单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 415 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-08-05 |
Miniature spatial transcriptomics for studying parasite-endosymbiont relationships at the micro scale
2023-10-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-42237-y
PMID:37838705
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研究论文 | 本文探讨了使用小型空间转录组学技术研究寄生虫与内共生体之间的关系 | 提出了一种小型空间转录组学的概念，能够揭示微小样本中的基因表达模式 | 未提及研究的具体局限性 | 研究寄生虫与内共生细菌Wolbachia之间的相互作用 | 成虫雌性Brugia malayi的生殖组织及发育中的胚胎 | 数字病理学 | 寄生虫病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小型样本类型 |
| 262 | 2024-08-07 |
Cancer stem cell-derived CHI3L1 activates the MAF/CTLA4 signaling pathway to promote immune escape in triple-negative breast cancer
2023-10-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04532-6
PMID:37838657
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研究论文 | 本研究探讨了三阴性乳腺癌干细胞通过CHI3L1/MAF/CTLA4信号通路促进免疫逃逸的分子机制 | 首次揭示了三阴性乳腺癌干细胞通过CHI3L1/MAF/CTLA4轴影响免疫逃逸的新机制 | NA | 利用单细胞转录组测序揭示CHI3L1/MAF/CTLA4信号通路在三阴性乳腺癌中通过肿瘤干细胞与免疫细胞相互作用介导免疫逃逸的分子机制 | 三阴性乳腺癌干细胞、免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 涉及三阴性乳腺癌组织中的八个细胞亚群 |
| 263 | 2024-08-07 |
Benchmarking strategies for cross-species integration of single-cell RNA sequencing data
2023-10-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41855-w
PMID:37838716
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研究论文 | 本文评估了28种基因同源性映射方法和数据集成算法的组合，在不同生物学场景下进行跨物种单细胞RNA测序数据整合的能力 | 开发了一种新的生物学保守度量，用于评估细胞类型可区分性的维持 | NA | 探索不同物种间细胞类型的进化关系，并确保数据整合结果真正反映生物学特性 | 跨物种单细胞RNA测序数据的整合策略 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | scANVI, scVI, SeuratV4, SAMap | 基因表达数据 | 多种生物学设置下的数据集 |
| 264 | 2024-08-05 |
Nr4a1 marks a distinctive ILC2 activation subset in the mouse inflammatory lung
2023-10-13, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01690-3
PMID:37833706
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研究论文 | 这篇文章研究了小鼠急性炎性肺中ILC2的激活亚群。 | 文章首次识别了小鼠肺中四种ILC2亚群，并揭示了Nr4a1标记的激活亚群的独特特征及其与PD-1的关系 | 研究主要集中于小鼠模型，结果的临床转化可能有限 | 阐明ILC2激活的分子机制及其在疾病防治中的作用 | 小鼠中的ILC2亚群，尤其是Nr4a1+ILC2 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学、基因报告和基因敲除 | NA | NA | NA |
| 265 | 2024-08-05 |
Pan-cancer spatially resolved single-cell analysis reveals the crosstalk between cancer-associated fibroblasts and tumor microenvironment
2023-10-13, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-023-01876-x
PMID:37833788
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研究论文 | 研究揭示了癌相关成纤维细胞与肿瘤微环境之间的相互作用 | 识别了四个不同功能亚组的CAF，并分析了它们的空间分布特征 | 关于CAF异质性的研究仅限于六种常见癌症类型及少数稀有癌症类型 | 探讨癌相关成纤维细胞在肿瘤微环境中的作用和相互作用 | 癌相关成纤维细胞及其在不同癌症类型中的功能 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及六种常见癌症类型和两种稀有癌症类型的数据集 |
| 266 | 2024-08-05 |
Daily turnover of active giant virus infection during algal blooms revealed by single-cell transcriptomics
2023-10-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adf7971
PMID:37824628
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示了藻类潮汐期间活性巨病毒感染的日常周转情况 | 首次应用单细胞RNA测序技术剖析了巨病毒在海洋藻类中的活性感染与宿主转录组 | 本研究仅集中于12,000个单细胞的转录组，可能存在样本偏倚 | 研究巨病毒对海洋藻类的感染动态及其对微生物食物链的影响 | 在海洋环境中，研究了12,000个单细胞藻类的病毒感染状态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 12,000个单细胞藻类样本 |
| 267 | 2024-08-05 |
Comprehensive cell atlas of the first-trimester developing human brain
2023-10-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adf1226
PMID:37824650
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研究论文 | 该文章揭示了人类大脑早期发育过程中的细胞类型及其轨迹 | 首次详尽地揭示了在妊娠初期人类大脑中细胞类型的建立及其空间分布 | 未提及样本的具体来源及样本大小的限制 | 研究人类大脑在妊娠初期的发展过程 | 人类大脑在妊娠5到14周时的细胞状态和轨迹 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | NA | 妊娠5到14周的人类大脑样本 |
| 268 | 2024-08-07 |
Kindlin-2 in myoepithelium controls luminal progenitor commitment to alveoli in mouse mammary gland
2023-10-13, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-06184-2
PMID:37833248
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研究论文 | 本文研究了Kindlin-2在乳腺肌上皮细胞中调控腔内祖细胞向肺泡细胞分化的分子机制 | 发现了Kindlin-2-Stat3-Dll1信号级联在肌上皮细胞中通过抑制Notch信号来驱动腔内祖细胞向肺泡细胞分化的作用 | NA | 探究肌上皮细胞在乳腺发育过程中调控腺泡分化的分子机制 | Kindlin-2在肌上皮细胞中的作用及其对腔内祖细胞分化的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了五种基因修饰的小鼠品系 |
| 269 | 2024-08-07 |
Identification of ATF3 as a novel protective signature of quiescent colorectal tumor cells
2023-10-13, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-06204-1
PMID:37833290
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，在人结直肠癌球状模型中区分增殖和静止癌细胞群体，并识别出ATF3作为静止癌细胞的新标志物 | 首次识别ATF3作为静止结直肠癌细胞的新标志物，并探讨了其与DDIT4和TRIB3在转录水平的相互作用 | NA | 开发新的靶向治疗策略以消除肿瘤细胞并延缓肿瘤复发 | 结直肠癌细胞中的增殖和静止细胞群体 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 270 | 2024-08-05 |
The early life immune dynamics and cellular drivers at single-cell resolution in lamb forestomachs and abomasum
2023-Oct-12, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-023-00933-1
PMID:37821933
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研究论文 | 本研究探讨了羔羊四室胃在早期免疫发育中的细胞动态和基因表达模式 | 首次在单细胞分辨率下揭示了羔羊四室胃的免疫动态及相关细胞驱动因子 | 研究主要集中在特定的时间点，可能未能全面捕捉免疫发育的复杂动态 | 分析羔羊四室胃早期的免疫发育和细胞驱动机制 | 羔羊的四室胃在不同年龄段的免疫发育 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 不同年龄（5, 10, 15, 25天）羔羊的四室胃样本 |
| 271 | 2024-08-07 |
Characterization of immune microenvironment in patients with HPV-positive and negative head and neck cancer
2023-10-12, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-023-02611-3
PMID:37828063
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，研究了HPV阳性和阴性头颈鳞状细胞癌（HNSCC）患者的免疫微环境特征 | 首次详细描述了HPV阳性和阴性HNSCC患者的免疫微环境差异，并揭示了B细胞表面标记物FCER2与改善生存率的关联 | NA | 探究HPV阳性和阴性头颈鳞状细胞癌患者的免疫微环境特征及其与临床结果的关系 | HPV阳性和阴性头颈鳞状细胞癌患者的免疫微环境 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | RNA序列 | 1403个上调基因和1877个下调基因 |
| 272 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing technology applied to epigenetics for the study of tumor heterogeneity
2023-10-11, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-023-01574-x
PMID:37821906
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在表观遗传学领域的应用，揭示了肿瘤异质性的表观遗传机制 | 介绍了单细胞测序在理解肿瘤微环境中细胞的表观遗传层次的最新进展 | 研究对当前技术工具和方法的局限性进行了概述 | 探讨表观遗传机制如何影响肿瘤的异质性 | 主要关注肿瘤微环境中的单细胞及其表观遗传特征 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 多组学数据 | NA |
| 273 | 2024-08-05 |
Analysis of potential biomarkers for diabetic kidney disease based on single-cell RNA-sequencing integrated with a single-cell sequencing assay for transposase-accessible chromatin
2023-10-11, Aging
DOI:10.18632/aging.205107
PMID:37827693
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研究论文 | 该文章分析了基于单细胞RNA测序的潜在糖尿病肾病生物标志物 | 本研究结合了转座酶可及染色质的单细胞测序，揭示了糖尿病肾病中开放的染色质区域和基因表达的差异 | 未详细描述研究的局限性 | 识别与糖尿病肾病相关的差异表达基因和转录因子 | 使用db/db和db/m小鼠的肾脏进行分析 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)与单细胞转座酶可及染色质测序(scATAC-seq)的结合 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自db/db和db/m小鼠的肾脏样本 |
| 274 | 2024-08-07 |
Eosinophils promote pulmonary matrix destruction and emphysema via Cathepsin L
2023-10-11, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-023-01634-x
PMID:37816708
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，在哮喘和肺气肿小鼠模型中识别嗜酸性粒细胞亚群，并分析其功能，发现嗜酸性粒细胞衍生的组织蛋白酶L在肺组织中导致细胞外基质降解，从而引发肺气肿 | 首次揭示了嗜酸性粒细胞衍生的组织蛋白酶L在肺气肿发展中的具体机制，并提出靶向这一途径可能成为治疗肺气肿的新策略 | 需要进一步研究针对组织蛋白酶L的治疗策略在肺气肿患者中的应用 | 探究嗜酸性粒细胞在肺气肿发展中的作用机制 | 嗜酸性粒细胞及其衍生的组织蛋白酶L在肺气肿中的作用 | NA | 肺气肿 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 275 | 2024-08-07 |
Single-cell multi-omics analysis identifies two distinct phenotypes of newly-onset microscopic polyangiitis
2023-10-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41328-0
PMID:37821442
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了新发显微镜下多血管炎患者的免疫学基础，并识别出两种不同的表型 | 首次通过单细胞多组学分析，识别出新发显微镜下多血管炎的两种不同免疫表型，并提供了个性化治疗和准确预后预测的临床见解 | NA | 探讨显微镜下多血管炎的临床异质性的免疫学基础 | 新发显微镜下多血管炎患者的外周血单个核细胞 | NA | 显微镜下多血管炎 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 新发显微镜下多血管炎患者的外周血单个核细胞样本 |
| 276 | 2024-08-07 |
A novel monoclonal antibody reveals the enrichment of NADPH oxidase 5 in human splenic endothelial cells
2023-10-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-44018-5
PMID:37821487
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研究论文 | 本文报道了一种新型抗NOX5单克隆抗体的开发和表征，该抗体能够识别人NOX5蛋白，并在多种应用中成功检测到NOX5的表达。 | 开发了一种新型抗NOX5单克隆抗体，能够在Western blot、免疫细胞化学和组织化学中识别人NOX5蛋白。 | NA | 研究NOX/DUOX家族的NADPH氧化酶在不同细胞和组织中的蛋白质水平检测。 | 人NOX5蛋白在不同组织和细胞类型中的表达和定位。 | NA | NA | 免疫组织化学、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质、RNA | 涉及人脾脏、睾丸和卵巢的组织样本，以及多种细胞类型。 |
| 277 | 2024-08-07 |
High-throughput identification of Toxoplasma gondii effector proteins that target host cell transcription
2023-10-11, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2023.09.003
PMID:37827122
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研究论文 | 本文通过结合CRISPR敲除筛选与双宿主-微生物单细胞RNA测序（称为双扰动测序），识别了弓形虫效应蛋白，这些蛋白影响宿主细胞转录 | 首次使用双扰动测序方法来识别和推断弓形虫效应蛋白的功能，这种方法可以广泛应用于研究宿主-微生物转录交互作用 | NA | 识别影响宿主细胞转录的弓形虫效应蛋白，并揭示其功能和免疫逃避机制 | 弓形虫效应蛋白及其在宿主细胞转录调节中的作用 | NA | NA | CRISPR敲除筛选，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 278 | 2024-08-05 |
Multi-species atlas resolves an axolotl limb development and regeneration paradox
2023-10-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41944-w
PMID:37816738
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研究论文 | 本研究通过多物种的单细胞转录组学图谱解析了水怪肢体发育和再生的矛盾 | 首次确认水怪中存在具有AER特征的细胞，并揭示其在再生过程中的不同表现 | 仅使用了几个物种的细胞，对水怪肢体再生机制的理解可能存在局限 | 探讨水怪在再生过程中肢体发育程序的重现程度 | 水怪及其他几种物种的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 多个物种的细胞，包括水怪、人类、老鼠、鸡和青蛙 |
| 279 | 2024-08-05 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomics reveals heterogeneity of fibroblast and pivotal genes in psoriasis
2023-10-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-44346-6
PMID:37816883
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研究论文 | 本文研究了银屑病的异质性及其关键基因，采用了综合的单细胞和空间转录组学分析 | 本研究首次整合了大规模转录组学、单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示了关键基因与纤维细胞的相互作用 | 未深入探讨其他治疗方法对这些关键基因的影响 | 阐明银屑病的潜在发病机制 | 银屑病患者及其皮损与非皮损样本中的纤维细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | RNA数据 | NA |
| 280 | 2024-08-07 |
Exploring oncogenes for renal clear cell carcinoma based on G protein-coupled receptor-associated genes
2023-Oct-10, Discover. Oncology
DOI:10.1007/s12672-023-00795-z
PMID:37816979
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研究论文 | 本研究基于G蛋白偶联受体相关基因探讨肾透明细胞癌中的癌基因 | 首次探讨G蛋白偶联受体在预测肾透明细胞癌预后中的作用，并建立基于G蛋白偶联受体相关基因的疾病模型 | NA | 探索G蛋白偶联受体相关基因在肾透明细胞癌诊断和预后中的作用 | 肾透明细胞癌患者 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括63个肿瘤样本和14个正常样本 |