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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-12-12 |
Single-cell mapping reveals several immune subsets associated with liver metastasis of pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-10-13, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2023.07.010
PMID:37633269
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研究论文 | 本研究通过单细胞质谱流式技术绘制了胰腺导管腺癌(PDAC)的免疫图谱,揭示了与肝转移相关的特定免疫细胞亚群 | 首次在PDAC中结合多部位(原发灶、血液、淋巴结)样本进行高维单细胞分析,并识别出与肝转移潜能相关的CD103+PD-1+CD39+ T细胞减少和CD73+巨噬细胞增加的免疫特征 | 样本量相对较小(26个样本来自11名患者),且为观察性研究,需要更大队列验证 | 探究晚期PDAC肿瘤微环境中与转移相关的免疫细胞动态变化,以寻找免疫治疗新策略 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者的不同阶段组织样本(原发肿瘤、血液、淋巴结) | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞质谱流式技术(CyTOF)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多重荧光免疫组化 | NA | 单细胞蛋白质表达数据、单细胞转录组数据、组织图像数据 | 26个样本(11个原发肿瘤组织、10个血液样本、5个淋巴结样本),来自11名PDAC患者 | NA | 单细胞蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2025-12-11 |
TALKIEN: crossTALK IntEraction Network. A web-based tool for deciphering molecular communication through ligand-receptor interactions
2023-10-30, Molecular omics
IF:3.0Q3
DOI:10.1039/d3mo00049d
PMID:37403821
|
研究论文 | 介绍了一个名为TALKIEN的在线R/Shiny应用,用于通过构建和分析蛋白质-蛋白质相互作用网络可视化分子对话信息 | 开发了一个简单直观的在线工具,整合了配体-受体相互作用网络构建、系统生物学分析和下游通路展示,支持药物靶点信息 | NA | 旨在帮助研究人员解释分子通信,特别是通过配体-受体相互作用来预测细胞间通信 | 基因或蛋白质列表,代表细胞谱系 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | 基因或蛋白质列表 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2025-12-06 |
Spatiotemporal, optogenetic control of gene expression in organoids
2023-10, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01986-w
PMID:37735569
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研究论文 | 本研究结合光遗传学和基因扰动技术,在类器官中实现了目标基因表达的可编程时空控制 | 首次将光遗传学与基因扰动技术结合,用于控制类器官中基因表达的时空模式,并通过空间和单细胞转录组分析揭示了SHH信号在神经发育中的新调控机制 | 未明确说明技术适用范围、效率或潜在脱靶效应,且可能仅限于特定类器官模型 | 开发控制类器官中基因表达时空模式的方法,以研究人类发育和疾病建模 | 干细胞衍生的类器官,特别是人类神经发育类器官模型 | 生物医学工程 | NA | 光遗传学、基因扰动技术、空间转录组学、单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2025-12-04 |
Single-cell dissection of cellular and molecular features underlying mesenchymal stem cell therapy in ischemic acute kidney injury
2023-10-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2023.07.024
PMID:37533253
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了间充质干细胞在缺血性急性肾损伤治疗中的细胞和分子机制 | 首次使用无偏单细胞RNA测序解析MSC治疗AKI的详细修复机制,并发现MSC来源的miR-26a-5p通过抑制Zeb2表达来抑制促纤维化TECs和免疫细胞招募 | 研究基于IRI模型,可能无法完全反映所有类型AKI的机制;单细胞测序数据为观察性,需进一步功能验证 | 探究间充质干细胞治疗缺血性急性肾损伤的细胞和分子机制 | 缺血再灌注损伤(IRI)模型小鼠的肾脏组织细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | IRI模型小鼠(有/无MSC治疗)的肾脏单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2025-12-04 |
A subpopulation of lipogenic brown adipocytes drives thermogenic memory
2023-10, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-023-00893-w
PMID:37783943
|
研究论文 | 本文探讨了短暂冷暴露如何通过脂源性棕色脂肪细胞亚群驱动“产热记忆”,从而改善二次冷暴露的产热反应 | 揭示了脂源性棕色脂肪细胞亚群在产热记忆中的关键作用,并发现酰基肉碱的补充足以模拟改善的二次冷反应 | 未明确说明研究的局限性,如样本量或实验模型的潜在限制 | 研究短暂环境刺激下棕色脂肪组织的长期适应机制,以探索对抗肥胖的潜在治疗策略 | 棕色脂肪组织及其脂源性亚群 | 单细胞组学 | 肥胖 | 单核RNA测序,空间转录组学 | NA | 转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单核RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 6 | 2025-12-02 |
Identification of human exTreg cells as CD16+CD56+ cytotoxic CD4+ T cells
2023-10, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01589-9
PMID:37563308
|
研究论文 | 本文通过小鼠模型和人类单细胞RNA测序数据,识别并验证了人类exTreg细胞为CD16+CD56+细胞毒性CD4+ T细胞 | 首次将人类exTreg细胞定义为CD16+CD56+细胞毒性CD4+ T细胞,并利用跨物种转录组分析和功能实验验证其细胞毒性 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本的验证可能有限,且疾病背景聚焦于动脉粥样硬化 | 识别和表征在动脉粥样硬化中从调节性T细胞转化而来的exTreg细胞的分子特征和功能 | 小鼠和人类的T细胞、exTreg细胞,以及自然杀伤细胞 | 免疫学 | 动脉粥样硬化 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, CITE-seq, 流式细胞术, T细胞受体测序, 细胞杀伤和CD107a脱颗粒实验 | NA | RNA测序数据, 流式细胞数据, 序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2025-12-02 |
Multimodal single-cell datasets characterize antigen-specific CD8+ T cells across SARS-CoV-2 vaccination and infection
2023-10, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01608-9
PMID:37735591
|
研究论文 | 本文使用多模态单细胞测序技术,对SARS-CoV-2疫苗接种和感染后的抗原特异性CD8+ T细胞进行了纵向分析 | 首次结合转录组、可及染色质景观和免疫表型,定义了疫苗诱导的CD8 T细胞亚群,并发现其与COVID-19患者临床结局相关 | 研究主要基于mRNA疫苗BNT162b2,可能不适用于其他疫苗类型;样本量有限,需进一步扩大验证 | 改善对T细胞反应的表征和量化,以补充基于抗体滴度的群体监测 | 人类循环白细胞,特别是CD8+ T细胞 | 单细胞组学 | COVID-19 | 多模态测序技术,包括scRNA-seq | NA | 单细胞多模态数据(转录组、染色质可及性、免疫表型) | 纵向收集的疫苗接种前后人类白细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 染色质可及性分析 | NA | NA |
| 8 | 2025-11-29 |
Combinatorial Immunotherapy with Agonistic CD40 Activates Dendritic Cells to Express IL12 and Overcomes PD-1 Resistance
2023-10-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0699
PMID:37478171
|
研究论文 | 本研究通过组合免疫疗法激活CD40使树突状细胞表达IL12,从而克服PD-1耐药性 | 发现CCL22+CCL5+ IL12分泌型树突状细胞亚群是三联疗法的关键早期效应因子,并证明新型IL12 mRNA疗法单独使用即可克服PD-1耐药 | 研究主要基于小鼠模型,人类患者数据仅限于系统性细胞因子谱比较 | 探索克服抗PD-1耐药性的免疫治疗策略 | 小鼠黑色素瘤模型和人类患者样本 | 免疫治疗 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,单细胞细胞因子分泌分析,微孔检测 | 小鼠黑色素瘤模型 | 单细胞RNA测序数据,细胞因子分泌数据 | 多数小鼠显示完全肿瘤消退 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞细胞因子分泌分析 | NA | 新型微孔检测法 |
| 9 | 2025-11-27 |
Radiotherapy-Induced Neurocognitive Impairment Is Driven by Heightened Apoptotic Priming in Early Life and Prevented by Blocking BAX
2023-10-13, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-1337
PMID:37470810
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了放疗引起神经认知损伤的年龄依赖性机制,并发现阻断BAX可预防此类损伤 | 首次发现幼年神经细胞存在更高的凋亡启动状态,并阐明BAX介导的凋亡通路是放疗神经毒性的关键机制 | 研究基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探究放疗引起年龄依赖性神经认知损伤的分子机制及防护策略 | 小鼠神经干细胞、祖细胞、神经元和星形胶质细胞 | 神经科学 | 中枢神经系统肿瘤 | 单细胞RNA测序,BH3分析,组织学分析 | 小鼠放疗模型 | 基因表达数据,组织学图像 | 不同年龄阶段的小鼠神经细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2025-11-27 |
Single-Cell Characterization of Pulmonary Nodules Implicates Suppression of Immunosurveillance across Early Stages of Lung Adenocarcinoma
2023-10-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0128
PMID:37477508
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析早期肺腺癌肺结节的免疫特征,发现免疫监视在早期阶段即受到抑制 | 首次在早期肺腺癌谱系中系统揭示自然杀伤细胞和自然杀伤T细胞细胞毒性活性下降及调节性T细胞早期增加 | 样本来源仅限于手术切除的肺结节,未涵盖更广泛的早期病变类型 | 阐明早期肺肿瘤发生的免疫发病机制 | 手术切除的肺结节及相关正常肺组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,免疫荧光图像 | 多个手术切除肺结节样本及相关正常组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2025-11-19 |
Single-cell RNA sequencing identifies eggplant as a regulator of germ cell development in Drosophila
2023-10-09, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202256475
PMID:37603128
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术发现茄子基因(eggpl)在果蝇生殖细胞发育中起关键调控作用 | 首次发现茄子基因(eggpl)在连接营养状态与生殖细胞增殖分化中的调控作用 | 研究仅限于果蝇模型,未在其他生物中进行验证 | 探索果蝇生殖细胞发育的调控机制 | 果蝇卵巢生殖系干细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,RNAi筛选,生物信息学分析 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2025-11-19 |
Defects in microvillus crosslinking sensitize to colitis and inflammatory bowel disease
2023-10-09, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202357084
PMID:37691494
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研究论文 | 本研究探讨微绒毛交联缺陷如何通过破坏肠道屏障功能增加结肠炎和炎症性肠病的易感性 | 首次揭示微绒毛交联在肠道屏障功能中的关键作用,并证明CDHR5缺陷与黏液层通透性增加共同导致炎症性肠病易感性 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅来自单细胞RNA测序分析,需要进一步验证 | 探究微绒毛交联在结肠炎和炎症性肠病发病机制中的作用 | CDHR5基因敲除小鼠和溃疡性结肠炎患者的肠道上皮细胞 | 细胞生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序,电子显微镜 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,显微图像 | CDHR5缺陷小鼠和溃疡性结肠炎患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2025-11-19 |
Deciphering pathogenic cellular module at single-cell resolution in checkpoint inhibitor-related pneumonitis
2023-10, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-023-02805-4
PMID:37653115
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示检查点抑制剂相关肺炎的关键致病细胞模块和分子通路 | 首次在单细胞分辨率下系统解析CIP的免疫微环境,发现CXCL13+ T细胞和CXCL9+单核细胞的关键作用,并提出具有高诊断能力的免疫特征 | 样本来源仅限于支气管肺泡灌洗液,未涉及其他组织部位;样本量相对有限 | 阐明检查点抑制剂相关肺炎的病理生理机制,为精准诊断和治疗提供新策略 | 支气管肺泡灌洗液中的免疫细胞 | 单细胞生物学 | 免疫相关肺炎 | 单细胞RNA测序,T细胞受体分析,拟时序分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2025-11-15 |
A lamprey neural cell type atlas illuminates the origins of the vertebrate brain
2023-10, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-023-02170-1
PMID:37710042
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研究论文 | 通过构建七鳃鳗全脑空间细胞类型图谱,揭示脊椎动物大脑的细胞和分子起源 | 首次建立无颌类脊椎动物七鳃鳗的全脑空间细胞类型图谱,通过跨物种比较重建了祖先脊椎动物大脑的细胞类型和基因表达程序 | 研究主要基于七鳃鳗与有颌脊椎动物的比较,可能无法完全代表所有脊椎动物祖先特征 | 系统追溯脊椎动物大脑的细胞和分子进化起源 | 七鳃鳗全脑组织及与其他脊椎动物(如小鼠)的神经数据比较 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,原位测序 | NA | 单细胞转录组数据,空间基因表达数据 | 七鳃鳗全脑样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 15 | 2025-11-15 |
Integrating spatial transcriptomics data across different conditions, technologies and developmental stages
2023-10, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-023-00528-w
PMID:38177758
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研究论文 | 提出了一种名为STAligner的图注意力神经网络,用于整合和分析来自不同条件、技术和发育阶段的空间转录组数据 | 开发了首个能够同时实现空间感知数据整合、空间域识别和下游比较分析的图注意力神经网络方法 | 未提及方法在超大规模数据集上的计算效率限制 | 开发空间转录组数据的整合分析方法,实现跨条件、技术和发育阶段的比较研究 | 人类大脑皮层切片、小鼠嗅球切片、正常与阿尔茨海默病条件下的小鼠海马组织切片、小鼠器官发生时空图谱 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | 图注意力神经网络(GAT) | 空间转录组数据 | 多个物种和条件的空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 16 | 2024-08-07 |
STAligner enables the integration and alignment of multiple spatial transcriptomics datasets
2023-10, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-023-00543-x
PMID:38177765
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2025-10-17 |
Stomach encyclopedia: Combined single-cell and spatial transcriptomics reveal cell diversity and homeostatic regulation of human stomach
2023-10-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113236
PMID:37819756
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学技术构建人类胃部细胞图谱,揭示胃部细胞多样性和稳态调控机制 | 构建了迄今为止最大的胃部单细胞和空间转录组数据集,发现LEFTY1作为未表征的干细胞标志物 | NA | 阐明人类胃部的精确细胞生物学特征和稳态调控机制 | 人类胃部组织 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 约380,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 18 | 2025-10-05 |
Spatial atlas of the mouse central nervous system at molecular resolution
2023-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06569-5
PMID:37758947
|
研究论文 | 本研究使用STARmap PLUS原位测序技术构建了小鼠中枢神经系统的分子分辨率空间图谱 | 开发了STARmap PLUS原位测序方法,首次在三维空间中以单细胞分辨率绘制了全脑分子细胞类型图谱 | 仅检测了1,022个基因,需要通过整合其他数据来推断全转录组表达谱 | 构建小鼠中枢神经系统的分子分辨率空间图谱 | 成年小鼠大脑和脊髓 | 空间转录组学 | NA | 原位测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,空间位置数据 | 109万个高质量细胞 | NA | 原位测序,单细胞RNA测序 | STARmap PLUS | STARmap PLUS原位测序技术,体素尺寸194×194×345纳米 |
| 19 | 2025-10-05 |
Self-patterning of human stem cells into post-implantation lineages
2023-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06354-4
PMID:37369348
|
研究论文 | 人类多能干细胞自组织形成模拟早期胚胎发育后植入阶段的三维结构 | 首次实现人类干细胞自组织形成同时包含胚胎外胚层样和胚外下胚层样谱系的三维结构,模拟了人类胚胎植入后发育的关键时空事件 | 未建立胎盘细胞类型,仅涵盖Carnegie阶段4-7的发育特征 | 理解人类早期发育的基本细胞和分子机制 | 人类多能干细胞 | 发育生物学 | 先天性疾病 | 单细胞转录组测序 | 三维干细胞自组织模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2025-10-05 |
Recent insights into the pathogenesis and therapeutic targets of chronic liver diseases
2023-Oct, eGastroenterology
DOI:10.1136/egastro-2023-100020
PMID:38074919
|
综述 | 概述慢性肝病(酒精性肝病、非酒精性脂肪性肝病和肝癌)的发病机制研究进展及潜在治疗靶点 | 重点探讨非编码RNA、自噬、肝外信号传导和巨噬细胞在肝病中的作用,并讨论单细胞RNA测序技术的应用 | 基于学术会议内容整理,未涉及原始研究数据 | 深入理解慢性肝病的发病机制并探索治疗靶点 | 酒精性肝病、非酒精性脂肪性肝病和肝癌 | 肝病学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |