单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 415 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-17 |
Upregulation of exosome secretion from tumor-associated macrophages plays a key role in the suppression of anti-tumor immunity
2023-10-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113224
PMID:37805922
|
研究论文 | 本文报道了肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)分泌的外泌体在抑制抗肿瘤免疫中的关键作用 | 首次揭示了TAMs通过增加外泌体分泌来抑制CD8 T细胞的增殖和功能，并提出靶向外泌体作为改善免疫疗法的潜在策略 | NA | 探讨肿瘤相关巨噬细胞分泌的外泌体在抑制抗肿瘤免疫中的作用及机制 | 肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)、外泌体、CD8 T细胞 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及患者黑色素瘤组织和小鼠黑色素瘤模型 |
| 82 | 2024-08-07 |
Single-cell and Spatial Transcriptomics Clustering with an Optimized Adaptive K-Nearest Neighbor Graph
2023-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.13.562261
PMID:37905097
|
研究论文 | 本文开发了一种名为aKNNO的方法，通过优化的自适应k近邻图同时识别丰富和稀有细胞类型 | aKNNO方法能够在不牺牲丰富细胞类型聚类性能的情况下，准确发现已知和新的稀有细胞类型 | NA | 开发一种新的方法来同时识别单细胞和空间转录组学数据中的丰富和稀有细胞类型 | 单细胞和空间转录组学数据中的细胞类型 | 单细胞测序 | NA | 单细胞和空间转录组学 | 自适应k近邻图 | 转录组数据 | 38个模拟数据集和20个单细胞及空间转录组学数据集 |
| 83 | 2024-08-07 |
A lipid-associated macrophage lineage rewires the spatial landscape of adipose tissue in early obesity
2023-10-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.171701
PMID:37651193
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和成像技术，探讨了小鼠饮食诱导肥胖过程中脂肪组织巨噬细胞（ATM）的动态变化及其与代谢疾病发展的关系 | 首次将单细胞RNA测序与空间转录组学结合，揭示了肥胖早期脂肪组织中脂质相关巨噬细胞（LAM）前体（pre-LAM）的空间分布及其与脂肪组织功能障碍标志物的共定位 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来研究需要验证这些发现是否适用于人类 | 深入理解肥胖过程中脂肪组织巨噬细胞的多样性及其在代谢疾病发展中的作用 | 脂肪组织巨噬细胞及其在肥胖过程中的动态变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据、图像数据 | 小鼠模型 |
| 84 | 2024-08-04 |
An ANXA11 P93S variant dysregulates TDP-43 and causes corticobasal syndrome
2023-Oct-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3462973/v1
PMID:37886540
|
研究论文 | 本研究识别了ANXA11中的一个新型变异P93S，其导致TDP-43的异常调控，并与皮质基底综合征相关。 | 首次将ANXA11 P93S变异与皮质基底综合征联系起来，拓展了ANXA11突变所致临床综合征的范围。 | 关于ANXA11 P93S变异对神经元功能的影响尚未全面理解，且样本规模可能有限。 | 探讨ANXA11突变在皮质基底综合征中的致病作用及其相关生物学机制。 | 针对携带ANXA11 P93S突变的个体进行的表型分析和细胞功能研究。 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 多组学评估 | iPSC衍生神经元 | 单细胞测序和蛋白组学分析 | 涉及对应突变的个体样本及其iPSC衍生的神经元和小胶质细胞 |
| 85 | 2024-08-05 |
Identification of CD133+ intercellsomes in intercellular communication to offset intracellular signal deficit
2023-10-17, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86824
PMID:37846866
|
研究论文 | 本文报道了CD133在细胞间通信中的作用，以补偿细胞内信号不足 | 提出了名为'intercellsome'的细胞间结构，并发现其与CD133表达相关 | 尚未探讨CD133 intercellsomes在其他组织或不同生理环境下的行为 | 研究CD133在细胞间通信和应对细胞内信号不足中的作用 | 主要研究CD133阳性肝细胞及其在肝再生中的表现 | 数字病理 | 肿瘤相关疾病 | 单细胞RNA测序，超分辨率显微镜，电子显微镜 | NA | mRNA | 多个动物物种中的癌细胞类型和肝脏、肠脏的原器官 |
| 86 | 2024-08-05 |
Signature morphoelectric properties of diverse GABAergic interneurons in the human neocortex
2023-10-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adf6484
PMID:37824669
|
研究论文 | 本研究分析了人类新皮层中多样的GABA能中间神经元的特征和形态电性质 | 采用快速GABA能神经元病毒遗传标记和Patch-seq技术，可靠地对人类皮层GABA能神经元亚类进行目标分析 | 研究主要集中在活体切片，可能无法完全代表神经元在体内的真实状态 | 探究人类大脑GABA能神经元的转录组多样性及其形态特征 | 人类新皮层的GABA能神经元亚类及其个别转录组类型 | 数字病理学 | NA | Patch-seq | NA | 转录组数据 | 人脑切片的多个样本 |
| 87 | 2024-08-04 |
Research progress on the application of single-cell sequencing in autoimmune diseases
2023-10, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-023-00216-9
PMID:37550409
|
综述 | 该文章总结了单细胞RNA测序技术在自身免疫疾病领域的应用进展 | 提供了对单细胞RNA测序技术的发展和在自身免疫疾病研究中的应用的系统性回顾 | 尚未完全理解自身免疫疾病的病因和发病机制 | 提供对自身免疫疾病发病机制、诊断和治疗的理解参考 | 自身免疫疾病 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 88 | 2024-08-04 |
Identification of Niche-Specific Gene Signatures between Malignant Tumor Microenvironments by Integrating Single Cell and Spatial Transcriptomics Data
2023-10-31, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14112033
PMID:38002976
|
研究论文 | 该文章提出了一种整合单细胞RNA测序和空间转录组数据的方法，以识别恶性肿瘤微环境中的特定基因特征 | 通过整合scRNA-seq和空间转录组数据，识别特定于细胞生态位的基因特征，展示了这一整合方法的潜力 | 未提及具体的局限性 | 旨在综合评估组织样本中的基因活性并识别细胞生态位特异性基因特征 | 研究对象包括五种癌症类型的配对或匹配的scRNA-seq和Visium平台数据 | 数字病理学 | 乳腺癌、胃肠道间质肿瘤、肝细胞癌、子宫内膜癌、卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及五种癌症类型的配对或匹配样本数据 |
| 89 | 2024-08-04 |
SARS-CoV-2 infection establishes a stable and age-independent CD8+ T cell response against a dominant nucleocapsid epitope using restricted T cell receptors
2023-10-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-42430-z
PMID:37872153
|
研究论文 | 本文分析了SARS-CoV-2感染后针对核壳蛋白的CD8 T细胞反应的特征 | 发现SARS-CoV-2感染后CD8 T细胞的增殖反应增强并持续存在 | 缺乏对CD8 T细胞在感染前后特异性和TCR组成的全面表征 | 研究SARS-CoV-2感染中CD8 T细胞对核壳蛋白特定表位的反应 | 针对SARS-CoV-2核壳蛋白的CD8 T细胞及其TCR特征 | 免疫学 | SARS-CoV-2感染 | 单细胞测序，转录组分析 | NA | 免疫细胞数据 | 包括恢复期和未感染供体的CD8 T细胞 |
| 90 | 2024-08-04 |
Immune profiling of murine cardiac leukocytes identifies triggering receptor expressed on myeloid cells 2 as a novel mediator of hypertensive heart failure
2023-10-24, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvad093
PMID:37314125
|
研究论文 | 本文探讨了小鼠模型中Trem2在高血压性心力衰竭中的新型介导作用 | 发现Trem2在高血压性心力衰竭中的心脏保护作用，并表明其在心脏免疫细胞中的调控 | 尚未确定Trem2在高血压性心力衰竭具体机制的详细信息 | 研究心脏免疫细胞在HFpEF中的改变及其潜在的治疗策略 | 高血压性心力衰竭小鼠模型及其心脏免疫细胞 | 数字病理学 | 心力衰竭 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用小鼠模型进行实验 |
| 91 | 2024-08-04 |
MuDCoD: multi-subject community detection in personalized dynamic gene networks from single-cell RNA sequencing
2023-10-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad592
PMID:37740957
|
研究论文 | 本文提出MuDCoD算法用于在个性化动态基因网络中进行多主体社区检测 | 本研究开发了MuDCoD，通过谱聚类框架促进不同主体及时间点网络之间的信息共享 | 暂无明显的研究限制信息 | 研究如何利用scRNA-seq数据在基因共表达网络水平上进行个性化动态社区检测 | 个性化动态基因网络中的基因簇和社区 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 谱聚类 | 基因表达数据 | 涉及多名个体的群体规模单细胞RNA-seq数据集 |
| 92 | 2024-08-05 |
Mapping pediatric brain tumors to their origins in the developing cerebellum
2023-10-03, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noad124
PMID:37534924
|
研究论文 | 本研究揭示了三种最常见儿童脑肿瘤的细胞起源 | 通过使用人类发育小脑地图，揭示了儿童脑肿瘤的细胞起源，提供了新的治疗靶点 | 由于仅使用正常发育人类小脑作为参考，可能无法覆盖所有变异情况 | 理解儿童脑肿瘤的起源，以识别潜在的肿瘤特异性疗法 | 主要研究三种儿童脑肿瘤：室管膜瘤、毛细胞星形胶质瘤和小脑神经母细胞瘤 | 数字病理学 | NA | 基因组变异分析，相关性分析，单细胞匹配技术 | NA | 转录组数据 | 使用了4416个肿瘤数据集，包括批量和单细胞转录组数据 |
| 93 | 2024-08-05 |
Hypoxia-Inducible Factor-1α in SM22α-Expressing Cells Modulates Alveolarization
2023-10, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0045OC
PMID:37290124
|
研究论文 | 本文研究了HIF-1α在SM22α表达细胞中的作用对肺泡化的影响 | 文章创新性地探讨了HIF-1α在特定间充质细胞亚群中调节出生后肺泡化的机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，可能无法完全推及人类 | 研究HIF-1α在SM22α表达细胞中的功能及其对肺发育的影响 | 以SM22α-表达细胞为对象，分析其在肺泡化中的作用 | 数字病理学 | 慢性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 使用了小鼠模型和早产儿样本 |
| 94 | 2024-08-04 |
Self-patterning of human stem cells into post-implantation lineages
2023-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06354-4
PMID:37369348
|
研究论文 | 这项研究展示了人类多能干细胞被触发自我组织成三维结构，重现早期人类胚胎发育的一些关键时空事件 | 提供了一种可重复、易于处理和可扩展的实验平台以理解人类发育的基本细胞和分子机制 | 未建立胎盘细胞类型，局限于人胚胎发育的特定阶段 | 探索人类发育的基本细胞和分子机制 | 人类多能干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | 三维自组织模型 | 细胞状态无特定类型 | NA |
| 95 | 2024-08-05 |
Spatial Single Cell Analysis of Proteins in 2D Human Gastruloids Using Iterative Immunofluorescence
2023-Oct, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.915
PMID:37882990
|
研究论文 | 本文描述了一种迭代免疫荧光协议和计算管道，用于在2D人类胚层模型中分析蛋白质的空间模式形成 | 提出的迭代免疫荧光协议实现了比标准免疫荧光技术更高的多重测量能力，并能够同时分析27种蛋白质 | 未详细讨论方法在实际生物样本中的应用限制 | 揭示细胞信号如何在时间和空间上共同指示细胞命运 | 主要研究2D人类胚层的细胞及其在不同信号通路下的蛋白质表达 | 数字病理学 | NA | 免疫荧光 | NA | 图像 | 超过27种蛋白质的单细胞表达聚类分析 |
| 96 | 2024-08-05 |
IL-1β inhibition partially negates the beneficial effects of diet-induced lipid lowering
2023-Oct-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.13.562255
PMID:37873280
|
研究论文 | 本研究探讨了IL-1β抑制对饮食诱导的脂质降低效果的部分抵消作用 | 研究揭示了IL-1β在饮食诱导的斑块负担减少和斑块稳定性提高中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全适用于人类 | 探讨饮食改变对动脉粥样硬化病变的影响及其机制 | 采用Apoe-/-小鼠作为研究对象，以分析饮食对动脉粥样硬化病变的影响 | 医学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, CyTOF, 免疫染色, 高分辨率共聚焦显微镜z堆叠分析 | NA | 组织样本 | Apoe-/-小鼠，18周喂养西方饮食后切换到低脂饮食 |
| 97 | 2024-08-04 |
TIMP1 is an early biomarker for detection and prognosis of lung cancer
2023-10, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1391
PMID:37759102
|
研究论文 | 本文研究了TIMP1作为肺癌早期生物标志物的潜力 | 首次将TIMP1确定为肺癌早期生物标志物，并验证其在临床样本中的有效性 | 研究主要依赖于小鼠模型和已公开的数据，可能需要更大范围的人类临床验证 | 确定TIMP1在肺癌早期检测和预后中的作用 | KrasG12D/+; Lkb1f/f小鼠模型及肺癌患者的血浆样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 免疫组织化学(IHC)、单细胞RNA测序和大规模RNA测序 | 小鼠模型 | 血浆、肿瘤组织 | 包含小鼠模型与临床样本 |
| 98 | 2024-08-04 |
A lamprey neural cell type atlas illuminates the origins of the vertebrate brain
2023-Oct, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-023-02170-1
PMID:37710042
|
研究论文 | 这篇文章建立了盲鳗整个大脑的细胞类型图谱，探讨了脊椎动物大脑的起源 | 通过单细胞RNA-seq和在位测序数据，首次系统描绘了盲鳗大脑的细胞和分子起源 | 研究发现了在进化过程中出现的关键组织和细胞类型，可能限制了对所有脊椎动物特征的认识 | 追踪脊椎动物大脑的细胞和分子起源 | 盲鳗这一无颚类物种的整个大脑 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq和在位测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 99 | 2024-08-05 |
Cancer cell-derived extracellular vesicles drive pre-metastatic niche formation of lymph node via IFNGR1/JAK1/STAT1-activated-PD-L1 expression on FRCs in head and neck cancer
2023-10, Oral oncology
IF:4.0Q2
|
研究论文 | 本研究评估了癌细胞来源的细胞外囊泡（CEVs）调节的成纤维网状细胞（FRCs）在淋巴结（LN）前转移生态位形成中的作用 | 发现癌细胞来源的细胞外囊泡通过IFNGR1/JAK1/STAT1通路促进FRCs上PD-L1的表达，进而导致CD8+ T细胞耗竭 | 本研究仅基于有限的样本数量，需进一步验证 | 评估癌细胞来源的细胞外囊泡在前转移生态位形成中的角色 | 来自20例癌症患者的60个新鲜颈部淋巴结中的FRCs | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序、质谱分析、蛋白质印迹法 | NA | 细胞、蛋白质 | 60个颈部淋巴结样本来自20位患者 |
| 100 | 2024-08-07 |
Correction to: Implanted Tissue-Engineered Vascular Graft Cell Isolation with Single-Cell RNA Sequencing Analysis, by Mirhaidari et al. Tissue Engineering Part C: Methods 2023;29(2):72-84; doi: 10.1089/ten.tec.2022.0189
2023-Oct, Tissue engineering. Part C, Methods
DOI:10.1089/ten.tec.2022.0189.correx
PMID:37672627
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |