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当前共找到 413 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-10 |
The developmental hierarchy and scarcity of replicative slender trypanosomes in blood challenges their role in infection maintenance
2023-10-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2306848120
PMID:37824530
|
研究论文 | 本文通过实验证明，在小鼠急性和慢性感染中，布氏锥虫的发育性细胞周期停滞是不可逆的，并揭示了细胞周期停滞和可逆性粗短样转录组出现的时间层次，同时发现感染建立后血液中增殖寄生虫异常稀少 | 首次实验证实布氏锥虫发育性细胞周期停滞在血液中不可逆，揭示细胞周期停滞与转录组变化的时间层次，并挑战了血液中增殖寄生虫在维持感染中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类或其他哺乳动物宿主中的情况；单细胞转录组分析可能受技术限制影响 | 探究布氏锥虫在哺乳动物宿主中的发育动态、细胞周期停滞的不可逆性及其在感染维持中的作用 | 布氏锥虫（Trypanosoma brucei）在血液中的不同形态阶段（细长型和粗短型） | 寄生虫学 | 锥虫病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠感染模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-02-03 |
Benchmarking algorithms for joint integration of unpaired and paired single-cell RNA-seq and ATAC-seq data
2023-10-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03073-x
PMID:37875977
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研究论文 | 本文对九种单细胞多组学数据整合方法进行了基准测试，评估了多组学数据在分析单模态数据中的指导作用以及从单模态数据中揭示峰-基因关联的能力 | 首次系统性地比较了现有单细胞多组学数据整合方法在整合未配对和配对的scRNA-seq与snATAC-seq数据方面的性能，并强调了多组学数据中足够细胞核数量对准确细胞类型注释的重要性 | 研究仅基于现有九种方法进行基准测试，可能未涵盖所有新兴整合方法；同时，结论可能受特定数据集和评估指标的限制 | 评估单细胞多组学数据整合方法在整合未配对和配对的scRNA-seq与snATAC-seq数据时的性能，以提供全面的细胞复杂性视图 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据、单核ATAC测序（snATAC-seq）数据以及配对的多组学数据 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核ATAC测序（snATAC-seq）、多组学测序 | NA | 单细胞基因表达数据、染色质可及性数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 3 | 2026-01-09 |
A Drosophila glial cell atlas reveals a mismatch between transcriptional and morphological diversity
2023-10, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002328
PMID:37862379
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了果蝇中枢神经系统中的胶质细胞，揭示了胶质细胞形态多样性与转录特征之间的不匹配关系 | 发现了果蝇腹神经索中一个新的形态和转录上独特的表面胶质细胞群体，并证明胶质细胞在形态水平上比转录水平上表现出更多样性 | 许多胶质细胞形态类别在转录上无法区分，且转录多样性可能受限于特定神经纤维层位置 | 探索果蝇胶质细胞形态多样性与转录特征之间的关系 | 果蝇中枢神经系统中的胶质细胞，包括胚胎腹神经索和成体视叶组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 果蝇胚胎腹神经索和成体视叶组织中的胶质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-01-09 |
Virally encoded interleukin-6 facilitates KSHV replication in monocytes and induction of dysfunctional macrophages
2023-10, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011703
PMID:37883374
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了卡波西肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）如何利用其编码的病毒白介素-6（vIL-6）促进病毒在单核细胞中的复制，并诱导功能障碍的巨噬细胞分化 | 首次在单细胞水平上阐明KSHV的vIL-6通过激活STAT1/3信号通路，不仅维持病毒裂解复制，还驱动受感染单核细胞增殖并分化为具有免疫抑制功能的巨噬细胞，揭示了病毒逃避免疫监视的新机制 | 研究主要基于体外实验，缺乏体内模型验证；对vIL-6如何精确调控病毒长链非编码RNA（PAN RNA）表达的分子机制尚未完全阐明 | 探究KSHV病毒编码的vIL-6在病毒感染单核细胞、维持病毒复制及诱导免疫功能障碍巨噬细胞中的作用机制 | 卡波西肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）、人CD14+单核细胞、重组KSHV病毒（vIL-6缺失型与回复型） | 病毒学与免疫学 | 卡波西肉瘤、淋巴增生性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、重组病毒构建、转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，使用原代单核细胞进行实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2025-12-30 |
SMASH: Scalable Method for Analyzing Spatial Heterogeneity of genes in spatial transcriptomics data
2023-10, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1010983
PMID:37862362
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研究论文 | 本文提出了一种名为SMASH的非参数方法，用于在空间转录组学数据中识别空间可变基因，以平衡计算效率和统计功效 | SMASH方法在计算需求和统计功效之间实现了平衡，相比现有方法具有更高的统计功效和鲁棒性 | NA | 识别空间转录组学数据中与细胞/点空间位置共变的基因，以理解复杂组织的结构和功能特征 | 空间转录组学数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 非参数方法 | 空间转录组学数据 | 四个来自不同平台的空间转录组学数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6 | 2025-12-12 |
Single-cell mapping reveals several immune subsets associated with liver metastasis of pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-10-13, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2023.07.010
PMID:37633269
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研究论文 | 本研究通过单细胞质谱流式技术绘制了胰腺导管腺癌（PDAC）的免疫图谱，揭示了与肝转移相关的特定免疫细胞亚群 | 首次在PDAC中结合多部位（原发灶、血液、淋巴结）样本进行高维单细胞分析，并识别出与肝转移潜能相关的CD103+PD-1+CD39+ T细胞减少和CD73+巨噬细胞增加的免疫特征 | 样本量相对较小（26个样本来自11名患者），且为观察性研究，需要更大队列验证 | 探究晚期PDAC肿瘤微环境中与转移相关的免疫细胞动态变化，以寻找免疫治疗新策略 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者的不同阶段组织样本（原发肿瘤、血液、淋巴结） | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞质谱流式技术（CyTOF）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重荧光免疫组化 | NA | 单细胞蛋白质表达数据、单细胞转录组数据、组织图像数据 | 26个样本（11个原发肿瘤组织、10个血液样本、5个淋巴结样本），来自11名PDAC患者 | NA | 单细胞蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2025-12-11 |
TALKIEN: crossTALK IntEraction Network. A web-based tool for deciphering molecular communication through ligand-receptor interactions
2023-10-30, Molecular omics
IF:3.0Q3
DOI:10.1039/d3mo00049d
PMID:37403821
|
研究论文 | 介绍了一个名为TALKIEN的在线R/Shiny应用，用于通过构建和分析蛋白质-蛋白质相互作用网络可视化分子对话信息 | 开发了一个简单直观的在线工具，整合了配体-受体相互作用网络构建、系统生物学分析和下游通路展示，支持药物靶点信息 | NA | 旨在帮助研究人员解释分子通信，特别是通过配体-受体相互作用来预测细胞间通信 | 基因或蛋白质列表，代表细胞谱系 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞测序，空间转录组学 | NA | 基因或蛋白质列表 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 8 | 2025-12-06 |
Spatiotemporal, optogenetic control of gene expression in organoids
2023-10, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01986-w
PMID:37735569
|
研究论文 | 本研究结合光遗传学和基因扰动技术，在类器官中实现了目标基因表达的可编程时空控制 | 首次将光遗传学与基因扰动技术结合，用于控制类器官中基因表达的时空模式，并通过空间和单细胞转录组分析揭示了SHH信号在神经发育中的新调控机制 | 未明确说明技术适用范围、效率或潜在脱靶效应，且可能仅限于特定类器官模型 | 开发控制类器官中基因表达时空模式的方法，以研究人类发育和疾病建模 | 干细胞衍生的类器官，特别是人类神经发育类器官模型 | 生物医学工程 | NA | 光遗传学、基因扰动技术、空间转录组学、单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-12-04 |
Single-cell dissection of cellular and molecular features underlying mesenchymal stem cell therapy in ischemic acute kidney injury
2023-10-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2023.07.024
PMID:37533253
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了间充质干细胞在缺血性急性肾损伤治疗中的细胞和分子机制 | 首次使用无偏单细胞RNA测序解析MSC治疗AKI的详细修复机制，并发现MSC来源的miR-26a-5p通过抑制Zeb2表达来抑制促纤维化TECs和免疫细胞招募 | 研究基于IRI模型，可能无法完全反映所有类型AKI的机制；单细胞测序数据为观察性，需进一步功能验证 | 探究间充质干细胞治疗缺血性急性肾损伤的细胞和分子机制 | 缺血再灌注损伤（IRI）模型小鼠的肾脏组织细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | IRI模型小鼠（有/无MSC治疗）的肾脏单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2025-12-04 |
A subpopulation of lipogenic brown adipocytes drives thermogenic memory
2023-10, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-023-00893-w
PMID:37783943
