单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 415 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-08-07 |
Glioblastoma initiation, migration, and cell types are regulated by core bHLH transcription factors ASCL1 and OLIG2
2023-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.30.560206
PMID:37873200
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研究论文 | 本文研究了神经发育转录因子ASCL1和OLIG2在胶质母细胞瘤（GBM）中的作用，揭示了它们在调控GBM肿瘤细胞异质性和层次结构中的关键角色 | 首次展示了ASCL1和OLIG2在GBM肿瘤细胞类型和迁移程度中的动态水平和相互结合作用，并通过单细胞RNA测序揭示了ASCL1在定义胶质瘤干细胞（GSCs）中的关键作用 | NA | 探讨ASCL1和OLIG2在胶质母细胞瘤中的调控作用及其对肿瘤细胞异质性和层次结构的影响 | 胶质母细胞瘤（GBM）及其肿瘤细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 222 | 2024-08-05 |
YAP/ACSL4 Pathway-Mediated Ferroptosis Promotes Renal Fibrosis in the Presence of Kidney Stones
2023-Oct-01, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11102692
PMID:37893066
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研究论文 | 这项研究探讨了YAP/ACSL4通路介导的铁死亡如何促进肾结石引发的肾纤维化 | 首次阐明了YAP-ACSL4轴介导的铁死亡在钙草酸盐结晶沉积引发的肾纤维化中的作用及其分子机制 | 未提及具体的临床试验数据或长期影响评估 | 探讨钙草酸盐结石对肾纤维化的影响及其相关机制 | 钙草酸盐结石患者的肾组织和小鼠模型 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞测序、转录组RNA测序、免疫组化分析、西方 blot 分析 | NA | 组织样本 | 患者的肾组织和小鼠模型的样本 |
| 223 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome and metagenome profiling reveals the genetic basis of rumen functions and convergent developmental patterns in ruminants
2023-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278239.123
PMID:37884341
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组和元基因组分析，揭示了反刍动物瘤胃功能和发育模式的遗传基础 | 构建了从胚胎早期到反刍阶段的全面转录组和元基因组图谱，重现了瘤胃的组织形态学和转录特征，揭示了瘤胃细胞、微生物群和核心转录调控网络发育的关键过渡特征 | NA | 研究瘤胃发育过程中的动态变化，并揭示其遗传基础 | 羊和山羊的瘤胃组织 | NA | NA | 单细胞转录组和元基因组分析 | NA | 转录组和元基因组数据 | 约308,000个细胞，来自17个时间点的羊和山羊瘤胃组织 |
| 224 | 2024-08-07 |
Collagen 1-mediated CXCL1 secretion in tumor cells activates fibroblasts to promote radioresistance of esophageal cancer
2023-10-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113270
PMID:37851572
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研究论文 | 本研究通过建立食管鳞状细胞癌（ESCC）患者的患者源性异种移植模型（PDXs），探讨了放射抵抗性的分子机制，并发现胶原蛋白1（Col1）和CXCL1在其中的作用 | 揭示了Col1通过增强DNA修复能力促进放射抵抗性，并诱导肿瘤细胞分泌CXCL1，进而通过CXCR2-STAT3途径激活癌症相关成纤维细胞（CAFs），形成正反馈循环 | NA | 探讨食管鳞状细胞癌放射治疗中放射抵抗性的分子机制 | 食管鳞状细胞癌患者的患者源性异种移植模型（PDXs） | 数字病理学 | 食管癌 | RNA测序，细胞因子阵列，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 19名ESCC患者 |
| 225 | 2024-08-07 |
Distinctiveness and continuity in transcriptome and connectivity in the anterior-posterior axis of the paraventricular nucleus of the thalamus
2023-10-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113309
PMID:37862168
|
research paper | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了小鼠丘脑室旁核（PVT）神经元的转录组特征，并探讨了其在前后轴上的差异和连续性 | 发现了PVT神经元在前后轴上的转录组差异和细胞类型的连续性，以及不同亚群对食欲相关神经肽的不同反应 | NA | 揭示丘脑室旁核神经元的功能基础 | 小鼠丘脑室旁核神经元的转录组特征及其在前后轴上的差异和连续性 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 226 | 2024-08-07 |
Imaging and multi-omics datasets converge to define different neural progenitor origins for ATRT-SHH subgroups
2023-10-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-42371-7
PMID:37863903
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研究论文 | 本文通过跨物种分析，研究了非典型畸胎瘤横纹肌样瘤（ATRT）的影像学和分子特征，特别是SHH亚组的神经前体细胞起源 | 首次明确区分了来自小脑前叶（CAL）和基底神经节/室管膜（BG/IV）区域的SHH ATRT，并利用单细胞RNA测序支持这些假设 | NA | 探讨ATRT不同亚组的神经前体细胞起源 | 非典型畸胎瘤横纹肌样瘤（ATRT）的影像学和分子特征 | 数字病理学 | 非典型畸胎瘤横纹肌样瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 影像数据，分子数据 | NA |
| 227 | 2024-08-07 |
Sympathetic activity regulates epithelial proliferation and wound healing via adrenergic receptor α2A
2023-10-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-45160-w
PMID:37863979
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研究论文 | 研究探讨了交感神经系统通过肾上腺素受体α2A调节肠道上皮细胞增殖和伤口愈合的作用 | 首次证实了肾上腺素受体α在肠道上皮细胞中的主要作用，并展示了其对上皮细胞增殖、分化和宿主防御的影响 | NA | 研究肾上腺素受体α在肠道上皮细胞中的作用及其对伤口愈合的影响 | 肠道上皮细胞和小鼠模型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 使用了公开的单细胞RNA测序数据集和小鼠模型及肠道类器官培养 |
| 228 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics reveal basal sex differences in supraoptic nucleus gene expression of adult rats related to cell signaling and ribosomal pathways
2023-10-19, Biology of sex differences
IF:4.9Q1
DOI:10.1186/s13293-023-00554-3
PMID:37858270
|
研究论文 | 本研究揭示了成年大鼠上视核中与细胞信号和核糖体通路相关的性别差异基因表达 | 首次使用空间转录组技术来探究成年大鼠上视核中性别差异基因表达 | 样本量相对较小，仅为8只大鼠，限制了结果的广泛性 | 探讨上视核中性别差异的基因表达及其相关通路 | 成年雄性和雌性斯普拉格-道利鼠 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 8只大鼠（4只雄性，4只雌性） |
| 229 | 2024-08-05 |
Macrophage-driven cardiac inflammation and healing: insights from homeostasis and myocardial infarction
2023-Oct-19, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-023-00491-4
PMID:37858035
|
综述 | 本文总结了巨噬细胞在心脏稳态和心肌梗死后修复过程中的作用 | 探讨了巨噬细胞的异质性与可塑性，并讨论了精准医学在临床研究中的应用 | 经典的M1和M2巨噬细胞分类过于简化，未能满足精准医疗的标准 | 研究巨噬细胞在心肌梗死发生后对心脏炎症和修复的影响 | 巨噬细胞的起源、组织分布、分类和表面标记 | 数字病理学 | 心肌梗死 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 230 | 2024-08-07 |
The energy metabolism of Balantidium polyvacuolum inhabiting the hindgut of Xenocypris davidi
2023-Oct-19, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09706-6
PMID:37858069
|
研究论文 | 本研究使用透射电子显微镜和单细胞转录组分析揭示了寄生于戴氏鲌鱼后肠的Balantidium polyvacuolum的代谢机制 | 首次详细描述了Balantidium polyvacuolum的线粒体相关器官（MROs）的特殊结构及其可能的代谢途径 | NA | 探究Balantidium polyvacuolum适应消化道微环境的分子机制 | Balantidium polyvacuolum的代谢机制 | NA | NA | 透射电子显微镜（TEM）、单细胞转录组分析 | NA | 图像、转录组数据 | NA |
| 231 | 2024-08-05 |
Exploring the global immune landscape of peripheral blood mononuclear cells in H5N6-infected patient with single-cell transcriptomics
2023-10-18, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-023-01693-7
PMID:37853397
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组技术描绘了H5N6感染患者外周血单核细胞的免疫细胞景观 | 采用单细胞RNA测序技术，揭示了H5N6感染个体外周血中的免疫细胞组成及其相关的分子机制 | 样本量有限，仅包括一名重症儿童和一名健康对照，可能影响结果的普遍性 | 研究H5N6感染患者的免疫细胞组成和其在发病机制中的作用 | 外周血单核细胞样本来自一名H5N6禽流感感染的危重儿童和一名健康对照供体 | 数字病理学 | 禽流感 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 合计3,248个单细胞转录组，包括一名H5N6感染儿童和一名健康对照供体 |
| 232 | 2024-08-05 |
Cuproptosis-related gene SLC31A1: prognosis values and potential biological functions in cancer
2023-10-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-44681-8
PMID:37853210
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研究论文 | 本研究探讨了SLC31A1在癌症中的作用及其预后价值 | 揭示了SLC31A1在多种癌症中的表达变化及其与免疫细胞的正相关性 | 对于SLC31A1在各种癌症中的具体机制仍未深入探讨 | 阐明SLC31A1在多种人类恶性肿瘤中的作用及预后价值 | 各类癌症患者中的SLC31A1基因及其表达情况 | 数字病理学 | 妇科癌症 | 单细胞测序、基因组数据库分析 | NA | 基因表达数据 | 采用来自癌症基因组图谱数据库的原始数据，涉及33种癌症 |
| 233 | 2024-08-05 |
Potential network markers and signaling pathways for B cells of COVID-19 based on single-cell condition-specific networks
2023-Oct-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09719-1
PMID:37853311
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研究论文 | 本文探讨了COVID-19感染的人类B细胞的潜在网络标记和相关信号通路 | 研究揭示了与COVID-19高度相关的枢纽基因和'黑暗'基因，并首次链接了这些基因及其编码的关键蛋白与JAK-STAT通路 | 未提及具体的样本数量和实验细节，可能影响结果的普适性 | 研究COVID-19感染对人类B细胞的影响及其潜在的生物标志物 | 人类B细胞，尤其是受到COVID-19感染的B细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞测序 | 条件细胞特异性网络模型 | 基因表达数据 | NA |
| 234 | 2024-08-05 |
Deciphering intratumoral heterogeneity of hepatocellular carcinoma with microvascular invasion with radiogenomic analysis
2023-10-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04586-6
PMID:37853415
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研究论文 | 本研究揭示了微血管侵袭阳性肝细胞癌的细胞图谱和免疫浸润模式 | 本研究创新性地结合了辐射基因组学分析，揭示了MVI+ HCC的细胞亚群相互作用和独特的代谢特征 | 样本数量相对较小，可能限制了结果的普遍性和代表性 | 本研究旨在通过辐射组学分析探索MVI+ 肝细胞癌的细胞图谱及其免疫浸润特征 | 分析了三例MVI阳性和三例MVI阴性的肝细胞癌样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序，整体转录组测序，辐射组学分析，外显子组测序 | NA | 组织样本 | 使用了6个单细胞样本以及26个MVI阳性和30个MVI阴性肝细胞癌组织样本 |
| 235 | 2024-08-05 |
Interaction, immune infiltration characteristics and prognostic modeling of efferocytosis-related subtypes in glioblastoma
2023-10-18, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-023-01688-4
PMID:37853449
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研究论文 | 本文探讨了与吞噬作用相关的亚型在胶质母细胞瘤中的相互作用、免疫浸润特征和预后建模 | 提出了一种新的与吞噬作用相关的评分系统，提供了胶质母细胞瘤肿瘤微环境的深入见解 | 对吞噬作用在胶质母细胞瘤中的作用了解不足 | 研究与吞噬作用相关的基因在胶质母细胞瘤中的表达和功能 | 549名胶质母细胞瘤患者和相关的22个与吞噬作用相关的基因 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq | 无监督聚类算法 | 基因表达数据 | 549名胶质母细胞瘤患者 |
