单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 449 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-05 |
Characterizing the Macrophage Population in Patients With Idiopathic Subglottic Stenosis
2023-09, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.30524
PMID:36524603
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研究论文 | 本研究旨在描述特发性声门下狭窄患者的巨噬细胞群体特征。 | 首次对特发性声门下狭窄中巨噬细胞的转录组进行表征，揭示S100A8/9作为关键生物标志物的作用。 | 在体内S100A8/9+巨噬细胞的作用仍需进一步研究。 | 研究特发性声门下狭窄中巨噬细胞的免疫特征及其相关生物标志物的纤维生成特性。 | 分析来自特发性声门下狭窄患者的气管活检样本以及非瘢痕组织。 | 数字病理学 | 特发性声门下狭窄 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 样本中细胞转录组数据 | 8个样本（4个特发性声门下狭窄瘢痕及4个匹配的非瘢痕区域） |
| 162 | 2024-08-05 |
[Advances of spatial omics in the individualized diagnosis and treatment of head and neck cancer]
2023-Sep, Lin chuang er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Journal of clinical otorhinolaryngology, head, and neck surgery
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研究论文 | 本文总结了空间组学在头颈癌诊断和治疗中的最新进展 | 介绍了空间组学如何弥补单细胞测序技术无法获取细胞空间分布信息的缺陷 | NA | 探讨空间组学在头颈癌中的应用进展 | 头颈癌的病理机制、靶点探索和药物开发 | 数字病理学 | 头颈癌 | NA | NA | NA | NA |
| 163 | 2024-08-07 |
Potential involvement of IL-32 in cell-to-cell communication between macrophages and hepatoblastoma
2023-Sep-26, Pediatric surgery international
IF:1.5Q3
DOI:10.1007/s00383-023-05557-0
PMID:37751001
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研究论文 | 本研究调查了白细胞介素32（IL-32）在肝母细胞瘤中的表达及其在肿瘤发生中的可能作用 | 发现IL-32在肝母细胞瘤细胞系中的表达上调，并可能通过诱导肿瘤激活的巨噬细胞介导肝母细胞瘤的化学耐药性 | IL-32的免疫组化染色仅在48%的病例中呈阳性，且在下载的数据集中IL-32基因表达为阴性 | 研究IL-32在肝母细胞瘤中的表达及其在肿瘤发生中的作用 | 肝母细胞瘤细胞系和巨噬细胞 | NA | 肝母细胞瘤 | RNA-seq分析、RT-qPCR、免疫组化染色（IHC）、western blot分析 | NA | RNA-seq数据 | 21例肝母细胞瘤患者样本 |
| 164 | 2024-08-05 |
[Heterogeneity analysis of pancreatic cancer and identification of molecular subtypes of tumor cells based on CEACAM5, LGALS1 and CENPF gene expression]
2023-Sep-20, Nan fang yi ke da xue xue bao = Journal of Southern Medical University
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研究论文 | 本研究探讨了胰腺癌的异质性以及肿瘤细胞分子亚型的新方法，识别了胰腺癌进展中的标志基因 | 通过分析单细胞测序数据，识别了胰腺癌细胞的不同亚型及其特征基因，揭示了其在发育过程中的表达模式 | 本研究主要基于有限的样本数据，可能无法全面反映胰腺癌的所有亚型特征 | 研究胰腺癌的异质性及肿瘤细胞的分子亚型 | 16个胰腺癌组织样本中的单细胞 | 数字病理 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 16个胰腺癌样本和179名胰腺癌患者及171名健康对照的数据 |
| 165 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis revealing the intratumoral heterogeneity of ccRCC and validation of MT2A in pathogenesis
2023-Sep-15, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01225-7
PMID:37713131
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的肿瘤内异质性，并验证了MT2A在ccRCC发病机制中的作用 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了ccRCC的单细胞景观，并发现了MT2A在ccRCC中的重要作用 | NA | 探讨ccRCC的肿瘤内异质性及MT2A在其发病机制中的作用 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）及其相关细胞类型 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | CNN | 转录组数据 | 来自TCGA和Young等人的研究数据 |
| 166 | 2024-08-07 |
Combination of RUNX1 inhibitor and gemcitabine mitigates chemo-resistance in pancreatic ductal adenocarcinoma by modulating BiP/PERK/eIF2α-axis-mediated endoplasmic reticulum stress
2023-Sep-11, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02814-x
PMID:37697370
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研究论文 | 本研究探讨了RUNX1抑制剂与吉西他滨联合使用通过调节内质网应激的BiP/PERK/eIF2α轴来减轻胰腺导管腺癌的化疗抗性 | 首次揭示了RUNX1在胰腺导管腺癌化疗抗性中的作用及其通过内质网应激信号通路的机制 | 研究主要基于体外和动物模型，需要进一步的临床试验验证 | 探索RUNX1在胰腺导管腺癌化疗抗性中的作用及机制，并评估其作为预测生物标志物的潜力 | 胰腺导管腺癌及其化疗抗性 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), qRT-PCR, 免疫组织化学(IHC), 蛋白质印迹(western blot) | NA | RNA | 使用了多个数据集，包括GSE223463和GSE183795，以及构建了稳定表达shRUNX1和RUNX1的细胞系 |
| 167 | 2024-08-05 |
Lorazepam Stimulates IL6 Production and Is Associated with Poor Survival Outcomes in Pancreatic Cancer
2023-09-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-0547
PMID:37587561
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研究论文 | 本研究探讨了苯二氮卓类药物与癌症患者生存结果之间的关系 | 首次显示洛拉西泮刺激IL6的产生并与胰腺癌患者的生存结果相关 | 本研究为回顾性分析，可能受到遗传和环境因素的影响 | 调查苯二氮卓类药物对胰腺癌患者生存的影响及其在肿瘤微环境中的作用 | 以胰腺癌患者为研究对象，评估洛拉西泮对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | 胰腺癌 | ELISA, qPCR, RNA测序, 免疫组化等 | NA | 实验数据 | NA |
| 168 | 2024-08-07 |
Adrenergic nerves regulate intestinal regeneration through IL-22 signaling from type 3 innate lymphoid cells
2023-09-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.07.013
PMID:37597516
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研究论文 | 研究探讨了肠道交感神经通过IL-22信号从第3型先天淋巴细胞（ILC3s）调节肠道再生的机制 | 首次揭示了交感神经-ILC3轴在肠道再生中的重要作用 | NA | 研究交感神经在肠道上皮细胞再生中的作用 | 肠道交感神经和第3型先天淋巴细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 169 | 2024-08-05 |
Effects of PYCR1 on prognosis and immunotherapy plus tyrosine kinase inhibition responsiveness in metastatic renal cell carcinoma patients
2023-09, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2023.100919
PMID:37517099
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研究论文 | 本文研究了PYCR1在转移性肾细胞癌患者中的预后和对免疫疗法加酪氨酸激酶抑制反应的影响 | 提出了PYCR1作为生物标志物来区分最佳治疗策略的潜力 | 缺少大规模多中心验证，需要进一步研究以确认结果 | 探讨PYCR1表达与转移性肾细胞癌患者免疫治疗及酪氨酸激酶抑制的相关性 | 转移性肾细胞癌患者的生物标志物分析 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA测序 | 随机森林 | 基因表达数据 | 三个队列，总体样本量未明示，涉及的两个来自本机构，一个来自临床试验 |
| 170 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of megakaryopoiesis in peripheral CD34+ cells: insights into ETV6-related thrombocytopenia
2023-09, Journal of thrombosis and haemostasis : JTH
IF:5.5Q1
DOI:10.1016/j.jtha.2023.04.007
PMID:37085035
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了外周CD34+细胞中的巨核细胞生成过程，并探讨了ETV6相关血小板减少症的转录机制和基因调控网络 | 首次揭示了ETV6缺陷在巨核细胞生成早期阶段导致异常细胞发育的机制，并发现了一个高度失调的核心“核糖体生物合成”途径 | NA | 解析ETV6基因突变与血小板减少症之间的转录机制和基因调控网络 | 外周CD34+细胞中的巨核细胞生成过程 | 数字病理学 | 血小板减少症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康对照组和ETV6相关血小板减少症患者的CD34+细胞 |
| 171 | 2024-08-05 |
[Identification of SULF1 as a Shared Gene in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
and Lung Adenocarcinoma]
2023-Sep-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
|
研究论文 | 本研究鉴定了在特发性肺纤维化和肺腺癌中共享的基因SULF1 | 文章创新性在于识别SULF1作为具有潜在免疫相关生物标志物和治疗靶点的共享基因 | 本研究可能在样本量和多样性方面存在局限性，具体的临床应用仍需进一步验证 | 探索IPF与肺腺癌之间的共享致病基因和分子通路 | 研究对象为特发性肺纤维化（IPF）和肺腺癌（LUAD） | 数字病理学 | 肺癌 | 生物信息学分析 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | 共识别出529个共享基因 |
| 172 | 2024-08-07 |
FEED: a feature selection method based on gene expression decomposition for single cell clustering
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad389
PMID:37935617
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研究论文 | 本文提出了一种基于基因表达分解的特征选择方法FEED，用于单细胞聚类，通过选择信息基因来提高聚类性能 | FEED方法通过将基因表达水平分解为多个高斯成分，并提出一种新的基因相关性计算方法，从分布的角度衡量基因之间的关系，以及基于排列的方法确定基因重要性的阈值，从而选择标记基因子集 | NA | 提高单细胞聚类中细胞类型识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多种scRNA-seq数据集，包括大型数据集 |
| 173 | 2024-08-07 |
An RNA-Scaffold Protein Subunit Vaccine for Nasal Immunization
2023-Sep-29, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines11101550
PMID:37896953
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研究论文 | 本文开发了一种自佐剂的蛋白质-RNA核糖核蛋白疫苗，用于鼻腔免疫，并在小鼠和SARS-CoV-2感染模型中验证了其有效性 | 该疫苗结合了刺突RBD（作为抗原）、核蛋白（作为适配器）和ssRNA（作为佐剂和RNA支架），能强有力地诱导黏膜IgA、中和抗体和多功能T细胞，同时提供对活病毒挑战的灭菌免疫 | NA | 开发安全且有效的鼻腔疫苗以对抗呼吸道病毒感染 | 蛋白质-RNA核糖核蛋白疫苗在小鼠和SARS-CoV-2感染模型中的效果 | 疫苗学 | 呼吸道病毒感染 | scRNA-seq | NA | RNA | 小鼠和SARS-CoV-2感染模型 |
| 174 | 2024-08-07 |
White Adipose Tissue Heterogeneity in the Single-Cell Era: From Mice and Humans to Cattle
2023-Sep-27, Biology
DOI:10.3390/biology12101289
PMID:37886999
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综述 | 本文综述了利用单细胞技术研究白色脂肪组织在不同哺乳动物中的转录和功能细胞多样性，特别关注了牛的研究进展和未来方向 | 利用下一代测序技术进行单细胞RNA测序，揭示了人类和小鼠模型中白色脂肪组织的细胞异质性，并探讨了其在畜牧物种中的应用 | NA | 总结当前关于白色脂肪组织细胞多样性的知识，并强调其在不同哺乳动物物种中的特定功能 | 白色脂肪组织在不同哺乳动物中的细胞类型和功能 | NA | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 175 | 2024-08-07 |
Robust Identification of Differential Gene Expression Patterns from Multiple Transcriptomics Datasets for Early Diagnosis, Prognosis, and Therapies for Breast Cancer
2023-09-24, Medicina (Kaunas, Lithuania)
DOI:10.3390/medicina59101705
PMID:37893423
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研究论文 | 本研究通过综合稳健统计学和生物信息学方法，从多个转录组数据集中识别出与乳腺癌相关的差异表达基因，用于早期诊断、预后和治疗。 | 本研究采用稳健的统计方法来识别乳腺癌相关的关键基因，这些方法对异常值不敏感，提高了结果的可靠性。 | NA | 探索乳腺癌相关潜在的关键基因，并评估其在早期诊断、预后和治疗中的表现。 | 乳腺癌相关的差异表达基因及其在诊断、预后和治疗中的应用。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 微阵列分析, 单细胞RNA测序, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析, 分子对接分析 | NA | 基因表达数据 | 从三个微阵列（GSE26910, GSE42568, GSE65194）和一个单细胞RNA测序（GSE235168）数据集中识别出46个共同差异表达基因。 |
| 176 | 2024-08-05 |
Emerging Insights into Molecular Mechanisms of Inflammation in Myelodysplastic Syndromes
2023-Sep-23, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11102613
PMID:37892987
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综述 | 本文总结了慢性骨髓增生性疾病(MDS)中炎症信号的作用机制。 | 通过单细胞测序和多组学方法揭示了MDS进展中炎症信号及天然免疫反应的重要性。 | 本文未提供具体的实验数据来支持所讨论的机制。 | 探讨炎症在骨髓增生性疾病中的作用与机制。 | 主要关注骨髓微环境中炎症因子对造血干细胞(HSC)命运的影响。 | 数字病理 | 骨髓增生性疾病 | 单细胞测序、多组学技术 | NA | NA | NA |
| 177 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-sequencing data clustering using variational graph attention auto-encoder with self-supervised leaning
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad383
PMID:37898127
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研究论文 | 本文提出了一种用于单细胞RNA测序数据聚类的新型深度学习框架VGAAE | 创新地引入了多头注意力机制和自监督学习以提高聚类质量 | 未提及模型在真实生物场景中的应用情况 | 研究希望改善单细胞RNA-seq数据的聚类性能 | 集中在单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 变分图注意自编码器（VGAAE） | NA | 在不同数据集上进行实验 |
| 178 | 2024-08-07 |
Quantum annealing-based clustering of single cell RNA-seq data
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad377
PMID:37874950
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研究论文 | 本文探讨了使用量子退火技术对单细胞RNA测序数据进行聚类分析的方法 | 提出了一种利用量子计算中的量子退火技术来探索聚类成本函数的新方法 | NA | 解决单细胞基因表达数据聚类分析中参数选择和算法选择的难题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 量子退火 | 量子计算 | 基因表达数据 | NA |
| 179 | 2024-08-07 |
Combining Bulk RNA-seq and scRNA-seq data to identify RNA m5C methyltransferases NSUN1: a rising star as a biomarker for cancer diagnosis, prognosis and therapy
2023-Sep-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-23-66
PMID:37859740
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研究论文 | 本研究结合Bulk RNA-seq和scRNA-seq数据，全面分析了NSUN1在癌症中的表达及其作为癌症诊断、预后和治疗标志物的潜力 | 首次在多种癌症中全面分析NSUN1的基因表达、生存状态、遗传改变、甲基化和磷酸化以及浸润性免疫细胞的关系 | 研究主要基于在线资源和公共数据库，缺乏实验验证 | 探讨NSUN1作为癌症诊断、预后和治疗标志物的有效性 | NSUN1在不同癌症中的表达及其与预后和免疫浸润的关系 | 数字病理学 | 乳腺癌，结肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，Bulk RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 多种人类癌症样本 |
| 180 | 2024-08-07 |
Characterization of the tumor microenvironment by single-cell RNA sequencing in non-small cell lung cancer treated with neo-adjuvant immunotherapy
2023-Sep-28, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-23-413
PMID:37854164
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |