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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-08-07 |
Dissection of key factors correlating with H5N1 avian influenza virus driven inflammatory lung injury of chicken identified by single-cell analysis
2023-10, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011685
PMID:37819993
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析,研究了H5N1和H9N2禽流感病毒感染鸡肺组织后的转录组变化,揭示了不同病毒株引起的炎症反应差异及其潜在机制 | 首次系统性地分析了H5N1和H9N2禽流感病毒感染鸡肺组织后16种细胞类型(19个集群)的转录组,并开发了这些细胞类型的标记基因目录 | NA | 揭示禽流感病毒感染鸡肺组织后的免疫反应机制 | 鸡肺组织中的16种细胞类型 | 数字病理学 | 禽流感 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | H5N1和H9N2禽流感病毒感染的鸡肺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 302 | 2024-08-07 |
Supplementation with a high-glucose drink stimulates anti-tumor immune responses to glioblastoma via gut microbiota modulation
2023-10-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113220
PMID:37804509
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研究论文 | 研究通过给GL261同源胶质母细胞瘤(GBM)小鼠短期补充高葡萄糖饮料(HGD),发现其生存率提高且无代谢疾病迹象,表明HGD通过调节肠道微生物群增强抗肿瘤免疫反应。 | 首次发现HGD补充通过调节肠道微生物群增强GBM小鼠的抗肿瘤免疫反应,特别是通过增加细胞毒性CD4 T细胞和与抗PD-1免疫检查点抑制剂的协同作用。 | 研究仅限于短期HGD补充和特定的小鼠模型,可能需要进一步研究其在人类和其他时间框架中的效果。 | 探讨高葡萄糖饮料补充对胶质母细胞瘤小鼠抗肿瘤免疫反应的影响及其机制。 | GL261同源胶质母细胞瘤小鼠及其肠道微生物群和免疫细胞。 | NA | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 特定数量的GL261同源胶质母细胞瘤小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 303 | 2024-08-07 |
Immaturity of immune cells around the dural venous sinuses contributes to viral meningoencephalitis in neonates
2023-10-13, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adg6155
PMID:37801517
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研究论文 | 研究使用淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒(LCMV)的Armstrong株探讨病毒在系统感染期间进入中枢神经系统(CNS)的机制,发现新生小鼠在感染后死亡率高,病毒从硬脑膜的静脉窦区域广泛传播至软脑膜、脉络丛和大脑皮层。 | 揭示了新生小鼠硬脑膜静脉窦区域的免疫细胞不成熟,主要由CD206巨噬细胞组成,而MHCII巨噬细胞稀少,这与成年小鼠形成对比,成年小鼠的静脉窦免疫细胞富含MHCII巨噬细胞,能产生抗病毒分子和趋化因子,保护CNS免受系统性病毒入侵。 | NA | 探讨病原体如何突破中枢神经系统屏障及其机制。 | 新生和成年小鼠的中枢神经系统免疫细胞。 | NA | 病毒性脑膜脑炎 | 免疫荧光染色和单细胞RNA测序分析 | NA | NA | 新生和成年小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 304 | 2024-08-07 |
Acute myeloid leukemia: from NGS, through scRNA-seq, to CAR-T. dissect cancer heterogeneity and tailor the treatment
2023-Oct-06, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02841-8
PMID:37803464
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研究论文 | 本文探讨了急性髓系白血病(AML)的病理学理解演变,以及单细胞RNA测序和基于基因组工具的T细胞修饰技术如何影响AML的分类和治疗 | 文章介绍了通过单细胞RNA测序和高通量下一代测序技术,对AML进行更个性化的诊断和治疗,以及使用工程化CAR-T细胞的个性化治疗策略 | NA | 探讨急性髓系白血病的病理学理解演变,以及新技术如何影响其分类和治疗 | 急性髓系白血病(AML)及其治疗策略 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),下一代测序(NGS) | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 305 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis reveals altered tumor microenvironments of relapse- and remission-associated pediatric acute myeloid leukemia
2023-10-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41994-0
PMID:37798266
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了儿童急性髓系白血病在诊断、诱导治疗结束和复发时间点的骨髓样本,揭示了复发和持续完全缓解相关AML细胞的微环境差异 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了儿童急性髓系白血病复发和持续完全缓解相关AML细胞的微环境差异,并验证了与AML细胞相关的7基因标志 | NA | 深入表征儿童急性髓系白血病复发和持续完全缓解相关的样本,以提供对骨髓微环境景观的见解 | 儿童急性髓系白血病的骨髓样本 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA-seq数据 | 多个时间点的骨髓样本 | NA | NA | NA | NA |
| 306 | 2024-08-07 |
MCProj: metacell projection for interpretable and quantitative use of transcriptional atlases
2023-10-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03069-7
PMID:37798781
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研究论文 | 描述了一种名为MCProj的算法,用于通过投影参考单细胞图谱来分析查询scRNA-seq数据 | 该方法能够区分并标记与图谱状态一致的查询细胞,以及未观察到的(新颖或人为的)行为,并识别成功映射的查询状态中的表达差异 | NA | 开发一种算法,用于通过投影参考单细胞图谱来分析查询scRNA-seq数据,以实现精确、定量和可解释的结果 | scRNA-seq数据和单细胞图谱 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 307 | 2024-08-07 |
LINC00922 decoys SIRT3 to facilitate the metastasis of colorectal cancer through up-regulation the H3K27 crotonylation of ETS1 promoter
2023-10-04, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-023-01859-y
PMID:37789393
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研究论文 | 本研究探讨了H3K27巴豆酰化在促进结直肠癌转移中的作用及机制 | 发现了LINC00922通过上调ETS1启动子区域的H3K27巴豆酰化水平,促进结直肠癌转移的新机制 | NA | 阐明巴豆酰化在Lys27位点上的组蛋白H3(H3K27cr)在促进结直肠癌转移中的作用和机制 | 结直肠癌组织和细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组织化学、单细胞RNA测序、免疫沉淀分析 | NA | 组织样本、细胞 | 临床上使用了转移性结直肠癌组织样本,体外和体内实验使用了结直肠癌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 308 | 2024-08-07 |
The integrated single-cell analysis developed an immunogenic cell death signature to predict lung adenocarcinoma prognosis and immunotherapy
2023-10-04, Aging
DOI:10.18632/aging.205077
PMID:37796202
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,开发了一种免疫原性细胞死亡(ICD)特征,用于预测肺腺癌(LUAD)的预后和免疫治疗效果 | 首次在肺腺癌中构建了ICD相关的预后特征,并探讨了其在免疫治疗中的应用 | NA | 旨在为肺腺癌患者创建ICD相关的预后特征,以准确预测生存预后 | 肺腺癌患者的预后和免疫治疗效果 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | LASSO和COX回归分析 | RNA | 涉及TCGA和GEO数据库中的肺腺癌患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 309 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Cellular Heterogeneity and Complex Cell-Cell Communication Networks in the Mouse Cornea
2023-10-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.64.13.5
PMID:37792336
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序绘制了小鼠角膜的细胞异质性和复杂的细胞间通讯网络 | 创新点在于构建了一个完整的单细胞转录组图及角膜中所有细胞类型的复杂信号交流图谱 | NA | 研究小鼠角膜的细胞异质性和细胞间通讯网络 | C57BL/6小鼠的角膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 40只小鼠角膜的14,732个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 310 | 2024-08-05 |
Alveolar macrophages in tissue homeostasis, inflammation, and infection: evolving concepts of therapeutic targeting
2023-10-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI170501
PMID:37781922
|
研究论文 | 该文章探讨了肺泡巨噬细胞在组织稳态、炎症和感染中的作用及其治疗靶向的概念演变 | 首次结合单细胞RNA测序和空间组学方法深入研究了肺泡巨噬细胞的起源、功能和可塑性 | 治疗靶向肺泡巨噬细胞可能面临严重的副作用风险,例如抗菌宿主防御能力的丧失 | 探索肺泡巨噬细胞在急性肺损伤中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 主要研究对象为肺泡巨噬细胞及其在感染和无菌肺炎中的功能 | 数字病理学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 311 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of cuproptosis and copper homeostasis genotyping and related immune land scape in lung adenocarcinoma
2023-10-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-43795-3
PMID:37783723
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研究论文 | 本研究分析了肺腺癌中铜死亡和铜稳态基因型及相关免疫景观 | 首次在肺腺癌中识别出新的铜死亡和铜稳态相关基因,并建立了基于这些基因的预后标志物 | NA | 探索肺腺癌中铜死亡和铜稳态相关基因及其在肿瘤治疗中的潜在应用 | 肺腺癌中的铜死亡和铜稳态相关基因 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA),lasso-惩罚的cox回归方法,单细胞RNA测序(scRNA-seq),实时定量聚合酶链反应(RT-qPCR) | NA | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 使用了来自TCGA和GEO的转录组数据,以及GSE30219、GSE183219和GSE203360的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 312 | 2024-08-07 |
Unravelling the role of immune cells and FN1 in the recurrence and therapeutic process of skull base chordoma
2023-10, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1429
PMID:37784253
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和T/B细胞受体测序,研究了颅底脊索瘤原发和复发肿瘤细胞及其微环境细胞的差异,并探讨了纤维连接蛋白1(FN1)在脊索瘤复发和治疗中的作用。 | 首次详细分析了颅底脊索瘤原发和复发肿瘤细胞及其微环境细胞的差异,并揭示了FN1在脊索瘤复发中的重要作用。 | NA | 深入了解颅底脊索瘤原发和复发肿瘤的细胞差异及其复发机制,为开发有效治疗策略提供依据。 | 颅底脊索瘤的原发和复发肿瘤细胞、浸润淋巴细胞、骨髓细胞、成纤维细胞和B细胞。 | 数字病理学 | 颅底脊索瘤 | 单细胞RNA测序,T/B细胞受体测序 | NA | 单细胞RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 313 | 2024-08-07 |
Bladder cancer intrinsic LRFN2 drives anticancer immunotherapy resistance by attenuating CD8+ T cell infiltration and functional transition
2023-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007230
PMID:37802603
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研究论文 | 本文研究了膀胱癌中LRFN2蛋白通过调节肿瘤微环境影响免疫治疗抵抗的机制 | 首次揭示了LRFN2在膀胱癌中通过抑制CD8+ T细胞的招募和功能转变,影响免疫检查点抑制剂治疗效果的新机制 | NA | 探讨LRFN2在膀胱癌免疫治疗抵抗中的作用及其机制 | 膀胱癌中的LRFN2蛋白及其对肿瘤微环境和免疫治疗的影响 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序, 免疫测定, 组织全景量化分析 | NA | RNA, 组织 | 涉及大量RNA测序和单细胞RNA测序,具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 314 | 2024-08-07 |
A transient wave of Bhlhe41+ resident macrophages enables remodeling of the developing infarcted myocardium
2023-10-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113174
PMID:37751357
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、空间转录组学和报告基因小鼠研究了心肌梗死后心脏巨噬细胞亚型的时间-空间动态变化 | 首次识别出心肌梗死区域中由单核细胞衍生的Bhlhe41 Mφs在第7天达到峰值,并揭示了其在抑制肌成纤维细胞激活中的关键作用 | NA | 研究心肌梗死后免疫系统在修复和重塑心肌中的作用 | 心肌梗死后的心脏巨噬细胞亚型及其功能 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 315 | 2024-08-07 |
MSU crystal deposition contributes to inflammation and immune responses in gout remission
2023-10-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113139
PMID:37756161
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了在痛风缓解期中,单钠尿酸盐(MSU)晶体沉积对免疫炎症反应的影响 | 首次揭示了在痛风缓解期中,MSU晶体沉积引起的系统性炎症和特异性免疫反应 | NA | 探讨MSU晶体沉积在痛风缓解期对免疫炎症反应的影响及其机制 | 痛风缓解期患者的周围血单个核细胞(PBMCs) | NA | 痛风 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 316 | 2024-08-07 |
Meningeal macrophages inhibit chemokine signaling in pre-tumor cells to suppress mouse medulloblastoma initiation
2023-10-23, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.08.033
PMID:37774709
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研究论文 | 本文探讨了脑膜巨噬细胞通过抑制前肿瘤细胞中的趋化因子信号来抑制小鼠髓母细胞瘤的启动 | 首次揭示了脑膜巨噬细胞在趋化因子调控的抗肿瘤对话中的关键作用,特别是在抑制髓母细胞瘤启动方面 | NA | 研究脑肿瘤微环境对肿瘤启动的影响 | 脑膜巨噬细胞和小鼠髓母细胞瘤 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 317 | 2024-08-05 |
ScribbleDom: using scribble-annotated histology images to identify domains in spatial transcriptomics data
2023-Oct-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad594
PMID:37756699
|
研究论文 | 本文提出了一种名为“ScribbleDom”的半监督卷积神经网络方法,用于在空间转录组学中识别领域。 | 通过利用人类专家的输入作为半监督的方法,ScribbleDom结合了人的认知能力与机器的计算能力。 | 在缺乏专家输入时,尽管ScribbleDom可以全自监督运行,但其性能可能无法与带专家输入时的效果相比。 | 研究空间转录组学中领域识别的重要性及其改进方法。 | 该研究以人类侧面前额皮层样本和黑色素瘤数据集为研究对象。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 卷积神经网络 | 半监督卷积神经网络 | 图像 | 12个人类侧面前额皮层样本和多个黑色素瘤数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 318 | 2024-08-05 |
Circulating Tumor Cells and Tumor Progression, Metastasis, and Poor Prognosis in Patients With Neuroblastoma
2023-Oct, Anticancer research
IF:1.6Q4
DOI:10.21873/anticanres.16627
PMID:37772576
|
评论 | 本文简要回顾了循环神经母细胞瘤细胞的定量方法及其与神经母细胞瘤患者预后的关系 | 强调了循环神经母细胞瘤细胞数量与预后不良之间的关系,并提出了对这些细胞进行全面遗传分析的必要性 | 目前大多数研究仅代表肿瘤负担,没有直接证据表明循环肿瘤细胞是神经母细胞瘤患者肿瘤进展和转移的来源 | 探讨循环肿瘤细胞在神经母细胞瘤进展、转移及预后不良中的作用 | 研究神经母细胞瘤患者中的循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞测序,外源细胞培养功能测定 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 319 | 2024-08-07 |
The unique interplay of mitochondrial oxidative phosphorylation (OXPHOS) and immunity and its potential implication for the sex- and age-related morbidity of severe COVID-19 patients
2023-Oct, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.371
PMID:37750090
|
研究论文 | 本研究分析了先前发表的单细胞RNA测序数据,揭示了线粒体氧化磷酸化(OXPHOS)和免疫在严重或危重COVID-19患者中的细胞类型、性别和年龄相关变化 | 发现OXPHOS和免疫在严重或危重COVID-19患者中的相互作用显示出细胞类型特异性、年龄相关性和性别偏向性 | 研究主要基于先前发表的数据,未进行新的实验验证 | 探讨线粒体氧化磷酸化与免疫在COVID-19患者中的相互作用及其对性别和年龄相关发病率的影响 | 严重或危重COVID-19患者、去势和再生小鼠模型 | 生物信息学 | COVID-19 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | RNA | 大量COVID-19患者、去势和再生小鼠、400个基因的RNAi文库 | NA | NA | NA | NA |
| 320 | 2024-08-07 |
Leprosy-specific subsets of macrophages and Schwann cells identified by single-cell RNA-sequencing
2023-Oct, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2023.154821
PMID:37757621
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术,研究了感染麻风分枝杆菌的小鼠模型中巨噬细胞和施万细胞的特定亚群及其相互作用 | 首次详细描述了麻风病中巨噬细胞的M1和M2样亚群及其与施万细胞的相互作用,揭示了这些细胞在疾病中的分子状态和功能 | 研究仅限于小鼠模型,需要进一步在人类样本中验证这些发现 | 探究麻风病中巨噬细胞和施万细胞的分子状态及其相互作用,以深入理解疾病的发病机制 | 麻风分枝杆菌感染的小鼠模型中的单个细胞 | 数字病理学 | 麻风病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类麻风病组织样本 | NA | NA | NA | NA |