| 236 | 2024-08-07 |
Author Correction: Probabilistic embedding, clustering, and alignment for integrating spatial transcriptomics data with PRECAST
2023-Oct-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-42412-1
PMID:37852962
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 237 | 2024-08-07 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing analysis identified pyroptosis-related signature for diagnosis and prognosis in osteoarthritis
2023-10-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-44724-0
PMID:37853066
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，探讨了焦亡相关基因在骨关节炎中的作用及其在不同软骨细胞亚型中的表达 | 本研究首次识别了与焦亡相关的骨关节炎诊断和预后标志物，并探索了软骨细胞在骨关节炎和正常样本中的异质性 | NA | 研究焦亡相关基因在骨关节炎中的作用及其表达，以识别新的诊断和预后标志物 | 骨关节炎及其相关软骨细胞亚型 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序和RNA-seq | NA | RNA | 涉及多个骨关节炎相关数据集和正常样本 |
| 238 | 2024-08-07 |
Single-cell characterization of self-renewing primary trophoblast organoids as modeling of EVT differentiation and interactions with decidual natural killer cells
2023-Oct-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09690-x
PMID:37853336
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研究论文 | 本文首次从人类胎盘绒毛中生成自我更新的滋养层器官（TO），并将其分化为外绒毛滋养层细胞（EVT-TO），以研究分化事件和与母体蜕膜自然杀伤（NK）细胞的相互作用。 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）全面表征和分子探索了TO模型中的EVT分化及其与dNK的相互作用，揭示了多种不同的滋养层状态和dNK亚群，并发现了细胞类型特异性的转录因子（TF）调控网络和配体-受体复合物。 | NA | 研究外绒毛滋养层细胞（EVT）的分化及其与母体蜕膜自然杀伤（NK）细胞的相互作用，为人类胎盘研究提供新的方法和线索。 | 人类胎盘绒毛生成的自我更新滋养层器官（TO）及其分化为的外绒毛滋养层细胞（EVT-TO），以及与母体蜕膜自然杀伤（NK）细胞的相互作用。 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 多种不同的滋养层状态和dNK亚群 |
| 239 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals pro-invasive cancer-associated fibroblasts in hypopharyngeal squamous cell carcinoma
2023-10-18, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-023-01312-z
PMID:37853464
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了喉下鳞状细胞癌中的癌症相关成纤维细胞，揭示了其在肿瘤微环境中的作用 | 首次详细描述了喉下鳞状细胞癌中恶性肿瘤相关成纤维细胞的亚型及其在促进肿瘤侵袭和构建肿瘤有利微环境中的作用 | NA | 探索喉下鳞状细胞癌的治疗新靶点和联合治疗策略 | 喉下鳞状细胞癌组织及其邻近正常黏膜 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 6例未经治疗的喉下鳞状细胞癌患者的主要肿瘤组织和2例邻近正常黏膜 |
| 240 | 2024-08-05 |
Resolving the tissue response to neoadjuvant chemotherapy in rectal cancer
2023-10-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101232
PMID:37852182
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研究论文 | 本文呈现了直肠癌肿瘤微环境在新辅助化疗前后的综合单细胞转录组分析 | 提供了直肠癌新辅助化疗对肿瘤微环境影响的深入数据 | 没有提供更广泛人群的样本数据 | 研究新辅助化疗对直肠癌肿瘤微环境的影响 | 直肠癌肿瘤及其微环境 | 数字病理学 | 直肠癌 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |