单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 413 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-08-07 |
Multi-omics characteristics of tumor-associated macrophages in the tumor microenvironment of gastric cancer and their exploration of immunotherapy potential
2023-10-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-38822-2
PMID:37880233
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序筛选肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）中的标记基因，并结合胃癌（GC）转录组数据，分析不同亚型患者的临床特征、预后差异、免疫浸润和药物敏感性，构建了胃癌的预后模型。 | 本研究发现了MDMs中的突变如CGN、S100A6和C1QA，并揭示了不同胃癌亚型中免疫细胞和免疫检查点的浸润差异，构建了高准确性的预测评分系统。 | NA | 探索肿瘤相关巨噬细胞在胃癌肿瘤微环境中的多组学特征及其在免疫治疗中的潜力。 | 肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）和胃癌（GC）患者。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 不同数据集中的不同亚型胃癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 222 | 2024-08-07 |
Decoding the metastatic potential and optimal postoperative adjuvant therapy of melanoma based on metastasis score
2023-Oct-25, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-023-01678-6
PMID:37880239
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研究论文 | 本研究通过综合分析大量和单细胞RNA测序数据，构建了一个用于预测黑色素瘤转移潜力的转移评分（MET评分），并通过多种机器学习算法验证其可靠性和稳健性。 | 本研究首次构建了一个基于机器学习算法的转移评分（MET评分），用于准确预测非转移性黑色素瘤的转移潜力和确定有效的术后辅助治疗。 | NA | 研究旨在准确预测非转移性黑色素瘤的转移潜力，并确定有效的术后辅助治疗以抑制转移。 | 研究对象为非转移性黑色素瘤（NMM）及其转移潜力。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA测序 | 机器学习算法 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 223 | 2024-08-07 |
Construction and validation of a novel prognostic model of neutrophil‑related genes signature of lung adenocarcinoma
2023-10-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-45289-8
PMID:37880277
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研究论文 | 本研究旨在探索肺腺癌中的中性粒细胞相关基因（NRGs），并开发一种预测肺腺癌预后的预测模型 | 本研究通过结合加权基因共表达网络分析（WGCNA）和单细胞RNA测序数据，构建了一个新的中性粒细胞相关基因的预后模型 | NA | 探索肺腺癌中的中性粒细胞相关基因，并开发预后预测模型 | 肺腺癌中的中性粒细胞相关基因 | 数字病理学 | 肺腺癌 | RNA测序 | Cox回归模型 | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 224 | 2024-08-07 |
Unveiling adcyap1 as a protective factor linking pain and nerve regeneration through single-cell RNA sequencing of rat dorsal root ganglion neurons
2023-10-25, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01742-8
PMID:37880634
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了Adcyap1在大鼠背根神经节神经元中作为疼痛和神经再生的保护因子的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了Adcyap1在疼痛和神经再生之间的内在联系，并验证了其在疼痛缓解和神经再生中的作用 | 研究主要基于大鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探索外周神经损伤后疼痛和神经再生之间的内在联系，并寻找潜在的分子治疗靶点 | 大鼠背根神经节神经元 | 数字病理学 | 神经疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个时间点的SNC和正常大鼠的背根神经节 | NA | NA | NA | NA |
| 225 | 2024-08-07 |
Decoding meningioma heterogeneity and neoplastic cell-macrophage interaction through single-cell transcriptome profiling across pathological grades
2023-10-25, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04445-4
PMID:37880655
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了不同病理类型脑膜瘤的异质性和肿瘤细胞与巨噬细胞的相互作用 | 首次揭示了脑膜瘤中肿瘤细胞的高异质性和不同生物学功能，以及肿瘤细胞与巨噬细胞之间的关键相互作用 | 研究样本量较小，且仅限于特定类型的脑膜瘤 | 探究脑膜瘤的异质性和肿瘤细胞与巨噬细胞的相互作用 | 不同病理类型的脑膜瘤样本 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 五种不同病理类型的脑膜瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 226 | 2024-08-07 |
A risk score model based on lipid metabolism-related genes could predict response to immunotherapy and prognosis of lung adenocarcinoma: a multi-dataset study and cytological validation
2023-Oct-24, Discover. Oncology
DOI:10.1007/s12672-023-00802-3
PMID:37874388
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研究论文 | 本研究基于脂质代谢相关基因构建了一个风险评分模型，用于预测肺腺癌对免疫治疗的反应和预后 | 首次探讨了脂质代谢与肺腺癌预后及治疗反应之间的关系，并构建了一个基于脂质代谢相关基因的风险评分模型 | 需要进一步的临床试验来验证该模型的预测准确性和实用性 | 研究脂质代谢在肺腺癌中的作用，并开发一个能够预测患者对免疫治疗反应和预后的风险评分模型 | 肺腺癌患者的脂质代谢相关基因及其对免疫治疗反应和预后的影响 | 数字病理学 | 肺腺癌 | RNA测序 | 非负矩阵分解（NMF） | RNA测序数据 | 包括七个批量RNA测序数据集和一个单细胞RNA测序数据集，以及多个用于测试免疫治疗反应的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 227 | 2024-08-07 |
ZDHHC9: a promising therapeutic target for triple-negative breast cancer through immune modulation and immune checkpoint blockade resistance
2023-Oct-24, Discover. Oncology
DOI:10.1007/s12672-023-00790-4
PMID:37875591
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研究论文 | 本研究通过分析不同表达基因（DEGs）的表达谱，旨在识别三阴性乳腺癌（TNBC）的潜在治疗靶点 | 发现ZDHHC9通过免疫调节和免疫检查点阻断抵抗，是三阴性乳腺癌的一个有前景的治疗靶点 | NA | 识别三阴性乳腺癌的潜在治疗靶点 | 三阴性乳腺癌（TNBC） | NA | 乳腺癌 | Limma包，免疫组织化学（IHC）分析，蛋白质印迹（western blotting），流式细胞术，组织免疫荧光分析，加权基因共表达网络分析（WGCNA），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据，组织样本 | 使用了TCGA和GEO数据集，具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 228 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis reveals exosome-associated biomarkers for prognostic prediction and immunotherapy in lung adenocarcinoma
2023-10-24, Aging
DOI:10.18632/aging.205140
PMID:37878007
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了肺腺癌肿瘤微环境中的外泌体相关基因，并开发了外泌体相关签名用于预测肺腺癌的预后和免疫治疗效果 | 首次综合利用单细胞和批量RNA测序分析，开发了外泌体相关签名，为肺腺癌的临床诊断和治疗管理提供了重要见解 | NA | 探索外泌体相关基因在肺腺癌中的作用，并开发用于预后预测和免疫治疗的生物标志物 | 肺腺癌肿瘤微环境中的外泌体相关基因 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 多个批量RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 229 | 2024-08-05 |
The Communication from Immune Cells to the Fibroblasts in Keloids: Implications for Immunotherapy
2023-Oct-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242015475
PMID:37895153
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综述 | 本文更新了关于瘢痕疙瘩微环境的知识，重点关注免疫细胞与成纤维细胞之间的沟通。 | 探讨了瘢痕疙瘩作为一种炎症性皮肤疾病的潜力，为靶向免疫介导的新药开发提供了新的思路。 | 未提及具体的实验数据或临床试验结果以支持观点。 | 旨在加深对瘢痕疙瘩发病机制的理解，以促进有效治疗方法的发展。 | 重点研究免疫细胞与瘢痕疙瘩成纤维细胞之间的交流及其对治疗的影响。 | 数字病理学 | 瘢痕疙瘩 | 单细胞测序 | NA | 文献综述 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 230 | 2024-08-07 |
TSPLASSO: A Two-stage Prior LASSO Algorithm for Gene Selection using Omics Data
2023-Oct-23, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2023.3326485
PMID:37871092
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研究论文 | 本文提出了一种名为TSPLASSO的两阶段先验LASSO算法，用于利用组学数据进行基因选择 | TSPLASSO算法首次尝试在特征选择中使用先验信息，通过两阶段过程进行基因选择和样本分类 | NA | 开发一种新的算法，用于提高从组学数据中选择癌症基因的准确性 | 癌症基因和样本分类 | 生物信息学 | NA | LASSO | 线性回归和逻辑回归模型 | 组学数据 | 涉及六个真实世界数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 231 | 2024-08-07 |
Venetoclax Overcomes Sorafenib Resistance in Acute Myeloid Leukemia by Targeting BCL2
2023-Oct-16, Biology
DOI:10.3390/biology12101337
PMID:37887047
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研究论文 | 研究通过分析单细胞和批量转录数据，探讨了维奈托克克服索拉非尼在急性髓系白血病中的耐药性的机制 | 开发了一个平台来预测AML患者在接受索拉非尼治疗后的耐药性和临床结果，并发现维奈托克与索拉非尼联合使用可能是一种有效的治疗策略 | NA | 探讨索拉非尼在急性髓系白血病中的耐药机制及克服耐药性的策略 | 急性髓系白血病患者的单细胞和批量转录数据 | NA | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录数据 | 耐药性和对照的急性髓系白血病患者 | NA | NA | NA | NA |
| 232 | 2024-08-05 |
A Methodological Approach to Identify Natural Compounds with Antifibrotic Activity and the Potential to Treat Pulmonary Fibrosis Using Single-Cell Sequencing and Primary Human Lung Macrophages
2023-Oct-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242015104
PMID:37894784
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研究论文 | 本文提出了一种方法论来识别具有抗纤维化活性的天然化合物，潜在用于治疗肺纤维化 | 文章创新地利用单细胞测序和人肺巨噬细胞筛选抗纤维化化合物，为肺纤维化治疗提供新思路 | 研究中使用的人肺巨噬细胞来自硅肺病患者，可能影响结果的广泛适用性 | 识别能够促进巨噬细胞向抗纤维化转化的天然化合物 | 以特定的单细胞转录组数据为基础，研究巨噬细胞基因表达和反应 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 从整个肺洗液中回收的人肺巨噬细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 233 | 2024-08-07 |
Using LLMs and Explainable ML to Analyze Biomarkers at Single-Cell Level for Improved Understanding of Diseases
2023-10-12, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13101516
PMID:37892198
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研究论文 | 本文提出了一种结合大型语言模型（LLM）和可解释机器学习的方法，用于分析单细胞水平的生物标志物，以更好地理解疾病 | 本文的创新点在于使用LLM框架和可解释机器学习来促进单细胞数据集之间的泛化，并识别基因签名以捕捉疾病驱动的转录变化 | NA | 旨在通过分析单细胞RNA测序数据，提高对疾病相关细胞类型的识别和理解 | 单细胞RNA测序数据和疾病相关细胞类型 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | scBERT | 转录组数据 | 使用了来自健康个体和溃疡性结肠炎患者的四个公开可用的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 234 | 2024-08-05 |
YAP/ACSL4 Pathway-Mediated Ferroptosis Promotes Renal Fibrosis in the Presence of Kidney Stones
2023-Oct-01, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11102692
PMID:37893066
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研究论文 | 这项研究探讨了YAP/ACSL4通路介导的铁死亡如何促进肾结石引发的肾纤维化 | 首次阐明了YAP-ACSL4轴介导的铁死亡在钙草酸盐结晶沉积引发的肾纤维化中的作用及其分子机制 | 未提及具体的临床试验数据或长期影响评估 | 探讨钙草酸盐结石对肾纤维化的影响及其相关机制 | 钙草酸盐结石患者的肾组织和小鼠模型 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞测序、转录组RNA测序、免疫组化分析、西方 blot 分析 | NA | 组织样本 | 患者的肾组织和小鼠模型的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 235 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome and metagenome profiling reveals the genetic basis of rumen functions and convergent developmental patterns in ruminants
2023-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278239.123
PMID:37884341
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组和元基因组分析，揭示了反刍动物瘤胃功能和发育模式的遗传基础 | 构建了从胚胎早期到反刍阶段的全面转录组和元基因组图谱，重现了瘤胃的组织形态学和转录特征，揭示了瘤胃细胞、微生物群和核心转录调控网络发育的关键过渡特征 | NA | 研究瘤胃发育过程中的动态变化，并揭示其遗传基础 | 羊和山羊的瘤胃组织 | NA | NA | 单细胞转录组和元基因组分析 | NA | 转录组和元基因组数据 | 约308,000个细胞，来自17个时间点的羊和山羊瘤胃组织 | NA | NA | NA | NA |
| 236 | 2024-08-07 |
Collagen 1-mediated CXCL1 secretion in tumor cells activates fibroblasts to promote radioresistance of esophageal cancer
2023-10-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113270
PMID:37851572
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研究论文 | 本研究通过建立食管鳞状细胞癌（ESCC）患者的患者源性异种移植模型（PDXs），探讨了放射抵抗性的分子机制，并发现胶原蛋白1（Col1）和CXCL1在其中的作用 | 揭示了Col1通过增强DNA修复能力促进放射抵抗性，并诱导肿瘤细胞分泌CXCL1，进而通过CXCR2-STAT3途径激活癌症相关成纤维细胞（CAFs），形成正反馈循环 | NA | 探讨食管鳞状细胞癌放射治疗中放射抵抗性的分子机制 | 食管鳞状细胞癌患者的患者源性异种移植模型（PDXs） | 数字病理学 | 食管癌 | RNA测序，细胞因子阵列，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 19名ESCC患者 | NA | NA | NA | NA |
| 237 | 2024-08-07 |
Distinctiveness and continuity in transcriptome and connectivity in the anterior-posterior axis of the paraventricular nucleus of the thalamus
2023-10-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113309
PMID:37862168
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research paper | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了小鼠丘脑室旁核（PVT）神经元的转录组特征，并探讨了其在前后轴上的差异和连续性 | 发现了PVT神经元在前后轴上的转录组差异和细胞类型的连续性，以及不同亚群对食欲相关神经肽的不同反应 | NA | 揭示丘脑室旁核神经元的功能基础 | 小鼠丘脑室旁核神经元的转录组特征及其在前后轴上的差异和连续性 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 238 | 2024-08-07 |
Imaging and multi-omics datasets converge to define different neural progenitor origins for ATRT-SHH subgroups
2023-10-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-42371-7
PMID:37863903
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研究论文 | 本文通过跨物种分析，研究了非典型畸胎瘤横纹肌样瘤（ATRT）的影像学和分子特征，特别是SHH亚组的神经前体细胞起源 | 首次明确区分了来自小脑前叶（CAL）和基底神经节/室管膜（BG/IV）区域的SHH ATRT，并利用单细胞RNA测序支持这些假设 | NA | 探讨ATRT不同亚组的神经前体细胞起源 | 非典型畸胎瘤横纹肌样瘤（ATRT）的影像学和分子特征 | 数字病理学 | 非典型畸胎瘤横纹肌样瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 影像数据，分子数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 239 | 2024-08-07 |
Sympathetic activity regulates epithelial proliferation and wound healing via adrenergic receptor α2A
2023-10-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-45160-w
PMID:37863979
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研究论文 | 研究探讨了交感神经系统通过肾上腺素受体α2A调节肠道上皮细胞增殖和伤口愈合的作用 | 首次证实了肾上腺素受体α在肠道上皮细胞中的主要作用，并展示了其对上皮细胞增殖、分化和宿主防御的影响 | NA | 研究肾上腺素受体α在肠道上皮细胞中的作用及其对伤口愈合的影响 | 肠道上皮细胞和小鼠模型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 使用了公开的单细胞RNA测序数据集和小鼠模型及肠道类器官培养 | NA | NA | NA | NA |
| 240 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics reveal basal sex differences in supraoptic nucleus gene expression of adult rats related to cell signaling and ribosomal pathways
2023-10-19, Biology of sex differences
IF:4.9Q1
DOI:10.1186/s13293-023-00554-3
PMID:37858270
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研究论文 | 本研究揭示了成年大鼠上视核中与细胞信号和核糖体通路相关的性别差异基因表达 | 首次使用空间转录组技术来探究成年大鼠上视核中性别差异基因表达 | 样本量相对较小，仅为8只大鼠，限制了结果的广泛性 | 探讨上视核中性别差异的基因表达及其相关通路 | 成年雄性和雌性斯普拉格-道利鼠 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 8只大鼠（4只雄性，4只雌性） | NA | NA | NA | NA |