单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 413 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-08-05 |
Gene Expression Within a Human Choroidal Neovascular Membrane Using Spatial Transcriptomics
2023-10-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.64.13.40
PMID:37878301
|
研究论文 | 本研究空间分析了健康视网膜、视网膜色素上皮和脉络膜中的基因表达，并描述了在黄斑新生血管形成中失调的一组候选分子 | 首次使用空间转录组学在黄斑新生血管中的不同细胞类型上分析基因表达变化 | 对不同细胞类型在病理过程中的失调理解仍然有限 | 研究黄斑新生血管中的基因表达变化及相关细胞类型的失调 | 人类供体的黄斑新生血管样本与健康对照样本 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 空间RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 一个人类供体眼及一个健康对照供体 | NA | NA | NA | NA |
| 182 | 2024-08-04 |
The promising application of cell-cell interaction analysis in cancer from single-cell and spatial transcriptomics
2023-10, Seminars in cancer biology
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.semcancer.2023.07.001
PMID:37454878
|
综述 | 文章讨论了细胞间相互作用分析在癌症研究中的应用，特别是单细胞转录组学和空间转录组学的工具和方法 | 介绍了从非空间单细胞RNA测序中推断细胞-细胞相互作用的快速发展的计算工具，以及空间转录组数据的有限但逐渐增多的方法 | 空间转录组学数据的相关方法仍然有限 | 探讨细胞-细胞相互作用在癌症发展中的作用以及相关分析工具 | 单细胞转录组学和空间转录组学数据 | 数字病理学 | 癌症 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 183 | 2024-08-04 |
Suppression of FOXO1 attenuates inflamm-aging and improves liver function during aging
2023-10, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13968
PMID:37602516
|
研究论文 | 本研究探讨了FOXO1在衰老过程中对肝脏功能和炎症的影响 | 发现FOXO1在衰老小鼠肝脏中活性显著增加，其抑制可以缓解衰老引起的肝脏炎症和功能障碍 | FOXO1抑制对单核细胞衍生巨噬细胞功能静止的影响有限 | 研究衰老如何通过影响肝脏巨噬细胞引起肝功能变化的分子机制 | 使用小鼠模型研究老年小鼠肝脏的炎症和功能状态 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 老年小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 184 | 2024-08-07 |
S100a9 Protects Against the Effects of Repeated Social Defeat Stress
2023-Oct, Biological psychiatry global open science
DOI:10.1016/j.bpsgos.2022.12.002
PMID:37881565
|
研究论文 | 本研究探讨了S100a9在重复社交挫败应激（RSDS）模型中对炎症和氧化还原状态的影响 | 发现缺失钙卫蛋白显著增强了T淋巴细胞的代谢需求，表明该蛋白可能在线粒体调控中发挥未被描述的作用 | 研究仅限于小鼠模型，未来需在人类中验证这些发现 | 探究心理创伤后炎症和氧化还原状态的机制 | S100a9基因和钙卫蛋白在心理创伤后的作用 | NA | 创伤后应激障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 186只小鼠（93只对照，93只RSDS） | NA | NA | NA | NA |
| 185 | 2024-08-07 |
Identification of Cell Type-Specific Effects of DNMT3A Mutations on Relapse in Acute Myeloid Leukemia
2023-Oct-31, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2023.0093
PMID:37853686
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了急性髓系白血病（AML）不同阶段（诊断、完全缓解和复发）的骨髓单个核细胞，以探索DNMT3A突变在细胞类型特异性效应及其对AML复发的影响 | 本研究通过改进R882突变的靶向单细胞RNA测序检测，发现了从完全缓解到复发期间主要残留的突变细胞类型，并揭示了这些细胞与AML和白血病细胞相关的基因特征 | NA | 探索DNMT3A突变在急性髓系白血病中的细胞类型特异性效应及其对复发的影响 | 急性髓系白血病患者的骨髓单个核细胞 | 数字病理学 | 血液病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自同一患者在不同AML阶段的骨髓单个核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 186 | 2024-08-05 |
DNA-GPS: A theoretical framework for optics-free spatial genomics and synthesis of current methods
2023-10-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2023.08.005
PMID:37751737
|
研究论文 | 本文提出了一种名为DNA-GPS的理论框架，用于无光学的空间基因组学 | 提出DNA-GPS这一新框架，结合数学制图和位置索引的思路，实现了大规模的无光学空间基因组学 | 讨论了当前空间基因组学技术在分辨率和规模上的权衡及其局限性 | 旨在为大规模无光学空间基因组学提供理论基础 | 对现有空间基因组学技术进行分类并进行分析 | 数字病理学 | NA | NA | 数学制图 | 分子特征数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 187 | 2024-08-07 |
Landscape of mast cell populations across organs in mice and humans
2023-10-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230570
PMID:37462672
|
research paper | 本文通过结合全组织成像和单细胞RNA测序数据，对小鼠和人类在稳态下的MCs进行了跨器官分析 | 首次在全器官水平上分析了小鼠和人类的MCs亚型，并揭示了不同亚型的转录组核心特征 | NA | 研究小鼠和人类不同器官中肥大细胞（MCs）的分布和特征 | 小鼠和人类的肥大细胞（MCs）及其亚型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠和人类的多个器官 | NA | NA | NA | NA |
| 188 | 2024-08-07 |
miR-126 identifies a quiescent and chemo-resistant human B-ALL cell subset that correlates with minimal residual disease
2023-10, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-023-02009-5
PMID:37640845
|
研究论文 | 研究探讨了微小RNA-126（miR-126）在B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）中的作用，发现miR-126高表达的细胞亚群具有化疗抵抗和静止状态的特征，与最小残留病相关。 | 首次揭示了miR-126在B-ALL中的作用，及其与化疗抵抗和疾病持续的关系。 | 研究主要基于患者来源的异种移植模型，可能与临床实际情况存在差异。 | 探究miR-126在B-ALL中的作用及其与化疗抵抗和疾病持续的关系。 | B细胞急性淋巴细胞白血病细胞及其亚群。 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 8/9个患者来源的异种移植模型，多个成人和儿童B-ALL队列。 | NA | NA | NA | NA |
| 189 | 2024-08-05 |
Integrated Machine Learning and Bioinformatic Analyses Constructed a Network Between Mitochondrial Dysfunction and Immune Microenvironment of Periodontitis
2023-Oct, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-023-01851-0
PMID:37311930
|
研究论文 | 这项研究揭示了线粒体功能障碍与牙周炎免疫微环境之间的相互作用 | 首次通过集成机器学习和生物信息学分析建立了线粒体功能障碍与牙周炎免疫微环境之间的网络 | 研究依赖公共数据库，可能受到数据质量和选择的限制 | 揭示线粒体功能障碍与牙周炎免疫微环境的交互作用 | 重点研究牙周炎患者中的线粒体功能障碍与免疫细胞浸润 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞测序，集成机器学习算法，人工神经网络 | 人工神经网络 | 公共数据，单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 190 | 2024-08-05 |
Single-cell profiling reveals unique features of diabetogenic T cells in anti-PD-1-induced type 1 diabetes mice
2023-10-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221920
PMID:37432393
|
研究论文 | 该文章探讨了抗PD-1诱导的1型糖尿病小鼠中糖尿病T细胞的独特特征 | 首次比较了抗PD-1诱导的1型糖尿病与自发性1型糖尿病之间的差异 | 研究结果主要基于小鼠模型，可能无法完全转化到人类 | 了解抗PD-1治疗引发的免疫相关不良事件的特征 | 使用非肥胖型糖尿病小鼠的胰腺、胰腺引流淋巴结和血液中的T细胞 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序和TCR测序 | NA | 细胞 | 使用了NOD小鼠的多种样本，包括来自胰腺和血液的T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 191 | 2024-08-05 |
Metformin potentiates nephrotoxicity by promoting NETosis in response to renal ferroptosis
2023-Oct-17, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00595-3
PMID:37848438
|
研究论文 | 这篇文章研究了二甲双胍如何通过促进肾脏铁死亡中的中性粒细胞死亡而加剧肾小管损伤。 | 揭示了二甲双胍加重肾脏损伤的全新机制，强调了铁、铁死亡和中性粒细胞死亡在急性肾损伤中的关系 | 尚未探讨二甲双胍对不同年龄段患者的影响 | 探索和阐明二甲双胍对肾功能的影响及其机制 | 小鼠模型，研究实验性急性肾损伤中的二甲双胍作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 生物样本数据 | 涉及多只小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 192 | 2024-08-07 |
Hnf4 activates mimetic-cell enhancers to recapitulate gut and liver development within the thymus
2023-10-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230461
PMID:37399024
|
研究论文 | 研究通过Hnf4α和Hnf4γ转录因子激活模拟细胞增强子，重现胸腺中的肠道和肝脏发育 | 揭示了Hnf4在胸腺中的基因调控机制，并发现了Hnf4γ在肠道微褶细胞和IgA反应中的作用 | NA | 探讨Hnf4在胸腺中模拟细胞的基因调控机制 | 胸腺中的模拟细胞（mTECs）及其在肠道和肝脏发育中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 193 | 2024-08-05 |
Multiparity increases the risk of diabetes by impairing the proliferative capacity of pancreatic β cells
2023-10, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-023-01100-2
PMID:37903900
|
研究论文 | 本研究评估了多次怀孕对母体产后糖尿病风险的影响 | 揭示了多次怀孕如何通过损害胰腺β细胞的增殖能力来增加糖尿病风险 | 缺乏长期跟踪研究数据以验证结果 | 探讨多次怀孕对母体代谢和胰腺β细胞功能的影响 | 人类和小鼠模型中的多次妊娠对代谢的影响 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 生物样本和血浆数据 | 人类样本未具体说明，小鼠样本涉及多次妊娠组和对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 194 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics in neuroscience
2023-10, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-023-01093-y
PMID:37779145
|
综述 | 本文总结了空间转录组学工具及其在神经科学中的应用 | 提供了新的工具和方法来解析大脑细胞类型的空间组织及其连接性 | 未提及具体的实验数据或案例研究 | 探讨如何将单细胞RNA测序与空间信息结合以理解大脑功能 | 各种细胞类型及其在大脑中的功能 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 195 | 2024-08-07 |
Distinct mononuclear diploid cardiac subpopulation with minimal cell-cell communications persists in embryonic and adult mammalian heart
2023-Oct, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-023-0987-9
PMID:37294383
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胚胎和成年哺乳动物心脏中的单核二倍体心肌细胞（MNDCMs）的异质性及其在发育过程中的变化 | 揭示了一种新的非增殖性MNDCM亚群，该亚群具有最小的细胞间通讯，并强调了微环境对心肌细胞成熟过程中命运的重要性 | NA | 阐明单核二倍体心肌细胞的异质性及其在心脏发育过程中的变化 | 胚胎和成年哺乳动物心脏中的单核二倍体心肌细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 12645个心脏细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 196 | 2024-08-07 |
Cell Type Catalog of Middle Turbinate Epithelium (Cell Catalog of Turbinate Epithelium)
2023 Oct-Dec, OTO open
IF:1.8Q2
DOI:10.1002/oto2.91
PMID:38093720
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术创建了人类中鼻甲黏膜的首个单细胞转录组目录 | 首次为中鼻甲黏膜创建了单细胞转录组目录 | NA | 揭示健康中鼻甲上皮的细胞层级基因表达谱，为鼻窦疾病的分子发病机制和靶向治疗研究奠定基础 | 中鼻甲黏膜的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自一名健康志愿者的中鼻甲头部样本 | NA | NA | NA | NA |
| 197 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics illuminates regulatory steps driving anterior-posterior patterning of Drosophila embryonic mesoderm
2023-10-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113289
PMID:37858470
|
研究论文 | 本研究应用单细胞技术和遗传分析探讨果蝇胚胎中胚层形态发生的动态转录变化 | 揭示了转录状态的空间调控时间过渡，以及ecdysone信号在胚层的上皮-间质转变中的早期作用 | 未提及具体样本数量的限制 | 研究果蝇胚胎发育过程中转录程序如何驱动前后轴模式的调控步骤 | 果蝇胚胎中的细胞谱系和转录状态 | 生物学 | NA | 单细胞转录组技术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 198 | 2024-08-05 |
Exosome and lipid metabolism-related genes in pancreatic adenocarcinoma: a prognosis analysis
2023-10-18, Aging
DOI:10.18632/aging.205130
PMID:37857015
|
研究论文 | 本研究旨在探讨外泌体和脂质代谢相关基因在胰腺腺癌中的诊断和预后的作用 | 创新点在于构建了基于EALMRGs的预后模型，并验证其在多种癌症中的预后价值 | 研究的样本来源主要依赖于TCGA和GEO数据库，可能存在样本偏倚 | 研究胰腺腺癌中外泌体和脂质代谢相关基因的mRNA水平与疾病的诊断和预后的关系 | 胰腺腺癌及其他类型的癌症患者的基因表达数据 | 数字病理学 | 胰腺癌 | LASSO回归 | COX回归分析 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 199 | 2024-08-07 |
S100P as a potential biomarker for immunosuppressive microenvironment in pancreatic cancer: a bioinformatics analysis and in vitro study
2023-Oct-18, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-11490-1
PMID:37853345
|
研究论文 | 本研究探讨了S100P蛋白在胰腺癌肿瘤微环境中的作用及其作为免疫抑制微环境标志物的潜力 | 发现S100P与免疫细胞浸润呈负相关，特别是CD8+ T细胞，并且与免疫治疗相关基因表达水平和肿瘤突变负荷有显著关联 | NA | 研究S100P在胰腺癌肿瘤微环境中的作用及其作为免疫抑制微环境标志物的潜力 | S100P蛋白在胰腺癌中的表达及其对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA-Seq, 微阵列, scRNA-Seq, DNA甲基化分析, 逆转录PCR, 免疫组化 | NA | RNA序列, 微阵列数据, 单细胞RNA序列, DNA甲基化数据, 组织样本 | 五个胰腺癌细胞系和60个胰腺癌组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 200 | 2024-08-05 |
Identification of novel therapeutic target and prognostic biomarker in matrix metalloproteinase gene family in pancreatic cancer
2023-10-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-44506-8
PMID:37821678
|
研究论文 | 本文探讨了基质金属蛋白酶基因家族在胰腺癌中的新治疗靶点和预后生物标志物 | 本研究发现MMP28在胰腺导管腺癌中的表达与患者预后及临床特征密切相关，提出了其作为潜在生物标志物的可能性 | 本研究未探讨MMP28与免疫细胞浸润之间的相关性 | 探究基质金属蛋白酶在胰腺导管腺癌中的表达模式及其预后和免疫学价值 | 主要研究对象为与胰腺导管腺癌相关的基质金属蛋白酶基因 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 实时定量PCR | NA | 基因表达数据 | 研究涉及多个胰腺癌细胞系和正常胰腺细胞的样本 | NA | NA | NA | NA |