单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 415 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2024-08-07 |
Arl4c is involved in tooth germ development through osteoblastic/ameloblastic differentiation
2023-10-30, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2023.09.014
PMID:37703759
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能丧失实验，探讨了Arl4c在小鼠牙胚发育中的作用及其通过成骨细胞/成釉细胞分化的机制 | 首次揭示了Arl4c在牙胚发育中的具体作用，并通过RNA测序和基因本体分析验证了其在成骨细胞/成釉细胞分化中的关键作用 | 实验主要集中在小鼠模型上，未来研究需要进一步验证在其他物种中的适用性 | 探究Arl4c在牙胚发育中的作用及其分子机制 | 小鼠牙胚发育过程中的成骨细胞/成釉细胞分化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), RNA测序 (RNA-seq) | NA | RNA | 涉及P1和P7小鼠磨牙和切牙的成牙本质细胞和成釉上皮细胞 |
| 322 | 2024-08-07 |
Gut bacteria induce IgA expression in pituitary hormone-secreting cells during aging
2023-Oct-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107747
PMID:37692284
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了衰老过程中垂体细胞群的变化和全局转录变化，发现免疫球蛋白A（IgA）在衰老的垂体中表达增加，并且这种表达受肠道微生物的调控。 | 首次发现垂体激素分泌细胞在衰老过程中能够产生IgA，并且这一过程受肠道细菌的影响。 | NA | 研究衰老过程中垂体激素分泌的基因调控机制。 | 衰老过程中的垂体细胞和肠道微生物。 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 具体样本数量未提及 |
| 323 | 2024-08-05 |
Single-cell characterization of neovascularization using hiPSC-derived endothelial cells in a 3D microenvironment
2023-10-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.08.008
PMID:37714147
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研究论文 | 这篇文章研究了利用人诱导 pluripotent 干细胞衍生的内皮细胞在 3D 微环境中进行新血管生成的单细胞特征。 | 文章提出了一种全面的单细胞转录组学研究，探讨了内皮细胞和共演化的壁细胞的发展与塑性，并发现了新的血管生成信号。 | 文章未详细说明在不同微环境中内皮细胞的具体生长条件和限制因素。 | 本研究的目的是为未来组织工程中的血管化提供体外的指导。 | 研究对象为人诱导 pluripotent 干细胞衍生的内皮细胞及其与其他细胞的相互作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 324 | 2024-08-05 |
Constructing heterogeneous single-cell landscape and identifying microenvironment molecular characteristics of primary and lymphatic metastatic head and neck squamous cell carcinoma
2023-10, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107459
PMID:37713790
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研究论文 | 本研究聚焦于利用单细胞和批量转录组数据构建原发性和淋巴转移头颈鳞状细胞癌的异质性微环境图谱 | 该文章通过单细胞转录组技术揭示了不同疾病状态下细胞群体的特征以及癌症和免疫细胞发育轨迹的差异 | 样本量可能限制了结果的普遍性，尤其是在特定亚型的外推 | 研究头颈鳞状细胞癌的微环境分子特征以揭示其异质性 | 研究了23个HNSCC样本和546个TCGA的HNSCC样本 | 数字病理学 | 头颈癌 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 23个HNSCC样本和546个TCGA HNSCC样本 |
| 325 | 2024-08-07 |
Recovery of missing single-cell RNA-sequencing data with optimized transcriptomic references
2023-Oct, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-02003-w
PMID:37697162
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研究论文 | 本文研究了单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中基因表达数据的缺失问题，并提出通过优化参考转录组来恢复这些数据 | 提出了一种优化参考转录组的方法，通过恢复假间基因读取、实施混合前mRNA映射策略和解决基因重叠来恢复缺失的基因表达数据 | NA | 提高单细胞RNA测序数据的细胞表征分辨率，揭示缺失的细胞类型和标记基因 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达数据缺失问题 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 多种小鼠和人类组织数据 |
| 326 | 2024-08-07 |
Physiological and immune profiling of tilapia Oreochromis niloticus gills by high-throughput single-cell transcriptome sequencing
2023-Oct, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2023.109070
PMID:37709178
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研究论文 | 本文通过高通量单细胞转录组测序技术，对罗非鱼鳃部的生理和免疫功能进行了深入研究 | 首次报道了罗非鱼鳃部在单细胞水平上的功能异质性 | NA | 探究罗非鱼鳃部的生理和免疫功能 | 罗非鱼鳃部的细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 12种细胞群体 |
| 327 | 2024-08-07 |
A paradigm shift in the prevention and diagnosis of oral squamous cell carcinoma
2023-Oct, Journal of oral pathology & medicine : official publication of the International Association of Oral Pathologists and the American Academy of Oral Pathology
IF:2.7Q2
DOI:10.1111/jop.13484
PMID:37710407
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研究论文 | 本文探讨了通过非侵入性刷取活检和深度学习技术来提高口腔鳞状细胞癌（OSCC）的预防和诊断效率 | 引入了非侵入性刷取活检和深度学习技术进行细胞学诊断，以及单细胞RNA测序技术来分析口腔角质细胞 | NA | 提高口腔鳞状细胞癌的早期诊断和治疗效果 | 口腔鳞状细胞癌及其前驱病变 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 细胞学样本 | 多中心前瞻性研究中的大量口腔角质细胞样本 |
| 328 | 2024-08-07 |
Metabolic and functional remodeling of colonic macrophages in response to high-fat diet-induced obesity
2023-Oct-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107719
PMID:37674984
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研究论文 | 本文研究了高脂饮食诱导的肥胖对结肠固有层巨噬细胞功能和代谢的影响 | 通过单细胞RNA测序识别出在高脂饮食中增加的负责脂质相关巨噬细胞特征的亚群 | NA | 探究高脂饮食诱导的肥胖对结肠固有层巨噬细胞的影响 | 结肠固有层巨噬细胞的功能和代谢 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达 | NA |
| 329 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics of a lycophyte root sheds light on root evolution
2023-10-09, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2023.08.030
PMID:37683643
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学探讨了蕨类植物根部的进化及相关基因的表达模式 | 首次揭示了在蕨类植物根冠形成中WOX基因的新潜在作用 | 主要集中于一种蕨类植物，缺乏对其他种类蕨类植物的比较研究 | 研究蕨类植物根部的进化及其分子机制 | 蕨类植物Selaginella moellendorffii的根部 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 根部相关的97个基因 |
| 330 | 2024-08-05 |
Noninvasive radiomics model reveals macrophage infiltration in glioma
2023-10-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2023.216380
PMID:37660885
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研究论文 | 本研究评估了放射组学生物标志物在胶质瘤中的预后作用，并探讨其与肿瘤微环境和巨噬细胞浸润的关系 | 文章创新性地开发了放射组学生存生物标志物RadSurv，显示出其在胶质瘤风险分层中的高效性 | 研究中使用的样本仅限于三个独立的数据集，可能存在外部验证不足的局限性 | 旨在评估胶质瘤的放射组学生物标志物的预后方面 | 研究对象为664名胶质瘤患者的术前MRI数据 | 数字病理学 | 胶质瘤 | MRI | NA | 影像 | 664名胶质瘤患者的术前MRI |
| 331 | 2024-08-05 |
System analysis based on glutamine catabolic-related enzymes identifies GPT2 as a novel immunotherapy target for lung adenocarcinoma
2023-10, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107415
PMID:37657356
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研究论文 | 本文研究了谷氨酸代谢相关酶在肺腺癌中的作用，并确定GPT2作为一种新的免疫治疗靶点 | 首次揭示了谷氨酸代谢相关酶在肿瘤免疫微环境中的关键作用，并确认了GPT2作为一种有前景的治疗靶点 | 当前文献关于谷氨酸代谢相关酶在肺腺癌中的功能仍然有限 | 探讨谷氨酸依赖性对肺腺癌细胞生长的影响及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 肺腺癌细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | C57BL/6小鼠中注射了Lewis肺癌细胞 |
| 332 | 2024-08-05 |
The role of regulatory T cells in the pathogenesis of acute kidney injury
2023-Oct, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17771
PMID:37667551
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研究论文 | 本研究探讨调节性T细胞在急性肾损伤发病机制中的作用 | 揭示了AKI组与非AKI组在调节性T细胞及免疫微环境的显著差异 | 目前对调节性T细胞与AKI其他免疫微环境成分之间的关系了解不够 | 研究调节性T细胞在急性肾损伤发病机制中的作用 | 急性肾损伤患者与正常肾组织的免疫细胞差异研究 | 数字病理 | 急性肾损伤 | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 五个AKI数据集和五个正常肾组织样本 |
| 333 | 2024-08-07 |
Intratumoral CD103+ CD8+ T cells predict response to neoadjuvant chemoimmunotherapy in advanced head and neck squamous cell carcinoma
2023-10, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12480
PMID:37658605
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重免疫荧光染色技术，探讨了肿瘤内CD103+ CD8+ T细胞在预测头颈部鳞状细胞癌患者对新辅助化疗免疫治疗反应中的作用 | 首次确定肿瘤内CD103+ CD8+ T细胞密度作为新辅助化疗免疫治疗效果的决定因素，并发现PD-1阻断和靶向TREM2+巨噬细胞可能增强这些T细胞的抗肿瘤活性 | 需要进一步的临床研究来验证提升CD103+ CD8+ T细胞群体的策略 | 识别预测头颈部鳞状细胞癌患者对新辅助化疗免疫治疗反应的准确生物标志物 | 头颈部鳞状细胞癌患者及其对新辅助化疗免疫治疗的反应 | NA | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重免疫荧光（mIHC） | NA | 细胞数据、图像数据 | 来自接受新辅助化疗免疫治疗的头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤样本 |
| 334 | 2024-08-07 |
scAAGA: Single cell data analysis framework using asymmetric autoencoder with gene attention
2023-10, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107414
PMID:37660567
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研究论文 | 本文提出了一种名为scAAGA的新型单细胞RNA测序数据分析框架，利用带有基因注意力模块的不对称自编码器来适应性地学习重要的基因特征，以提高聚类效果 | scAAGA框架采用不对称自编码器与基因注意力模块，能够适应性地学习单细胞RNA测序数据中的重要基因特征，从而提升聚类效果 | NA | 提高单细胞RNA测序数据分析中的聚类效果，特别是在COVID-19研究中的应用 | COVID-19患者外周血单个核细胞（PBMC）的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 不对称自编码器 | 单细胞RNA测序数据 | 外周血单个核细胞（PBMC） |
| 335 | 2024-08-07 |
Deciphering the heterogeneity and immunosuppressive function of regulatory T cells in osteosarcoma using single-cell RNA transcriptome
2023-Oct, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107417
PMID:37669584
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了骨肉瘤中的调节性T细胞及其在肿瘤微环境中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了骨肉瘤中调节性T细胞的异质性及其在肿瘤生长和进展中的作用 | 研究主要基于数据分析，需要进一步的实验验证 | 探究骨肉瘤中调节性T细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的免疫抑制功能 | 骨肉瘤中的调节性T细胞及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个骨肉瘤样本及其邻近组织 |
| 336 | 2024-08-07 |
High urea induces anxiety disorders associated with chronic kidney disease by promoting abnormal proliferation of OPC in amygdala
2023-Oct-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2023.175905
PMID:37640220
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研究论文 | 本研究探讨了高尿素水平通过促进杏仁核中少突胶质细胞前体细胞（OPC）的异常增殖，导致慢性肾脏病（CKD）患者焦虑障碍的病理作用及分子机制 | 首次揭示了高尿素在CKD相关焦虑障碍中的病理作用及其分子机制，并提供了客观的血清学指标和潜在的新药物靶点 | NA | 研究高尿素在慢性肾脏病相关焦虑障碍中的病理作用及其分子机制 | 慢性肾脏病患者的焦虑障碍及高尿素的影响 | 神经科学 | 慢性肾脏病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 使用腺嘌呤诱导的CKD小鼠模型和UT-B小鼠模型进行研究 |
| 337 | 2024-08-07 |
Thyroid hormone receptor α1: a novel regulator of thyroid cancer cell differentiation
2023-10, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-023-02815-2
PMID:37634007
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研究论文 | 本文探讨了甲状腺激素受体α1（TRα1）在甲状腺癌细胞分化中的作用 | 发现TRα1通过调节PAX8基因表达和多条信号通路抑制甲状腺癌细胞生长，并促进细胞分化 | NA | 研究TRα1在甲状腺癌中的功能及其作为治疗靶点的潜力 | 甲状腺癌细胞分化 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞转录组分析（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用了两个甲状腺癌细胞系THJ-11T和THJ-16T，以及它们的TRα1表达细胞 |
| 338 | 2024-08-07 |
Polyploid tubular cells initiate a TGF-β1 controlled loop that sustains polyploidization and fibrosis after acute kidney injury
2023-10-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00081.2023
PMID:37642236
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研究论文 | 本研究探讨了急性肾损伤后多倍体管状细胞在纤维化过程中的作用及其分子机制 | 首次揭示了多倍体管状细胞通过TGF-β1信号通路维持自身多倍体化和促进纤维化的自我维持机制 | NA | 阐明多倍体管状细胞在急性肾损伤后纤维化过程中的作用及其分子机制 | 多倍体管状细胞及其在急性肾损伤后的生存和纤维化作用 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用转基因小鼠模型和单细胞RNA测序技术进行研究 |
| 339 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing analysis revealed malignant ductal cell heterogeneity and prognosis signatures in pancreatic cancer
2023-Oct, Clinics and research in hepatology and gastroenterology
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.clinre.2023.102200
PMID:37643692
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了胰腺癌中的恶性导管细胞异质性及其预后标志物 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了胰腺癌中导管细胞的两个主要亚群（S100A6+细胞和FXYD2+细胞），并发现了与肿瘤发展相关的不同通路，同时整合了批量和单细胞RNA测序数据以生成和验证胰腺癌患者的总体生存预后标志物 | NA | 探索胰腺癌中的恶性导管细胞异质性及其预后标志物 | 胰腺癌中的导管细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 340 | 2024-08-07 |
Microbiome characteristics description of COVID-19 patients based on bulk RNA-seq and scRNA-Seq data
2023-10, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107400
PMID:37651767
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research paper | 本文通过重新注释COVID-19患者的bulk RNA-seq和scRNA-Seq数据中的微生物序列，描述了COVID-19患者的细胞微生物景观并识别了各组织中的特征微生物 | 发现了与COVID-19症状高度相关的Acinetobacter lwoffii，并揭示了SARS-CoV-2与hMPV的共感染现象 | NA | 研究COVID-19患者体内微生物群落的变化及其与疾病进展的关系 | COVID-19患者的微生物群落特征 | digital pathology | COVID-19 | RNA-seq | NA | RNA-seq data | 具体样本数量未在摘要中提及 |