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研究论文 | 本文探讨了短暂冷暴露如何通过脂源性棕色脂肪细胞亚群驱动“产热记忆”，从而改善二次冷暴露的产热反应 | 揭示了脂源性棕色脂肪细胞亚群在产热记忆中的关键作用，并发现酰基肉碱的补充足以模拟改善的二次冷反应 | 未明确说明研究的局限性，如样本量或实验模型的潜在限制 | 研究短暂环境刺激下棕色脂肪组织的长期适应机制，以探索对抗肥胖的潜在治疗策略 | 棕色脂肪组织及其脂源性亚群 | 单细胞组学 | 肥胖 | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | 转录组数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 11 | 2025-12-02 |
Identification of human exTreg cells as CD16+CD56+ cytotoxic CD4+ T cells
2023-10, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01589-9
PMID:37563308
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研究论文 | 本文通过小鼠模型和人类单细胞RNA测序数据，识别并验证了人类exTreg细胞为CD16+CD56+细胞毒性CD4+ T细胞 | 首次将人类exTreg细胞定义为CD16+CD56+细胞毒性CD4+ T细胞，并利用跨物种转录组分析和功能实验验证其细胞毒性 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本的验证可能有限，且疾病背景聚焦于动脉粥样硬化 | 识别和表征在动脉粥样硬化中从调节性T细胞转化而来的exTreg细胞的分子特征和功能 | 小鼠和人类的T细胞、exTreg细胞，以及自然杀伤细胞 | 免疫学 | 动脉粥样硬化 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, CITE-seq, 流式细胞术, T细胞受体测序, 细胞杀伤和CD107a脱颗粒实验 | NA | RNA测序数据, 流式细胞数据, 序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2025-12-02 |
Multimodal single-cell datasets characterize antigen-specific CD8+ T cells across SARS-CoV-2 vaccination and infection
2023-10, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01608-9
PMID:37735591
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研究论文 | 本文使用多模态单细胞测序技术，对SARS-CoV-2疫苗接种和感染后的抗原特异性CD8+ T细胞进行了纵向分析 | 首次结合转录组、可及染色质景观和免疫表型，定义了疫苗诱导的CD8 T细胞亚群，并发现其与COVID-19患者临床结局相关 | 研究主要基于mRNA疫苗BNT162b2，可能不适用于其他疫苗类型；样本量有限，需进一步扩大验证 | 改善对T细胞反应的表征和量化，以补充基于抗体滴度的群体监测 | 人类循环白细胞，特别是CD8+ T细胞 | 单细胞组学 | COVID-19 | 多模态测序技术，包括scRNA-seq | NA | 单细胞多模态数据（转录组、染色质可及性、免疫表型） | 纵向收集的疫苗接种前后人类白细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 染色质可及性分析 | NA | NA |
| 13 | 2025-11-29 |
Combinatorial Immunotherapy with Agonistic CD40 Activates Dendritic Cells to Express IL12 and Overcomes PD-1 Resistance
2023-10-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0699
PMID:37478171
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研究论文 | 本研究通过组合免疫疗法激活CD40使树突状细胞表达IL12，从而克服PD-1耐药性 | 发现CCL22+CCL5+ IL12分泌型树突状细胞亚群是三联疗法的关键早期效应因子，并证明新型IL12 mRNA疗法单独使用即可克服PD-1耐药 | 研究主要基于小鼠模型，人类患者数据仅限于系统性细胞因子谱比较 | 探索克服抗PD-1耐药性的免疫治疗策略 | 小鼠黑色素瘤模型和人类患者样本 | 免疫治疗 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，单细胞细胞因子分泌分析，微孔检测 | 小鼠黑色素瘤模型 | 单细胞RNA测序数据，细胞因子分泌数据 | 多数小鼠显示完全肿瘤消退 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞细胞因子分泌分析 | NA | 新型微孔检测法 |
| 14 | 2025-11-27 |
Radiotherapy-Induced Neurocognitive Impairment Is Driven by Heightened Apoptotic Priming in Early Life and Prevented by Blocking BAX
2023-10-13, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-1337
PMID:37470810
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了放疗引起神经认知损伤的年龄依赖性机制，并发现阻断BAX可预防此类损伤 | 首次发现幼年神经细胞存在更高的凋亡启动状态，并阐明BAX介导的凋亡通路是放疗神经毒性的关键机制 | 研究基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证 | 探究放疗引起年龄依赖性神经认知损伤的分子机制及防护策略 | 小鼠神经干细胞、祖细胞、神经元和星形胶质细胞 | 神经科学 | 中枢神经系统肿瘤 | 单细胞RNA测序，BH3分析，组织学分析 | 小鼠放疗模型 | 基因表达数据，组织学图像 | 不同年龄阶段的小鼠神经细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2025-11-27 |
Single-Cell Characterization of Pulmonary Nodules Implicates Suppression of Immunosurveillance across Early Stages of Lung Adenocarcinoma
2023-10-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0128
PMID:37477508
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析早期肺腺癌肺结节的免疫特征，发现免疫监视在早期阶段即受到抑制 | 首次在早期肺腺癌谱系中系统揭示自然杀伤细胞和自然杀伤T细胞细胞毒性活性下降及调节性T细胞早期增加 | 样本来源仅限于手术切除的肺结节，未涵盖更广泛的早期病变类型 | 阐明早期肺肿瘤发生的免疫发病机制 | 手术切除的肺结节及相关正常肺组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,免疫荧光图像 | 多个手术切除肺结节样本及相关正常组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2025-11-19 |
Single-cell RNA sequencing identifies eggplant as a regulator of germ cell development in Drosophila
2023-10-09, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202256475
PMID:37603128
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术发现茄子基因(eggpl)在果蝇生殖细胞发育中起关键调控作用 | 首次发现茄子基因(eggpl)在连接营养状态与生殖细胞增殖分化中的调控作用 | 研究仅限于果蝇模型，未在其他生物中进行验证 | 探索果蝇生殖细胞发育的调控机制 | 果蝇卵巢生殖系干细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,RNAi筛选,生物信息学分析 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2025-11-19 |
Defects in microvillus crosslinking sensitize to colitis and inflammatory bowel disease
2023-10-09, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202357084
PMID:37691494
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研究论文 | 本研究探讨微绒毛交联缺陷如何通过破坏肠道屏障功能增加结肠炎和炎症性肠病的易感性 | 首次揭示微绒毛交联在肠道屏障功能中的关键作用，并证明CDHR5缺陷与黏液层通透性增加共同导致炎症性肠病易感性 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅来自单细胞RNA测序分析，需要进一步验证 | 探究微绒毛交联在结肠炎和炎症性肠病发病机制中的作用 | CDHR5基因敲除小鼠和溃疡性结肠炎患者的肠道上皮细胞 | 细胞生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序,电子显微镜 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,显微图像 | CDHR5缺陷小鼠和溃疡性结肠炎患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-11-19 |
Deciphering pathogenic cellular module at single-cell resolution in checkpoint inhibitor-related pneumonitis
2023-10, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-023-02805-4
PMID:37653115
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示检查点抑制剂相关肺炎的关键致病细胞模块和分子通路 | 首次在单细胞分辨率下系统解析CIP的免疫微环境，发现CXCL13+ T细胞和CXCL9+单核细胞的关键作用，并提出具有高诊断能力的免疫特征 | 样本来源仅限于支气管肺泡灌洗液，未涉及其他组织部位；样本量相对有限 | 阐明检查点抑制剂相关肺炎的病理生理机制，为精准诊断和治疗提供新策略 | 支气管肺泡灌洗液中的免疫细胞 | 单细胞生物学 | 免疫相关肺炎 | 单细胞RNA测序，T细胞受体分析，拟时序分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2025-11-15 |
A lamprey neural cell type atlas illuminates the origins of the vertebrate brain
2023-10, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-023-02170-1
PMID:37710042
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研究论文 | 通过构建七鳃鳗全脑空间细胞类型图谱，揭示脊椎动物大脑的细胞和分子起源 | 首次建立无颌类脊椎动物七鳃鳗的全脑空间细胞类型图谱，通过跨物种比较重建了祖先脊椎动物大脑的细胞类型和基因表达程序 | 研究主要基于七鳃鳗与有颌脊椎动物的比较，可能无法完全代表所有脊椎动物祖先特征 | 系统追溯脊椎动物大脑的细胞和分子进化起源 | 七鳃鳗全脑组织及与其他脊椎动物（如小鼠）的神经数据比较 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,原位测序 | NA | 单细胞转录组数据,空间基因表达数据 | 七鳃鳗全脑样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2025-11-15 |
Integrating spatial transcriptomics data across different conditions, technologies and developmental stages
2023-10, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-023-00528-w
PMID:38177758
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研究论文 | 提出了一种名为STAligner的图注意力神经网络，用于整合和分析来自不同条件、技术和发育阶段的空间转录组数据 | 开发了首个能够同时实现空间感知数据整合、空间域识别和下游比较分析的图注意力神经网络方法 | 未提及方法在超大规模数据集上的计算效率限制 | 开发空间转录组数据的整合分析方法，实现跨条件、技术和发育阶段的比较研究 | 人类大脑皮层切片、小鼠嗅球切片、正常与阿尔茨海默病条件下的小鼠海马组织切片、小鼠器官发生时空图谱 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | 图注意力神经网络(GAT) | 空间转录组数据 | 多个物种和条件的空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |