单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 414 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-07-12 |
Thyroid hormone receptor α1: a novel regulator of thyroid cancer cell differentiation
2023-10, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-023-02815-2
PMID:37634007
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研究论文 | 研究甲状腺激素受体α1（TRα1）在甲状腺癌细胞分化中的新调控作用 | 首次发现TRα1通过调控PAX8基因表达，促进未分化甲状腺癌（ATC）细胞向分化状态转变 | 研究仅基于两种ATC细胞系和小样本TCGA数据分析，未进行体内实验验证 | 阐明TRα1在甲状腺癌中的功能机制及其治疗潜力 | 未分化甲状腺癌（ATC）细胞系THJ-11T和THJ-16T | 癌症生物学 | 甲状腺癌 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq）、TCGA数据分析 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 2种ATC细胞系（THJ-11T和THJ-16T）的多个克隆 |
| 2 | 2025-07-10 |
Signature morphoelectric properties of diverse GABAergic interneurons in the human neocortex
2023-10-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adf6484
PMID:37824669
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研究论文 | 该研究通过快速GABA能神经元病毒遗传标记和Patch-seq技术，分析了人类大脑切片中GABA能神经元的亚类和转录组类型 | 揭示了PVALB和SST亚类之间的过渡，识别了灵长类特有的双束细胞（DBCs）的多个空间不同类型，并阐明了小鼠和人类新皮层GABA能神经元类型之间的细胞差异 | 研究仅基于人类大脑切片，可能无法完全反映体内环境的复杂性 | 理解人类大脑细胞类型的保守和特化细胞特性 | 人类新皮层中的GABA能神经元 | 神经科学 | NA | Patch-seq（膜片钳电生理学加单细胞RNA测序） | NA | 电生理和转录组数据 | 人类大脑切片中的GABA能神经元样本 |
| 3 | 2025-07-02 |
Single-Nucleus Transcriptome Profiling of Dorsolateral Prefrontal Cortex: Mechanistic Roles for Neuronal Gene Expression, Including the 17q21.31 Locus, in PTSD Stress Response
2023-10-01, The American journal of psychiatry
DOI:10.1176/appi.ajp.20220478
PMID:37491937
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研究论文 | 首次使用单核RNA测序技术研究创伤后应激障碍(PTSD)和重度抑郁症(MDD)患者背外侧前额叶皮层(DLPFC)的细胞类型特异性转录组病理学 | 首次在PTSD研究中应用单核RNA测序技术，揭示了细胞类型特异性的基因表达机制 | 样本量相对较小(11名PTSD患者、10名MDD患者和11名对照)，且仅研究了DLPFC区域 | 阐明PTSD和MDD在细胞类型特异性水平上的转录组病理学机制 | 人脑背外侧前额叶皮层(DLPFC)组织 | 神经科学 | 精神疾病 | 单核RNA测序(snRNA-seq), 诱导多能干细胞(iPSC)技术 | NA | RNA测序数据 | 47个DLPFC样本(约575K细胞核)，包括11名PTSD患者、10名MDD患者和11名对照 |
| 4 | 2025-06-17 |
Integration of scHi-C and scRNA-seq data defines distinct 3D-regulated and biological-context dependent cell subpopulations
2023-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.29.560193
PMID:37873257
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研究论文 | 开发了一种名为MUDI的计算方法，整合scHi-C和scRNA-seq数据，以精确定义3D调控和生物背景依赖的细胞亚群 | 首次在单细胞分辨率上整合3D染色质结构和基因表达数据，定义了拓扑整合亚群（TISPs）和拓扑保守关联域（CAD） | NA | 研究3D染色质结构在单细胞分辨率上对基因表达的调控及其在癌症细胞异质性中的作用 | 乳腺癌细胞模型 | 计算生物学 | 乳腺癌 | scHi-C, scRNA-seq | MUDI算法 | 单细胞多组学数据 | 公开可用的和新生成的scHi-C和scRNA-seq数据 |
| 5 | 2025-05-19 |
Glioblastoma initiation, migration, and cell types are regulated by core bHLH transcription factors ASCL1 and OLIG2
2023-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.30.560206
PMID:37873200
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research paper | 该研究探讨了核心bHLH转录因子ASCL1和OLIG2在胶质母细胞瘤（GBM）起始、迁移和细胞类型调控中的作用 | 揭示了ASCL1和OLIG2在GBM肿瘤细胞异质性和层级结构中的调控机制，以及它们在肿瘤形成和迁移中的动态作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类GBM中的具体机制仍需进一步验证 | 探究ASCL1和OLIG2在GBM肿瘤发生和发展中的功能 | 胶质母细胞瘤（GBM）和胶质瘤干细胞（GSCs） | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 小鼠GBM模型 | 基因表达数据 | NA |
| 6 | 2025-05-08 |
Impact of Memory T Cells on SARS-COV-2 Vaccine Response in Hematopoietic Stem Cell Transplant
2023-Oct-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.26.564259
PMID:37961434
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研究论文 | 研究造血干细胞移植（HSCT）受者中记忆T细胞对SARS-COV-2疫苗反应的影响 | 揭示了HSCT受者在接种SARS-CoV-2 mRNA疫苗后记忆T细胞群的缺陷及其与T细胞反应缺失的关联 | 样本量较小（42名HSCT受者和5名健康对照） | 评估HSCT受者对SARS-CoV-2 mRNA疫苗的体液和适应性免疫反应 | 造血干细胞移植（HSCT）受者和健康对照 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序、TCR和BCR测序 | NA | 血清、外周血单核细胞 | 42名HSCT受者和5名健康对照 |
| 7 | 2025-04-27 |
Comprehensive single cell aging atlas of mammary tissues reveals shared epigenomic and transcriptomic signatures of aging and cancer
2023-Oct-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.20.563147
PMID:37961129
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研究论文 | 该研究通过单细胞分辨率分析了小鼠乳腺组织的转录组和表观基因组变化，揭示了衰老与癌症之间的潜在机制联系 | 首次在单细胞水平上构建了乳腺组织衰老的综合图谱，并发现了衰老与癌症共享的表观基因组和转录组特征 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证仍需进一步研究 | 探索衰老如何通过细胞和分子事件影响癌症发生 | 小鼠乳腺组织中的上皮细胞、间质细胞和免疫细胞 | 生物医学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据、空间转录组数据 | NA（未明确提及具体样本数量） |
| 8 | 2025-04-26 |
Programs, Origins, and Niches of Immunomodulatory Myeloid Cells in Gliomas
2023-Oct-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.24.563466
PMID:37961527
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序等技术，揭示了胶质瘤中髓系细胞的免疫调节程序及其驱动因素 | 发现了胶质瘤相关髓系细胞表达的四种免疫调节活性程序，并揭示了这些程序由微环境信号和治疗驱动，而非细胞类型、起源或突变状态 | 研究主要基于人类肿瘤样本，未涉及动物模型验证 | 理解胶质瘤中免疫调节性髓系细胞的特征及其对免疫治疗的影响 | 胶质瘤中的髓系细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | scRNA-seq, 线粒体DNA谱系追踪, 空间转录组学, 类器官外植系统 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 85个人类肿瘤中的183,062个髓系细胞 |
| 9 | 2025-04-24 |
Spatial heterogeneity of bone marrow endothelial cells unveils a distinct subtype in the epiphysis
2023-10, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-023-01240-7
PMID:37798545
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序揭示了骨髓内皮细胞的空间异质性，并鉴定了一种仅存在于骨骺的毛细血管亚型——S型（次级骨化）内皮细胞 | 首次定义了骨髓内皮细胞的空间异质性，发现并表征了骨骺特异性S型内皮细胞亚型，揭示了其通过分泌I型胶原蛋白促进骨强度获取的非典型功能 | 未探讨S型内皮细胞与其他骨髓微环境组分的相互作用机制 | 解析骨髓内皮细胞的异质性及其在骨骼和造血发育中的作用 | 骨髓内皮细胞（BMECs） | 单细胞生物学 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量（骨髓内皮细胞） |
| 10 | 2025-04-12 |
Recent insights into the pathogenesis and therapeutic targets of chronic liver diseases
2023-Oct, eGastroenterology
DOI:10.1136/egastro-2023-100020
PMID:38074919
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评论 | 本文综述了慢性肝病的发病机制及治疗靶点的最新研究进展 | 重点讨论了非编码RNA、自噬、肝外信号传导、巨噬细胞等在肝病中的作用，以及单细胞RNA测序在肝病研究中的应用 | 未提及具体研究数据或实验验证 | 探讨慢性肝病的发病机制及潜在治疗靶点 | 病毒性肝炎、酒精性肝病(ALD)、非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)及肝癌 | 肝病学 | 慢性肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 11 | 2025-02-13 |
Transcriptional regulators of arterial and venous identity in the developing mammalian embryo
2023-Oct, Current opinion in physiology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.cophys.2023.100691
PMID:38328689
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综述 | 本文综述了哺乳动物胚胎发育过程中动脉和静脉身份的转录调控机制 | 强调了转录调控在内皮细胞动脉和静脉身份获取中的重要性，并探讨了不同转录因子在这一过程中的作用 | NA | 探讨内皮细胞在发育过程中如何获得动脉和静脉身份的调控机制 | 哺乳动物胚胎的内皮细胞 | 生物医学 | NA | 单细胞RNA测序、细胞谱系追踪 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12 | 2025-02-04 |
Post-ischemic inactivation of HIF prolyl hydroxylases in endothelium promotes maladaptive kidney repair by inducing glycolysis
2023-Oct-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.03.560700
PMID:37873349
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研究论文 | 本文研究了缺血性急性肾损伤（AKI）后内皮细胞中氧感应脯氨酰羟化酶（PHD）的作用及其对肾脏修复的影响 | 发现了内皮细胞中PHD1、PHD2和PHD3的联合失活促进不良肾脏修复的机制，并提出了通过抑制MCT4来恢复适应性肾脏修复的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，人类肾脏样本的研究仍需进一步验证 | 探讨缺血性急性肾损伤后内皮细胞中PHD酶的作用及其对肾脏修复的影响 | 小鼠和人类肾脏内皮细胞 | 生物医学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类肾脏样本 |
| 13 | 2025-01-25 |
Mural cell-derived chemokines provide a protective niche to safeguard vascular macrophages and limit chronic inflammation
2023-10-10, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.08.002
PMID:37652021
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研究论文 | 本文研究了血管巨噬细胞维持机制，揭示了壁细胞通过分泌趋化因子CCL2和MIF保护巨噬细胞存活及其稳态功能，从而限制慢性炎症 | 发现了壁细胞通过分泌趋化因子CCL2和MIF维持血管巨噬细胞的稳态功能，并揭示了这一机制在动脉粥样硬化中的保护作用 | 研究主要关注动脉粥样硬化，未涉及其他慢性炎症疾病 | 研究血管巨噬细胞的维持机制及其在慢性炎症中的作用 | 血管巨噬细胞和壁细胞（周细胞和平滑肌细胞） | 生物医学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞转录组学、共培养实验、基因敲除实验 | NA | 图像、基因表达数据 | NA |
| 14 | 2025-01-23 |
Molecular and spatial landmarks of early mouse skin development
2023-10-23, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.07.015
PMID:37591247
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学、空间细胞类型分配和细胞谱系追踪技术，解构了早期胚胎小鼠皮肤的关键发育过程 | 揭示了早期皮肤发育中的细胞多样性和组织架构，发现了毛囊诱导、肌肉支持和筋膜形成的成纤维细胞的时空出现，以及PCM肌肉的形成、无周细胞覆盖的血管萌芽和皮肤中最早的肥大细胞和树突状免疫细胞的定居 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能不完全适用于人类皮肤发育 | 探索早期皮肤发育过程中的细胞类型多样性和组织架构的形成 | 早期胚胎小鼠皮肤 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学、空间细胞类型分配、细胞谱系追踪 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 早期胚胎小鼠皮肤样本 |
| 15 | 2024-12-21 |
K-Nearest-Neighbors Induced Topological PCA for Single Cell RNA-Sequence Data Analysis
2023-Oct-23, ArXiv
PMID:37961744
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研究论文 | 本文提出了一种基于k近邻持久拉普拉斯技术的拓扑主成分分析方法，用于单细胞RNA测序数据分析 | 本文创新性地结合了持久拉普拉斯技术和L范数正则化，提出了一种新的拓扑主成分分析方法，并通过k近邻持久拉普拉斯技术提高了方法的鲁棒性 | 本文未提及具体的局限性 | 开发一种新的维度降低和特征选择方法，以解决单细胞RNA测序数据中的多尺度和多类别异质性问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 拓扑主成分分析 | 基因表达数据 | 11个不同的单细胞RNA测序基准数据集 |
| 16 | 2024-12-09 |
Identification of human exTreg cells as CD16+CD56+ cytotoxic CD4+ T cells
2023-Oct, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01589-9
PMID:37563308
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研究论文 | 本文通过RNA测序和单细胞RNA测序技术，鉴定了人类exTreg细胞为CD16+CD56+细胞毒性CD4+T细胞 | 首次鉴定了人类exTreg细胞为CD16+CD56+细胞毒性CD4+T细胞，并验证了其细胞毒性功能 | 研究主要基于小鼠模型和人类样本，可能存在种属差异 | 鉴定人类exTreg细胞的表型和功能 | 人类和小鼠的T细胞和exT细胞 | 免疫学 | 动脉粥样硬化 | RNA测序、单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | RNA | 小鼠和人类样本 |
| 17 | 2024-12-08 |
Epididymal segment-specific miRNA and mRNA regulatory network at the single cell level
2023-10, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.1080/15384101.2023.2280170
PMID:37982230
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研究论文 | 研究比较了不同附睾段特异性样本之间的miRNA和mRNA表达，并构建了单细胞水平的miRNA和mRNA调控网络 | 首次在单细胞水平上揭示了人类附睾段特异性的miRNA-mRNA调控网络及其上游转录因子和下游通路 | 研究仅基于小鼠样本，且样本量有限 | 揭示人类附睾段特异性的miRNA-mRNA调控网络及其功能 | 附睾不同段的miRNA和mRNA表达及其调控网络 | 基因表达调控 | NA | RNA测序（RNA-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、定量实时PCR（qRT-PCR） | NA | 基因表达数据 | 6只小鼠的附睾组织 |
| 18 | 2024-11-27 |
A spatial human thymus cell atlas mapped to a continuous tissue axis
2023-Oct-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.25.562925
PMID:37986877
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研究论文 | 本文通过空间解析分析，建立了一个新的定量形态学框架，用于描述胸腺的皮质-髓质轴，并展示了胸腺细胞和胸腺上皮细胞的高度组织性 | 本文创新性地结合了多模态单细胞、空间转录组学和高分辨率多重成像技术，构建了一个连续组织轴上的空间人类胸腺细胞图谱 | NA | 研究胸腺细胞在出生前和出生后的发育过程及其微解剖学基础 | 胸腺细胞和胸腺上皮细胞的发育轨迹及其组织结构 | NA | NA | 空间转录组学、高分辨率多重成像 | NA | 单细胞数据、空间转录组数据、图像数据 | NA |
| 19 | 2024-11-23 |
Single-Cell Integration of BMD GWAS Results Prioritize Candidate Genes Influencing Age-Related Bone Loss
2023-Oct, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/jbm4.10795
PMID:37808401
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研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序数据整合骨密度全基因组关联研究结果，优先筛选影响年龄相关骨丢失的候选基因 | 通过单细胞RNA测序数据，揭示了候选基因在特定细胞类型中的表达特征，为骨密度维持提供了新的治疗靶点 | 主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 研究年龄相关骨丢失的遗传机制，并筛选潜在的治疗靶点 | 骨密度相关基因及其在不同细胞类型中的表达 | 基因组学 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 老年小鼠的骨髓和骨组织样本 |
| 20 | 2024-11-18 |
Technical Advances and Applications of Spatial Transcriptomics
2023-Oct, GEN biotechnology
IF:2.0Q3
DOI:10.1089/genbio.2023.0032
PMID:39544230
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术的最新进展及其在生物学研究中的应用 | 本文系统地介绍了空间转录组学技术在揭示RNA分子在亚细胞、细胞和组织水平上的位置模式方面的创新应用 | 本文主要讨论了现有空间转录组学技术的局限性，包括方法上的挑战和应用中的限制 | 旨在为研究人员提供关于空间转录组学技术的全面指南 | 空间转录组学技术及其在生物学研究中的应用 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |