单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 449 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-05 |
Effects of PYCR1 on prognosis and immunotherapy plus tyrosine kinase inhibition responsiveness in metastatic renal cell carcinoma patients
2023-09, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2023.100919
PMID:37517099
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研究论文 | 本文研究了PYCR1在转移性肾细胞癌患者中的预后和对免疫疗法加酪氨酸激酶抑制反应的影响 | 提出了PYCR1作为生物标志物来区分最佳治疗策略的潜力 | 缺少大规模多中心验证，需要进一步研究以确认结果 | 探讨PYCR1表达与转移性肾细胞癌患者免疫治疗及酪氨酸激酶抑制的相关性 | 转移性肾细胞癌患者的生物标志物分析 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA测序 | 随机森林 | 基因表达数据 | 三个队列，总体样本量未明示，涉及的两个来自本机构，一个来自临床试验 |
| 162 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of megakaryopoiesis in peripheral CD34+ cells: insights into ETV6-related thrombocytopenia
2023-09, Journal of thrombosis and haemostasis : JTH
IF:5.5Q1
DOI:10.1016/j.jtha.2023.04.007
PMID:37085035
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了外周CD34+细胞中的巨核细胞生成过程，并探讨了ETV6相关血小板减少症的转录机制和基因调控网络 | 首次揭示了ETV6缺陷在巨核细胞生成早期阶段导致异常细胞发育的机制，并发现了一个高度失调的核心“核糖体生物合成”途径 | NA | 解析ETV6基因突变与血小板减少症之间的转录机制和基因调控网络 | 外周CD34+细胞中的巨核细胞生成过程 | 数字病理学 | 血小板减少症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康对照组和ETV6相关血小板减少症患者的CD34+细胞 |
| 163 | 2024-08-05 |
[Identification of SULF1 as a Shared Gene in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
and Lung Adenocarcinoma]
2023-Sep-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
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研究论文 | 本研究鉴定了在特发性肺纤维化和肺腺癌中共享的基因SULF1 | 文章创新性在于识别SULF1作为具有潜在免疫相关生物标志物和治疗靶点的共享基因 | 本研究可能在样本量和多样性方面存在局限性，具体的临床应用仍需进一步验证 | 探索IPF与肺腺癌之间的共享致病基因和分子通路 | 研究对象为特发性肺纤维化（IPF）和肺腺癌（LUAD） | 数字病理学 | 肺癌 | 生物信息学分析 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | 共识别出529个共享基因 |
| 164 | 2024-08-07 |
FEED: a feature selection method based on gene expression decomposition for single cell clustering
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad389
PMID:37935617
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研究论文 | 本文提出了一种基于基因表达分解的特征选择方法FEED，用于单细胞聚类，通过选择信息基因来提高聚类性能 | FEED方法通过将基因表达水平分解为多个高斯成分，并提出一种新的基因相关性计算方法，从分布的角度衡量基因之间的关系，以及基于排列的方法确定基因重要性的阈值，从而选择标记基因子集 | NA | 提高单细胞聚类中细胞类型识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多种scRNA-seq数据集，包括大型数据集 |
| 165 | 2024-08-07 |
An RNA-Scaffold Protein Subunit Vaccine for Nasal Immunization
2023-Sep-29, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines11101550
PMID:37896953
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研究论文 | 本文开发了一种自佐剂的蛋白质-RNA核糖核蛋白疫苗，用于鼻腔免疫，并在小鼠和SARS-CoV-2感染模型中验证了其有效性 | 该疫苗结合了刺突RBD（作为抗原）、核蛋白（作为适配器）和ssRNA（作为佐剂和RNA支架），能强有力地诱导黏膜IgA、中和抗体和多功能T细胞，同时提供对活病毒挑战的灭菌免疫 | NA | 开发安全且有效的鼻腔疫苗以对抗呼吸道病毒感染 | 蛋白质-RNA核糖核蛋白疫苗在小鼠和SARS-CoV-2感染模型中的效果 | 疫苗学 | 呼吸道病毒感染 | scRNA-seq | NA | RNA | 小鼠和SARS-CoV-2感染模型 |
| 166 | 2024-08-07 |
White Adipose Tissue Heterogeneity in the Single-Cell Era: From Mice and Humans to Cattle
2023-Sep-27, Biology
DOI:10.3390/biology12101289
PMID:37886999
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综述 | 本文综述了利用单细胞技术研究白色脂肪组织在不同哺乳动物中的转录和功能细胞多样性，特别关注了牛的研究进展和未来方向 | 利用下一代测序技术进行单细胞RNA测序，揭示了人类和小鼠模型中白色脂肪组织的细胞异质性，并探讨了其在畜牧物种中的应用 | NA | 总结当前关于白色脂肪组织细胞多样性的知识，并强调其在不同哺乳动物物种中的特定功能 | 白色脂肪组织在不同哺乳动物中的细胞类型和功能 | NA | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 167 | 2024-08-07 |
Robust Identification of Differential Gene Expression Patterns from Multiple Transcriptomics Datasets for Early Diagnosis, Prognosis, and Therapies for Breast Cancer
2023-09-24, Medicina (Kaunas, Lithuania)
DOI:10.3390/medicina59101705
PMID:37893423
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研究论文 | 本研究通过综合稳健统计学和生物信息学方法，从多个转录组数据集中识别出与乳腺癌相关的差异表达基因，用于早期诊断、预后和治疗。 | 本研究采用稳健的统计方法来识别乳腺癌相关的关键基因，这些方法对异常值不敏感，提高了结果的可靠性。 | NA | 探索乳腺癌相关潜在的关键基因，并评估其在早期诊断、预后和治疗中的表现。 | 乳腺癌相关的差异表达基因及其在诊断、预后和治疗中的应用。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 微阵列分析, 单细胞RNA测序, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析, 分子对接分析 | NA | 基因表达数据 | 从三个微阵列（GSE26910, GSE42568, GSE65194）和一个单细胞RNA测序（GSE235168）数据集中识别出46个共同差异表达基因。 |
| 168 | 2024-08-05 |
Emerging Insights into Molecular Mechanisms of Inflammation in Myelodysplastic Syndromes
2023-Sep-23, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11102613
PMID:37892987
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综述 | 本文总结了慢性骨髓增生性疾病(MDS)中炎症信号的作用机制。 | 通过单细胞测序和多组学方法揭示了MDS进展中炎症信号及天然免疫反应的重要性。 | 本文未提供具体的实验数据来支持所讨论的机制。 | 探讨炎症在骨髓增生性疾病中的作用与机制。 | 主要关注骨髓微环境中炎症因子对造血干细胞(HSC)命运的影响。 | 数字病理 | 骨髓增生性疾病 | 单细胞测序、多组学技术 | NA | NA | NA |
| 169 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-sequencing data clustering using variational graph attention auto-encoder with self-supervised leaning
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad383
PMID:37898127
|
研究论文 | 本文提出了一种用于单细胞RNA测序数据聚类的新型深度学习框架VGAAE | 创新地引入了多头注意力机制和自监督学习以提高聚类质量 | 未提及模型在真实生物场景中的应用情况 | 研究希望改善单细胞RNA-seq数据的聚类性能 | 集中在单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 变分图注意自编码器（VGAAE） | NA | 在不同数据集上进行实验 |
| 170 | 2024-08-07 |
Quantum annealing-based clustering of single cell RNA-seq data
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad377
PMID:37874950
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研究论文 | 本文探讨了使用量子退火技术对单细胞RNA测序数据进行聚类分析的方法 | 提出了一种利用量子计算中的量子退火技术来探索聚类成本函数的新方法 | NA | 解决单细胞基因表达数据聚类分析中参数选择和算法选择的难题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 量子退火 | 量子计算 | 基因表达数据 | NA |
| 171 | 2024-08-07 |
Combining Bulk RNA-seq and scRNA-seq data to identify RNA m5C methyltransferases NSUN1: a rising star as a biomarker for cancer diagnosis, prognosis and therapy
2023-Sep-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-23-66
PMID:37859740
|
研究论文 | 本研究结合Bulk RNA-seq和scRNA-seq数据，全面分析了NSUN1在癌症中的表达及其作为癌症诊断、预后和治疗标志物的潜力 | 首次在多种癌症中全面分析NSUN1的基因表达、生存状态、遗传改变、甲基化和磷酸化以及浸润性免疫细胞的关系 | 研究主要基于在线资源和公共数据库，缺乏实验验证 | 探讨NSUN1作为癌症诊断、预后和治疗标志物的有效性 | NSUN1在不同癌症中的表达及其与预后和免疫浸润的关系 | 数字病理学 | 乳腺癌，结肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，Bulk RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 多种人类癌症样本 |
| 172 | 2024-08-07 |
Characterization of the tumor microenvironment by single-cell RNA sequencing in non-small cell lung cancer treated with neo-adjuvant immunotherapy
2023-Sep-28, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-23-413
PMID:37854164
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 173 | 2024-08-05 |
NG-SEM: an effective non-Gaussian structural equation modeling framework for gene regulatory network inference from single-cell RNA-seq data
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad369
PMID:37864293
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研究论文 | 提出了一种新的非高斯结构方程模型框架NG-SEM，用于从单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络。 | 引入了一种灵活的噪声建模策略，以高斯混合模型近似生物系统的复杂随机特性，改进了传统结构方程模型。 | 未提及具体限制因素 | 提高单细胞RNA-seq数据中基因调控网络推断方法的准确性。 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络。 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | 非高斯结构方程模型 | 生物数据集 | 合成数据和真实生物数据集的多种控制实验 |
| 174 | 2024-08-05 |
Screening single-cell trajectories via continuity assessments for cell transition potential
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad356
PMID:37864296
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研究论文 | 本文提出了一种评估细胞转变潜力的连续性的方法，用于单细胞轨迹分析 | 创新地生成了一种简单的评分算法来评估轨迹的连续性 | 当前缺乏评估指标，使得确定轨迹何时偏离连续性变得困难 | 研究单细胞轨迹的连续性评估，以提高推断准确性 | 对肠道干细胞发育和CD8+ T细胞分化的真实案例进行了研究 | 数字病理学 | 牛皮癣关节炎和急性肾损伤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 在模拟和真实的单细胞数据中分析了断裂情况 |
| 175 | 2024-08-07 |
[Identification of Peripheral Blood GZMK + CD8 + T Cells As Biomarkers of Alzheimer's Disease Based on Single-Cell Transcriptome]
2023-Sep, Sichuan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Sichuan University. Medical science edition
DOI:10.12182/20230960107
PMID:37866940
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序技术，探索阿尔茨海默病（AD）患者外周血中的免疫特征，并识别GZMK+ CD8+ T细胞作为潜在的生物标志物 | 首次发现AD患者外周血中GZMK+ CD8+ T细胞含量增加，并与其异常信号传导及RESISTIN信号通路的增强相关 | 研究仅基于单一数据集GSE168522，可能存在样本偏倚；未涉及临床验证 | 识别阿尔茨海默病的潜在血液生物标志物 | 阿尔茨海默病患者的外周血免疫细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用来自Gene Expression Omnibus数据库的GSE168522数据集 |
| 176 | 2024-08-07 |
Transcriptional Regulation of Airway Epithelial Cell Differentiation: Insights into the Notch Pathway and Beyond
2023-Sep-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241914789
PMID:37834236
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综述 | 本文综述了气道上皮细胞分化的转录调控机制，特别关注了Notch信号通路及其相关因素 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了气道上皮细胞的组成，包括一些特殊和罕见的细胞类型 | NA | 探讨气道上皮细胞分化的机制，为呼吸系统疾病的治疗提供靶向疗法 | 气道上皮细胞的分化过程及其在呼吸系统疾病中的作用 | NA | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 177 | 2024-08-07 |
SLAM Modification as an Immune-Modulatory Therapeutic Approach in Cancer
2023-Sep-29, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15194808
PMID:37835502
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综述 | 本文综述了信号淋巴细胞激活分子（SLAM）家族在肿瘤环境中调节免疫反应的关键作用，并探讨了基于SLAM的免疫调节治疗在癌症治疗中的潜力 | 文章提出了基于SLAM家族的精确靶向治疗方法，利用单细胞RNA测序和高级成像技术，为更个性化和适应性强的癌症治疗提供了新方向 | 文章强调了患者安全性和临床试验的重要性，暗示当前研究可能存在临床应用上的限制 | 探讨SLAM家族在癌症治疗中的应用，特别是作为免疫调节治疗的新策略 | 研究对象为SLAM家族及其在肿瘤免疫反应中的作用 | 肿瘤学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | NA |
| 178 | 2024-08-07 |
Recent Advances in Single-Cell RNA-Sequencing of Primary and Metastatic Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2023-Sep-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15194734
PMID:37835428
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在原发性和转移性透明细胞肾细胞癌研究中的最新进展 | 利用单细胞RNA测序技术深入解析了肿瘤、免疫和基质细胞的多样性及其在疾病进展中的相互作用和通路 | 对于转移性透明细胞肾细胞癌的研究相对有限，这可能是导致该类型患者生存率和响应率较低的原因之一 | 旨在填补透明细胞肾细胞癌转移研究的知识空白，并强调提高转移性透明细胞肾细胞癌生存率的关键步骤 | 原发性和转移性透明细胞肾细胞癌 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 179 | 2024-08-07 |
Deciphering Cellular Heterogeneity and Communication Patterns in Porcine Antral Follicles by Single-Cell RNA Sequencing
2023-Sep-26, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani13193019
PMID:37835625
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索了猪腔前卵泡中颗粒细胞的分子和细胞特征 | 揭示了猪腔前卵泡中颗粒细胞的异质性和通信模式，以及它们在卵泡发育和卵母细胞成熟中的作用 | NA | 理解猪腔前卵泡中颗粒细胞的异质性和通信模式 | 猪腔前卵泡中的颗粒细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 180 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing of Donor-Reactive T Cells Reveals Role of Apoptosis in Donor-Specific Hyporesponsiveness of Kidney Transplant Recipients
2023-Sep-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241914463
PMID:37833911
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肾移植受者中供体反应性T细胞的转录组和T细胞受体谱，揭示了凋亡在供体特异性低反应性中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了肾移植受者中供体反应性T细胞的转录组和T细胞受体谱，并发现了凋亡在供体特异性低反应性中的作用 | 研究样本量较小，仅包括7名肾移植受者，可能影响结果的普遍性 | 探究肾移植后供体特异性低反应性的潜在机制 | 肾移植受者的供体反应性T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 7名肾移植受者 |