本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-08-05 |
A multi-omics integrative approach unravels novel genes and pathways associated with senescence escape after targeted therapy in NRAS mutant melanoma
2023-10, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-023-00640-z
PMID:37420093
|
研究论文 | 本研究揭示了NRAS突变黑色素瘤在靶向治疗后与衰老逃逸相关的新基因和通路 | 首次将胰岛素信号传导与持续衰老表型的维持相关联,并提出干扰素γ在衰老逃逸中的新角色 | 尚未明确实验的临床适用性和结果的真实世界验证 | 研究癌细胞如何逃逸衰老,以优化靶向疗法的临床效果 | 三种不同的NRAS突变黑色素瘤细胞系的反应特征 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA-seq | NA | 转录组数据、miRNA相互作用组数据 | 三种不同类型的NRAS突变黑色素瘤细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 382 | 2024-08-07 |
Lsd1 safeguards T-cell development via suppressing endogenous retroelements and interferon responses
2023-10, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202302042
PMID:37429639
|
研究论文 | 本研究探讨了组蛋白去甲基化酶Lsd1在胸腺细胞发育中的生理功能 | 首次揭示了Lsd1通过抑制内源性逆转录元件和干扰素反应来维持早期T细胞发育中的内源性逆转录元件稳态 | NA | 探究Lsd1在胸腺细胞发育中的作用 | 胸腺细胞中的Lsd1功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序、链特异性总RNA-seq和ChIP-seq分析 | NA | RNA | 小鼠胸腺细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 383 | 2024-08-05 |
Spatial regulation of plant hormone action
2023-10-13, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erad244
PMID:37401809
|
研究论文 | 本文综述了植物激素作用的空间调控机制 | 探讨了植物激素传感器技术的新发展,提供了前所未有的空间域分辨率 | NA | 研究植物激素在不同植物部分的空间特异性作用及其调控机制 | 植物激素及其对植物生长和发育的影响 | NA | NA | FRET和单细胞RNA-seq | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 384 | 2024-08-05 |
Clonal dynamics and copy number variants by single-cell analysis in leukemic evolution of myeloproliferative neoplasms
2023-10, American journal of hematology
IF:10.1Q1
DOI:10.1002/ajh.27013
PMID:37399248
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了骨髓增生性肿瘤(MPN)向急性转变的克隆动态和拷贝数变异 | 首次利用单细胞测序技术揭示了MPN在急性转变过程中的克隆轨迹和拷贝数变异 | 仅分析了10名患者的配对样本,样本量较小可能影响广泛适用性 | 探讨骨髓增生性肿瘤从慢性相向急性相转化的机制 | 研究对象为10名骨髓增生性肿瘤患者的慢性和急性配对样本 | 数字病理学 | 血液癌症 | 单细胞测序 (SCS) | NA | 基因拷贝数数据 | 10名患者的慢性和急性配对样本 | NA | NA | NA | NA |
| 385 | 2024-08-05 |
Heterogeneity of T cells in periapical lesions and in vitro validation of the proangiogenic effect of GZMA on HUVECs
2023-Oct, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.13951
PMID:37400946
|
研究论文 | 本研究探讨了T细胞在慢性根尖周炎中的作用,并验证了GZMA对HUVECs的促血管生成效应 | 本研究提供了T细胞在根尖周病变中的异质性新见解,并揭示了GZMA在调节HUVECs血管生成中的潜在作用 | 样本数量有限,仅包括五个慢性根尖周炎病例 | 研究慢性根尖周炎中T细胞的作用及GZMA在血管生成中的调节机制 | 慢性根尖周炎患者的T细胞及其对HUVECs的影响 | 数字病理学 | 慢性根尖周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 五个慢性根尖周炎病例的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 386 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of mitochondrial dysfunction and necroptosis in intracranial aneurysms from the perspective of predictive, preventative, and personalized medicine
2023-10, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-023-01865-x
PMID:37410216
|
研究论文 | 本研究探讨了线粒体功能障碍和程序性坏死在颅内动脉瘤中的作用 | 研究首次揭示了线粒体功能障碍和程序性坏死在颅内动脉瘤形成中的重要性,并确定了几个关键基因 | 研究的样本大小和来源可能影响结果的普适性 | 探索线粒体功能障碍和程序性坏死在颅内动脉瘤的预测、预防和个性化医学中的应用 | 75个颅内动脉瘤样本和37个对照样本的转录组数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq | 机器学习 | 基因表达数据 | 75个颅内动脉瘤样本和37个对照样本 | NA | NA | NA | NA |
| 387 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Provides New Insights into Therapeutic Roles of Thyroid Hormone in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2023-10, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0080OC
PMID:37402274
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了甲状腺激素3,5,3'-三碘甲状腺原氨酸(T)在特发性肺纤维化中的治疗作用及其对肺泡再生的影响 | 首次在单细胞水平上揭示了甲状腺激素T通过调节肺泡上皮细胞、巨噬细胞和成纤维细胞的状态和细胞间通讯,促进肺泡再生和减轻纤维化的机制 | NA | 探索甲状腺激素在特发性肺纤维化中的治疗作用及其对肺泡再生的影响 | 特发性肺纤维化中的甲状腺激素治疗作用 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用bleomycin处理的 mice 作为模型 | NA | NA | NA | NA |
| 388 | 2024-08-07 |
Advanced Progression for the Heterogeneity and Homeostasis of Intestinal Stem Cells
2023-Oct, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-023-10578-2
PMID:37351833
|
综述 | 本文综述了肠道干细胞(ISCs)的异质性和稳态的最新进展,利用类器官和单细胞RNA测序技术阐明了细胞异质性 | 通过类器官和单细胞RNA测序技术,揭示了ISCs的异质性和稳态的关键因素,并识别了几种潜在的ISCs类型 | ISCs在肠道肿瘤发生、化疗抵抗和结肠癌偶尔复发中的复杂作用仍有待进一步讨论 | 旨在阐明ISCs的复杂性,揭示肠道隐窝微环境的整合,并为治疗开发创造新机会 | 肠道干细胞的异质性和稳态 | NA | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 389 | 2024-08-07 |
Unraveling Mechanisms of Autoimmune Skin Blistering: Applying Single-Cell Transcriptomics to Pemphigus B Cells
2023-10, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.05.004
PMID:37330716
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 390 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells from Kimura disease patient successfully treated with dupilumab
2023-10, Allergology international : official journal of the Japanese Society of Allergology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.alit.2023.06.002
PMID:37349231
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 391 | 2024-08-07 |
Correction to Single-cell RNA sequencing identify SDCBP in ACE2-positive bronchial epithelial cells negatively correlates with COVID-19 severity
2023-Oct, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17778
PMID:37300372
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 392 | 2024-08-07 |
WISP2 downregulation inhibits the osteogenic differentiation of BMSCs in congenital scoliosis by regulating Wnt/β-catenin pathway
2023-10, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2023.166783
PMID:37302424
|
研究论文 | 本研究探讨了WISP2下调通过调节Wnt/β-catenin通路抑制先天性脊柱侧弯中BMSCs的成骨分化 | 首次揭示了WISP2在先天性脊柱侧弯中通过Wnt/β-catenin信号通路调控BMSCs成骨分化的作用 | NA | 揭示BMSCs在先天性脊柱侧弯中的作用及其机制 | 先天性脊柱侧弯患者的BMSCs和健康捐赠者的BMSCs | NA | 先天性脊柱侧弯 | scRNA-seq, RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 先天性脊柱侧弯患者和健康捐赠者的BMSCs | NA | NA | NA | NA |
| 393 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics identifies perturbed molecular pathways in midbrain organoids using α-synuclein triplication Parkinson's disease patient-derived iPSCs
2023-Oct, Neuroscience research
IF:2.4Q3
DOI:10.1016/j.neures.2023.06.001
PMID:37271312
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学识别帕金森病患者来源的中脑器官中受扰动的分子通路 | 首次深入分析SNCA三重拷贝、揭示多巴胺神经元中氧化磷酸化、翻译和内质网蛋白折叠的分子功能障碍 | NA | 研究中脑多巴胺神经元在帕金森病中的变化及其分子机制 | 通过来自健康和帕金森病患者的诱导性多能干细胞生成的中脑器官 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自健康和帕金森病捐赠者的iPSC生成的中脑器官 | NA | NA | NA | NA |
| 394 | 2024-08-07 |
Comprehensive analyses of brain cell communications based on multiple scRNA-seq and snRNA-seq datasets for revealing novel mechanism in neurodegenerative diseases
2023-10, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14280
PMID:37269061
|
研究论文 | 本研究基于多组scRNA-seq和snRNA-seq数据,系统分析了大脑细胞间的通信,揭示了神经退行性疾病中的新机制 | 本研究整合了四种方法评估六种主要脑细胞类型间的配体-受体相互作用得分,并构建了阿尔茨海默病早期预测模型 | NA | 探索大脑细胞通信,揭示正常脑功能和神经退行性疾病中的生物学机制 | 大脑细胞通信,特别是神经退行性疾病中的细胞通信 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | scRNA-seq, snRNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 共提取了1,039,459个细胞,来自28个脑单细胞RNA测序(scRNA-seq)或单核RNA测序(snRNA-seq)数据集,包括12个人类和16个老鼠数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 395 | 2024-08-05 |
Expression of Rab25 is down-regulated in the foreskin of children with hypospadias
2023-10, Journal of pediatric urology
IF:2.0Q2
DOI:10.1016/j.jpurol.2023.05.006
PMID:37246119
|
研究论文 | 本研究探讨了Rab25在隐睾症儿童包皮组织中的表达情况 | 首次报告了Rab25在隐睾症患者包皮组织中的异常表达 | 研究样本量相对较小且仅限于某一地区的儿童 | 探讨Rab25在隐睾症发病机制中的关键分子调控作用 | 18名接受隐睾症修复手术的儿童及18名有包茎的儿童作为对照组 | 数字病理学 | 隐睾症 | 免疫组化、西方印迹、免疫荧光和聚合酶链反应 | NA | 生物样本 | 36名儿童(18名隐睾症儿童和18名包茎儿童) | NA | NA | NA | NA |
| 396 | 2024-08-07 |
Tissue-specific transcriptome analyses in Drosophila provide novel insights into the mode of action of the insecticide spinosad and the function of its target, nAChRα6
2023-Oct, Pest management science
IF:3.8Q1
DOI:10.1002/ps.7585
PMID:37248207
|
研究论文 | 通过RNA测序比较了低剂量暴露下spinosad和imidacloprid的转录特征,揭示了它们对果蝇组织特异性基因表达的影响 | 发现了spinosad对溶酶体功能、蛋白质折叠和生殖相关基因的独特影响,并确认了nAChRα6在脂肪体细胞和雄性生殖细胞中的表达 | NA | 研究杀虫剂spinosad和imidacloprid的作用机制及其对目标nAChRα6功能的影响 | 果蝇的组织特异性转录组 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 397 | 2024-08-07 |
CellEnBoost: A Boosting-Based Ligand-Receptor Interaction Identification Model for Cell-to-Cell Communication Inference
2023-10, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2023.3278685
PMID:37216267
|
研究论文 | 本文开发了一种基于Boosting的配体-受体相互作用识别模型CellEnBoost,用于细胞间通信的推断 | CellEnBoost模型结合了Light梯度提升机和AdaBoost以及卷积神经网络,用于预测和过滤配体-受体相互作用,并通过结合细胞间通信强度测量和单细胞RNA测序数据进行验证 | NA | 旨在识别肿瘤微环境中癌细胞自身及癌细胞与正常细胞间的通信,以帮助理解癌症的发生、发展和转移 | 细胞间通信及配体-受体相互作用 | 机器学习 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | CNN | 数据集 | 收集了四个配体-受体相互作用数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 398 | 2024-08-08 |
A Carboxy-terminal Smarcb1 Point Mutation Induces Hydrocephalus Formation and Affects AP-1 and Neuronal Signalling Pathways in Mice
2023-Oct, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-023-01361-5
PMID:37219662
|
研究论文 | 本文通过建立一个新的携带羧基端Smarcb1 c.1148del点突变的小鼠模型,研究了该突变对小鼠大脑发育的影响。 | 首次探讨了特定非截断型Smarcb1突变的影响,并通过磁共振成像、组织学和单细胞RNA测序技术进行了深入分析。 | 仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证这些发现。 | 研究SMARCB1突变对神经发育的影响及其相关表型。 | 携带羧基端Smarcb1 c.1148del点突变的小鼠。 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 磁共振成像、组织学、单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 图像、组织切片、RNA序列 | 新生突变小鼠的脑组织 | NA | NA | NA | NA |
| 399 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic data reveal the increase in extracellular matrix organization and antigen presentation abilities of fibroblasts and smooth muscle cells in patients with pelvic organ prolapse
2023-Oct, International urogynecology journal
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s00192-023-05539-9
PMID:37222740
|
研究论文 | 研究通过单细胞转录组测序分析了盆腔器官脱垂患者阴道壁中成纤维细胞和平滑肌细胞的细胞特性变化 | 首次揭示了盆腔器官脱垂患者中成纤维细胞和平滑肌细胞的细胞外基质组织和抗原呈递能力增强的现象 | 研究样本量较小,仅包括5例盆腔器官脱垂患者和5例对照组 | 探索盆腔器官脱垂中成纤维细胞和平滑肌细胞的细胞特性,以增进对盆腔器官脱垂分子机制的理解 | 盆腔器官脱垂患者的成纤维细胞和平滑肌细胞 | 数字病理学 | 盆腔器官脱垂 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 5例盆腔器官脱垂患者和5例对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 400 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the cellular and molecular characteristics of high-grade and metastatic bladder cancer
2023-Oct, Cellular oncology (Dordrecht)
DOI:10.1007/s13402-023-00820-x
PMID:37170046
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了高级别和转移性膀胱癌的细胞和分子特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了膀胱癌的细胞类型比例和基因表达谱,揭示了肿瘤微环境中细胞间的通信机制 | NA | 探究高级别和转移性膀胱癌的细胞和分子特征,为未来的治疗提供潜在的治疗靶点 | 膀胱癌的邻近正常组织、原发肿瘤和淋巴结转移样本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 共50,158个细胞 | NA | NA | NA | NA |