单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 413 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis reveals exosome-associated biomarkers for prognostic prediction and immunotherapy in lung adenocarcinoma
2023-10-24, Aging
DOI:10.18632/aging.205140
PMID:37878007
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了肺腺癌肿瘤微环境中的外泌体相关基因，并开发了外泌体相关签名用于预测肺腺癌的预后和免疫治疗效果 | 首次综合利用单细胞和批量RNA测序分析，开发了外泌体相关签名，为肺腺癌的临床诊断和治疗管理提供了重要见解 | NA | 探索外泌体相关基因在肺腺癌中的作用，并开发用于预后预测和免疫治疗的生物标志物 | 肺腺癌肿瘤微环境中的外泌体相关基因 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 多个批量RNA测序数据集 |
| 222 | 2024-08-05 |
The Communication from Immune Cells to the Fibroblasts in Keloids: Implications for Immunotherapy
2023-Oct-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242015475
PMID:37895153
|
综述 | 本文更新了关于瘢痕疙瘩微环境的知识，重点关注免疫细胞与成纤维细胞之间的沟通。 | 探讨了瘢痕疙瘩作为一种炎症性皮肤疾病的潜力，为靶向免疫介导的新药开发提供了新的思路。 | 未提及具体的实验数据或临床试验结果以支持观点。 | 旨在加深对瘢痕疙瘩发病机制的理解，以促进有效治疗方法的发展。 | 重点研究免疫细胞与瘢痕疙瘩成纤维细胞之间的交流及其对治疗的影响。 | 数字病理学 | 瘢痕疙瘩 | 单细胞测序 | NA | 文献综述 | NA |
| 223 | 2024-08-07 |
TSPLASSO: A Two-stage Prior LASSO Algorithm for Gene Selection using Omics Data
2023-Oct-23, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2023.3326485
PMID:37871092
|
研究论文 | 本文提出了一种名为TSPLASSO的两阶段先验LASSO算法，用于利用组学数据进行基因选择 | TSPLASSO算法首次尝试在特征选择中使用先验信息，通过两阶段过程进行基因选择和样本分类 | NA | 开发一种新的算法，用于提高从组学数据中选择癌症基因的准确性 | 癌症基因和样本分类 | 生物信息学 | NA | LASSO | 线性回归和逻辑回归模型 | 组学数据 | 涉及六个真实世界数据集 |
| 224 | 2024-08-07 |
Venetoclax Overcomes Sorafenib Resistance in Acute Myeloid Leukemia by Targeting BCL2
2023-Oct-16, Biology
DOI:10.3390/biology12101337
PMID:37887047
|
研究论文 | 研究通过分析单细胞和批量转录数据，探讨了维奈托克克服索拉非尼在急性髓系白血病中的耐药性的机制 | 开发了一个平台来预测AML患者在接受索拉非尼治疗后的耐药性和临床结果，并发现维奈托克与索拉非尼联合使用可能是一种有效的治疗策略 | NA | 探讨索拉非尼在急性髓系白血病中的耐药机制及克服耐药性的策略 | 急性髓系白血病患者的单细胞和批量转录数据 | NA | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录数据 | 耐药性和对照的急性髓系白血病患者 |
| 225 | 2024-08-05 |
A Methodological Approach to Identify Natural Compounds with Antifibrotic Activity and the Potential to Treat Pulmonary Fibrosis Using Single-Cell Sequencing and Primary Human Lung Macrophages
2023-Oct-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242015104
PMID:37894784
|
研究论文 | 本文提出了一种方法论来识别具有抗纤维化活性的天然化合物，潜在用于治疗肺纤维化 | 文章创新地利用单细胞测序和人肺巨噬细胞筛选抗纤维化化合物，为肺纤维化治疗提供新思路 | 研究中使用的人肺巨噬细胞来自硅肺病患者，可能影响结果的广泛适用性 | 识别能够促进巨噬细胞向抗纤维化转化的天然化合物 | 以特定的单细胞转录组数据为基础，研究巨噬细胞基因表达和反应 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 从整个肺洗液中回收的人肺巨噬细胞样本 |
| 226 | 2024-08-07 |
Using LLMs and Explainable ML to Analyze Biomarkers at Single-Cell Level for Improved Understanding of Diseases
2023-10-12, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13101516
PMID:37892198
|
研究论文 | 本文提出了一种结合大型语言模型（LLM）和可解释机器学习的方法，用于分析单细胞水平的生物标志物，以更好地理解疾病 | 本文的创新点在于使用LLM框架和可解释机器学习来促进单细胞数据集之间的泛化，并识别基因签名以捕捉疾病驱动的转录变化 | NA | 旨在通过分析单细胞RNA测序数据，提高对疾病相关细胞类型的识别和理解 | 单细胞RNA测序数据和疾病相关细胞类型 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | scBERT | 转录组数据 | 使用了来自健康个体和溃疡性结肠炎患者的四个公开可用的单细胞RNA测序数据集 |
| 227 | 2024-08-05 |
YAP/ACSL4 Pathway-Mediated Ferroptosis Promotes Renal Fibrosis in the Presence of Kidney Stones
2023-Oct-01, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11102692
PMID:37893066
|
研究论文 | 这项研究探讨了YAP/ACSL4通路介导的铁死亡如何促进肾结石引发的肾纤维化 | 首次阐明了YAP-ACSL4轴介导的铁死亡在钙草酸盐结晶沉积引发的肾纤维化中的作用及其分子机制 | 未提及具体的临床试验数据或长期影响评估 | 探讨钙草酸盐结石对肾纤维化的影响及其相关机制 | 钙草酸盐结石患者的肾组织和小鼠模型 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞测序、转录组RNA测序、免疫组化分析、西方 blot 分析 | NA | 组织样本 | 患者的肾组织和小鼠模型的样本 |
| 228 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome and metagenome profiling reveals the genetic basis of rumen functions and convergent developmental patterns in ruminants
2023-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278239.123
PMID:37884341
|
研究论文 | 研究通过单细胞转录组和元基因组分析，揭示了反刍动物瘤胃功能和发育模式的遗传基础 | 构建了从胚胎早期到反刍阶段的全面转录组和元基因组图谱，重现了瘤胃的组织形态学和转录特征，揭示了瘤胃细胞、微生物群和核心转录调控网络发育的关键过渡特征 | NA | 研究瘤胃发育过程中的动态变化，并揭示其遗传基础 | 羊和山羊的瘤胃组织 | NA | NA | 单细胞转录组和元基因组分析 | NA | 转录组和元基因组数据 | 约308,000个细胞，来自17个时间点的羊和山羊瘤胃组织 |
| 229 | 2024-08-07 |
Collagen 1-mediated CXCL1 secretion in tumor cells activates fibroblasts to promote radioresistance of esophageal cancer
2023-10-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113270
PMID:37851572
|
研究论文 | 本研究通过建立食管鳞状细胞癌（ESCC）患者的患者源性异种移植模型（PDXs），探讨了放射抵抗性的分子机制，并发现胶原蛋白1（Col1）和CXCL1在其中的作用 | 揭示了Col1通过增强DNA修复能力促进放射抵抗性，并诱导肿瘤细胞分泌CXCL1，进而通过CXCR2-STAT3途径激活癌症相关成纤维细胞（CAFs），形成正反馈循环 | NA | 探讨食管鳞状细胞癌放射治疗中放射抵抗性的分子机制 | 食管鳞状细胞癌患者的患者源性异种移植模型（PDXs） | 数字病理学 | 食管癌 | RNA测序，细胞因子阵列，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 19名ESCC患者 |
| 230 | 2024-08-07 |
Distinctiveness and continuity in transcriptome and connectivity in the anterior-posterior axis of the paraventricular nucleus of the thalamus
2023-10-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113309
PMID:37862168
|
research paper | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了小鼠丘脑室旁核（PVT）神经元的转录组特征，并探讨了其在前后轴上的差异和连续性 | 发现了PVT神经元在前后轴上的转录组差异和细胞类型的连续性，以及不同亚群对食欲相关神经肽的不同反应 | NA | 揭示丘脑室旁核神经元的功能基础 | 小鼠丘脑室旁核神经元的转录组特征及其在前后轴上的差异和连续性 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 231 | 2024-08-07 |
Imaging and multi-omics datasets converge to define different neural progenitor origins for ATRT-SHH subgroups
2023-10-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-42371-7
PMID:37863903
|
研究论文 | 本文通过跨物种分析，研究了非典型畸胎瘤横纹肌样瘤（ATRT）的影像学和分子特征，特别是SHH亚组的神经前体细胞起源 | 首次明确区分了来自小脑前叶（CAL）和基底神经节/室管膜（BG/IV）区域的SHH ATRT，并利用单细胞RNA测序支持这些假设 | NA | 探讨ATRT不同亚组的神经前体细胞起源 | 非典型畸胎瘤横纹肌样瘤（ATRT）的影像学和分子特征 | 数字病理学 | 非典型畸胎瘤横纹肌样瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 影像数据，分子数据 | NA |
| 232 | 2024-08-07 |
Sympathetic activity regulates epithelial proliferation and wound healing via adrenergic receptor α2A
2023-10-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-45160-w
PMID:37863979
|
研究论文 | 研究探讨了交感神经系统通过肾上腺素受体α2A调节肠道上皮细胞增殖和伤口愈合的作用 | 首次证实了肾上腺素受体α在肠道上皮细胞中的主要作用，并展示了其对上皮细胞增殖、分化和宿主防御的影响 | NA | 研究肾上腺素受体α在肠道上皮细胞中的作用及其对伤口愈合的影响 | 肠道上皮细胞和小鼠模型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 使用了公开的单细胞RNA测序数据集和小鼠模型及肠道类器官培养 |
| 233 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics reveal basal sex differences in supraoptic nucleus gene expression of adult rats related to cell signaling and ribosomal pathways
2023-10-19, Biology of sex differences
IF:4.9Q1
DOI:10.1186/s13293-023-00554-3
PMID:37858270
|
研究论文 | 本研究揭示了成年大鼠上视核中与细胞信号和核糖体通路相关的性别差异基因表达 | 首次使用空间转录组技术来探究成年大鼠上视核中性别差异基因表达 | 样本量相对较小，仅为8只大鼠，限制了结果的广泛性 | 探讨上视核中性别差异的基因表达及其相关通路 | 成年雄性和雌性斯普拉格-道利鼠 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 8只大鼠（4只雄性，4只雌性） |
| 234 | 2024-08-05 |
Macrophage-driven cardiac inflammation and healing: insights from homeostasis and myocardial infarction
2023-Oct-19, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-023-00491-4
PMID:37858035
|
综述 | 本文总结了巨噬细胞在心脏稳态和心肌梗死后修复过程中的作用 | 探讨了巨噬细胞的异质性与可塑性，并讨论了精准医学在临床研究中的应用 | 经典的M1和M2巨噬细胞分类过于简化，未能满足精准医疗的标准 | 研究巨噬细胞在心肌梗死发生后对心脏炎症和修复的影响 | 巨噬细胞的起源、组织分布、分类和表面标记 | 数字病理学 | 心肌梗死 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 235 | 2024-08-07 |
The energy metabolism of Balantidium polyvacuolum inhabiting the hindgut of Xenocypris davidi
2023-Oct-19, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09706-6
PMID:37858069
|
研究论文 | 本研究使用透射电子显微镜和单细胞转录组分析揭示了寄生于戴氏鲌鱼后肠的Balantidium polyvacuolum的代谢机制 | 首次详细描述了Balantidium polyvacuolum的线粒体相关器官（MROs）的特殊结构及其可能的代谢途径 | NA | 探究Balantidium polyvacuolum适应消化道微环境的分子机制 | Balantidium polyvacuolum的代谢机制 | NA | NA | 透射电子显微镜（TEM）、单细胞转录组分析 | NA | 图像、转录组数据 | NA |
| 236 | 2024-08-05 |
Exploring the global immune landscape of peripheral blood mononuclear cells in H5N6-infected patient with single-cell transcriptomics
2023-10-18, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-023-01693-7
PMID:37853397
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组技术描绘了H5N6感染患者外周血单核细胞的免疫细胞景观 | 采用单细胞RNA测序技术，揭示了H5N6感染个体外周血中的免疫细胞组成及其相关的分子机制 | 样本量有限，仅包括一名重症儿童和一名健康对照，可能影响结果的普遍性 | 研究H5N6感染患者的免疫细胞组成和其在发病机制中的作用 | 外周血单核细胞样本来自一名H5N6禽流感感染的危重儿童和一名健康对照供体 | 数字病理学 | 禽流感 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 合计3,248个单细胞转录组，包括一名H5N6感染儿童和一名健康对照供体 |
| 237 | 2024-08-05 |
Cuproptosis-related gene SLC31A1: prognosis values and potential biological functions in cancer
2023-10-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-44681-8
PMID:37853210
|
研究论文 | 本研究探讨了SLC31A1在癌症中的作用及其预后价值 | 揭示了SLC31A1在多种癌症中的表达变化及其与免疫细胞的正相关性 | 对于SLC31A1在各种癌症中的具体机制仍未深入探讨 | 阐明SLC31A1在多种人类恶性肿瘤中的作用及预后价值 | 各类癌症患者中的SLC31A1基因及其表达情况 | 数字病理学 | 妇科癌症 | 单细胞测序、基因组数据库分析 | NA | 基因表达数据 | 采用来自癌症基因组图谱数据库的原始数据，涉及33种癌症 |
| 238 | 2024-08-05 |
Potential network markers and signaling pathways for B cells of COVID-19 based on single-cell condition-specific networks
2023-Oct-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09719-1
PMID:37853311
|
研究论文 | 本文探讨了COVID-19感染的人类B细胞的潜在网络标记和相关信号通路 | 研究揭示了与COVID-19高度相关的枢纽基因和'黑暗'基因，并首次链接了这些基因及其编码的关键蛋白与JAK-STAT通路 | 未提及具体的样本数量和实验细节，可能影响结果的普适性 | 研究COVID-19感染对人类B细胞的影响及其潜在的生物标志物 | 人类B细胞，尤其是受到COVID-19感染的B细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞测序 | 条件细胞特异性网络模型 | 基因表达数据 | NA |
| 239 | 2024-08-05 |
Deciphering intratumoral heterogeneity of hepatocellular carcinoma with microvascular invasion with radiogenomic analysis
2023-10-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04586-6
PMID:37853415
|
研究论文 | 本研究揭示了微血管侵袭阳性肝细胞癌的细胞图谱和免疫浸润模式 | 本研究创新性地结合了辐射基因组学分析，揭示了MVI+ HCC的细胞亚群相互作用和独特的代谢特征 | 样本数量相对较小，可能限制了结果的普遍性和代表性 | 本研究旨在通过辐射组学分析探索MVI+ 肝细胞癌的细胞图谱及其免疫浸润特征 | 分析了三例MVI阳性和三例MVI阴性的肝细胞癌样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序，整体转录组测序，辐射组学分析，外显子组测序 | NA | 组织样本 | 使用了6个单细胞样本以及26个MVI阳性和30个MVI阴性肝细胞癌组织样本 |
| 240 | 2024-08-05 |
Interaction, immune infiltration characteristics and prognostic modeling of efferocytosis-related subtypes in glioblastoma
2023-10-18, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-023-01688-4
PMID:37853449
|
研究论文 | 本文探讨了与吞噬作用相关的亚型在胶质母细胞瘤中的相互作用、免疫浸润特征和预后建模 | 提出了一种新的与吞噬作用相关的评分系统，提供了胶质母细胞瘤肿瘤微环境的深入见解 | 对吞噬作用在胶质母细胞瘤中的作用了解不足 | 研究与吞噬作用相关的基因在胶质母细胞瘤中的表达和功能 | 549名胶质母细胞瘤患者和相关的22个与吞噬作用相关的基因 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq | 无监督聚类算法 | 基因表达数据 | 549名胶质母细胞瘤患者 |