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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-06 |
Glioblastoma initiation, migration, and cell types are regulated by core bHLH transcription factors ASCL1 and OLIG2
2023-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.30.560206
PMID:37873200
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研究论文 | 本研究揭示bHLH转录因子ASCL1和OLIG2在胶质母细胞瘤起始、迁移和细胞类型调控中的核心作用 | 首次证明ASCL1和OLIG2在胶质母细胞瘤中功能冗余地启动肿瘤形成,并通过动态水平和相互结合调控肿瘤细胞类型与迁移程度 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证有限 | 探究ASCL1和OLIG2转录因子在胶质母细胞瘤异质性和细胞层级调控中的作用机制 | 胶质母细胞瘤肿瘤细胞和胶质瘤干细胞 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠胶质母细胞瘤模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 82 | 2025-10-07 |
Impact of Memory T Cells on SARS-COV-2 Vaccine Response in Hematopoietic Stem Cell Transplant
2023-Oct-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.26.564259
PMID:37961434
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研究论文 | 评估造血干细胞移植受者对SARS-CoV-2 mRNA疫苗的免疫反应特征 | 首次在HSCT受者中结合单细胞RNA测序与TCR/BCR测序分析疫苗无应答机制 | 样本量较小(仅42例患者),缺乏长期随访数据 | 探究造血干细胞移植受者对SARS-CoV-2疫苗的免疫应答机制 | 造血干细胞移植受者和健康对照者 | 免疫学 | 传染病 | 单细胞RNA测序,TCR测序,BCR测序,抗体滴度检测 | NA | 单细胞转录组数据,血清学数据 | 42例HSCT受者,5例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 83 | 2025-10-07 |
Machine learning-based metabolism-related genes signature, single-cell RNA sequencing, and experimental validation in hypersensitivity pneumonitis
2023-Oct-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000034940
PMID:37800807
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法识别了过敏性肺炎的代谢相关基因诊断标志物,并验证了其与M2巨噬细胞的关联 | 首次结合机器学习、单细胞RNA测序和实验验证,系统分析了过敏性肺炎中代谢相关基因的诊断价值及其与M2巨噬细胞的关联 | 样本来源仅限于公共数据库和部分实验验证,需要更大样本量进一步验证 | 识别过敏性肺炎的代谢相关基因诊断标志物并研究其与免疫细胞的关系 | 过敏性肺炎患者和健康对照的基因表达数据及外周血样本 | 生物信息学 | 过敏性肺炎 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 流式细胞术, 生物信息学分析 | 机器学习算法 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 来自Gene Expression Omnibus数据库的样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | NA |
| 84 | 2025-10-07 |
Comprehensive single cell aging atlas of mammary tissues reveals shared epigenomic and transcriptomic signatures of aging and cancer
2023-Oct-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.20.563147
PMID:37961129
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研究论文 | 通过单细胞分辨率研究小鼠乳腺组织衰老过程中的转录组和表观基因组变化,揭示衰老与癌症之间的分子联系 | 首次构建了乳腺组织衰老的单细胞图谱,揭示了衰老过程中上皮细胞、基质细胞和免疫细胞的表观遗传和转录组变化,并发现衰老特征与人类乳腺癌的相似性 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;空间转录组数据可能覆盖区域有限 | 探究衰老如何影响乳腺组织的细胞和分子程序,以及这些变化与癌症发生的关系 | 小鼠乳腺组织中的上皮细胞、基质细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,表观基因组分析 | NA | 单细胞转录组数据,表观基因组数据,空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量的小鼠乳腺组织 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 85 | 2025-10-07 |
Spatial heterogeneity of bone marrow endothelial cells unveils a distinct subtype in the epiphysis
2023-10, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-023-01240-7
PMID:37798545
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了骨髓内皮细胞的空间异质性,并在骨骺区发现了一种独特的毛细血管亚型——S型内皮细胞 | 首次在骨骺区鉴定出具有独特表型特征的S型内皮细胞,发现其通过分泌I型胶原蛋白参与骨强度获得,并形成造血干细胞的特殊储存库 | NA | 探索骨髓内皮细胞的异质性及其在骨形成和造血过程中的功能 | 骨髓内皮细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 86 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA-Sequencing in Astrocyte Development, Heterogeneity, and Disease
2023-Oct, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-023-01397-7
PMID:37552355
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综述 | 本文综述了星形胶质细胞的发育、异质性及其在中枢神经系统生理和病理环境中的关键作用,重点关注单细胞测序技术的应用 | 系统整合了单细胞RNA测序技术在揭示星形胶质细胞异质性、发育轨迹和疾病作用方面的最新研究进展 | NA | 探讨星形胶质细胞的发育过程、细胞异质性及其在中枢神经系统疾病中的作用 | 星形胶质细胞 | 单细胞生物学 | 中枢神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 87 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis profiles cellular and molecular alterations in submandibular gland and blood in IgG4-related disease
2023-10, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224363
PMID:37474274
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了IgG4相关疾病中颌下腺和血液的细胞与分子改变 | 发现了三种新型组织驻留免疫细胞亚群,揭示了TOP2A_B细胞和TOP2A_T细胞的分化轨迹,以及ICOS_PD-1_B细胞在B细胞向IgG4+浆细胞分化中的中间状态 | 样本量有限,需要在更大队列中验证发现 | 解析IgG4相关疾病的细胞种群和免疫细胞与非免疫细胞间的相互作用 | IgG4相关疾病患者和匹配对照的颌下腺组织和外周血单个核细胞 | 单细胞生物学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 多重免疫荧光染色 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据, 免疫组库数据, 图像数据 | IgG4相关疾病患者和匹配对照的颌下腺和PBMC样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 88 | 2025-02-04 |
Post-ischemic inactivation of HIF prolyl hydroxylases in endothelium promotes maladaptive kidney repair by inducing glycolysis
2023-Oct-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.03.560700
PMID:37873349
|
研究论文 | 本文研究了缺血性急性肾损伤(AKI)后内皮细胞中氧感应脯氨酰羟化酶(PHD)的作用及其对肾脏修复的影响 | 发现了内皮细胞中PHD1、PHD2和PHD3的联合失活促进不良肾脏修复的机制,并提出了通过抑制MCT4来恢复适应性肾脏修复的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型,人类肾脏样本的研究仍需进一步验证 | 探讨缺血性急性肾损伤后内皮细胞中PHD酶的作用及其对肾脏修复的影响 | 小鼠和人类肾脏内皮细胞 | 生物医学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类肾脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 89 | 2025-10-07 |
IL-21-producing effector Tfh cells promote B cell alloimmunity in lymph nodes and kidney allografts
2023-10-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169793
PMID:37870962
|
研究论文 | 本研究揭示了产生IL-21的效应Tfh细胞在肾移植排斥中通过调控B细胞克隆动态发挥关键作用 | 首次发现并表征了产生IL-21的效应Tfh细胞亚群在肾移植排斥中的双重作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人类患者中验证 | 阐明Tfh细胞在肾移植排斥中的具体亚群、起源和功能机制 | 效应Tfh细胞、B细胞、肾移植模型 | 免疫学 | 肾移植排斥 | 单细胞RNA测序, 单B细胞培养系统 | NA | 基因表达数据, 细胞功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2025-10-07 |
Itaconate-producing neutrophils regulate local and systemic inflammation following trauma
2023-10-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169208
PMID:37707952
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研究论文 | 本研究揭示了创伤后产生衣康酸的中性粒细胞在调节局部和全身炎症中的关键作用 | 首次发现高度成熟的中性粒细胞亚型(而非巨噬细胞)是创伤后衣康酸的主要生产者,并揭示了这些细胞通过骨髓循环调节全身炎症的新机制 | 研究主要关注肌腱损伤模型,在其他类型创伤中的普适性需要进一步验证 | 探究创伤后免疫反应的代谢调控机制及其对修复结局的影响 | 肌腱损伤模型中的免疫细胞,特别是中性粒细胞亚型 | 免疫代谢 | 创伤修复 | 代谢组学,单细胞RNA测序,分子验证 | NA | 代谢组数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,代谢组学 | NA | NA |
| 91 | 2025-10-07 |
Mural cell-derived chemokines provide a protective niche to safeguard vascular macrophages and limit chronic inflammation
2023-10-10, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.08.002
PMID:37652021
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研究论文 | 本研究揭示了血管壁细胞通过分泌趋化因子CCL2和MIF为巨噬细胞提供保护性微环境,维持其稳态功能并限制慢性炎症 | 首次发现血管壁细胞通过分泌特定趋化因子构建巨噬细胞保护性微环境,这一机制在动脉粥样硬化中具有关键保护作用 | 研究主要聚焦于动脉粥样硬化模型,在其他慢性炎症疾病中的普适性需要进一步验证 | 探究维持血管巨噬细胞稳态的分子机制及其在慢性炎症疾病中的作用 | 血管巨噬细胞、血管壁细胞(周细胞和平滑肌细胞) | 细胞生物学 | 动脉粥样硬化 | 活体成像、单细胞转录组测序、共培养实验、基因敲除 | NA | 图像数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 92 | 2025-10-07 |
Elimination of senescent cells by treatment with Navitoclax/ABT263 reverses whole brain irradiation-induced blood-brain barrier disruption in the mouse brain
2023-10, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-023-00870-x
PMID:37642933
|
研究论文 | 本研究通过Navitoclax/ABT263清除衰老细胞,逆转全脑照射导致的小鼠血脑屏障破坏 | 首次证明清除衰老内皮细胞可逆转辐射引起的血脑屏障破坏 | 样本量有限,仅在小鼠模型中进行研究 | 探究全脑照射诱导内皮细胞衰老与血脑屏障破坏的因果关系 | 转基因p16-3MR小鼠 | 神经科学 | 脑转移瘤 | 双光子显微镜、成像流式细胞术、免疫标记、单细胞RNA测序 | 动物模型 | 图像、序列数据 | 转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 93 | 2024-12-21 |
K-Nearest-Neighbors Induced Topological PCA for Single Cell RNA-Sequence Data Analysis
2023-Oct-23, ArXiv
PMID:37961744
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研究论文 | 本文提出了一种基于k近邻持久拉普拉斯技术的拓扑主成分分析方法,用于单细胞RNA测序数据分析 | 本文创新性地结合了持久拉普拉斯技术和L范数正则化,提出了一种新的拓扑主成分分析方法,并通过k近邻持久拉普拉斯技术提高了方法的鲁棒性 | 本文未提及具体的局限性 | 开发一种新的维度降低和特征选择方法,以解决单细胞RNA测序数据中的多尺度和多类别异质性问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 拓扑主成分分析 | 基因表达数据 | 11个不同的单细胞RNA测序基准数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 94 | 2024-12-08 |
Epididymal segment-specific miRNA and mRNA regulatory network at the single cell level
2023-10, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.1080/15384101.2023.2280170
PMID:37982230
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研究论文 | 研究比较了不同附睾段特异性样本之间的miRNA和mRNA表达,并构建了单细胞水平的miRNA和mRNA调控网络 | 首次在单细胞水平上揭示了人类附睾段特异性的miRNA-mRNA调控网络及其上游转录因子和下游通路 | 研究仅基于小鼠样本,且样本量有限 | 揭示人类附睾段特异性的miRNA-mRNA调控网络及其功能 | 附睾不同段的miRNA和mRNA表达及其调控网络 | 基因表达调控 | NA | RNA测序(RNA-seq)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、定量实时PCR(qRT-PCR) | NA | 基因表达数据 | 6只小鼠的附睾组织 | NA | NA | NA | NA |
| 95 | 2024-11-23 |
Single-Cell Integration of BMD GWAS Results Prioritize Candidate Genes Influencing Age-Related Bone Loss
2023-Oct, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/jbm4.10795
PMID:37808401
|
研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序数据整合骨密度全基因组关联研究结果,优先筛选影响年龄相关骨丢失的候选基因 | 通过单细胞RNA测序数据,揭示了候选基因在特定细胞类型中的表达特征,为骨密度维持提供了新的治疗靶点 | 主要基于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 研究年龄相关骨丢失的遗传机制,并筛选潜在的治疗靶点 | 骨密度相关基因及其在不同细胞类型中的表达 | 基因组学 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 老年小鼠的骨髓和骨组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2024-11-18 |
Technical Advances and Applications of Spatial Transcriptomics
2023-Oct, GEN biotechnology
IF:2.0Q3
DOI:10.1089/genbio.2023.0032
PMID:39544230
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术的最新进展及其在生物学研究中的应用 | 本文系统地介绍了空间转录组学技术在揭示RNA分子在亚细胞、细胞和组织水平上的位置模式方面的创新应用 | 本文主要讨论了现有空间转录组学技术的局限性,包括方法上的挑战和应用中的限制 | 旨在为研究人员提供关于空间转录组学技术的全面指南 | 空间转录组学技术及其在生物学研究中的应用 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 97 | 2024-11-08 |
Bayesian-frequentist hybrid inference framework for single cell RNA-seq analyses
2023-Oct-03, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3384541/v1
PMID:37886581
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研究论文 | 本文提出了一种贝叶斯-频率主义混合推断框架用于单细胞RNA测序分析 | 本文的创新点在于提出了贝叶斯-频率主义混合框架,以提高单细胞RNA测序数据中差异表达基因的识别能力 | 本文的局限性在于仅在一个特例(特发性肺纤维化)中进行了验证,尚未在其他疾病或数据集中进行广泛验证 | 本文的研究目的是提高单细胞RNA测序数据中差异表达基因的识别能力 | 本文的研究对象是单细胞RNA测序数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯-频率主义混合框架 | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 98 | 2024-11-07 |
Transcriptional Landscape of Cotton Roots in Response to Salt Stress at Single-cell Resolution
2023-Oct-27, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2023.100740
PMID:39492159
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组技术系统分析了棉花根系对盐胁迫的响应 | 首次在单细胞分辨率下描绘了盐胁迫下棉花根系的转录图谱,揭示了细胞异质性和分化轨迹 | NA | 探究盐胁迫下棉花根系的分子机制 | 棉花根系在盐胁迫下的响应 | NA | NA | 单细胞转录组技术 | NA | 转录组数据 | 从自然生长和不同盐处理条件下的5天龄侧根尖中获得了56,281个高质量细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2024-10-28 |
Liquid-biopsy proteomics combined with AI identifies cellular drivers of eye aging and disease in vivo
2023-10-26, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.09.012
PMID:37863056
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研究论文 | 本文通过结合液体活检蛋白质组学和单细胞转录组学,追踪了5953种蛋白质在房水中的细胞来源,并开发了人工智能模型评估个体细胞的衰老情况 | 本文首次将液体活检蛋白质组学与单细胞转录组学结合,用于追踪非再生器官如眼睛和大脑的疾病机制,并揭示了帕金森病中的视网膜退化现象 | 本文的研究主要集中在眼睛,尚未扩展到其他器官系统 | 研究眼睛衰老和疾病的细胞驱动因素,并开发新的分子诊断和预后方法 | 眼睛中的5953种蛋白质及其细胞来源,以及个体细胞的衰老情况 | 生物信息学 | 眼科疾病 | 液体活检蛋白质组学,单细胞转录组学 | 人工智能模型 | 蛋白质组学数据,转录组学数据 | 5953种蛋白质 | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2024-10-26 |
Microfluidic single-cell migration chip reveals insights into the impact of extracellular matrices on cell movement
2023-10-24, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d3lc00651d
PMID:37750357
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研究论文 | 开发了一种高通量微流控细胞迁移芯片,结合机器人液体处理和计算机视觉技术,监测3200个单细胞的运动,研究细胞外基质对细胞迁移的影响 | 开发了高通量微流控细胞迁移芯片,提供前所未有的单细胞分辨率,研究不同细胞外基质对三阴性乳腺癌细胞迁移的影响 | 研究主要集中在三阴性乳腺癌细胞,未涵盖所有类型的细胞和疾病 | 研究细胞外基质对细胞迁移的影响,为开发治疗与细胞迁移相关疾病的新策略提供见解 | 三阴性乳腺癌细胞在不同细胞外基质中的迁移行为 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 微流控技术 | NA | 图像 | 3200个单细胞 | NA | NA | NA | NA |