单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 413 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-10-13 |
Data-driven identification of total RNA expression genes for estimation of RNA abundance in heterogeneous cell types highlighted in brain tissue
2023-10-16, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03066-w
PMID:37845779
|
研究论文 | 本文定义并识别了一种新的控制基因类别，称为总RNA表达基因（TREGs），用于下一代测序，这些基因与不同大小和转录活性的细胞类型中的总RNA丰度相关 | 提出了一个新的数据驱动方法，从单细胞RNA测序数据中识别TREGs，用于估计总RNA量 | NA | 开发一种新的方法来识别与总RNA丰度相关的基因，用于估计不同细胞类型中的RNA量 | 总RNA表达基因（TREGs） | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 五个脑区 | NA | NA | NA | NA |
| 82 | 2024-10-13 |
Spatial transcriptomics in development and disease
2023-Oct-09, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-023-00144-0
PMID:37806992
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综述 | 本文综述了空间转录组学在生物系统中的发展及其在疾病研究中的应用 | 空间转录组学技术能够同时捕获基因表达谱和细胞的空间位置信息，为研究区域基因表达、空间域和细胞间相互作用提供了新的维度 | 当前空间转录组学技术在通量和分辨率上仍存在局限，且数据分析和整合仍面临挑战 | 总结空间转录组学技术的发展历程、技术原理及其在生物医学研究中的应用，并探讨其未来发展方向 | 空间转录组学技术及其在发育和疾病研究中的应用 | 基因组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2024-10-13 |
Fibroblast growth factor 18 stimulates the proliferation of hepatic stellate cells, thereby inducing liver fibrosis
2023-10-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-42058-z
PMID:37813881
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研究论文 | 本文研究了成纤维细胞生长因子18（Fgf18）在肝星状细胞（HSCs）增殖和肝纤维化中的作用 | 首次揭示了Fgf18在肝纤维化中的关键作用，并提出了其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和人类肝活检样本，缺乏更大规模的人类临床数据 | 探讨Fgf18在肝纤维化中的作用机制 | 肝星状细胞（HSCs）和小鼠肝纤维化模型 | NA | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型和人类肝活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 84 | 2024-10-11 |
Systematic investigation of mitochondrial transfer between cancer cells and T cells at single-cell resolution
2023-10-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.09.003
PMID:37816332
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术和MERCI统计反卷积方法，系统研究了癌细胞和T细胞之间线粒体转移的现象 | 引入MERCI方法，能够追踪和量化癌细胞和T细胞之间的线粒体转移，并准确预测接收细胞及其相对线粒体组成 | NA | 研究癌细胞和T细胞之间线粒体转移的现象，并探索其潜在的治疗机会 | 癌细胞和T细胞之间的线粒体转移 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 统计反卷积方法 | RNA序列 | 涉及多种癌症类型的人类癌症样本 | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2024-10-11 |
ZNF683 marks a CD8+ T cell population associated with anti-tumor immunity following anti-PD-1 therapy for Richter syndrome
2023-10-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.08.013
PMID:37738974
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研究论文 | 研究分析了Richter综合征患者在接受PD-1阻断治疗后的单细胞转录组数据，发现ZNF683标记的CD8+ T细胞与抗肿瘤免疫反应相关 | 首次发现ZNF683在PD-1阻断治疗后标记的CD8+ T细胞与Richter综合征患者的抗肿瘤免疫反应相关 | 研究样本量较小，仅涉及6名Richter综合征患者和10名其他患者的预处理外周血样本 | 探究Richter综合征患者在接受PD-1阻断治疗后的抗肿瘤免疫反应机制 | Richter综合征患者的骨髓样本和外周血样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 17个骨髓样本和10个外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 86 | 2024-10-08 |
Chromatin accessibility profiling of targeted cell populations with laser capture microdissection coupled to ATAC-seq
2023-10-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100598
PMID:37776856
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研究论文 | 本研究报告了激光捕获显微切割与ATAC-seq结合（LCM-ATAC-seq）用于新鲜冷冻样本的空间染色质可及性特征分析 | 首次将激光捕获显微切割与ATAC-seq结合，用于空间染色质可及性分析 | 研究仅限于新鲜冷冻样本，未涉及其他类型的样本 | 探索空间表观基因组学领域，提供基因调控的进一步见解 | 染色质可及性在健康和疾病中的作用 | 表观基因组学 | NA | 激光捕获显微切割（LCM），ATAC-seq | NA | 染色质可及性数据 | 新鲜冷冻样本 | NA | NA | NA | NA |
| 87 | 2024-10-07 |
Allele-specific expression reveals genetic drivers of tissue regeneration in mice
2023-10-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.08.010
PMID:37714154
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研究论文 | 研究通过杂交MRL和非再生小鼠，利用等位基因特异性基因表达分析，揭示了与小鼠组织再生相关的顺式调控变异 | 首次通过等位基因特异性基因表达分析，识别出与小鼠耳部再生相关的顺式调控变异，并发现补体因子H在促进伤口修复和再生中的作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证这些发现 | 揭示小鼠组织再生的分子机制，并探索其临床应用潜力 | MRL小鼠和非再生小鼠的杂交后代，以及不同细胞类型的基因表达 | 分子生物学 | NA | 等位基因特异性基因表达分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | MRL和非再生小鼠的杂交后代，涉及免疫细胞、成纤维细胞和内皮细胞三种主要细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 88 | 2024-10-05 |
Neutrophils resist ferroptosis and promote breast cancer metastasis through aconitate decarboxylase 1
2023-10-03, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2023.09.004
PMID:37793345
|
研究论文 | 研究揭示了中性粒细胞通过aconitate脱羧酶1（Acod1）抵抗铁死亡并促进乳腺癌转移的机制 | 首次发现Acod1在中性粒细胞中的高表达及其在抵抗铁死亡和促进乳腺癌转移中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行大规模验证 | 探讨中性粒细胞在乳腺癌转移中的作用及其潜在治疗靶点 | 肿瘤浸润中性粒细胞（TINs）和循环中性粒细胞 | 癌症研究 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠乳腺肿瘤模型中的TINs和循环中性粒细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 89 | 2024-10-04 |
IL-17 Signaling in Primary Sclerosing Cholangitis Patient-Derived Organoids
2023-Oct-16, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3406046/v1
PMID:37886596
|
研究论文 | 研究了IL-17信号在原发性硬化性胆管炎患者来源的类器官中的作用 | 首次直接评估了IL-17信号在原发性硬化性胆管炎胆管细胞中的作用 | 未发现IL-17通路相关基因的罕见变异，但发现了MAPK信号通路的罕见变异 | 探讨原发性硬化性胆管炎外周胆管细胞类器官对IL-17A刺激的反应 | 原发性硬化性胆管炎和非原发性硬化性胆管炎患者的胆管细胞类器官 | NA | 原发性硬化性胆管炎 | 转录组学、分泌组分析、基因组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 来自原发性硬化性胆管炎和非原发性硬化性胆管炎患者的胆管细胞类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 90 | 2024-10-04 |
Molecular insights using spatial transcriptomics of the distal lung in congenital diaphragmatic hernia
2023-10-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00154.2023
PMID:37605849
|
研究论文 | 研究使用空间转录组学技术分析先天性膈疝（CDH）远端肺组织的转录组特征 | 首次在CDH患者中应用空间转录组学技术，识别不同肺细胞亚群在CDH病理生理中的作用，并强调性别特异性差异 | NA | 探讨先天性膈疝（CDH）远端肺组织与正常肺组织在转录组水平上的差异 | 先天性膈疝（CDH）和正常新生儿的远端肺组织 | 数字病理学 | 先天性疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 男性和女性CDH及正常新生儿的肺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 91 | 2024-10-04 |
Identification of de novo Mutations in the Chinese Autism Spectrum Disorder Cohort via Whole-Exome Sequencing Unveils Brain Regions Implicated in Autism
2023-Oct, Neuroscience bulletin
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12264-023-01037-6
PMID:36881370
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研究论文 | 通过全外显子测序在中国自闭症谱系障碍队列中识别新生突变，揭示与自闭症相关的大脑区域 | 结合全基因组筛查、单细胞测序和脑成像数据的综合分析，揭示了与自闭症病因相关的大脑区域 | 东亚自闭症队列在全基因组遗传研究中仍代表性不足 | 识别中国自闭症谱系障碍队列中的新生突变，并研究其与大脑区域的关系 | 369个中国自闭症三联体（包括患者及其未受影响的父母） | 基因组学 | 自闭症谱系障碍 | 全外显子测序 | NA | 基因组数据、单细胞测序数据、脑成像数据 | 369个自闭症三联体 | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2024-10-04 |
Transcriptomic Profiling Identifies Ferroptosis-Related Gene Signatures in Ischemic Muscle Satellite Cells Affected by Peripheral Artery Disease-Brief Report
2023-10, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.319518
PMID:37675635
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研究论文 | 研究通过转录组分析识别出外周动脉疾病影响下的缺血肌肉卫星细胞中与铁死亡相关的基因特征 | 首次发现铁死亡相关基因在外周动脉疾病影响的人类骨骼肌中差异表达 | 样本量较小，仅基于8个捐赠者的样本 | 探讨外周动脉疾病对肌肉卫星细胞转录组的影响，识别与肌肉病变相关的损伤途径 | 外周动脉疾病患者的肌肉卫星细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 8个捐赠者的25000多个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2024-10-04 |
Transforming Growth Factor-β Blockade in Pancreatic Cancer Enhances Sensitivity to Combination Chemotherapy
2023-10, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.05.038
PMID:37263309
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研究论文 | 研究探讨了在胰腺癌中阻断TGFβ与化疗联合使用的效果 | 首次证明了TGFβ阻断在胰腺癌模型中增强化疗敏感性的作用，并提供了在临床环境中评估NIS793与FOLFIRINOX或吉西他滨/纳米颗粒（白蛋白结合）紫杉醇联合化疗的理论基础 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人类临床试验中验证 | 研究TGFβ阻断在胰腺癌中与化疗联合使用的效果 | 胰腺癌细胞及其微环境 | 癌症研究 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序和免疫荧光 | NA | RNA序列和免疫荧光图像 | 使用了正位胰腺癌模型中的小鼠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 94 | 2024-10-04 |
Divergent Actions of Renal Tubular and Endothelial Type 1 IL-1 Receptor Signaling in Toxin-Induced AKI
2023-10-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000191
PMID:37545036
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研究论文 | 研究IL-1受体1在肾小管和内皮细胞中的不同信号传导对毒素诱导的急性肾损伤的影响 | 发现IL-1R1在肾小管和内皮细胞中的激活对急性肾损伤有相反的影响，肾小管中的激活加剧损伤，而内皮细胞中的激活减轻损伤 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类中验证结果 | 探讨IL-1R1在不同肾脏细胞类型中的信号传导对急性肾损伤的影响 | IL-1R1在肾小管和内皮细胞中的信号传导 | NA | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类和小鼠的肾脏组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 95 | 2024-10-04 |
Single-cell analysis of dorsal root ganglia reveals metalloproteinase signaling in satellite glial cells and pain
2023-10, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2023.08.005
PMID:37557960
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术分析背根神经节中的卫星胶质细胞，揭示了金属蛋白酶信号在疼痛中的作用 | 首次揭示了卫星胶质细胞中金属蛋白酶信号通路在处理躯体感觉刺激中的作用，并发现了一种潜在的疼痛治疗方法 | 研究主要集中在体外实验和细胞水平，尚未在动物模型或人体中验证 | 探讨卫星胶质细胞在疼痛中的作用及其分子机制 | 背根神经节中的卫星胶质细胞和感觉神经元 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 多个卫星胶质细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2024-10-02 |
Spatially Resolved Transcriptomics Technology Facilitates Cancer Research
2023-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202302558
PMID:37632718
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术在癌症研究中的应用及其在揭示基因表达和细胞功能空间位置方面的主要成就 | 空间转录组学技术（SRT）能够探索特定细胞与其空间背景之间的关系，弥补了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在空间信息上的不足 | NA | 旨在通过深入理解肿瘤细胞与周围非恶性细胞的相互作用，开发更有效的临床治疗策略 | 肿瘤细胞及其周围非恶性细胞的空间位置与功能 | 数字病理学 | 癌症 | 下一代测序（NGS） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 97 | 2024-10-02 |
Lepr-Expressing PDLSCs Contribute to Periodontal Homeostasis and Respond to Mechanical Force by Piezo1
2023-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303291
PMID:37553778
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研究论文 | 研究揭示了Lepr+ PDLSCs在牙周稳态中的作用及其对机械力的响应机制 | 首次通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术鉴定出Lepr+ PDLSCs，并发现Piezo1介导了Lepr+ PDLSCs的机械感应 | NA | 探讨Lepr+ PDLSCs在牙周稳态中的作用及其对机械力的响应机制 | Lepr+ PDLSCs及其在牙周组织修复和稳态维持中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 98 | 2024-10-01 |
Revealing the impact of CD70 expression on the manufacture and functions of CAR-70 T-cells based on single-cell transcriptomics
2023-Oct, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03475-7
PMID:37382633
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研究论文 | 研究基于单细胞转录组学揭示CD70表达对CAR-70 T细胞制造和功能的影响 | 首次探讨了在CAR T细胞制造过程中敲除CD70对T细胞扩增、存活和抗肿瘤效果的影响 | 研究仅限于实验室环境，尚未在临床上验证其效果 | 探讨CD70表达对CAR-70 T细胞制造和功能的影响，为CAR T细胞治疗T细胞癌症提供指导 | CD70敲除和野生型CAR-70 T细胞的制造和抗肿瘤能力 | 细胞治疗 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序和TCR测序 | NA | 基因表达数据 | CD70敲除和野生型CAR-70 T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2024-10-01 |
Identification of an antigen-presenting cells/T/NK cells-related gene signature to predict prognosis and CTSL to predict immunotherapeutic response for lung adenocarcinoma: an integrated analysis of bulk and single-cell RNA sequencing
2023-Oct, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03485-5
PMID:37458771
|
研究论文 | 本研究旨在通过综合分析bulk和单细胞RNA测序数据，识别与抗原呈递细胞（APC）/T/NK细胞相关的基因特征（ATNKGS）和潜在的免疫细胞相关基因（IRGs），以实现肺癌腺癌（LUAD）患者的危险分层、预后预测和免疫治疗反应预测 | 本研究首次构建了一个包含16个基因的ATNKGS，用于预测LUAD患者的总体生存率，并揭示了CTSL在免疫治疗反应预测中的重要作用 | 本研究主要基于公共数据集和外部免疫治疗队列进行验证，未来需要更多的临床试验数据来进一步验证这些发现 | 识别与APC/T/NK细胞相关的基因特征和潜在的免疫细胞相关基因，以实现LUAD患者的危险分层、预后预测和免疫治疗反应预测 | 肺癌腺癌（LUAD）患者 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | LASSO Cox回归 | RNA测序数据 | 1108名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2024-10-01 |
Female Gene Networks Are Expressed in Myofibroblast-Like Smooth Muscle Cells in Vulnerable Atherosclerotic Plaques
2023-10, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.319325
PMID:37589136
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研究论文 | 研究探讨了女性基因网络在易损性动脉粥样硬化斑块中的平滑肌细胞中的表达 | 首次揭示了女性基因网络在易损性动脉粥样硬化斑块中的平滑肌细胞中的表达，并识别了两个主要的平滑肌细胞基因调控网络 | 研究主要集中在人类颈动脉斑块和Apoe-/-小鼠模型上，可能无法完全代表所有动脉粥样硬化情况 | 探讨女性基因网络在易损性动脉粥样硬化斑块中的作用 | 人类颈动脉斑块和Apoe-/-小鼠模型 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类颈动脉斑块样本和Apoe-/-小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |