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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-09-28 |
Hematologic Neoplasms Associated with Down Syndrome: Cellular and Molecular Heterogeneity of the Diseases
2023-Oct-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242015325
PMID:37895004
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研究论文 | 本文探讨了唐氏综合症(DS)相关血液肿瘤的细胞和分子异质性 | 利用单细胞多组学技术,如单细胞RNA测序和数字空间分析,提供了对DS相关血液肿瘤细胞和分子异质性的新见解 | 唐氏综合症易患白血病的分子基础尚未完全理解 | 研究唐氏综合症相关血液肿瘤的分子基础和异质性 | 唐氏综合症相关髓系白血病(ML-DS)和急性淋巴细胞白血病(ALL-DS) | 数字病理学 | 血液肿瘤 | 单细胞RNA测序,数字空间分析 | NA | 单细胞RNA数据,空间数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 122 | 2024-09-28 |
Scaling cross-tissue single-cell annotation models
2023-Oct-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.07.561331
PMID:37873298
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研究论文 | 本文提出了一种名为scTab的自动化、基于特征注意力的细胞类型预测模型,用于单细胞RNA测序数据,并在大规模数据集上进行了训练和验证 | scTab模型能够处理大规模数据集,并利用深度集成进行不确定性量化,同时考虑了标签之间的本体关系,提高了跨组织注释的准确性 | NA | 开发一种能够跨组织进行细胞类型预测的自动化模型,并验证其在单细胞RNA测序数据中的应用 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 表格数据 | 2220万个人类细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 123 | 2024-09-28 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of the Early Postnatal Mouse Lens Epithelium
2023-10-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.64.13.37
PMID:37870847
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研究论文 | 本文使用单细胞RNA测序技术分析了出生后第2天小鼠晶状体上皮的转录异质性,并识别出不同的上皮细胞亚型 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了小鼠晶状体上皮细胞在出生后第2天的转录异质性,并识别出七个亚群,这些亚群反映了上皮细胞在增殖、信号传导和维持中的多样性角色 | NA | 研究小鼠晶状体上皮细胞在出生后第2天的转录异质性,识别不同的上皮细胞亚型,以更好地理解晶状体的生长、分化和稳态 | 出生后第2天的小鼠晶状体上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 出生后第2天的小鼠晶状体样本 | NA | NA | NA | NA |
| 124 | 2024-09-28 |
A Specialized Epithelial Cell Type Regulating Mucosal Immunity and Driving Human Crohn's Disease
2023-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.30.560293
PMID:37873404
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学分析,揭示了一种新型上皮细胞类型LND在克罗恩病中的作用 | 首次发现并描述了一种新型上皮细胞类型LND,其在克罗恩病中的表达显著增加,并与免疫调节和抗菌反应相关 | 研究样本仅限于65名克罗恩病患者和18名非炎症性肠病对照,样本量有限 | 探讨克罗恩病中上皮细胞的异质性及其在疾病发病机制中的作用 | 克罗恩病患者和非炎症性肠病对照的回肠末端和升结肠样本 | NA | 克罗恩病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 170个样本,包括65名克罗恩病患者和18名非炎症性肠病对照 | NA | NA | NA | NA |
| 125 | 2024-09-28 |
Multi-modal transcriptomic analysis unravels enrichment of hybrid epithelial/mesenchymal state and enhanced phenotypic heterogeneity in basal breast cancer
2023-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.30.558960
PMID:37873432
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研究论文 | 本文通过多模态转录组数据分析,揭示了基底乳腺癌中混合上皮/间充质状态的富集和表型异质性的增强 | 本文创新性地整合了批量、单细胞和空间转录组数据,揭示了上皮-间充质转化与管腔-基底可塑性之间的关联,并提出了基于数学模型的机制解释 | 本文主要基于转录组数据和数学模型,未涉及实验验证,可能影响结论的直接应用 | 研究肿瘤内表型异质性的分子起源,并开发新的治疗策略 | 乳腺癌细胞系和原发肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 转录组学 | 数学模型 | 转录组数据 | 涉及乳腺癌细胞系和原发肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 126 | 2024-09-28 |
Single-cell RNA sequencing analysis reveals transcriptional heterogeneity of multiple primary lung cancer
2023-10, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1453
PMID:37846760
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了多发性原发性肺癌的转录异质性 | 首次全面揭示了多发性原发性肺癌的细胞特征和细胞间连接 | 研究样本量有限,仅包括六名患者 | 全面揭示多发性原发性肺癌的细胞特征和细胞间连接 | 多发性原发性肺癌患者的肿瘤和邻近组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 23个样本,来自6名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 127 | 2024-09-27 |
Single-cell RNA sequencing reveals the effects of capsaicin in the treatment of sepsis-induced liver injury
2023-Oct, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.395
PMID:37808269
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示辣椒素在治疗脓毒症诱导的肝损伤中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了辣椒素对脓毒症诱导的肝损伤中不同细胞类型的动态响应 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探讨辣椒素在治疗脓毒症诱导的肝损伤中的作用及其机制 | 正常小鼠、盲肠结扎穿刺诱导的脓毒症模型小鼠和辣椒素处理的小鼠的肝细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 86,830个肝细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 128 | 2024-09-26 |
Multi-omics approach reveals dysregulated genes during hESCs neuronal differentiation exposure to paracetamol
2023-Oct-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107755
PMID:37731623
|
研究论文 | 研究了扑热息痛对人类胚胎干细胞神经分化过程中基因表达和表观遗传变化的影响 | 首次通过多组学方法研究扑热息痛对早期人类神经发育模型的影响,并揭示了扑热息痛诱导的染色质开放性变化与基因表达的关联 | 研究仅限于体外模型,需要进一步验证其在体内的相关性和长期影响 | 探讨扑热息痛对早期人类神经发育的潜在影响及其因果关系 | 人类胚胎干细胞在神经分化过程中暴露于扑热息痛后的基因表达和表观遗传变化 | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序和ATAC测序 | NA | 基因表达数据和表观遗传数据 | 人类胚胎干细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 129 | 2024-09-26 |
Single-cell RNA sequencing of retina revealed novel transcriptional landscape in high myopia and underlying cell-type-specific mechanisms
2023-Oct, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.372
PMID:37746666
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析高度近视和对照组小鼠视网膜,揭示了高度近视进展中各细胞类型的参与机制 | 发现了高度近视视网膜中一种新的杆状细胞亚群,并揭示了高度近视视网膜中神经元和胶质细胞的异常相互作用 | 研究仅限于小鼠模型,结果的临床相关性需要进一步验证 | 揭示高度近视视网膜的转录组景观及其细胞类型特异性机制 | 高度近视和对照组小鼠的视网膜 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 高度近视和对照组小鼠的视网膜样本 | NA | NA | NA | NA |
| 130 | 2024-09-26 |
Colocalization of expression transcripts with COVID-19 outcomes is rare across cell states, cell types and organs
2023-Oct, Human genetics
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s00439-023-02590-w
PMID:37640912
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研究论文 | 研究探讨了基因表达与COVID-19结果共定位的罕见性及其在不同细胞状态、细胞类型和器官中的影响 | 使用孟德尔随机化(MR)方法分析单细胞和批量RNA测序数据,评估基因表达与COVID-19结果的共定位情况 | 大多数基因表达与COVID-19结果的共定位可能是由于连锁不平衡导致的假阳性,共定位在不同细胞类型、细胞刺激和器官中高度可变且有时不一致 | 确定影响COVID-19结果的基因位点,并探讨基因表达与疾病结果共定位的影响因素 | COVID-19严重性和易感性,以及基因表达与疾病结果的共定位 | 基因组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序 | 孟德尔随机化(MR) | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 131 | 2024-09-25 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity and intercellular communication of hepatic stellate cells and macrophages during liver fibrosis
2023-Oct, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.378
PMID:37724132
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了肝星状细胞和巨噬细胞在肝纤维化过程中的异质性和细胞间通讯 | 首次在单细胞水平上揭示了肝星状细胞和巨噬细胞在肝纤维化中的异质性和相互调节网络,并发现了一种促纤维化的Thbs1+巨噬细胞亚群 | 研究仅限于小鼠和人类样本,未涉及其他物种 | 揭示肝纤维化过程中肝星状细胞和巨噬细胞的异质性和细胞间通讯 | 肝星状细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自正常和纤维化小鼠肝脏的非实质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 132 | 2024-09-20 |
Barcoding intracellular reverse transcription enables high-throughput phenotype-coupled T cell receptor analyses
2023-10-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100600
PMID:37776855
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为INCERTS的新方法,通过细胞内逆转录和荧光激活细胞分选技术,实现高通量表型耦合的T细胞受体分析 | 提出了INCERTS方法,结合分子索引和荧光激活细胞分选技术,显著提高了样本处理量和成本效益 | NA | 开发一种高通量、低成本的方法来分析T细胞受体与细胞表型的关联 | T细胞受体序列与细胞表型的关联,特别是从癌症患者中发现的抗原特异性TCRs | 生物信息学 | 癌症 | 荧光激活细胞分选(FACS),单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | T细胞受体序列,单细胞RNA数据 | 从28个患者样本中处理了数百万个外周血单核细胞(PBMC) | NA | NA | NA | NA |
| 133 | 2024-09-19 |
Cancer-associated fibroblasts in early-stage lung adenocarcinoma correlate with tumor aggressiveness
2023-10-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-43296-3
PMID:37848457
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研究论文 | 研究早期肺腺癌中癌症相关成纤维细胞与肿瘤侵袭性的关系 | 首次发现早期肺腺癌中ADH1B癌症相关成纤维细胞的数量与肿瘤侵袭性呈负相关,并发现其与特定的细胞外基质和免疫细胞特征相关 | 研究仅基于早期肺腺癌样本,结果可能不适用于其他阶段或类型的肺癌 | 探讨早期肺腺癌中癌症相关成纤维细胞对肿瘤侵袭性的影响,以改进诊断和治疗策略 | 早期肺腺癌患者的组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 早期肺腺癌患者的组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 134 | 2024-09-19 |
PLA2G2E-mediated lipid metabolism triggers brain-autonomous neural repair after ischemic stroke
2023-10-04, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.06.024
PMID:37490917
|
研究论文 | 研究揭示了PLA2G2E介导的脂质代谢在缺血性脑损伤后触发脑自主神经修复的机制 | 首次发现PLA2G2E通过生成二高-γ-亚麻酸(DGLA)触发脑自主神经修复,并确定15-羟基-二十碳三烯酸(15-HETrE)作为促进功能恢复的关键代谢物 | NA | 阐明脑损伤后脑自主恢复的内在机制 | PLA2G2E、二高-γ-亚麻酸(DGLA)及其代谢物15-羟基-二十碳三烯酸(15-HETrE)在脑损伤后的作用 | NA | 脑卒中 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、表观遗传分析 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 135 | 2024-09-15 |
BK Channels Function in Nematocyst Discharge from Vibration-Sensitive Cnidocyte Supporting Cell Complexes of the Sea Anemone Diadumene lineata
2023-10, The Biological bulletin
DOI:10.1086/730702
PMID:38976849
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研究论文 | 研究了海葵Diadumene lineata中BK通道在振动敏感型刺细胞支持细胞复合体中的功能 | 首次在非两侧对称动物中证明了BK通道的功能 | NA | 验证BK通道在海葵刺细胞释放中的作用 | 海葵Diadumene lineata的刺细胞支持细胞复合体 | 生物学 | NA | RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 136 | 2024-09-13 |
Human-specific genetics: new tools to explore the molecular and cellular basis of human evolution
2023-10, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-022-00568-4
PMID:36737647
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综述 | 本文综述了利用现代和古代人类、大猩猩和其他灵长类动物的基因组测序数据,以及新兴的单细胞测序、基因操作和干细胞培养技术,来探索人类特异性遗传变化及其对人类进化分子和细胞基础的影响 | 本文介绍了利用单细胞测序、基因操作和干细胞培养等新兴技术,结合基因组测序数据,来研究人类特异性遗传变化及其对人类进化分子和细胞基础的影响 | 由于大量低效应大小的遗传变化、细胞类型水平上发育差异的有限描述以及缺乏实验模型,将人类特异性遗传变化与物种差异联系起来一直具有挑战性 | 理解人类特异性遗传变化如何影响人类的形态、认知和代谢变化,从而揭示人类进化的分子和细胞基础 | 现代和古代人类、大猩猩和其他灵长类动物的基因组,以及人类特异性遗传变化对人类进化分子和细胞基础的影响 | 基因组学 | NA | 单细胞测序、基因操作、干细胞培养 | NA | 基因组数据 | 现代和古代人类、大猩猩和其他灵长类动物的基因组样本 | NA | NA | NA | NA |
| 137 | 2024-09-05 |
Mast-Cell Expressed Membrane Protein-1 (MCEMP1) is expressed in classical monocytes and alveolar macrophages in Idiopathic Pulmonary Fibrosis and regulates cell chemotaxis, adhesion, and migration in a TGFβ dependent manner
2023-Oct-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.07.561349
PMID:37873485
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研究论文 | 本文研究了MCEMP1在特发性肺纤维化中的表达及其对细胞趋化、粘附和迁移的调控作用 | 首次揭示了MCEMP1在特发性肺纤维化中通过TGFβ依赖的方式调控单核细胞的趋化、粘附和迁移 | NA | 探究MCEMP1在特发性肺纤维化中的机制作用 | MCEMP1在特发性肺纤维化患者中的表达及其功能 | NA | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、染色质免疫沉淀、邻近连接分析、RNA干扰、慢病毒转导、批量RNA测序、活性RHO下拉实验 | NA | RNA | 来自特发性肺纤维化患者和对照组的PBMC和肺组织样本,以及THP-1细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 138 | 2024-09-04 |
Convergent alterations in the tumor microenvironment of MYC-driven human and murine prostate cancer
2023-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.07.553268
PMID:37905029
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和分子病理学方法,探讨了MYC驱动的肿瘤微环境在人类和小鼠前列腺癌中的变化 | 首次在MYC驱动的肿瘤微环境中,通过单细胞RNA测序技术揭示了人类和小鼠前列腺癌中细胞状态的保守性 | 研究主要依赖于基因工程小鼠模型,可能与人类前列腺癌的实际情况存在差异 | 探究MYC信号激活在前列腺癌肿瘤微环境变化中的作用 | 人类和小鼠的前列腺癌细胞及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | RNA | 涉及人类和小鼠的前列腺癌组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 139 | 2024-08-23 |
Tertiary lymphoid structures correlate with enhancement of antitumor immunity in esophageal squamous cell carcinoma
2023-10, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-023-02396-7
PMID:37604932
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研究论文 | 本文研究了三级淋巴结构(TLSs)与食管鳞状细胞癌(ESCC)预后及肿瘤免疫微环境(TIME)的关系 | 首次探讨了TLSs在ESCC中的预后意义及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 研究样本量有限,且仅限于ESCC组织 | 探讨TLSs在ESCC中的预后意义及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 180例ESCC组织样本及14例ESCC组织的单细胞RNA测序 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 组织样本 | 180例ESCC组织样本及14例ESCC组织 | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2024-08-17 |
Upregulation of exosome secretion from tumor-associated macrophages plays a key role in the suppression of anti-tumor immunity
2023-10-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113224
PMID:37805922
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研究论文 | 本文报道了肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)分泌的外泌体在抑制抗肿瘤免疫中的关键作用 | 首次揭示了TAMs通过增加外泌体分泌来抑制CD8 T细胞的增殖和功能,并提出靶向外泌体作为改善免疫疗法的潜在策略 | NA | 探讨肿瘤相关巨噬细胞分泌的外泌体在抑制抗肿瘤免疫中的作用及机制 | 肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)、外泌体、CD8 T细胞 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及患者黑色素瘤组织和小鼠黑色素瘤模型 | NA | NA | NA | NA |