单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 415 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-08-07 |
Targeting the Immunoglobulin IGSF9 Enhances Antitumor T-cell Activity and Sensitivity to Anti-PD-1 Immunotherapy
2023-Oct-13, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-3115
PMID:37506192
|
研究论文 | 本文研究了免疫球蛋白超家族成员9（IGSF9）在肿瘤细胞和肿瘤浸润免疫细胞中的表达，并探讨了其作为免疫检查点在肿瘤免疫逃逸中的作用 | 发现IGSF9通过抑制T细胞增殖和激活促进肿瘤免疫逃逸，为免疫治疗提供了新的靶点 | 研究主要集中在体外和小鼠模型中，需要进一步的人体临床试验验证 | 探索新的免疫检查点以改善癌症患者的免疫治疗反应 | 免疫球蛋白超家族成员9（IGSF9）在肿瘤免疫逃逸中的作用 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及多种癌症类型的肿瘤细胞和肿瘤浸润免疫细胞 |
| 362 | 2024-08-05 |
Single-cell profiling of muscle-infiltrating T cells in idiopathic inflammatory myopathies
2023-10-11, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202217240
PMID:37522383
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研究论文 | 本研究深入分析了特发性炎症性肌病患者中浸润肌肉的T细胞 | 揭示了特发性炎症性肌病患者肌肉组织中存在的记忆T细胞特征，并提供了识别新的治疗靶点的转录组图谱 | 样本量较小，仅涉及六名患者，可能限制结果的普遍性 | 探讨特发性炎症性肌病患者浸润肌肉的T细胞特征 | 六名最近被诊断为特发性炎症性肌病的患者 | 数字病理学 | 特发性炎症性肌病 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 六名患者的肌肉和外周血记忆T细胞 |
| 363 | 2024-08-05 |
Emerging Concepts in Precision Medicine in Axial Spondyloarthritis
2023-10, Current rheumatology reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1007/s11926-023-01113-w
PMID:37505349
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研究论文 | 本文回顾了轴性脊柱关节炎中精准医学的新兴概念和最近发展 | 探讨了多基因风险评分、孟德尔随机化、药物基因组学、单细胞测序和空间转录组学等新思想 | 在临床应用之前，需要大量研究和实施策略 | 探索精准医学在轴性脊柱关节炎患者中的应用 | 关注于轴性脊柱关节炎患者的遗传风险因素和免疫反应 | 数字病理学 | NA | 多基因风险评分、孟德尔随机化、药物基因组学、单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 364 | 2024-08-07 |
NLRRC: A Novel Clustering Method of Jointing Non-Negative LRR and Random Walk Graph Regularized NMF for Single-Cell Type Identification
2023-10, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2023.3299748
PMID:37506010
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研究论文 | 本文提出了一种名为NLRRC的新型矩阵分解方法，用于单细胞类型识别，结合非负低秩表示和随机游走图正则化NMF | NLRRC方法通过非负低秩表示和随机游走图正则化NMF，有效地揭示了细胞的自然分组，提高了单细胞类型识别的准确性 | NA | 研究旨在提高单细胞RNA测序数据分析中细胞聚类的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞聚类 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NMF | 基因表达数据 | 模拟和真实单细胞数据集 |
| 365 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies macrophage signatures correlated with clinical features and tumour microenvironment in meningiomas
2023-10, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.12074
PMID:37515398
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别与脑膜瘤相关的巨噬细胞特征，并分析这些特征与临床特征及肿瘤微环境的关系 | 本研究首次使用高维度加权基因共表达网络分析（hdWGCNA）识别与脑膜瘤相关的巨噬细胞模块基因，并构建了基于这些基因的机器学习模型来预测肿瘤等级 | NA | 旨在识别与脑膜瘤相关的巨噬细胞模块基因，并分析其与临床特征和免疫浸润的相关性 | 脑膜瘤及其相关的巨噬细胞 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 两对脑膜瘤和正常脑膜样本 |
| 366 | 2024-08-05 |
SCM is potential resource for non-invasive preimplantation genetic testing based on human embryos single-cell sequencing
2023-Oct-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2023.147647
PMID:37473972
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研究论文 | 本研究探讨了使用胎胚单细胞测序的非侵入性植入前基因检测的潜力 | 本文章创新点在于提出了使用花球液（SCM）作为更有效的胚胎DNA来源进行植入前基因检测 | 目前非侵入性植入前基因检测的临床应用受到灵敏度和特异性不足的限制 | 本研究旨在提高非侵入性植入前基因检测的有效性 | 本研究的对象为218个人胚胎 | 数字病理学 | NA | 单细胞全基因组扩增（WGA） | NA | 基因组数据 | 218个人胚胎 |
| 367 | 2024-08-05 |
T-cell subsets in allergy and tolerance induction
2023-10, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202249983
PMID:37489248
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研究论文 | 讨论抗原特异性T淋巴细胞在过敏和耐受诱导中的作用 | 介绍了通过多参数流式细胞术和单细胞测序直接表征过敏原特异性T细胞的新技术 | 目前对过敏免疫治疗（AIT）机制的理解仍不完全 | 研究T细胞亚群在健康状态、过敏敏感化过程和AIT中的作用 | 抗原特异性T细胞的不同表型和功能特征 | 数字病理学 | 过敏 | 单细胞测序、多参数流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 368 | 2024-08-05 |
m6A regulator-mediated RNA methylation modification remodels immune microenvironment in dilated cardiomyopathy
2023-Oct, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31085
PMID:37475583
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研究论文 | 本研究探讨了m6A调节因子介导的RNA甲基化对扩张型心肌病中的免疫微环境的重塑作用 | 本研究首次验证了IGFBP2在扩张型心肌病中的关键作用及其在免疫微环境中的重塑机制 | 此研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类的病理情况 | 探讨m6A RNA甲基化如何影响扩张型心肌病患者的免疫微环境 | 扩张型心肌病小鼠模型及相关免疫细胞的研究 | 数字病理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | RNA、蛋白质 | N/A |
| 369 | 2024-08-05 |
High expression of centromere protein A and its molecular mechanism and clinical significance in prostate cancer: A study based on data mining and immunohistochemistry
2023-10, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.12073
PMID:37488766
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研究论文 | 这项研究揭示了中心体蛋白A在前列腺癌中的重要作用及其分子机制和临床意义 | 本研究首次将中心体蛋白A的表达与前列腺癌和转移性前列腺癌的临床病理特征关联起来 | 本研究的局限性在于需要进一步实验验证CENPA在前列腺癌中的具体作用 | 阐明中心体蛋白A在前列腺癌中的重要作用及其临床意义 | 本研究的对象为前列腺癌及转移性前列腺癌患者的数据 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA测序和免疫组化 | NA | RNA数据 | 使用了大量的RNA测序数据及内部免疫组化数据 |
| 370 | 2024-08-05 |
Transcriptomic evidence for Brachyury expression in the caudal tip region of adult Ptychodera flava (Hemichordata)
2023-Oct, Development, growth & differentiation
DOI:10.1111/dgd.12882
PMID:37483093
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研究论文 | 本文展示了在成年Ptychodera flava的尾端区域中Brachyury基因的表达情况 | 首次在成年阶段发现Brachyury基因的表达，扩展了对这一基因在发育过程中作用的理解 | 需要进一步研究Brachyury在成年个体中的具体功能 | 探讨Brachyury基因在成年Ptychodera flava中的表达模式及其潜在功能 | 成人Ptychodera flava的尾端区域细胞 | NA | NA | Iso-Seq, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | 使用了成年Ptychodera flava的样本 |
| 371 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis profiles cellular and molecular alterations in submandibular gland and blood in IgG4-related disease
2023-10, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224363
PMID:37474274
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了IgG4相关疾病中颌下腺和外周血单个核细胞的细胞和分子改变 | 发现了IgG4相关疾病中颌下腺内三种新的组织驻留免疫细胞亚群，并揭示了免疫细胞与非免疫细胞间的通信模式变化 | NA | 旨在通过单细胞水平分析IgG4相关疾病受累组织和外周血单个核细胞的转录组图谱，以识别细胞群体及其间的相互作用，从而理解IgG4相关疾病的病因 | IgG4相关疾病患者的颌下腺和外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | IgG4相关疾病患者和匹配对照组的颌下腺和外周血单个核细胞样本 |
| 372 | 2024-08-07 |
Dual-GCN-based deep clustering with triplet contrast for ScRNA-seq data analysis
2023-Oct, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本文提出了一种基于双图卷积网络（Dual-GCN）和三元组对比的深度聚类方法（scDGDC），用于单细胞RNA测序（ScRNA-seq）数据分析中的降维和聚类 | 引入了双图卷积网络编码器以捕获更全面的拓扑信息，并使用三元组对比来减少图卷积网络的过度平滑问题 | 现有的基于图的深度聚类算法在构建细胞图时忽略了节点的分布信息，导致嵌入表示中的信息不完整 | 优化单细胞RNA测序数据分析中的聚类和降维任务 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq） | 图卷积网络（GCN） | 基因表达数据 | 八个真实单细胞RNA测序数据集 |
| 373 | 2024-08-07 |
Corrigendum to "A single-cell RNA-seq analysis of early larval cell-types of the starfish, Patiria pectinifera: Insights into evolution of the chordate body plan" [Dev. Biol. 496 (2023) 52-62]
2023-Oct, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2023.06.014
PMID:37454579
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 374 | 2024-08-07 |
Cross-species analysis and comparison of the inner ear between chickens and mice
2023-10, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25524
PMID:37462291
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研究论文 | 本研究通过比较鸡和鼠的内耳结构，利用RNA测序技术分析了同源基因的表达，并探讨了内耳结构形成的基因表达模式 | 首次进行了鸡和鼠内耳结构的跨物种比较分析，并利用单细胞RNA测序和批量RNA-Seq技术揭示了内耳结构形成的基因表达模式 | NA | 探讨不同物种内耳结构的细胞和分子基础 | 鸡和鼠的内耳结构 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | 鸡和鼠的内耳组织 |
| 375 | 2024-08-07 |
Inhibitory Neurons in Nucleus Tractus Solitarius Are Involved in Decrease of Heart Rate Variability and Development of Depression-Like Behaviors in Temporal Lobe Epilepsy
2023-10-19, The international journal of neuropsychopharmacology
DOI:10.1093/ijnp/pyad033
PMID:37417335
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研究论文 | 研究抑制性神经元在延髓孤束核中对颞叶癫痫患者心率变异性下降和抑郁样行为发展的作用 | 首次报道了心率变异性与颞叶癫痫合并抑郁症在不同阶段的相关性，并发现心率变异性中枢控制相关的抑制性神经元在颞叶癫痫中抑郁的发展中起作用 | NA | 探讨心率变异性在颞叶癫痫尤其是伴有抑郁障碍的癫痫中的机制 | 心率变异性、自发反复发作和抑郁样行为在匹鲁卡平诱导的颞叶癫痫小鼠不同阶段的表现 | 神经科学 | 癫痫 | 单细胞RNA测序分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 376 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing and bulk RNA data reveal the tumor microenvironment infiltration characteristics of disulfidptosis related genes in breast cancer
2023-Oct, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05109-y
PMID:37428249
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研究论文 | 本研究揭示了与二硫化物凋亡相关基因在乳腺癌肿瘤微环境中的浸润特征 | 本研究首次探讨了二硫化物凋亡在乳腺癌中的预后价值及其在免疫微环境中的作用 | 未对二硫化物凋亡在其他癌症类型中的影响进行评估 | 研究二硫化物凋亡相关基因在乳腺癌中的作用及其对免疫治疗的影响 | 乳腺癌患者的单细胞测序数据和散装RNA数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序，bulk RNA测序 | 风险评估模型 | 基因表达数据 | NA |
| 377 | 2024-08-05 |
A multi-omics integrative approach unravels novel genes and pathways associated with senescence escape after targeted therapy in NRAS mutant melanoma
2023-10, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-023-00640-z
PMID:37420093
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研究论文 | 本研究揭示了NRAS突变黑色素瘤在靶向治疗后与衰老逃逸相关的新基因和通路 | 首次将胰岛素信号传导与持续衰老表型的维持相关联，并提出干扰素γ在衰老逃逸中的新角色 | 尚未明确实验的临床适用性和结果的真实世界验证 | 研究癌细胞如何逃逸衰老，以优化靶向疗法的临床效果 | 三种不同的NRAS突变黑色素瘤细胞系的反应特征 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA-seq | NA | 转录组数据、miRNA相互作用组数据 | 三种不同类型的NRAS突变黑色素瘤细胞系 |
| 378 | 2024-08-07 |
Lsd1 safeguards T-cell development via suppressing endogenous retroelements and interferon responses
2023-10, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202302042
PMID:37429639
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研究论文 | 本研究探讨了组蛋白去甲基化酶Lsd1在胸腺细胞发育中的生理功能 | 首次揭示了Lsd1通过抑制内源性逆转录元件和干扰素反应来维持早期T细胞发育中的内源性逆转录元件稳态 | NA | 探究Lsd1在胸腺细胞发育中的作用 | 胸腺细胞中的Lsd1功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序、链特异性总RNA-seq和ChIP-seq分析 | NA | RNA | 小鼠胸腺细胞 |
| 379 | 2024-08-05 |
TALKIEN: crossTALK IntEraction Network. A web-based tool for deciphering molecular communication through ligand-receptor interactions
2023-Oct-30, Molecular omics
IF:3.0Q3
DOI:10.1039/d3mo00049d
PMID:37403821
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研究论文 | TALKIEN是一个用于通过配体-受体相互作用解析分子通信的在线工具 | 提供了一种简单直观的在线应用程序来可视化分子交互信息，并构建和分析蛋白质-蛋白质相互作用网络 | 具体的单细胞序列或空间转录组数据解析能力仍然未详细讨论 | 研究不同细胞类型之间的分子交流及其在癌症研究中的重要性 | 输入基因或蛋白质列表，以代表不同的细胞谱系 | 数字病理学 | 癌症 | 系统生物学技术 | NA | 基因或蛋白质列表 | NA |
| 380 | 2024-08-05 |
Spatial regulation of plant hormone action
2023-10-13, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erad244
PMID:37401809
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研究论文 | 本文综述了植物激素作用的空间调控机制 | 探讨了植物激素传感器技术的新发展，提供了前所未有的空间域分辨率 | NA | 研究植物激素在不同植物部分的空间特异性作用及其调控机制 | 植物激素及其对植物生长和发育的影响 | NA | NA | FRET和单细胞RNA-seq | NA | NA | NA |