索和阐明二甲双胍对肾功能的影响及其机制 | 小鼠模型，研究实验性急性肾损伤中的二甲双胍作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 生物样本数据 | 涉及多只小鼠 |
| 174 | 2024-08-07 |
Elimination of senescent cells by treatment with Navitoclax/ABT263 reverses whole brain irradiation-induced blood-brain barrier disruption in the mouse brain
2023-10, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-023-00870-x
PMID:37642933
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研究论文 | 本研究测试了全脑照射（WBI）诱导的内皮细胞衰老对血脑屏障（BBB）破坏和微血管稀疏的影响，并通过使用Navitoclax/ABT263消除衰老细胞来逆转这些效应。 | 本研究首次使用Navitoclax/ABT263消除衰老细胞，以逆转全脑照射诱导的血脑屏障破坏和微血管稀疏。 | 研究仅在转基因p16-3MR小鼠模型中进行，结果的普遍性和临床应用尚需进一步验证。 | 测试全脑照射诱导的内皮细胞衰老对血脑屏障破坏和微血管稀疏的影响，并探索消除衰老细胞的治疗方法。 | 转基因p16-3MR小鼠，接受全脑照射治疗。 | NA | NA | 两光子显微镜、成像流式细胞术、免疫标记和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 图像 | 转基因p16-3MR小鼠 |
| 175 | 2024-08-07 |
Hnf4 activates mimetic-cell enhancers to recapitulate gut and liver development within the thymus
2023-10-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230461
PMID:37399024
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研究论文 | 研究通过Hnf4α和Hnf4γ转录因子激活模拟细胞增强子，重现胸腺中的肠道和肝脏发育 | 揭示了Hnf4在胸腺中的基因调控机制，并发现了Hnf4γ在肠道微褶细胞和IgA反应中的作用 | NA | 探讨Hnf4在胸腺中模拟细胞的基因调控机制 | 胸腺中的模拟细胞（mTECs）及其在肠道和肝脏发育中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 176 | 2024-08-05 |
Spatiotemporal molecular dynamics of the developing human thalamus
2023-10-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adf9941
PMID:37824646
|
研究论文 | 本研究探讨了人类丘脑发育过程中分子动态的时空特征 | 首次使用单细胞和多重空间转录组技术描绘人类丘脑神经元的分子轨迹 | 尚未深入了解丘脑发育的分子架构 | 阐明人类正在发育的丘脑中细胞命运特征和组织的分子轨迹 | 人类发育中的丘脑神经元及其分子特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞空间转录组 | NA | 转录组数据 | NA |
| 177 | 2024-08-05 |
Multiparity increases the risk of diabetes by impairing the proliferative capacity of pancreatic β cells
2023-10, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-023-01100-2
PMID:37903900
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研究论文 | 本研究评估了多次怀孕对母体产后糖尿病风险的影响 | 揭示了多次怀孕如何通过损害胰腺β细胞的增殖能力来增加糖尿病风险 | 缺乏长期跟踪研究数据以验证结果 | 探讨多次怀孕对母体代谢和胰腺β细胞功能的影响 | 人类和小鼠模型中的多次妊娠对代谢的影响 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 生物样本和血浆数据 | 人类样本未具体说明，小鼠样本涉及多次妊娠组和对照组 |
| 178 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics in neuroscience
2023-10, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-023-01093-y
PMID:37779145
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综述 | 本文总结了空间转录组学工具及其在神经科学中的应用 | 提供了新的工具和方法来解析大脑细胞类型的空间组织及其连接性 | 未提及具体的实验数据或案例研究 | 探讨如何将单细胞RNA测序与空间信息结合以理解大脑功能 | 各种细胞类型及其在大脑中的功能 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 179 | 2024-08-07 |
Distinct mononuclear diploid cardiac subpopulation with minimal cell-cell communications persists in embryonic and adult mammalian heart
2023-Oct, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-023-0987-9
PMID:37294383
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胚胎和成年哺乳动物心脏中的单核二倍体心肌细胞（MNDCMs）的异质性及其在发育过程中的变化 | 揭示了一种新的非增殖性MNDCM亚群，该亚群具有最小的细胞间通讯，并强调了微环境对心肌细胞成熟过程中命运的重要性 | NA | 阐明单核二倍体心肌细胞的异质性及其在心脏发育过程中的变化 | 胚胎和成年哺乳动物心脏中的单核二倍体心肌细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 12645个心脏细胞 |
| 180 | 2024-08-07 |
Cell Type Catalog of Middle Turbinate Epithelium (Cell Catalog of Turbinate Epithelium)
2023 Oct-Dec, OTO open
IF:1.8Q2
DOI:10.1002/oto2.91
PMID:38093720
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术创建了人类中鼻甲黏膜的首个单细胞转录组目录 | 首次为中鼻甲黏膜创建了单细胞转录组目录 | NA | 揭示健康中鼻甲上皮的细胞层级基因表达谱，为鼻窦疾病的分子发病机制和靶向治疗研究奠定基础 | 中鼻甲黏膜的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自一名健康志愿者的中鼻甲头部样本 |