单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 414 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-05 |
IL-1β inhibition partially negates the beneficial effects of diet-induced lipid lowering
2023-Oct-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.13.562255
PMID:37873280
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研究论文 | 本研究探讨了IL-1β抑制对饮食诱导的脂质降低效果的部分抵消作用 | 研究揭示了IL-1β在饮食诱导的斑块负担减少和斑块稳定性提高中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全适用于人类 | 探讨饮食改变对动脉粥样硬化病变的影响及其机制 | 采用Apoe-/-小鼠作为研究对象，以分析饮食对动脉粥样硬化病变的影响 | 医学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, CyTOF, 免疫染色, 高分辨率共聚焦显微镜z堆叠分析 | NA | 组织样本 | Apoe-/-小鼠，18周喂养西方饮食后切换到低脂饮食 |
| 102 | 2024-08-04 |
TIMP1 is an early biomarker for detection and prognosis of lung cancer
2023-10, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1391
PMID:37759102
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研究论文 | 本文研究了TIMP1作为肺癌早期生物标志物的潜力 | 首次将TIMP1确定为肺癌早期生物标志物，并验证其在临床样本中的有效性 | 研究主要依赖于小鼠模型和已公开的数据，可能需要更大范围的人类临床验证 | 确定TIMP1在肺癌早期检测和预后中的作用 | KrasG12D/+; Lkb1f/f小鼠模型及肺癌患者的血浆样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 免疫组织化学(IHC)、单细胞RNA测序和大规模RNA测序 | 小鼠模型 | 血浆、肿瘤组织 | 包含小鼠模型与临床样本 |
| 103 | 2024-08-04 |
A lamprey neural cell type atlas illuminates the origins of the vertebrate brain
2023-Oct, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-023-02170-1
PMID:37710042
|
研究论文 | 这篇文章建立了盲鳗整个大脑的细胞类型图谱，探讨了脊椎动物大脑的起源 | 通过单细胞RNA-seq和在位测序数据，首次系统描绘了盲鳗大脑的细胞和分子起源 | 研究发现了在进化过程中出现的关键组织和细胞类型，可能限制了对所有脊椎动物特征的认识 | 追踪脊椎动物大脑的细胞和分子起源 | 盲鳗这一无颚类物种的整个大脑 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq和在位测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 104 | 2024-08-05 |
Cancer cell-derived extracellular vesicles drive pre-metastatic niche formation of lymph node via IFNGR1/JAK1/STAT1-activated-PD-L1 expression on FRCs in head and neck cancer
2023-10, Oral oncology
IF:4.0Q2
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研究论文 | 本研究评估了癌细胞来源的细胞外囊泡（CEVs）调节的成纤维网状细胞（FRCs）在淋巴结（LN）前转移生态位形成中的作用 | 发现癌细胞来源的细胞外囊泡通过IFNGR1/JAK1/STAT1通路促进FRCs上PD-L1的表达，进而导致CD8+ T细胞耗竭 | 本研究仅基于有限的样本数量，需进一步验证 | 评估癌细胞来源的细胞外囊泡在前转移生态位形成中的角色 | 来自20例癌症患者的60个新鲜颈部淋巴结中的FRCs | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序、质谱分析、蛋白质印迹法 | NA | 细胞、蛋白质 | 60个颈部淋巴结样本来自20位患者 |
| 105 | 2024-08-07 |
Correction to: Implanted Tissue-Engineered Vascular Graft Cell Isolation with Single-Cell RNA Sequencing Analysis, by Mirhaidari et al. Tissue Engineering Part C: Methods 2023;29(2):72-84; doi: 10.1089/ten.tec.2022.0189
2023-Oct, Tissue engineering. Part C, Methods
DOI:10.1089/ten.tec.2022.0189.correx
PMID:37672627
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 106 | 2024-08-05 |
Endothelial cells are a key target of IFN-g during response to combined PD-1/CTLA-4 ICB treatment in a mouse model of bladder cancer
2023-Oct-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107937
PMID:37810214
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研究论文 | 本研究探讨了在膀胱癌小鼠模型中，内皮细胞如何响应联合PD-1/CTLA-4免疫检查点抑制治疗 | 揭示了内皮细胞中IFN-g信号传导在免疫检查点抑制诱导的抗肿瘤活性中的关键作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，可能限制了对人类疾病的直接应用 | 探索不同细胞类型对联合PD-1/CTLA-4免疫检查点抑制治疗的响应机制 | 侵袭性尿路上皮癌小鼠模型中的肿瘤细胞及内皮细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | scRNA-seq | NA | 表格数据 | 三种条件下的细胞样本：未治疗肿瘤、治疗肿瘤、CD4 T细胞耗竭后治疗的肿瘤 |
| 107 | 2024-08-05 |
Uncovering the Heterogeneity of Cardiac Lin-KIT+ Cells: A scRNA-seq Study on the Identification of Subpopulations
2023-10-08, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxad057
PMID:37539750
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析心脏Lin-KIT+细胞的异质性及其亚群体。 | 该研究揭示并分类了心脏KIT细胞的三种主要亚群体及其独特的代谢适应性。 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类心脏细胞的特性。 | 揭示心脏Lin-KIT+细胞的异质性并识别其亚群体及标记物。 | 成年小鼠心脏来源的细胞群体。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | 基因组数据 | 成年小鼠心脏细胞 |
| 108 | 2024-08-05 |
Combinatorial Immunotherapy with Agonistic CD40 Activates Dendritic Cells to Express IL12 and Overcomes PD-1 Resistance
2023-10-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0699
PMID:37478171
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研究论文 | 本文展示了联合使用CD40激动剂与抗PD-1治疗能够激活树突状细胞以表达IL12，从而克服PD-1抗性 | 该研究提出CD40激活与CSF1R阻断的联合治疗，为克服抗PD-1耐药性提供了一种新策略 | 该研究仅在小鼠模型中进行，临床应用的有效性需进一步验证 | 研究用于克服PD-1抗性的新型免疫治疗策略 | 以抗PD-1耐药的小鼠黑色素瘤模型为研究对象 | 数字病理学 | 癌症 | NA | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多数小鼠 |
| 109 | 2024-08-05 |
Sodium glucose co-transporter 2 inhibition increases epidermal growth factor expression and improves outcomes in patients with type 2 diabetes
2023-10, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.07.007
PMID:37543256
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研究论文 | 本研究探讨了钠-葡萄糖共转运蛋白2抑制剂在2型糖尿病患者中对表皮生长因子表达的影响及其对肾脏结果的改善 | 本研究首次揭示了SGLT2抑制剂能agliflozin对EGF表达的影响及其在肾脏疾病进展中的潜在机制 | 本文的局限性在于使用的样本量及单细胞RNA测序的具体实验条件可能影响结果的普遍性 | 本研究的目的是探讨SGLT2抑制剂对2型糖尿病患者肾脏保护机制中的EGF表达的影响 | 研究对象包括3521名参与CANVAS研究的2型糖尿病患者及10名年轻的2型糖尿病患者的肾组织样本 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 生物样本 | 3521名参与者和20个肾组织样本 |
| 110 | 2024-08-07 |
Stromal STAT5-Mediated Trophic Activity Regulates Hematopoietic Niche Factors
2023-10-08, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxad055
PMID:37465968
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研究论文 | 研究通过STAT5ab敲除小鼠模型，探讨STAT5在骨髓造血微环境中的作用及其对造血干细胞的影响 | 首次揭示了STAT5ab在骨髓微环境中对造血干细胞分化的调控作用，并通过单细胞转录组分析验证了其机制 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人类样本中验证这些发现 | 探讨STAT5在骨髓造血微环境中的作用及其对造血干细胞的影响 | STAT5ab敲除小鼠模型及其对骨髓造血微环境的影响 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | mRNA表达 | 多种Cre转基因小鼠品系 |
| 111 | 2024-08-07 |
Lamin A upregulation reorganizes the genome during rod photoreceptor degeneration
2023-10-25, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-06224-x
PMID:37880237
|
研究论文 | 研究了核纤层在杆状光感受器退化过程中对基因组组织的作用 | 首次展示了在视网膜色素变性模型中，核纤层蛋白A的异常上调与基因组可及性的增加相关，表明异染色质锚定蛋白对基因组可及性有全局影响 | 研究主要集中在杆状光感受器，未涉及其他类型的光感受器或细胞类型 | 探讨核纤层在神经退行性疾病中对基因组组织的影响 | 杆状光感受器及其在视网膜色素变性中的退化过程 | NA | 视网膜色素变性 | scRNA-seq, ATAC-seq | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 未具体说明样本数量 |
| 112 | 2024-08-04 |
A Population of Tumor-Infiltrating CD4+ T Cells Co-Expressing CD38 and CD39 Is Associated with Checkpoint Inhibitor Resistance
2023-10-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-0653
PMID:37505479
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研究论文 | 本研究探讨了一种共表达CD38和CD39的肿瘤浸润CD4+ T细胞人口及其与检查点抑制剂抗性的关系 | 发现了一种新的人群CD4+ T细胞共同表达CD38和CD39，并关联到检查点免疫治疗抗性 | 未详细描述具体的机制或治疗干预措施 | 进一步研究CD38+CD39+ T细胞与转移黑色素瘤患者检查点免疫治疗抗性之间的关系 | 来自转移性黑色素瘤患者的外周血T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA测序和流式细胞术 | NA | RNA数据及免疫荧光成像数据 | 来自转移性黑色素瘤患者的外周血和肿瘤组织样本 |
| 113 | 2024-08-04 |
Friend or foe? The elusive role of hepatic stellate cells in liver cancer
2023-10, Nature reviews. Gastroenterology & hepatology
DOI:10.1038/s41575-023-00821-z
PMID:37550577
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综述 | 本文讨论了肝星形细胞在肝癌中的双重角色 | 揭示了肝星形细胞亚群在肝纤维化和肝癌发展中的不同作用 | NA | 探讨肝星形细胞在肝纤维化及肝癌进展中的作用 | 肝星形细胞及其在肝癌中的不同亚群 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 114 | 2024-08-07 |
Longitudinal scRNA-seq analysis in mouse and human informs optimization of rapid mouse astrocyte differentiation protocols
2023-10, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01424-2
PMID:37697111
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研究论文 | 本研究利用单细胞/单核RNA测序技术分析了超过298,000个细胞和细胞核，以优化小鼠和人类星形胶质细胞的分化协议 | 通过计算方法识别了参与胶质细胞命运指定的候选基因，并利用转录组数据优化了小鼠星形胶质细胞分化协议，缩短了协议长度和复杂性 | NA | 优化小鼠和人类星形胶质细胞的分化协议 | 小鼠胚胎和人类诱导多能干细胞中的星形胶质细胞和少突胶质细胞的分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞/单核RNA测序（scRNA-seq/snRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 超过298,000个细胞和细胞核 |
| 115 | 2024-08-05 |
Tissue morphology influences the temporal program of human brain organoid development
2023-10-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.09.003
PMID:37802039
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研究论文 | 本文研究了组织形态如何影响人脑类器官的发展时间程序 | 创新点在于揭示了组织形态对细胞命运决策的影响，并通过单核RNA测序和空间转录组学分析了这种相互作用 | 研究的局限性在于实验模型的复杂性可能影响结果的推广性 | 研究的目的是探讨组织形态如何影响细胞命运和组织架构的相互作用 | 研究对象为人类脑类器官及其发育过程中的细胞命运变化 | 数字病理 | NA | snRNA-seq 和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 116 | 2024-08-07 |
Matrisome gene-based subclassification of patients with liver fibrosis identifies clinical and molecular heterogeneities
2023-10-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000423
PMID:37098756
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研究论文 | 本文通过分析肝纤维化患者的转录组数据，识别并验证了与肝纤维化相关的基质基因（LFMGs），并探讨了这些基因在临床和生物学上的相关性 | 本文首次识别了与病因无关的肝纤维化特异性基质基因（LFMGs），并揭示了这些基因在肝纤维化进展和逆转中的表达模式和细胞景观 | NA | 旨在揭示与病因无关的基质基因，这些基因在临床上与肝纤维化相关 | 肝纤维化患者的转录组数据和临床特征 | 数字病理学 | 肝纤维化 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 35个肝纤维化特异性基质基因（LFMGs） |
| 117 | 2024-08-07 |
Spatial atlas of the mouse central nervous system at molecular resolution
2023-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06569-5
PMID:37758947
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研究论文 | 本文使用STARmap PLUS技术在单细胞分辨率下绘制了成年小鼠大脑和脊髓的1,022个基因的空间图谱 | 开发了计算流程来分割、聚类和注释分子细胞类型和分子组织区域，并整合了STARmap PLUS测量与单细胞RNA测序图谱，创建了一个转录组范围的空间图谱 | 未提及 | 绘制小鼠中枢神经系统的分子分辨率空间图谱，揭示脑解剖学和功能的分子基础 | 成年小鼠的大脑和脊髓 | 数字病理学 | NA | STARmap PLUS | NA | 基因表达数据 | 1.09百万个高质量细胞 |
| 118 | 2024-08-07 |
HCG18, LEF1AS1 and lncCEACAM21 as biomarkers of disease severity in the peripheral blood mononuclear cells of COVID-19 patients
2023-10-26, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04497-6
PMID:37884975
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和qPCR验证，探索了长非编码RNA（LncRNAs）在COVID-19患者外周血单个核细胞（PBMCs）中的表达模式，并发现HCG18-242、HCG18-244、LEF1-AS1和lncCEACAM21与COVID-19的严重程度和死亡率相关 | 本研究首次发现HCG18-242、HCG18-244、LEF1-AS1和lncCEACAM21作为COVID-19严重程度和死亡率的潜在创新生物标志物 | NA | 探索COVID-19严重程度和死亡率的可靠和准确生物标志物 | COVID-19患者外周血单个核细胞中的长非编码RNA | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序 | NA | RNA | 2906个长非编码RNA在COVID-19患者PBMCs中的表达模式，以及111名住院COVID-19患者的qPCR验证 |
| 119 | 2024-08-07 |
Characterization of the Limbal Epithelial Stem Cell Niche
2023-10-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.64.13.48
PMID:37906057
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研究论文 | 本文研究了角膜缘上皮干细胞微环境的主要成分，特别是透明质酸（HA）及其复合物在维持干细胞状态中的作用 | 首次详细描述了透明质酸/重链复合物在角膜缘上皮干细胞微环境中的存在及其表达情况 | 研究主要基于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 鉴定角膜缘上皮干细胞微环境的关键成分，特别是透明质酸特异性微环境的组成部分 | 角膜和角膜缘边缘的mRNA提取物 | NA | NA | 单细胞RNA测序、实时PCR、Western blotting、免疫组织化学 | NA | mRNA | 小鼠和人类的角膜样本 |
| 120 | 2024-08-07 |
Correction: iDESC: identifying differential expression in single-cell RNA sequencing data with multiple subjects
2023-Oct-19, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05523-6
PMID:37858060
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |