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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-06 |
SARS-CoV-2 infection establishes a stable and age-independent CD8+ T cell response against a dominant nucleocapsid epitope using restricted T cell receptors
2023-10-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-42430-z
PMID:37872153
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研究论文 | 本研究揭示了SARS-CoV-2感染后针对核衣壳蛋白优势表位LLL的CD8+ T细胞应答特征 | 首次发现针对SARS-CoV-2核衣壳蛋白优势表位LLL的CD8+T细胞具有高度受限的TCR库特征,且该应答具有年龄无关性和长期稳定性 | 研究主要聚焦于单一HLA-A2限制性表位,未全面评估其他HLA类型下的T细胞应答 | 解析SARS-CoV-2感染前后针对非刺突蛋白的CD8+T细胞特异性及TCR组成特征 | SARS-CoV-2感染者及未感染对照者的CD8+ T细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞测序、转录组分析、结构表征 | NA | 单细胞TCR序列、转录组数据 | 未明确样本数量(包含康复期患者和未感染供体) | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 42 | 2025-10-06 |
Molecular and spatial landmarks of early mouse skin development
2023-10-23, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.07.015
PMID:37591247
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研究论文 | 通过单细胞转录组学、空间细胞类型定位和细胞谱系追踪技术,解析早期小鼠皮肤发育过程中的细胞多样性和组织结构形成机制 | 首次揭示了早期单层表皮内的意外上皮异质性和信号丰富的周皮层,识别了毛囊诱导、肌肉支持和筋膜形成成纤维细胞的时空出现模式 | 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类皮肤发育过程 | 解析早期胚胎小鼠皮肤发育过程中的细胞类型多样性和组织结构形成机制 | 早期胚胎小鼠皮肤组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学, 空间细胞类型定位, 细胞谱系追踪 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 早期胚胎小鼠皮肤组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 43 | 2025-10-06 |
Immune checkpoint inhibitor-induced colitis is mediated by polyfunctional lymphocytes and is dependent on an IL23/IFNγ axis
2023-10-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41798-2
PMID:37872166
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研究论文 | 本研究揭示了免疫检查点抑制剂诱发结肠炎的机制,发现其由多功能淋巴细胞介导并依赖于IL23/IFNγ轴 | 首次证明CPI结肠炎依赖于肠道微生物群组成,并由表达IFNγ、细胞毒性分子和其他促炎因子的淋巴细胞诱导 | 研究基于小鼠模型,临床转化需进一步验证 | 探究免疫检查点对肠道稳态的影响及CPI结肠炎的发病机制 | 接受抗CTLA4和抗PD-1免疫治疗的小鼠模型 | 免疫学 | 结肠炎 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 44 | 2025-10-06 |
An ANXA11 P93S variant dysregulates TDP-43 and causes corticobasal syndrome
2023-Oct-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3462973/v1
PMID:37886540
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研究论文 | 本研究通过识别ANXA11基因的新型P93S变异体,揭示了其导致皮质基底节综合征的致病机制 | 首次发现ANXA11 P93S变异体与皮质基底节综合征的关联,并通过多组学分析揭示了小胶质细胞免疫失调在疾病中的核心作用 | 神经元中的致病组学特征相对微弱,研究样本量有限 | 确定ANXA11基因变异体的致病性及其在神经退行性疾病中的作用机制 | ANXA11基因变异体、iPSC来源的神经元和小胶质细胞 | 神经科学 | 皮质基底节综合征 | 单细胞测序、蛋白质组学分析、多模态计算分析 | iPSC衍生细胞模型 | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据 | 一个具有皮质基底节综合征的家族及神经退行性疾病临床数据库 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 45 | 2025-10-06 |
The developmental hierarchy and scarcity of replicative slender trypanosomes in blood challenges their role in infection maintenance
2023-10-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2306848120
PMID:37824530
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研究论文 | 通过实验证明锥虫发育过程中的细胞周期停滞在急性和慢性感染中是不可逆的,并发现血液中增殖寄生虫极其稀少 | 首次证实锥虫发育细胞周期停滞的不可逆性,揭示细胞周期停滞与可逆性转录组变化的时间层级关系,发现血液中增殖寄生虫的稀缺性 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在其它哺乳动物宿主中验证 | 探究锥虫在哺乳动物宿主中的发育生物学和感染维持机制 | 布氏锥虫的细长型和粗短型形态 | 发育生物学 | 锥虫病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠感染模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 46 | 2025-10-06 |
High-throughput identification of Toxoplasma gondii effector proteins that target host cell transcription
2023-10-11, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2023.09.003
PMID:37827122
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研究论文 | 本研究开发了一种名为dual perturb-seq的新方法,用于识别弓形虫靶向宿主细胞转录的效应蛋白 | 结合CRISPR敲除筛选与宿主-微生物单细胞RNA测序,首次实现直接从未表征效应蛋白推断其功能 | 方法主要应用于弓形虫模型,在其他病原体中的适用性需进一步验证 | 解析宿主-微生物转录相互作用机制,揭示病原体感染和免疫逃逸机制 | 弓形虫效应蛋白及其对宿主细胞转录的调控作用 | 单细胞组学 | 寄生虫感染 | CRISPR筛选, 单细胞RNA测序 | dual perturb-seq | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2025-10-06 |
Meta-Analysis of Single-Cell RNA-Seq Data Reveals the Mechanism of Formation and Heterogeneity of Tertiary Lymphoid Organ in Vascular Disease
2023-10, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.318762
PMID:37589134
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meta-analysis | 通过整合单细胞RNA测序数据和文献组织学图像,系统分析血管疾病中三级淋巴器官的形成机制和异质性 | 首次在五种血管疾病模型中系统揭示三级淋巴器官的存在,并阐明其形成的细胞和分子机制 | 基于已有数据集的分析,缺乏实验验证;组织学证据来源于文献回顾而非原始数据 | 探究血管疾病中三级淋巴器官的存在及其形成机制 | 五种血管疾病模型(动脉粥样硬化、腹主动脉瘤、内膜增生、同种移植物和异种移植物) | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、组织学图像 | 28个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 48 | 2025-10-06 |
Identification of the regulatory circuit governing corneal epithelial fate determination and disease
2023-10, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002336
PMID:37856539
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了调控角膜上皮细胞命运决定和角膜混浊疾病的分子机制 | 首次通过基因调控网络分析识别了共享和细胞类型特异性转录因子,并发现FOSL2作为PAX6直接靶基因与角膜混浊相关的新候选基因 | NA | 揭示角膜上皮细胞命运决定的调控机制及其与角膜疾病的关系 | 人类角膜缘干细胞和表皮角质形成细胞 | 生物信息学 | 角膜疾病 | 多组学分析,单细胞RNA测序,基因调控网络分析 | NA | 基因组学数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2025-10-06 |
Developmental estrogen exposure in mice disrupts uterine epithelial cell differentiation and causes adenocarcinoma via Wnt/β-catenin and PI3K/AKT signaling
2023-10, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002334
PMID:37856394
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了发育期雌激素暴露通过Wnt/β-catenin和PI3K/AKT信号通路破坏子宫上皮细胞分化并诱发腺癌的机制 | 首次使用单细胞RNA测序和空间转录组学定义了子宫上皮干细胞标记物、不同祖细胞群体及细胞分化轨迹,揭示了发育期环境暴露导致癌症的新机制 | 研究基于小鼠模型,人类相关性需要进一步验证 | 探究发育期雌激素暴露导致子宫内膜腺癌的致病机制 | 小鼠子宫组织 | 数字病理学 | 子宫内膜腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 50 | 2025-10-06 |
The parenting hub of the hypothalamus is a focus of imprinted gene action
2023-10, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1010961
PMID:37856383
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现印记基因在控制亲代行为的神经元中富集表达,并首次证实Magel2基因对亲代养育行为的关键作用 | 首次采用无偏见的系统生物学方法证明印记基因在亲代行为调控中的集中作用,并发现Magel2这一新型印记基因对亲代养育行为的影响 | 研究主要聚焦于Magel2单个基因,其他富集印记基因的功能尚未验证 | 探究印记基因是否显著汇聚调控亲代养育行为 | 小鼠下丘脑视前区表达甘丙肽的神经元及Magel2基因敲除小鼠 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Magel2基因敲除小鼠(包括母亲、父亲和处女雌鼠) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2025-10-06 |
Transcriptional regulators of arterial and venous identity in the developing mammalian embryo
2023-Oct, Current opinion in physiology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.cophys.2023.100691
PMID:38328689
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综述 | 讨论哺乳动物胚胎发育过程中动脉和静脉身份获得的转录调控机制 | 整合内皮特异性基因调控元件分析、单细胞RNA测序和细胞谱系追踪等最新技术,深入揭示动静脉分化的转录调控机制 | NA | 阐明动静脉规范、分化和身份建立的调控通路 | 哺乳动物胚胎血管内皮细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 细胞谱系追踪, 基因调控元件分析 | NA | 基因表达数据, 谱系追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 52 | 2025-10-06 |
Glioblastoma initiation, migration, and cell types are regulated by core bHLH transcription factors ASCL1 and OLIG2
2023-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.30.560206
PMID:37873200
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研究论文 | 本研究揭示bHLH转录因子ASCL1和OLIG2在胶质母细胞瘤起始、迁移和细胞类型调控中的核心作用 | 首次证明ASCL1和OLIG2在胶质母细胞瘤中功能冗余地启动肿瘤形成,并通过动态水平和相互结合调控肿瘤细胞类型与迁移程度 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证有限 | 探究ASCL1和OLIG2转录因子在胶质母细胞瘤异质性和细胞层级调控中的作用机制 | 胶质母细胞瘤肿瘤细胞和胶质瘤干细胞 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠胶质母细胞瘤模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2025-10-07 |
Impact of Memory T Cells on SARS-COV-2 Vaccine Response in Hematopoietic Stem Cell Transplant
2023-Oct-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.26.564259
PMID:37961434
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研究论文 | 评估造血干细胞移植受者对SARS-CoV-2 mRNA疫苗的免疫反应特征 | 首次在HSCT受者中结合单细胞RNA测序与TCR/BCR测序分析疫苗无应答机制 | 样本量较小(仅42例患者),缺乏长期随访数据 | 探究造血干细胞移植受者对SARS-CoV-2疫苗的免疫应答机制 | 造血干细胞移植受者和健康对照者 | 免疫学 | 传染病 | 单细胞RNA测序,TCR测序,BCR测序,抗体滴度检测 | NA | 单细胞转录组数据,血清学数据 | 42例HSCT受者,5例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 54 | 2025-10-07 |
Machine learning-based metabolism-related genes signature, single-cell RNA sequencing, and experimental validation in hypersensitivity pneumonitis
2023-Oct-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000034940
PMID:37800807
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法识别了过敏性肺炎的代谢相关基因诊断标志物,并验证了其与M2巨噬细胞的关联 | 首次结合机器学习、单细胞RNA测序和实验验证,系统分析了过敏性肺炎中代谢相关基因的诊断价值及其与M2巨噬细胞的关联 | 样本来源仅限于公共数据库和部分实验验证,需要更大样本量进一步验证 | 识别过敏性肺炎的代谢相关基因诊断标志物并研究其与免疫细胞的关系 | 过敏性肺炎患者和健康对照的基因表达数据及外周血样本 | 生物信息学 | 过敏性肺炎 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 流式细胞术, 生物信息学分析 | 机器学习算法 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 来自Gene Expression Omnibus数据库的样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | NA |
| 55 | 2025-10-07 |
Comprehensive single cell aging atlas of mammary tissues reveals shared epigenomic and transcriptomic signatures of aging and cancer
2023-Oct-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.20.563147
PMID:37961129
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研究论文 | 通过单细胞分辨率研究小鼠乳腺组织衰老过程中的转录组和表观基因组变化,揭示衰老与癌症之间的分子联系 | 首次构建了乳腺组织衰老的单细胞图谱,揭示了衰老过程中上皮细胞、基质细胞和免疫细胞的表观遗传和转录组变化,并发现衰老特征与人类乳腺癌的相似性 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;空间转录组数据可能覆盖区域有限 | 探究衰老如何影响乳腺组织的细胞和分子程序,以及这些变化与癌症发生的关系 | 小鼠乳腺组织中的上皮细胞、基质细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,表观基因组分析 | NA | 单细胞转录组数据,表观基因组数据,空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量的小鼠乳腺组织 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 56 | 2025-10-07 |
Spatial heterogeneity of bone marrow endothelial cells unveils a distinct subtype in the epiphysis
2023-10, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-023-01240-7
PMID:37798545
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了骨髓内皮细胞的空间异质性,并在骨骺区发现了一种独特的毛细血管亚型——S型内皮细胞 | 首次在骨骺区鉴定出具有独特表型特征的S型内皮细胞,发现其通过分泌I型胶原蛋白参与骨强度获得,并形成造血干细胞的特殊储存库 | NA | 探索骨髓内皮细胞的异质性及其在骨形成和造血过程中的功能 | 骨髓内皮细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA-Sequencing in Astrocyte Development, Heterogeneity, and Disease
2023-Oct, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-023-01397-7
PMID:37552355
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综述 | 本文综述了星形胶质细胞的发育、异质性及其在中枢神经系统生理和病理环境中的关键作用,重点关注单细胞测序技术的应用 | 系统整合了单细胞RNA测序技术在揭示星形胶质细胞异质性、发育轨迹和疾病作用方面的最新研究进展 | NA | 探讨星形胶质细胞的发育过程、细胞异质性及其在中枢神经系统疾病中的作用 | 星形胶质细胞 | 单细胞生物学 | 中枢神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 58 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis profiles cellular and molecular alterations in submandibular gland and blood in IgG4-related disease
2023-10, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224363
PMID:37474274
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了IgG4相关疾病中颌下腺和血液的细胞与分子改变 | 发现了三种新型组织驻留免疫细胞亚群,揭示了TOP2A_B细胞和TOP2A_T细胞的分化轨迹,以及ICOS_PD-1_B细胞在B细胞向IgG4+浆细胞分化中的中间状态 | 样本量有限,需要在更大队列中验证发现 | 解析IgG4相关疾病的细胞种群和免疫细胞与非免疫细胞间的相互作用 | IgG4相关疾病患者和匹配对照的颌下腺组织和外周血单个核细胞 | 单细胞生物学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 多重免疫荧光染色 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据, 免疫组库数据, 图像数据 | IgG4相关疾病患者和匹配对照的颌下腺和PBMC样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 59 | 2025-02-04 |
Post-ischemic inactivation of HIF prolyl hydroxylases in endothelium promotes maladaptive kidney repair by inducing glycolysis
2023-Oct-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.03.560700
PMID:37873349
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研究论文 | 本文研究了缺血性急性肾损伤(AKI)后内皮细胞中氧感应脯氨酰羟化酶(PHD)的作用及其对肾脏修复的影响 | 发现了内皮细胞中PHD1、PHD2和PHD3的联合失活促进不良肾脏修复的机制,并提出了通过抑制MCT4来恢复适应性肾脏修复的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型,人类肾脏样本的研究仍需进一步验证 | 探讨缺血性急性肾损伤后内皮细胞中PHD酶的作用及其对肾脏修复的影响 | 小鼠和人类肾脏内皮细胞 | 生物医学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类肾脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2025-10-07 |
IL-21-producing effector Tfh cells promote B cell alloimmunity in lymph nodes and kidney allografts
2023-10-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169793
PMID:37870962
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研究论文 | 本研究揭示了产生IL-21的效应Tfh细胞在肾移植排斥中通过调控B细胞克隆动态发挥关键作用 | 首次发现并表征了产生IL-21的效应Tfh细胞亚群在肾移植排斥中的双重作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人类患者中验证 | 阐明Tfh细胞在肾移植排斥中的具体亚群、起源和功能机制 | 效应Tfh细胞、B细胞、肾移植模型 | 免疫学 | 肾移植排斥 | 单细胞RNA测序, 单B细胞培养系统 | NA | 基因表达数据, 细胞功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |