单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 449 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-04 |
Control of energy homeostasis by the lateral hypothalamic area
2023-09, Trends in neurosciences
IF:14.6Q1
DOI:10.1016/j.tins.2023.05.010
PMID:37353461
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综述 | 这篇综述文章探讨了外侧下丘脑区域在能量平衡中的控制作用。 | 文章突出了外侧下丘脑不同神经元群体如何通过与其他脑区的复杂连接调节能量平衡的最新发现 | 许多LHA细胞类型的功能仍然不清楚，研究覆盖面可能有限 | 研究外侧下丘脑在能量平衡及其调节中的作用 | 探讨不同的外侧下丘脑神经元类型及其对能量平衡的影响 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 142 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics: Technologies, applications and experimental considerations
2023-09, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2023.110671
PMID:37353093
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综述 | 本文概述了空间转录组技术的现状及其应用 | 强调了商业化空间转录组技术的发展以及实验的注意事项 | 未充分探讨所有类型的空间转录组技术 | 旨在理解基因在细胞中的空间表达及其对细胞功能的影响 | 空间转录组技术与其在生物医学研究中的应用 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 143 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals peripheral blood mononuclear immune cell landscape associated with operational tolerance in a kidney transplant recipient
2023-09, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2023.04.035
PMID:37201755
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肾移植后操作性耐受患者的免疫细胞景观 | 首次使用单细胞分析技术评估肾移植后操作性耐受患者的免疫景观 | 研究样本量较小，需要在大规模队列中进行进一步验证 | 探究肾移植后操作性耐受患者的细胞和分子通路 | 肾移植后操作性耐受患者的周围单核细胞 | 数字病理学 | 肾移植 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 包括一名操作性耐受的肾移植受者、两名健康个体和一名接受标准免疫抑制治疗的肾移植受者 |
| 144 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomics of Mtb/HIV Co-Infection
2023-09-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12182295
PMID:37759517
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综述 | 本文总结了使用单细胞RNA测序技术在结核和HIV感染中的免疫图谱研究进展 | 引入单细胞RNA测序技术，以更高分辨率揭示细胞异质性并定义结核病和HIV共感染中的免疫特征 | 未提及具体实验数据或样本结果 | 研究结核病和HIV共感染的免疫反应及其相互作用 | 结核病和HIV共感染中的个体细胞 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 145 | 2024-08-05 |
Denoising sparse microbial signals from single-cell sequencing of mammalian host tissues
2023-Sep, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-023-00507-1
PMID:37946872
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研究论文 | 本研究开发了一种名为SAHMI的计算资源，用于从哺乳动物组织的转录组测序中识别真实存在的微生物核酸并过滤掉污染物和虚假的分类分配 | 提出了一种新的计算工具SAHMI，能够有效区分真菌和污染物，从而改善微生物信号的识别 | 可能需要进一步验证SAHMI在不同组织和样本类型中的普适性 | 研究如何从单细胞测序中去噪稀疏的微生物信号 | 哺乳动物组织中的微生物和宿主细胞 | 数字病理学 | NA | 转录组测序 | 计算资源 | 基因组数据 | 多种组织中的已知微生物感染 |
| 146 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of the aging murine ovary
2023-Sep-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.29.538828
PMID:37162983
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序分析了年轻和老年小鼠卵巢组织的转录组变化，揭示了卵巢衰老过程中的细胞和分子机制 | 首次提供了衰老小鼠卵巢的单细胞图谱，识别了卵巢衰退的早期驱动因素 | 研究仅限于小鼠模型，结果的临床相关性需进一步验证 | 填补关于衰老卵巢转录组变化的综合细胞图谱的空白 | 年轻和老年小鼠的卵巢组织 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻（3个月大）和老年（9个月大）小鼠的卵巢组织 |
| 147 | 2024-08-07 |
A single-cell CRISPRi platform for characterizing candidate genes relevant to metabolic disorders in human adipocytes
2023-09-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00148.2023
PMID:37486064
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研究论文 | 本文利用CROP-Seq技术，结合CRISPR干扰和单细胞RNA测序，研究了人类脂肪细胞中的脂肪形成和脂肪细胞生物学 | 开发了一种强大的无假设工具，用于识别与代谢疾病相关的脂肪形成、前脂肪细胞和脂肪细胞功能的新调节因子 | 确定因果基因及其在代谢中的作用机制是一个耗时的过程 | 研究与代谢疾病相关的候选基因在人类脂肪细胞中的作用 | 人类前脂肪细胞SGBS细胞系和脂肪细胞 | 基因组学 | 代谢疾病 | CRISPR干扰、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过400个差异表达基因在至少一个时间点被识别 |
| 148 | 2024-08-05 |
Single-cell brain organoid screening identifies developmental defects in autism
2023-Sep, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06473-y
PMID:37704762
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研究论文 | 本研究开发了CRISPR人类类器官单细胞RNA测序系统，以筛查自闭症相关的发育缺陷 | 提出了一种新的系统用于高通量表型特征分析，揭示了自闭症谱系障碍基因对细胞命运决定的影响 | 研究主要集中在特定的基因突变，可能未涵盖所有自闭症相关的遗传变异 | 探讨自闭症谱系障碍的发育缺陷及其与基因调控网络的关系 | 聚焦于与自闭症谱系障碍相关的36个高风险基因的功能筛查 | 数字病理学 | 自闭症 | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据 | NA |
| 149 | 2024-08-07 |
A Single-Cell Taxonomy Predicts Inflammatory Niche Remodeling to Drive Tissue Failure and Outcome in Human AML
2023-09-01, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-23-0043
PMID:37470778
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，研究了人类急性髓系白血病（AML）中组织驻留造血干细胞/祖细胞（HSPC）与其肿瘤对应物及其原生微环境之间的预测信号相互作用 | 识别了LEPR+基质细胞作为造血作用的核心调节因子，并预测炎症微环境重塑和关键HSPC调节因子的剥夺会抑制NPM1突变AML中的高输出造血干细胞亚群 | NA | 揭示人类AML中细胞间信号传导，预测炎症微环境重塑对组织抑制和克隆选择的影响 | 人类急性髓系白血病（AML）中的造血干细胞/祖细胞（HSPC）及其微环境 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 150 | 2024-08-07 |
Identification and characterization of a hepatic IL-13-producing ILC3-like population potentially involved in liver fibrosis
2023-09-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000350
PMID:37029085
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研究论文 | 本文详细研究了人体肝脏中的固有淋巴细胞（ILCs）在健康和纤维化肝脏中的组成及其在慢性肝病中的潜在作用 | 发现了一种先前未被描述的IL-13产生型ILC3样细胞亚群，该细胞在人体肝脏中富集，可能参与调节慢性肝病 | NA | 研究肝脏中固有淋巴细胞的组成及其在慢性肝病中的作用 | 肝脏中的固有淋巴细胞（ILCs） | NA | 肝纤维化 | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 总共分析了50个肝脏样本（非纤维化=22，纤维化=29），以及结肠和扁桃体组织（各14个）和外周血（32个） |
| 151 | 2024-08-05 |
High-dimensional analysis reveals an immune atlas and novel neutrophil clusters in the lungs of model animals with Actinobacillus pleuropneumoniae-induced pneumonia
2023-Sep-13, Veterinary research
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s13567-023-01207-4
PMID:37705063
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研究论文 | 本研究揭示了模型动物肺部因Actinobacillus pleuropneumoniae引起的肺炎中的免疫图谱和新型中性粒细胞亚群 | 首次识别了具有抗原呈递细胞特征的MHC-II中性粒细胞，并发现了它们在APP感染后数量的增加 | 该研究主要集中在小鼠模型中，尚需在其他动物模型或人类中进行验证 | 研究肺部特异的免疫反应和参与细菌感染的关键免疫细胞亚群 | Actinobacillus pleuropneumoniae感染的小鼠及幼猪 | 数字病理学 | 猪肺炎 | 高维质谱细胞术和单细胞RNA-seq | NA | 细胞谱系和转录组数据 | 小鼠与感染APP和克雷伯氏肺炎杆菌的幼猪样本 |
| 152 | 2024-08-07 |
A novel mutation in intron 1 of Wnt1 causes developmental loss of dopaminergic neurons in midbrain and ASD-like behaviors in rats
2023-Sep, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-023-02223-8
PMID:37658228
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研究论文 | 本研究通过大规模筛选自闭症谱系障碍（ASD）风险/致病基因，发现Wnt1基因内含子1中的一个同源突变，该突变导致WNT1表达减少，并在人源化大鼠模型中观察到ASD样行为和多巴胺能神经元的丢失。 | 首次证明中脑多巴胺能神经元的发育损失是ASD发病机制的一部分，异常的前体细胞模式是这种发育性多巴胺能神经元损失的细胞基础。 | NA | 探讨自闭症谱系障碍的遗传机制及其潜在的治疗方法。 | Wnt1基因突变对大鼠行为和神经元发育的影响。 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 153 | 2024-08-05 |
Characterizing the Macrophage Population in Patients With Idiopathic Subglottic Stenosis
2023-09, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.30524
PMID:36524603
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研究论文 | 本研究旨在描述特发性声门下狭窄患者的巨噬细胞群体特征。 | 首次对特发性声门下狭窄中巨噬细胞的转录组进行表征，揭示S100A8/9作为关键生物标志物的作用。 | 在体内S100A8/9+巨噬细胞的作用仍需进一步研究。 | 研究特发性声门下狭窄中巨噬细胞的免疫特征及其相关生物标志物的纤维生成特性。 | 分析来自特发性声门下狭窄患者的气管活检样本以及非瘢痕组织。 | 数字病理学 | 特发性声门下狭窄 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 样本中细胞转录组数据 | 8个样本（4个特发性声门下狭窄瘢痕及4个匹配的非瘢痕区域） |
| 154 | 2024-08-05 |
[Advances of spatial omics in the individualized diagnosis and treatment of head and neck cancer]
2023-Sep, Lin chuang er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Journal of clinical otorhinolaryngology, head, and neck surgery
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研究论文 | 本文总结了空间组学在头颈癌诊断和治疗中的最新进展 | 介绍了空间组学如何弥补单细胞测序技术无法获取细胞空间分布信息的缺陷 | NA | 探讨空间组学在头颈癌中的应用进展 | 头颈癌的病理机制、靶点探索和药物开发 | 数字病理学 | 头颈癌 | NA | NA | NA | NA |
| 155 | 2024-08-07 |
Potential involvement of IL-32 in cell-to-cell communication between macrophages and hepatoblastoma
2023-Sep-26, Pediatric surgery international
IF:1.5Q3
DOI:10.1007/s00383-023-05557-0
PMID:37751001
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研究论文 | 本研究调查了白细胞介素32（IL-32）在肝母细胞瘤中的表达及其在肿瘤发生中的可能作用 | 发现IL-32在肝母细胞瘤细胞系中的表达上调，并可能通过诱导肿瘤激活的巨噬细胞介导肝母细胞瘤的化学耐药性 | IL-32的免疫组化染色仅在48%的病例中呈阳性，且在下载的数据集中IL-32基因表达为阴性 | 研究IL-32在肝母细胞瘤中的表达及其在肿瘤发生中的作用 | 肝母细胞瘤细胞系和巨噬细胞 | NA | 肝母细胞瘤 | RNA-seq分析、RT-qPCR、免疫组化染色（IHC）、western blot分析 | NA | RNA-seq数据 | 21例肝母细胞瘤患者样本 |
| 156 | 2024-08-05 |
[Heterogeneity analysis of pancreatic cancer and identification of molecular subtypes of tumor cells based on CEACAM5, LGALS1 and CENPF gene expression]
2023-Sep-20, Nan fang yi ke da xue xue bao = Journal of Southern Medical University
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研究论文 | 本研究探讨了胰腺癌的异质性以及肿瘤细胞分子亚型的新方法，识别了胰腺癌进展中的标志基因 | 通过分析单细胞测序数据，识别了胰腺癌细胞的不同亚型及其特征基因，揭示了其在发育过程中的表达模式 | 本研究主要基于有限的样本数据，可能无法全面反映胰腺癌的所有亚型特征 | 研究胰腺癌的异质性及肿瘤细胞的分子亚型 | 16个胰腺癌组织样本中的单细胞 | 数字病理 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 16个胰腺癌样本和179名胰腺癌患者及171名健康对照的数据 |
| 157 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis revealing the intratumoral heterogeneity of ccRCC and validation of MT2A in pathogenesis
2023-Sep-15, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01225-7
PMID:37713131
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的肿瘤内异质性，并验证了MT2A在ccRCC发病机制中的作用 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了ccRCC的单细胞景观，并发现了MT2A在ccRCC中的重要作用 | NA | 探讨ccRCC的肿瘤内异质性及MT2A在其发病机制中的作用 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）及其相关细胞类型 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | CNN | 转录组数据 | 来自TCGA和Young等人的研究数据 |
| 158 | 2024-08-07 |
Combination of RUNX1 inhibitor and gemcitabine mitigates chemo-resistance in pancreatic ductal adenocarcinoma by modulating BiP/PERK/eIF2α-axis-mediated endoplasmic reticulum stress
2023-Sep-11, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02814-x
PMID:37697370
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研究论文 | 本研究探讨了RUNX1抑制剂与吉西他滨联合使用通过调节内质网应激的BiP/PERK/eIF2α轴来减轻胰腺导管腺癌的化疗抗性 | 首次揭示了RUNX1在胰腺导管腺癌化疗抗性中的作用及其通过内质网应激信号通路的机制 | 研究主要基于体外和动物模型，需要进一步的临床试验验证 | 探索RUNX1在胰腺导管腺癌化疗抗性中的作用及机制，并评估其作为预测生物标志物的潜力 | 胰腺导管腺癌及其化疗抗性 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), qRT-PCR, 免疫组织化学(IHC), 蛋白质印迹(western blot) | NA | RNA | 使用了多个数据集，包括GSE223463和GSE183795，以及构建了稳定表达shRUNX1和RUNX1的细胞系 |
| 159 | 2024-08-05 |
Lorazepam Stimulates IL6 Production and Is Associated with Poor Survival Outcomes in Pancreatic Cancer
2023-09-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-0547
PMID:37587561
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研究论文 | 本研究探讨了苯二氮卓类药物与癌症患者生存结果之间的关系 | 首次显示洛拉西泮刺激IL6的产生并与胰腺癌患者的生存结果相关 | 本研究为回顾性分析，可能受到遗传和环境因素的影响 | 调查苯二氮卓类药物对胰腺癌患者生存的影响及其在肿瘤微环境中的作用 | 以胰腺癌患者为研究对象，评估洛拉西泮对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | 胰腺癌 | ELISA, qPCR, RNA测序, 免疫组化等 | NA | 实验数据 | NA |
| 160 | 2024-08-07 |
Adrenergic nerves regulate intestinal regeneration through IL-22 signaling from type 3 innate lymphoid cells
2023-09-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.07.013
PMID:37597516
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研究论文 | 研究探讨了肠道交感神经通过IL-22信号从第3型先天淋巴细胞（ILC3s）调节肠道再生的机制 | 首次揭示了交感神经-ILC3轴在肠道再生中的重要作用 | NA | 研究交感神经在肠道上皮细胞再生中的作用 | 肠道交感神经和第3型先天淋巴细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |