单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 415 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-08-05 |
Clonal dynamics and copy number variants by single-cell analysis in leukemic evolution of myeloproliferative neoplasms
2023-10, American journal of hematology
IF:10.1Q1
DOI:10.1002/ajh.27013
PMID:37399248
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了骨髓增生性肿瘤（MPN）向急性转变的克隆动态和拷贝数变异 | 首次利用单细胞测序技术揭示了MPN在急性转变过程中的克隆轨迹和拷贝数变异 | 仅分析了10名患者的配对样本，样本量较小可能影响广泛适用性 | 探讨骨髓增生性肿瘤从慢性相向急性相转化的机制 | 研究对象为10名骨髓增生性肿瘤患者的慢性和急性配对样本 | 数字病理学 | 血液癌症 | 单细胞测序 (SCS) | NA | 基因拷贝数数据 | 10名患者的慢性和急性配对样本 |
| 382 | 2024-08-05 |
Heterogeneity of T cells in periapical lesions and in vitro validation of the proangiogenic effect of GZMA on HUVECs
2023-Oct, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.13951
PMID:37400946
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研究论文 | 本研究探讨了T细胞在慢性根尖周炎中的作用，并验证了GZMA对HUVECs的促血管生成效应 | 本研究提供了T细胞在根尖周病变中的异质性新见解，并揭示了GZMA在调节HUVECs血管生成中的潜在作用 | 样本数量有限，仅包括五个慢性根尖周炎病例 | 研究慢性根尖周炎中T细胞的作用及GZMA在血管生成中的调节机制 | 慢性根尖周炎患者的T细胞及其对HUVECs的影响 | 数字病理学 | 慢性根尖周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 五个慢性根尖周炎病例的样本 |
| 383 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of mitochondrial dysfunction and necroptosis in intracranial aneurysms from the perspective of predictive, preventative, and personalized medicine
2023-10, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-023-01865-x
PMID:37410216
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研究论文 | 本研究探讨了线粒体功能障碍和程序性坏死在颅内动脉瘤中的作用 | 研究首次揭示了线粒体功能障碍和程序性坏死在颅内动脉瘤形成中的重要性，并确定了几个关键基因 | 研究的样本大小和来源可能影响结果的普适性 | 探索线粒体功能障碍和程序性坏死在颅内动脉瘤的预测、预防和个性化医学中的应用 | 75个颅内动脉瘤样本和37个对照样本的转录组数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq | 机器学习 | 基因表达数据 | 75个颅内动脉瘤样本和37个对照样本 |
| 384 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Provides New Insights into Therapeutic Roles of Thyroid Hormone in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2023-10, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0080OC
PMID:37402274
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了甲状腺激素3,5,3'-三碘甲状腺原氨酸（T）在特发性肺纤维化中的治疗作用及其对肺泡再生的影响 | 首次在单细胞水平上揭示了甲状腺激素T通过调节肺泡上皮细胞、巨噬细胞和成纤维细胞的状态和细胞间通讯，促进肺泡再生和减轻纤维化的机制 | NA | 探索甲状腺激素在特发性肺纤维化中的治疗作用及其对肺泡再生的影响 | 特发性肺纤维化中的甲状腺激素治疗作用 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用bleomycin处理的 mice 作为模型 |
| 385 | 2024-08-07 |
Integrated single-cell RNA sequencing analysis reveals a mesenchymal stem cell-associated signature for estimating prognosis and drug sensitivity in gastric cancer
2023-Oct, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05058-6
PMID:37410142
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，识别与间充质干细胞相关的标志物，用于预测胃癌患者的预后和药物敏感性 | 开发了一种基于间充质干细胞标志基因的风险特征，不仅能预测胃癌患者的预后，还能反映抗肿瘤治疗的疗效 | NA | 识别间充质干细胞相关标志物在胃癌中的预后价值 | 胃癌患者的预后和药物敏感性 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 174个间充质干细胞标志基因，TCGA-STAD和GEO数据库中的数据 |
| 386 | 2024-08-07 |
Advanced Progression for the Heterogeneity and Homeostasis of Intestinal Stem Cells
2023-Oct, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-023-10578-2
PMID:37351833
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综述 | 本文综述了肠道干细胞（ISCs）的异质性和稳态的最新进展，利用类器官和单细胞RNA测序技术阐明了细胞异质性 | 通过类器官和单细胞RNA测序技术，揭示了ISCs的异质性和稳态的关键因素，并识别了几种潜在的ISCs类型 | ISCs在肠道肿瘤发生、化疗抵抗和结肠癌偶尔复发中的复杂作用仍有待进一步讨论 | 旨在阐明ISCs的复杂性，揭示肠道隐窝微环境的整合，并为治疗开发创造新机会 | 肠道干细胞的异质性和稳态 | NA | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 387 | 2024-08-07 |
Identification and validation of cancer-associated fibroblast-related subtypes and the prognosis model of biochemical recurrence in prostate cancer based on single-cell and bulk RNA sequencing
2023-Oct, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05011-7
PMID:37369799
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序技术，识别和验证了与癌症相关成纤维细胞（CAFs）相关的亚型，并开发了前列腺癌生化复发（BCR）相关的CAF预测模型。 | 本研究首次通过非负矩阵分解（NMF）聚类方法，基于CAF相关基因揭示了肿瘤微环境（TME）的免疫特征差异，并建立了BCR相关的CAF签名，用于准确预测前列腺癌患者的预后和免疫治疗反应。 | NA | 研究前列腺癌中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的特征，并开发预测前列腺癌患者生化复发（BCR）的CAF签名。 | 前列腺癌患者的癌症相关成纤维细胞（CAFs）及其在生化复发（BCR）中的作用。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序 | 非负矩阵分解（NMF） | RNA序列数据 | 来自TCGA和GEO数据库的批量RNA-seq数据，以及从GEO数据库下载的单细胞RNA测序数据 |
| 388 | 2024-08-05 |
Investigation and verification of GIMAP6 as a robust biomarker for prognosis and tumor immunity in lung adenocarcinoma
2023-Oct, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-04980-z
PMID:37338641
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研究论文 | 本研究探讨了GIMAP6在肺腺癌中的预后和肿瘤免疫中的作用 | 确认GIMAP6作为一个有效的预后分子，并参与肺腺癌免疫微环境的调节 | 未提及具体的限制 | 探索GIMAP6在肺腺癌发展及肿瘤免疫中的影响 | 肺腺癌患者和细胞模型 | 数字病理 | 肺癌 | 反转录定量PCR、西方印迹、细胞计数试剂盒-8及其他细胞实验 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未提及 |
| 389 | 2024-08-05 |
Comprehensive landscape of the miRNA-regulated prognostic marker LAYN with immune infiltration and stemness in pan-cancer
2023-Oct, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-04986-7
PMID:37335337
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研究论文 | 本文研究了miRNA调控的预后标志物LAYN在全癌症中的免疫浸润和干性方面的综合特征 | 揭示了LAYN在多种癌症中的功能机制，并为癌症预后、转移和免疫疗法提供了新见解 | 对LAYN的研究在全癌症的广泛性和深入性方面仍然有限 | 探讨LAYN在全癌症中的作用及其潜在的临床应用 | 主要研究了LAYN在不同类型癌症中的表达情况及其与预后的关系 | 数字病理学 | NA | 生物信息学方法和单细胞测序 | NA | 样本数据，包括健康和癌症患者的基因组数据 | 通过GTEx和TCGA数据库收集健康和癌症患者样本 |
| 390 | 2024-08-07 |
Unraveling Mechanisms of Autoimmune Skin Blistering: Applying Single-Cell Transcriptomics to Pemphigus B Cells
2023-10, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.05.004
PMID:37330716
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 391 | 2024-08-07 |
Identification a unique disulfidptosis classification regarding prognosis and immune landscapes in thyroid carcinoma and providing therapeutic strategies
2023-Oct, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05006-4
PMID:37347261
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研究论文 | 本研究探讨了二硫化物死亡（disulfidptosis）与甲状腺癌（THCA）预后之间的关系，并基于二硫化物死亡相关基因开发了一个预后指数 | 本研究首次利用二硫化物死亡相关基因进行分类，并开发了一个新的分类系统，能够有效预测甲状腺癌患者的临床预后和药物敏感性 | NA | 研究二硫化物死亡与甲状腺癌预后的关联，并开发基于二硫化物死亡基因的预后指数 | 甲状腺癌患者及其预后 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 非负矩阵分解（NMF） | Enet模型 | 基因表达数据、体细胞突变信息、拷贝数变异数据、临床数据 | 甲状腺癌患者的基因表达数据、体细胞突变信息、拷贝数变异数据和临床数据来自TCGA数据库，单细胞转录组数据GSE184362来自GEO数据库 |
| 392 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells from Kimura disease patient successfully treated with dupilumab
2023-10, Allergology international : official journal of the Japanese Society of Allergology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.alit.2023.06.002
PMID:37349231
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 393 | 2024-08-07 |
Correction to Single-cell RNA sequencing identify SDCBP in ACE2-positive bronchial epithelial cells negatively correlates with COVID-19 severity
2023-Oct, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17778
PMID:37300372
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 394 | 2024-08-07 |
WISP2 downregulation inhibits the osteogenic differentiation of BMSCs in congenital scoliosis by regulating Wnt/β-catenin pathway
2023-10, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2023.166783
PMID:37302424
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研究论文 | 本研究探讨了WISP2下调通过调节Wnt/β-catenin通路抑制先天性脊柱侧弯中BMSCs的成骨分化 | 首次揭示了WISP2在先天性脊柱侧弯中通过Wnt/β-catenin信号通路调控BMSCs成骨分化的作用 | NA | 揭示BMSCs在先天性脊柱侧弯中的作用及其机制 | 先天性脊柱侧弯患者的BMSCs和健康捐赠者的BMSCs | NA | 先天性脊柱侧弯 | scRNA-seq, RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 先天性脊柱侧弯患者和健康捐赠者的BMSCs |
| 395 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics identifies perturbed molecular pathways in midbrain organoids using α-synuclein triplication Parkinson's disease patient-derived iPSCs
2023-Oct, Neuroscience research
IF:2.4Q3
DOI:10.1016/j.neures.2023.06.001
PMID:37271312
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学识别帕金森病患者来源的中脑器官中受扰动的分子通路 | 首次深入分析SNCA三重拷贝、揭示多巴胺神经元中氧化磷酸化、翻译和内质网蛋白折叠的分子功能障碍 | NA | 研究中脑多巴胺神经元在帕金森病中的变化及其分子机制 | 通过来自健康和帕金森病患者的诱导性多能干细胞生成的中脑器官 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自健康和帕金森病捐赠者的iPSC生成的中脑器官 |
| 396 | 2024-08-07 |
Comprehensive analyses of brain cell communications based on multiple scRNA-seq and snRNA-seq datasets for revealing novel mechanism in neurodegenerative diseases
2023-10, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14280
PMID:37269061
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研究论文 | 本研究基于多组scRNA-seq和snRNA-seq数据，系统分析了大脑细胞间的通信，揭示了神经退行性疾病中的新机制 | 本研究整合了四种方法评估六种主要脑细胞类型间的配体-受体相互作用得分，并构建了阿尔茨海默病早期预测模型 | NA | 探索大脑细胞通信，揭示正常脑功能和神经退行性疾病中的生物学机制 | 大脑细胞通信，特别是神经退行性疾病中的细胞通信 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | scRNA-seq, snRNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 共提取了1,039,459个细胞，来自28个脑单细胞RNA测序（scRNA-seq）或单核RNA测序（snRNA-seq）数据集，包括12个人类和16个老鼠数据集 |
| 397 | 2024-08-05 |
Expression of Rab25 is down-regulated in the foreskin of children with hypospadias
2023-10, Journal of pediatric urology
IF:2.0Q2
DOI:10.1016/j.jpurol.2023.05.006
PMID:37246119
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研究论文 | 本研究探讨了Rab25在隐睾症儿童包皮组织中的表达情况 | 首次报告了Rab25在隐睾症患者包皮组织中的异常表达 | 研究样本量相对较小且仅限于某一地区的儿童 | 探讨Rab25在隐睾症发病机制中的关键分子调控作用 | 18名接受隐睾症修复手术的儿童及18名有包茎的儿童作为对照组 | 数字病理学 | 隐睾症 | 免疫组化、西方印迹、免疫荧光和聚合酶链反应 | NA | 生物样本 | 36名儿童（18名隐睾症儿童和18名包茎儿童） |
| 398 | 2024-08-07 |
Tissue-specific transcriptome analyses in Drosophila provide novel insights into the mode of action of the insecticide spinosad and the function of its target, nAChRα6
2023-Oct, Pest management science
IF:3.8Q1
DOI:10.1002/ps.7585
PMID:37248207
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研究论文 | 通过RNA测序比较了低剂量暴露下spinosad和imidacloprid的转录特征，揭示了它们对果蝇组织特异性基因表达的影响 | 发现了spinosad对溶酶体功能、蛋白质折叠和生殖相关基因的独特影响，并确认了nAChRα6在脂肪体细胞和雄性生殖细胞中的表达 | NA | 研究杀虫剂spinosad和imidacloprid的作用机制及其对目标nAChRα6功能的影响 | 果蝇的组织特异性转录组 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 399 | 2024-08-07 |
CellEnBoost: A Boosting-Based Ligand-Receptor Interaction Identification Model for Cell-to-Cell Communication Inference
2023-10, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2023.3278685
PMID:37216267
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研究论文 | 本文开发了一种基于Boosting的配体-受体相互作用识别模型CellEnBoost，用于细胞间通信的推断 | CellEnBoost模型结合了Light梯度提升机和AdaBoost以及卷积神经网络，用于预测和过滤配体-受体相互作用，并通过结合细胞间通信强度测量和单细胞RNA测序数据进行验证 | NA | 旨在识别肿瘤微环境中癌细胞自身及癌细胞与正常细胞间的通信，以帮助理解癌症的发生、发展和转移 | 细胞间通信及配体-受体相互作用 | 机器学习 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | CNN | 数据集 | 收集了四个配体-受体相互作用数据集 |
| 400 | 2024-08-08 |
A Carboxy-terminal Smarcb1 Point Mutation Induces Hydrocephalus Formation and Affects AP-1 and Neuronal Signalling Pathways in Mice
2023-Oct, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-023-01361-5
PMID:37219662
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研究论文 | 本文通过建立一个新的携带羧基端Smarcb1 c.1148del点突变的小鼠模型，研究了该突变对小鼠大脑发育的影响。 | 首次探讨了特定非截断型Smarcb1突变的影响，并通过磁共振成像、组织学和单细胞RNA测序技术进行了深入分析。 | 仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证这些发现。 | 研究SMARCB1突变对神经发育的影响及其相关表型。 | 携带羧基端Smarcb1 c.1148del点突变的小鼠。 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 磁共振成像、组织学、单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 图像、组织切片、RNA序列 | 新生突变小鼠的脑组织 |