单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 449 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-07 |
DOT1L regulates lung developmental epithelial cell fate and adult alveolar stem cell differentiation after acute injury
2023-09-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.07.006
PMID:37595582
|
研究论文 | 研究探讨了DOT1L在肺发育和急性损伤后成年肺泡干细胞分化中的调控作用 | 首次发现DOT1L是AT2细胞生长和分化的调控因子，并揭示了Dot1l失活后AT2细胞的新状态 | NA | 识别控制肺AT2-AT1再生反应的表观遗传途径 | 肺AT2细胞和AT1细胞的分化 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 142 | 2024-08-07 |
Probing the communication patterns of different chondrocyte subtypes in osteoarthritis at the single cell level using pattern recognition and manifold learning
2023-09-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-41874-z
PMID:37660146
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据集探索不同软骨细胞亚型在骨关节炎中的协同和通信模式 | 首次基于单细胞层面的网络分析和模式识别，分析了不同软骨细胞亚型的活跃通信模式，并使用流形学习和定量对比分析了保守和特定的通信途径 | NA | 理解骨关节炎的微环境并优化细胞靶向疗法 | 不同软骨细胞亚型在人类软骨退化和再生中的通信模式 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞转录组 | 流形学习 | 转录组数据 | 1600个软骨细胞来自10名骨关节炎患者 |
| 143 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA sequencing integrated with bulk RNA sequencing analysis reveals diagnostic and prognostic signatures and immunoinfiltration in gastric cancer
2023-09, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107239
PMID:37450965
|
研究论文 | 本研究探讨了与胃癌（GC）患者T细胞相关的预后基因特征，提供了预测患者生存率和免疫浸润水平的见解 | 建立了胃癌的单细胞转录组图谱，并识别了与T细胞相关的预后基因特征 | 样本数量较少，仅基于10个肿瘤样本和相应的正常样本进行分析 | 探讨可以预测胃癌患者预后的相关基因特征 | 胃癌患者的免疫相关预后基因特征 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | 细胞 | 10个肿瘤样本和相应正常样本，包含18416个细胞 |
| 144 | 2024-08-05 |
SnapATAC2: a fast, scalable and versatile tool for analysis of single-cell omics data
2023-Sep-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.11.557221
PMID:37745443
|
研究论文 | 本文介绍了一种新算法SnapATAC2，用于单细胞组学数据的分析。 | 提出了一种快速非线性降维算法，能够高效捕捉单细胞组学数据的异质性，同时运行时间和内存使用与细胞数量线性相关。 | 未提及具体的限制 | 旨在提高对复杂组织中动态基因调控的理解。 | 分析单细胞组学数据，包括单细胞ATAC-seq和单细胞RNA-seq等。 | 单细胞组学 | NA | NA | NA | 单细胞组学数据 | 使用了多种单细胞组学数据类型 |
| 145 | 2024-08-07 |
ETV6 represses inflammatory response genes and regulates HSPC function during stress hematopoiesis in mice
2023-09-26, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022009313
PMID:37522715
|
研究论文 | 本研究通过生成携带Etv6R355X失活突变的小鼠模型，探讨ETV6基因在HSPC功能和炎症反应基因调控中的作用 | 首次揭示了ETV6在HSPC中抑制炎症基因表达的机制，特别是在应激造血过程中的作用 | NA | 阐明ETV6基因变异如何影响HSPC功能并导致疾病 | ETV6基因在HSPC中的功能及其对炎症反应基因的调控作用 | NA | 血液系统恶性肿瘤 | 转座酶可及染色质测序、高吞吐量染色体构象捕获、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型，包括Etv6R355X/+和Etv6+/+小鼠的骨髓细胞 |
| 146 | 2024-08-04 |
COMO: a pipeline for multi-omics data integration in metabolic modeling and drug discovery
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad387
PMID:37930022
|
研究论文 | 开发了一个名为COMO的用户友好型管道，用于多组学数据整合，支持代谢建模和药物发现 | COMO整合了多种建模方法和异构生物数据集，是一个高效的工具，适用于代谢模型的构建和药物发现 | 不提及具体的局限性 | 促进药物发现，通过代谢建模整合多组学数据 | 使用公共数据库和开源解决方案构建B细胞的代谢模型，以预测类风湿关节炎和系统性红斑狼疮的药物靶点 | 数字病理学 | 类风湿关节炎, 系统性红斑狼疮 | RNA-seq, 微阵列, 蛋白质组学 | 代谢模型 | 多组学数据 | 不提及具体样本量 |
| 147 | 2024-08-04 |
Robust discovery of gene regulatory networks from single-cell gene expression data by Causal Inference Using Composition of Transactions
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad370
PMID:37897702
|
research paper | 使用因果推断方法从单细胞RNA-seq数据中发现基因调控网络 | 提出了一种新的因果推断方法CICT，以预测因果调控关系并推断基因调控网络 | NA | 揭示基因调控网络的结构和功能 | 单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq (scRNA-seq) | 机器学习算法 | RNA表达数据 | 使用了模拟和实验的单细胞RNA-seq数据 |
| 148 | 2024-08-07 |
Cellular heterogeneity of the developing worker honey bee (Apis mellifera) pupa: a single cell transcriptomics analysis
2023-09-30, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkad178
PMID:37548242
|
研究论文 | 本研究使用单细胞转录组学分析方法，探讨了工蜂（Apis mellifera）蛹发育阶段的细胞异质性 | 这是首次对蜜蜂在任何发育阶段的完整单细胞图谱进行研究，展示了在细胞水平上进一步研究其生物学的潜力 | NA | 旨在通过单细胞转录组学分析，揭示工蜂蛹发育阶段的细胞类型及其基因表达特征 | 工蜂（Apis mellifera）蛹的细胞类型及其基因表达 | NA | NA | scRNA-Seq | NA | 转录组 | 涉及11天龄的预蛹和15天龄的蛹，共识别出63个不同的细胞簇，其中17个在两个阶段都可识别 |
| 149 | 2024-08-07 |
Nuclear corepressors NCOR1 and NCOR2 entrain thymocyte signaling, selection, and emigration
2023-Sep-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.27.559810
PMID:37808728
|
研究论文 | 本文研究了核共抑制因子NCOR1和NCOR2在胸腺细胞信号传导、选择和迁移中的作用 | 首次揭示了NCOR1和NCOR2在胸腺细胞发育中的多个关键作用，包括影响T细胞受体信号传导、CD4/CD8谱系决定和胸腺细胞迁移 | NA | 探讨NCOR1和NCOR2在胸腺细胞发育中的作用 | 胸腺细胞的发育过程 | NA | NA | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 细胞和RNA | 使用小鼠模型进行实验 |
| 150 | 2024-08-05 |
SpaRx: elucidate single-cell spatial heterogeneity of drug responses for personalized treatment
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad338
PMID:37798249
|
研究论文 | 本研究展示了如何利用SpaRx模型揭示肿瘤中单细胞对药物反应的空间异质性 | 提出了一种基于图的领域适应模型SpaRx，以识别药物抵抗的空间定位细胞异质性 | 未提及具体的样本或实验条件限制 | 研究单细胞空间转录组学中药物反应的异质性，以个性化治疗 | 肿瘤细胞对不同位置的药物反应能力 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | 图形领域适应模型 | 转录组数据 | NA |
| 151 | 2024-08-04 |
Single-cell profiling reveals inflammatory polarization of human carotid versus femoral plaque leukocytes
2023-09-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.171359
PMID:37471165
|
研究论文 | 该研究探讨了人类颈动脉与股动脉斑块内白细胞的炎症极化特征 | 通过单细胞RNA测序揭示了股动脉和颈动脉斑块中免疫细胞的不同转录组特征 | 主要集中于49名患者的数据，样本量较小且仅限于特定地区的斑块分析 | 比较不同血管部位的动脉粥样硬化斑块及其微环境的免疫特征 | 49名接受股动脉或颈动脉内膜切除术的患者的斑块内白细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、流式细胞术（flow cytometry）、免疫组化（IHC） | NA | 细胞数据 | 49名患者（股动脉斑块23名，颈动脉斑块26名） |
| 152 | 2024-08-04 |
Control of energy homeostasis by the lateral hypothalamic area
2023-09, Trends in neurosciences
IF:14.6Q1
DOI:10.1016/j.tins.2023.05.010
PMID:37353461
|
综述 | 这篇综述文章探讨了外侧下丘脑区域在能量平衡中的控制作用。 | 文章突出了外侧下丘脑不同神经元群体如何通过与其他脑区的复杂连接调节能量平衡的最新发现 | 许多LHA细胞类型的功能仍然不清楚，研究覆盖面可能有限 | 研究外侧下丘脑在能量平衡及其调节中的作用 | 探讨不同的外侧下丘脑神经元类型及其对能量平衡的影响 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 153 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics: Technologies, applications and experimental considerations
2023-09, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2023.110671
PMID:37353093
|
综述 | 本文概述了空间转录组技术的现状及其应用 | 强调了商业化空间转录组技术的发展以及实验的注意事项 | 未充分探讨所有类型的空间转录组技术 | 旨在理解基因在细胞中的空间表达及其对细胞功能的影响 | 空间转录组技术与其在生物医学研究中的应用 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 154 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals peripheral blood mononuclear immune cell landscape associated with operational tolerance in a kidney transplant recipient
2023-09, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2023.04.035
PMID:37201755
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肾移植后操作性耐受患者的免疫细胞景观 | 首次使用单细胞分析技术评估肾移植后操作性耐受患者的免疫景观 | 研究样本量较小，需要在大规模队列中进行进一步验证 | 探究肾移植后操作性耐受患者的细胞和分子通路 | 肾移植后操作性耐受患者的周围单核细胞 | 数字病理学 | 肾移植 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 包括一名操作性耐受的肾移植受者、两名健康个体和一名接受标准免疫抑制治疗的肾移植受者 |
| 155 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of the aging murine ovary
2023-Sep-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.29.538828
PMID:37162983
|
research paper | 本研究通过单细胞RNA测序分析了年轻和老年小鼠卵巢组织的转录组变化，揭示了卵巢衰老过程中的细胞和分子机制 | 首次提供了衰老小鼠卵巢的单细胞图谱，识别了卵巢衰退的早期驱动因素 | 研究仅限于小鼠模型，结果的临床相关性需进一步验证 | 填补关于衰老卵巢转录组变化的综合细胞图谱的空白 | 年轻和老年小鼠的卵巢组织 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻（3个月大）和老年（9个月大）小鼠的卵巢组织 |
| 156 | 2024-08-05 |
Single-cell brain organoid screening identifies developmental defects in autism
2023-Sep, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06473-y
PMID:37704762
|
研究论文 | 本研究开发了CRISPR人类类器官单细胞RNA测序系统，以筛查自闭症相关的发育缺陷 | 提出了一种新的系统用于高通量表型特征分析，揭示了自闭症谱系障碍基因对细胞命运决定的影响 | 研究主要集中在特定的基因突变，可能未涵盖所有自闭症相关的遗传变异 | 探讨自闭症谱系障碍的发育缺陷及其与基因调控网络的关系 | 聚焦于与自闭症谱系障碍相关的36个高风险基因的功能筛查 | 数字病理学 | 自闭症 | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据 | NA |
| 157 | 2024-08-07 |
A Single-Cell Taxonomy Predicts Inflammatory Niche Remodeling to Drive Tissue Failure and Outcome in Human AML
2023-09-01, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-23-0043
PMID:37470778
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，研究了人类急性髓系白血病（AML）中组织驻留造血干细胞/祖细胞（HSPC）与其肿瘤对应物及其原生微环境之间的预测信号相互作用 | 识别了LEPR+基质细胞作为造血作用的核心调节因子，并预测炎症微环境重塑和关键HSPC调节因子的剥夺会抑制NPM1突变AML中的高输出造血干细胞亚群 | NA | 揭示人类AML中细胞间信号传导，预测炎症微环境重塑对组织抑制和克隆选择的影响 | 人类急性髓系白血病（AML）中的造血干细胞/祖细胞（HSPC）及其微环境 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 158 | 2024-08-07 |
Identification and characterization of a hepatic IL-13-producing ILC3-like population potentially involved in liver fibrosis
2023-09-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000350
PMID:37029085
|
研究论文 | 本文详细研究了人体肝脏中的固有淋巴细胞（ILCs）在健康和纤维化肝脏中的组成及其在慢性肝病中的潜在作用 | 发现了一种先前未被描述的IL-13产生型ILC3样细胞亚群，该细胞在人体肝脏中富集，可能参与调节慢性肝病 | NA | 研究肝脏中固有淋巴细胞的组成及其在慢性肝病中的作用 | 肝脏中的固有淋巴细胞（ILCs） | NA | 肝纤维化 | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 总共分析了50个肝脏样本（非纤维化=22，纤维化=29），以及结肠和扁桃体组织（各14个）和外周血（32个） |
| 159 | 2024-08-05 |
High-dimensional analysis reveals an immune atlas and novel neutrophil clusters in the lungs of model animals with Actinobacillus pleuropneumoniae-induced pneumonia
2023-Sep-13, Veterinary research
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s13567-023-01207-4
PMID:37705063
|
研究论文 | 本研究揭示了模型动物肺部因Actinobacillus pleuropneumoniae引起的肺炎中的免疫图谱和新型中性粒细胞亚群 | 首次识别了具有抗原呈递细胞特征的MHC-II中性粒细胞，并发现了它们在APP感染后数量的增加 | 该研究主要集中在小鼠模型中，尚需在其他动物模型或人类中进行验证 | 研究肺部特异的免疫反应和参与细菌感染的关键免疫细胞亚群 | Actinobacillus pleuropneumoniae感染的小鼠及幼猪 | 数字病理学 | 猪肺炎 | 高维质谱细胞术和单细胞RNA-seq | NA | 细胞谱系和转录组数据 | 小鼠与感染APP和克雷伯氏肺炎杆菌的幼猪样本 |
| 160 | 2024-08-07 |
A novel mutation in intron 1 of Wnt1 causes developmental loss of dopaminergic neurons in midbrain and ASD-like behaviors in rats
2023-Sep, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-023-02223-8
PMID:37658228
|
研究论文 | 本研究通过大规模筛选自闭症谱系障碍（ASD）风险/致病基因，发现Wnt1基因内含子1中的一个同源突变，该突变导致WNT1表达减少，并在人源化大鼠模型中观察到ASD样行为和多巴胺能神经元的丢失。 | 首次证明中脑多巴胺能神经元的发育损失是ASD发病机制的一部分，异常的前体细胞模式是这种发育性多巴胺能神经元损失的细胞基础。 | NA | 探讨自闭症谱系障碍的遗传机制及其潜在的治疗方法。 | Wnt1基因突变对大鼠行为和神经元发育的影响。 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |