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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics map of the embryonic mouse brain - a tool to explore neurogenesis
2023-10-15, Biology open
IF:1.8Q3
DOI:10.1242/bio.060151
PMID:37855382
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研究论文 | 这篇文章提供了一个关于胚胎小鼠大脑的空间转录组图谱,旨在探索神经发生 | 建立了一个空间转录组图谱,并结合了单细胞RNAseq数据,揭示了特定解剖领域内的独特转录特征 | NA | 研究胚胎小鼠大脑发育中细胞类型及其相互作用 | 胚胎小鼠大脑的不同类型神经和非神经细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA数据 | 胚胎第13.5天小鼠脑切片的RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 262 | 2024-08-05 |
Integrative analysis of miRNA in cartilage-derived extracellular vesicles and single-cell RNA-seq profiles in knee osteoarthritis
2023-10-15, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2023.109785
PMID:37844826
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研究论文 | 该文章探讨了膝关节骨关节炎中源自软骨的细胞外囊泡的miRNA及单细胞RNA测序的整合分析 | 首次整合了源自软骨的EV-DE-miRNA靶基因与每个软骨细胞亚群特异性标记基因之间的关联 | 关于EV-miRNA与软骨细胞群体特征标记基因的关联尚需进一步验证 | 研究源自软骨的EV-miRNA在膝关节骨关节炎中的作用及其潜在的诊断和治疗方法 | 研究对象包括膝关节骨关节炎患者的软骨细胞及其来源的细胞外囊泡 | 数字病理学 | 膝关节骨关节炎 | miRNA测序和单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 涉及来自膝关节骨关节炎患者的软骨细胞及细胞外囊泡 | NA | NA | NA | NA |
| 263 | 2024-08-05 |
Telomere maintenance mechanism subtype reveals different immune activity in vestibular schwannoma
2023-Oct, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-023-04458-5
PMID:37864645
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研究论文 | 本文研究了端粒酶及端粒的替代延长机制在前庭神经瘤中的作用 | 本研究揭示了不同端粒维护机制亚型在前庭神经瘤患者中的免疫活动差异 | 当前对前庭神经瘤中端粒酶活性和替代延长机制的了解仍然有限 | 阐明端粒酶和端粒替代延长机制在前庭神经瘤中的作用 | 前庭神经瘤患者,分为高端粒酶组和高ALT样组 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 基因数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 264 | 2024-08-07 |
Cartilage tissue from sites of weight bearing in patients with osteoarthritis exhibits a differential phenotype with distinct chondrocytes subests
2023-10, RMD open
IF:5.1Q1
DOI:10.1136/rmdopen-2023-003255
PMID:37848267
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研究论文 | 本研究探讨了骨关节炎患者负重区域的软骨组织中是否存在不同亚群的软骨细胞,并分析了这些亚群在不同负重条件下的表型差异。 | 首次鉴定并验证了骨关节炎软骨组织负重区域中存在一种名为OA肥大软骨细胞的亚群,这些细胞具有独特的表型和分子特征。 | NA | 阐明骨关节炎患者负重区域软骨组织中不同软骨细胞亚群的表型差异及其分子机制。 | 骨关节炎患者的软骨组织,特别是负重区域的软骨细胞亚群。 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 蛋白质组分析,单细胞RNA测序,全转录组测序 | NA | 组织,细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 265 | 2024-08-07 |
Divergent tumor and immune cell reprogramming underlying immunotherapy response and immune-related adverse events in lung squamous cell carcinoma
2023-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007305
PMID:37857527
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析,研究了免疫检查点抑制剂治疗前后肺鳞状细胞癌中的肿瘤和免疫细胞重编程,以及其与治疗反应和免疫相关不良事件的关系 | 揭示了免疫检查点抑制剂治疗中肿瘤和免疫细胞的特定重编程,以及肿瘤坏死因子信号通路在抗肿瘤免疫和免疫相关不良事件中的不同作用 | NA | 深入了解免疫检查点抑制剂治疗肺鳞状细胞癌的抗肿瘤反应和免疫相关不良事件的免疫特征,以最大化患者的治疗益处 | 肺鳞状细胞癌患者的肿瘤和免疫细胞 | 数字病理学 | 肺鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 两个独立的肺鳞状细胞癌患者队列和一个已发表的免疫检查点抑制剂治疗患者队列 | NA | NA | NA | NA |
| 266 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals neurovascular-osteochondral network crosstalk during temporomandibular joint osteoarthritis: Pilot study in a human condylar cartilage
2023-Oct, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e20749
PMID:37867837
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了颞下颌关节骨关节炎中神经血管-骨软骨网络的交叉对话 | 首次使用单细胞RNA测序技术识别人类颞下颌关节骨关节炎软骨中的细胞和基因,并展示了神经血管-骨软骨网络在人类颞下颌关节骨关节炎过程中的交叉对话 | NA | 旨在发现人类颞下颌关节骨关节炎中神经血管-骨软骨网络交叉对话中起重要作用的细胞和基因 | 颞下颌关节骨关节炎患者的髁状软骨 | 数字病理学 | 颞下颌关节骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 颞下颌关节骨关节炎患者的髁状软骨样本及其他良性髁状增生患者的对照样本 | NA | NA | NA | NA |
| 267 | 2024-08-07 |
In-depth analysis of human virus-specific CD8+ T cells delineates unique phenotypic signatures for T cell specificity prediction
2023-10-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113250
PMID:37837618
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研究论文 | 本文通过高维质谱流式细胞术和单细胞RNA测序,深入分析了114名健康捐赠者和55名癌症患者外周血样本中针对CMV、EBV、流感病毒和SARS-CoV-2抗原的CD8 T细胞反应 | 利用机器学习方法提取抗原特异性T细胞的表型特征,并预测批量CD8 T细胞的病毒特异性 | NA | 评估感染历史并理解其对保护性免疫的贡献 | 人类病毒特异性CD8 T细胞的表型特征 | 免疫学 | NA | 高维质谱流式细胞术,单细胞RNA测序 | 机器学习 | 细胞 | 114名健康捐赠者和55名癌症患者的外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 268 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptomics: Emerging Technologies in Tissue Gene Expression Profiling
2023-10-24, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.3c02029
PMID:37814884
|
评论 | 本文讨论了空间转录组技术的当前状态和进展,旨在提供高分辨率的基因表达图谱 | 介绍了高通量、范围广泛的转录组分析技术,以及单细胞分辨率的方法 | 未详细描述特定技术的缺点和适用范围的可能限制 | 探讨空间转录组技术在组织基因表达分析中的应用和发展 | 包括不同技术在组织架构、发育生物学和疾病研究中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 基于微切割、测序和单分子FISH等多种技术的方法 | NA | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 269 | 2024-08-07 |
Ewing Sarcoma Single-cell Transcriptome Analysis Reveals Functionally Impaired Antigen-presenting Cells
2023-10-24, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0027
PMID:37823774
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了尤文肉瘤的免疫微环境,揭示了功能受损的抗原呈递细胞 | 首次通过单细胞RNA测序技术深入分析了尤文肉瘤的免疫微环境,发现了肿瘤细胞与免疫微环境的相互作用机制 | 研究样本仅限于18个尤文肉瘤组织样本,可能影响结果的普遍性 | 探索尤文肉瘤的免疫微环境,为免疫治疗提供新的策略 | 尤文肉瘤的免疫微环境和抗原呈递细胞的功能 | 数字病理学 | 尤文肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 18个尤文肉瘤组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 270 | 2024-08-05 |
Spatial downregulation of CD74 signatures may drive invasive component development in part-solid lung adenocarcinoma
2023-Oct-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107699
PMID:37810252
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研究论文 | 本文探讨了部分实性肺腺癌中CD74标记的空间下调如何驱动侵袭性成分的发展 | 结合空间转录组学和病理注释,揭示了早期肺腺癌的空间组成和演变轨迹 | 仅研究了20个部分实性结节,而且4个样本使用了单细胞RNA测序,样本量相对较小 | 定义早期肺腺癌的空间组成及其演化轨迹 | 20个部分实性结节(PSNs)和匹配的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学(ST) | NA | 转录组数据 | 20个部分实性结节,4个样本进行了单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA |
| 271 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome profiling reveals immune and stromal cell heterogeneity in primary Sjögren's syndrome
2023-Oct-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107943
PMID:37810210
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,探讨了原发性干燥综合征(pSS)患者和非pSS对照组中免疫和间质细胞的异质性 | 首次揭示了pSS患者中SOX9下调的肌上皮细胞、扩大的ACKR1内皮亚群以及外周血中IGHD幼稚B细胞的扩展,以及纤维母细胞在间质-免疫相互作用网络中的关键作用 | NA | 揭示原发性干燥综合征中免疫和间质细胞的异质性,为治疗策略提供见解 | 原发性干燥综合征患者和非pSS对照组的免疫和间质细胞 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 11名pSS患者和5名非pSS对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 272 | 2024-08-05 |
Miniature spatial transcriptomics for studying parasite-endosymbiont relationships at the micro scale
2023-10-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-42237-y
PMID:37838705
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研究论文 | 本文探讨了使用小型空间转录组学技术研究寄生虫与内共生体之间的关系 | 提出了一种小型空间转录组学的概念,能够揭示微小样本中的基因表达模式 | 未提及研究的具体局限性 | 研究寄生虫与内共生细菌Wolbachia之间的相互作用 | 成虫雌性Brugia malayi的生殖组织及发育中的胚胎 | 数字病理学 | 寄生虫病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小型样本类型 | NA | NA | NA | NA |
| 273 | 2024-08-07 |
Cancer stem cell-derived CHI3L1 activates the MAF/CTLA4 signaling pathway to promote immune escape in triple-negative breast cancer
2023-10-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04532-6
PMID:37838657
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研究论文 | 本研究探讨了三阴性乳腺癌干细胞通过CHI3L1/MAF/CTLA4信号通路促进免疫逃逸的分子机制 | 首次揭示了三阴性乳腺癌干细胞通过CHI3L1/MAF/CTLA4轴影响免疫逃逸的新机制 | NA | 利用单细胞转录组测序揭示CHI3L1/MAF/CTLA4信号通路在三阴性乳腺癌中通过肿瘤干细胞与免疫细胞相互作用介导免疫逃逸的分子机制 | 三阴性乳腺癌干细胞、免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 涉及三阴性乳腺癌组织中的八个细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 274 | 2024-08-07 |
Benchmarking strategies for cross-species integration of single-cell RNA sequencing data
2023-10-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41855-w
PMID:37838716
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研究论文 | 本文评估了28种基因同源性映射方法和数据集成算法的组合,在不同生物学场景下进行跨物种单细胞RNA测序数据整合的能力 | 开发了一种新的生物学保守度量,用于评估细胞类型可区分性的维持 | NA | 探索不同物种间细胞类型的进化关系,并确保数据整合结果真正反映生物学特性 | 跨物种单细胞RNA测序数据的整合策略 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | scANVI, scVI, SeuratV4, SAMap | 基因表达数据 | 多种生物学设置下的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 275 | 2024-08-05 |
Nr4a1 marks a distinctive ILC2 activation subset in the mouse inflammatory lung
2023-10-13, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01690-3
PMID:37833706
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研究论文 | 这篇文章研究了小鼠急性炎性肺中ILC2的激活亚群。 | 文章首次识别了小鼠肺中四种ILC2亚群,并揭示了Nr4a1标记的激活亚群的独特特征及其与PD-1的关系 | 研究主要集中于小鼠模型,结果的临床转化可能有限 | 阐明ILC2激活的分子机制及其在疾病防治中的作用 | 小鼠中的ILC2亚群,尤其是Nr4a1+ILC2 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学、基因报告和基因敲除 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 276 | 2024-08-05 |
Pan-cancer spatially resolved single-cell analysis reveals the crosstalk between cancer-associated fibroblasts and tumor microenvironment
2023-10-13, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-023-01876-x
PMID:37833788
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研究论文 | 研究揭示了癌相关成纤维细胞与肿瘤微环境之间的相互作用 | 识别了四个不同功能亚组的CAF,并分析了它们的空间分布特征 | 关于CAF异质性的研究仅限于六种常见癌症类型及少数稀有癌症类型 | 探讨癌相关成纤维细胞在肿瘤微环境中的作用和相互作用 | 癌相关成纤维细胞及其在不同癌症类型中的功能 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及六种常见癌症类型和两种稀有癌症类型的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 277 | 2024-08-05 |
Daily turnover of active giant virus infection during algal blooms revealed by single-cell transcriptomics
2023-10-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adf7971
PMID:37824628
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示了藻类潮汐期间活性巨病毒感染的日常周转情况 | 首次应用单细胞RNA测序技术剖析了巨病毒在海洋藻类中的活性感染与宿主转录组 | 本研究仅集中于12,000个单细胞的转录组,可能存在样本偏倚 | 研究巨病毒对海洋藻类的感染动态及其对微生物食物链的影响 | 在海洋环境中,研究了12,000个单细胞藻类的病毒感染状态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 12,000个单细胞藻类样本 | NA | NA | NA | NA |
| 278 | 2024-08-05 |
Comprehensive cell atlas of the first-trimester developing human brain
2023-10-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adf1226
PMID:37824650
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研究论文 | 该文章揭示了人类大脑早期发育过程中的细胞类型及其轨迹 | 首次详尽地揭示了在妊娠初期人类大脑中细胞类型的建立及其空间分布 | 未提及样本的具体来源及样本大小的限制 | 研究人类大脑在妊娠初期的发展过程 | 人类大脑在妊娠5到14周时的细胞状态和轨迹 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | NA | 妊娠5到14周的人类大脑样本 | NA | NA | NA | NA |
| 279 | 2024-08-07 |
Kindlin-2 in myoepithelium controls luminal progenitor commitment to alveoli in mouse mammary gland
2023-10-13, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-06184-2
PMID:37833248
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研究论文 | 本文研究了Kindlin-2在乳腺肌上皮细胞中调控腔内祖细胞向肺泡细胞分化的分子机制 | 发现了Kindlin-2-Stat3-Dll1信号级联在肌上皮细胞中通过抑制Notch信号来驱动腔内祖细胞向肺泡细胞分化的作用 | NA | 探究肌上皮细胞在乳腺发育过程中调控腺泡分化的分子机制 | Kindlin-2在肌上皮细胞中的作用及其对腔内祖细胞分化的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了五种基因修饰的小鼠品系 | NA | NA | NA | NA |
| 280 | 2024-08-07 |
Identification of ATF3 as a novel protective signature of quiescent colorectal tumor cells
2023-10-13, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-06204-1
PMID:37833290
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,在人结直肠癌球状模型中区分增殖和静止癌细胞群体,并识别出ATF3作为静止癌细胞的新标志物 | 首次识别ATF3作为静止结直肠癌细胞的新标志物,并探讨了其与DDIT4和TRIB3在转录水平的相互作用 | NA | 开发新的靶向治疗策略以消除肿瘤细胞并延缓肿瘤复发 | 结直肠癌细胞中的增殖和静止细胞群体 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |